4GXMA

Oye1-w116l in complex with aromatic product of r-carvone dismutation
Total Genus 152
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
152
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLLVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X‑ray Crystallography Reveals How Subtle Changes Control the Orientation of Substrate Binding in an Alkene Reductase
doi rcsb
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces pastorianus
total genus 152
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-09-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4gxmA00
4HNUA 4LTSA 5BRBA 1QPOA 4DF1A 2PCQA 4RXGA 5DY2A 1YTDA 3W7KA 1TTJA 1VRDA 4JN6A 1GQNA 3MW7A 3L0NA 1B3OA 2QCHA 4NQ1A 1W5OA 2QCLA 3PSWA 4FF7A 4I7VA 3T44A 3W2MA 1AMKA 3PY2A 1R2TA 4CNNA 3TSDA 3UPWA 3NA8A 5CG7A 2G97A 1G6CA 2JBMA 1W31A 5D32A 3FJ6A 4X22A 4JTGA 2CU0A 1OX5A 5C5YA 3EWBX 4IMEA 3Q58A 4J9JA 3M1ZA 5E0KA 1C29A 4H3DA 1S5VA 4QAIA 1LOSA 1SZEA 4JR5A 3RU6A 4M6QA 1W5PA 1TJRA 2B4GA 1IIHA 4UTHA 3Q2DA 2ZTJA 4IMCA 3G1SA 4CQ8A 4K8EA 3LCIA 3A5VA 1NF7A 4MY8A 1L6SA 4NJIA 1SU5A 3NZ1A 5HUOA 2A6NA 1W3TA 1MEIA 4TMCA 3IV3A 1IIGA 1DHPA 2TMDA 2Z2UA 4NJGA 2EF9A 2CLIA 1G4EA 3S5YA 4NX5A 3UZ5A 3I6RA 3NAVA 4S2BA 3WJWA 2CLFA 2ZRUA 2GVGA 3GDTA 3CWNA 4UUIA 4LRSA 2HTMA 3NM3A 4LT9A 5E93A 3M47A 5FF0A 3E12A 2UV8G 3PUEA 4JTJA 3O63A 4E2BA 3R13A 2ZZ2A 3P84A 4XTIA 5DELA 3KVJA 4O12A 1B4EA 5FESA 2Y85A 3BLFA 1SZNA 4FO4A 3ATZA 4N6EA 1VC4A 1U83A 2B7OA 3GX9A 1H60A 2VFIA 4ZL1A 1V7YA 4GE8A 4CQAA 5DXYA 3W7QA 3S1XA 1GEQA 3W1RA 1EX5A 5HWNA 3DU0A 1M7OA 5CZ0A 2G95A 5EKYA 2CZFA 2ISWA 2RDUA 3NO5A 5D04C 4JEQA 3BPWA 4MPQA 1GG0A 3P82A 3NVTA 4NJHA 4RCXA 4ZVJA 3HBLA 1UASA 4GWEA 3BGJA 3HPZA 3A22A 1I2QA 5DXXA 3R89A 1RZMA 4O52A 3I7QA 3TIMA 3SIZA 3UXDA 3JR2A 3OVPA 4GC4A 4JGDA 5G2WA 2DJXA 3NL2A 4A2SA 1F6PA 1HFBA 4LUJA 1GT8A 3DFTA 3W70A 3G1VA 1GJPA 3HG4A 5J5RA 2V30A 1IF2A 1KM6A 4FX7A 3TJLA 2FFCA 4JX6A 4R7JA 4WX2A 5IBXA 2QDGA 2C16A 3UPBA 2ZFAA 4LC6A 4OBTA 4JY9A 3MI2A 