4HHPA

Crystal structure of triosephosphate isomerase from trypanosoma cruzi, mutant e105d
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
249
structure length
249
Chain Sequence
SKPQPIAAANWKCNGSESLLVPLIETLNAATFDHDVQCVVAPTFLHIPMTKARLTNPKFQIAAQNAITRSGAFTGEVSLQILKDYGISWVVLGHSERRLYYGDTNEIVAEKVAQACAAGFHVIVCVGETNEEREAGRTAAVVLTQLAAVAQKLSKEAWSRVVIAYEPVWAIGTGKVATPQQAQEVHELLRRWVRSKLGTDIAAQLRILYGGSVTAKNARTLYQMRDINGFLVGGASLKPEFVEIIEATK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Different contribution of conserved amino acids to the global properties of triosephosphate isomerases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase, glycosomal
total genus 92
structure length 249
sequence length 249
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2012-10-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4hhpA00
1ADOA 3VE7A 5LNUA 1IXQA 5G1YA 1J2WA 1LORA 3VE9A 4S2CA 3NO5A 1OYAA 5EA9A 3M16A 2C18A 1B3OA 1YPIA 3CQ0A 3PWAA 1P5BA 3OHIA 1TJRA 4UMAA 3W7MA 1KFLA 5HMSA 2YCEA 1W3IA 3M6YA 1QNVA 3TAKA 1LTDA 2ZZ3A 1JCJA 5AOUA 1BWLA 3B05A 3E02A 1U83A 1FWWA 3QSRA 4O50A 4FXRA 1YLVA 5SWUA 4RZ4A 4DPQA 4LOCA 3STFA 2H90A 4UFMA 5F1UA 5U7SA 3HPSA 3GNNA 2H8XA 5HWJA 2W79A 1PIIA 4K39A 4NJJA 5FESA 2G97A 3W3OA 3LRMA 4K7YA 4ZQNA 2G96A 1T8XA 1KW1A 3FEMA 3W1PA 1VS1A 1SPQA 4MY1A 5G4WA 1OFQA 2QCCA 3ABSA 1G4PA 1OFBA 1GYLA 4E0CA 1KM6A 3LTPA 3L0GA 5E1QA 1JUBA 3PUOA 3KHJA 4JTFA 3W7QA 2QCGA 4BI7A 2H3DA 4MY9A 1O95A 2WSQA 4NX0A 1DBTA 3EKZA 4H6KA 3MI6A 1FBAA 1EIXA 4OHQA 1P0NA 3W7JA 2Y70A 2BWGA 5C2XA 2OT1A 3HPZA 4PL2A 4YCOA 5AHFA 1J4EA 3P61A 3BPWA 3W7LA 3M0ZA 3RF9A 2A4AA 2NWRA 2TRSA 1DQXA 1FDYA 1SO5A 3GX9A 4ADSA 4EVZA 5K9CA 2JBMA 1VQTA 3H54A 5I3FA 2P10A 5FEZA 3M41A 4JTKA 1FY6A 1G7VA 1W5OA 4OBTA 2NLIA 3MWAA 5DCEA 3W7RA 3HG4A 4UFIA 3PUEA 4TX9A 2ZA2A 3CB8A 2NWSA 2WQPA 1MZHA 1S5TA 1F5ZA 2E6YA 2GUUA 1WA3A 3C2EA 2E6DA 3PBVA 1JVNA 1CI1A 4GFSA 3TFXA 4FEZA 1JQXA 3EX2A 3G3MA 3LCFA 5CKSA 2J88A 2QAFA 3T55A 2VFIA 3JR2A 1OK4A 3L0NA 3O6CA 2NUWA 4FX6M 4GWEA 3B06A 3LHVA 4GUHA 4PC8A 3KRZA 