4GE8A

Oye1-w116i complexed with (s)-carvone
Total Genus 155
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
155
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLIVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title X‑ray Crystallography Reveals How Subtle Changes Control the Orientation of Substrate Binding in an Alkene Reductase
doi rcsb
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces pastorianus
total genus 155
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ge8A00
3TQKA 3EWUA 3QEZA 4UTIA 4DPQA 3LXCA 4JYFA 1B9BA 1H61A 4IMFA 3L2IA 2E77A 3GXTA 3GX9A 4C1KA 3PSWA 4CNPA 1VRDA 3BK0A 5FF3A 1OYAA 3C2RA 1RVGA 1R30A 4JTUA 3M44A 1FCBA 1TIMA 4O0ZA 2LLEA 2BSLA 4BI5A 3PBYA 1N7KA 2A1YA 1ZAIA 1B57A 3GDLA 3P8JA 3HF3A 2V8ZA 3B8DA 2YZRA 4IUOA 5DBTA 1EUNA 3N14A 4M7TA 3P62A 5HMSA 4IWWA 3WJWA 3BVJA 3C8FA 3NM1A 3W71A 1B4KA 1IXQA 1V7YA 3PULA 5DCDA 4JTLA 3TQVA 4FNSA 5CZJA 1ZHAA 4N6EA 3BW2A 2V82A 4XBSA 3W7IA 5KINA 3STGA 1I2RA 4IMGA 5F4XA 4LVBA 1K8ZA 4LRSA 4MY9A 4DBEA 1VYRA 3DKLA 2NX9A 1LYXA 2ZZ1A 1PVNA 2P10A 4CCDA 4UTTA 3LXBA 2HSAA 3W1XA 1JRCA 1SW7A 1TPC1 4UFMA 2Y63A 2V30A 4PH6A 2A7RA 4O4VA 4OGZA 1T0OA 1R2SA 1OK6A 4OBTA 5GVJA 3TW6A 4MZYA 3L65A 4QSHA 3ZFHA 1LRNA 4Y90A 3NQFA 1MZHA 2Q3RA 1OFQA 3CT7A 3W84A 1K7XA 3NDOA 3O6DA 5CGQA 1Z41A 1GWJA 3IGUA 2QF7A 3I7SA 3BO9A 3S5OA 5K4ZA 1ZFJA 1VZWA 3B0PA 3GB6A 4BK9A 2NUXA 2PC4A 1TO3A 5H2ZA 2W0UA 3ZWSA 1VHCA 3LERA 5F1UA 3W07A 3P60A 2J6XA 1R46A 1Z48A 4XZ9A 4IQLA 3PC0A 1ZY9A 1JCNA 4UTHA 5HR7A 1OVDA 1FX6A 2FB3A 3L5LA 2NXIA 3I68A 3KXQA 3MO7A 3NQ8A 4X2RA 3STCA 1P4CA 2YFNA 1FDJA 1KM5A 2NZLA 2ZA3A 3G1XA 3KVMA 4NNAA 2TMDA 4Z0JA 2DZTA 5CPLA 3UD6A 3B03A 2ZZ5A 3QC3A 3H54A 4ZQNA 1EP1A 3HGSA 4MLRA 4WQ6A 5HJLA 5CPOA 2ZTKA 1F76A 2WJZA 5AYYA 1N8FA 3IIVA 3M16A 5AHFA 3QM3A 1NEYA 2G96A 2C14A 3NL2A 3S8HA 4RZ6A 1AW5A 1MEIA 1SZNA 5G2HA 3VFLA 2C0AA 5HULA 4ZQMA 4JYEA 4PL1A 5ABTA 3CEUA 3GDKA 1AG1O 1DQWA 3SECA 3TJLA 3MBFA 3CQ0A 3DAQA 2XFWA 4UFJA 