4H6QA

Structure of oxidized deinococcus radiodurans proline dehydrogenase complexed with l-tetrahydrofuroic acid
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
281
structure length
281
Chain Sequence
PQVEQLARQKMWNLAERFVAGESIESAIQAVQALERDGIAGNLDLLGEFIDSPAKCTEFADDVIKLIEAAHAAGIKPYVSIKLSSVGQGKDENGEDLGLTNARRIIAKAKEYGGFICLDMEDHTRVDVTLEQFRTLVGEFGAEHVGTVLQSYLYRSLGDRASLDDLRPNIRMVKGAYLEPATVAYPDKADVDQNYRRLVFQHLKAGNYTNVATHDERIIDDVKRFVLAHGIGKDAFEFQMLYGIRRDLQKQLAAEGYRVRVYLPYGRDWYAYFSRRIAETP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures and kinetics of monofunctional proline dehydrogenase provide insight into substrate recognition and conformational changes associated with flavin reduction and product release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proline dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Deinococcus radiodurans
total genus 123
structure length 281
sequence length 281
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.5.5.2: Proline dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01619 Pro_dh Proline dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.530 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel TIM Barrel 4h6qA00
4H6RA 2G37A 2EKGA 4H6QA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LT7A 3C5QA 4J5NA 3B97A 1CXHA 2G50A 4QJ5B 3V0TA 4ECLA 5HNNA 1AFSA 5AC8A 3KRUA 3DN5A 2R91A 5I3GA 4I7WA 1S38A 3THUA 3W7IA 4NJIA 1WPCA 1K4GA 3DFQA 3VOFA 1YDNA 4HNLA 4H7VA 4AWEA 3KTCA 2J4GA 3T0CA 4HBKA 4RZBA 2Y7DA 3LMZA 3W74A 1SGJA 3I3DA 2G3IA 4LF2A 2YDRA 4S3JA 3UVAA 3HGJA 1W1VA 1YRRA 4JQ2A 1D3GA 1XLGA 3S2MA 3B9OA 3HOJA 3ALFA 3CTLA 5BU6A 4YHGA 4BFAA 5MF5A 2PEVA 4G5DA 4IG2B 2ACRA 2FB2A 3WMSA 2F7FA 4BY3A 4EF9A 4UR8A 3V0UA 3CL6A 2CBIA 3SY1A 1R8LA 1IEQA 2QJHA 1E6NA 3OEXA 1EUAA 2WB5A 3WQ4A 3CUJA 2V5JA 1R3WA 1OFDA 5FL0A 4ROPA 3QXBA 5I3KA 3NJ3A 4BCEA 3CO8A 1KFLA 3UCCA 2BY0A 1LTDA 1TKKA 3IACA 3ALGA 1PEZA 1ZJAA 1AVAA 2W91A 3AJ7A 2GUUA 3CNYA 3ERPA 1VRXA 3C4UA 2V5KA 2OT0A 3EX1A 4ZSTA 3VOJA 4LAKA 2QGHA 2CERA 4DJFC 2GVEA 2QPUA 5FI8A 1XIFA 3BK0A 3PFMA 1IYXA 3LK6A 4J7RA 1QK2A 1P0BA 3F4NA 1GEQA 1KD0A 3FW6A 4B5UA 