4GUHA

1.95 angstrom crystal structure of the salmonella enterica 3-dehydroquinate dehydratase (arod) e86a mutant in complex with dehydroshikimate (crystal form #2)
Total Genus 90
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
90
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NLYFQSNAMKTVTVRDLVVGEGAPKIIVSLMGKTITDVKSEALAYREADFDILEWRVDHFANVTTAESVLEAAGAIREIITDKPLLFTFRSAKAGGEQALTTGQYIDLNRAAVDSGLVDMIDLELFTGDDEVKATVGYAHQHNVAVIMSNHDFHKTPAAEEIVQRLRKMQELGADIPKIAVMPQTKADVLTLLTATVEMQERYADRPIITMSMSKTGVISRLAGEVFGSAATFGAVKKASAPGQISVADLRTVLTILHQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
publication title Reassessing the type I dehydroquinate dehydratase catalytic triad: Kinetic and structural studies of Glu86 mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-dehydroquinate dehydratase
total genus 90
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2012-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4guhA00
3EXTA 2GVGA 4YXGA 2EF9A 3L5LA 4LRSA 3NQ2A 4JTTA 3W7QA 4NNBA 1YDNA 2RDWA 1TPUA 2Y85A 1XKYA 2FIQA 3GR7A 5KZDA 3B03A 1OJXA 1KFCA 3B0VC 5CPOA 1JRBA 2QCFA 1W3NA 3MO7A 4POCA 1OX5A 3NQ6A 3JS3A 1D3HA 2YXGA 3TW6A 4R34A 3S1UA 3PAJA 2W79A 4L4MA 3B05A 5D04C 3IVTA 3W7EA 3TW7A 4O12A 4O15A 4RK8A 3NL6A 1TMHA 4OU1A 5BW6A 5CZTA 4WXZA 2YYTA 3IGSA 3W23A 5IBXC 2E5CA 3N3MA 1W5QA 5J5RA 1TPFA 2ZZ2A 5HWNA 3W7JA 1P4CA 3L0KA 2QCMA 3QMTA 1KLYA 3NM3A 3RLUA 2J9XA 3TV8A 2BWGA 4JXCA 2CLKA 3ABRA 4UFIA 1OHLA 2E5BA 4UMCA 3DFNA 3O06A 5CPMA 1MZHA 4RKAA 4NQ1A 1ML1A 1FWSA 3RF9A 3FKKA 3GX9A 1OF8A 1Z48A 3PSWA 2QCHA 1AMKA 2HS8A 1D3GA 2CU0A 3C52A 1SW0A 1LOQA 3W83A 4NJHA 1KM5A 3NYZA 5DBUA 2VFDA 3WK3A 1U83A 4JD4A 4IXHA 1Q6LA 2ZRYA 4HSNA 3M5VA 3QM3A 3DKLA 3U6WA 5D05A 1MEWA 3DHDA 3NVTA 1ALDA 3SR7A 3LV6A 4A2RA 3CIXA 4OGZA 1H50A 2ATMA 3TSBA 2TYSA 3GR8A 3M0ZA 4ONVA 5U7SA 4TO8A 1F7BA 1GVOA 3B4UA 3S0CA 4I7UA 1Z41A 4RX0A 2NV2A 3I6RA 3VNDA 5K9XA 5CZ0A 5EMUA 3HBLA 3S5YA 4GBUA 3OVQA 4MZ1A 5F2GA 1H7RA 3G1YA 3HG5A 4QNWA 1ZCOA 1ZENA 1OX6A 5LNUA 2XN2A 1X1OA 4UTIA 4GUJA 2Y6ZA 2ZDRA 5DCDA 2XN0A 3LCWA 3TE9A 