2ZZ6A 3ABQA 2V5BA 3RK8A 3GZ3A 1L6WA 3G0UA 2BLEA 3TROA 2CLFA 2RH9A 3TK7A 3UY7A 4A2SA 1DJQA 5FF7A 2CLEA 8TIMA 1THFD 1WXJA 2A1YA 2J9XA 4GXMA 2ATSA 1JCYA 4O4VA 3UWVA 2C14A 3LHZA 3UWQA 4PEKA 3DENA 1A53A 1GVFA 1K03A 2TMDA 2YFNA 4ZQOA 1EUNA 4DO6A 1X6UA 1ZY9A 3W1XA 4OWGA 2JK2A 1NF7A 4DBDA 1VCFA 3NQMA 5E0KA 1WYIA 4NNBA 3N3MA 4AXKA 1RQHA 4O57A 1RR2A 1K7EA 3WK2A 1LOQA 2ISWA 2DZVA 1FWRA 3PB2A 2GVLA 3BK0A 3KX6A 1Q3NA 4ONVA 5I3KA 2E5BA 3Q2DA 3ZS4A 1I2RA 3FKKA 4RV8A 4EF8A 1ALDA 5LHFA 5AYYA 1W37A 1F74A 4YL2A 3LLDA 1I8JA 3R13A 2WOQA 3UQNA 1ME7A 2Y62A 3NQAA 4JTTA 3FJLA 5HULA 5HQEA 4DBEA 1OJXA 4CNOA 1TYGA 1FCBA 5CPMA 1OFRA 5KZEA 1IIGA 3LCHA 4TO8A 2NXIA 1SZGA 1WX0A 4X22A 3NL5A 1Z48A 1NFBA 1DV7A 4AAJA 1P0KA 4O13A 2X2GA 3CT7A 4N6FA 1JQVA 3F03K 1OYCA 4LVBA 3UPWA 1T0OA 2CLLA 2EAWA 3A9IA 5CGQA 3GLCA 3EEGA 3P5YA 1TPDA 3B03A 1OF8A 1W8SA 3L68A 1VPXA 2YDAA 1KFEA 3TQVA 2E6AA 1R2SA 1GG1A 4K37A 3WJSA 3THQA 5F2IA 2E5CA 5HNRA 3B04A 3MHFA 3P74A 1QO2A 2ZCGA 2WV8A 3NQEA 4RCXA 4AWSA 3NQ6A 4IPIA 1NF0A 3NPXA 3W70A 4EIVA 2PRMA 4R34A 1VCVA 1N7KA 1TV7A 3O15A 3GDRA 2DU2A 1NEYA 3S1VA 1PHQA 4E38A 1F73A 3MYOA 4BK9A 1G4EA 3VNDA 1I45A 5G5IA 3H53A 1ICPA 5D2YA 2VEPA 4MOZA 1A5BA 4HIBA 3HG3A 1NAL1 3FKRA 1YTKA 1XFBA 3ZWTA 4M7TA 2HS8A 5TQLA 1V5XA 2IQTA 2Y85A 3NA8A 1JCNA 2E1DA 3STGA 3M47A 4K8HA 1ME9A 2W0UA 1QPNA 3TC6A 1VHNA 2YPIA 4JGDA 3RLVA 4BWLC 3M9YA 4JY9A 4O1CA 2P1FA 3UWUA 4NT0A 1W5QA 1YDOA 2Y7FA 1H50A 2A0NA 4PFMA 3LRLA 3NM1A 3C3NA 1OFOA 2FLIA 3CU2A 4K38A 5D2WA 3S42A 3S9YA 3LBMA 5BRBA 3TMQA 3WK1A 1VCGA 2Q3RA 3P62A 4RXFA 4ZMGA 4LS2A 5KTLA 3L5AA 3S6DA 3W7KA 4J9JA 1RVGA 3A5FA 3W1RA 1D3GA 3LOTA 4JX4A 4XKYA 2VEIA 5D38A 3HGSA 3HO8A 3NDOA 5LHEA 4CCCA 3EX6A 6ALDA 3G1VA 4A29A 1FWSA 4UTMA 2C15A 1Z44A 1W3TA 1GEQA 2H3BA 3N2MA 3LX9A 1H7RA 1Z41A 1TCDA 3DXIA 3NPVA 1SSDA 3DI0A 4O0ZA 1O4UA 1PE1A 2ZRUA 2ZYFA 5H2ZA 4JEQA 4A2RA 3LLFA 1GJPA 1M7OA 6TIMA 2FJKA 3O07A 1BEUA 1B57A 4AMAA 1DL3A 1XCFA 3JS3A 3LI0A 1DHPA 4FHAA 4O17A 3QSTA 4RZ6A 3CIXA 2ISVA 1QPQA 4HN4A 3GXPA 3RU6A 5K3VA 5CZ0A 3HGRA 1DQWA 3WJYA 3TXZA 5DXXA 1KM2A 