4H6QA

Structure of oxidized deinococcus radiodurans proline dehydrogenase complexed with l-tetrahydrofuroic acid
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
PQVEQLARQKMWNLAERFVAGESIESAIQAVQALERDGIAGNLDLLGEFIDSPAKCTEFADDVIKLIEAAHAAGIKPYVSIKLSSVGQGKDENGEDLGLTNARRIIAKAKEYGGFICLDMEDHTRVDVTLEQFRTLVGEFGAEHVGTVLQSYLYRSLGDRASLDDLRPNIRMVKGAYLEPATVAYPDKADVDQNYRRLVFQHLKAGNYTNVATHDERIIDDVKRFVLAHGIGKDAFEFQMLYGIRRDLQKQLAAEGYRVRVYLPYGRDWYAYFSRRIAETP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structures and kinetics of monofunctional proline dehydrogenase provide insight into substrate recognition and conformational changes associated with flavin reduction and product release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proline dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Deinococcus radiodurans
total genus 123
structure length 281
sequence length 281
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.5.5.2: Proline dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01619 Pro_dh Proline dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.530 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel TIM Barrel 4h6qA00
4H6QA 2G37A 2EKGA 4H6RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FTWA 4JTEA 1JZ6A 1X96A 1C9DA 1EDTA 1F4AA 3WMLA 2JE8A 1VH7A 7TIMA 2J7HA 4JTSA 4O1FA 4CN4A 3SCVA 1RY8A 1GQJA 3MO4A 3QYQA 4CNPA 1UB3A 1JPKA 1LYXA 1L9WA 2VEPA 4UTJA 6A3HA 3OVPA 1TCMA 3WO8A 1OIMA 1OX4B 1J0IA 3IJQA 2XVGA 4QE4A 3WEMA 1F07A 4H2HA 4ZCWA 1E1CB 4JQ1A 3NPUA 2E5DA 2X16A 3L4ZA 1D3GA 1O1ZA 4GCXA 8TIMA 2P88A 4IQDA 3WD0A 1DWAM 1DE5A 2AKZA 3ONBA 4ZR8A 2DZPA 1FWAC 3LNMA 4DLFA 1SO3A 2W4XA 3N18A 4MOZA 1FWFC 1XLBA 2WK2A 5ABHA 1B9ZA 1KBJA 4XKMA 2EPNA 4Q8TA 3RGTA 4FNSA 1ZAHA 2YCJA 1RA0A 4K68A 2PPGA 1RALA 4NZCA 3MO7A 2FFCA 4WIWA 3WUBA 1VPQA 3ICJA 4YWIA 3JR2A 3AALA 4Q33A 3OBAA 1C3FA 3MI6A 3MU7A 2NLIA 4JIHA 3B0YA 2V69A 2BHYA 5J8LA 4D1IA 2FPTA 2VNCA 3GXDA 5IXEA 2VCCA 1QPNA 4W7WA 5HANA 2CESA 1XH1A 5LSMA 2CLMA 2WBGA 3N19B 1VBJA 3KLKA 1QNVA 5FCZA 2WVTA 3WSUA 1JQXA 1JI1A 2J77A 3S42A 1ZGDA 3BV4A 1KFWA 2DZVA 1N8IA 2WMHA 5LXEA 2WM1A 