4FF7 | Genus

Total Genus 89

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	89
sequence length	247
structure length	247
Chain Sequence	ARTFFVGGNFKLNGSKQSIKEIVERLNTASIPENVEVVICPPATYLDYSVSLVKKPQVTVGAQNAYLKASGAFTGENSVDQIKDVGAKWVILGHSERRSYFHEDDKFIADKTKFALGQGVGVILSIGETLEEKKAGKTLDVVERQLNAVLEEVKDWTNVVVAYEPVWAIGTGLAATPEDAQDIHASIRKFLASKLGDKAASELRILYGGSANGSNAVTFKDKADVDGFLVGGASLKPEFVDIINSRN

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Effects of a buried cysteine-to-serine mutation on yeast triosephosphate isomerase structure and stability. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Triosephosphate isomerase
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Saccharomyces cerevisiae
total genus	89
structure length	247
sequence length	247
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2012-05-31

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00121	TIM	Triosephosphate isomerase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4ff7A00

4WUIA 4LV9A 1OJXA 3G1XA 3C0JA 4N6FA 3S6DA 4MY9A 3BVJA 3TV8A 1XDLA 2NUXA 3QYQA 1S5TA 3CLMA 4QSHA 4JN6A 3DAQA 2X1SA 2DJXA 4JEQA 4AF0B 4S2BA 2YXGA 1ZAHA 3JR2A 3EX3A 3C56A 3I65A 4PC8A 1U5JA 3C61A 1JCNA 3TFXA 4WD0A 1Q45A 2E77A 3G1HA 3W2KA 2R94A 4A29A 1GVOA 3UY8A 2XN2A 3T55A 4O1CA 4KKXA 2QCDA 1BWLA 3EWUA 1QFEA 4HKPA 3C2OA 3PUOA 2HMCA 2QCDB 1HO4A 4OHQA 2PRMA 2NWSA 3FJLA 2XN1A 5AB3A 2QUUA 3PWAA 4O1AA 1OABA 4O52A 1DORA 2HTMA 3PR2A 3OA3A 3NVTA 4LUIA 3MP5A 4ZQNA 4C1KA 1TPDA 3G3MA 2E09A 1UBSA 5KMYA 3R8RA 1XC4A 4O15A 5D03A 2JGQA 3LCIA 1GYNA 1H7XA 3OVRA 3Q2DA 1H50A 1KW1A 1ME9A 1LTDA 1FUYA 3O05A 1YTEA 5DY2A 1Q6OA 2J9YA 2H3DA 3ANYA 2ZZ4A 2QDHA 3N19B 3P81A 1VPXA 5EYWA 1GVFA 1LCOA 3G8RA 1SZEA 4FNUA 3N2MA 3QRHA 3B06A 3HIJA 2ZRWA 2RFGA 4RXFA 3UWYA 1I2NA 5F2MA 4WY0F 1K8ZA 3LB0A 4JIPA 3PM6A 4NU7A 3KRZA 3N2XA 1XUZA 4S2CA 2X30A 4JIQA 1ADOA 4GUGA 1G7UA 1GG1A 3DI1A 