4H6QA

Structure of oxidized deinococcus radiodurans proline dehydrogenase complexed with l-tetrahydrofuroic acid
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
PQVEQLARQKMWNLAERFVAGESIESAIQAVQALERDGIAGNLDLLGEFIDSPAKCTEFADDVIKLIEAAHAAGIKPYVSIKLSSVGQGKDENGEDLGLTNARRIIAKAKEYGGFICLDMEDHTRVDVTLEQFRTLVGEFGAEHVGTVLQSYLYRSLGDRASLDDLRPNIRMVKGAYLEPATVAYPDKADVDQNYRRLVFQHLKAGNYTNVATHDERIIDDVKRFVLAHGIGKDAFEFQMLYGIRRDLQKQLAAEGYRVRVYLPYGRDWYAYFSRRIAETP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Deinococcus radiodurans
publication title Crystal structures and kinetics of monofunctional proline dehydrogenase provide insight into substrate recognition and conformational changes associated with flavin reduction and product release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proline dehydrogenase
total genus 123
structure length 281
sequence length 281
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.5.5.2: Proline dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01619 Pro_dh Proline dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.530 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel TIM Barrel 4h6qA00
2G37A 2EKGA 4H6QA 4H6RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CPUA 1YADA 3A6OA 5JQ9A 1L8NA 4ILSA 3ZM8A 4XBJA 4JIHA 3F4NA 3UWZA 1S2WA 2HRWA 3R94A 3MWAA 2BVTA 3KWXA 2NX9A 3SRFA 1BTCA 4GCXA 3LX9A 6XIAA 2OGJA 2ZVIA 4GG9A 3C0JA 3AIRA 3LRKA 3QR0A 4IXHA 3CQIA 2X09A 1R2RA 2C14A 1QFEA 2BBFA 1VRDA 1GZJA 2E9BA 4N7QA 1X6LA 3MUCA 4DPPA 4HKPA 4PUMA 2PLJA 2WC4A 4LB4A 3TFCA 2VGGA 4ZFCA 3QTGA 4RZ6A 2W27A 1TPB1 4Q4PA 4HOZA 4UZSA 1GQLA 4X2RA 1JEZA 3CO8A 2XJ7A 1UUQA 1YNYA 3NQVA 1XP3A 3EXTA 3R13A 4US5D 3W23A 1K9TA 4DAIA 1XC4A 2QCCA 2VZVA 4JYFA 4LYKA 3RM4A 6TAAA 5I2UA 2DZSA 3KBWA 1KO0A 3GHRA 2YBUA 4MM1A 1GNXA 1MMFA 4HIBA 5K9CA 4DELA 1EBGA 3NWRA 4B15A 3WLMA 4KCTA 5ECUA 5HJLA 3EB3A 2ZUVA 3CZ8A 1P43A 5CPNA 5A6JA 1CXLA 4CEUC 1PCWA 1JCLA 3E2VA 2RAGA 1F7BA 1XDLA 5FA5A 3ZR6A 3URQA 4AWTA 2ZDSA 1VCGA 3JU2A 3KOWA 5CZKA 1VFLA 4GY7A 2WQDA 2DSKA 3RJXA 4PL1A 3C3UA 3CUGA 4LVDA 3ATYA 2F6UA 1AH4A 1PX3A 4Z1BA 1T99A 1JG9A 3VMPA 1W5PA 2WQPA 3BCFA 2QDDA 1UBSA 