4EVZ | Genus

Total Genus 79

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	79
sequence length	258
structure length	254
Chain Sequence	MLAKRIIPCLDVKDGRVVKGNLRDAGDPVELAARYDEEGADELVFLDITASHEGRETMLEVVERTAEQVFIPLTVGGGIRSVEDASRLLRAGADKVSINTAAVKNPELITEAAEEFGSQAVVVAIDAKRVGGGWEVFTHGGRKPTGLDAVEWARKVVELGAGEILLTSMDRDGTKAGYDLELTRAVSEAVSVPVIASGGAGELEHFAEVFELEGADAALAASIFHFGEITIREVKAYLRERGIEVRLEHHHHHH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Evidence for the existence of elaborate enzyme complexes in the Paleoarchean era. pubmed doi rcsb
molecule keywords	HisF-LUCA
molecule tags	Lyase
total genus	79
structure length	254
sequence length	258
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2012-04-26

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4evzA00

2ZA1A 2QUTA 3OVPA 5LNVA 4WJEA 3SIZA 4HPXA 4JTFA 4CCDA 5C2XA 1N8FA 4JR5A 1X1ZA 4MZ1A 4C1KA 3KOFA 3PBWA 4LT9A 1YTKA 1V7YA 3W2MA 3G3MA 1NF7A 1YADA 3W1LA 1Q6OA 2QUUA 3MBDA 1PE1A 3W73A 5AHLA 1KFJA 1TB3A 2PURA 5K9CA 1TV8A 3EWYA 2DZXA 2ZA2A 4UTTC 4NJGA 1RQBA 1EWDA 4MUZA 3W84A 1GG0A 4N02A 2QCFA 3B0UX 4GC4A 4HNUA 2Y85A 3MO7A 4JYFA 1OJXA 3G8RA 2I9EA 5H91A 1XM3A 5LKYA 3UWWA 5J5RA 2VEIA 3G1SA 4IOTA 4JTKA 4YWIA 2Y7EA 1SU5A 1CI1A 2J9XA 4LVDA 3W7IA 1EWEA 2PC4A 4UTJA 3DBPA 1KFBA 4RZ6A 1KM4A 1RQEA 3PG9A 4JTIA 4O13A 1I8JA 1DQWA 2BTMA 4MZYA 1FWTA 1PV8A 3BARA 3W23A 3TW6A 1R2SA 1H7WA 4DO6A 1VGAA 1LLZA 4RKAA 4WXZA 1P0NA 1W3IA 2OX1A 3SSJA 1AW2A 4LW7A 5E0KA 5U4NA 2X1SA 2NX9A 5BOOA 5CPOA 4A2RA 4JIQA 1K7EA 1DOSA 1DL3A 1T99A 1FWSA 2ZRYA 3KXQA 3O07A 3G1VA 4K38A 3UWYA 1KM3A 1H50A 1QR7A 4QISA 4WY0A 1JUEA 4R34A 4P61A 4PH6A 4JTLA 5G2IA 1GVFA 5F4XA 3TA6A 4OBTA 1NSJA 1W5OA 4O54A 3ABSA 1TV5A 2CWNA 3DKJA 4C1LA 4HN4A 1G67A 1QPRA 3GXTA 4XBSA 4HT3A 4O57A 2CLKA 2QR6A 3L5LA 3W71A 4UFJA 3O8AA 4O1CA 4G1KA 5DXXA 4AHQA 4CCCA 1H7NA 3C4UA 3LTPA 4FNQA 1H1YA 1XI3A 3PAJA 2DP3A 5CPLA 1Y0EA 4FXSA 1LRNA 3S1XA 1ICPA 3ABRA 4JX6A 5LGXA 1NAL1 3TQ0A 3IEBA 6ALDA 5EMUA 4UTIA 1ICQA 1IIGA 1H60A 3MHGA 2QJGA 3GR7A 1PCKA 3N34A 3W7LA 2DZPA 3W85A 1K8XA 2QF7A 4HIBA 