4FX7A

Structure of sym2 d9v+d55v+d130v+d176v
Total Genus 84
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
84
sequence length
240
structure length
240
Chain Sequence
QRVVVAIVAKRVDGEFMVFTHSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRVGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVAIVAKRVDGEFMVFTHSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRVGTKSGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Sym2 D9V+D55V+D130V+D176V
rcsb
molecule keywords Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF
molecule tags Lyase
source organism Thermotoga maritima
total genus 84
structure length 240
sequence length 240
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2012-07-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4fx7A00
1H61A 2KZHA 2FPYA 3QEZA 3GAYA 1MZHA 3LTYA 5D2TA 3D0CA 5TQLA 3P74A 3B8DA 3NQEA 1JRBA 2NUYA 4NJJA 4CQ8A 3W7IA 3UNDA 4N9CA 2ZZ1A 3BW2A 2QCFA 4DBDA 3LBMA 3DI0A 3ELFA 1KA9F 2ZRZA 1SZFA 1VC4A 3W07A 4U28A 4UUIA 3UQNA 1HTIA 1ALDA 4UCGA 1M7PA 3OIXA 1H60A 5I3KA 3G22A 3TQVA 1F74A 1QNVA 1W31A 3W1QA 3T40A 3WJZA 5HR6A 4Q32A 1YTDA 4MZYA 1DJQA 4FX6M 4A2SA 3LXCA 3TW7A 4DF2A 5D05A 4JR5A 2GVLA 2R91A 2VFGA 2V2CA 3W72A 1IIGA 3LLFA 4QNEA 3HGSA 4UFJA 2C16A 4LRTA 2C1HA 5FEXA 1H50A 1XCFA 4QIUA 4AWTA 5FESA 2ABBA 3CQ0A 3BVJA 1H5YA 1DQWA 1W5PA 5U7SA 3A5FA 2V2DA 2XN1A 3EB2A 1FWNA 4UMBA 5BMWA 5CPLA 5F4SA 5AYXA 3LI0A 5G2WA 1IF2A 2PCQA 1X7FA 1F7BA 2XN0A 5C6MA 4HSOA 1TPDA 4Y90A 1PVNA 3L65A 3P84A 3KVJA 3V75A 2ZZ5A 2QCHA 4GC4A 3I6RA 5D2VA 6ALDA 1ICPA 1IIHA 4Z08A 4GUFA 1VR6A 1OYBA 3STEA 2CU0A 1KM1A 3TFXA 1TO3A 5FEPA 3BARA 1BWLA 1KV5A 3TXVA 2RDWA 3A24A 3LGEA 4Z0JA 3LLDA 1VYPX 4RV8A 1VZWA 3CM4A 1TTJA 3KVLA 4XTIA 3EX1A 3LM7A 1JRCA 5F2MA 3CIWA 2BLEA 3LV6A 2WO5A 1ICQA 5DXXA 4TMBA 1Z41A 2NLIA 3O05A 1AMKA 2BXVA 1LZOA 3CEUA 3LTPA 3S5ZA 1FWSA 1RQEA 2E09A 5BMXA 1GT8A 2X1UA 4UTIA 1S3HA 2P1FA 1QFEA 4M6PA 5BRBA 4JD4A 3DENA 1TQJA 3ZWSA 3B04A 1RQBA 4K8HA 1THFD 2ZCGA 4ZZ9A 1KW1A 3TDFA 2CFFA 4WXYA 3WJYA 3OG3A 1IXPA 2ZYFA 