4H6RA

Structure of reduced deinococcus radiodurans proline dehydrogenase
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
KMWNLAERFVAGESIESAIQAVQALERDGIAGNLDLLGEFIDSPAKCTEFADDVIKLIEAAHAAGIKPYVSIKLSSVGQGKDENGEDLGLTNARRIIAKAKEYGGFICLDMEDHTRVDVTLEQFRTLVGEFGAEHVGTVLQSYLYRSLGDRASLDDLRPNIRMVKGAYLEPATVAYPDKADVDQNYRRLVFQHLKAGNYTNVATHDERIIDDVKRFVLAHGIGKDAFEFQMLYGIRRDLQKQLAAEGYRVRVYLPYGRDWYAYFSRRIAETP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Deinococcus radiodurans
publication title Crystal structures and kinetics of monofunctional proline dehydrogenase provide insight into substrate recognition and conformational changes associated with flavin reduction and product release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proline dehydrogenase
total genus 116
structure length 272
sequence length 272
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.5.5.2: Proline dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01619 Pro_dh Proline dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.530 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel TIM Barrel 4h6rA00
4H6QA 2G37A 4H6RA 2EKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3SBFA 2BZNA 3IV3A 3AC0A 1P43A 1REQA 4MPKA 1YKWA 1WBHA 2ZRZA 4O4VA 4LXFA 1XLJA 3SCSA 4B5XA 4UCFA 3WD3A 4XTDA 1H50A 4S3AA 1UBPC 3UPWA 1XGEA 2NW0A 3WLMA 4Q8NA 2PD9A 4J40A 2PWEA 5BRPA 1UHVA 2AMGA 4TOQA 4UZUA 5CC5A 5ENLA 4LWWA 3VKAA 1H1ZA 1X6LA 3B8UA 1BSLA 5C9XA 5LNWA 3AI0A 1GUVA 1JL8A 3TCSA 2HK0A 3LS9A 4HA1A 5I3GA 4HK7A 2TSYA 3UWQA 2VJXA 1GONA 4WIWA 2EPHA 5A6LA 3NQ6A 2Q6ZA 1UD3A 1OEPA 3B0UX 3W07A 2YFNA 1BVZA 4D2JA 1LBLA 3CHDA 5L9FA 4MB5A 5C7HA 1J10A 1B3VA 4B3ZA 4Z2GA 2FPTA 1I2PA 1U22A 1MSSA 2B7OA 1SO6A 1J79A 4JTHA 4I90A 4H8HA 3CAQA 2HVOA 3G0XA 2ZRXA 1JD7A 3O6DA 5EKYA 2D22A 1FWFC 4WRHA 4Z42C 4P7LA 3WNPA 1EDGA 5I3DA 4I9TA 1H3GA 3DXIA 2VX6A 1D3CA 3NQVA 3PY2A 2ZX5A 5HA7A 2WO5A 5FJUA 3ABSA 3RAOA 3LHTA 4K6AA 2W6RA 3NVDA 3LB0A 3F2BA 4S1FA 1O94A 1GW1A 2XVKA 2G41A 3UD6A 1UD6A 1PE1A 4QLKA 1IGSA 5U4NA 5ABHA 1N55A 3H7UA 1JF6A 4N4PA 1LG1A 3H7VA 1A47A 3H8AA 4QEHA 4ZR8A 4UR7A 2WVVB 