4F66A

The crystal structure of 6-phospho-beta-glucosidase from streptococcus mutans ua159 in complex with beta-d-glucose-6-phosphate.
Total Genus 186
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
186
sequence length
478
structure length
478
Chain Sequence
AMSKLPENFLWGGAVAAHQLEGGWQEGGKGISVADVMTAGRHGVAREITAGVLEGKYYPNHEAIDFYHHYKEDVKLFAEMGFKCFRTSIAWTRIFPKGDEAEPNEAGLQFYDDLFDECLKYGIEPVVTLSHFELPYHLVTEYGGFTNRKVIDFFVHFAEVCFRRYKDKVKYWMTFNEINNQANYQEDFAPFTNSGIVYKEGDDREAIMYQAAHYELVASARAVKIGHAINPNLNIGCMVAMCPIYPATCNPKDILMAQKAMQKRYYFADVHVHGFYPEHIFKYWERKAIKVDFTERDKKDLFEGTVDYIGFSYYMSFVIDAHRENNPYYDYLETEDLVKNPYVKASDWDWQIDPQGLRYALNWFTDMYHLPLFIVENGFGAIDQVEADGMVHDDYRIDYLGAHIKEMIKAVDEDGVELMGYTPWGCIDLVSAGTGEMRKRYGFIYVDKDDEGKGTLKRSPKLSFNWYKEVIASNGDDI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title GH1-family 6-P-beta-glucosidases from human microbiome lactic acid bacteria.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative phospho-beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus mutans
total genus 186
structure length 478
sequence length 478
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.86: 6-phospho-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2012-05-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4f66A00
1K9EA 2XFRA 4W7VA 2YDQA 3FAWA 2ZUNA 4N42A 2OYLA 3ZJ7A 3N11A 4JCLA 1MQPA 2CNCA 3VMOA 1HJVA 1XSIA 1GOMA 3GH4A 3OZPA 3T2PA 1VEOA 3OLGA 2PC8A 5CPSA 2D24A 1G5AA 4QLLA 4PTMA 2VR5A 1H41A 1J9YA 3VIJA 4NSBA 4N0RA 4HU0A 1JFXA 4AIOA 3ZOAA 1KCKA 3EDJA 3CHCA 3NDZA 1UR9A 5HBFA 3U5YA 1E6QM 3MMUA 1DWGM 4OOZA 1V0NA 2ZXDA 3WNLA 1QNQA 3ARSA 4BQ3A 1RP8A 5GQBA 2O9TA 3VMNA 1K9FA 2GSJA 3OGVA 3W24A 1WB0A 1R85A 3EBVA 4AD1A 3VM7A 3AS3A 3SUWA 1XD1A 2CBJA 5CSUA 1E3ZA 2ZUUA 1E4LA 3FAXA 3GM8A 4L4PA 3RIKA 3NUKA 3MO4A 3GXDA 3TP4A 1E6SM 4D1JA 2WSKA 3WNMA 4CU7A 3ZJ8A 2VTFA 5FIPA 2VT0A 1NOUA 2J4GA 2EXOA 4OIFA 1EA9C 3VD7A 1EQCA 1HJWA 2JIEA 4M8UA 