4IMAA 1O66A 4QS5A 1BHGA 4H3DA 4KT2A 3AUOA 1K9DA 1CGYA 3HMJG 1E56A 4AAJA 4NI8A 4WJXA 3ITTA 4PN2A 1O60A 3PNZA 2XIMA 3QY6A 4D6IA 2PD9A 3LEPA 4AY7A 2BMBA 1XYFA 5CQ1A 2GJNA 4AU0A 2ATSA 4U10A 5AN7A 2J13A 3RG6A 2PF0A 4LEFA 2YXGA 1IXQA 3I6EA 4AIEA 1QI2A 3SQMA 3WF4A 3WH6A 3LD5A 3IGXA 3UT0A 2CYGA 2DSZA 4S3CA 3AMCA 3K2GA 4AZCB 3BICA 3GNDA 4UIOA 4GYKA 4AZCA 3MBDA 1AMYA 7PTDA 4ERAA 3QV7A 1H11A 3S9YA 1AL7A 4IP5A 4QQUA 4JTIA 4JFTA 1H4PA 2AKZA 3DG7A 3ZXWA 1IZKA 2GLKA 1EP3A 4M6UA 1XIIA 3OJGA 1VB9A 2EQDA 3A5VA 5AY7A 3MANA 1Z3NA 4CNNA 1HT6A 1L6GA 4OUEA 3NQMA 4LBSA 5GQBA 2B7PA 4L7ZA 4NXSA 3NJ3A 1X6UA 1RLDA 4C65A 2DH2A 1SMDA 3HURA 2J7HA 3APGA 3LM7A 1E1CB 3CH9A 1AJ0A 4NKCA 3OTRA 1E1CA 2F38A 5A3HA 3I68A 3GG1A 3TYUA 2NW0A 3RJYA 1XXXA 2D2JA 2V63A 5LXEA 2CBJA 1UR0A 3LHWA 2C13A 4ACYA 3D47A 1BAGA 3DN5A 1M68A 5HWJA 2D1ZA 3UWUA 2G8ZA 1JZ4A 4M51A 4FS9A 1O94A 1J0IA 4PSPA 1OINA 2RJHA 3C8NA 1X8CA 1LQAA 2BP1A 2ZUTA 3MHUA 4DUWA 1QW7A 2AAMA 2PCEA 4IUOA 1LL6A 3K1DA 1TREA 3R79A 4AH7A 4HCHA 2PSNA 1H7PA 2IQ0A 5DRIA 2VFIA 3MU7A 3EMCA 1S2CA 3RRAA 5A6TC 3GXPA 1XUUA 1TRDA 2B31A 1ISVA 1F07A 2HTMA 2GK1B 4H8VA 4HSHA 1KQZA 3NGJA 3M0VA 2GK1A 1W1ZA 4N4PA 3KBVA 1VFMA 4GK8A 1WDWA 4LALA 1NF0A 3ABZA 3GNRA 4UMAA 3RXZA 1EIBA 5JUVA 5FAJA 1WBHA 3FEMA 1B0IA 1E9YB 3GTXA 3DHFA 3GW3A 1SJAA 1RZMA 1EHAA 3VTRA 1YPIA 2Y5SA 3ARZA 5C2GA 3W37A 5IDZA 1VYPX 3STEA 4YNGA 2CWXA 3HGJA 2FB2A 4X2PA 3LLDA 4E6MA 4Z2GA 3EWDA 2TYSA 2G37A 3PPHA 3M0LA 4F2TA 3A22A 2PDJA 1RY0A 4TV6A 3P8IA 1U5HA 1K6AA 1JZ7A 1BXCA 4I7UA 1QRQA 4CVWA 3C2OA 1OYAA 2OZ3A 2WCSA 3NA8A 3RILA 3GH5A 4MHBA 4PCFA 4IM4A 2NQ5A 1VBUA 2NXGA 3GY1A 4OZOA 4MZ8A 2IPWA 2OODA 4QDMA 4CCCA 5KITA 2XM2A 2B7QA 4KWUA 4BEQA 1ADSA 1NIUA 3NURA 4JKLA 5HUPA 3H2NA 1ZENA 2VR5A 5M03A 1CI1A 6ALDA 3CUZA 4ZVJA 5JMUA 1D2KA 4UTIA 1UWAA 4KGLA 5CBIA 2DSVA 3LMYA 3PHAA 5CPSA 4UNLA 4UMCA 3B0XA 3GU9A 3M16A 4B5WA 4W8BA 3KWSA 1NARA 4GGBA 1UZHA 3V5FA 3S1XA 4TUFA 1LQ2A 4GYPA 1W9UA 5BXPA 4E2BA 3IJIA 1ZLPA 4QLJA 1OABA 3WH9A 5I0DA 3GLCA 4LANA 4YPJA 3BG3A 2WJFA 1WKDA 3R0UA 1I0BA 2YDAA 3DFHA 2X16A 4JTAA 2P76A 2YZRA 4YVVA 5D9NA 3QV6A 5BWFA 5CGMA 1VYSX 4NNBA 1DXEA 5AKQA 1OZQA 4GQRA 3QHMA 2QGYA 1QDSA 2VQUA 5D33A 