3PSWA 1ZAJA 1EPXA 1A50A 3YPIA 3S42A 4XKYA 2ZRUA 2G95A 3PG8A 5D02A 5F4SA 3NQ2A 3LI1A 4LS2A 3KVKA 2ISSA 4XKYB 2ZZ5A 3NZRA 4H4IA 3LCHA 3TAKA 1LYXA 4JYEA 3LX9A 5BNKA 5HULA 1JCXA 3TQ0A 3LTYA 1AK5A 3T40A 1FXPA 3U8GA 1M7OA 2QCGA 3EWXA 3C2FA 3W72A 3S0CA 2I1OA 2CZEA 4UTTA 4UFLA 1OFBA 1LM1A 5D38A 2Y63A 2NWRA 3SZ8A 3TSBA 1PIIA 3A5FA 1SU5A 4DELA 2Y7FA 4X22A 1O94A 4I7VA 5EL1A 3A9IA 3IVUA 5CPMA 1QOQA 3TNOA 2LLEA 5D2TA 3TW6A 3FIGA 4MLRA 4OE7A 1EA0A 4TIMA 2OZ0A 2X2GA 4UNKA 1M7PA 3W7DA 1VHCA 2CWNA 1YTKA 2FFCA 3QSRA 3HGOA 4HNNA 4PODA 3BPWA 2RDUA 3A5VA 5D2VA 1YDVA 2PC4A 1FDYA 1TQXA 3TCEA 2CLIA 2P0OA 1N8FA 3HPZA 3UZJA 4O4VA 4TO8A 1LBMA 5FEZA 2C13A 2FLIA 1SSDA 3JRKA 4JXCA 3W7EA 3ABSA 1H7PA 3RMJA 4YCPA 3HPSA 4ZQRA 3FEMA 4YMZA 4OV4A 1AMKA 3OIXA 2Y6ZA 4N02A 1J5TA 2QF7A 3QPZA 1HG3A 2Z6IA 3LDVA 4M6QA 3VKJA 3BW4A 3EWBX 3NG3A 5DCBA 3IEBA 3W1RA 4N9BA 1L6WA 2NUWA 1RV8A 4G1KA 3FS2A 1BKSA 1MO0A 1TJPA 3BW2A 2ZA1A 3NQFA 4O19A 2QCLA 2NLIA 3Q58A 4ADSA 2O7SA 3UY7A 2VEKA 5LHEA 2EF9A 2R8WA 3NQAA 5GVJA 3B03A 3TKFA 2C18A 1TPC1 4N6EA 3NGJA 1RR2A 1TREA 2RDTA 3C4UA 1BWKA 1SO3A 3NQCA 4KFPA 3SR7A 3W70A 1DHPA 4JY9A 1EUAA 2FJKA 2FPYA 3GXTA 3L68A 1LRQA 3M7WA 4N4QA 1HUVA 3O07A 1Q6RA 3NR0A 1ZFJA 2EPHA 3ATZA 2WKJA 5G2IA 3I68A 1JRBA 1QDSA 4RR4A 2A7RA 4PFMA 2GQAA 1UASA 2VFDA 4LOCA 3EB2A 1VCFA 4CNNA 2B0MA 5AYZA 5E1QA 5C55A 1NAL1 4ZQMA 1IF2A 3CTLA 1W3TA 3LHWA 3W74A 2V82A 4PTNA 4D2JA 3L9CA 4A22A 1KFBA 5D09A 5L6UA 1UJPA 3C2RA 5LNSA 1VC4A 4UMAA 4JTTA 3R2GA 1QCWA 3DFTA 3GDTA 3AO0A 4I7WA 3KHJA 4EF8A 3N14A 4WOZA 4LW7A 4ORIA 5A5WA 1G6CA 2R91A 4UFHA 4NVTA 3EKLA 1GYLA 1TV8A 3LTPA 1JCJA 2YW4A 1ZHAA 1OHLA 3PBUA 4Z0JA 3W7IA 5H2ZA 4GWEA 4K6AA 1UCWA 5HR7A 5I3KA 3WK2A 3IIZA 3LXBA 4XTIA 3IRDA 3PVFA 5CG7A 5AHLA 5D2YA 1WOBA 1H61A 3HOJA 3G1SA 3DENA 3C8FA 3DFQA 3CIXA 3W9ZA 3ZWSA 2C0AA 1W3IA 4OWGA 1K03A 3OG3A 1EP2A 1JRCA 4EVZA 3PB0A 2Y85A 1G69A 4FNTA 3IGXA 5DELA 1ONRA 3STGA 1FWRA 