4H6RA

Structure of reduced deinococcus radiodurans proline dehydrogenase
Total Genus 116
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
116
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
KMWNLAERFVAGESIESAIQAVQALERDGIAGNLDLLGEFIDSPAKCTEFADDVIKLIEAAHAAGIKPYVSIKLSSVGQGKDENGEDLGLTNARRIIAKAKEYGGFICLDMEDHTRVDVTLEQFRTLVGEFGAEHVGTVLQSYLYRSLGDRASLDDLRPNIRMVKGAYLEPATVAYPDKADVDQNYRRLVFQHLKAGNYTNVATHDERIIDDVKRFVLAHGIGKDAFEFQMLYGIRRDLQKQLAAEGYRVRVYLPYGRDWYAYFSRRIAETP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Deinococcus radiodurans
publication title Crystal structures and kinetics of monofunctional proline dehydrogenase provide insight into substrate recognition and conformational changes associated with flavin reduction and product release.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Proline dehydrogenase
total genus 116
structure length 272
sequence length 272
chains with identical sequence C
ec nomenclature ec 1.5.5.2: Proline dehydrogenase.
pdb deposition date 2012-09-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01619 Pro_dh Proline dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.530 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel TIM Barrel 4h6rA00
4H6QA 2EKGA 2G37A 4H6RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2NUYA 2D73A 4JL2A 3IIXA 4E2OA 2WOQA 2NSXA 3MKCA 2XPKA 1JNEA 3S9YA 3VNDA 1UZ4A 3EWCA 1X8CA 2OKOA 4PL1A 2RH9A 3G1FA 3QJAA 5LIYX 1GOMA 3V16A 1G7VA 3BGAA 3ZJKA 3A5VA 3SR7A 5CPTA 4LUYA 3T78A 4GZEA 2AQVA 4JOMA 3NZRA 4EAMA 3LZ5A 5DLCA 4XBJA 2HSAA 3T2PA 3C4UA 4HK6A 3UVIA 2CNCA 2Y70A 1GHRA 3AYSA 4E8DA 1DJYA 3BLPX 1P1XA 3QOKA 3TYCA 1B54A 1ADDA 1GW1A 1ZJIA 1W1B1 1V3IA 3GR7A 1HIZA 1XF0A 1XRFA 3B8TA 1QO5A 1I1WA 2GUUA 5HPCA 1XGZA 3LEPA 1FH9A 1YXYA 4PMOA 2VEMA 4AHQA 2R1MA 3GTIA 3R13A 4UMAA 2EXOA 3ZT5A 3RUBL 1W3JA 3PZGA 1NF0A 1ONWA 3M1ZA 4DJFD 1KM4A 1VEPA 3NYDA 2W9MA 2YBUA 5ABFB 5C70A 1FH8A 1JCXA 1QK0A 1UR8A 1S2CA 1R3VA 4XKMA 1XLAA 3NJ3A 2Z1XA 2PZ0A 2OB3A 1F3TA 1Q45A 4ORIA 3WBXA 3WF3A 3T40A 4A3UA 5DCDA 1ZQ5A 4X2PA 4PRWA 1XIGA 4C91A 1J0JA 1ITCA 4BWLC 3F5KA 4W8BA 4GJIA 3LDVA 4XD5A 1IEQA 4A35A 