3HG2A 3BPWA 5HR7A 2QAPA 4U33A 3VOCA 5D2XA 3MHGA 1J18A 1X1OA 1AD1A 1VPYA 1YTKA 3B4YA 4XZNX 4WSHA 5FCZA 3PTKA 2E0PA 3BAJA 4KMQA 2XSBA 1JVNA 3UWYA 2V5JA 5C6MA 3QC0A 1V51A 1FH7A 3NQGA 4N42A 4IJRA 5LIYX 3Q58A 5AHNA 4DIAA 2J8GA 1KQYA 5HAOA 3VA8A 4YL2A 2QCEA 4I9TA 1W3KA 3ERPA 2OEMA 3CV6A 5HMDA 1QMLA 4TO8A 3BJSA 3TQVA 2OU4A 2HV5A 1O7AA 4C6LA 1JZ5A 4Q8OA 1M03A 2WJDA 3P0WA 3G6MA 3T4WA 4Y8EA 2VEIA 4H8NA 3GDKA 2OZTA 3THUA 3HQNA 3A4AA 3QY8A 3BGJA 1JXKA 4F2UA 1ML1A 3W71A 2PTWA 1SFSA 4IIFA 3GG7A 3MJYA 1G9HA 2BV9A 4MJ2A 5HJXA 3M44A 1M6JA 4MWAB 3AXXA 4PB3A 1CPUA 4MWAA 5BCAA 2REQB 5DCDA 2G3NA 2PDYA 3H70A 2REQA 1BLIA 3B0VC 4KESA 4JKMA 2ZXAA 2AOSA 2VRKA 4MSSA 4Q4SA 1FWGC 1NWTA 4NY2A 3SUSA 1MRAA 1EF2A 4S3KA 1UD8A 1E9LA 3LLFA 4I9JA 5CKSA 3OYXA 2WHMA 2YL9A 5EMYA 4MAVA 1EP2A 3CV7A 1OGGA 3EPOA 2QJNA 4V1YA 4GNJA 4HJFA 4DI9A 5EMLA 5I06A 4L6OA 2X7WA 3TA6A 3KS5A 2TRSA 4FOJA 5M3WA 2C1IA 2CLHA 3WELA 3NEHA 1PTAA 4DJFA 4KWOA 1GKPA 4IXXA 1LZOA 4V27A 4RXGA 4FNRA 4PMNA 5HJYA 5TD4A 3QVQA 1ZU8A 3L0NA 4I3GA 4ZO9A 1VFHA 3THQA 1J12A 2QCGA 1OQFA 2RGMA 1B3YA 2Z6JA 3UZWA 2GVLA 1GVEA 4O16A 3WBYA 3W7QA 1KM5A 4ZSTA 2Q3RA 1GONA 4W86A 1WNOA 5T9BG 4MJMA 4ACZB 5FJOA 4DJEC 1XX1A 4WY0F 4O14A 4ACZA 2A1YA 2QCFA 2WWDA 2Z26A 1AJZA 4NRSA 3VZZA 3EA1A 1SFLA 4PL2A 1G5AA 2YW3A 1YXDA 3UJFA 1QNQA 1G1YA 4LOCA 1OFPA 4HMNA 3WH5A 4ORMA 3W2UA 4XAYA 1KRBC 3IIXA 1A5NC 1AH0A 5C55A 3HB9A 5LSMA 3QPYA 5IDIA 3S2MA 2RGLA 4O1EA 2PDMA 2DZTA 2X05A 3T0CA 1TV4A 2ADAA 3M9YA 1RBOB 3GB6A 4Q8NA 1T8XA 1TWDA 1AQHA 2GFTA 3QLDA 1R9XA 3O0FA 3UEQA 3SURA 4LV9A 2WSYA 1VGAA 4DM2A 3S47A 3CNYA 3CV2A 3PPCA 4IGMA 2ZVRA 4F79A 3QGAC 1NEYA 2GUBA 5A6KA 1DJWA 1RUSA 4I6KA 5AYYA 4B5XA 1H0IA 1WQ5A 3DC0A 2I56A 2PWEA 3T9PA 3M0MA 2E9LA 2PDUA 4A3UA 4H6KA 3PPGA 5HWNA 1PHQA 1Q7QA 4I7WA 1P5BA 4G8TA 1DTUA 3Q37A 2D3NA 4HTYA 4U3CA 5I5RA 1WDDA 2HS6A 1W1IE 4LYPA 2EKGA 4HYWA 4W8LA 4MZYA 3GTFA 2VT0A 3VCNA 1FCBA 4GUJA 4D6HA 2WZEA 4C6NA 1AQ0A 3M43A 3GNXA 1H09A 2CNCA 5FACA 4HCDA 1PJ9A 1HQTA 1DIEA 3QEZA 4JFVA 3W76A 1WKFA 2XH0A 5CBBA 3FY1A 4PBGA 1QNOA 3CAWA 4MWAC 5MHBA 1V6VA 3LHVA 2G3MA 1M7JA 2FHBA 4NAEB 3GAYA 1OZMA 4NAEA 5BU6A 4GA8A 5C9WA 2QCDB 1C8QA 3OQ8A 4JQ4A 2ZWZA 3R7MA 3EBVA 