4LVDA 3P84A 1PVNA 1VCGA 3UYCA 4XWUA 1SZNA 3DGRA 5F2LA 3G0XA 4O54A 2HS6A 1K7XA 3NQ8A 2CZDA 4CCCA 1F05A 5HMSA 6ALDA 4RLIA 3WK1A 3UWQA 3PC0A 2GVGA 2BSLA 3W85A 1FDZA 4MZYA 2DZTA 4TU1A 4BI7A 5LSMA 4ICNA 1ALDA 1GQNA 4CQ9A 1YXDA 2Y89A 1VGAA 3MP3A 1VCVA 2FQIA 1Z41A 2VENA 4UTMA 5KTLA 4CNOA 3DBPA 1VRDA 4JX6A 1TRIA 1FY6A 5IBXC 1W5PA 5A8GA 3STEA 4DO5A 3SGZA 5HUPA 5U7SA 3RF9A 1TTQA 4A3UA 1N55A 1XKYA 3VCRA 5EY5A 3W84A 2QCHA 5EKYA 2DJLA 5K7JA 4WX2A 2TRSA 4BI5A 1IXQA 4BR1A 1WX0A 4QAIA 3KVMA 1KTBA 5G2WA 1SUXA 5CZSA 4FNPA 4O17A 1H7WA 1RD5A 2DZWA 3MHUA 4HSOA 4O4WA 3RFAA 2H8XA 3G18A 1WQ5A 1V7YA 3STFA 1P1XA 4QNWA 4HPXA 2QR6A 4CCEA 2C1HA 3FFSA 1XI3A 3DZ1A 1W3NA 4JTFA 1VR6A 2ATSA 4UFIA 1WOAA 3LGEA 1ML1A 3DFSA 1LRNA 4DPPA 3DFOA 1O5KA 4M7SA 4X3ZA 3HGSA 2RKXA 1MEIA 5TQLA 4O11A 5CZJA 3LHZA 1K02A 2BXVA 3TROA 1V5XA 3MMTA 3P82A 5K3VA 4RKAA 3W7GA 2NV1A 2E5BA 3INPA 3W7KA 4ONVA 2YW3A 2CLEA 2ZTJA 3RK8A 4DXVA 3LRMA 4X9SA 1AG1O 2CZ5A 4N9CA 3W1QA 1RQHA 4IJBA 2V2CA 3I6RA 1G7VA 1KBJA 2Y7GA 3L5MA 4EIVA 1B3OA 1HTIA 4PA8A 1W8SA 1ZNNA 3LHYA 3G3DA 2DU2A 1GVQA 2H6RA 4LY8A 5CZ0A 4DPQA 4UFKA 2A6LA 3KAOA 1DJQA 1TPH1 2O7QA 4IUOA 3N9SA 2E68A 5F2GA 3THAA 4LU0A 1N7KA 3A24A 3G24A 3SI9A 5BMWA 1FQ0A 3M0ZA 3BGJA 3UNDA 2KZHA 3W86A 1EX5A 2H8ZA 2ISWA 4GE8A 1SZFA 3TC6A 5AHNA 4GUJA 4DO4A 1KFKA 1ZALA 5J5DA 3FOKA 3IIOA 4CQAA 3UZ5A 4OGZA 3EX1A 2BWGA 1TMHA 4P2VA 2ZBTA 3E9AA 4IQLA 3IIXA 2Q8LA 1KLZA 4HPJA 4O53A 1ZCOA 3NL2A 1PCWA 2BTMA 4Z1CA 1B4EA 1VLIA 1MZHA 4K36A 2CFFA 3TW7A 1C9DA 1JCYA 3UXAA 4ZL1A 3CB8A 1I45A 2QJGA 2F84A 1KM3A 2WO5A 1P5BA 4NZJA 4NXSA 2JKEA 4OU1A 4NNAA 3GK0A 1TPWA 4HT3A 3TAOA 3GKFA 1DOSA 4K39A 3G1FA 1QMLA 2YYUA 1FCBA 3L2IA 1D3GA 1W5QA 2RDWA 3L0KA 3DHFA 1ZAIA 3LRLA 4MKNA 4BFAA 3FYOA 1UB3A 5J5RA 5K4XA 1Z42A 1SW0A 3UWUA 3LCWA 1QPRA 3SJ3A 1LDCA 2VC6A 3KOFA 4O50A 1EUNA 3GAKA 4K7VA 5LHFA 5DXXA 1LROA 3HQ1A 1VYSX 4GUHA 1PS9A 3TSMA 1FBAA 2G5WA 4UTWA 2A4AA 