4GBUA 1RZMA 3NQCA 5D30A 3HGOA 2YXGA 3I6RA 4FNPA 4E2BA 5D32A 1ME8A 1W0MA 1EEPA 2V2CA 3W7EA 2YW3A 1TMHA 1ZALA 3SZ8A 3UXDA 3O05A 4X2RA 5F2MA 3FYPA 3ATZA 3UWYA 4LVDA 3LV5A 1Z42A 3A22A 3G22A 2HSAA 3C8FA 1F76A 4PH6A 3TE9A 3VCRA 1XI3A 2QCHA 3QJAA 4IMCA 2B7NA 3TSDA 1AG1O 4O52A 3PBYA 3NGJA 4K7VA 4DF1A 1HUVA 3TUUA 2PURA 1UJPA 3P67A 5EKYA 3P7YA 4AEOA 1BKSA 2Z6JA 2CLOA 3GR7A 2TSYA 2WSYA 4OV9A 4HSNA 3G1XA 3I68A 3P81A 1HL2A 4QQ3A 5HR7A 2VOMA 3A5VA 4WJEA 1K7FA 1OFDA 3DU0A 1YXDA 4FX8A 4HKPA 2CLKA 4OQVA 1JR1A 1LLZA 4AB4A 2E09A 1YDVA 3IRDA 4N9EA 4OV4A 3FIGA 2F7FA 1E51A 1QDSA 4NJKA 1XBVA 4YLWA 4M5PA 3BG5A 3DFPA 2BX7A 4GUJA 4LRTA 2DJLA 2NZLA 5BNKA 4GUFA 1FUYA 3GAKA 1DKWA 3TQ0A 2ABAA 2C16A 4O16A 3SW6A 5L9FA 5DN1A 2JKPA 2RKXA 5EPDA 2VENA 4WOQA 4GRSA 5KSWA 4S2BA 3L0KA 3N9RA 3SECA 1EA0A 2C0AA 3GVGA 1YTEA 1B4EA 3R8RA 5D09A 2QF7A 4C1KA 1PCKA 3DHDA 2QCNA 2RFGA 3PUDA 3R5EA 4OE7A 4PL1A 3LHYA 4AHOA 2CW6A 2B7OA 3N34A 5AYXA 1LBLA 3RNDA 3LCGA 3M5YA 4UFJA 1VLWA 4KFPA 3C2OA 4LVGA 5DCDA 5AYZA 4GC4A 3WFAA 2Z2UA 3M5XA 3L65A 3HF3A 4LC6A 3KOFA 4BFAA 3Q94A 2CZFA 1XUUA 1VRDA 3LM7A 3TC7A 4IPJA 1D3HA 1F6KA 1ZENA 1I2NA 1DVJA 5F4XA 4N6EA 3W7NA 1LOLA 2A7RA 5TIMA 5K4ZA 5G4EA 2X1RA 1ZJIA 2ZZ2A 1FCUA 3TSBA 4FNSA 4ICNA 1HFBA 4UNKA 3ABRA 3GYEA 1EX5A 2E6FA 1NSJA 3W2KA 2DZSA 4UR7A 3LCXA 3TDFA 4NXSA 4P2VA 2Y7DA 3NQVA 3W1MA 4ALDA 1KV5A 4MLRA 2B4GA 2NX3A 3UWZA 3NAVA 3P82A 4O28A 3TX9A 5FF0A 5AHEA 5F4WA 5LSMA 3BVJA 3I7SA 5LNVA 4R33A 4UTJA 3U6WA 4GUIA 3B8DA 1JULA 3AJXA 3M5ZA 4IMDA 4C1LA 3MBFA 3TIMA 2XN0A 1QMLA 3GDKA 3NYZA 3GB6A 2C13A 1G4SA 2ZTJA 1KLYA 3BV4A 1S3HA 4UUIA 4RR4A 3N19B 4DEFA 3NQGA 2PC4A 1FWTA 1GOXA 1ZNNA 4M7SA 3ELFA 2QCEA 2CLIA 3CM4A 1L6SA 2WNZA 3GKFA 3PULA 3QPYA 4UTWC 3IIVA 1KM4A 3LRKA 4JTLA 5CZTA 3PS7A 5CSRA 4JICA 4WQ6A 2Z1BA 4RZ5A 4NNAA 4FNUA 2GPTA 2R91A 3W76A 1VR6A 2FPTA 1LM1A 5C6MA 2V9DA 1H51A 3PR2A 3BGGA 3W07A 5D2VA 1TPVA 2B0MA 2QR6A 4QSHA 4JYFA 5LNSA 3G0SA 5HUPA 4AHPA 3BW4A 3DAQA 3LERA 5GVJA 3BARA 4WXYA 3VKJA 2V82A 4X9SA 4DF2A 1KFCA 3PSVA 5A5WA 4ZL1A 3P84A 2Y63A 3DKJA 3IVTA 2G95A 1H62A 