4FHA | Genus

Total Genus 105

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	105
sequence length	310
structure length	306
Chain Sequence	SYQDLKECKIITAFITPFHEDGSINFDAIPALIEHLLAHHTDGILLAGTTAESPTLTHDEELELFAAVQKVVNGRVPLIAGVGTNDTRDSIEFVKEVAEFGGFAAGLAIVPYYNKPSQEGMYQHFKAIADASDLPIIIYNIPGRVVVELTPETMLRLADHPNIIGVECTSLANMAYLIEHKPEEFLIYTGEDGDAFHAMNLGADGVISVASHTNGDEMHEMFTAIAESDMKKAAAIQRKFIPKVNALFSYPSPAPVKAILNYMGFEAGPTRLPLVPAPEEDVKRIIKVVVDGDYEATVTGVLRPDY

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure, Function, Stability and Knockout Phenotype of Dihydrodipicolinate Synthase from Streptococcus pneumoniae rcsb
molecule keywords	Dihydrodipicolinate synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Streptococcus pneumoniae
total genus	105
structure length	306
sequence length	310
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date	2012-06-06

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4fhaA00

4I7WA 2GQAA 3CWNA 2A5HA 3W72A 5DXYA 5AHLA 1Q6LA 1W5PA 3W2UA 4IPIA 5BNKA 2QUUA 3I7SA 3G1DA 3W3OA 2Y6ZA 4IUOA 5C55A 5KITA 5FESA 3T55A 3GXPA 1XI3A 1JQVA 3I6RA 3DI1A 1TPWA 1H62A 2Y85A 3G24A 3O1NA 3TA6A 4N9EA 3GAKA 3MI2A 3W71A 2W0UA 3BLEA 3THQA 3PULA 3GIYA 3DFSA 3NOEA 1NVMA 3TAKA 3W7KA 4O1CA 4TIMA 2ZZ6A 1K03A 3LHUA 2C6QA 3L21A 5CZ0A 2TPSA 3G1HA 3QMRA 1F74A 4JDYA 4O54A 2NX3A 4GUGA 3G1YA 4QQ3A 2DP3A 1VZWA 1SSGA 2EPHA 1EB3A 3G3DA 3W1AA 1EPXA 2QCDA 3QJAA 3UPWA 1JRCA 3IIXA 2CZEA 3NQAA 1KV8A 1S5TA 3HPXA 2FTPA 4JTFA 3IVTA 3NNTA 3S6DA 3TSDA 1SZEA 3P80A 2VFGA 3B04A 1PCWA 1GT8A 3QW3A 4O4VA 3V75A 1O4UA 2GOUA 1F6PA 4FNPA 1UBSA 4WUIA 1YPIA 1FCBA 1ME9A 1B9BA 3W85A 3DFNA 3P67A 3BLIA 4K38A 3VE7A 4M5PA 2A0NA 5DCDA 4TX9A 2EHHA 3LBMA 1L6WA 3R12A 5A8GA 3M44A 1EP1A 1X1ZA 3EEGA 4NNBA 4GUFA 3O8AA 1OFDA 2C3ZA 3DHDA 3BO9A 1JUKA 1ZJIA 1OF6A 1ZENA 4CLMA 4EWND 3OG3A 1XFBA 3HBLA 1LORA 4R53A 1GYLA 3S1XA 1YXDA 3MWAA 3LHWA 4JTEA 1SO6A 4XBKA 2HS6A 4YL2A 1HO4A 3NQVA 5KZEA 4Z08A 1PHWA 3W1XA 1H60A 3FLUA 2YFNA 4IQLA 4O8RA 1FCQA 3N34A 3BG3A 1LOSA 5T26A 3IVSA 2ABBA 4Y9AA 3NVTA 4HSNA 5AHEA 5F1UA 1BWKA 2X1TA 4R34A 