3VIOA 3B9DA 4HMDA 1CWYA 3CHDA 1WDSA 4E8DA 3WBEA 3OBAA 1W9DM 2YBTA 5ABGA 2Q8XA 1X6LA 2BY1A 3W29A 2EO7A 3IAQA 4WF7A 1UUQA 2D0GA 3N1AA 3AFBA 4LPCA 5EFDA 2OSXA 4RL3A 2J7CA 3OG2A 1JD7A 1NP0A 5AYIA 2VVSA 1NWUA 3WUGA 3QHMA 3WDPP 4WJXA 4D72A 2XG9A 4B9ZA 1OIMA 4Q7NA 3AMKA 4PRWA 1SMDA 4UQEA 5IHRA 2WPGA 5IFTA 3RILA 4X0NA 5C71A 1XYFA 3AIQA 4UFIA 3OLEA 4NI3A 2YLAA 3WDQA 4M82A 3BAWA 2BFGA 2W91A 4XB3A 1HL9A 1BYBA 2HVMA 3S6TA 2VVNA 1E1FA 3ZSTA 2XIBA 5ABEA 1DWAM 1B3VA 3IK2A 4QDMA 4KGLA 3B9AA 3W37A 2G41A 1V0LA 1HNYA 3WBAA 1BSIA 4HOXA 2W62A 2FGLA 4HOWA 1KXQA 1E55A 2WNWA 4Z2JA 1SFSA 2GJPA 4B3KA 2BY3A 1Q4NX 1BYDA 1RP9A 2Y5EA 3AMDA 3SIMA 2YKKA 2C8NA 1CXFA 4PMDA 2J8FA 1SMAA 1J0KA 5IHSA 4LYPA 1W32A 1PX4A 2JALA 2DT1A 5A6AA 1JZ8A 3HN3A 4HZ6A 2D0HA 3VU2A 1WZKA 3W38A 1HT6A 3MSGA 1KWGA 1JYWA 1BQCA 1JXKA 3WUBA 1D3CA 1FA2A 5JIWA 3CUHA 1B30A 1GOWA 1CPUA 4UFMA 1W1TA 2W67A 3KL5A 1I1XA 1H49A 3GH5A 2XFYA 2XTKA 3MANA 4AZCB 1EO5A 3ARWA 5D9NA 3FW6A 3N17A 4RE4A 4JZ5A 4AEFA 3GBDA 4ZEPA 1UR8A 1MFUA 1LF1A 3QR3A 1LG1A 3PHAA 1OIFA 4AZ6A 1E40A 4V2XA 3I3EA 1C93A 1QBBA 1KBBA 1W2VA 3AS1A 4C7FA 2YA0A 1GOIA 2DH3A 1GQKA 1SYTA 1C3FA 1HXJA 1E3XA 1US2A 2D3NA 2BY0A 4W93A 5KZ6A 4AZ5A 3SCOA 3W27A 1EDTA 3WH9A 3ZT5A 3WH5A 1C8YA 1V3MA 1BLIA 4GO8A 2CBVA 1JZ7A 3WMSA 4GINA 2WMIA 2ZX9A 1CGUA 1B2YA 5D8ZA 3ZSSA 3VGHA 4DWSC 3DYMA 3T2QA 1HJXA 3PBGA 4MPKA 2FGZA 3L4UA 4MJ2A 4AXNA 2CCRA 2GK1A 4FLQA 4QAWA 4W86A 2VZTA 3NSNA 1CXIA 3VNZA 4D6CA 3PZIA 1W3HA 4KWUA 5LA2A 5A6JA 3BLKA 4M56A 4X0VA 4QFUA 3WKZA 4JL1A 2YLLA 2V5CA 1WE5A 2NT0A 1OT2A 1E6RA 5E9AA 7CGTA 1EIBA 2X05A 5D8WA 4P8UA 1WZMA 1WKYA 4IM4A 1B3WA 3AQUA 1KXVA 3FY1A 1V6UA 4M81A 1MW1A 4AZBA 1ISZA 3VOCA 4GXPA 4BF7A 4CGTA 5ABFA 1G94A 2E9BA 4H8VA 1W3LA 1V3JA 2WCSA 4LYQA 3MMDA 3WFLA 4HPGA 1H3GA 2PB1A 3MUY1 5BYWA 2DIJA 3AZSA 2WM0A 1CENA 4HTYA 3DHPA 2BHYA 2FDMA 2A3AA 1GVYA 1NQ6A 3WN6A 2D22A 3AYSA 2DT3A 1D7FA 2WLZA 1HKIA 2Y2WA 3OA5A 3UG3A 1UD4A 1ZJAA 1GPFA 4IPLA 1H1NA 1HP4A 