4TX9A 2A1YA 3W7DA 4O11A 4UNKA 3HQ1A 3LTYA 1KFCA 1PHWA 1XFBA 3GXTA 5BMXA 4Q32A 3TSMA 4TU1A 4UTTA 1TPWA 2FPYA 3CWOX 1LROA 1FDJA 5U7SA 4UC5A 2ZZ4A 2DZTA 3LM7A 4Y8FA 4DBEA 4FX6M 3LI0A 3N9SA 3QMRA 4EIVA 2GJNA 2JKAA 3EWUA 3M5XA 4IGHA 1H5YA 3GLCA 3TUUA 5FEZA 2CWNA 3BO9A 3GDRA 4M7TA 4K7VA 1IXQA 4YL2A 3NQCA 5K9XA 2I1OA 4HSNA 3HOJA 5K2ZA 2R94A 3N2MA 4UIOA 3NG3A 3NL5A 4KFNA 2ZZ3A 2BLEA 4QIUA 1LBMA 2QCCA 4R34A 1ICSA 4Q4KA 2Y63A 4XZ9A 1Q45A 4M19A 2WKJA 3NPXA 3P74A 3LXAA 2BSLA 3C3NA 3EX4A 1DQXA 2X30A 1XBZA 1SFLA 2CZ5A 4IUOA 3W1AA 1I4NA 4PFMA 4UFLA 4WXZA 1TV7A 2ZZ6A 3BGGA 2CLKA 4WOQA 5G4EA 3SJ3A 5HJLA 1TV5A 2DZVA 1QAPA 5BNKA 3EXRA 5E1QA 4O1CA 4DEFA 5AC8A 4LRTA 2V9DA 4UMCA 3V1PA 1ME7A 2YR1A 1Y0EA 5IBXC 3W1UA 4O4VA 2PC4A 2TYSA 4YCPA 1KM5A 3UZJA 4K36A 3O1NA 3W83A 2NWSA 4UTTC 1TMHA 1SO6A 4DF2A 3P61A 3NQGA 3UWQA 3ZR4A 4MYXA 3GDKA 3W2UA 1S3HA 1VLIA 4PCFA 2QUTA 4NXSA 1KV8A 1YADA 3PG8A 3N34A 3S0CA 1TSIA 1PV8A 1TRIA 5A8GA 4U28A 3INPA 3LB0A 3IIPA 3NQFA 1RQBA 2ZRYA 2WPBA 4EF8A 2QJHA 5AFDA 1GWJA 2WV8A 1TPFA 2AQWA 3TE9A 4XBSA 1ME8A 2GUUA 1Q6LA 2ZA2A 4HN4A 3TR2A 5AC7A 5EY5A 5AHLA 3PS7A 3DXIA 3OA3A 3N73A 4GUHA 7TIMA 4OHQA 1JCYA 4ONVA 5KZDA 1VJIA 4RX0A 5AHEA 2ZA3A 1X8FA 2ZRVA 5CZJA 1XBVA 5C6MA 4GFSA 1KM1A 1SO5A 4BR1A 3TW6A 3W75A 1EP2A 5I3JA 3NQAA 1WA3A 3DH7A 1OYBA 1DVJA 3F03K 3EKZA 1OYCA 1WOAA 2YYTA 3AO0A 5K9DA 4JYEA 1XL9A 4LC8A 3WFAA 5F1VA 4FIQA 5DBTA 3OEXA 4H4IA 1SZFA 1YXYA 2X1UA 2TSYA 3CPRA 1TPB1 3MP5A 4Z08A 2NZLA 2OCZA 4JTHA 2JK2A 2R91A 5K4XA 1P0KA 4IPJA 1QOQA 4NJJA 4HT3A 4O0KA 2H90A 2VFEA 3S1WA 5F4SA 1YDOA 3SR7A 3V75A 1EEPA 4XQ6A 6TIMA 4ADSA 3L5AA 2VELA 4ZZ9A 1OFBA 1TPUA 3EKLA 5AHMA 5F2MA 4CQ9A 5K9CA 5G2HA 2VFHA 5HR6A 4KFOA 4LVDA 2H8ZA 1FCBA 4MUZA 1P1XA 5AC6A 3LXCA 3NGJA 2DZWA 4A29A 1XDLA 3LTSA 3PBWA 2RDWA 1OJXA 1FXPA 4DBDA 3R2GA 2X1RA 3E49A 5CZSA 4ADTA 3F1QA 3L68A 4WQ6A 1R46A 2JGYA 4JYFA 4NNCA 1VS1A 1RPXA 2Q8LA 3HJZA 4UMAA 4LS0A 5AB3A 4FXSA 2C18A 1UCWA 3B8DA 1QO5A 3NQVA 3THAA 4FIRA 4NX0A 3N14A 3DAQA 1OX4B 4FEZA 