4PUEA 1P7TA 1GEQA 2P3EA 1V6VA 3IRDA 5FAGA 5T26A 4F40A 3N11A 6PTDA 3CHEA 2ZUVA 2F38A 4JTDA 4YCOA 1D7KA 5AHLA 2FPYA 3QV6A 1VENA 4JTSA 1FCUA 5A6TC 2FZDA 3UY8A 5E9XA 3VOIA 5AKQA 1EUNA 1B90A 5EU9A 3ZO9A 2XH2A 5TF0A 5CAHA 4H6EA 3U8GA 1H1NA 1Q6LA 4ZB0A 3T2OA 5RUBA 1NWUA 2DZPA 3D6NA 4C1KA 1GHSA 3U4AA 4XUYA 4PMNA 1GZ1A 2C0HA 3MKKA 2VGBA 5CZTA 1LLOA 1TR1A 2EJ1A 3KOZA 3M43A 1EC9A 1JUBA 1A3HA 4H3DA 2P0OA 4HU4A 1HP4A 2ZDSA 2NXIA 1G5AA 4XZHA 1EYEA 5CGMA 3DYOA 3EZ4A 3FSUA 5H6HA 3ERPA 3UZZA 2WBGA 2QPUA 4N7QA 4O52A 1OFRA 4O19A 3MO4A 1ZY9A 4TIMA 1KGXA 3BAYA 5FEPA 1QI3A 5D2WA 2R91A 4GYJA 3LCXA 1XP3A 2Z24A 1HT6A 1RK6A 4JNZA 3LMZA 1NOWA 4QG6A 4TX8A 3P81A 4GNKB 3CPRA 3HF3A 3QXBA 4HPHA 2CXEA 4MWAE 3QM3A 4MNKA 1RLDA 5KZDA 3L4ZA 1XCFA 3LHTA 1OBAA 5D8WA 1ITUA 3KL5A 1OT1A 2FTYA 4S3FA 3OZMA 2VFIA 4FNTA 4KWUA 3KUMA 2XIIA 4PTVA 5HATA 4R9OA 3FEQA 1DTUA 4BCEA 2DVXA 5EFDA 3HQNA 1JCMP 3A12A 2DQXA 5BXRA 3W1NA 1V6TA 2HTMA 3R11A 3A13A 2IKGA 1F6YA 4NI3A 1KW1A 4JYEA 3CQJA 2CKSA 4C6KA 1GQIA 1W0MA 4F0RA 1BTMA 3WQ8A 5C6MA 1EDQA 1Q6GA 3MWAA 2A3LA 3MDWA 1Z32X 1P6CA 2CWXA 1JZ2A 4N9DA 4Z2JA 1QTWA 4AB4A 4DF1A 1EZWA 4HYWA 1ZJHA 5FSDC 3NL6A 3R0KA 2XVLA 2FJKA 4YMZA 3PTDA 1WYIA 1QNRA 3WLTA 2WNQA 4H6KA 4UTMA 4DJFC 2HK0A 2CC0A 1AD1A 3AXHA 2J74A 4J3VA 1PTGA 1Z89A 4EIVA 1FKXA 3W74A 1F4AA 1TTPA 3WD3A 4ZVJA 2FJUB 1AQ0A 1RVKA 4Y8EA 3T9PA 1BEUA 2BNJA 1SZEA 4K8EA 3WLIA 1B57A 3LPOA 2P53A 1BPLB 2QEZA 3W7MA 4BI6A 1FFQA 1Q5MA 1F76A 2VDIA 3WK0A 1FWAC 3HURA 2CZDA 1P48A 3PC0A 2R9RA 4LUSB 3QW4B 1ZAJA 2IPWA 2W79A 3BARA 5DMYA 2L5HA 4F9DA 1HF6A 3L65A 3G2GA 2C1HA 2HZGA 3GU1A 3LBOA 3DECA 1JD9A 2QHAA 3BG3A 1EF3A 2IUZA 3WO8A 1C7TA 3OZOA 4O13A 2QS8A 2DZVA 4O14A 3LM3A 1TV7A 1OJXA 4KBXA 1MFUA 3IPWA 3IVTA 3K1DA 4MJZA 3W7QA 3SRKA 2NVCA 2WJFA 3TVAA 1DQWA 1F74A 1PKLA 4ZO9A 4DAIA 3EMQA 3SCSA 2WVUA 3M5XA 1O1HA 3DFNA 3GZAA 4JTTA 1AK5A 3WQGA 3VXGA 4D6HA 5A69A 5J04A 1UYQA 1XCWA 1XBVA 4G7FA 1FWRA 3V4BA 4D1IA 4B92A 3MP3A 3CUGA 3FA3A 5CPQA 3COTA 3IJ8A 5ABHA 2HDJA 3NTYA 3BO9A 3I10A 3I6EA 1MQRA 3MUXA 2J24A 2J4GA 4PUNA 4LH8A 1OM0A 3QHMA 5D2YA 3LCHA 1R3RA 3WLSA 3AIWA 2GL5A 2O92A 2P76A 4J9JA 4AD0A 1CX9A 4GI4A 2CLHA 4C1NA 1GZGA 2P3ZA 1VCFA 