2V5LA 3O1NA 3NQDA 3DFPA 4ZZ9A 3MYPA 3ZR4A 4FX7A 4GBUA 3LCLA 5HUOA 3ATYA 1XM3A 1PV8A 5DBTA 3VE9A 5DBUA 3W71A 3M5VA 1I4NA 3P8JA 1JCMP 1J4EA 4U28A 3LV6A 2A21A 4UTWC 3S5NA 3W1PA 2PRLA 3G1DA 3TQKA 3P60A 1W5MA 4NJJA 1WYIA 1Q3NA 3H53A 2Y62A 3EWWA 4O10A 5FEPA 2QKFA 3N3MA 2Q3RA 4ALDA 1SPQA 3G1AA 5CGQA 4QJ1A 3RU6A 1VJIA 2V2DA 1EWEA 1GJPA 5DCEA 4XZ9A 2P1FA 4O0KA 1K3UA 2Z0IA 1GTEA 1DJNA 3P67A 4K38A 1I2OA 4DF2A 4JTGA 1GVSA 2V30A 2WOQA 3W1TA 4PL1A 1YPFA 3SFKA 3TU9A 5K9XA 3C52A 3LXCA 4MOZA 2VELA 4XBSA 4WXZA 3C6CA 3K30A 3TR2A 3NQVA 3MJYA 3IV3A 3P80A 4UCGA 1T96A 3O16A 1ZY9A 1JUEA 4WY0A 4RV8A 2A7PA 4AWUA 5C5YA 5C2XA 5HWMA 4MZ8A 1TPB1 4WY0B 3HPXA 2QCNA 2WV8A 1K8XA 1I2RA 2NX3A 5LZLA 3TFCA 2DZVA 4IMFA 4JD4A 2WSYA 1JJKA 4UTHA 4R33A 1XBZA 2X1TA 3B0VC 1QPQA 2BZNA 1AW1A 4WQ6A 3NZ1A 1QO5A 4L4MA 2PCQA 1SZGA 1XFBA 1G4SA 4FF7A 3DKJA 1L6YA 3W2UA 2NX1A 3TXZA 3M5ZA 1HL2A 2VFEA 5C54A 1YDOA 3NOEA 1SFLA 1FX6A 1KM2A 4MJZA 2A7NA 2B4GA 2Y88A 2G97A 2GJLA 3I7RA 4JY8A 1R47A 1D9EA 3P7YA 4AAJA 3M41A 1YTDA 1QWGA 2WJZA 2ZRXA 1KFCA 1WAUA 4CNPA 4O14A 4IMCA 5G4WA 2WNNA 4EF9A 4MYAA 3QH2A 4TR9A 1LRTA 3W1NA 2CLMA 1QO2A 4E38A 1NEYA 3EWYA 4HHPA 1DVJA 4JDBA 2ZCGA 3HG2A 3NAVA 4P61A 3EXSA 1OYBA 1ICQA 1O4UA 3N9RA 3TUUA 3QF0A 2FTPA 4LV4A 2A6NA 3GDMA 2QJIA 2Q8ZA 3D0CA 2A1YA 4NJGA 4C1LA 5FF2A 3TK7A 2H3BA 3HG3A 4XBKA 3W6YA 4GUIA 4Y96A 1T0OA 1IXOA 5F4XA 2QDGA 1M6JA 1KM6A 3QFEA 1GPWA 3DXIA 1R2TA 3USBA 1FWNA 3W3OA 3LBMA 3UPBA 2FB2A 2R14A 3M44A 2X16A 3BLFA 1H1YA 1DKWA 4LRTA 2JKPA 4FXSA 3G1VA 3E02A 3TH6A 1OFOA 3W2NA 3L65A 5K2ZA 1KM4A 4AHOA 3BARA 3HF3A 5KITA 1PCKA 2VFIA 5F1UA 1A5AA 2YPIA 1SSGA 4O0ZA 4RX0A 1G4TA 3V1PA 1B4KA 2JGYA 2ZZ6A 3DFNA 2E5DA 3PS7A 3PY2A 4A2RA 4LVAA 1QOPA 3B04A 3W7LA 3S1WA 5G1TA 4O18A 3KVJA 3TC7A 3PBVA 1WBJA 3WK0A 2J9ZA 2V8ZA 2J9XA 3P5ZA 2A5HA 3T78A 2OT0A 4NJHA 4GC4A 5D04C 3S5ZA 1M5WA 1DV7A 3PF3A 3JS3A 4NJIA 5AHEA 1ZJIA 3TXVA 5G5IA 4JTUA 1VLWA 3OHIA 