4FOJA

1.55 a crystal structure of xanthomonas citri fimx eal domain in complex with c-digmp
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
255
structure length
253
Chain Sequence
DRAEEERIERWVEQLREALVGDGFLLHYQPVLNLQPLELYQAFLRLERNGEMMSPNAFMAIAEEHDLVTEIDRWVVARAIRQLGERQRAGHKTHLLVRIGPNSFSDPQMIDTIREQLAVYGVPGERLWLQTPESKVFTHLRNAQQFLAAVSAMDCKVGLEQFGSGLDSFQLLAHFHPAFLKLDRGITGDIASARDSQEKIREITSRAQPAGILTMAEFVADAQSMSSFFSAGVDYVQGDFVAPTGPLMNYEFG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of the PilZ-FimXEAL-c-di-GMP Complex Responsible for the Regulation of Bacterial Type IV Pilus Biogenesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FimX
molecule tags Protein binding
source organism Xanthomonas axonopodis pv. citri
total genus 88
structure length 253
sequence length 255
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-06-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00563 EAL EAL domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.450 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel EAL domain 4fojA00
3GFXA 4Q6JA 3PFMA 3PJTA 3PJUA 4Y9PA 3HV9A 3PJWA 3GG0A 3GFYA 4FOUA 3KZPA 5M1TA 5MKGA 4Y9MA 4AFYA 4AG0A 4ES4A 3HV8A 3TLQA 4RNFA 4F3HA 2BASA 2W27A 4Y9OA 4LJ3A 4RNIA 4RNHA 3SY8A 2R6OA 4KIEA 4HU3A 4Y8EA 4HU4A 4RNJA 3GFZA 4J40A 3S83A 4FOKA 4LYKA 4Y9NA 3PJXA 3U2EA 5MKGB 4FOJA 5MF5A 3N3TA 4HJFA 4F48A 3GG1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5I0DA 1ZJIA 2I5GA 1TR1A 1UWRA 4QG8A 3QZAA 1XX1A 1PAMA 1IWBA 3OBEA 1R3WA 2VDHA 4OHQA 2HPMA 4P7OA 1Q7ZA 3UZXA 4JQ3A 3O07A 2UZ9A 1TX0A 4WDWA 1LLZA 4JFUA 2OMAA 3RPDA 1PCKA 2Z1WA 3RK8A 1YNYA 3EB4A 4XAZA 1F73A 1EBHA 1ZGDA 4QCFA 4FK9A 5BXTA 1U2YA 3LI1A 1TZ9A 2NQJA 2X1TA 3KBWA 1SO5A 2DZXA 3QYQA 2PDJA 2PRMA 2ZDRA 2GUYA 3QPZA 1C7TA 3FYYA 5HBFA 3LXCA 2P50A 3T0TA 4J3VA 4RJEA 3GRIA 4AAJA 3VILA 1TRDA 3LERA 5FOOA 4HPGA 3WLNA 3AS3A 3JW7A 4NJIA 4C6FA 3GC2A 3K4DA 3QQWA 4I9TA 4O1EA 3KFTA 5BU6A 2JEQA 1NDZA 4UR7A 1LG2A 2XFRA 3UJFA 4UTWC 1FHVA 1DWAM 4JKKA 1B1YA 4YTRA 3PPFA 1ADDA 4FX6M 1W1YA 5I24A 4NT0A 2XVGA 1EC9A 2G3NA 3S1XA 1O6IA 2V2DA 5AHEA 4GVGA 2Y7EA 4E8DA 4ZE4A 2W67A 4URIA 1XXXA 4Y9NA 2YCLA 4PMQA 3NIYA 3OZOA 4HA3A 