1J4EA 5C2XA 1YDOA 1O94A 1WV2A 5CKSA 1I8JA 1F05A 1K8XA 1G69A 3LM7A 2C3ZA 2CLHA 2HS8A 2X1UA 1FBAA 4MLJA 3MHFA 3TQ0A 2A21A 2E6FA 3NXFA 3KRSA 3LI0A 3TE9A 3M5ZA 3MI2A 4BWLA 3MP5A 4BFAA 2WSYA 3QJAA 1UASA 5CSSA 3MYOA 3FLUA 2OMAA 4IMEA 4FIQA 3TAKA 3B0UX 2Y62A 1NF7A 2ZZ4A 4QISA 4K39A 1TYGA 3CWNA 2B7OA 1SO5A 3LCLA 5D2VA 2RHGA 3DGRA 3WJZA 5BOOA 3HGRA 1X1OA 2NLIA 3SI9A 3MMTA 2YFOA 2CZFA 1C29A 1LOSA 3SGUA 2VXNA 4K38A 1NFBA 3GNDA 1A5CA 1RQHA 5K9DA 1A5AA 1M6JA 3UY8A 2BLEA 3W2NA 4JTJA 3VE9A 2CLFA 3NZ1A 4BF9A 5G2IA 1X6UA 4HT3A 1LOLA 2Y6ZA 1RPXA 3W1NA 4MZ1A 2JKPA 1H51A 1HO1A 4R7JA 3DFTA 5FESA 3MUXA 1FWWA 4PODA 4E2DA 3PBUA 2HMCA 1LCOA 3G1FA 2F84A 1KFCA 4ADSA 5D30A 3W2KA 4CQ9A 1JCLA 3ABSA 2QCLA 3MWAA 3M9YA 4IGHA 5FEPA 5FF0A 3PB2A 2Y89A 5EYWA 3SGZA 4IPJA 3UWZA 5K4XA 3SY5A 3JRKA 3M7WA 3O63A 3K30A 4C1LA 4AHQA 1RR2A 4M6VA 4KFOA 1SZFA 4LU0A 2G5WA 2DZXA 4MY1A 2A6NA 3NQEA 1W54A 1EB3A 2EKCA 4LW7A 2NUWA 3MW7A 3G1HA 4DF0A 4IOTA 2DJXA 3KRUA 3SR7A 2YCEA 5IBXC 3QYQA 1JCJA 3M5VA 4GUIA 3W70A 1I2NA 3IIXA 4JEQA 4NJHA 1QCWA 4O53A 2TPSA 4PA8A 3GAYA 2Q8ZA 3N2MA 3F4NA 2DJLA 4UUIA 4D2JA 3GKFA 3TU9A 4J9JA 1LBMA 4PEKA 1KFKA 1GG0A 3W7DA 1MEHA 3P7YA 1JR1A 3LCXA 1H63A 1YTKA 3ZS4A 4RXFA 4N4QA 4O1DA 1TPFA 3L0NA 1QFEA 2CLEA 4AWTA 3QPZA 4UC5A 4LY8A 3FFSA 3TIMA 1FXQA 2RH9A 5AFDA 3KRZA 4POCA 1QO5A 3W7NA 1L6WA 2X2GA 2WKJA 4GUJA 4YCPA 3IIPA 3TH6A 4GXMA 3ELFA 4YXGA 5AHEA 2XN1A 3IEBA 4YMZA 3S5ZA 1G7VA 1ICQA 3DH7A 1M7OA 3LB0A 3PBWA 1KTBA 4QIUA 1KA9F 1I45A 1AK5A 2B4GA 1XC4A 3FKRA 1ME9A 4IMCA 3CM4A 4FNPA 5HWMA 1WXJA 2QKFA 3T7VA 5LNSA 3B05A 4RLIA 1XBZA 2A7PA 3OVRA 3GK0A 3LLDA 3EX2A 1FXPA 4Z1BA 3DKJA 4Z1AA 2J9XA 3CEPA 1VS1A 2HS6A 3B04A 3QSTA 3OA3A 1Z42A 4O57A 3MYPA 3W87A 4Q32A 2E6DA 4R34A 1OYBA 1SFLA 4UMAA 1FDYA 4NXSA 2X1RA 4K6AA 4JIQA 4UTLA 3UPBA 1O5XA 3VNDA 3B06A 4IXXA 2FIQA 5D2YA 1DHPA 1G4TA 2PE4A 2OJPA 4QJ1A 4P61A 4CNOA 1KV8A 3CB8A 3C4UA 3H53A 2GQ9A 4FEZA 5I3JA 1J5TA 3MHGA 3L5AA 4JY8A 4A2RA 5G4WA 4IX0A 3WFAA 4O11A 2VEMA 