1KCLA 2ZUTA 3MC5A 3N15A 3ZWTA 5CJ5A 1T0OA 4TX9A 2YCIX 1TV5A 2VZUA 3CJPA 3B8WA 3SRKA 3BSMA 4JTKA 3WMCA 4GI4A 5CPMA 4AVOA 4XAGA 2A79A 3MY9A 4LNCA 4F4RA 3QKZA 4AEEA 4NG3A 3MUXA 2RH9A 1Y65A 2J6VA 1P7TB 1BG9A 1FWTA 3TDFA 3WQ6A 2J9ZA 3WD4A 1NWRA 1KGWA 2J74A 4DELA 5AC6A 3FNDA 1WE5A 5F4XA 3WK0A 3E12A 4EXAA 1K8XA 3UERA 4BF9A 3VD5A 3BLPX 3GFXA 2I1OA 4JIQA 1E4LA 3AHZA 4H41A 5LKYA 4NIRA 3M9YA 4MVAA 4WSKA 4R5EA 2RFGA 3CUIA 1WDWA 2A3EA 1FX6A 2ZE0A 1V3HA 1BWKA 4NVTA 3B4UA 3ELFA 1CECA 2VZTA 1QNPA 3DECA 1I45A 1CGUA 1IEIA 4IT1A 3MO4A 3NEHA 3HJEA 3WMSA 3FGCB 3O0KA 4O1DA 4QITA 1TPH1 3S9YA 3FCPA 3NQ2A 3SCTA 4HB7A 1GQNA 2V5LA 3ITLA 3FN9A 4J3SA 3B9NA 3W83A 4JQ3A 2TMDA 3VMOA 5HQLA 5EFFA 2DVXA 2WNQA 4GUGA 3KRZA 3V3WA 1YXCA 3O07A 3V0SA 1MDLA 1FY6A 1B2YA 1VD6A 3ZJ7A 3P80A 1E9IA 1I8JA 3ZFHA 3D6NA 3UJSA 1E1CA 2Z6JA 2EQDA 4TTGA 2ISSA 1XCWA 4B4FA 4H9TA 1AUSL 1KFJA 2NQ5A 3TROA 3W7KA 2NXHA 2PGRA 3WO8A 1QBAA 1HP5A 5U7SA 3W6LA 1HKWA 1OABA 4KWWA 1HKKA 1RBOB 1LZOA 1JEZA 3NZQA 3VNMA 3EA3A 3K1GA 4ML9A 2Z1KA 1V4YA 1HJVA 3BDKA 4J7RA 1MUWA 5D09A 2WKGA 4ILSA 1WZMA 2ZWZA 2DY3A 3HQNA 2J8GA 4U31A 1XIDA 2DZBA 4N7QA 4DX3A 4HU8A 1A5CA 3AU2A 1SYTA 1RVGA 3IACA 4PBGA 1XH2A 1IZJA 1T7LA 1LQ0A 4AUBA 3V36A 4IPNB 3U6WA 3EWBX 3VTRA 1UIOA 2CNCA 2XVLA 4US5A 2R1NA 3MV01 4S3EA 3NAVA 5A69A 1OINA 2ZX8A 2HRWA 1F3XA 1U83A 3PAOA 3KZSA 3FJLA 1OX5A 3CMGA 3TIMA 3N9SA 3BZGA 3PPFA 4MWAA 2ZA2A 3AALA 1PX8A 3AO0A 5HNNA 1RALA 4GBUA 1LLOA 4JTFA 1J2BA 5A8PA 1MW2A 1SU5A 1WDSA 3DDMA 1MW3A 1TYGA 1WUFA 1AH3A 3IGUA 3C6CA 1K6WA 3T0CA 4LYQA 2PRMA 1OG0A 1CCWB 1R6WA 5A8OA 3P6LA 1QDSA 4PSPA 3W7NA 2PDGA 3WH8A 3IVSA 3ITOA 4JQ2A 1HL2A 6TAAA 4Y2WA 1VPQA 5DMNA 3CZJA 4JIRA 3KW3A 1OC6A 2H8XA 2AQWA 3BLIA 3CT2A 3IIXA 4HZMA 1BHGA 3WF0A 4BWLC 4V1XA 4IGNA 3MSYA 3SIMA 1GOIA 3G1XA 4XX6A 1R86A 3W26A 4Z2HA 4GI8A 1JUKA 1VJZA 1XRSA 2O0TA 4BCEA 1AQFA 3TUUA 1Q7QA 3M47A 3E2RA 4J3ZA 3KWSA 2OKOA 2VC6A 2OZTA 1YHTA 2H8ZA 2J4GA 3UVAA 5LIXX 1RV8A 1FWHC 3TQPA 3W7IA 5CSUA 1VLWA 3VC6A 1GEHA 1J0IA 1AH4A 2A3AA 4GO9A 5HDRA 3HV9A 1A5UA 6A3HA 4L64A 2YA1A 1L8PA 2CZVA 1PKLA 4HYWA 5AHFA 4C6MA 2FVLA 2X42A 1Q2SA 1VEMA 1UJQA 3EZ4A 1REQB 4H19A 