3GAYA 3OVRA 3KOFA 2DJLA 3M5ZA 4N9BA 3G8RA 1LTDA 1RD5A 2FB2A 4RJEA 3W88A 1H7NA 3GR8A 3A24A 1O60A 3HGRA 4IPIA 4ML9A 3FYPA 3MHFA 3MP4A 1D9EA 2TRSA 4FHAA 2ZBTA 1NF0A 4MZYA 2ATSA 3KRSA 2V2HA 3G0UA 3LHWA 4POCA 5AHFA 1ZY9A 4I9AA 3LCXA 1DOSA 5HWJA 3DFSA 3IGXA 1VCFA 3VCRA 3HG5A 3GDLA 4MY1A 3DZ1A 4MIMA 3GIYA 2QKFA 3LRKA 4M6VA 3PB0A 5KZMA 1XI3A 2NUWA 4BI5A 1JUBA 3B0VC 1GTEA 4UTKA 2CFFA 2E6DA 4QITA 3STCA 4MLRA 2QF7A 1OFOA 1JUKA 3FIGA 1KA9F 5GVJA 4UR7A 4AEOA 2QAFA 4YMZA 1ADOA 3G1YA 3DKLA 1ZAHA 3G22A 3H54A 3EX1A 1TTQA 4W9TA 4R53A 4O1AA 2ZZ7A 4RZ6A 3TQKA 2OT0A 2J88A 3SGZA 5CPMA 5AYZA 2FJKA 2DZPA 2FIQA 2WSRA 4E0CA 1HG3A 1F2JA 1YTKA 1TIMA 4KKXA 3W74A 1WYIA 1K7XA 1QDSA 3DFNA 1KFLA 3C2OA 4TIMA 1K02A 4N6FA 4CCEA 3Q37A 5D37A 3RK8A 3M9YA 3TJXA 1ZAJA 3QF0A 2JKEA 1YYAA 4O14A 3FOKA 4IJBA 2CLOA 2HMCA 4UNLA 5BOOA 4GXMA 3W2LA 1FWSA 2PRLA 3G0XA 5F4WA 1TQXA 1C9DA 1CW2A 3W7OA 3EX6A 3FKKA 1YXCA 2X16A 4B5NA 2B7QA 5HWMA 3AJXA 1W54A 2HSAA 1OFRA 5LHFA 4IWWA 5LKYA 3TQVA 3MHGA 1JRCA 3EB2A 2Y7EA 1H50A 3LRLA 3C4UA 4O19A 4AVFA 1N55A 4N02A 3RFAA 2DZSA 5FF2A 2Y88A 1PS9A 3LOTA 2C15A 1DJNA 3HO8A 2G5WA 2H8XA 4HNTA 4A3UA 1TPC1 4L4MA 1UB3A 2XN1A 4NVTA 1ZENA 3IGSA 2C14A 3I7RA 3DBPA 4PEKA 1LLWA 3P7YA 3W1MA 1TCDA 3W07A 1YDVA 4FXRA 3W7CA 1VR6A 4AMAA 3MMTA 3IIVA 3CC1A 1OK6A 1T96A 3F4WA 1O94A 4K6AA 1G7VA 2VEKA 8TIMA 4UTUA 1VYPX 1GTHA 3IRDA 3MYPA 4O10A 2QCEA 3TSBA 3W2NA 1SW0A 3LBMA 3VI2A 3M5YA 3NPUA 4AWSA 5LSMA 4O1BA 2I9EA 3R8RA 2ZDRA 4OWGA 1K8ZA 1LOQA 1S5WA 4R33A 5H91A 2OZ0A 4QM1A 3TX9A 1GVOA 3SY5A 3LV6A 1OX4A 1KM0A 3O06A 4WXYA 3G3DA 2J27A 2EKCA 5DY3A 1Q3NA 2E5DA 4TO8A 1FUYA 1G69A 3BVJA 3TK7A 2ALDA 3W2JA 2A85A 3P60A 1I45A 3L66A 3WJZA 3R5EA 4NZJA 1QMLA 2GQ8A 1FWRA 4O57A 3VFLA 3P8JA 2NUXA 1WOBA 3A9IA 4UTLA 3O16A 3LBCA 3NDOA 4E2DA 3G1XA 2Y6ZA 4BWLA 3I68A 4MKNA 1TB3A 4Q33A 4O0ZA 4O54A 2YSWA 1ME9A 2P0OA 2QEZA 5D03A 5KSWA 1G4TA 3PULA 3B05A 4JX5A 1FX6A 1RQHA 4Z0SA 3W72A 1GVRA 2ISVA 5D2XA 3SI9A 2DP3A 4DO5A 1A5BA 1RVGA 3EWYA 1LORA 1SPQA 1Q6OA 