2VOMA 1TB3A 3QQ1A 4E38A 4UTKA 4LVAA 2V2CA 4WY0F 1ADOA 3LX9A 4JDBA 2J27A 4M7SA 1H7PA 1T8XA 5AN7A 4HKPA 2CZDA 1G4EA 4O19A 4QITA 1AL8A 2V5LA 2A6LA 1EP2A 3LRMA 1FWRA 4NX0A 3STEA 2Z2UA 5FF4A 1P0KA 5D09A 3FEMA 2VEPA 5AYZA 3LI1A 2Q8LA 2YX0A 1ZENA 1KW1A 1ALDA 4E2BA 1YYAA 1UB3A 3QMSA 4AWSA 1XKYA 5A8GA 5KITA 3UQNA 2VFDA 3CIXA 4O10A 4YL2A 1WA3A 5EA9A 1RD5A 1LM1A 3PM6A 3W3OA 2KZHA 2EF9A 3NO5A 2YYUA 2CWNA 1RV8A 3LGEA 4GNJA 3G0XA 4O16A 4IPIA 4ML9A 4O1CA 4BI6A 1GJPA 2HTMA 3V1PA 3FIGA 2X1SA 1MSSA 3TW7A 3RNDA 1VPXA 3LCFA 2ISVA 2FPYA 2DZSA 3W73A 3S0CA 4ZQCA 1TJPA 3NL3A 3MP4A 2GJNA 1GQNA 3BGGA 3R8RA 2O7QA 3UXAA 2NXGA 4ZMGA 2ZRYA 5C5YA 1G6CA 1GVOA 5FEWA 3VCRA 1TTQA 2QCGA 3BLEA 3VE7A 5DXYA 1OFPA 4LS2A 2QCMA 4O54A 1LDCA 1P0NA 2V0TA 2OZ0A 2XN0A 1YADA 4RR4A 3O16A 4O17A 3RLUA 3I6RA 1ICSA 1H7RA 1XCFA 3TFCA 1MXSA 1WYIA 3W1QA 2JGQA 5DN1A 5DXXA 3UWYA 3FJ6A 1LRQA 2D73A 3O6CA 3U8GA 3M0ZA 5AC6A 3C2FA 1P5BA 4Y8FA 1HG3A 1YPIA 2ZCGA 5LNWA 4GC4A 4AXKA 4A29A 3R13A 4RJEA 2OT1A 4BR1A 1QDSA 2XN2A 4K7VA 2WQPA 4NU7A 3ABOA 2ATMA 5BNKA 3BG9A 3NNTA 2WNNA 3ATZA 4WY0A 5AHMA 1GOXA 3HB9A 1TCDA 2W6RA 3BW3A 2TRSA 3N73A 1TPUA 3DI0A 2E68A 5HWJA 4AEOA 3W76A 3G3DA 1LOQA 4MVAA 3PUEA 3TC7A 4QQ3A 1YXDA 1SPQA 4PC8A 3LRKA 3QPYA 1TJRA 4GE8A 4HNUA 5AB3A 4NUWA 5FEZA 1DBTA 1VR6A 3QH2A 3LCGA 4ICNA 5D2XA 4NXKA 3S5NA 4ZZ9A 1GVFA 2TYSA 4GJ1A 4UCGA 3KVJA 4JNMA 2CLIA 3BLFA 3EWYA 4WD0A 1FDZA 3Q94A 3TDFA 3EEGA 1QPNA 1O4UA 4W9TA 3OIXA 3DHDA 2ISWA 4IJBA 4AVFA 3QF0A 2VFHA 3NQ7A 4NVTA 1GTEA 1UCWA 1Q6OA 3E96A 1W8SA 4O28A 3W9ZA 5LZLA 5LGXA 5IM51 1SFJA 2V2DA 4PL2A 4MKNA 1VJIA 4Y9AA 3HO8A 1MEWA 1TTIA 2A2IA 2NWRA 3GKAA 3LBMA 3CLMA 4XBKA 3ATYA 5HUOA 3NOEA 1XBYA 1TPWA 4O14A 4N6FA 3PUDA 5EBUA 3W88A 1IXNA 1W5OA 1HFBA 1C8VA 2ZA1A 2ZYFA 2J9YA 4M5PA 4ADTA 2FLIA 4KWVA 1ZALA 3N34A 1W5PA 2H90A 2QJIA 2WNZA 1HO4A 1XFBA 4WY0B 3RFAA 4BWLC 4FNUA 3VI2A 3GAKA 4GUFA 4IXHA 4K36A 2V9DA 1LORA 1K7EA 3D0CA 3GDTA 3W23A 4UTUA 2J9ZA 1JCYA 4LC8A 4A2SA 3L66A 2RDWA 