4FEZA

Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from vibrio cholerae, deletion mutant
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
361
structure length
316
Chain Sequence
MLRIAKEALTFDDVLLVPAHSTVLPNTADLRTRLTKNIALNIPMVSASMDTVTEARLAIALAQEGGIGFIHKNMSIEQQAAQVHQVKIFESKPNACKDEQGRLRVGAAVGAAPGNEERVKALVEAGVDVLLIDSSHGHSEGVLQRIRETRAAYPHLEIIGGNVATAEGARALIEAGVSAVKVGIGPGSICTTRIVTGVGVPQITAIADAAGVANEYGIPVIADGGIRFSGDISKAIAAGASCVMVGSMFAGTEEAPGEVILYQGRSYKAYRIAYKGHLKEIIHQQMGGLRSCMGLTGSATVEDLRTKAQFVRISGA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Inosine 5'-monophosphate dehydrogenase from Vibrio cholerae, deletion mutant.
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Vibrio cholerae o1 biovar el tor
total genus 107
structure length 316
sequence length 361
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-05-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4fezA00
1SPQA 4OE7A 1GVQA 1VCGA 3G18A 1DJNA 5EY5A 3W87A 4OV9A 3IGXA 1YYAA 3W23A 4GFSA 1KTNA 2QUTA 1OK6A 4Z1AA 2QKFA 3BVJA 3GR8A 3I6RA 3UY8A 1ML1A 2XN0A 2H90A 2OMAA 3E0IA 2ZRYA 2NX1A 3W85A 2Z6JA 1PHQA 4Z1DA 4BI5A 3P80A 3E12A 4O50A 4DBDA 3TR2A 5K4ZA 4S2BA 3I65A 5D2TA 5FI8A 4MZ8A 4MFEA 3SZ8A 2VOMA 3IVTA 1EP1A 4Q4KA 4IQLA 1RVGA 1S3HA 3D0CA 2OT0A 3G8RA 3MO7A 3S5NA 3M5YA 3C2OA 1J2WA 1O60A 5A5WA 3A24A 4QM1A 3W1NA 3B03A 2FQIA 1W54A 3RMJA 4KKXA 2R8WA 1JUBA 5FF7A 4M19A 3SSJA 3B06A 5HWMA 4ZMGA 3LCXA 2V2DA 2VXNA 5KZMA 3NQVA 2ZTKA 1KV8A 3RK8A 3W7OA 3FIGA 1TRDA 3CPRA 4JTLA 3B8DA 3UD6A 3CWNA 3FKRA 3NQGA 4RR4A 2ZTJA 1CX9A 1GYNA 4H4IA 4MLRA 1FWNA 2RKXA 2DJLA 2H8ZA 2Y7GA 2VFIA 3DKJA 2FIQA 5TIMA 1QPOA 1PL9A 4N02A 1U5JA 2IQTA 3ABSA 1G4SA 3QC3A 1ZAIA 4JX6A 2PURA 3HMJG 3V75A 5CPMA 4JTTA 2ALDA 1PHWA 2YPIA 4DEFA 3BLEA 4NNAA 4UMCA 1ADOA 2ZRVA 3SJ3A 2NWSA 2F84A 3ATZA 3ABQA 5D30A 4MJZA 5LKYA 3IGSA 5BOOA 2XN1A 1WAUA 3LHVA 3MP3A 4QITA 4WY0B 3DZ1A 3UNDA 2P0OA 3G1AA 2B7NA 2I14A 3ZWSA 3Q58A 2WOQA 1W3TA 4ZQRA 1TTJA 4LRSA 2QEZA 3UWYA 3GXPA 3DI1A 3SR7A 1FWTA 3WJWA 2B7PA 4FO4A 3SGUA 1XKYA 5A8GA 1SO5A 3DAQA 3UZ5A 4R7JA 