4EWN | Genus

Total Genus 82

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	82
sequence length	249
structure length	243
Chain Sequence	LAKRIIACLDVKDGRVVKGTNFENLRDSGDPVELGKFYSEIGIDELVFLDITKTMLELVEKVAEQIDIPFTVGGGIHDFETASELILRGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVAIVAKRVDGEFMVFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRVGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADAALAASVFHFREIDVRELKEYLKKHGVNVRL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	A sugar isomerization reaction established on various (beta-alpha)8-barrel scaffolds is based on substrate-assisted catalysis pubmed doi rcsb
molecule keywords	Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF
molecule tags	Lyase
source organism	Thermotoga maritima
total genus	82
structure length	243
sequence length	249
ec nomenclature	ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2012-04-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
D	PF00977	His_biosynth	Histidine biosynthesis protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4ewnD00

3MP3A 4G1KA 4I7UA 2YGYA 4HPXA 3TSBA 1TPH1 5H91A 3NR0A 3TH6A 4A21A 1LBMA 2YR1A 3DHDA 1JCYA 5DBUA 1ZAJA 2H3DA 4BFAA 2A6NA 2X30A 4HNUA 3OIXA 3CHVA 4JY8A 3U6WA 1H1ZA 1W5MA 3WK1A 2VFHA 4LS2A 2XN1A 3HGOA 5D2TA 2OT1A 3RMJA 4JGDA 3WK0A 3DFNA 3H53A 3W1RA 5D32A 1DJQA 3L5AA 1YPFA 1LP6A 4N9EA 3BVJA 1X7FA 5LHEA 2GVJA 2QCCA 4O12A 5IM51 5G1YA 3KVLA 1XBXA 3EWUA 4JTSA 4JTGA 2DZSA 3NQMA 4PCFA 1GVRA 4TO8A 2E1DA 1QMLA 1J5TA 1W31A 4LUJA 3W7JA 5D05A 5D2XA 5HQEA 5AOUA 1WBHA 4HSNA 1FQ0A 1JCMP 4O1CA 2QCFA 2VFIA 4K7VA 5EYWA 3R5EA 1D3HA 4JY9A 4AVFA 1SFJA 3OG3A 2VEKA 3UNDA 3O06A 3WK2A 2W0UA 4NJIA 5LNVA 1G69A 4JYFA 4NZFA 5CGQA 3M5ZA 3W1PA 3EXRA 1TPWA 2AQWA 3P81A 3W7GA 3BPWA 4UTUA 3UZJA 4UTHA 4JTUA 2CZEA 4JN6A 4DO6A 3MHFA 3PBUA 4TU1A 4N02A 3MHUA 2NLIA 1SQ7A 1DORA 2ZZ2A 2FIQA 3QH2A 4HNTA 3RF9A 3SECA 4CQ8A 3W2KA 1ZCOA 2A1YA 3BLFA 1GTHA 3HB9A 3NQ7A 5DXXA 1MEWA 1TV5A 4N9DA 3LHZA 4BF9A 3W84A 4MLRA 4JEQA 2C3ZA 4WOQA 4JX5A 3WJZA 5BRBA 1WV2A 5HMSA 1SZEA 1QAPA 3L67A 3NQ8A 3PBWA 1BTMA 1FCUA 2V5BA 