4X22A 4YMZA 4G9PA 1FDZA 3MI2A 3A3HA 3PWIA 3EXSA 1A5UA 3BQ5A 4O52A 4HNLA 2CLPA 4O12A 1DXEA 1X97A 1ITCA 4G7EA 2X30A 3BLEA 1HJWA 4CD6A 4M81A 1W3KA 1WCGA 3CQIA 3WQ8A 3GVRA 1JI2A 1CTNA 2I56A 3VCNA 3VNYA 5BOEA 3D3AA 4XUGA 5JQ9A 5IM51 4AF0A 3WUFA 2CXEA 3W81A 1Z6KA 3T0CA 3A9BA 1BVNP 1PUDA 4DAFA 3EDJA 1WDRA 3RILA 2GL5A 3B06A 2BOEX 3STGA 1Z8AA 1WZMA 3H53A 4PMRA 4C5YA 1A50A 5ABFB 1Q4WA 5G4WA 2C0AA 4K8EA 3T08A 4AUBA 4Y8EA 5FF7A 2CLLA 3RO8A 4ADUA 4MNMA 5AHEA 4ZXLA 4H6QA 3HZ3A 1TYGA 3OZMA 4RV3A 3VIPA 2VD9A 4J3UA 4QISA 3M0KA 1AJZA 4IPIA 1IXPA 2J9YA 2W5FA 2PGFA 4C6DA 4YXGA 1FUYA 3WLJA 1MUCA 2WC7A 1FWBC 3CLWA 4CQBA 4HT3A 4Y9OA 5DT5A 1P0NA 1JDDA 1Q6GA 1VEOA 3CZ8A 3QY8A 3H2EA 3QR3A 1JFHA 3UJSA 4AC1X 3ZZ1A 2C19A 3QGVA 3LTYA 5I3IA 3FKRA 1IZKA 2HVOA 1R7AA 2G8ZA 5IRPA 4BI5A 3DYMA 1MW3A 3RPMA 4AY1A 3U3HA 4B4HA 3BJTA 3DC8A 3KOXA 3Q37A 3G1DA 3HPZA 4IFKB 3EWDA 2DUAA 2BGQA 2CZDA 4WLCA 3MKCA 4U10A 2FHFA 1YDOA 5AFDA 3H26A 1RK6A 1DV7A 3OG2A 3PBWA 4U3CA 4LAMA 1TE1A 3F5LA 3G1AA 4JXCA 4AZGA 4E6MA 5DEZA 4KQNA 4CEUC 3CUFA 3U2CA 2W61A 1OD0A 2VFEA 2GPTA 4Y2WA 2ZXQA 1FHLA 3BAWA 3TN4A 3DBPA 1BAGA 1DL3A 3DG6A 1SVDA 4F48A 1DJGA 1KXTA 1XCXA 3CZLA 1PTGA 4ZQOA 3DFYA 2B0MA 1Q6EA 1P0DA 5XIMA 3CL6A 2WC3A 3G1XA 3N4AA 3AHZA 2OODA 3SM0A 1UKQA 3TWAA 3W1AA 4EPDC 3N34A 5ABGA 1E43A 3PTMA 5IOBA 1XWYA 3KRUA 3PPCA 4NJKA 2Z26A 4WUIA 2QUNA 1K6AA 1KQYA 3M0MA 3TUUA 3CBWA 2WNQA 1QHPA 2QGHA 4WQ6A 1R9XA 3SIMA 4CD5A 4TVCA 4HPHA 1UP3A 1O60A 1BF2A 4ICCX 2QUTA 4FLSA 4JTCA 2X42A 4JHZA 3BC9A 4TX6A 3VNIA 3MV11 2WJZA 3WLKX 4UQEA 2G37A 4ATLA 3WLIA 3EX2A 1J8VA 4F0HA 1GPWA 3GQYA 3S6DA 2NT1A 1JAKA 3G0SA 2C18A 3LA4A 4Y6GA 4QAWA 4TIMA 4KCUA 1O5QA 3W28A 2HS8A 4C6BA 1V6XA 1XBZA 4DF0A 1PL9A 4DZIA 1WZAA 3L21A 2FIQA 4FXRA 1VJSA 4HOXA 1XC6A 3OJGA 3FJ4A 4OT7A 2OX1A 3H2MA 2VX6A 1A0DA 1MMFA 2Q8ZA 1K8ZA 2QPUA 1WDQA 2OYLA 1XLJA 4RNHA 3B0XA 5FSEC 1I1WA 2VGGA 1US0A 1J79A 2UWFA 4IGNA 1UMYA 4HTBA 1FP8A 3FN9A 3RF9A 4C6LA 3VXGA 5AZ1A 2PDNA 1XCFA 2Y8VA 1WO2A 4YHEA 3TTQA 4R34A 2XGIA 1JCTA 7REQB 5AVNA 3QOMA 3B03A 3RXZA 4C1NA 1EC8A 1QVBA 4H6EA 1LF1A 3SW6A 3REQA 5U4NA 1QI0A 1YTDA 3HQOA 1OCBA 3DC0A 2HMCA 3RRXA 2XIBA 1PAMA 2DVXA 