1XXXA 3MBDA 1G4SA 1I8JA 4RR4A 3STGA 3TW7A 5AOUA 3VE9A 4N9CA 5LNWA 1H51A 1XM3A 2EHHA 3RLVA 1H7OA 2NWRA 3PWAA 2CLLA 3ABQA 2YPIA 1K8XA 3SFKA 1OYAA 3HPXA 3MHUA 5FEPA 1BEUA 4YLWA 1JR1A 2ZRZA 4P2VA 1HO1A 2JGQA 1ONRA 2ISSA 4IXHA 4K38A 1XUZA 2E68A 5CSSA 2WNQA 4O8RA 3STFA 3C8FA 4JTEA 1JVNA 1ICQA 5D2VA 4A2RA 4AHOA 4OV9A 5KITA 1OX6A 4ZQOA 2ATMA 2C6QA 3IGUA 5EPDA 1L6YA 3CEUA 4DPPA 3KVKA 4BI7A 4NU7A 2VC6A 3EX3A 3MYOA 3NPVA 3LXBA 3QPZA 3C2FA 3W1QA 1LRTA 2NV2A 4ORIA 5G5IA 1YXDA 4U4MA 1PCKA 2Y61A 3FA5A 1H7XA 1D3HA 5LNRA 1WXJA 2CLMA 3IVSA 3G1DA 4Z1CA 2P1FA 4XBKA 1E51A 1JQVA 4ZQPA 1A5CA 3LCHA 4BFAA 3C56A 3WK2A 5D2YA 3LHVA 3G0SA 4QNEA 3LCWA 1R2RA 1LDCA 1XDMA 3UWVA 2VFGA 1SZGA 3IVUA 3ZS4A 2F84A 3QMTA 2X1TA 1W8SA 1MO0A 4BWLC 4Y9AA 1EWEA 2X1SA 3IIZA 4PODA 3TXZA 1F7BA 1M6JA 3PG9A 4NZFA 4IOTA 3T78A 2WNNA 3G3MA 1GPWA 3GNDA 3K30A 3NEVA 3M0ZA 3DHFA 1NVMA 1GZGA 2OT1A 1H63A 2Z0IA 2A2IA 5AYYA 1NEYA 3GVGA 3MJYA 4LUIA 1OG0A 3WK3A 5D2WA 1QOPA 2E1DA 1D3GA 2ZRWA 4DO4A 2Q3OA 4ALDA 1FWWA 3HG2A 3PF3A 4JX4A 1MZHA 4UFHA 4O17A 1G67A 5LNSA 3BV4A 3CIWA 3SZ8A 3UWZA 1FDZA 3S5ZA 1LOLA 3FEMA 2VKZG 5CPNA 5TIMA 2DZXA 1DV7A 2V2DA 2NX3A 1QNVA 1PL9A 4WD0A 3CQ0A 3FKRA 5AYXA 3NPWA 3O6CA 4ZQCA 2D73A 2QCFA 3S42A 3BARA 1DQWA 3L0GA 3O07A 3P67A 1GOXA 3MI3A 3LERA 2TPSA 2YW3A 1W0MA 3N2XA 1JJKA 1OFEA 3ELFA 2YFNA 3HG3A 3O8AA 4WJEA 5L9FA 1TPDA 5MHBA 1NSJA 5EL1A 4EWND 3DENA 5CPLA 2CW6A 4IQLA 1XC4A 4MZ1A 1VQTA 1CI1A 2ZYFA 1B4KA 4QSHA 1AL8A 1RQEA 2KZHA 2Y89A 1B57A 4MZ8A 4N4PA 4S2CA 5F2GA 1TPH1 3N3MA 3WK1A 2AGKA 1FCUA 4O53A 2QUUA 3W23A 4XTDA 1O5KA 3N19B 1NFBA 2O7SA 1SW3A 1KM4A 3CLMA 4UMBA 4YXGA 3BW4A 3W1TA 4M6PA 2CZDA 4D2JA 1OFDA 4NNBA 4JICA 3E02A 1OF8A 4IX0A 2GQAA 3W2KA 1H7RA 4K39A 5K3VA 2Y7GA 1IXPA 4GUIA 1OFQA 3WJSA 5EMUA 1T8XA 4KWWA 2GPTA 4HPXA 3G1AA 3LV5A 3VNDA 3T7VA 3QH2A 4LVAA 3KRUA 3C0JA 3TFXA 5LGZA 2A0NA 5LNVA 1XKYA 3O6DA 1A5AA 3BG3A 4FNSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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