4KFPA 4UR7A 1Z41A 2ZYFA 1ZALA 1YTDA 4YXGA 1GT8A 4NZJA 5AHIA 3PC0A 5E93A 3WJXA 1G67A 3F4WA 1H51A 2C14A 1KM0A 1QOPA 3FKKA 3NPXA 3C61A 1NAL1 1YXDA 3GXTA 4UNKA 4UFHA 1FXQA 3W85A 5AYZA 4DQWA 2NX3A 2X1RA 2Y7DA 4FHAA 4OE7A 1KTBA 1Q6RA 2DZUA 4QM1A 4XKYA 4HHPA 1IIHA 3S5YA 2X2GA 3G1XA 4JTEA 1QDSA 4EF9A 3W87A 1ML1A 4OV4A 5LNSA 3T40A 1O5XA 3VE9A 1JCLA 3LCLA 3I68A 1SW7A 1JCXA 3M7WA 5CPNA 3LHTA 5EBUA 3IGXA 4GUHA 1SZNA 3OVQA 3W07A 4CNOA 5ABTA 2YW4A 5DCDA 1W5QA 3W71A 4QAIA 3LHUA 1OJXA 1PV8A 1QPRA 4UFLA 2EPHA 3T4CA 3EX4A 1P4CA 3W7HA 3LTSA 3SI9A 3NQDA 3BLIA 5FF2A 3FKRA 5IBXA 4RX0A 1IGSA 4AWTA 1KV8A 2QEZA 1VHNA 4OHQA 3W1NA 4O4WA 5LGZA 1AL8A 2DZXA 1XDMA 3QPZA 3MMTA 1K3UA 2H8ZA 2Q3OA 5AC8A 2ZDRA 3RLUA 4XKYB 2CW6A 1D9EA 1DOSA 4PC8A 1GWJA 4I7VA 3A21A 3BG9A 4IX0A 3PUDA 4MOZA 3I65A 1QFEA 1LRQA 3UWZA 1TRIA 5J5RA 3C2VA 1W54A 4XBSA 3USBA 4MYXA 2YFNA 1TPEA 2J6XA 5I3HA 4AWSA 1W5NA 5HWNA 2ZRZA 3CM4A 2ZFAA 2PCQA 1LLWA 4EOUA 5LNUA 3G1DA 3GNNA 3M47A 2H8XA 5AYXA 3C2RA 1QWGA 4LU0A 3TIMA 4JDBA 3NL5A 4NQ1A 1EP3A 4LRSA 4AH7A 3NQVA 3HPSA 4ZZ9A 4D2JA 1OX5A 4OGZA 4A22A 4DEFA 1DHPA 4MLJA 4C1LA 3LXCA 4ZQCA 3DFTA 2Y88A 3LRMA 3LI1A 4AEOA 1H7XA 3ABQA 1OYCA 1JUKA 2B4GA 1HL2A 1E51A 3T44A 3KOFA 2FLIA 4KWWA 1R2SA 1XI3A 4I9AA 4UMCA 4JTJA 2E5CA 4RKAA 2B7NA 3GDRA 1J2WA 4Z08A 5CKSA 3UWVA 2LLEA 3T78A 4ADSA 4WQ6A 5F4SA 2ISWA 4PL2A 4GWEA 2ZCGA 1KW1A 5LSMA 4A3UA 5DY3A 4M19A 2O7QA 2NX9A 1VCFA 4O11A 4O1DA 4UNLA 1R2RA 1DJNA 5F2IA 1NF7A 3W1MA 1JCNA 3KHJA 3TMLA 4FIQA 2VFFA 5I3JA 3W9ZA 4X3ZA 3NQ2A 4WOZA 4MJZA 3PUEA 2GVGA 4JYEA 4O0KA 1F76A 3C8FA 1L9WA 3S5ZA 3EX6A 2FB2A 3HG5A 1A5CA 1XUUA 2Y85A 2QJHA 4MY9A 2BTMA 3CTLA 4IUOA 1OFDA 5KZEA 3HO8A 2A21A 4DELA 1EPXA 2VFGA 3GNDA 4R53A 1K7XA 4ZQPA 2R8WA 1RR2A 3ATZA 1KM1A 3IIZA 1EUAA 3LCFA 1P5BA 2ZA1A 4EWND 1XDLA 1L6YA 1G4PA 3NG3A 7TIMA 4DO4A 2J9ZA 3DU0A 1BKSA 3HQ1A 3W74A 2Q3RA 3G3DA 1PS9A 3IEBA 1JJKA 2E5BA 4QNWA 3NVTA 5DY2A 3DFPA 1F6KA 3P5ZA 1MEHA 1LOLA 4JTFA 2GVLA 1KFKA 1TTQA 2ZTJA 4BK9A 4O52A 3ABSA 3MHGA 1ICPA 3GDMA 3GX9A 3DHFA 2Z6IA 3C6CA 5BNKA 2Z1BA 3A5FA 3QYQA 4UFJA 4U4MA 2Y6ZA 2C15A 4EIVA 4HPJA 2QCDB 3B03A 3NXFA 3EEGA 