3LDVA 4M7TA 3OVPA 5D04C 3EWWA 4IPJA 4KWWA 2NV2A 4O50A 2X1UA 1D9EA 1T99A 3SECA 3GXNA 1I4NA 3D0CA 4PL2A 1IF2A 3O07A 3O6YX 5HWMA 1ZALA 1GEQA 1JRBA 4JTKA 3P5YA 1N7KA 2DZXA 1X8FA 1CX9A 4RZ6A 3BLFA 1U5JA 2VC6A 3BW3A 2ZZ2A 2AGKA 4MFDA 4AF0A 3C2OA 1KLZA 2G97A 3TXZA 3STGA 1YLVA 4KFOA 1LZOA 1SQ7A 3PB0A 4O0KA 2JGQA 3HG4A 1W0MA 3RU6A 2H3DA 3NL6A 1MO0A 1TTPA 3DFQA 3I7RA 3MYOA 5F2IA 3EX4A 3G8RA 4MPQA 3UXDA 2OZ0A 1NEYA 2GVJA 2DZPA 3C2EA 1YDOA 4BFAA 1H7OA 2CLEA 5KMYA 3PBUA 3W76A 1OABA 1YYAA 3PY2A 5I3JA 2VXNA 3EX1A 2YW4A 1H7RA 1B57A 1O5XA 2VOMA 1BKSA 1XBVA 3Q58A 4PH6A 1VCGA 3LRLA 4XQ6A 3W73A 4O52A 1Q6RA 5C5YA 2V81A 4ZMGA 2QCGA 1KFLA 1K7XA 1R46A 2DORA 5AC7A 1EP3A 4O10A 3QRHA 4GC4A 1DJQA 1SW0A 1A5AA 1OFBA 2B7OA 3DI0A 3C61A 4WJEA 3SI9A 5BMXA 1FUYA 4NJJA 2I1OA 1A5SA 2A7RA 2C1HA 4N4QA 3N2MA 3GNDA 2YZRA 3NGJA 1K3UA 2H8XA 5CZJA 3IEBA 3SIZA 5TQLA 4LUIA 1QO2A 5LKYA 1JULA 3W83A 5F4SA 1W5NA 4GXMA 4UIOA 4GBUA 3W1NA 3EWYA 1VPXA 2E6DA 1GJPA 3F1QA 2A2IA 1OX4B 4CNNA 2F84A 4IMFA 2GJNA 4K8EA 4OE7A 3EX6A 4A22A 4N6FA 1EX5A 5G2IA 1P4CA 2B7NA 2J9ZA 3K30A 4WY0B 4AH7A 5IM51 5HWNA 3W87A 3A22A 5D2WA 1ONRA 3KVMA 3LCXA 2OMAA 3LLDA 2EKCA 5DY3A 4XTIA 1SW7A 5F4XA 1V7YA 4IJBA 3O06A 4RZ5A 5F1VA 1G4PA 4S1FA 4FHAA 2YR1A 2H90A 3CPRA 4FB7A 4RJEA 3QMTA 3SZ8A 2GUUA 3QM3A 3O15A 4MIMA 1F73A 1TJRA 4FXSA 1KFJA 2X1SA 5G1TA 2ZZ1A 5KTLA 5U7SA 3NPWA 1LRNA 1TPVA 1FDJA 2E77A 5BRBA 5EL1A 3WJXA 4LVGA 4LV4A 4O11A 2QAFA 1HFBA 1U83A 5D37A 3UPBA 4ZVJA 1XBYA 2WOQA 1UUMA 2NXHA 1SFLA 1K8YA 2TRSA 1P5BA 1MEHA 5L6UA 2RFGA 1QO5A 1QWGA 1QOQA 2ZZ7A 3TCEA 3KRSA 2QCFA 2R91A 4DEFA 1ML1A 4GE8A 1WV2A 2LLEA 1JUEA 3LHVA 5C6MA 1DOSA 3ZFHA 1EP2A 1ICPA 3ELFA 4HNNA 3LCHA 4EF8A 4TMCA 2ZDRA 2FDSA 1JCJA 5FF3A 2TYSA 4UFHA 2DZWA 5CZTA 2J24A 1OHLA 4MUZA 1FBAA 3BGGA 2WSYA 3WK0A 2A21A 4MY1A 2BTMA 3P60A 5I3KA 3BGJA 4XWUA 1OYCA 2ZTJA 3S1WA 4NJGA 2JKPA 2Q3OA 5DLCA 4QNEA 1I2QA 1QPOA 3PBWA 1HO1A 4LU0A 3TK7A 3T44A 3O6DA 3P62A 3NR0A 5EBUA 4UNLA 4RX0A 4NXSA 2I14A 1KM6A 3CWOX 3PC0A 1NFBA 4H3DA 3B0PA 4XKYB 3O63A 3G8EA 4NU7A 4O15A 2PURA 1X6UA 4YXGA 2ISWA 3L2IA 5G4EA 3TDFA 3KRUA 2FB2A 1TV7A 