5FJRA 2ALRA 1JZ5A 2GK1B 4M51A 4XAPA 3FSTA 3G22A 3PTQA 2R1KA 1GJUA 1X7FA 4MSSA 5EFFA 3F4NA 3T2OA 1NQ6A 4JD4A 4BI5A 2JIWA 4OECA 4TTGA 2PSNA 3FV9A 3FA3A 3R4IA 4ZQMA 3UW6A 1JYWA 3FEMA 2XFFA 1C29A 3KBMA 3CZJA 5DBUA 3TYUA 1GVOA 3FLUA 4V1XA 3N11A 4GXPA 4YN5A 3GC5A 4LU0A 4U3AA 1UASA 3FFSA 4D8ZA 4S3FA 2XSBA 2DUXA 1A5BA 4OE7A 1P7TB 4R9OA 3TKFA 4Y6GA 3FX4A 3MHUA 1E43A 1VEMA 3N2TA 3TUUA 1FWEC 4AEFA 1JDDA 3VVGA 1UOKA 2R1MA 3KOWA 4OV4A 2AGTA 4NSBA 3W7GA 3NL3A 2J6VA 3TZNA 3Q45A 1UBSA 4IPIA 5A6JA 2PU0A 5IDZA 1DWGM 1P1XA 1IIHA 3GHTA 3RLHA 4LVDA 1W8SA 4M29A 4PE8A 1UR9A 3MMWA 1E4LA 4TVDA 5HA7A 2ISWA 4UTJA 2DT1A 2VEIA 3UZZA 2JK2A 3KVJA 1ODUA 3IVSA 2PC8A 2WZHA 1UH2A 3MZNA 2PDXA 1IGSA 2BWGA 2DT3A 2Q6ZA 1VJIA 4H2CA 2OOFA 5HNRA 1RBOB 1IGWA 1KGWA 3EMZA 4O0ZA 3SRDA 2IKJA 1EZ2A 4XTIA 1X96A 3UD6A 3WUEA 4F48A 1TJ0A 3QZEA 1S39A 4JQ4A 3TAOA 3B8TA 3ARXA 2VZVA 4JDBA 3U48A 2YSWA 2KZHA 4Q8TA 2WHKA 1R85A 2FLIA 1S2TA 1HVQA 1XBXA 2YDAA 4LBRA 4XZLX 5KSWA 2ZXQA 3FNDA 3G1FA 4UXDA 1V0KA 1XLMA 4OBRA 1NTHA 2F84A 4LUIA 4EF9A 1H1NA 4EWND 3UZWA 1AW5A 2H90A 1XLLA 3K13A 4JEQA 1TMLA 1MNZA 4AC7C 2VO5A 3CK5A 4PMYA 3ISIX 3NNTA 3P7YA 4PUNA 3H21A 3FIGA 3ALFA 2R24A 3U5UA 4HTYA 1HT6A 4AMAA 4H8HA 1V3MA 2CESA 2CLLA 1VFOA 3VNMA 3CQJA 4DPQA 4O0KA 1I2RA 4QNEA 5EB8A 4GI6A 1EA9C 3W85A 4KIRA 4WSHA 5HNNA 5FF0A 3EB3A 4W8LA 3MDUA 1KV8A 3M4HA 2PDLA 2CLOA 3S2NA 3CH9A 4X22A 2CERA 2E5CA 1NF0A 4FNPA 2PTXA 3T4CA 5G5IA 2DVTA 3O1NA 1XYZA 3G1SA 2QV5A 1DHPA 1T7LA 3GWQA 1RPXA 4OV9A 2CHRA 3M0XA 4K7VA 4Q8PA 1LOSA 4CGTA 3AO0A 5H2ZA 3HF3A 1GQNA 5LKYA 1RY0A 2QDHA 2B7NA 4PFMA 3PK7A 4J2PA 1OX4A 1OG0A 1GJPA 1A5KC 5RUBA 1TQJA 2DEPA 4EPDC 2GL5A 4ERIA 3EBVA 3I7SA 5CZ0A 1IHIA 3PG9A 2F61A 2BASA 4QS6A 2WNNA 3EDJA 2FGBA 1IT0A 3BAIA 2YCJA 3MCOA 4JTLA 4CVWA 1Z7AA 4EVZA 4XAGA 1C9DA 1KRMA 1E3XA 3G1AA 1BF2A 1XL9A 4ICCX 2XIOA 2OGYA 1PKNA 1FWTA 1JI2A 3VM7A 4NAEA 3WQFA 2AL1A 2ANUA 1MEIA 3HG2A 4PMRA 3TVAA 2J7DA 1UP0A 3LPGA 1AZ2A 1EWDA 1VJSA 1J8VA 1KA9F 2EPKX 4PMDA 3WLLA 1R3SA 1VFLA 4BA0A 2XFWA 5CC6A 4ZQCA 3CMGA 1E4IA 3B9AA 4I90A 3JUGA 3BG9A 3M44A 4GIRA 2IPGA 1KTCA 1EP1A 2QXWA 2H3BA 3S2JA 4POCA 1MW0A 3MC5A 5JBEA 2WHLA 1EPXA 1TWSA 1EHAA 4PMZA 3T05A 4NXSA 3QSRA 4D8LA 5C2CA 