1FBAA 2WOQA 2DZPA 3S5NA 4EIVA 1GVOA 2VXNA 3BPWA 4FXSA 1TPEA 3W1NA 1NAL1 3F1QA 3W88A 3BG3A 3M47A 4NJIA 3G0XA 3NQ8A 1Z44A 3HMJG 4WY0F 4UC5A 3LCLA 3L5MA 4UXDA 1EEPA 4EWND 1KM3A 5L6UA 2ATSA 3W71A 2P0OA 1K03A 1WQ5A 1O60A 3NQVA 5KZDA 1QMLA 3RNDA 1DV7A 3W2KA 1FDYA 1OF8A 3QMSA 2QCCA 3I7RA 5CZJA 2B0MA 1F6PA 4OU1A 3C2FA 4YLWA 2OMAA 4AEOA 1TV7A 3MO7A 2ZZ7A 4M5PA 4H3DA 4G1KA 1GG1A 3TC6A 5K9XA 3SW6A 3F4NA 3DKLA 2VEPA 1TB3A 4MY9A 4O1DA 3NAVA 3NGJA 2ISSA 4GFSA 1GTHA 1SSGA 2A5HA 2ALDA 4YCPA 3FYOA 3EWWA 3B0PA 3GDRA 3EX3A 4IXXA 3CWNA 3M5YA 3I7SA 2ZTKA 3W86A 1EIXA 3DHFA 3VI2A 4U4MA 5FF0A 1AL7A 3JRKA 2QEZA 4A21A 2Z2UA 5D30A 2Q8LA 5I3FA 3N14A 3RFAA 2X30A 3KOFA 1W5OA 2VENA 2H3DA 1GVSA 1EWDA 2CLIA 3JR2A 3W73A 3W7RA 1MEWA 3FEMA 5F4XA 3FOKA 3PBYA 5C55A 3R13A 4AF0A 2G97A 1J2WA 1TIMA 3CHVA 3M0ZA 1W0MA 1WDWA 4JX5A 2ATMA 1K02A 1TRDA 4M7SA 1TPC1 4ML9A 3MP3A 3PUDA 4O54A 3W1TA 3GXTA 3QM3A 1SFJA 4CCCA 1LLZA 1VCFA 5CPNA 3G24A 3PAJA 4O15A 2Y85A 3TH6A 1LYXA 1T0OA 1WBHA 2PRHA 3KVMA 2ZQ0A 2V2HA 4IMCA 1EP3A 2FIQA 2X2GA 1SZGA 3PWAA 4CNOA 3NL3A 1I2PA 2E6FA 4C1LA 1VYRA 1LLWA 3NL6A 1BWKA 5CZTA 3W85A 1C29A 5FI8A 4O53A 2CZFA 1VHCA 1JCXA 5I3GA 2JK2A 1W3IA 4O57A 2WSRA 2E6AA 5F1UA 3DFOA 2ZRVA 2DJLA 1UBSA 4C1KA 3W7JA 1L6YA 4Y9AA 2WNQA 3LCXA 3A5VA 3NM1A 4AHQA 3S5OA 1DBTA 2Y88A 1OK4A 4K39A 2OT0A 3W2UA 4I7WA 1FXPA 1R46A 2DP3A 1I45A 4GBUA 1PV8A 4YMZA 3MJYA 5E93A 3TSDA 2QJGA 4HN4A 1XM3A 4IGHA 1SFLA 1W5QA 3NQ2A 3W1UA 5KMYA 4BI7A 2QDHA 3VE7A 3B03A 1A5AA 2A0NA 3BG9A 1ME8A 2G5WA 1A53A 3AJXA 2J9ZA 3KVKA 4JN6A 3BW4A 1FWWA 2QCGA 1UUMA 3C4UA 3ZFHA 3O63A 5D2XA 4Z1BA 3C2RA 4E0CA 3SECA 2EGZA 3EX2A 3UWWA 5LNRA 3U6WA 4EVZA 1SU5A 4MFDA 1P0KA 2VELA 2DZTA 1KBJA 5G2IA 1WA3A 3IGSA 3WJSA 3ABSA 3NG3A 3W6YA 3FJLA 5C54A 4J9JA 2E77A 2ZA3A 3W7KA 2A7PA 1ZNNA 2V82A 3TCEA 1PHWA 4NJHA 3M5XA 3H55A 3HJZA 2QUTA 1XC4A 2J9YA 1XUUA 2CZDA 3WJWA 4BWLC 3GXPA 3SR7A 3KAOA 3ABRA 4ORIA 1OFAA 2FQIA 2O7SA 5CPOA 1MXSA 3R8RA 3TQKA 4I7UA 4N9BA 2FJKA 1I8JA 1DQXA 3Q58A 3THAA 4O14A 3W7LA 3DXIA 4O1BA 4ZQPA 3W70A 1AW1A 4IX2A 3HGRA 