4EWN | Genus

Total Genus 82

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	82
sequence length	249
structure length	243
Chain Sequence	LAKRIIACLDVKDGRVVKGTNFENLRDSGDPVELGKFYSEIGIDELVFLDITKTMLELVEKVAEQIDIPFTVGGGIHDFETASELILRGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVAIVAKRVDGEFMVFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRVGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADAALAASVFHFREIDVRELKEYLKKHGVNVRL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	A sugar isomerization reaction established on various (beta-alpha)8-barrel scaffolds is based on substrate-assisted catalysis pubmed doi rcsb
molecule keywords	Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF
molecule tags	Lyase
source organism	Thermotoga maritima
total genus	82
structure length	243
sequence length	249
ec nomenclature	ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2012-04-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
D	PF00977	His_biosynth	Histidine biosynthesis protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4ewnD00

1QAPA 4EF8A 4LTSA 2V8ZA 5TIMA 3OEXA 4KFPA 4CNPA 3NQFA 4CQ8A 2QUVA 3NXFA 5TQLA 1MEWA 1TJRA 3O07A 1AK5A 3LM7A 1OJXA 2NV1A 3EWBX 3TROA 1XBXA 5CSRA 4OGZA 1CI1A 3DI0A 1FCUA 4HNUA 3IVUA 4LW7A 4LVAA 3C2EA 2R14A 2J27A 3G24A 1QOPA 5DCBA 1OF8A 4LVFA 1MEIA 4QISA 1FDYA 4Z0JA 1SZFA 4GFSA 2VXNA 4K36A 1GYLA 1YXDA 3TC7A 2QEZA 5AHEA 3PUEA 4DF0A 5C5YA 4LVDA 4Q33A 3LERA 3IIPA 1JCYA 3T78A 2QCGA 3W1TA 4AB4A 2QCLA 2VFIA 3HGOA 1SPQA 5G2HA 1XI3A 4A29A 5F2IA 3N34A 3UWUA 1FCVA 5K9DA 4MYXA 4O16A 1JRBA 3UWZA 3KHJA 2E09A 3DFTA 4UR8A 3G1DA 1B3OA 1Q3NA 2JKEA 2XN0A 4O0ZA 3BGJA 2V9DA 1OX4A 2VEMA 3W7NA 2BTMA 2ZZ2A 3M44A 4LC6A 3W1PA 4FNUA 3S1XA 1VGAA 3SGUA 1NF0A 5HINA 1KFLA 5D2WA 3W2UA 4FNQA 1ZY9A 3WJWA 4LVBA 4E0CA 1TJPA 2VFEA 2A7NA 5D04C 1J4EA 1K7FA 3LHTA 5F1VA 2ZRZA 1TPVA 2YDAA 1JUBA 1TRIA 2FB2A 5DCEA 2ZTKA 4K8HA 3NL5A 4RZ6A 5CG7A 2CLIA 4UTWC 3KRUA 3TMQA 3NQ6A 4RX0A 3STFA 5D30A 2CLFA 1WA3A 8TIMA 1VJIA 3B4UA 2YYUA 4RLIA 4ZVJA 1OYCA 3JRKA 1L6WA 2KZHA 5HR6A 5IBXC 2C16A 1P0KA 4MPQA 1AMKA 1OX6A 