4HKPA 3P74A 3BARA 3EXSA 1J4EA 1BEUA 1OX4A 3N9SA 2C13A 2XFWA 5K9XA 3M6YA 4OT7A 3MUXA 3AJXA 2Y63A 3G3MA 4MJMA 3EXTA 4QQ3A 2DJLA 5E0KA 4K6AA 1KA9F 3PSVA 3EX3A 1QPNA 4TMCA 2EGZA 3W1QA 1UBSA 3L5LA 3I7SA 1WQ5A 5SWUA 4QSHA 5CSSA 4FB7A 3NDOA 2G5WA 3L66A 1SFLA 5K4XA 4ZVJA 1SZGA 4FXSA 3PF3A 3TQ0A 5HNRA 4JYDA 1FCVA 2DORA 3R13A 4WXZA 4HT3A 4MY1A 3W70A 3TR2A 3B0UX 5FI8A 2QUUA 3QQ1A 2B7OA 1OK6A 4LUIA 3CLMA 6TIMA 2R14A 3RLVA 3FYPA 1AL7A 3FJ6A 5FF0A 4FX7A 3IVSA 1VYSX 2V0TA 1EP2A 1XBVA 1TTJA 5G1TA 3V75A 1LCOA 1NSJA 1OX4B 3ZFHA 2E77A 5EY5A 4WUIA 5AHMA 3GR7A 4YLWA 1LTDA 2QDHA 3TK7A 3WK3A 4M6PA 3T55A 1MZHA 2J9YA 3MI6A 3I6RA 4N2YA 4ORMA 4LVDA 1KM5A 4Z1AA 1ADOA 2PRHA 1K02A 5BMWA 3H54A 2W79A 4RK8A 1H7NA 1UB3A 3PAJA 2NUWA 4L4MA 1N7KA 1T96A 4PFMA 4MFDA 5AC7A 3WJSA 1S3HA 5DN1A 4J9JA 4A2RA 4M5PA 3TQVA 1I4NA 1AW5A 3UWQA 3EWYA 2ATMA 3P67A 1FCBA 2ISVA 3PG8A 2BLEA 3NPUA 4LC6A 3C2FA 3HPZA 4YMZA 1FWSA 2VOMA 3HJZA 1C8VA 3QM3A 4IMFA 4NVTA 1OX6A 3MJYA 4FXRA 3W76A 2BSLA 2EAWA 5EL1A 3FLUA 3EB2A 5FEPA 3SFKA 4O57A 4POCA 2ZRUA 1H7RA 3G1SA 5AYYA 4CLMA 1OFBA 4CQ9A 3IIVA 3QPYA 4XTDA 5BMXA 2P1FA 2E6AA 3NL6A 3K30A 3SIZA 3W23A 4O13A 4RZ5A 2YCEA 4EVZA 2YPIA 3N2XA 4K8EA 1FY6A 3INPA 4IWWA 4UTWC 5HR7A 3NL2A 3LCWA 4TX9A 3N3MA 2VELA 4Y8FA 4HIBA 4UIOA 4Z1DA 3ZWTA 1B4EA 1H7PA 3BG3A 4DBDA 3UWYA 1T8XA 3TROA 2YXGA 4K37A 3DI0A 1DQXA 4RXGA 4LNYA 3HGSA 1VCVA 3L0GA 4GJ1A 1JULA 1LBFA 3W2MA 1XKYA 3G8RA 1ICSA 4TR9A 2JK2A 5K4ZA 3IGSA 4FX6M 4KWVA 3VFLA 3B0VC 4TMBA 3UWUA 2ZZ4A 3C4UA 2ABAA 2JGYA 3JS3A 3MYOA 4P61A 4XTIA 1SW0A 2R91A 3O8AA 3STFA 4EF8A 2CWNA 3N14A 1LRNA 3PBVA 4K36A 3TSDA 1IIGA 1O5KA 1H5YA 4JICA 3OBKA 4GC4A 1BWLA 3L68A 1TO3A 4JD4A 4S1FA 3OVPA 1ICQA 1VR6A 2DU2A 4MFEA 1I45A 1H61A 2HSAA 3PG9A 4DXVA 1U83A 1H62A 3PY2A 2BZNA 1TB3A 2CLKA 3LM7A 3QSTA 3W1UA 4CCDA 5F1UA 3LBCA 5C55A 3A9IA 3QMSA 3TUUA 1V7YA 4QISA 3NQEA 5C5YA 1IXNA 1GVFA 4QIUA 4JTIA 4K8HA 5G4EA 2NUYA 3S9YA 5LZLA 2A5HA 4ICNA 1OG0A 2Z6JA 1PHQA 3BW2A 1T0OA 3MBFA 4Z0SA 4PH6A 3L65A 5FF3A 4RXFA 3P62A 1YADA 2YZRA 4CQAA 1RPXA 5A8GA 4ZQNA 3DI1A 2QR6A 4IOTA 2WKJA 5FEZA 4X22A 2PC4A 1HG3A 1YDNA 5AHFA 3M41A 3Q37A 4NT0A 