1FFRA 1R2SA 5EBUA 4WCJA 5KEZA 4EXBA 1IT0A 3KRBA 2C91A 1PPIA 3ATYA 4YJ5A 1KXTA 1Z44A 4IGHA 1PX3A 1UC5A 5CC3A 2A5HA 5MKGB 1ZCOA 3VKJA 1W1PA 3M0JA 5HJXA 3LBOA 1QRQA 4EXQA 2QULA 4WGXA 1UWSA 2A1YA 4NNCA 5BNKA 3AUJA 3DX5A 3ABOA 3B9OA 4D6JA 2PEVA 1W3TA 3LGEA 3VIGA 4IMCA 4QJ1A 3BJTA 4S2CA 4EOUA 1PYMA 2QEZA 1R3QA 2DW7A 2X7WA 1CENA 4XO6A 1WOAA 3NL2A 3DFOA 3BLEA 3RM8A 4PMJA 5A1AA 1KC7A 1S2WA 3JZEA 4UNIA 4XIMA 2J9YA 3F5JA 1EJTC 4JX4A 1MWOA 2ZZ2A 2VKZG 3EA1A 4M1RA 3DHPA 4E8GA 3B8IA 3T05A 4IIFA 4FZIA 2DH2A 4IZGA 1KR1A 3STCA 3JVAA 4Q4OA 3VZYA 5BOOA 3CZEA 1QPOA 1SFTA 1ISZA 1F73A 2ZYFA 4LY8A 4IG2B 1DIEA 1ZS2A 3EMZA 1KM4A 3GIYA 2YXXA 1RK6A 1G69A 1QJWA 4GJJA 1FWIC 3ZR6A 1CIUA 3BMXA 2VGIA 4NP7A 1PZ1A 4UC5A 2HZGA 3PWIA 2ZC8A 4DAIA 1FH8A 4RNHA 5EMMA 3HPSA 3R6IA 2Z1XA 2IMRA 1FDZA 4F79A 3GAYA 4E6MA 1IWAA 4NASA 2YW3A 5HMEA 3TA9A 4J3UA 1VBGA 1WKDA 2X05A 4GLEA 4CD7A 1TTJA 3LZ5A 1W1ZA 2PDYA 5CZTA 3VOJA 2D1ZA 3OGVA 2QCCA 3WENA 4AZ6A 1W1TA 4LNYA 4TX8A 1FQ0A 4GINA 1DTNA 2JIEA 4R33A 3UNTA 3LMZA 3M07A 3A21A 4W84A 4M6UA 4YWIA 3MCNA 3SECA 1YNQA 4MGGA 1VCFA 4TQTA 2BVDA 4POCA 2OTDA 4AVNA 1Z9AA 2PDIA 1FKXA 1XL9A 4ZSUA 3PTQA 3QN3A 2ABAA 4ZVJA 3TC6A 1JNDA 3A4XA 3S2MA 1EJUC 4QJ5B 1GHRA 4K39A 5C9ZA 1AD1A 4BA0A 4O53A 2BXYA 4XKYB 3UW6A 3EPMA 3OP2A 1MW1A 3SW6A 1BVNP 3W1QA 1HVQA 3LHYA 4AX7A 2YZ5A 4IUGA 3GW0A 3VKCA 3CUJA 2V5JA 2C71A 3PTMA 4C7DA 4B9YA 4H6QA 1L8NA 5DBUA 4I8DA 3GSMA 1F3WA 3B05A 1BD0A 3EMCA 4YTTA 1GORA 2Z29A 3NA8A 3G18A 4MDPA 3MJMA 3H2NA 3CPRA 2VEPA 1M7XA 1BKHA 2HE5A 1JZ6A 3D47A 1ICSA 2PLKA 2Z7KA 4ADUA 1AMYA 4LW7A 1WUEA 3MKCA 4ZQPA 2Y5JA 2TYSA 3VK5A 4NT0A 2RKXA 2EHHA 2EJAA 3L66A 3OLIA 3UCQA 1YBQA 4JFVA 4LQ1A 3ZR5A 1ZNNA 1EL3A 1CEOA 3P5YA 4AW7A 3TTYA 2CBUA 3T2PA 4O11A 4KMQA 3VX1A 4L4MA 7ODCA 1A5SA 1RP9A 1XINA 4BQ4A 2R6OA 2BDQA 3KP0A 3L2IA 3QRHA 2QVNA 3WK2A 2JK2A 4ZOBA 1MZHA 4JIEA 1EDQA 3WH7A 3FW6A 1FWEC 1CB2A 1UWUA 3ARPA 4JFTA 3KBMA 1RD5A 2PWHA 2X0HA 3ARYA 3MZNA 1H61A 2CXEA 2TODA 3W84A 4E2VA 2HTMA 3T0TA 4W8LA 3E0LA 3BJSA 1QU4A 2WZHA 5HWNA 4HPJA 5LSMA 4FNQA 5AY7A 2WHKA 1Y5VA 4HMDA 4WZHA 1K9DA 2YPIA 3NR0A 3DGRA 2D73A 5DXYA 5KITA 3KEHA 2NQHA 2WBKA 