4HSNA 4W9TA 2E77A 1Z44A 1LRTA 3IGUA 5K4ZA 1SW7A 2WSQA 3QQ0A 2C3ZA 1XBYA 1DBTA 2VEKA 5E93A 1XDMA 4J9JA 1KBIA 4JTUA 1NFBA 5AYYA 1KM2A 5CPMA 4N9CA 3HQ1A 3P62A 4S2CA 3NEVA 1H60A 1FQ0A 3F4NA 4HPXA 2GVJA 7TIMA 3P5ZA 4C1KA 1NEYA 3MYOA 3UPWA 3VKJA 1RPXA 2Q8ZA 4LRTA 2WSRA 3L9CA 4KFOA 3ATYA 3HMJG 5FF0A 3P7YA 5D03A 4IQLA 4ALDA 1BEUA 2A5HA 5C6MA 2ISVA 3VE9A 2DJXA 1H1ZA 5DY2A 5AHMA 1MXSA 2OMAA 4OE7A 4XBSA 3G0SA 5FF7A 4R7JA 2RDUA 3BG9A 1BKSA 4GXMA 3M16A 3UY7A 1AG1O 2CZFA 4JTIA 3TSDA 4IMGA 2A85A 4LT9A 4AMAA 4JYFA 4UTTC 1W37A 1GVFA 1H7XA 3YPIA 4ADUA 5LHEA 4AF0B 3KVJA 3CWNA 1H7WA 1KV8A 4H6KA 3UD6A 1L2UA 1KV5A 2GJLA 3LTSA 1WYIA 3MI6A 1OFRA 1HO1A 2DJLA 3LI0A 2R91A 1I2PA 3UQNA 2X30A 1F2JA 4HNTA 4N2YA 5CZJA 4UUIA 1EUAA 4CLMA 3EWWA 2V30A 3BW3A 4BF9A 4YCPA 3W3OA 3N14A 4O13A 3PG9A 4QNWA 1A50A 1RD5A 3P81A 3GVGA 3FLUA 4PTNA 1GTEA 1S5VA 3M6YA 2ISSA 1O95A 2ZYFA 4JDBA 1SFJA 1R47A 3MHGA 4Y8FA 1B4EA 1T8XA 4DBEA 4OU1A 2BX7A 2DZSA 3A9IA 3HB9A 4ONVA 4UMAA 2V2HA 3S5OA 5C2XA 4AH7A 2RHGA 5LNWA 4H3DA 1O94A 3FS2A 3CTLA 2X2GA 1IGSA 3FA5A 4O11A 3HPSA 4JTHA 1GWJA 1ME7A 1G67A 4JYEA 4DF2A 1OFAA 4UMBA 4ADTA 3TIMA 3NPXA 3CC1A 2ABAA 4NX5A 2PRHA 2C1HA 3NG3A 2PCQA 5FEPA 1Q6QA 2H3BA 1VCGA 3FKKA 4UTKA 3PWAA 4GE8A 4CNNA 1L9WA 1ADOA 4N9DA 3BW2A 3NAVA 1A5CA 3KAOA 1GVQA 1LOQA 2CWNA 3S42A 4EIVA 5LGZA 3SR7A 3LCLA 2WNQA 4NQ1A 1F6KA 5SWUA 1K8XA 5CGQA 1GQNA 2QCDB 1GVRA 1TCDA 1ZJIA 3CEPA 4IUOA 3WJXA 3S1VA 1THFD 3ABRA 3QMTA 3S8HA 4HT3A 2Y61A 4DF1A 3V1PA 1KM3A 1SSDA 3MO7A 3HG3A 4EF9A 1SZNA 3BV4A 3L67A 4GWEA 4X2RA 1F5ZA 4IXHA 4E2DA 4GJ1A 2QUUA 2AGKA 3GKFA 4XZ9A 3KRSA 4LS2A 1A53A 1VYSX 3GIYA 3NNTA 4AHPA 3R2GA 1TTJA 2W0UA 3TJLA 4O4VA 3STGA 1HL2A 1NAL1 1ME9A 1P4CA 3KVLA 4WUIA 1SQ7A 4WXYA 2QUTA 4IWWA 3G1AA 4XKYB 3P74A 3N19B 3K30A 3LV5A 5BNKA 4CQ9A 5AYXA 1FCQA 2C14A 2Y63A 4L4MA 4EOUA 4NXSA 3FIGA 2EPHA 2NXGA 2V5BA 4JX4A 4YXGA 1TTPA 2RFGA 4K7YA 3LDVA 5EA9A 1DHPA 2GQ8A 3CQ0A 3LTYA 1LTDA 1SO6A 3GXPA 3P60A 3PC0A 2WJZA 4FIRA 4JGDA 1TTIA 3ZWSA 4L4LA 2QCCA 1DVJA 5F4XA 1ICQA 2B4GA 4TIMA 2E5DA 2AAMA 3NQAA 3EEGA 4MZ1A 4WJEA 3VCRA 4HNNA 3L0GA 1YYAA 2GUUA 4NJIA 1VLIA 1R30A 3LHVA 