5F4WA 4XKYB 1G67A 4O0ZA 2CWNA 2NZLA 2A2IA 3TAOA 3S8HA 3I7SA 2Y7GA 2GJLA 1QPOA 3SECA 1SO5A 1VYRA 3LHTA 3DFQA 3GB6A 2OX1A 3G0XA 1WV2A 3FJ6A 3TUUA 2A7PA 3UD6A 2P10A 4FNPA 1AW1A 3JRKA 1OABA 5K9DA 3FFSA 3K30A 2PRHA 4A22A 4MJZA 4FIQA 3CC1A 3NQ7A 5DCBA 3TFXA 3QW4B 2B7NA 1UCWA 4LVDA 2WNQA 3M5XA 4S2CA 3FA5A 4JDBA 2DZXA 1D9EA 3NQAA 3IIVA 5D33A 5C6MA 4IQLA 2Q3OA 2RKXA 3NA8A 3DXIA 5FEZA 4LW7A 2X1SA 3WK2A 2ZRZA 3MW7A 4LTSA 3LRKA 4OHQA 1Q6OA 3M5YA 4MOZA 2WO5A 1TIMA 3WJXA 3G8EA 3QMSA 4I9AA 3CIWA 1TSIA 1OFDA 3FLUA 4UMAA 3KFTA 2ISVA 3C2OA 5GVJA 2CLOA 3LDVA 4Z08A 3OBKA 3G0SA 2VC6A 3LRMA 1G4SA 3W07A 3P74A 1SQ7A 3MP4A 3L66A 3W6YA 3P5YA 3GAKA 2P0OA 1QOQA 3PR2A 3N2MA 1M7PA 3ABQA 3NQFA 1LDCA 3STCA 3A21A 3TFCA 2TPSA 3TA6A 2E6DA 1H1ZA 2FFCA 1OYCA 4K38A 1KV8A 1NEYA 3EWXA 3L0NA 2E6FA 1SZEA 2QUTA 1C29A 1LTDA 3UPWA 3KAOA 2B7OA 1B4KA 2WV8A 3KVKA 3P60A 4DPQA 5HULA 1XBYA 1EEPA 6TIMA 3THAA 3W7KA 2Z0IA 5I3FA 2TRSA 2Z2UA 3DGRA 1R46A 3NL5A 1A5SA 3NNTA 4GC4A 4IMFA 3P84A 4RXGA 4HNNA 5F1VA 5L6UA 4O10A 4EOUA 4BR1A 3B06A 4K7YA 1JVNA 3HGOA 3HOJA 4CQ9A 4LS2A 1UBSA 3TAKA 2CLEA 3LCGA 4NVTA 3ATYA 3DFOA 1YLVA 2WSYA 1EWDA 3MI3A 3SGZA 1SO6A 3Q2DA 2ZZ3A 5CSSA 4YMZA 1TQJA 1LRQA 4AHQA 2VXNA 2W0UA 4N4QA 2HTMA 1A5BA 2A85A 5LSMA 4LS1A 4IXXA 4E2DA 3W76A 3WJWA 3EKLA 3HPSA 3OIXA 4H3DA 1W8SA 3GAYA 3T7VA 4UFKA 1DBTA 1Q6RA 1I2QA 3EB2A 3N34A 1LP6A 1GT8A 2V2HA 2ZZ1A 4EIVA 1GTHA 1SW3A 1L6YA 3A9IA 4HNUA 3BW4A 2OZ0A 5CKSA 2Z6IA 1G7VA 1WOBA 3N9SA 4O17A 5CPNA 1QR7A 2VKZG 4O28A 1IXQA 3H53A 4NT0A 3FEMA 1K02A 1QMLA 1K03A 4HN4A 4O18A 1RQEA 3W72A 2VEPA 2QKFA 2E09A 1TYGA 1I4NA 1GWJA 3OVPA 3PBVA 1ZAJA 2QR6A 1S5VA 3M43A 3LHWA 1JULA 1MSSA 1TPH1 4G1KA 2QUUA 3DKJA 1PIIA 3SY5A 1GJPA 2FPVA 4HNVA 5C55A 1TJRA 6ALDA 3PY2A 5I3IA 2ZBTA 4MZ8A 1A53A 2G97A 4H6KA 3PULA 4NX5A 4AEOA 3BGGA 4S1FA 4AH7A 2DJXA 3G1HA 5I3GA 1GYLA 3UWVA 4C1KA 3NPWA 2QDGA 5J5DA 3NPVA 1W5OA 3V1PA 2YDAA 1FDYA 3E12A 2NXGA 2PRMA 1LBLA 4ZQPA 3B0UX 1H7WA 2CLMA 3PS7A 3CPRA 3DHFA 1PE1A 2GQAA 3G0UA 3UXAA 3UWQA 1AL8A 3MYOA 4O1AA 1GQNA 3DH7A 3TXVA 1QFEA 1YTKA 1KM6A 2YW4A 4HKPA 3IIZA 3P62A 4OWGA 