2VNCA 2XM2A 5CPTA 2ZUMA 1HN1A 4PMZA 2WHKA 1MQQA 1ZB5A 8A3HA 1QPKA 1HKMA 5M03A 4UR9A 2BHUA 1UA3A 2PWEA 4W85A 1V3KA 3MUAA 2WMJA 5EMYA 3UERA 5IFPA 4UTFA 5HPOA 3U5UA 1JFHA 1ISWA 3SCQA 1W9BM 2CYGA 3BMWA 1J01A 3SCWA 5A1AA 3VIHA 1K6AA 1UD5A 4DM1A 2DH2A 3FXYA 1BYAA 1UZ4A 2OSWA 2F61A 3THCA 5JBDA 1JZ6A 2PWFA 4FLSA 5EFFA 1HJSA 1MW0A 3BCFA 4H8HA 4HP5A 4J3UA 2W63A 2OYMA 4UOZA 2VOTA 2VX4A 2XPKA 2PI6A 1CGXA 2A3BA 2E4TA 3GDBA 3UR7A 4AD4A 3RCNA 4A3YA 1IZJA 1AQ0A 2E9MA 2FHFA 5DT7A 4MAZA 3JUGA 1UWUA 3GNPA 4UQDA 7A3HA 4DUVA 1J0YA 3VM5A 2BV9A 4PN2A 2WMHA 2D2OA 2XGIA 2YA2A 3QOMA 3L4YA 3AXXA 1DWHM 8CGTA 4UZUA 1XH1A 2YDSA 3SUVA 5ABHA 3BGAA 2NSXA 1UKSA 2VI0A 1U2YA 2VX7A 4Z2LA 1GQJA 1TZ7A 3WQ8A 1JI2A 4LXFA 3WDIA 4ZXLA 3UG4A 4H8UA 1NP2A 1W9VA 3WD2A 4C7DA 4W89A 4PMXA 1JYXA 1W3JA 3BAJA 2WLYA 1KB3A 3WENA 4JL2A 4UQ9A 3WD3A 4KRTA 1PX8A 3ARZA 1ODZA 2YL5A 3CUGA 4FLRA 3CUIA 5D9PA 5JBEA 2QF8A 2XIIA 4J3VA 5LA1A 3TOPA 4B3LA 3IANA 1Q6DA 4CN6A 1QI4A 3FHAA 5IDIA 1WZAA 3PZTA 1UR2A 4H41A 4QLKA 3TTOA 2CHNA 2UY3A 1QNPA 1M03A 4MNMA 3BLPX 4UOJA 1BFNA 4M1RA 3EDFA 9CGTA 3I3BA 2IXVA 2WC4A 3NIYA 1LQ0A 1MW2A 3DYOA 3K1DA 1DWFM 4IPNB 3T0AA 3WF0A 5I5RA 1C8QA 5M5DA 4LQ1A 1UZ1A 1OGSA 3VD4A 5A94A 4TX6A 3RM9A 5GNYA 4Z2HA 1M04A 4GI8A 1OT1A 4PMYA 4FK9A 3DC0A 1ISVA 2WVSA 5EB8A 5A8NA 3VIMA 1UKOA 1X6NA 3O9NA 4CU6A 1C7SA 4P7LA 3SEPA 5FL1A 4AMCA 1GZJA 2DPEA 1OM0A 4ML4A 1W3KA 3EMQA 5BRQA 4AIUA 4PTXA 3VDAA 3TONA 3TTQA 3NCOA 1LL6A 1CLXA 4U2ZA 2JFEX 4MAVA 1UQYA 4CN4A 1E6XM 5DFAA 3ZIZA 3WNPA 4AIEA 3VNYA 1ZJBA 3AZTA 3WF2A 1N82A 5CQ1A 2GJXA 2A3CA 3BCDA 1VBUA 4D71A 4F9DA 5GNZA 1V02E 2YL6A 1J0IA 1KCLA 1UWSA 3PZMA 1JZ3A 2WKGA 1FH7A 3F5KA 4UCFA 2G4FA 3LPGA 1ITXA 5DO8A 4D6GA 2WZEA 4MTVA 2ZE0A 4KMQA 1B31A 3M6DA 1AMYA 3K8MA 2VC9A 2OWWA 1EOKA 2GJRA 2V3DA 1PIGA 1PBGA 3CIVA 3IJ7A 4F9JA 3WQ4A 1H0IA 1NM9A 4W84A 1ZBWA 1CECA 1H09A 1F4AA 2UY5A 1G0CA 3VUPA 3RMEA 2XYLA 1CGWA 1TCMA 3CMGA 1ECEA 1W1YA 3PZNA 4J3TA 1A3HA 2ZUTA 3GBEA 2ZWYA 