2V2DA 5EKYA 3BG9A 3TKFA 2VEPA 5AB3A 2C13A 5K4XA 4MZ8A 1FY6A 5LZLA 2A4AA 5FEWA 5CPMA 5LGXA 2JKAA 5K7JA 1GYNA 1QFEA 1OX5A 1ZY9A 4IX0A 1TO3A 4D2JA 1DQXA 2DU2A 2QF7A 3W70A 1RQBA 3S1UA 4FX6M 3GDRA 3IIVA 4UFLA 3STFA 4MKNA 2FFCA 1D3GA 5DY2A 1JUBA 4QNWA 3PG9A 4E2BA 1V5XA 1AW1A 1S3HA 1SO4A 3CIXA 1G7VA 2QCMA 2Y7DA 3B06A 4N9BA 1VH7A 4LW7A 3VFLA 4OV4A 2NXGA 3TAOA 2GVGA 5FEXA 2ZCGA 3NEVA 1M6JA 3GDKA 1KM3A 3G0UA 3GKFA 3MJYA 4MLRA 3A9IA 4K6AA 3W23A 3W74A 2RDWA 3W75A 3TC7A 5J5RA 1JCLA 3FYPA 4BI5A 2EF9A 2VELA 4LWWA 1UB3A 1TV5A 1ZAHA 4BR1A 1NF0A 3NQCA 4DBEA 1MEWA 3GDTA 4PFMA 4L4LA 4TMBA 5AHFA 3TMQA 3LCIA 1PV8A 3TNOA 5I3GA 1THFD 4JY8A 4NXKA 1PIIA 1FDYA 3GR8A 3LM7A 3IIPA 3M1ZA 4JTIA 3KOFA 3EXSA 4NUWA 4TO8A 5LNVA 3S9YA 2ISSA 3CQ0A 2V82A 2Y89A 1ZAIA 2BXVA 1TB3A 5KINA 3W7OA 1DORA 4FEZA 5HR7A 1NF7A 3NL3A 4IMCA 4FNQA 4LVAA 1X1OA 2ZA1A 1YTEA 1TYGA 1C9DA 2J6XA 4AHQA 3QH2A 1X7FA 3L67A 4PEKA 4DO6A 1M7OA 3DZ1A 3CC1A 5CSRA 5LNSA 3LERA 1FWNA 1DQWA 4PC8A 2DZUA 4WOQA 1B4EA 3GYEA 3E9AA 3GXTA 3TUUA 5D33A 4P61A 3QFEA 1W8SA 4GNJA 3KX6A 2YYUA 1KFKA 1IIHA 1I2RA 1ZAJA 4IX2A 3O05A 2YFOA 3KHJA 3PWAA 3QPYA 2WNNA 4ONVA 1IXNA 3N2XA 3WJWA 3F03K 3N73A 1FX6A 2X1RA 1G4EA 5K9CA 3DGRA 3W7PA 4Y6GA 3FKKA 4AMAA 4PTNA 5CSSA 3JS3A 3UQNA 4FXRA 3E12A 2HS8A 1OX6A 3G22A 2FB3A 3NG3A 4YMZA 1OYAA 4Z0JA 1YADA 5FEZA 3CLMA 3N3MA 4JICA 3O6CA 3UWYA 5D2XA 5HUPA 1FCUA 1VCVA 4RXGA 1IXPA 3N14A 4O1BA 1W56A 1N8FA 3VCRA 3S5NA 4I9AA 3M41A 4N6EA 4JX4A 3UZ5A 2NV1A 4UTHA 3NYZA 1MEIA 2E5CA 4UTMA 4Z1AA 4X2RA 1WXJA 3C2VA 3WK2A 4O12A 5EY5A 1KBJA 3TU9A 2P0OA 1F2JA 2ZZ3A 3G18A 3UZJA 1T96A 3NPUA 2E1DA 4MLJA 4QAIA 2H3BA 3H55A 3NQEA 4N2YA 1O5KA 2FPTA 4O14A 3QC3A 3W22A 5C54A 1QDSA 3MW7A 2CLHA 2O7SA 3Q37A 4UXDA 4QISA 3LB0A 1LBFA 3BV4A 3HGSA 2Z0IA 1OX4A 1SSDA 3EKLA 2OCZA 4RR4A 3DFPA 3LLFA 4OHQA 3NXFA 1OFRA 3PG8A 4EIVA 1QMLA 1M7PA 3LI0A 3JR2A 3W7NA 3I65A 4R7JA 4WY0A 3VNDA 3E96A 3WJYA 3L5LA 4DELA 1AL8A 3W1UA 2CWNA 3HG2A 3LRKA 4CQAA 4IMDA 5K9DA 3C4UA 1TPFA 4O0ZA 4RV8A 4WD0A 4GFSA 2CU0A 3H54A 2E5DA 4MVAA 5AOUA 5AC6A 1WYIA 3W7LA 4Z0SA 4C1LA 2Z6JA 3HGOA 4UFJA 2V2HA 1KW1A 1F6KA 