3M6DA 2REQB 4QE1A 2V2HA 1XIJA 5DXXA 4RZ5A 4ROPA 4LQ1A 2H6RA 4FHAA 4RE0A 1XQKA 4FLOA 2V0TA 1NQKA 3SADA 1EJRC 3LLFA 1TV3A 1Q3NA 5HPCA 4HU3A 1DQUA 4XD5A 3ITXA 4D6GA 3MMUA 2ISVA 4XZLX 2J7BA 2J8GA 4AZ6A 3ID7A 1EIBA 2ZKMX 3BW3A 3VD5A 4A29A 2WSPA 2C3ZA 3OPSA 3NL2A 4AZCB 3JU2A 3V35A 1XRTA 3EEGA 2QCHA 2PDLA 3M0LA 3WLSA 1PXGA 3N6JA 3CV7A 1KTCA 1R3TA 1AZ2A 1OG0A 3WLRA 3QQ0A 4K3ZA 4H9ZA 3ZOAA 1CBGA 3BVJA 2ZWYA 1SQ7A 4JL1A 4S2CA 3TYBA 3GHUA 1GT8A 1EJTC 5FJUA 1UROA 1UOKA 1Z42A 2R1KA 4G7EB 5AN7A 3AXIA 3EXRA 1SFLA 2GVJA 2J62A 1UWIA 2AQOA 3HPSA 3GNPA 3U6WA 2QHAA 5GNZA 2AKMA 1RJPA 1X7IA 3DZ1A 4QNEA 2CBUA 5DCBA 1SPQA 2YX0A 4AF0B 2A6NA 1TPFA 5C6MA 5K9XA 2VENA 1X98A 3R79A 1FP9A 1BYAA 1KXQA 3TLQA 4XZ9A 3C4UA 3BMXA 2WSYA 1HQTA 1X8CA 2QAFA 4K38A 1BWVA 1NWSA 1ISZA 1CLXA 5JBDA 2J79A 4NZ5A 1W9VA 3BLPX 2XHYA 4G1NA 3LCIA 3L0GA 5REQA 2BBFA 4L6HA 3DENA 1RP9A 5EB8A 1O94A 2WCGA 3ORWA 2DQXA 1PKMA 4EWJA 1B4EA 3WBWA 1V93A 3KLLA 3D5HA 2ZUWA 3SRDA 1G4SA 3CUXA 4DB7A 3UZZA 1MRQA 1YW1A 4N9DA 4DO5A 4Q8NA 1UR4A 2XN1A 4N7QA 2O92A 2PRMA 4AEOA 4GNVA 2CHNA 3THUA 5TD4A 3M0VA 4M1BA 4FOKA 1QWKA 2F6XA 3K13A 2Z24A 4GIRA 4O16A 1X1NA 1IYXA 1R3VA 2GVYA 5FJPA 3NQ7A 3WL0A 4PUJA 2B7OA 3M4HA 1JCLA 1F4HA 1XYLA 1EA0A 3CASA 2RKXA 1HUVA 3FAXA 1TA3B 2B81A 1SZFA 3IJ6A 1SU5A 3OW1A 3KWXA 5A8QA 1HL2A 4GI9A 5H8PA 5C2XA 2RDTA 4A8NA 3W4RA 2DZTA 4QLKA 4E8DA 1EOMA 1FCUA 3TW6A 2OFJA 1XYCA 4GC4A 3UEQA 3CNYA 2IMRA 3VIFA 1AQ0A 1OX5A 5DMNA 3BH4A 4GI4A 3FJNA 4WGXA 4JHMA 1FBAA 3M5VA 4E4FA 4ML9A 1W91A 3HBLA 2I9EA 5A8MA 3LOTA 2QW5A 1OWQA 5EKYA 4B5VA 1W31A 2ZXAA 3CQJA 4H9XA 5HUOA 3SUTA 5FJJA 1D3CA 2ZTJA 1RCOB 2O0TA 5DCEA 4QROA 4M8UA 1W3IA 3N15A 2PTDA 1UUQA 2DPEA 5CPNA 1DQXA 1Z9AA 4P8XA 3KVJA 5KINA 3TFXA 3CV2A 5B80A 4F0KA 2WQDA 3R11A 3VA8A 4JOMA 2W91A 1FWTA 4EP8C 3GNRA 4FPSA 1VEMA 1BEUA 3TYUA 2G97A 3OBKA 3VFCA 4MJ2A 3OOQA 3TROA 3W74A 4DIAA 2CFFA 1U33A 1XLEA 4DJFA 1RR2A 5F4WA 3V0UA 3VIIA 3DKJA 4AVNA 1J4EA 3VU2A 3VZXA 3VOJA 1UH3A 3PZGA 3HG2A 5CPOA 4DO4A 4AWUA 5KEZA 2FYMA 4IWWA 3ZJ6A 1PO9A 1TPEA 4GRSA 4MZYA 4ZODA 2EXOA 3UR8A 2X40A 5I03A 2WW5A 3M7WA 2W27A 3M46A 3A9IA 4OKDA 1A4LA 2OZ8A 1BGAA 4QXIA 2I57A 2CITA 3BCFA 3NQCA 