5J5RA 3NO5A 3W2NA 3BW4A 1Q6OA 4GC4A 1LCOA 2Y7DA 3G3DA 3HG2A 1DORA 3PF3A 3NGJA 4BWLA 2ALDA 2ATMA 3IGSA 5K9XA 3W72A 1NVMA 3W7IA 3NM1A 5D2TA 1KBJA 1J5TA 1OABA 1JCNA 2A6NA 5D32A 1LOLA 5DLCA 4O15A 3CM4A 3LLFA 2W6RA 4UNLA 1VR6A 5KMYA 2G97A 4NXKA 3LXBA 2Y88A 3C2RA 4KKXA 5AOUA 5EYWA 2H3DA 3VI2A 4ZQOA 4NJJA 3UNDA 4QJ1A 1SFLA 3C2OA 3P8JA 4JIQA 5J5DA 3WK1A 3LGEA 4MIMA 3V75A 2IQTA 4PA8A 3P84A 4FNRA 4WY0A 4OWGA 3C61A 1GOXA 3DGRA 2DP3A 4K8EA 1VH7A 4MUZA 2GQ9A 1W0MA 3WK3A 3W84A 1N55A 1VLWA 3RFAA 4G1KA 1JUEA 3G1VA 3GNDA 3HO8A 1GYNA 2YPIA 1YDVA 3M5VA 2E68A 3PM6A 3DENA 4RXGA 3W9ZA 4R34A 1PHQA 1P1XA 3F1QA 1QDSA 1A5SA 2O7SA 2NUYA 3NQCA 5ABTA 4MVAA 1VC4A 3W75A 4Z1DA 4E38A 3W2LA 3LOTA 1I4NA 4O53A 4PFMA 2OJPA 2WKJA 3NQGA 3P82A 3LB0A 2EHHA 1UASA 2G95A 3A5VA 1G69A 3LHYA 1OFQA 2Z0IA 4IPIA 3SSJA 1XUUA 4Y96A 4YLWA 4JEQA 1OVDA 3GDLA 3W1AA 3P67A 2HS6A 1LZOA 2PRLA 2VEPA 3GDKA 3DAQA 3A22A 3LX9A 1D3GA 4LU0A 4IMFA 3LLDA 1G7VA 4BK9A 2DORA 5E1QA 1VS1A 4AAJA 1P5BA 4PCFA 4M19A 3TAKA 3E02A 2B7OA 5AC8A 2ZRVA 5H91A 1IF2A 1W5OA 3EXTA 2FIQA 3S6DA 1K8ZA 1AW1A 3O63A 5I3KA 3R13A 4HSOA 3W7QA 5DXYA 1TTQA 3BPWA 2A21A 5G4WA 4ORMA 1TPC1 3DH7A 3EKLA 1RV8A 1SSGA 3EXRA 4Y90A 3W1NA 4ZZ9A 3W71A 4YWIA 3M0ZA 1F7BA 3FJLA 1OF6A 1QOQA 3GDTA 3GDRA 4UFIA 5FF2A 3W2KA 3W76A 2YR1A 4FHAA 3W74A 1JCMP 4JX6A 4IOTA 4A2SA 1N8FA 2JGQA 3VE7A 3FEMA 4IJBA 5HULA 4PODA 2FB3A 2WNZA 1XKYA 2Y7EA 4R33A 3QW4B 1OK4A 4OBTA 2X1UA 2ABBA 4LC8A 3S0CA 4N02A 4O57A 3G18A 3NPWA 2BWGA 2O7QA 1MO0A 4O50A 3GZ3A 4D2JA 1KTCA 5F2LA 1C9DA 1ONRA 5CZ0A 3TXZA 1YXCA 3SI9A 4LV4A 4KWWA 4I9AA 2X1SA 1EX5A 1R2SA 3P8IA 2Y7FA 1JVNA 1VRDA 4IXXA 2ZBTA 5TBOA 3EWUA 3SY5A 3QW3A 1HUVA 2ZA2A 3MMTA 3GYEA 3LBCA 5BRBA 2OZ0A 4NZFA 2OT0A 1T0OA 4N9EA 6TIMA 5F4SA 4O1AA 2V0TA 4Q4KA 1H5YA 3NQ7A 3SZ8A 5A5WA 3LCGA 3G1SA 3S1WA 3SIZA 2QCHA 4RZ4A 2EGZA 3I7RA 1WOAA 3IIXA 3RU6A 4LOCA 3KXQA 1XDLA 3M43A 5D2VA 2GOUA 2X1TA 4JYDA 2BXVA 1W54A 1H51A 2Z6IA 1V5XA 3F03K 4UFJA 1H61A 1IXQA 4I7VA 2QJIA 5F2MA 5L6UA 4WZHA 5AFDA 1DQXA 4WQ6A 3W88A 1NF7A 1W1ZA 4O8RA 1TSIA 1BWKA 3QRHA 1MZHA 4WY0F 2R8WA 1OX5A 3W07A 2QCMA 4QM1A 4LS1A 4AEOA 5FF4A 3GR8A 3I68A 