4I7UA 2W0UA 3M43A 5AC7A 4Z1BA 3EXTA 5K9CA 1W37A 1GWJA 3M16A 3Q37A 4W9TA 4RXGA 3ZFHA 3CU2A 4K37A 4RJEA 3TA6A 1SO4A 2F7FA 3DKLA 3IIPA 4HNTA 1F2JA 2Y70A 1OYCA 3SY5A 3LBCA 3W7RA 1JR1A 3DU0A 4FNSA 4MJMA 5G4EA 3T44A 4YLWA 1IGSA 2A0NA 4EOUA 3MBDA 1LOLA 3THQA 4Y90A 4UTUA 4DEFA 3UQNA 4HSNA 1T99A 3OVPA 4UMCA 2OT1A 4AVFA 3WJWA 1GVRA 4YCOA 4O13A 3MP4A 1VYRA 3R13A 4DO6A 1D3HA 2GOUA 4MLJA 4DF0A 2YX0A 4Z1DA 5CZTA 3W2LA 2DORA 2DZUA 2CLLA 2FPTA 4OT7A 4KWVA 4CQ8A 1PHWA 3NEVA 4FNRA 3CEUA 4U4MA 5FESA 3CM4A 5IBXA 1KBIA 2HSAA 2ZZ7A 2GVLA 4IMEA 4UFMA 5FF0A 5ABTA 1YYAA 4H6KA 3MYOA 3CPRA 1W1ZA 3B8DA 3CIWA 1VYPX 5LGZA 3BG5A 4OQVA 3E0IA 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1O60A 1P0NA 2QJHA 4XTDA 3B4UA 5CSSA 1L6SA 1TCDA 1EEPA 3TDFA 4JGDA 5KZDA 4UIOA 5F1VA 1FDJA 4ZMGA 3M5YA 3G8EA 4DBEA 1KA9F 2DZPA 1WBHA 2CLHA 3C2VA 1LBFA 1X7FA 3P62A 4FO4A 3ELFA 2Y7EA 4LVBA 3S5YA 1RQBA 4LVFA 2WSQA 3C3NA 3GYEA 5CPLA 1LLZA 3TJLA 3ABOA 5AC8A 2GVJA 3IVSA 3HMJG 3NPUA 5CPOA 2CLKA 2P10A 3BO9A 2GPTA 3UPWA 5KINA 1KM0A 5DXYA 4KFNA 1X1ZA 3WJYA 3FKRA 4RZ4A 3T7VA 2QEZA 4RCXA 2NX9A 4GUFA 5DY3A 3M47A 1NFBA 3EKZA 1OF8A 4LS0A 3M9YA 4AMAA 4NX0A 1AW2A 1TSIA 1F6KA 4DQWA 3W1AA 1TYGA 3OEXA 3ZS4A 1MEWA 2TPSA 3I7SA 4PEKA 4RK8A 1G4PA 2VOMA 1RQEA 3FYPA 4ADUA 3W7OA 4N2YA 5LGXA 3TMQA 3RNDA 4AF0A 1MSSA 1XBVA 5HR6A 1FWWA 1KFEA 4ORMA 3NL6A 3S8HA 3LCXA 4O8RA 1CW2A 1H7OA 4FX8A 2B7OA 2JBMA 4E2BA 3S1XA 2C16A 1F73A 1OFRA 4OBTA 4DBDA 3O6CA 3EEGA 3NXFA 2CLOA 4JDYA 2E6YA 4JNMA 5C6MA 3GR8A 1SQ7A 2TSYA 1OVDA 4KWWA 5D05A 5EBUA 3CT7A 1KFJA 3IIVA 3UD6A 3NNTA 3W83A 1R2RA 4WJEA 2QCMA 1JVNA 1OFQA 4NX5A 2ABBA 2H90A 3L0NA 1QPNA 2AAMA 1W0MA 2E1DA 4UR8A 1ME7A 1EP1A 4Z0SA 3QC3A 4PH6A 3NQGA 3RLVA 1FCQA 1T8XA 1DQXA 1VQTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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4FF7A

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