5EA9A 4B3ZA 2D0HA 5D38A 4UNKA 1ZSXA 3WNPA 1SU5A 1MYRA 3TN5A 2YL6A 1Q65A 1O5XA 4DF2A 3BW4A 1G01A 3ANVA 2OLAA 3NQ2A 3BDKA 4PC8A 1BEUA 5FSEC 1S3TC 3S5OA 3ENLA 4AD5A 4O1BA 3HTWA 3E2QA 3TFCA 3TDFA 1SZFA 1OC5A 4PTXA 1WO2A 5FF3A 1X8CA 3CUZA 3T7VA 6XIMA 3N17A 4IMFA 1WDRA 4QEEA 5FAJA 3VNKA 3FSUA 4MY8A 5A8QA 4Q8NA 4C6IA 4FPSA 5CPNA 2CWNA 3HG3A 3TJLA 3ARWA 5M1TA 4I9MA 2OKOA 4B5UA 3UCQA 2ISSA 4NILA 3W6YA 1V77A 4NZ1A 3NEHA 1CB7B 4C7DA 2CETA 4WXZA 3IS4A 2XGBA 4Q7NA 2G96A 3POHA 3LB0A 2WHJA 1X98A 2WMGA 2O56A 1GVEA 2CIPA 1I2OA 2HBVA 4HGXA 3I6EA 2GZXA 2E9LA 2YA0A 3HGOA 5HDRA 5F2LA 2W3ZA 3VC6A 2C0HA 1Q8AA 4CQAA 4QFUA 2J88A 2QUMA 2BY1A 4RE3A 2ZVRA 3BSMA 3TW6A 3R7MA 1MZHA 4YTTA 5JMUA 2E6FA 3BO9A 5TBOA 2DZBA 3UXAA 1YW1A 1Q66A 4AW7A 4NL1A 2VXNA 3BAWA 1QO2A 4A35A 5EMKA 4KQNA 3UESA 2VFEA 4Y9PA 1OFDA 2AQOA 4D6FA 1CZ1A 1YTDA 1XS2A 4L6DA 1Q6QA 3N4FA 3P14A 4UFJA 2ZYFA 4J3UA 4S2CA 3URNA 3CZKA 3E5PA 4B91A 1KLYA 5AB3A 1Y5XA 2PDQA 1CW2A 5HOSA 2FDMA 1L2UA 3CZ8A 3VXGA 4AVFA 1A5CA 1ZZMA 3AICA 1Q5MA 2X0HA 3CU2A 1EBGA 3S6OA 3W53A 4XD4A 1C8YA 1POJA 3AIQA 1CYGA 5CXPA 4GD0A 1QATA 3N19B 3L2LA 2NWSA 3VX1A 3WO8A 1WE5A 3G1RA 2WKJA 3SSJA 1Z32X 3OYXA 1S2UA 2ZZ7A 1UH4A 2ZC8A 3ZLHA 4M3PA 4HNLA 4JFWA 4KW2A 3SCOA 4ADTA 1RQHA 3GTNA 2YBVA 4XD6A 3LS9A 3O15A 1KQYA 2ZIDA 1RUSA 4MJMA 2GQ9A 1TPUA 3K8KA 4E6MA 5K4XA 5B7ZA 3A3HA 4QQ3A 1TV4A 2VWTA 1J4EA 2QUUA 4LFYA 4J28A 4Y8EA 2W63A 1H62A 4X3ZA 4U31A 2V9DA 1H63A 4OJYA 3SUWA 4WCJA 1V0LA 1BTMA 3VNYA 1OGGA 1VRXA 1BQGA 4ZQPA 3C5QA 1VC4A 3ONBA 3S9YA 1FWHC 4AZ6A 3WSUA 4IH3A 3TN3A 2XSXA 5CJMA 1PIGA 4L4OA 1PTDA 2ZXDA 3MQTA 3C2EA 2ZRWA 4A21A 1RBAA 3MW7A 1W1B1 2ZFAA 3G18A 4I6KA 3G8EA 4QSHA 1CX9A 1TPEA 1H11A 5H8MA 4F40A 3C56A 2NV1A 1K8XA 1F61A 1CNVA 3WDIA 4JAWA 2BG5A 3T8QA 3RN6A 4MYXA 4LB4A 1H50A 4EPKA 4PUJA 4GMEA 4UQBA 4C5YA 4MUZA 1UP3A 2WVTA 1Y5WA 4AZGA 2X7VA 3RCYA 4KWWA 3STFA 1YDVA 4PGLA 2OT0A 1OGSA 2DZWA 3TYDA 2QV4A 4X61A 4Q8OA 1YX1A 4TO8A 3I6RA 5D32A 4AIBA 2QVNA 4JGDA 2WMFA 3CV6A 4UTTC 3SIMA 2E5DA 3PZIA 1L8PA 3MMDA 2JE8A 2R94A 3TONA 2AOSA 4JIEA 3MP4A 2OZ0A 4DJFC 5D2XA 3H53A 2RHGA 3C2RA 4O11A 1UWTA 1MUMA 4RDZA 3EA1A 4P8WA 4F0LA 2ZZ4A 3WLJA 3P60A 2X41A 2OWXA 3AMGA 3AIVA 2XWEA 3W7MA 2J7BA 