1QK0A 2FZNA 1K7EA 2QJHA 4ZE5A 4ZGYA 5DCDA 4M6UA 4UTKA 1V6WA 1ODZA 3SFWA 2J13A 4IPLA 4H9YA 1LLWA 3ZT5A 1JXJA 3QQ1A 4RPQA 5FI8A 4I7WA 4WKAA 1TV2A 3I65A 1N8WA 1OGGA 1XFBA 3CPRA 4HZ6A 1TWSA 1PYFA 3GWQA 4Z2KA 1UP0A 4XV0A 4TO8A 4HNUA 3CEPA 2O4MA 3G18A 1RLDA 1TREA 5I07A 1Q5MA 1XLCA 1VCGA 1XDMA 4LUSA 5C54A 4FI4A 4IT1A 3RMJA 4KIEA 5E0KA 1KM6A 2C14A 1QXLA 3W27A 4WY0F 4C1NB 5AHMA 2YB1A 3THAA 5I3JA 2RDUA 3V75A 3M1ZA 3MUCA 3W2MA 1M41A 4ZO9A 3HV8A 2OT0A 2WO5A 1XBXA 4GZEA 2VDGA 5LKYA 1BTCA 3N4EA 3TCEA 3W82A 1NOWA 1HJSA 4EPKA 1PS9A 1EYWA 4PYSA 7XIMA 4W87A 4PRRA 1T8XA 1P7TB 2DORA 1YPIA 4XZWA 2NT0A 1EUNA 2F84A 5KITA 3SGZA 5M5DA 3PWGA 1AZ1A 4R88A 4Y7EA 3MB9A 2A4AA 1Z41A 2W66A 4WRHA 3IJ9A 4BZYA 3TN3A 2ICSA 1H63A 2ACQA 4LUIA 3AIQA 1GVRA 4PTWA 3GVWA 3WH5A 1FCVA 1LL4A 3DDMA 1IZCA 2PWHA 2YBVA 3KTSA 1ZJHA 4A8IA 2VGFA 4IQEA 3UZYA 4GBUA 1EO7A 2EPMX 5LNSA 1DORA 1JCYA 1MO0A 1KRAC 5BCAA 1TMQA 3KBNA 1HNYA 1I2OA 5LZLA 1QCWA 3AIVA 3S8HA 3QV7A 4KWVA 4HHMA 2E28A 2DZWA 1WXJA 3CZGA 1ONWA 2ZWZA 3AUJA 1VD6A 3AISA 3WD3A 2BDQA 1F6KA 3GTHA 3DYOA 4UWMA 1XH0A 2X1SA 3A3XA 2E1WA 1V02E 3DFHA 4WKHA 2HCVA 2D3NA 2RJGA 3UGRA 4R53A 3UR2A 4UIOA 5DBTA 1D7KA 7ENLA 2GWNA 1H50A 1JUKA 4AHPA 3L2MA 5G4EA 2JIWA 1Q6CA 4AD2A 4LYQA 1TJ1A 3W7QA 3Q2DA 1U30A 2P3EA 5DELA 4PSPA 4BQ5A 4ZB5A 2W0UA 3MA8A 1T41A 1VR6A 2E9BA 2YB4A 4EPBC 3FJLA 5BZAA 1S2WA 3HGOA 3DIPA 3L0NA 4AWSA 4AISA 4AD1A 3W6YA 3TYAA 2VFHA 2DH3A 1XDJA 2YFNA 2EO7A 3ANYA 3C2EA 1IGSA 4K1WA 2NXGA 4S3FA 1SO5A 1KFJA 4POCA 3UD6A 1L6SA 1HVXA 2PS2A 4QRNA 5E6ZA 4R9XA 4DYKA 2OOFA 3FXGA 4JIIX 3LY0A 3AWNA 3O6DA 4MWAA 3M0YA 3W76A 3V0TA 2WZTA 1W3TA 2MNRA 4NAEB 1S3TC 2RGLA 2BFGA 3ITTA 4H7CA 4DO7A 1TIWA 1JCJA 1QHOA 2FVKA 2QT3A 4IL0A 3NIYA 1J0ZA 2WPBA 3BLOA 1WZKA 2ZZ4A 3RX3A 2E67A 2DGAA 3LUTA 3QBUA 4H01A 4I9JA 4EXQA 5C9UA 1JZ4A 5JIPA 4J3VA 3KZPA 1OK6A 2CWNA 1LUCA 3RCYA 3N25A 2QIWA 3OLIA 3O6YX 3BG5A 3U9IA 1KWKA 4YPJA 2ZX5A 3N17A 3P3BA 1IR2A 1TZ9A 3N4FA 2IKJA 1E9IA 5D30A 1TJ2A 4U4MA 3W26A 4J35A 1KRCC 3TOYA 4C6JA 2Y70A 1Q6LA 3O07A 4D6IA 1KFKA 1ZP4A 3TDFA 1X6NA 1QMLA 1T7LA 2F6UA 3L5MA 4QAIA 2HZGA 4C6FA 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