3G8RA 5IOBA 3L5AA 3VIKA 4DNMA 2WMKA 2YBTA 4HVXA 3S1WA 2ZOXA 1IR2A 4GNVA 4EXAA 3KW3A 1PIFA 5G1YA 3NZ1A 5FJPA 1ZAJA 1RCXB 1DJIA 4M6QA 1YHTA 3W84A 4LX4A 3VC6A 5DLCA 1ICPA 4Z2IA 2G3JA 4MUPA 1ONXA 5GJNA 3FK4A 1UH2A 3BAXA 4WUIA 3EWBX 4DJFC 5C9RA 2HXTA 3N1AA 2FJUB 1J8VA 3WNLA 3E0VA 3M0JA 1BGAA 1PIGA 3OU8A 2QCNA 2YCJA 1YPXA 4BI7A 5CPLA 1V6XA 3NZQA 1CGXA 2CZEA 4B92A 2PLMA 3MTWA 5EYWA 2QUTA 3FDGA 3LGDA 3MKKA 3CLWA 3MV11 1EJXC 4TXEA 3NYZA 2VGFA 3L12A 4HJWA 1FDJA 3UJEA 1BSIA 4XKYB 4K8EA 1DIOA 3HO8A 4XKYA 4P7NA 3VZXA 4Z1CA 1DKWA 2SFPA 3L2IA 3OVRA 1H1NA 3HGSA 5LNSA 2JF7A 5CSRA 3OG2A 3S1GA 4H9UA 4ZZ9A 1EC8A 5G2IA 4CVUA 1J6OA 4PUEA 3QRHA 2O55A 3PP7A 1OYBA 1FWAC 3ZOAA 3UBPC 3STCA 4AZ6A 5KTLA 2Y4SA 3CUIA 1KFWA 3N3TA 3VOIA 2A21A 4MF4A 4WDWA 5F4WA 4AX6A 5KMYA 3NM1A 2I9UA 2CLKA 4O8AA 2ZX6A 4RZ5A 3AIBA 3BGAA 4Z1YA 2CZ5A 4IGSA 4QP0A 2V3DA 1HJUA 3G77A 2FGBA 3VC5A 3O16A 3PUDA 3GVQA 5LZLA 1VPQA 4L1XA 4OT7A 1RSCA 4C6KA 1VHNA 5E1QA 3VGDA 3W24A 2YB1A 4B5TA 4H7VA 3NPWA 1T8QA 3VDBA 3W01A 4PE8A 3TLLA 1UWUA 4U2YA 3T2OA 3H12A 2CXEA 3H26A 1OK4A 1UKOA 2HDJA 3BANA 2NUXA 3W1XA 1J11A 5A8PA 1K8ZA 4AZHA 3QM3A 1QNVA 1EC9A 1U1UA 2P8BA 2FH6A 4A8IA 4XIAA 1GJUA 4AWSA 3RM9A 3KBNA 3A3WA 4ZFMA 1KCZA 1TIWA 2PODA 2V5KA 3O7UA 4REQB 1DWGM 2NLIA 2RDWA 4REQA 2R1PA 2VEMA 3RPMA 4GMEA 2QCLA 1EJ7L 1K4GA 1UD4A 3UESA 3NQDA 3WK2A 3SCWA 1DWHM 1XPGA 1N8FA 2VM8A 3UNTA 4MLJA 3VIMA 4M0XA 2JIWA 3FKKA 5D8WA 3ZR4A 3W73A 3PM6A 4YXGA 2B7NA 4HNNA 3EX4A 4JXCA 1TV2A 1UD3A 1JFHA 3SUVA 4LBRA 4AHPA 1TCMA 4AQLA 3EX2A 4JTKA 4MFEA 3WBEA 1WE5A 4QGCA 4HHLA 4I5UA 1MXGA 3WIJA 4E38A 3TAOA 3RIKA 3T40A 2R1NA 1QHPA 1NY1A 3N3MA 2VCBA 1CNVA 1DYSA 2NLYA 4QJ1A 1FKWA 3GNNA 3TSBA 3UYIA 3BV4A 3HG4A 4M80A 4QISA 4PMOA 4Q4QA 2PF8A 1DJGA 1JAEA 3G24A 3UU0A 2PWVA 1SW0A 1W5QA 1XINA 2R9RA 4Y9PA 1PSCA 3TMQA 2YPIA 4QR6A 3N9SA 8XIAA 5CEWA 1EYWA 1H5VA 1V0LA 2CLPA 3V0SA 4UFIA 3OZOA 4NZ4A 3DDMA 1V4YA 1XBYA 3IGSA 1J2BA 3PBUA 1J0KA 3NTYA 2W91A 1QPNA 1S5VA 1C8XA 1TB3A 3XINA 2QJIA 1UR4A 3F5LA 3KE0A 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#similar chains in the Genus database (?% sequence similarity)
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