4NVTA 3NG3A 3DFOA 1YPIA 5HWNA 5LZLA 4MYAA 5LSMA 2RDTA 1OABA 1KM6A 1QO5A 2GVGA 4JTUA 4Z1BA 4DO4A 4FHAA 4UC5A 1WYIA 3QJAA 4LU0A 4LWWA 5D33A 4AH7A 3EWXA 4TMBA 4UMBA 3INPA 1IIHA 5J5DA 5L9FA 1PCKA 1Q6OA 3LDVA 3P7YA 2ZYFA 4UR7A 5U7SA 4FIQA 2NX9A 2WNZA 4UFMA 4PL1A 4LNYA 3O05A 3PM6A 1YDVA 7TIMA 3P84A 6TIMA 3W3OA 4QQ3A 4NX0A 3MI6A 3LCHA 4IMEA 1UUOA 1L2UA 2ZRWA 2YZRA 4O18A 2JKPA 3NNTA 1QCWA 1B4KA 1JR1A 3USBA 2WJZA 3NAVA 5HWJA 4UFHA 3ABRA 3NZRA 3W86A 4LVDA 1UB3A 1KLYA 3GXTA 3M9YA 4DELA 3C2FA 2YW3A 2X1UA 4OHQA 3WJYA 3N34A 3TSDA 2J24A 2B4GA 5G5IA 2FB3A 3G22A 5TBOA 3GAYA 1VQTA 1VPXA 3S6DA 3R2GA 1VGAA 3C8FA 1F2JA 3MHFA 3W7QA 2LLEA 3PR2A 4DQWA 2VELA 4O10A 1XUZA 4UCGA 4WX2A 3NL3A 1OF6A 3BLIA 3BV4A 3FS2A 1FCVA 3A5VA 2Z1BA 4RLIA 2A85A 4NNBA 2Y6ZA 4MY9A 1G4PA 4LC6A 5CPLA 3TIMA 2NWRA 4AAJA 3T40A 5L6UA 1UBSA 2DU2A 5G4WA 3EKLA 5LHFA 3M47A 4MVAA 3S1UA 4YLWA 2RH9A 4O16A 5T26A 4O0ZA 1TQXA 3GLCA 3LHYA 3PS7A 3O6DA 4GUJA 4IPJA 5G2HA 1R47A 2DP3A 3UWQA 3QQ0A 2E68A 2A7RA 1EX5A 4RZ5A 4QIUA 3G1DA 3GX9A 3L66A 4Y9AA 5C5YA 4LS0A 3OVRA 3CIWA 3I7QA 2E6DA 2EGZA 5C6MA 1MXSA 5CKSA 1FXQA 1VYRA 4FF7A 3NQ7A 1EWDA 1A5AA 4IX0A 1VLWA 1TV8A 1I2QA 1OYCA 3T44A 3THQA 3LTPA 1XFBA 1X6UA 5KSWA 4Q33A 3LHUA 4FX7A 5D38A 4O4WA 1KM0A 4Z0JA 3NQDA 5AC6A 4TX9A 2QCLA 4WOQA 3PY2A 5AHLA 4DPPA 5HNRA 1IGSA 1TPDA 2QR6A 4WXYA 3W7HA 4I9AA 3IEBA 2JBMA 4ZQNA 3TA6A 5FESA 2E5BA 3F4WA 5AYYA 1R30A 1YTKA 5HINA 1HO1A 4FNRA 1GTHA 4UTKA 3LXBA 4Y6GA 1O5XA 4QNEA 2ZCGA 3T78A 5AC7A 1FDZA 5LNRA 4FXSA 4O1BA 5F2IA 4FX8A 5IM51 4O11A 3PB0A 4ONVA 1K7FA 1K7EA 3FOKA 3PB2A 3GAKA 3EEGA 3SIZA 3OHIA 4M6QA 4EF9A 4U4MA 4AVFA 1SZFA 2QCGA 4MYXA 1OYBA 3NQCA 4KWVA 2HSAA 3KAOA 2CLHA 1E51A 4HT3A 3TSMA 5H91A 5I3KA 4WXZA 1OFRA 1QPQA 5MHBA 3L5MA 2CLEA 3GDTA 4JN6A 1FBAA 4K8HA 3UWWA 2Z0IA 4N6EA 3P74A 3B0UX 2VFGA 1TREA 3EWUA 4YCPA 1H63A 2NXHA 5FEWA 4XZ9A 3W1AA 5DN1A 1LRQA 3TW6A 3M43A 3KHJA 1RV8A 3W2KA 4JYEA 2QDHA 3EX6A 1OFQA 1ME8A 2CLOA 3M1ZA 4IX2A 4LT9A 4EF8A 3CT7A 5G2IA 1SW0A 4IWWA 4GJ1A 1HTIA 4RV8A 1BKSA 4JR5A 4WQ6A 2CLIA 2ZZ6A 4BWLA 3FJ6A 5E93A 2Y7EA 2CLMA 3EX3A 4A21A 