2B0MA 4M6VA 4O1BA 1EP3A 3MHUA 5K3VA 3OVQA 3LXAA 2E5CA 4O17A 4ZQCA 1WBJA 2CZEA 1KFBA 3TR2A 3QSTA 2FPVA 1OX4B 1N7KA 5LHFA 4AWUA 5FEWA 3W87A 2ZZ7A 3TQ0A 2NWRA 2J9ZA 5DCDA 4MJMA 3W7LA 4MJZA 1KW1A 2YX0A 2LLEA 2RDWA 3B05A 1TPH1 3IIOA 1JQVA 1VZWA 1M7OA 2P10A 4MLJA 1PS9A 1X8FA 2BLEA 1SZGA 1YLVA 3SJ3A 4DXVA 1YPIA 3TUUA 4O0KA 1YTDA 3C2VA 2Q3RA 4ICNA 4GNJA 4YL2A 2NWSA 4JTJA 4FIQA 3CIXA 5K2ZA 5AHLA 2Y7GA 3W2MA 2CW6A 4K37A 4IX0A 1O5KA 3L0NA 3TFXA 3W6YA 1QO2A 3OA3A 1M6JA 5EMUA 3M7WA 1OYAA 4POCA 1ZALA 5KINA 5CZSA 1BTMA 5FEXA 1EP2A 2ZTJA 1S5WA 2NV2A 4R53A 2HMCA 3UWWA 4DPQA 3G1XA 2Z1BA 1I2NA 5C54A 2J9XA 5LNUA 5T26A 4M5PA 4KWVA 2B7PA 5LKYA 4CCDA 1G4SA 3IGXA 2VOMA 2E6AA 3QMSA 2C19A 2VFGA 3TMLA 4JR5A 3MYPA 3LV6A 3W1XA 4JTSA 2Q8LA 1H7RA 1AL8A 1G4TA 4TO8A 1GG1A 3W86A 4BR1A 5CKSA 2I9EA 1JJKA 1LP6A 1G6CA 5K4XA 3L0KA 3W1MA 1E51A 2E6DA 3CWOX 4MFDA 2NXHA 4UFMA 3MP3A 3TE9A 5DBUA 1KM5A 3T7VA 1FCBA 3A5FA 3FFSA 3MW7A 1YXYA 4UXDA 2G5WA 3HPZA 3L2IA 1QMLA 3I65A 4WXZA 4GUFA 4OV9A 5F4WA 3W7MA 4U4MA 1SU5A 3HGJA 4PL2A 1P0NA 4UTUA 5L9FA 1DL3A 3NL2A 3QC3A 3CPRA 1LOSA 1TPUA 2NX1A 3STEA 5HNRA 2DU2A 3T44A 3W1RA 1SR9A 1YDOA 4QQ3A 2BZNA 3U6WA 2CLEA 4RK8A 1UUMA 5HWNA 3W22A 3T55A 1KA9F 2Y6ZA 3N2XA 3TH6A 1UUOA 2GVLA 5HJLA 2QAFA 4Q32A 2NX9A 3L5AA 5AC6A 3PY2A 5MHBA 3PAJA 5FI8A 5FF3A 4IMEA 5D09A 3L68A 4ZMGA 3EXSA 2AQWA 1W8SA 3DKJA 3UY8A 3GK0A 5AHIA 1OHLA 2YXGA 2OX1A 3LBMA 3BLFA 3Q37A 3NQ8A 4FNSA 3QSRA 3O6YX 1MSSA 3HJZA 2FPYA 4B5NA 4BI7A 1ME8A 1TREA 5I3IA 3PSWA 1AW5A 3L66A 5AYZA 3UWQA 2JGYA 2WQPA 2A7RA 4WOZA 2J6XA 1TYGA 1O5XA 2E1DA 1H7NA 4HHPA 3OIXA 3NL6A 4LUJA 5HWMA 1VQTA 3IRDA 5BW6A 3N2MA 4PEKA 1ICSA 3B0PA 5AB3A 3ABQA 3ZWTA 4NNCA 4BWLC 3IEBA 4M6PA 1F6PA 2NZLA 3R8RA 3QJAA 3T4CA 2JKPA 1FDJA 5G2WA 4ZL1A 1KFJA 3TSMA 2CLHA 3TXVA 3DZ1A 2A7PA 3QZEA 4S2BA 2G96A 1RVGA 1PL9A 3GAYA 3F4WA 2GQAA 3QPYA 4MY1A 3DHFA 4UFHA 4FXSA 4MY9A 3EX3A 2C18A 5DBTA 1VHNA 2ZZ4A 4DO4A 3HG4A 4NVTA 1YPFA 4AHOA 4ADSA 3QYQA 1WV2A 2F84A 1GZGA 4ZQPA 3C52A 3QPZA 4FNTA 3A24A 2RH9A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4EWND

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