2O7SA 4AWTA 3K30A 4LVFA 1TTQA 2ZRZA 3CWOX 3M43A 3MP3A 4JN6A 3MW7A 4MPQA 4HNVA 3MUXA 4XBKA 1H7XA 3T44A 3HQ1A 3NQ7A 5TBOA 1QCWA 5KMYA 3MHUA 2Z6IA 4LVAA 4UTKA 1YPFA 5DBTA 1LBFA 5FF2A 3FS2A 3KVMA 1N8FA 1RPXA 2RDWA 5U4NA 3WJZA 1MXSA 3G3DA 4O10A 1OFAA 3FOKA 5F1VA 3IGSA 4LNYA 1WBJA 3L21A 4L4LA 3WJXA 3N9SA 3V75A 3ABOA 1HG3A 2C19A 2X30A 1Y0EA 1ICSA 2AQWA 3NL2A 2Z0IA 1TPUA 2TPSA 3IVUA 4KWVA 5D37A 3MBDA 2I1OA 1G69A 1W5NA 4XKYB 3A23A 2QDHA 1W5MA 3S5NA 4HT3A 4A21A 4MFDA 1GPWA 4H4IA 1AW1A 1TPWA 2TYSA 3DFSA 2A2IA 4WY0F 3W87A 3EWZA 1VYPX 3TMLA 3DHFA 3W7HA 3R2GA 1YXYA 3CIWA 4WY0B 1LRTA 4CCDA 3LV6A 1JUEA 3THAA 4JTUA 2NUXA 4MFEA 1CW2A 1RQEA 3W2UA 3TFCA 1KFKA 4UTIA 1LROA 2Y61A 5I3JA 2OJPA 2V8ZA 5D2XA 2J24A 1KV8A 4S1FA 3FJ6A 4NJIA 1TSIA 4UC5A 4L4MA 1GG0A 3TW7A 5C5YA 4Q4KA 1KBJA 1YTDA 2DJXA 1TPH1 4N9CA 1GZGA 4Z1DA 4TIMA 4Z1BA 3LCLA 3NQ8A 3DKLA 1QFEA 4RKAA 1QWGA 3QMRA 3A21A 2YW4A 4MLJA 2Y88A 3PVFA 3PG9A 4N4QA 5AHLA 1DJNA 1ZAJA 4UMCA 4MIMA 3N14A 2X1TA 4HPJA 2GOUA 2GQAA 3W2NA 3QMSA 4EF9A 5BW6A 4O54A 1O5XA 2YGYA 5CG7A 1Q6LA 4LY8A 3R89A 3PG8A 1JCLA 1O60A 3BLIA 4UFKA 3LXAA 4AVFA 3L9CA 4A3UA 1GT8A 1LRNA 4XWUA 3BG3A 4FXSA 3QPZA 1SW7A 5FF3A 4TMBA 1KTBA 1XM3A 1RD5A 4O4WA 1R2RA 4UTTC 3O6YX 2Y6ZA 4NVTA 4ZQCA 3G1FA 3LHUA 4M6QA 3EX4A 3LCIA 2Y7EA 4ZZ9A 1ICQA 3B0UX 2WKJA 1XDMA 3G1SA 2Q8ZA 2ZRVA 4Y6GA 1QOPA 5AC8A 1GWJA 2WNNA 2YFOA 4CQAA 1ZFJA 3N73A 2QUTA 1T99A 4N9DA 1TV8A 1SO4A 2X16A 4N9BA 1GTEA 1SSGA 3IIOA 3U2OA 1K7XA 2YYTA 2Q3OA 1KFJA 3CPRA 1HTIA 3DBPA 4IUOA 4BWLA 3IIXA 3T78A 3V1PA 3W74A 2H6RA 3W85A 1R46A 5H91A 3W2JA 4ZQPA 5F2GA 1SFJA 4POCA 4P61A 2GQ8A 4PTNA 3W84A 3IV3A 1IXOA 3LB0A 2CWNA 3QC3A 4MZYA 2ZFAA 1SZEA 1HO1A 3EWUA 3W6YA 4ZVJA 2QUUA 2RHGA 4GE8A 1VC4A 3EX3A 4EWND 4Z08A 2VEMA 1EPXA 2ISSA 2NV1A 3EXTA 3G1HA 3OVRA 1I4NA 3C0JA 3O1NA 4QJ1A 1Q45A 3KVKA 3G1YA 2NXGA 3ATYA 2C6QA 2X1SA 5ABTA 4WD0A 4WY0A 2EKCA 4CQ9A 2NX1A 4LS0A 3KAOA 2BSLA 1A50A 2VFFA 2B7PA 5IBXA 1QPOA 3W1TA 1UASA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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