4O8RA 4FO4A 1P1XA 3LRKA 4NX0A 2X1TA 3O15A 1OK6A 2RKXA 3MUXA 3ZWTA 1LROA 1ADOA 4PTNA 1QR7A 3SY5A 1KFCA 2YDAA 5KINA 3T55A 3GZ3A 4LU0A 1VLWA 3RK8A 3W76A 2E5BA 3W7HA 1EPXA 4DO4A 4TO8A 2NWRA 4JIQA 2I9EA 2Y63A 3IVTA 4NZFA 3QMTA 4IOTA 3W9ZA 1G69A 3P61A 3N2MA 3GB6A 3PB2A 2OX1A 4WXZA 5DY3A 2C14A 5LNUA 1K7EA 3HO8A 4UTUA 1F76A 1LORA 1NFBA 2DZXA 2DU2A 1RPXA 3TE9A 1SZNA 1D3HA 4NNAA 2QCNA 3AO0A 1FXQA 3MBDA 1P0NA 2Z1BA 4M7TA 1QWGA 5AC7A 3TU9A 3MI2A 5CZ0A 1VHNA 5D02A 4YWIA 3GLCA 5G1TA 1H7OA 3RU6A 1GEQA 1LDCA 3QJAA 3UZJA 3PB0A 4LV4A 4ZQMA 4NJKA 2TMDA 5F4WA 3HOJA 3LXBA 1VS1A 2ZDRA 3QSRA 3LCFA 4H4IA 4FX8A 4JIPA 2JKAA 4NXKA 5AC6A 3G8RA 3LTSA 5FF7A 2QCLA 1B57A 3RLUA 1OX4A 1LOQA 2YX0A 3L0GA 1VGAA 3IIVA 1AG1O 3DZ1A 3TR2A 3ZS4A 1Y0EA 3G1SA 5EPDA 2R94A 4OV9A 1GJPA 1LBFA 1R2SA 4UTLA 3M1ZA 1GYLA 4JXCA 3QRHA 1LM1A 3DI1A 3JS3A 4NXSA 4A2RA 5FEWA 5K9CA 3HQ1A 2NX3A 3W83A 4M6VA 3N19B 3FJ6A 4PH6A 3C2OA 1TSIA 1R2RA 2DORA 2YGYA 3EWXA 2PC4A 4YL2A 1SQ7A 3FLUA 4FX7A 2Y61A 3IV3A 3QQ0A 3PSVA 5DCEA 2EKCA 1KLYA 5KITA 3W2LA 1HL2A 3B4UA 4P61A 4ZL1A 3C61A 1SO5A 3R89A 1EWEA 4LNYA 1EP2A 4LVAA 3WFAA 1GQNA 4A22A 2B7NA 1W56A 5AHEA 5CGQA 4DF1A 2H8XA 5IM51 3O07A 2R8WA 1EA0A 1PIIA 5EL1A 1JUEA 3M6YA 4H6KA 3TAKA 3EEGA 3IRDA 1UASA 5IBXA 4AHOA 3WJXA 2GQAA 2Y7DA 2Z6JA 3CIXA 4CLMA 3LHZA 3HG3A 2LLEA 2A4AA 2WV8A 1LOLA 4JTEA 3SIZA 3KXQA 3C6CA 3IGUA 4L4MA 4MPQA 4RLIA 1QO5A 3NEVA 5TBOA 4TX9A 1KTBA 1WAUA 1OYAA 3GXNA 3NNTA 1W3NA 2PRMA 3G3DA 4K38A 4ALDA 5CPMA 4NNCA 1QPQA 4LS0A 4GUGA 4HNTA 3S1WA 1RR2A 2DZVA 3HPXA 4OQVA 3HIJA 1SR9A 2UV8G 1GZGA 3M16A 5LZLA 4MUZA 4DF0A 7TIMA 4N9EA 1XDMA 1SPQA 1PS9A 4N2YA 3ABQA 4AWSA 2RHGA 1QOPA 4KFPA 4ZQRA 3NQ7A 4UNLA 2W6RA 1KFEA 1FUYA 3N3MA 3E0IA 1A5SA 3LHWA 3MI6A 2ZFAA 3P8JA 3UYCA 3PVFA 5G5IA 3LXAA 2D73A 2WSYA 4OHQA 2VFEA 4ORMA 3P80A 4O1AA 3HG5A 5D32A 3TC7A 4WOQA 4DBEA 1WXJA 3FFSA 4Y96A 3OEXA 2RH9A 1QAPA 1RVGA 3OHIA 4LV9A 3W1MA 3O8AA 4LVFA 4Q33A 1JQVA 1IXQA 3UZ5A 3W74A 4UTJA 4EOUA 2VEMA 2YXGA 3P5ZA 4FNSA 5K4XA 1DHPA 4K37A 3NQCA 5HQEA 4LVDA 5EA9A 3HPSA 1RV8A 2VFDA 