2NXGA 5G5IA 1HTIA 1L6SA 1EWEA 1O60A 1QPQA 2E6YA 3W2NA 3JR2A 1FWWA 3LCIA 4A2SA 1YTKA 4GUIA 2I9EA 3VKJA 2GUUA 4MY8A 4FNTA 2ZQ0A 3P60A 1GQNA 1M6JA 3W7DA 5K3VA 4OU1A 4FO4A 5I3FA 2GPTA 2YFOA 5L6UA 3P8IA 4LV4A 1M7PA 4CNPA 1JQVA 1PCKA 2NWSA 3TDFA 2FFCA 5AHLA 1GG0A 4JNMA 4IQLA 2BX7A 3SZ8A 1KFLA 2E6DA 3P84A 2JKEA 1VC4A 2ISSA 1O94A 3GKAA 5F1VA 1THFD 2XN0A 3G1VA 3S1XA 3W22A 2JKAA 1IXOA 2G95A 4NX0A 8TIMA 1B57A 2JBMA 5C6MA 3R8RA 1TV7A 1YDOA 2ZRXA 3GK0A 2QF7A 2A7RA 2YSWA 1F5ZA 3E9AA 3NYZA 3O05A 1H60A 3A23A 3GDKA 2VENA 3NQ6A 1PCWA 3W7EA 3G24A 2FPVA 4WXYA 4RCXA 1F2JA 1C29A 2TYSA 3SR7A 1H63A 1I2OA 3STCA 3F4NA 3MP4A 4O54A 1HO4A 4MVAA 2QDGA 4OV9A 3W7RA 2CLEA 4BI5A 4MZ1A 3M5YA 5K9DA 4IPIA 1Q45A 4JR5A 4DPQA 5LGXA 1B4KA 4XQ6A 3LV5A 3C2OA 3IVUA 4N9CA 2ZTKA 1DBTA 4O50A 1N8FA 3NOEA 3GZ3A 3A5VA 3MWAA 3W75A 3W86A 2QKFA 4BWLC 4CCEA 2WQPA 3G0XA 5F2MA 4WY0A 4Q33A 1VYRA 1O95A 3NAVA 3S1VA 3KX6A 3TE9A 3FA5A 1TQJA 1GYNA 2H3BA 3G0SA 4NUWA 1W5PA 2A6LA 3JRKA 1C9DA 3CEUA 4L4LA 1SO5A 3HGRA 1R47A 4AMAA 3TC7A 3PULA 1R46A 3B8DA 1PL9A 5DXYA 4UTTC 3CEPA 3EX1A 2E6FA 3I7QA 4K39A 4HSOA 4O18A 1RQEA 5DBTA 5D2WA 3P7YA 3NNTA 4U28A 2QJGA 1WXJA 4PODA 3W7QA 2BXVA 4CNNA 2V8ZA 2A7PA 5G2WA 1WX0A 1QO2A 4BI7A 1VPXA 3CPRA 1SO4A 3CU2A 3KVKA 3W1LA 3YPIA 3CB8A 4JTLA 5LNRA 1TMHA 3DAQA 4NJJA 5D38A 2C18A 3DZ1A 4FF7A 2ZZ5A 1G6CA 1S5TA 2KZHA 3LTPA 4AAJA 3C0JA 2A2IA 2RKXA 3GDLA 3T7VA 4WY0B 2EF9A 2QUTA 2FQIA 1FX6A 1NFBA 2ZZ7A 2TRSA 5F2LA 4NJGA 1VHCA 1RD5A 1K8YA 1RV8A 4A29A 3TC6A 1AK5A 3ELFA 2Y62A 4N6EA 2CZ5A 1ZY9A 1WYIA 1ZNNA 5FEWA 2QCEA 2C1HA 4WJEA 1ME9A 1H1YA 3GLCA 2J9XA 2V2CA 1A53A 4ALDA 1X8FA 4S2CA 3HG2A 2ZZ1A 3Q58A 3S1UA 1OFAA 1YXCA 4JX6A 4Z0JA 3LCHA 4NJKA 3TKFA 5U7SA 2Q8LA 1WOBA 1X1OA 1IF2A 4MUZA 5LHFA 1ZENA 1WAUA 1X1ZA 3KFTA 4UTIA 1K7FA 3BK0A 3ZWSA 1Z44A 2EKCA 2CLOA 1KV5A 4UC5A 3M43A 3TAKA 3QFEA 3STEA 5F4WA 2QCGA 2HS8A 1WA3A 5F2GA 1TPDA 1XL9A 1DL3A 1H7OA 2WJZA 1ALDA 1DQWA 2NZLA 1MXSA 5K7JA 4ORIA 5HUPA 4GRSA 2WNZA 5G4WA 5KMYA 2FPTA 3L0NA 2ATSA 3TX9A 4LT9A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4EWND

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