2IXUA 2OSXA 5C55A 3GH5A 4LYPA 1U22A 3VD9A 1E15A 3LUTA 1EGMA 5AYIA 4D6GA 2V81A 5AYZA 4HQVA 2Y5JA 4IICA 2YXXA 4TQTA 3ZT5A 3EA2A 5A6TC 2OSYA 2JALA 4QGCA 1VHCA 3IJDA 3QZ6A 1XR2A 2SFPA 4Y8FA 3W1TA 3N15A 4L4LA 2L5HA 3GAYA 1RPKA 4C6NA 1QASA 3FOKA 1ZQ5A 3H4WA 4HYVA 4IUOA 1JYVA 2CLPA 1PEZA 4A6GA 4PEKA 1W3TA 4NX5A 1I45A 5REQB 4ZXOA 1W3HA 4AB4A 2OCZA 5H8UA 3LY0A 3OGRA 1VCGA 1C91A 1JAEA 2OEJA 3H2FA 5KETA 1EA0A 5AOUA 4M1BA 2IKGA 1TIWA 5J5RA 4AEOA 1GVIA 1BSIA 4HNOA 4WXYA 2QCLA 2DV0A 1V3KA 3F7JA 5HWJA 1N8IA 3PP7A 3PZUA 1UWUA 1YTEA 2C8NA 4MFEA 4F9JA 2YDQA 1OCQA 4NZ5A 5DO8A 3C2VA 2GGEA 2YOCA 3MV01 5BOFA 1XF0A 4R7JA 4PBGA 4NJGA 3ZVIA 2X16A 3A3WA 4B5VA 1KXTA 3RR4A 4PH6A 1MDRA 1ZPTA 3OBKA 4KCVA 5FL0A 5HAOA 3GZAA 4AISA 4KESA 2QS8A 2V0TA 2G97A 4MAZA 3INPA 3WY1A 2Y5EA 1M53A 4JFSA 4K39A 2PF0A 1A47A 4D9PA 3LTYA 2GLKA 4YHGA 3SCVA 1KW1A 1ZLPA 2FFCA 3W1MA 2J24A 3V3WA 4JTSA 4LVFA 4DI9A 5IXEA 1TV8A 4AD3A 5LXXA 1LL7A 1ONRA 3TYAA 5KZMA 3DG6A 4CD5A 3QXBA 5JH2A 3ATZA 2OXNA 3BWWA 2D22A 2WLYA 2QMJA 4Y7EA 4DO7A 2QAPA 1XFCA 5EMUA 2RDTA 4L6OA 1FTXA 3EX3A 3UR5A 2WZTA 3ARSA 2XU2A 1TMQA 4PMJA 3C2YA 4GO9A 1KLZA 5DXXA 2W4XA 4DB7A 5DCBA 2TAAA 2ZRUA 2XIBA 2QGYA 1Z41A 1HKIA 2Z7KA 1A50A 3IGHX 1SO4A 1E0XA 4KPLA 2Z25A 1TG7A 1TPDA 1KFBA 4GUJA 4HOWA 1J93A 2GSEA 1U5HA 3N14A 3VNZA 3S83A 1JIBA 4ROQA 4EAYA 1W1PA 1QR7A 3BMWA 1G1YA 3GTFA 3GG1A 4AY8A 3SR7A 4CUCA 1O66A 1M03A 1TIMA 1VLWA 3W81A 2ZCGA 1FCBA 3HPSA 2P88A 2XYLA 1GOWA 4E8CA 3E0WA 2PDWA 3W83A 1XLCA 2D1ZA 3LCWA 4WK9A 5ABEA 4L9XA 1MUCA 5DCDA 3GU1A 1QOXA 1XLAA 4B5TA 4Q6JA 3WENA 4HMCA 4PA8A 3RO8A 5I5RA 1OCJA 1EFZA 4GUFA 1XLJA 2A1YA 2NQHA 3OODA 3SJ3A 1QWGA 1T6MA 1PPIA 1PKMA 3T0CA 4LB3A 4Q32A 2X30A 3PBYA 5A6MA 2DVUA 2OG9A 2ABBA 4HOXA 3XINA 2WYSA 4S39A 1XYFA 1TB3A 3G1HA 4PTWA 4XZIA 2HK0A 2QW5A 5DMLA 4H19A 4RZ6A 3FS2A 5LIYX 4LW7A 1A4LA 5DRCA 3T8LA 2ZKMX 2WPBA 4L56A 4XD3A 2QUVA 2P0IA 1E4MM 1ZJAA 2BHUA 3TSMA 3NGFA 1GORA 4UCFA 3LXBA 3CUJA 4LALA 3I4EA 2YL9A 2VD8A 2WCAA 4GY1A 2GOKA 3H23A 4DVOA 3QGAC 1V6WA 3GUWA 1DEDA 3WN6A 5FESA 4H3DA 4IF2A 4KH2A 3GVGA 3L65A 4H6RA 1W6TA 1FA2A 1E1EA 4OBTA 1AQHA 2GDVA 4JX5A 1E55A 4OUIA 1XGEA 2VQUA 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