4M7SA 4EF8A 1P1XA 2YGYA 3BW3A 3HIJA 4FXRA 4LV9A 2BZNA 4YLWA 4UR7A 5AHNA 1W5PA 4OQVA 5U4NA 2FQIA 4ZQCA 3G1FA 5E93A 4RLIA 5FEWA 2A6NA 4RZ6A 1FBAA 2JBMA 1LBMA 1WBJA 4FNUA 3MBFA 3G8RA 4HPXA 5I3HA 5KINA 2A7NA 3NQGA 1G4TA 3BW2A 1JQVA 3IIXA 3PB2A 1R47A 3GDRA 3SW6A 1XFBA 1K7XA 2R94A 2YW3A 1GZGA 4EVZA 1SUXA 2ATSA 5HR6A 4M7TA 2NWRA 4CLMA 1XBVA 2Q8LA 4NJJA 3FJLA 3MUXA 2RHGA 1JCYA 2H8XA 2WSQA 4QISA 1PS9A 4UIOA 2QCGA 4BFAA 3IRDA 3LI1A 4N6FA 4CQ8A 2Q8ZA 4JTLA 4O53A 1JCMP 1DOSA 1LCOA 3EKZA 3NQVA 1IXPA 4LT9A 3TCEA 2NXHA 4NX0A 4JN6A 2CZEA 3LBMA 5AHFA 2ABBA 2A0NA 1UUMA 4JX4A 3W74A 3O6DA 1XDLA 3BLFA 1HFBA 4O14A 2GUUA 3SFKA 3MBDA 2DZTA 2NXIA 1JCNA 3T78A 1VYPX 5H2ZA 1DQWA 3M5ZA 1FX6A 5T26A 2A1YA 1NF0A 2BXVA 2E6AA 1SSDA 3TNOA 3NQDA 1T96A 3GNDA 3UZ5A 4O50A 4CQAA 3H55A 1OFQA 2UV8G 3STFA 4I7VA 2VFHA 2E5DA 3OVRA 1XUUA 4O4VA 2ZRWA 3TSDA 2G5WA 2HMCA 4O1DA 2C0AA 3IGXA 1ME8A 2BTMA 1EA0A 3QSRA 4OV4A 1IF2A 1L6SA 4MUZA 3QZEA 5G2IA 3SGUA 2V5LA 1YYAA 3RFAA 3O6CA 1WQ5A 1ZNNA 4IX2A 1EUAA 4Y90A 2QCEA 3UPBA 4MYAA 1W31A 2EAWA 2JKPA 5G2WA 4O13A 4ZQMA 5EY5A 1YTEA 4ORIA 4TR9A 4Y9AA 4JYEA 2B7PA 4IMEA 2NUYA 5A8GA 3A22A 3T4CA 1F74A 2JKEA 1B9BA 3G1DA 4MY1A 1FCUA 2EKCA 4OBTA 2ZA3A 1IIGA 4WX2A 4LRTA 1XXXA 5D03A 3GIYA 2V0TA 2TMDA 3L0GA 5AHMA 1N8FA 1GVQA 1CI1A 3E96A 5TIMA 1O94A 4OE7A 4YL2A 1OYBA 3VI2A 3R89A 3CEPA 4AVFA 3BV4A 3FS2A 4OV9A 1EP1A 4UC5A 3IEBA 2OT1A 1TO3A 4TMCA 1WAUA 3KRUA 5G1TA 1Q6QA 1QOPA 5F2MA 3M16A 2DJLA 4PCFA 3S9YA 5HMSA 3LXBA 2IQTA 1NVMA 5TBOA 4WJEA 3TU9A 4K8EA 3FYPA 1X8FA 3W70A 3GLCA 4K36A 3LTYA 2A21A 4LNYA 5F1UA 2CZFA 3V75A 1LROA 4YCOA 3S1XA 3DZ1A 4JX5A 3LI0A 3A24A 2W6RA 3S5ZA 3W88A 3KX6A 1AK5A 1LORA 1W0MA 2HSAA 3DFSA 3ABOA 5EBUA 2C6QA 3DFPA 5K7JA 4N4PA 1G7UA 2XFWA 3C61A 1TTIA 1EIXA 2GVLA 4RV8A 4LY8A 4Z1AA 4FXSA 2V8ZA 3LCHA 1WXJA 4O1BA 3CWNA 1J4EA 2O7QA 1Z44A 4XUGA 3U8GA 1FY6A 1H51A 1F05A 2Y7DA 4GNJA 1BEUA 2F84A 3Q58A 2OJPA 3W73A 4UFHA 2GPTA 3CQ0A 4K6AA 3SJ3A 1O5XA 4JICA 4UNLA 4P61A 5DN1A 5F2LA 5AHLA 3I65A 2QEZA 4JTSA 2YFOA 3WFAA 1KM3A 5G4WA 1W56A 4QSHA 3TJXA 3L9CA 4CCCA 3F1QA 1KFKA 4MYXA 1OFBA 2VFEA 