1UWRA 4HHHA 3N17A 3D3FA 3I65A 1HL9A 3ABRA 2ZZ1A 4MKVA 1TSIA 4ZBCA 3A9BA 4A3YA 4F66A 1J12A 1Q6GA 4HIBA 4MM1A 1GKQA 4DBSA 2YKKA 5FL1A 4QRNA 4MUZA 2Z28A 2QCHA 1ADOA 1MO0A 2DQXA 4UOJA 3UP8A 1Q6QA 5A95A 2XIOA 3CGTA 2J77A 1MEWA 3QMTA 5E6ZA 2AQVA 3WMBA 1TPVA 2VELA 4C6LA 4C6EA 1AW2A 5DT5A 1AZ1A 3KDOA 1V77A 1VFTA 3WCZA 3CYJA 1CDGA 1KFEA 3RXZA 1JZ2A 4TO8A 4K36A 3NGJA 2J79A 4QBXA 1UMLA 5EB8A 1C8XA 3AOFA 3CTLA 3GTNA 2VI0A 3BC9A 1UQZA 2O4QA 2WNWA 1QO2A 3FHAA 4HYVA 3R8RA 5BXPA 3LM3A 1TVPA 3F5LA 5A6KA 2J7EA 2VL4A 3G22A 2V8ZA 3GZAA 1V03A 3M1ZA 2VRKA 3QC0A 3R7MA 5AN7A 2QAPA 1QOXA 3URBA 3K8KA 1EF3A 4RXFA 3VNLA 3HZ3A 3GTFA 1AQHA 1G9HA 4CU6A 5T8GA 5HANA 4RNIA 3F5KA 4QM1A 4NZ5A 5FACA 5FF4A 3Q94A 4ONVA 4LUJA 4PMOA 2IKGA 3TJXA 1JI2A 4H04A 4Z2IA 1PWMA 3WMLA 4RJEA 1WKFA 3KVMA 5CSRA 4O17A 3BG3A 5C9RA 5LIKX 2XGBA 4O18A 4ZSTA 3HO8A 3VIPA 1MNSA 1LBMA 4JDBA 4DUWA 2CLKA 2OJPA 2ACRA 5JH2A 4DYJA 1QK2A 3SY8A 3VC5A 3WEMA 3VUSA 1FCVA 4B5VA 3WUGA 4DF0A 3PM6A 2HMCA 1S3TC 3CAWA 4Q33A 1I4NA 1ONEA 3PG9A 1HJUA 4FLOA 1CXEA 2WHJA 3OYXA 4IQDA 3WDIA 1EP1A 1OQFA 2VTFA 1FVPA 4QS5A 2WM0A 3W53A 2Z4GA 2PF0A 3C56A 3H7RA 4JQ4A 4MJ2A 2WHMA 3QBUA 4UTJA 3I3EA 1C9DA 2DJXA 4S2BA 1P5BA 2JFEX 1CZ1A 2O7QA 5F1UA 1QPQA 1MDRA 2OO6A 1UBSA 3BV4A 3OODA 2Y88A 5IDIA 2B31A 3RFAA 5B80A 4OV9A 1VJIA 1OT1A 3W1AA 3DFHA 4G8TA 1T8QA 1XYLA 1K70A 5FF3A 3P8JA 3W1UA 3MMWA 2YXOA 3L2MA 4PCTA 1VBUA 2FJUB 2PP0A 2J7BA 3NO1A 1EKOA 1LT7A 2PDCA 6REQB 2BOEX 3FSTA 1E3ZA 1U5HA 1WP6A 2G3IA 2ZTKA 2G96A 3PUGA 3THAA 2CITA 3RLUA 2QJIA 4FHAA 4O0ZA 3CASA 2CZ5A 1MEHA 3MTWA 4I7UA 2J47A 2A21A 1J0KA 1YYAA 4YNGA 5D9OA 3W7DA 4IIBA 3VAVA 2QUMA 3DBNA 2YA0A 1KFCA 2W92A 2I5GA 3UF9A 4DJDA 4GGBA 3PNUA 5DRCA 1ALDA 1BEUA 1RBLA 1YPXA 1XYFA 2F6UA 4CNSA 2X7VA 3JW7A 2FVMA 3S2NA 4XV0A 2E8YA 1VFUA 5C6MA 3VUPA 3FJ6A 2W3ZA 2VEIA 1XLEA 3LHUA 3UGVA 3TTQA 1ZUAX 2QIWA 4QQUA 5AKQA 4N2YA 4PTXA 2HEJA 1Y0EA 3DFTA 3TE9A 4B5SA 4Q3MA 3N13A 1OIMA 4JDYA 3M0VA 3BGGA 2XN1A 3IANA 1NWSA 4NZCA 3VE9A 4WR3A 4UQDA 1NEYA 3IIVA 3CU2A 4J9JA 1KGXA 4NI3A 2ZXDA 4A2SA 3BMWA 4JXCA 1LL7A 1EQCA 4AF0A 3EMQA 4A4AA 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