3LTYA 1G4EA 4BWLC 4GRSA 5AN7A 1UCWA 3BW2A 1TMHA 1OFOA 5LGZA 3NR0A 3W88A 1WYIA 1LBFA 2QCDB 3DENA 3WJYA 1W0MA 2JKAA 3UWVA 3CIXA 4JTUA 4O0ZA 3LBCA 2E5CA 2ISWA 3R8RA 3GLCA 3V1PA 2GVLA 4QIUA 5G1YA 4FIQA 3W7GA 5FESA 1Q6RA 3TMQA 3PWAA 3LCLA 2CW6A 1ZNNA 3NQDA 3BGGA 3P61A 3F1QA 1ZAIA 1SW7A 1K02A 7TIMA 4LVAA 3MP3A 1YYAA 1BWKA 4UNLA 3M47A 2EPHA 2TSYA 2QCCA 2YFOA 3M5XA 3A9IA 5IM51 4RCXA 3MMTA 3CWOX 4POCA 1TPUA 3PS7A 3S1UA 3WJWA 1YTDA 3N2MA 2FB3A 3M1ZA 2PRMA 4JDYA 1TIMA 4N9CA 3RNDA 5HMSA 1EUNA 1OFAA 1FCBA 2NV2A 4AVFA 2YW3A 1THFD 1OFDA 3UWUA 3AJXA 1CX9A 1MO0A 4ZVJA 4E0CA 1LROA 4TMBA 1ICSA 3NQMA 3CPRA 5FF3A 3C2VA 1X7FA 2RH9A 1J4EA 3OVQA 4KWVA 4NJHA 3W7RA 3CEUA 1YXCA 3QC3A 5F2GA 1GYNA 1O4UA 1KBJA 3NO5A 4QJ1A 4MY8A 4UTWC 2EHHA 2V0TA 2B4GA 4WD0A 1B4KA 3M9YA 2QAPA 2HSAA 2WSRA 4Z08A 3LRMA 2DZUA 3NQFA 1EP1A 4BFAA 4GUGA 1XBVA 1S3HA 2FFCA 4M7SA 3T44A 3PULA 4X22A 3LXBA 2GVJA 3RK8A 3OVRA 1MEWA 4ADTA 3C2OA 3NQEA 3N19B 5KINA 4K7VA 2UV8G 3QSTA 4ZMGA 3NL5A 1TPEA 1LOQA 3JR2A 3RLUA 3T55A 4JNMA 2FPTA 3M41A 2FPYA 4LC6A 1F73A 2TRSA 2CLLA 2P10A 3STEA 3NA8A 3FA5A 3B06A 1FUYA 4DPPA 1MZHA 4UMCA 5HQEA 2JKPA 2A0NA 4CNPA 1G4SA 4MYAA 1VQTA 5CKSA 1H1ZA 2DJLA 1I45A 1SFLA 3W1NA 1LOSA 3W07A 1TCDA 3NPVA 4A2SA 1R47A 2H8XA 1LTDA 4L4LA 3MWAA 1O5KA 1TPDA 2BSLA 3W7KA 3TUUA 3YPIA 2J88A 3N3MA 5D2TA 3PG8A 3M43A 2YR1A 4ZL1A 2NXHA 4XTIA 4Y96A 2CLIA 3F4WA 1M7OA 2RFGA 4O17A 1OG0A 3A22A 5AYZA 1QPNA 3P82A 3T40A 1F5ZA 4IMGA 4OV4A 3PSVA 1N55A 2WSQA 4FO4A 3OIXA 5D05A 3RF9A 1YDVA 2Q8ZA 4WXYA 3N9SA 5F2IA 3FS2A 3MHFA 1ZFJA 2RDTA 3O6DA 1BTMA 4HNTA 3P8JA 3E02A 4TU1A 4DEFA 5TIMA 4M6QA 2VXNA 3G1YA 1TRDA 1XBXA 2ZTKA 1F74A 1FCQA 1L2UA 1ZJIA 4OE7A 3T7VA 4Q32A 3W1PA 5J5DA 1H7PA 3RFAA 4FHAA 5DY2A 3CC1A 2ATSA 5ABTA 2ABBA 5D2WA 1W5NA 2Z1BA 4UTMA 3GZ3A 4M5PA 4W9TA 3HJZA 2V9DA 2E77A 1GPWA 5DELA 1WBJA 1SUXA 1H62A 4RR4A 3TAOA 3KVMA 1VRDA 3PSWA 3NVTA 3VNDA 4FNPA 1LORA 3EXTA 4DF0A 2WNZA 3EX6A 1M7PA 3TIMA 2A6LA 3GK0A 3ABOA 2ZRVA 3HPSA 5AYXA 5L6UA 4RJEA 1ADOA 4WOZA 1KLZA 1NVMA 3NPWA 4JS3A 1WQ5A 3BO9A 4FEZA 1R46A 2TYSA 4DXVA 1I4NA 2VFEA 2J9YA 3PC0A 