3K30A 2C16A 4CQ8A 3WK1A 3MMTA 2AGKA 2V81A 4K38A 2C0AA 4W9TA 1ICSA 1ZCOA 1LORA 2PRMA 2DZPA 3CEPA 3OVPA 1FWWA 4UUIA 4JS3A 1TPWA 1LYXA 1ZENA 4JTHA 5AHMA 2BX7A 1P0KA 1SO3A 4LTSA 3CTLA 3S5YA 5HMSA 1TV7A 5KITA 1QMLA 3OIXA 3LOTA 1DQWA 3MBFA 2JKAA 1FWRA 1TPC1 4X2RA 1K03A 4GUFA 3LV6A 4Z0SA 1O95A 2JGQA 4RXFA 2UV8G 2FFCA 1TPEA 3W7PA 2VEIA 2QCEA 1BWKA 2YSWA 5DBUA 5AHNA 5FEZA 3NYZA 1OFAA 4PC8A 1SSGA 1LOQA 2V2CA 2QF7A 2ATMA 4OU1A 3W72A 5D04C 3W84A 5C2XA 3S5OA 4XQ6A 1J5TA 1NVMA 1H7XA 1XCFA 3UPWA 3W2UA 4FB7A 3G1SA 1NEYA 1BWLA 3W7GA 4AWTA 4GE8A 1ALDA 1SZEA 1LRTA 5D09A 4PA8A 5G1TA 1EP2A 3PUOA 2VFEA 2BZNA 2C3ZA 4NJHA 3F03K 4YCOA 4ADUA 5LNVA 4LV9A 5J5RA 1AL7A 1VZWA 3W1RA 5DELA 1K7XA 1WBHA 3GR7A 5F1UA 3S9YA 1R2TA 1SFLA 3R12A 1KFBA 2C6QA 1XL9A 2R94A 3STGA 3C4UA 3DH7A 4X9SA 5ABTA 3UWVA 2EF9A 3MHGA 5FEPA 3W1XA 4JX4A 1TIMA 1H61A 2YXGA 2ZZ1A 1I2RA 2GOUA 1JJKA 2DZTA 2O7QA 3P61A 3W71A 5G1YA 1JCLA 5DXYA 3FLUA 3W7DA 2E6AA 4OBTA 4HSNA 4QJ1A 4JIQA 2V2HA 2ZBTA 3GKFA 3O6CA 3W7NA 4N9DA 1CW2A 4CCCA 2TSYA 3NQ2A 4CQAA 2YCEA 5F2LA 1DVJA 3W1LA 1BTMA 1P4CA 2Y88A 2OZ0A 1R2SA 3W7LA 4HN4A 2ABAA 4MUZA 1KV5A 1TSIA 5AHEA 4BWLC 1VRDA 3W7RA 2YR1A 1F05A 5D2YA 5I3GA 1EA0A 2R14A 4UTWA 1WBJA 5SWUA 6ALDA 2Y61A 1YTDA 1LOSA 3JS3A 4UTTC 1GVFA 1NF0A 3HIJA 1F7BA 3QH2A 2E77A 3O63A 1DKWA 1JCNA 4ORMA 4O17A 4GC4A 1M6JA 3KOFA 1OX6A 3G0XA 2VEMA 4PTNA 1YADA 4FNPA 4P61A 2A5HA 4A2RA 3N14A 1JRCA 3GB6A 4G1KA 4IXXA 1LLWA 1IF2A 3SGZA 3CWOX 2P10A 1WOBA 3N9SA 2VC6A 4L4LA 4DPQA 2JK2A 1KLZA 1WV2A 5KMYA 1H50A 4JIPA 4BFAA 3VFLA 3M5XA 3NQEA 4UNKA 2WO5A 3W1MA 5FF2A 3L5LA 2G95A 4CNOA 2W79A 3PBWA 4Z08A 3W1UA 3MI2A 1FXPA 1GEQA 5DY2A 3ZR4A 1LZOA 1ZFJA 3MI3A 1KFLA 1DJQA 3TJXA 3FKKA 3QPYA 5HR7A 3N2MA 5IBXA 5I3FA 3QYQA 1K8YA 4NZFA 1NF7A 3GDMA 4UMAA 3EX2A 2G97A 4HNUA 5DCBA 3GIYA 1V7YA 3W6YA 3ABOA 1C8VA 4QSHA 1GVSA 3RU6A 2AQWA 3VE9A 4N4QA 3SY5A 3CB8A 2CZDA 3DKLA 3G24A 4DO5A 1VHCA 3SI9A 3LRMA 3MW7A 3G3DA 1GYLA 1G7UA 3ZWTA 4M7TA 1TQJA 4BR1A 3P62A 2VENA 5TQLA 3G0SA 1YXYA 3CIXA 2ZZ7A 2OJPA 2PRLA 4TIMA 2VEKA 1H62A 5DLCA 3PF3A 2C1HA 3A5FA 5CZTA 3N3MA 