2ZA1A 3ATYA 2GUUA 3E02A 3GDLA 2GQ9A 1QO2A 4CNPA 3O06A 1TPB1 2YR1A 2O7QA 4LS2A 3N9RA 5C5YA 3QYQA 3W1RA 2FFCA 1DVJA 3P81A 5K7JA 4AMAA 4PC8A 1SUXA 1N55A 3N34A 2YYUA 3DKJA 4PA8A 5MHBA 3EX4A 4AH7A 4KWVA 3GVGA 2NWSA 3BGGA 2BX7A 5LHFA 5BNKA 2HS8A 1YLVA 5K4ZA 1ZAHA 1SSDA 2QCEA 1KFKA 2NX9A 4IMGA 1A50A 3SZ8A 4QJ1A 4N4PA 3I7QA 3UWZA 1OX6A 4AF0B 4CCEA 5SWUA 1RZMA 3PBWA 4FNRA 4HPXA 1VCVA 3TKFA 5J5RA 2CZ5A 2HTMA 1O95A 4HSNA 3PS7A 2C0AA 4XUGA 1JCJA 1H7XA 1QPRA 1VH7A 2CWNA 2X1RA 5AFDA 3G1XA 5H2ZA 3W2JA 3QZEA 4RZ5A 4RZ6A 1XKYA 3E12A 4JTSA 3N9SA 1F2JA 1OG0A 4R33A 4LUJA 5G4EA 2ZZ4A 3E9AA 1RQHA 3G0UA 1QPOA 3GK0A 4O19A 2B7OA 4RKAA 2V5BA 5D38A 4AAJA 1I2RA 3NYZA 2FPVA 1YDVA 1BKSA 1MSSA 3EKLA 4UNKA 5T26A 3TXZA 3EKZA 2BTMA 3VE9A 5D09A 3NZRA 1TPVA 2CLHA 4QQ3A 4ADSA 2E6YA 2RFGA 3NA8A 3HBLA 2NV2A 5J5DA 3S42A 1NF0A 1YYAA 4LS1A 4FIQA 3S5YA 4W9TA 3W1XA 3OVRA 1VQTA 1W5NA 1EX5A 4LVBA 3M5VA 2V5LA 3G8EA 4EF9A 2QUVA 5BOOA 1FDJA 2C13A 5K2ZA 2BZNA 1OFOA 3W75A 3FA5A 4O4WA 4NQ1A 1VRDA 2E1DA 4WD0A 3UY7A 3W84A 4FNQA 3RMJA 1GOXA 3EXSA 3DFSA 2VFFA 2XFWA 3SFKA 2TSYA 2A1YA 3WK0A 5BW6A 1KBIA 1TQXA 2EHHA 3KRZA 2PURA 4UFMA 3LHVA 1T96A 1S5VA 2GQ8A 4JNMA 4LC8A 4FB7A 4N4QA 4OE7A 3TX9A 1V5XA 3G3MA 4WOZA 1G4PA 1VPXA 3B05A 3LHUA 1MEIA 1SO3A 4MKNA 3QFEA 4UTTC 2FPTA 3W1PA 4X3ZA 2NX1A 3M44A 3PG8A 5HR7A 4O0KA 4XBKA 1FWTA 3DFNA 1SW0A 4O50A 5F2LA 4RZ4A 5LNSA 4MYXA 3W7QA 3UY8A 4BK9A 3HF3A 2EF9A 4FXRA 3O6YX 3NL5A 1H7PA 2WNNA 4QNWA 2C18A 1ME7A 4K8EA 2WSQA 1VLIA 3FIGA 4TU1A 1JUKA 4LOCA 4UTWC 1UB3A 1QDSA 3P82A 4MYAA 3PY2A 2VKZG 4UTTA 1FY6A 3CC1A 1SW7A 1AW5A 4X2RA 5GVJA 1HO1A 3EXRA 3NPVA 4HIBA 3OVPA 4Z1DA 2NUXA 4XKYA 1YXCA 4DELA 2J6XA 3QSTA 3W7CA 3MWAA 3IEBA 4JEQA 1V7YA 4JYFA 2ZA2A 3Q2DA 3UXDA 3P7YA 3DAQA 1JR1A 3MP4A 5G4WA 1Q3NA 1JVNA 3HPZA 5AB3A 3I65A 1ZFJA 1Q6RA 3NQFA 3L21A 5HNRA 1ZY9A 4LWWA 4OBTA 2A6LA 3DFQA 3EWBX 2QAPA 4MJZA 4O13A 1SZEA 1H51A 1WYIA 5HWMA 1H7RA 4Z0SA 3W7EA 2R14A 3TNOA 4ADTA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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