2EKCA 3JS3A 4L4MA 3NYZA 2IQDA 1FWSA 1M5WA 2X2YA 3QSRA 1U2YA 1UKTA 3UXLA 1KRBC 3AZTA 3R58A 1GVSA 4DEFA 3GDLA 4JKMA 3MVTA 1TV8A 2PF8A 4RZBA 2FPVA 4GI9A 3CJPA 4ACZB 1YPIA 4LSBA 3LQLA 5I3JA 1UPPA 3OZYA 3SUTA 1K8YA 3Q94A 4BS0A 4PB3A 4QQ3A 1FUYA 4FNSA 2J62A 4U3CA 4O17A 1UKOA 1C8YA 3WQVA 2HVNA 1SO4A 4TUFA 4MKSA 1JZ7A 2OWXA 3CYJA 3TSDA 1TG7A 1LBMA 2O7QA 4QGCA 3TONA 2PWVA 4MAVA 3IGXA 4W5ZA 5LNUA 4A3RA 3AHZA 2J88A 2V63A 4FX8A 4Q4PA 1KCLA 3RCNA 4X60A 3GTNA 4Y9PA 3KW3A 3E0VA 1RY0A 1A5OC 1A50A 3IUIA 1Q7MA 4O1FA 1EFZA 2IMRA 4Y8FA 1E0XA 3H7UA 5A6AA 2X1IA 4ZQOA 1F3XA 4DUXA 4AF0A 2A3CA 4WDWA 4U5IA 3GNOA 3B9EA 2VR4A 1EGVA 5F1VA 1LQAA 3KHDA 4HNLA 3WKZA 1QNVA 1W5MA 3FGCB 3W70A 1KO0A 2VCCA 1KTCA 4CCEA 4RNJA 4Z2KA 5KITA 2VQUA 2CU0A 4W8LA 1GOKA 2PDYA 2YL5A 1PIFA 2NZLA 2Q8ZA 2H8ZA 4PC8A 1SW0A 3TIMA 1R87A 4IGSA 1G01A 1X7IA 4D6IA 3LA4A 4AISA 1FBAA 4I9AA 3UVAA 3B9AA 1KBKA 1OVDA 1QU4A 1S1PA 2BVTA 2HEJA 1C91A 4ZTXA 4HZMA 4PB4A 3VD5A 4UTHA 2X09A 4E3TA 3XINA 2V5LA 1VLIA 2I9EA 2XM2A 1HGYA 2PWGA 3JZEA 3W3OA 4JN8A 1T0OA 1PCWA 1V3MA 5I3HA 2J6VA 3BV4A 5DY2A 2FHFA 1HVQA 4KFNA 4GI6A 5D8ZA 2AL1A 3T0DA 1I4NA 3OBAA 1W9PA 1E9LA 3WQEA 1CWYA 3NQGA 4HN4A 1JAKA 1E73M 1UR9A 1F61A 2DY3A 1ICPA 1W3LA 3DGBA 4NZCA 3NNTA 4QSFA 1VYRA 5DY3A 5HINA 4XZ9A 3GUGA 1YXDA 1MDRA 2DT1A 1JI2A 1UWIA 2ZX8A 4IG2A 1Q6DA 2PZNA 2YYTA 1W8GA 1BVNP 2PDGA 1UMYA 4JAWA 2DU2A 3TXVA 3KZSA 4IMEA 3LXAA 3MZNA 3WQ6A 1NDVA 1R7OA 3W88A 3BSMA 1TJ0A 3SUSA 3H4WA 3K4WA 3TAOA 4FP1A 1UZ1A 4D6JA 5HBFA 4LEQA 2XHYA 3HZ3A 2EHHA 1TPEA 1KM0A 1OK6A 4S39A 1EC8A 3HFTA 2V81A 3UEQA 4EE9A 3C56A 3IGHX 1UZHA 4H04A 3QLLA 3S2JA 2ISVA 4LUIA 1JULA 1TVPA 1W9XA 1M3UA 2CLKA 1L9WA 5EY5A 4QJ3B 4HNCA 4JNYA 3NL2A 2JQXA 3SDOA 1HVXA 4BA0A 2DZSA 4B2DD 4AZIA 4DELA 3REQA 1QK2A 3QY7A 2AGKA 4KRTA 3WF2A 2D0GA 1SZNA 4HTBA 4EPKA 1QPNA 1T8XA 3GXTA 2EJAA 1GYLA 5ABTA 2WYSA 1HKWA 5EBAA 1AQHA 4MPQA 2HWGA 3VKDA 4B3LA 4ZQMA 4CGTA 3PM6A 3C0JA 3W1QA 2PGWA 3OVGA 3EA2A 1AJ0A 3H2EA 1F8IA 3QMSA 3VZXA 5I3FA 5FL1A 4RXFA 3IJLA 4CCCA 2W6RA 1KM1A 1RBOB 1V51A 3PANA 3W1UA 1XIJA 1GJWA 3QFWA 3W0KA 1HKMA 4F0HA 4WF7A 3QKZA 4E8GA 3KVKA 3ZJ7A 3GG1A 1TV5A 3L7RA 2FGLA 2R82A 1DTNA 3BDKA 4IPNB 