3LRLA 4ALDA 2V2DA 3C6CA 4FNQA 2QCCA 1C8VA 4MPQA 2HS6A 1FUYA 2CLLA 2VOMA 3C56A 1YXYA 1EX5A 1GG1A 2TSYA 3SIZA 4DO6A 3GXTA 2X1RA 1MO0A 2A6LA 5DY3A 3CEUA 2V81A 3GZ3A 3PG9A 1TPWA 1A50A 4WQ6A 3I68A 2I14A 3QRHA 3EX3A 3DI0A 3NAVA 4MFDA 1N7KA 4UCGA 3EWUA 2ZYFA 4NXKA 1RD5A 2PURA 1ME7A 3USBA 1HG3A 1EP2A 4FB7A 1K8XA 3QJAA 4WD0A 4PH6A 3UXDA 1YTDA 4AB4A 3QEZA 3M1ZA 4JS3A 1FQ0A 1KFEA 1TV8A 4LV4A 1GEQA 4DF1A 1VGAA 4JTIA 3L68A 4LOCA 5KITA 1XI3A 2EGZA 3BG5A 3O8AA 4ZQRA 4MY9A 2JK2A 3M44A 3TQ0A 2YPIA 4ZMGA 2YX0A 4AHPA 1I2NA 1SPQA 3EX1A 4ZL1A 4K8HA 5K9CA 2VFGA 3QPYA 2BX7A 3W1QA 1HTIA 1QO2A 3RNDA 4FHAA 4AWTA 2BSLA 3GXPA 3MHGA 1SU5A 3B04A 5FF3A 1SZNA 2J9ZA 5F4XA 1HUVA 3C8FA 3R12A 2X1TA 3NDOA 4NJIA 4ADUA 2EPHA 5LHFA 1GOXA 3DFTA 2R91A 1EUNA 1VPXA 1ZJIA 1W54A 3PBUA 1ZAHA 4O16A 3TH6A 5KMYA 1UJPA 1VCFA 3LHVA 2YR1A 4LC8A 5DBTA 1TREA 4JTUA 4JIPA 1ZAIA 3UNDA 3LOTA 1ZY9A 2NUWA 3TIMA 3A5VA 3Q37A 5D2XA 2ZZ6A 1TB3A 4N9DA 1QPNA 2YZRA 4EWND 5KTLA 1V7YA 1X6UA 4UTWC 1TPC1 1DHPA 2J24A 4KFOA 1JUBA 4UFJA 3GDTA 2H3DA 2Y63A 2VEIA 3P8IA 4Z1CA 4JTEA 3M6YA 3LCIA 4AWSA 1LOSA 4FIRA 1XC4A 2Y70A 3EWWA 4KWVA 2NLIA 3LCLA 4ZVJA 5HR7A 1KTCA 4NZJA 1ZFJA 1K7FA 1H62A 4LVFA 2C14A 3LBCA 3WK1A 1TJPA 3EWZA 2PE4A 1AW5A 2V30A 4UTHA 4BWLA 4NXSA 3UY7A 4KWWA 1DQXA 4DELA 1L9WA 3UQNA 5AN7A 4QITA 5FF0A 3E02A 3IGUA 3BARA 5HWMA 3HPXA 2YYUA 2FTPA 4HT3A 3HG2A 4Z0JA 3LB0A 5FEPA 3INPA 4N2YA 5HQEA 3N73A 1VCVA 4JEQA 1AW2A 1SSGA 3DAQA 4XTIA 5CGQA 4IWWA 1JRCA 5FI8A 3QH2A 2J9YA 3LTSA 2B4GA 2QCDB 5HUOA 2ISWA 4XTDA 4QQ3A 5AYYA 4LVAA 2QJIA 3W22A 3W7IA 2CFFA 2C3ZA 1F6KA 3W7PA 1GVSA 2H90A 3MJYA 3RK8A 1GTEA 3G1VA 1F2JA 1WYIA 1DKWA 3LHZA 1SFJA 3NGJA 5D30A 1QAPA 1RQHA 1P0KA 3GKAA 2J6XA 4K7VA 1TPB1 4I7WA 2Y62A 2ZA2A 4NNAA 4ZZ9A 1VLIA 1FCVA 5H91A 5C5YA 2G96A 3T55A 4KFNA 1JQXA 2E68A 2A7RA 3CTLA 5MHBA 5L9FA 5AOUA 1P5BA 3W9ZA 3H54A 2GJNA 1DL3A 4IPIA 4DO5A 1JUEA 2ZCGA 4IGHA 3KOFA 3BK0A 5LZLA 1W1ZA 1VCGA 3LHYA 3I7QA 4IUOA 1LLZA 1M5WA 3N14A 3GYEA 5DXXA 4LWWA 1IIHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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