1TTJA 3M6YA 4KFNA 4Z0SA 4UFIA 4MY8A 5F4SA 3DFSA 4O15A 3TC6A 4UFHA 4OV9A 4TR9A 2PURA 3GLCA 3W2JA 3LTSA 5F2IA 1W3IA 1OFOA 5LNRA 1F6PA 3NQVA 5EKYA 4TO8A 2VEIA 3W75A 1DJQA 3W7KA 3LHUA 1VYPX 4K8EA 4Z08A 1K7FA 3DFNA 2I9EA 3MJYA 1TPH1 2C16A 5KZDA 3A21A 3P74A 3KFTA 2GQ8A 4N9CA 5L6UA 3NVTA 4MYXA 4EOUA 1BKSA 4DF2A 3TFXA 3W7RA 2FTPA 4QAIA 1TREA 3S5YA 1GVSA 1H60A 4I7VA 4EIVA 3G3MA 3IIZA 4YWIA 2H6RA 4S2CA 5K7JA 4IMDA 4GBUA 2YW3A 4MFDA 2ZQ0A 4X3ZA 2ZRUA 5AC7A 2E1DA 1H7NA 5CZ0A 1L6SA 3W1LA 2WO5A 3HQ1A 3TSBA 3G24A 4JY9A 4LNYA 5I3GA 1L6YA 2W79A 2ISSA 1GVQA 3LXAA 3NQCA 4HPJA 1F7BA 2PRHA 4FX6M 5K3VA 3HG4A 5DBUA 3UXDA 1W31A 2VFIA 5I3HA 3THQA 4TX9A 3C2OA 3RLVA 3MHUA 2E5BA 1YDNA 2GQAA 2GVJA 5LHEA 4FNTA 2DU2A 4O0KA 5HUPA 4LV4A 2QDHA 2PRLA 3PAJA 3IVSA 3QFEA 4N4PA 2VELA 5D02A 2YYTA 1GPWA 1TV8A 4MFEA 2DZWA 3TUUA 1B3OA 2B0MA 4WOZA 3S6DA 1FWTA 1KFEA 1IXPA 2VENA 4HPXA 4CLMA 3PG9A 2ZZ2A 1ML1A 3GNNA 3G0UA 2YSWA 3TK7A 3KVKA 4LOCA 4OE7A 4O13A 4AMAA 4K8HA 5D38A 2I1OA 4OQVA 2QEZA 3F03K 2CLOA 4AF0A 4OU1A 3RU6A 1PCKA 1Z44A 3P5ZA 4RZ4A 2Y61A 2QCDA 3IVUA 3S1VA 3E0IA 3CHVA 1RQEA 1W1ZA 2C13A 2Y70A 2QUVA 1D9EA 2WOQA 3R2GA 2P0OA 4UNLA 2YPIA 2ZDRA 1OFDA 5LNVA 3P81A 1QR7A 2VFFA 4MIMA 4JTTA 3Q2DA 1TV5A 3LHYA 1D3GA 4M6PA 4RXGA 1JUKA 3CWOX 4UTJA 4HN4A 2JK2A 1J2WA 3LHTA 3ANYA 3W7LA 2FDSA 3UPWA 5BMWA 3UZJA 5EY5A 2EPHA 3BV4A 4Z1DA 3O06A 3QRHA 1FUYA 4O12A 4KWWA 1HUVA 3EXRA 3L0GA 4PTNA 1JCMP 1K3UA 2ZRWA 2CW6A 3EKLA 3I7RA 5C55A 1JUBA 3BG5A 3WK0A 1WOAA 5U4NA 3KOFA 2A4AA 5K2ZA 1O95A 4H3DA 2CLMA 4LV9A 3M43A 3R12A 2WSRA 4L4LA 1QPOA 1D3HA 2YGYA 2A85A 5I3FA 1KM1A 3LLFA 3E9AA 1W5MA 5L9FA 1EWEA 4HNVA 4NJKA 2ABAA 1RZMA 3STFA 3NR0A 2R91A 2QDGA 1A50A 4PFMA 4KKXA 1QWGA 5HINA 1AL7A 1JQVA 1IXOA 1LLWA 3DFPA 4K7YA 4AF0B 4OWGA 4UTWC 8TIMA 5EPDA 1TRIA 2ALDA 2QCDB 5A5WA 3OEXA 3BG3A 3GDRA 2Y7EA 1OK4A 5TQLA 5AYXA 5C54A 1C9DA 2VFEA 3LTYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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