3OIHA 1KGWA 4ATLA 4K68A 1E6PA 2FH8A 2VX6A 3CUJA 5A2CA 2QLYA 3WDRA 3SCNA 3EDKA 4A3HA 1HF6A 2ZWZA 1VFMA 4D6FA 5E0FA 2C0HA 4CVWA 4OBSA 3K46A 4W88A 3AMGA 2WHJA 3VGBA 1WPCA 2PWHA 5I0DA 1W2PA 1V02A 4B16A 1ODUA 5C8BB 1Y7VA 3CZGA 4C7GA 1QVBA 4AD2A 5A8OA 1E0XA 4JFWA 3AS0A 1E56A 4WKAA 1L8NA 3ZJ6A 1KGUA 3OGSA 2O9PA 4JFUA 4OBRA 3K4AA 3K4DA 3ALGA 3L4TA 3AI0A 2WC3A 4R5EA 4BA0A 1BPLB 2JF6A 1XHGA 1LJYA 3PZOA 1JD9A 4YPJA 2XVLA 2A3HA 4MJ4A 1TR1A 1JAKA 2Y4SA 4PCSA 4WLCA 1JL8A 1VENA 2WWDA 1CXKA 5LYRA 2ESCA 2Y8VA 4W8BA 4F8XA 2DDXA 1GJWA 1V3IA 2PWDA 4CD6A 1M7XA 3AROA 2JEPA 1MVYA 3FNDA 2WKLA 2ZXQA 1G9HA 1V08A 2JF7A 3WD4A 2QHAA 4JHOA 3N04A 1V03A 2VRQA 1EQPA 1CZ1A 2GK1B 4J3SA 1OSEA 2WXDM 3L4WA 1JF6A 4CCEA 2CITA 3WNOA 3K8LA 2EEXA 2W66A 4OOUA 2Z1SA 3KWXA 1C90A 2PWGA 1UKTA 1BGGA 3PZVA 4F79A 1EH9A 1TE1A 1J0HA 1LWJA 3VDHA 2UWFA 1XV8A 3F5LA 4H04A 2G3NA 3HMCA 4H2CA 1E6ZA 5A3HA 2YOCA 3UESA 4DM2A 3QGVA 3MV01 4EE9A 1XD0A 2BY2A 3ARXA 4GPNA 4YN5A 3MSDA 4TXEA 1UQZA 3KL0A 2X0YA 4ACZA 1GW1A 3NJ3A 4W8LA 3AZRA 3CHFA 2VURA 2VUYA 4PSPA 1MYRA 4L4OA 1M53A 4J3XA 2NW0A 3W53A 4AYSA 2E9LA 3W81A 2V5DA 3GXFA 3AMLA 4IISA 4PMRA 1J18A 3WH7A 3A4AA 5CG0A 3UEQA 1B9ZA 1VEPA 3AOFA 2HISA 3TA9A 3LPOA 3IAPA 2CEQA 1UOKA 5HXMA 3VIPA 3VTRA 3POCA 3VD5A 3AIWA 1W1VA 5HDRA 4EAMA 4AWEA 4TUFA 4AZIA 4W7WA 2Z1KA 1QNSA 2Y8KA 1BG9A 4FF5A 1PPIA 4AISA 1TUXA 1UD8A 2VCCA 3VO0A 1WP6A 1GUVA 3ARTA 1EO7A 2VR4A 2VMFA 3UR8A 1C7TA 1UH4A 3II1A 3GNRA 4GIAA 2VZSA 4MNKA 4MB1A 4ZXOA 3WIJA 1ZBCA 1MXDA 3WDHA 1TA3B 2VL4A 1X1NA 4HA3A 3T08A 4HPHA 1B0IA 3IJ8A 4GI6A 3NSMA 1XH0A 3VIIA 1JAEA 2A3EA 3CZKA 3OZOA 4PBGA 2EPOA 1JI1A 4TVUA 1KQZA 2WWCA 1TVNA 2XUCA 1GORA 1VFUA 2XVGA 1MXGA 3VGDA 2D3LA 4WSKA 1J10A 1XYZA 1VRXA 3FN9A 4ATDA 5I24A 3CTTA 1WO2A 2XM1A 1AQMA 5C70A 1NOFA 2ZX6A 1RD6A 1R8LA 4AZGA 3A4XA 3ECQA 1JIBA 1UR0A 5BCAA 1XCWA 1J0ZA 2O9OA 2EPNA 6TAAA 4PMNA 3VIKA 3WEZA 4B9YA 2G3MA 4CU8A 1OGBA 5A6MA 4D6EA 1JDDA 2WMFA 2W4XA 3BSGA 3EMCA 2CHOA 4AC1X 