5K9DA 2E68A 3LLFA 1VS1A 1KM2A 3GDMA 1IXQA 1QWGA 3AO0A 4U28A 4EF8A 3EWUA 2AQWA 3TKFA 1TRIA 3G0SA 3OEXA 4DF1A 3NZ1A 2ZBTA 3E9AA 3RMJA 5BW6A 3KAOA 1LBMA 2DZWA 4NZJA 1RQHA 2E5BA 2R8WA 1TREA 3SY5A 2A21A 3ZR4A 2W6RA 1LDCA 2V81A 3W2UA 2Q8LA 1T8XA 1NF0A 3PBVA 3P67A 1WOAA 3W1MA 4O10A 4O15A 2W0UA 5AB3A 1B57A 2WJZA 3W2LA 3IVTA 3NL2A 3SJ3A 1TPH1 3SW6A 4UNKA 4JYDA 3A5FA 1OFBA 2WSYA 3I65A 5CPNA 1IXPA 3DI0A 3KRSA 5CSSA 2Y63A 2WNQA 4PODA 1OYBA 2ZQ0A 4LUJA 3NM1A 1R2RA 3HPZA 1VC4A 2BXVA 2FQIA 2NX1A 5MHBA 1TJPA 3LCFA 5K4ZA 4BK9A 1PVNA 3IIVA 4JN6A 2B7OA 1Z44A 1DHPA 3C52A 5G4EA 1U83A 3MUXA 4ZQRA 4O1DA 4ZQNA 2E5DA 2YXGA 3S1WA 1ML1A 3LLDA 1JJKA 3EWWA 2C13A 2JK2A 1FBAA 3N2XA 4FB7A 1K7FA 3N73A 3DU0A 1OFPA 2ZCGA 4AB4A 3P8IA 3TSMA 3LHUA 3TJXA 5A5WA 3UY8A 1VYRA 2V8ZA 5I3FA 1L6SA 2YW4A 3SGZA 2G95A 4GUFA 3DKLA 3THAA 3R5EA 1SO4A 4WY0F 3MI3A 2YDAA 1TPWA 3BW3A 4NXSA 5G2WA 4MFDA 4IUOA 4BI5A 4LV4A 1YDNA 3IIXA 4N4PA 4XWUA 3H53A 2ZRUA 3QZEA 5AHIA 4LS2A 4QITA 2GQAA 1MEHA 3HGJA 4E2DA 2WV8A 4CQAA 3SFKA 3UXAA 3ZS4A 2AAMA 1M6JA 2OCZA 3QQ1A 3LOTA 3DI1A 3DFPA 4IJBA 3VCRA 2NWRA 1UUOA 4MZ8A 1GG1A 1W5PA 3EX4A 2R94A 4JTSA 3LTSA 3R12A 5C6MA 3NQGA 1W8SA 4AWSA 1H63A 5DY3A 3UNDA 4YCOA 4Z1AA 3UY7A 3P84A 2XFWA 2B7NA 1F2JA 1Z41A 3PUOA 1O60A 2ZZ3A 1Q6QA 1W31A 3PBYA 3OHIA 2X30A 3P74A 2KZHA 4BR1A 1A5AA 1WA3A 1L6YA 1JQVA 4N2YA 1QPQA 3CIWA 4L4MA 3RLVA 3TFXA 1HO4A 1B9BA 4GJ1A 4PA8A 2QJHA 1Q45A 1W5MA 1O95A 1XC4A 1FDYA 1JCYA 2ZA3A 5DXYA 1ZENA 4MVAA 4XBKA 4EIVA 1I2OA 1OHLA 1SO6A 1TO3A 2C1HA 3A21A 4FX8A 2CLEA 3I6RA 3P62A 3UWQA 2ZRZA 3TK7A 1AL8A 4M6VA 1GOXA 4R33A 1P4CA 3EX1A 3WK2A 4A3UA 3GDTA 4NQ1A 4JY9A 3CHVA 3IIZA 3PB2A 4N4QA 3L65A 4DELA 3G22A 1KFCA 2ISVA 4XZ9A 3DFOA 1J2WA 3S5YA 1GT8A 1X8FA 4RXGA 1P0KA 1ZHAA 1A50A 3C0JA 4JX5A 3FIGA 2YGYA 3PUEA 4JICA 3TR2A 4MPQA 3TU9A 4ORMA 4K8HA 4WX2A 4LY8A 2E6YA 1VLWA 1GVSA 1D9EA 4YXGA 2NXIA 2ZZ4A 3THQA 3G1AA 3USBA 3TSBA 5G2HA 5F4WA 1LP6A 1B3OA 2D73A 2NX3A 4PFMA 3BVJA 4JTGA 1YLVA 3NPXA 3I7RA 5HR7A 2G96A 4JIPA 1QO2A 4BI6A 2VOMA 4EVZA 2YYUA 2GVGA 2ZDRA 4HNNA 2CZEA 3HG2A 2QCEA 1F7BA 4P2VA 5D04C 