4Z1YA 4RDZA 2O9TA 4IUOA 5E09A 2VC6A 2O9OA 3FKKA 4D71A 1OFOA 3G5EA 3RMJA 3S8HA 4EPBC 3BICA 4UTWC 1BSLA 5CH9A 4KEMA 5D2YA 4AXKA 3NZQA 3L0NA 4O1CA 2PLKA 1JDFA 1VFTA 3WK0A 1W1PA 1LBLA 4BWLC 1KO0A 2FZNA 3EBVA 3TLLA 1NWRA 4KESA 4I6KA 4LXFA 3G6LA 1JXJA 2VOTA 1QWKA 3O6YX 1CXLA 1U22A 3I65A 2VZUA 2NQJA 2PDCA 3A5FA 4FMVA 1RY0A 4IQLA 1XKJA 4C6BA 9XIMA 5AC6A 1OM0A 1XRSA 3VFCA 3O6DA 1PZ3A 4LTSA 4NVTA 3DU0A 1M01A 4DBUA 3LRLA 2PZNA 3EA2A 5K4ZA 4C1NB 1JIBA 3FJNA 1ZP4A 4UTMA 2I14A 4OIFA 1HUVA 4YVXA 5BXRA 4H6KA 5E0FA 1QT1A 1FWDC 1DXEA 3S6DA 4DUVA 3SCOA 5U4NA 2YYTA 3GE7A 1EOKA 4GPNA 2NV9A 4RZ6A 2WANA 3E2SA 1ICQA 4G2DA 1MO0A 3O8AA 1GJWA 2Z7KA 5DT7A 4FF7A 4M56A 4D8ZA 3MP5A 3WQ5A 2GJXA 1CTNA 3P8IA 5CC5A 4MWAC 2ZZ3A 2PDJA 3C6CA 3L68A 3BW2A 4AZCB 4GI6A 1WZLA 4IPJA 2VVSA 3N17A 3LD5A 1TV4A 4YYCA 4US5D 4L80A 4JYFA 1JZ4A 4M0XA 2P53A 2V5BA 1NY1A 1WDWA 5A6TC 2GWGA 3VIIA 5A5WA 3UU0A 2YB4A 3WN6A 1A0DA 1FWCC 1W3TA 3WLJA 4I5XA 4J2MA 4H9MA 3P67A 1H7PA 1IQ8A 3HPAA 3MUZ1 3UNTA 4RPQA 4QG6A 3DENA 2ZYFA 5G4EA 1E15A 3P60A 4KWVA 4ZA0A 3R7MA 1C8XA 1IT8A 1VEPA 1GQIA 1I2OA 3U5YA 2OZ8A 1POJA 4DWSC 3BSHA 3TOYA 1IZCA 1RVGA 3NOYA 1RD5A 2VEGA 4UNIA 4AY1A 1B4KA 1GG0A 2XIQA 2R9RA 1VFHA 3N9RA 3EOSA 4Q8VA 4YS1A 1V03A 3ISIX 3IIVA 3PZVA 2WWCA 1ESWA 2D69A 3GS6A 2OLSA 2XSBA 4B92A 2DZPA 4AD5A 4EPKA 2VELA 4CNUA 3DHFA 1BEUA 4LAZA 2B81A 4FALA 3B9EA 2QCFA 3IJIA 4FI4A 4QEEA 3W2UA 3H54A 2EQDA 4NZ1A 3MKCA 1VCVA 3M07A 1E0VA 1ME7A 3QV7A 3P5ZA 3S5ZA 1MXGA 1GVQA 1JG9A 1VIWA 4BQ2A 4QCEA 4IXHA 3QQWA 3U2CA 4RE0A 2XIJA 5DMMA 4CVWA 2VFHA 1H49A 1ISVA 4AHPA 2Y7GA 3B40A 2HS8A 1M6JA 3TA6A 4QX4A 5JVLA 3BJSA 1CIUA 4I7VA 3OZPA 1XD1A 4MGGA 3G1DA 5CPSA 2UY2A 1M1BA 3GW3A 2VL4A 4URIA 2WAGA 3S1XA 4LX4A 3KL5A 4Q22A 4XZHA 1XWYA 4PMYA 1SYTA 5G4HC 2Q09A 5GJMA 1CW2A 3DYOA 1F61A 3H2AA 1QCWA 3VDHA 4M82A 4P7RA 4DO7A 2O4QA 5CBIA 4H9YA 1RA0A 1X96A 2XWDA 1KXVA 4LSBA 3M44A 3WJWA 4IH3A 2CHOA 4MZ1A 4TVCA 1NDVA 1L6FA 1A5SA 3DEQA 3REQA 1XIIA 1C9DA 1K8ZA 2E9MA 4UFJA 5AYXA 1W31A 4U5KA 4LFYA 5AYIA 2J88A 2IQTA 3N34A 1YTEA 1EDTA 1BKSA 1UR4A 3M0VA 5EB8A 1ADDA 3TJXA 2QJMA 4KWWA 1A4LA 3SCUA 3AXXA 1V08A 2TYSA 1J0HA 3S4TA 3S6OA 1GQJA 2NLYA 1LT8A 