4PUDA 4PSRA 1R86A 3M07A 3WQ6A 1NWSA 2WVTA 1R7AA 4W8AA 2F8QA 4E2OA 2V3GA 2VQTA 5JUVA 4TTUA 4EANA 2WB5A 3WL0A 1JDCA 1Q6GA 3N12A 2Y24A 3OLIA 3TTYA 2ZX7A 5BXTA 4M29A 1UH2A 3CZLA 1ZBKA 1IV8A 3AXHA 3AIVA 4OJYA 1VB9A 1LLOA 2WW5A 1KFWA 5E0CA 2GDVA 5ECUA 1GOKA 1XGZA 1M01A 1S46A 2FHCA 4W87A 1E73M 1JDAA 1B3XA 2J7HA 2XSAA 1CXLA 2BNJA 4ZFMA 1DP0A 5I78A 5D4YA 2YL9A 4P8VA 2V3EA 1XSKA 1OD0A 4NF7A 5TD4A 1GOOA 5I2UA 3K8KA 4UFKA 1J11A 2E3ZA 3WMCA 3CHEA 3WQWA 2EBNA 2OYKA 3O6AA 5A6BD 4UZSA 4MNJA 3M46A 1IZKA 3WMBA 3G6MA 3L4XA 2DT2A 4CD7A 3N9KA 2JE8A 5JIPA 5A2AA 4AW7A 1J12A 1V0MA 1H5VA 4CVUA 4OUEA 4V28A 2E8ZA 4AZCA 4GKLA 3VPLA 2CKSA 2WC7A 2WYSA 1KR1A 4J3WA 2GJXB 2DSZA 1JXJA 4HMEA 3PTKA 3BH4A 4P7NA 1QW9A 2RGMA 1B3YA 3CUFA 3ARPA 5EBAA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1K9E A;  2XFR A;  4W7V A;  2YDQ A;  3FAW A;  2ZUN A;  4N42 A;  2OYL A;  3ZJ7 A;  3N11 A;  4JCL A;  1MQP A;  2CNC A;  3VMO A;  1HJV A;  1XSI A;  1GOM A;  3GH4 A;  3OZP A;  3T2P A;  1VEO A;  3OLG A;  2PC8 A;  5CPS A;  2D24 A;  1G5A A;  4QLL A;  4PTM A;  2VR5 A;  1H41 A;  1J9Y A;  3VIJ A;  4NSB A;  4N0R A;  4HU0 A;  1JFX A;  4AIO A;  3ZOA A;  1KCK A;  3EDJ A;  3CHC A;  3NDZ A;  1UR9 A;  5HBF A;  3U5Y A;  1E6Q M;  3MMU A;  1DWG M;  4OOZ A;  1V0N A;  2ZXD A;  3WNL A;  1QNQ A;  3ARS A;  4BQ3 A;  1RP8 A;  5GQB A;  2O9T A;  3VMN A;  1K9F A;  2GSJ A;  3OGV A;  3W24 A;  1WB0 A;  1R85 A;  3EBV A;  4AD1 A;  3VM7 A;  3AS3 A;  3SUW A;  1XD1 A;  2CBJ A;  5CSU A;  1E3Z A;  2ZUU A;  1E4L A;  3FAX A;  3GM8 A;  4L4P A;  3RIK A;  3NUK A;  3MO4 A;  3GXD A;  3TP4 A;  1E6S M;  4D1J A;  2WSK A;  3WNM A;  4CU7 A;  3ZJ8 A;  2VTF A;  5FIP A;  2VT0 A;  1NOU A;  2J4G A;  2EXO A;  4OIF A;  1EA9 C;  3VD7 A;  1EQC A;  1HJW A;  2JIE A;  4M8U A;  3VIO A;  3B9D A;  4HMD A;  1CWY A;  3CHD A;  1WDS A;  4E8D A;  3WBE A;  3OBA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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