3N9RA 3HGOA 5L9FA 3WK3A 1IGSA 2HS8A 1WAUA 2VELA 4R53A 4M7TA 1DVJA 1SSDA 5AHEA 3P5ZA 4IMDA 3B03A 5GVJA 2J24A 1K7XA 2VEPA 2P0OA 4AWUA 2JGYA 1TTQA 1VYSX 1LBLA 4PCFA 2C3ZA 4N6FA 2EAWA 4DBDA 3D0CA 1XKYA 2QDGA 3FJLA 2C6QA 2QCDA 3TH6A 3B04A 3LERA 3TX9A 2CU0A 2RDUA 3EXRA 4XQ6A 1B4EA 4Z0JA 4NX5A 4JX4A 3IGXA 1H61A 3LHVA 4UCGA 3S5OA 3TJLA 3W75A 1JCXA 5D32A 3QPZA 5F1UA 5D02A 1EP2A 3W86A 4IXHA 4QM1A 1TV7A 3GXPA 5HNRA 3HO8A 3LI1A 1DJQA 2BZNA 4S1FA 1YPIA 4PC8A 1YPFA 3UPWA 3JS3A 3DFTA 3TC6A 1VR6A 2EF9A 1VCGA 5G1TA 3GX9A 5AC6A 3GNDA 2VC6A 3M5VA 1RD5A 4O12A 4OT7A 3QJAA 4EWND 1VHCA 1SO5A 3G3DA 4UFMA 1A5CA 1M5WA 2ZRXA 2EGZA 3QEZA 4OU1A 1LRQA 2V2DA 2A7RA 1EEPA 4XTDA 3PBUA 3MW7A 3P80A 4ZQMA 1YTEA 1GWJA 5DCDA 3V75A 4I7UA 3G1DA 1YXYA 3B0VC 4LC8A 4WQ6A 3UYCA 4YCPA 4JY8A 4PTNA 5LNSA 1WV2A 5IBXA 4TR9A 5U7SA 2YX0A 3I7SA 2GJLA 1FWWA 3CLMA 3ZWTA 3L0GA 4MFEA 1VH7A 2ZZ6A 2EKCA 4DF2A 3CU2A 2BLEA 3DXIA 3QF0A 1OX4B 1IXNA 5H2ZA 4NXKA 1QPOA 4IX0A 2QCHA 1GTHA 3LXCA 1FQ0A 4NVTA 3BLIA 1DV7A 3KVKA 4GUHA 2NV1A 3W1RA 1QMLA 1NEYA 1K03A 1H5YA 3I68A 3K30A 3HGSA 5DBUA 2QEZA 3C6CA 3NQCA 2E6AA 1G69A 3LV6A 3IGSA 3IRDA 1RZMA 3IGUA 4HHPA 5BMXA 1OF6A 2YSWA 5FF2A 4GFSA 1VJIA 4O14A 2GQ9A 5TQLA 4Y9AA 3W7JA 3NNTA 4KWWA 5K4XA 1JCJA 1W56A 2Y89A 3LDVA 1RR2A 1OX5A 1TQJA 1SZNA 1YDOA 3TXVA 4YLWA 2Z0IA 3U2OA 2DZVA 1GEQA 3DAQA 5LNRA 2CFFA 2O7SA 2A1YA 1SZFA 3EKZA 1L9WA 4LWWA 2H90A 1I2NA 3NAVA 3KRUA 5AOUA 2WKJA 3TROA 3LM7A 2WQPA 2Y7DA 3G24A 2Y88A 2LLEA 1D3GA 3FKRA 5FF7A 4JGDA 2OMAA 3SZ8A 1A5SA 5F2MA 3UQNA 2WOQA 5CSRA 3TQVA 3NQ2A 1IIHA 1JUKA 2VFDA 4Y90A 3U8GA 1DBTA 2X1TA 3LGEA 2OJPA 3CQ0A 4LVFA 1FX6A 2Y7FA 4O52A 3TXZA 3BG3A 2O7QA 5CG7A 3NYZA 5D37A 4IXXA 3W1QA 3NXFA 3W7NA 3GB6A 2H3BA 4AEOA 3MYOA 4UTTA 3QYQA 1W54A 2PRLA 1FDJA 3MP5A 5AHMA 1HG3A 5KZDA 2AGKA 2G97A 1LYXA 3MYPA 3W1AA 4GWEA 4IMEA 4MLJA 5CZJA 3IVUA 4ICNA 1XUZA 3H54A 1ME7A 4JTTA 4JDBA 5C55A 3EWXA 4X9SA 1T0OA 1AG1O 5KMYA 5FEZA 4ORIA 3LHWA 4CQ9A 4MOZA 4NZFA 4UUIA 5CZTA 1GYLA 5D2VA 3P81A 3NPUA 5E1QA 8TIMA 4O1AA 4IQLA 4WUIA 3HGRA 4RX0A 3W76A 3LCHA 5I3KA 1Q6LA 1H7XA 3WJZA 1EPXA 