1RY8A 3MI2A 3VDGA 3TW6A 2G41A 1SZRA 1XIHA 2VMFA 1YNPA 4GX8A 4IP7A 4KEVA 4ILSA 2Y4SA 4JIIX 3QJAA 4ZB5A 1RSCA 4QHRA 3GYEA 1ZY9A 1EF3A 1J79A 3IUHA 1GG1A 2GSJA 1JD7A 4CNOA 3R8HA 3IS4A 2XFFA 1HKMA 2IXVA 1WOAA 1S5NA 1F76A 1J2WA 5DEZA 3EEGA 1GYMA 3OBEA 2CLIA 3KLLA 2VEKA 1S5WA 3L4VA 1J12A 5G5IA 1TSIA 2PMQA 3WEMA 3P14A 3G8RA 1Y0EA 3NL3A 1JF6A 1U2YA 4IIFA 1U1HA 3PBVA 2OKTA 1RAKA 4LV4A 1O95A 2NT0A 5IM51 2YL6A 4Q4KA 4XG1A 4AU0A 3GKFA 4IICA 1V6TA 1TCDA 3CEPA 4AC1X 4YCPA 4O1AA 3TWBA 3Q45A 4PL2A 1DOSA 1FUYA 2DU2A 2BASA 2QUVA 4UIOA 1HGYA 1GYLA 3TE9A 1J0IA 3W9ZA 2YFNA 5CJ5A 3G77A 3ZJ8A 5A1AA 1W9VA 3BOXA 3ZJ6A 4JQ3A 3RUBL 2OSWA 2PDIA 4WDUA 1MMFA 2F84A 3NZ1A 4NP7A 1XBXA 4EXQA 3LDVA 1UBPC 4V33A 5H1WA 3WMBA 4OOZA 3E5BA 1ZS2A 1W8SA 3NWRA 2PC4A 3H2NA 5TIMA 3QGAC 5C2CA 1Q4NX 1EDGA 1KBLA 1QNSA 1DEDA 2ZUTA 5LGXA 3GC2A 2AOSA 3OA5A 4XKYB 4J3WA 1Q6RA 2TRSA 4UQAA 2WVUA 1VJSA 2XM2A 3DI1A 2GGJA 4RXGA 2XG9A 2I9UA 3UERA 3N12A 4IIEA 3M16A 1BF6A 3OA3A 2WBGA 2H3BA 3B05A 1TQJA 4QS6A 3SEPA 3RHGA 1FRBA 1JCJA 5A94A 4Q8WA 4Q4OA 3U57A 3TTQA 5BXPA 3UPMA 1FWJC 1W3KA 1WUEA 4A3QA 5MKGB 1FKXA 1F4HA 3TAKA 4FNPA 3WQVA 4JN8A 5BRBA 3UD6A 4LAUA 3ZJ7A 2HWGA 2VT0A 4OV9A 1VPYA 2PDQA 3QY6A 1K7EA 4G8TA 1HT6A 2BMBA 3PANA 4N6EA 2OMAA 3B8WA 3WDPP 2IXUA 2DVTA 3POHA 2YDAA 2IPJA 4AD0A 1QASA 4N7QA 1S2AA 2OYLA 4EOUA 2NXHA 4S3BA 2A7NA 3BJFA 4WKHA 1I2PA 1FCBA 4ZVJA 1NTHA 1M03A 1W1IE 2P50A 3GHUA 4CUCA 4WX2A 2QV4A 1AW5A 3T42A 5C6MA 4NASA 4JTIA 2YSWA 3GAKA 2E7FA 3N6HA 3ZLFA 4RDWA 3U4FA 1FWGC 3QPEA 3DKJA 4HHLA 1ZCCA 4UFLA 3QPZA 3WUEA 5C55A 3HMJG 2HVNA 2P0OA 3ABXA 4U28A 4V15A 3GC5A 5ENLA 3GUGA 1TUXA 1LOQA 4OHQA 3NDOA 5I0DA 3UG3A 2YA2A 1R7OA 1CGVA 1HL9A 2VTFA 4LNCA 1IGSA 4LV9A 2J79A 2WOQA 1BD0A 1LORA 2E5DA 4O0QA 2QKFA 1YMYA 4MNJA 3KFTA 4LS1A 2EGZA 3E2RA 3INPA 2XZ7A 3G0SA 3HTWA 1E4NA 1NELA 4PUJA 2XN1A 4J3XA 3PZOA 5A6MA 5BRQA 2VOMA 5CGTA 1VYRA 4LF1A 4FF5A 4DI9A 3WG6A 4BQ4A 3KOFA 3IJDA 4WY0F 3AOFA 5A6AA 3MUCA 3WK2A 3VD9A 1EPVA 5AB3A 1GGOA 1ZUAX 2Y7EA 3QM3A 3L4WA 3DYPA 1CWYA 4G6CA 4HZ6A 2V30A 1GZGA 3C3NA 3W86A 1I0BA 2PDXA 4AEOA 2BDQA 1TPFA 5E6YA 1I0DA 2R14A 3HG5A 4IIGA 3VTRA 4MKNA 4QE1A 4C1LA 1ZHAA 5CG7A 1RPXA 4K38A 