1BKHA 4DUWA 3S5ZA 2YW4A 2FZBA 3WJWA 3R94A 3EA3A 3O3RA 3TAKA 7XIMA 2EG8A 2XG9A 4LX4A 1H2JA 3AFBA 4AMAA 3W6LA 5D2VA 1AFSA 4NAFA 2Y7DA 5I3IA 1Y0EA 4GIYA 5REQB 3AI0A 1LTDA 3F5LA 5A6BD 4F2BA 3DGRA 1Q6EA 4UFMA 3UWYA 3MSDA 4JTHA 4YVXA 1BXNA 2BGNE 4BKNA 4DWSB 4RW5A 3T1GA 4LAUA 2ISWA 3ARSA 4HJWA 4P5UA 1I2RA 1XFCA 3AOFA 4ORMA 2GYIA 1R9XA 1K70A 3JRKA 2V3DA 3LY0A 2PODA 1BSIA 3W53A 4IOTA 1OFEA 2IPJA 1OCQA 5JXQA 2AOSA 4AC7C 1OFBA 2WXDM 4JQ1A 3IARA 1OFQA 2RDXA 1TJ1A 4F4RA 1P0KA 4AY8A 3GVGA 4DUOA 5IXEA 1B30A 1QW7A 1TELA 4XVEA 1GVIA 1XUZA 3H2FA 1SFSA 4NJGA 1CB7B 3F4DA 4MB5A 2X40A 1GORA 3OJGA 4AWUA 5LSMA 4WGXA 2D2HA 3M0JA 2J75A 4AZ6A 3MO7A 4OECA 3HG2A 1UR3M 3USZA 3WFLA 1UJQA 3PBGA 4LOCA 2IKIA 4UTUA 2VDHA 3SFWA 5F4XA 1XSIA 2ESCA 1JZ4A 1MUMA 4KWWA 1LZOA 3HB9A 1WE5A 3AIRA 4A29A 1O94A 2FVMA 4MJMA 4I7UA 2ZDRA 5LIUX 1VPXA 5BXTA 2QUTA 1JNDA 2RJHA 3QTGA 3W87A 2G0WA 2PSNA 3N25A 3ZIZA 4S23A 1SSDA 3RO8A 4AZCB 1PL9A 3P62A 4UUIA 2V5DA 3PTQA 3WNMA 3FS2A 4J28A 3RNDA 1E1CA 4NY2A 2LLEA 5C8BB 2GLKA 3LTSA 4HA1A 7CGTA 4JFVA 4M56A 2XVNA 2E8YA 4MF4A 1XLHA 4AZBA 1MYRA 5EFFA 2J7EA 2HROA 1W9UA 2D69A 5HANA 3CUZA 5KSWA 2XJ7A 3CLWA 2VCBA 3WUEA 2HISA 4M80A 5KMYA 4GYPA 3WDPP 4GZ7A 2DW7A 4LYQA 4MVAA 3XIMA 3ABQA 3LCLA 3THQA 2WAGA 1UH2A 2WJZA 3A9IA 4NILA 3UG5A 4YXGA 1XLMA 5M1TA 5I79A 2AL2B 4JEQA 1QPRA 3EA1A 1ZP4A 2OQYA 4GC3A 1B3VA 4KCUA 5DCBA 2CBJA 4WDUA 3ARVA 1ME7A 3TWAA 5AC5A 1UWUA 2WANA 4GO8A 4FA3A 2F84A 1XYLA 4PTDA 4IXHA 3PUGA 1UASA 2JFEX 1GOXA 3K46A 5FJUA 1UR4A 4KWOA 3CEPA 3D5HA 3LV5A 2DDXA 4C6MA 5I09A 1W17A 4HKPA 3W72A 1KB3A 5HR7A 4Z42C 1RQHA 3POCA 2WMIA 1EZ2A 1TA3B 4W84A 1LG2A 3W1LA 3FV9A 2QCFA 1GK8A 3TW9A 1CPUA 1UQYA 4FOJA 1S38A 3KBSA 1TV4A 2FVLA 3FN9A 3CHFA 5A6KA 4O1AA 5I23A 3EOSA 5CLTA 3V36A 4FALA 3EKGA 1S2VA 2TAAA 2QAFA 4PTWA 4AW7A 2GDVA 1PKNA 1KQZA 4PUUA 1NEYA 2WZHA 3MHUA 4Q4RA 4O54A 3P84A 1SW7A 4H8NA 4O10A 3KTCA 3OP2A 4H1ZA 2VURA 2PTYA 5AHNA 3SM0A 3VNZA 2NQHA 4XSMA 2QDEA 1SMAA 4Q22A 1SJDA 2ZWZA 4PFHA 3MQTA 4A2SA 4N2YA 1LWJA 1V3KA 5K9XA 5FEWA 4FK9A 4QM1A 4O1BA 1LM1A 1XLDA 1DJXA 4JDYA 2PWUA 2WLYA 3GG0A 4UBPC 4AIOA 3ITCA 3IIOA 3BZGA 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