4S2BA 3EB2A 1SSGA 1OFQA 2WO5A 4O0KA 3MBFA 1N7KA 1DQXA 4ZQPA 3HMJG 1KA9F 2Z6JA 3MP4A 3QW4B 2FTPA 3BLFA 3DH7A 2ZRWA 4FNSA 3W7PA 3M7WA 1W1ZA 3KRZA 3P5YA 1WXJA 4LS0A 2YCEA 3EX2A 3FJ6A 2VEKA 1R30A 3GDKA 2DZTA 2NUXA 3QPYA 1O94A 5KZMA 4BF9A 3W22A 1VCVA 1F6PA 4MYXA 2QCNA 1ZAJA 3LRKA 1TTPA 3JRKA 5F4SA 3O05A 1TJRA 3L5AA 4JTHA 3DFSA 2FJKA 3W1TA 3NZRA 2V5BA 1P1XA 1ONRA 3ATZA 3DFNA 2QUVA 1KV5A 1KM1A 4TO8A 2Y6ZA 1OK6A 1MSSA 2JGQA 4Y8FA 4KFNA 2B0MA 3R89A 1QOQA 1KFEA 3CEPA 1SPQA 3M6YA 3ATYA 4M19A 2C16A 2NZLA 5EPDA 3NQVA 3ELFA 2W79A 3BGJA 3G1FA 4O50A 1SW0A 1WX0A 1HTIA 1C29A 3M0ZA 3M5ZA 2E1DA 1EB3A 1GJPA 2XN2A 4Q4KA 1LZOA 2R91A 5K2ZA 3NL3A 3IVSA 4O4VA 3VE7A 3BG5A 4A29A 4NUWA 2B7PA 2VKZG 1X1OA 3W74A 1UUMA 4LS1A 4BWLA 2C18A 3PUDA 2E6DA 5EKYA 5FEWA 3NQ6A 3T78A 1JUBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2QUT A;  3WBA A;  3OVP A;  3UZY A;  5ABF A;  3FVM A;  3HZ3 A;  4CCD A;  4LYQ A;  3KOF A;  2CET A;  4Q4Q A;  1YTK A;  3W2M A;  3PHA A;  2VUN A;  1YAD A;  3CUF A;  2C1I A;  3DOP A;  3EKG A;  5AHL A;  3V3W A;  4KT2 A;  1P6B A;  2VX7 A;  4DJE C;  1TV8 A;  2DZX A;  4D8A A;  3GVW A;  3FJN A;  1EWD A;  2ACS A;  3W84 A;  3VM7 A;  2P76 A;  3B0U X;  4PMU A;  1BPL B;  4HNU A;  2JQX A;  3GW3 A;  3RO8 A;  2QPX A;  1O68 A;  2XH0 A;  3UWW A;  5J5R A;  1VBJ A;  1J2B A;  2QYG A;  3WF2 A;  5FOO A;  4C5Y A;  1J01 A;  3FND A;  1VEN A;  1EWE A;  1JZ7 A;  2Z29 A;  4F48 A;  1UR0 A;  1RQE A;  4DZH A;  1DQW A;  5CJM A;  3DYO A;  5EMM A;  3DUG A;  3OBA A;  4DM2 A;  4DO6 A;  1UP2 A;  4JAW A;  4IF2 A;  1W3I A;  3UGR A;  3W01 A;  5E0K A;  2V3D A;  4X60 A;  1XLJ A;  5CPO A;  4PUJ A;  1K7E A;  1DL3 A;  3WYZ A;  4GYP C;  4JZ5 A;  4EE9 A;  2G4F A;  4G5D A;  4QIS A;  3TYC A;  3TLL A;  3SSZ A;  1TE6 A;  1GVF A;  1GVE A;  3K4D A;  1O7A A;  4B5U A;  1YE4 A;  1QPR A;  3EDJ A;  3GXT A;  2QR6 A;  1IGW A;  4Y9M A;  3U7B A;  2NQ9 A; 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4EVZA

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Chord Diagram

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