5FEPA 1N8FA 2V9DA 1NDWA 3WZ0E 1VFSA 4LNYA 3ZR5A 1WBJA 3ZT6A 2ZUWA 3H6OA 4A8RA 2C0AA 5RUBA 5BYWA 1VBGA 2GJLA 1O1ZA 4WDTA 3VC5A 4D1JA 2DZUA 4WSJA 4MG4A 3H55A 3TSMA 4O0ZA 1MUCA 2PWUA 3A5VA 4XZMX 4S39A 5A3HA 4Z08A 4E6MA 1HL2A 2MANA 4FHAA 2GPTA 3TKFA 3GTIA 4FIRA 1J11A 2YOCA 3THQA 2G8ZA 3KRZA 3WUGA 1RK5A 1ZP3A 4M24A 1K9EA 4MB1A 1MNZA 5XIMA 2WZHA 5T91A 4Y9PA 3EWXA 1SFJA 4CQCA 2ZZ2A 1EYWA 1OF8A 2OX4A 1Q63A 3WQGA 4JY8A 5H91A 4WSHA 3HU7A 1MSSA 4FNTA 3TC7A 1MQQA 3ARRA 3RG6A 1FWRA 1WYIA 2YCLA 1P1XA 4V1XA 1R2TA 4HPNA 4BF9A 1O5KA 5CJMA 3GTNA 3S9ZA 2YL9A 3IV8A 2OYKA 3QOKA 4WXYA 2QUMA 3BMWA 2QJNA 3G1YA 3DHDA 3W84A 1PJ9A 3HV9A 5AECA 2ZRYA 1CGXA 1JCNA 1M68A 5KMYA 3MMUA 2CZVA 5HBFA 4YWSA 4W86A 1U1JA 2E67A 1B3OA 3SCTA 3EPMA 5ECUA 3W01A 3ZM8A 1UD6A 3CWOX 4HZMA 3GDRA 3NUKA 4M19A 2WC7A 1MW3A 3CLWA 2QDDA 1QW7A 4HYRA 3VKAA 3IK2A 2ZZ4A 5A6BA 3H4GA 3M6DA 4F0RA 4K37A 2ZRZA 3DCPA 4BF7A 3AAMA 2W0UA 2FZ8A 1WB0A 5JU6A 2BWGA 3BGJA 4HU8A 1EP1A 1VBUA 3BMXA 4N9BA 1LJYA 1UH4A 3GXTA 4DPPA 3PUOA 3QC3A 4DRSA 2WVSA 1R9YA 4KERA 1E51A 2OX1A 4HU0A 3UW6A 3BCJA 3M0IA 4IXXA 3VX0A 5AYYA 3FJLA 4PA8A 1HKJA 4Z1CA 2B7NA 3S0CA 2Y6ZA 2REQA 1EJWC 1V3KA 3CPRA 4Q8OA 5BOOA 2GZXA 1BYAA 1B3YA 2QULA 3CJPA 2HBXA 1AH4A 1E72M 3T0DA 1QMLA 2YGYA 3EYPA 4YMZA 2WMIB 3GBEA 5T9CE 3E74A 3NQDA 4AVOA 1LG2A 2W63A 1UOZA 3LRMA 3W7GA 4HTYA 3G18A 5ABFB 1SO6A 1FCVA 3LQGA 2I57A 5DT5A 2C8NA 4MNMA 4F0LA 3KZSA 2CLEA 1XH0A 4UTIA 1HJVA 3NQAA 4Z2IA 4C6CA 3R2GA 1XLAA 2XSAA 2V5LA 5AVNA 1VYPX 4R7WA 3ZXWA 1JZ7A 3HO8A 2BFGA 3MVIA 3M7WA 4F40A 3PB0A 4YVVA 2QUUA 1G01A 2EJ1A 4DXVA 1OFEA 3TX9A 3QGKC 2UZ9A 2J9YA 4DJFA 4UTFA 2QV5A 5I3IA 2VCAA 3K1GA 1XIMA 2EPHA 2QCNA 1G4SA 4R27A 3W72A 1F3EA 1C9WA 1IF2A 3H21A 4QISA 3UYCA 4XSLA 4E4PA 4XTIA 4U3AA 2CLFA 4AHQA 3RILA 5FJOA 1KM2A 4NZCA 3DI0A 3O7UA 3QV6A 1OABA 3WQOA 4FNUA 2VUYA 3AIEA 1EO5A 4UTWA 1BWLA 2R1MA 3LOTA 1QPNA 2XFWA 2QDHA 2CKSA 5F4XA 2PTWA 3RCYA 4C7DA 4O18A 4BWLA 1LQ0A 3EWYA 4C6KA 1F6YA 2PDYA 2WMHA 4LVGA 1F6PA 4HMDA 1SSDA 1NP0A 3K8KA 1CZ1A 3W2NA 3LLDA 3NAVA 5ABHA 1E5NA 2Z00A 1TPB1 2CBVA 3HV8A 3CHFA 1T8QA 4OT7A 4I90A 3GNNA 3PR2A 4IUGA 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