2R8WA 1RQHA 3QQ1A 5DN1A 4AHPA 4U28A 5F2GA 4NJIA 3NQ2A 3TSBA 2NLIA 1WBHA 4ZZ9A 5C2XA 1XBZA 4JNMA 3LGEA 4JX6A 3DBPA 2OT0A 4BK9A 4LRSA 2B7PA 3W7DA 2QCHA 4JDBA 5LNUA 5KZDA 3TXVA 1ZCOA 4AWSA 3QQ0A 3A21A 3WJZA 3LXBA 3AO0A 3KVKA 2ZRYA 4I7VA 3OA3A 5CZSA 1Y0EA 3M5YA 5E1QA 4DPPA 2G95A 2A7PA 3BG5A 1EA0A 2DJXA 1KFCA 5I3FA 2BLEA 2NX9A 5G4WA 3NQGA 1WAUA 1TCDA 5AHMA 1HTIA 1R30A 1GZGA 4NVTA 4HNUA 2TSYA 5BMWA 3KRZA 2PC4A 3BPWA 3EWBX 1TREA 3G1FA 4UFMA 3B8DA 4HIBA 2WNZA 3TFXA 4FNSA 1W54A 4JEQA 4N4PA 4O1DA 2C16A 4UTTA 1LRTA 3EX3A 1YPFA 3UWZA 3PUEA 3W2MA 1QCWA 3WJSA 4JN6A 3BW2A 1K7EA 2QCNA 5FF2A 4UR7A 1PE1A 4XKYA 2E6YA 4G1KA 1TQXA 1DBTA 1VR6A 3AJXA 2ALDA 2WO5A 1EWDA 3C8FA 1KM4A 3M9YA 3QEZA 3SFKA 1L2UA 3N19B 3E02A 1BWLA 4AEOA 1Z41A 1I45A 1OK4A 1G6CA 3B4UA 4OQVA 4FX8A 3NQ8A 1LOLA 4GJ1A 2ZRWA 3C3NA 1OFEA 3DFTA 2RDUA 4CQ8A 4LUJA 4BWLA 1A50A 2H6RA 3TV8A 1TIMA 5AC8A 2CLOA 5G2WA 3C6CA 2Y7GA 1L6YA 2NZLA 4HT3A 5G1YA 1KM2A 1SZFA 1UUOA 3L68A 5AYXA 5D2VA 2CW6A 3W6YA 2Q8LA 3VI2A 3W2JA 5K2ZA 3PBVA 2DZTA 3HOJA 4XBSA 1M5WA 3FIGA 1HL2A 4NX0A 3FA5A 5LNRA 2OJPA 2HTMA 5FF7A 2VENA 3LCLA 4ORIA 2RH9A 3ATYA 1XKYA 3W86A 3HG5A 3MHGA 5E93A 3PSWA 3GKAA 1DVJA 3CEUA 2GVLA 1VLWA 1KA9F 4WZHA 3KXQA 4JTTA 4LY8A 4UC5A 3FKRA 2QJGA 1JJKA 3P74A 3IGXA 3DAQA 4K37A 4Y8FA 3RK8A 1WOAA 1XL9A 2FPVA 1S5WA 5CGQA 2WKJA 3LTPA 4FNUA 1UJPA 2C0AA 2P1FA 1F7BA 1PCKA 3KFTA 1WBJA 2J9XA 3P7YA 3L5AA 1H7PA 4JGDA 3NL2A 1C8VA 3C56A 2E5BA 4JX5A 4ZQCA 1H50A 5F4WA 3DKLA 2QDGA 3EB2A 3DU0A 2C15A 4CCDA 2GJLA 3P81A 2Y7FA 5CG7A 3TE9A 1RVGA 3O16A 4FIRA 2A6NA 4UR8A 4E38A 3HO8A 2ZFAA 4C1KA 1LROA 1QPQA 5D03A 1CI1A 3STEA 4PCFA 1Z42A 4Z1BA 5EMUA 1VYSX 3TX9A 2FLIA 3BK0A 2KZHA 3GX9A 3M5XA 4B5NA 2V30A 6ALDA 1TSIA 4R33A 3QSRA 1W37A 4WQ6A 1OJXA 4J9JA 1JVNA 2A1YA 3RF9A 1AW2A 2HMCA 4MYAA 2XN1A 3W88A 3LCGA 3GLCA 3L65A 2BSLA 4X9SA 4N02A 3QYQA 3W1MA 1YTKA 5LHEA 4AVFA 2JGYA 3MI3A 1GVOA 3M16A 4UCGA 4M6VA 1YXYA 3TQVA 2YPIA 2TMDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4FHAA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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