3NM3A 5U4NA 3ATYA 1AW1A 3GYEA 1X8FA 1VC4A 1C9DA 3HG2A 1PVNA 4K37A 1ICQA 3L65A 1DV7A 3KRZA 1GT8A 1Q3NA 5AFDA 3S8HA 3FFSA 3NL2A 2DZVA 4K6AA 3EX1A 4LUIA 1VYPX 3STEA 2QCFA 3U8GA 1WOAA 3QW4B 1OFOA 2J9XA 3IIZA 4YXGA 5DCDA 4EVZA 3M6YA 1K3UA 3TC6A 4UTIA 4XBSA 3HG3A 5DY3A 1KBIA 2YFOA 4RK8A 3C2RA 3LLFA 1L6SA 3NPUA 2NLIA 1AW2A 3C0JA 3WJZA 5K4XA 3M16A 3EXRA 1G4EA 3W9ZA 4IMDA 2FDSA 3NPVA 2AAMA 3EB2A 2BWGA 1IXPA 3G1HA 3DHDA 1LOLA 3S42A 3FA5A 3LERA 3W2LA 4JDBA 1CI1A 2V30A 3P5ZA 3A22A 1OF8A 4AHPA 2JGYA 4UTWC 2EPHA 5H2ZA 1GQNA 1H51A 1VJIA 3NQMA 2C13A 4IMGA 1W5QA 1OFBA 4HPJA 3DXIA 4HNNA 3KX6A 2QJGA 4LRTA 3LRKA 3A21A 1WDWA 3L0NA 4HNTA 4NZJA 4MJMA 3WFAA 3F1QA 1W56A 4QNWA 4Y96A 8TIMA 1EP3A 3U6WA 4JNMA 1N8FA 1JUKA 1EEPA 1EIXA 2NV2A 2A7PA 2Q8ZA 4O57A 4UR8A 1Z48A 3EXSA 4B5NA 2QUUA 2YYTA 3C56A 2CZEA 2J6XA 1B3OA 2B0MA 1EB3A 2CU0A 2JKEA 5CG7A 3EWYA 4O14A 1TPH1 2FJKA 5K7JA 3LI0A 3PBUA 2VFFA 4N6FA 3DFSA 2E6YA 3MYPA 3UPBA 3LXCA 3LCGA 2QCNA 1XBZA 2X30A 2A4AA 4OV4A 1B9BA 1LBLA 1O94A 1L6WA 2PC4A 3A23A 3C2VA 3STFA 4ORIA 3LHTA 3UXAA 3TW7A 1QFEA 1XDLA 3W70A 5DXXA 2VEPA 1LBMA 3QF0A 4AHOA 2O7SA 3W76A 1S5TA 3Q37A 4HKPA 3DGRA 2TRSA 1OX5A 4PEKA 4M6VA 2TMDA 1B57A 3NQ6A 4RXGA 1A53A 3VKJA 3O1NA 1A5BA 1FDYA 3NXFA 1QOPA 1JQXA 4JYDA 3BLFA 2V9DA 1LTDA 3G0UA 3EWWA 3OG3A 3OEXA 4E2DA 3P8JA 3NPXA 3LGEA 5KTLA 2GQ9A 3QRHA 3N9RA 3HB9A 1XBVA 1D3HA 3L0KA 3MJYA 1ME7A 1A5SA 5AYZA 1ZJIA 2FLIA 2J88A 1H7NA 4IUOA 3LV5A 4ICNA 1O4UA 1KFJA 1TMHA 4HIBA 3M5VA 1DBTA 4JY9A 3B0VC 3L68A 3DI0A 2YDAA 5EL1A 1R2RA 4FIRA 3TJLA 2PRHA 1ZNNA 3LXAA 4HHPA 3ELFA 1XBYA 3VNDA 1TTIA 4A22A 1IXQA 4FXRA 2TPSA 1FCBA 5EMUA 4BF9A 4H6KA 4O28A 5FF0A 5D32A 3C3NA 4O15A 4NJGA 1JQVA 1W5PA 1IIGA 3NM1A 3LI1A 1Q6RA 1GPWA 1QPRA 4UTJA 1G6CA 1GVRA 2WSQA 3PAJA 4CNPA 2V5LA 1Y0EA 4UTUA 3L2IA 1TCDA 4LVGA 4GBUA 1A5CA 2GPTA 2HMCA 2ZZ3A 4LVFA 4UXDA 1TB3A 3OVQA 4JDYA 2ISSA 4O19A 2NUXA 2DZSA 3GK0A 3QSTA 4TO8A 2X16A 3KRUA 1K8XA 3EWZA 1KM2A 3PBYA 4K7YA 4WY0F 3BO9A 1TTQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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