4HIBA

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with cmp-n4-oh
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel cytidine-based orotidine-5'-monophosphate decarboxylase inhibitors with an unusual twist.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2012-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4hibA00
3TIMA 3S42A 1QPNA 4IJBA 2C13A 2EHHA 3I7RA 3TW7A 1AK5A 1IXQA 1OX4B 2ZTKA 1KW1A 4JTSA 3M44A 1GQNA 3OA3A 5EKYA 1K8XA 3L65A 1IGSA 3M6YA 4N4PA 3PVFA 3MI3A 3T55A 2R8WA 1WXJA 1IIGA 1X7FA 2E09A 3ATZA 3C3NA 2JK2A 3QYQA 1T96A 3P74A 3NQCA 1RQHA 4X2RA 4CNOA 5K4ZA 2ZZ3A 3INPA 3MMTA 1YTKA 3GDRA 3CWOX 1DBTA 2B0MA 3STGA 4CQ8A 1PCKA 4UC5A 4JYEA 3P82A 3W1TA 3BGGA 5DXXA 3O63A 1A5BA 1ICPA 3M5YA 4UTHA 2GUUA 1ZALA 4K8EA 3NQ7A 3C0JA 4PL1A 3TCEA 1LBMA 3QC3A 3E0IA 5K4XA 2V2DA 3CT7A 3G0XA 3DZ1A 1N8FA 4JYDA 1VLWA 3TH6A 1TPDA 4FXSA 5AHNA 5AC7A 3W74A 3GZ3A 3LHZA 2V2CA 3STFA 3A22A 4WX2A 3NZRA 1H7XA 1P0KA 3GYEA 1NF7A 2WNZA 1L2UA 1XXXA 3CB8A 2R91A 2CW6A 4NVTA 4K36A 1KFJA 2PCQA 3KVMA 1DOSA 1H5YA 4JICA 4ALDA 4ML9A 3QPZA 4DO4A 3GNNA 2R14A 3NPXA 1G4PA 1KA9F 4UNKA 4M6VA 2Y7GA 1KV8A 2I14A 4QSHA 2GQ9A 2B7OA 3QMRA 4N2YA 4AWSA 4CQAA 3SGUA 3L5AA 4BI5A 2A7RA 3IEBA 1DJNA 4TX9A 1SZNA 1XI3A 3L21A 3GR7A 4R53A 4O8RA 2Y63A 1TPUA 4P2VA 4FB7A 3O16A 1VPXA 1JUKA 3WK3A 1X1OA 4DBDA 1OF6A 3BW2A 2ZZ5A 4AVFA 1WX0A 4Q4KA 3L67A 4JTLA 1QPRA 3DH7A 1LBFA 2WQPA 3DBPA 4O54A 2Y61A 1HFBA 3UYCA 3W1QA 1AMKA 2X30A 4UTTC 3LCHA 4UFJA 3G1DA 1W5NA 4UXDA 2FB2A 2VKZG 5LNSA 5AYZA 4K39A 2VFEA 4LOCA 3TMLA 4NZJA 5LSMA 1KM4A 3W7MA 2C14A 4U4MA 3EWXA 2B7PA 1W37A 2CLOA 4WZHA 1OVDA 2YSWA 3TDFA 2QEZA 4AMAA 4UFHA 5FF2A 4NXSA 3W75A 1TPB1 2ZRVA 3UWQA 3W1PA 1W0MA 4UTJA 3QH2A 2NUXA 3G1YA 1LROA 2DZSA 1P4CA 2QCDB 4FHAA 3AO0A 5KMYA 4M5PA 1H7PA 2EPHA 3W87A 3B4UA 4JX4A 3P5YA 3QSRA 1ME7A 3QMTA 1EP2A 4ZVJA 1UBSA 4KFOA 1KFLA 5KSWA 2BX7A 4MZ8A 3G1VA 4LVFA 4N4QA 5DLCA 1VC4A 1VRDA 1LBLA 3LV5A 4ZL1A 3GKFA 3LCGA 1OX5A 3W7RA 2BSLA 3B8DA 1R2TA 1AL8A 4BWLA 3IVUA 4RZ4A 1O94A 2JGQA 2ZRUA 3CWNA 2FJKA 3QQ1A 5D37A 1SZFA 1K8ZA 3F1QA 5AHLA 3LM7A 4H3DA 4HNNA 1TPH1 1O5XA 4K6AA 3W7PA 4PODA 1DVJA 5HWMA 5D30A 1DJQA 1TB3A 4I9AA 3TJXA 2VEPA 3IIPA 5DELA 2ZRXA 1HL2A 1SW3A 1VCVA 4KFPA 4LS0A 4ADSA 1MEWA 4IPIA 1GTHA 1HTIA 2PE4A 2C16A 4O4WA 5J5DA 7TIMA 5TBOA 2HS8A 3R89A 3MJYA 1WV2A 3BLIA 2P10A 3NM3A 4FX6M 1YLVA 4PA8A 1FXQA 2ZZ4A 4JTGA 4CCCA 2JKAA 3BLFA 4GC4A 4RR4A 2V8ZA 4A2SA 1IXNA 2Q3OA 3IGSA 3TC7A 1H62A 4R33A 1XUZA 4X9SA 3M0ZA 2J88A 1XUUA 3HG5A 3W7DA 3NDOA 3S0CA 3NGJA 1P1XA 3HGJA 2X1RA 4MFDA 1S3HA 3UPBA 5SWUA 3FEMA 1ZJIA 1ME9A 1RQBA 3HOJA 2HTMA 1PHWA 1EIXA 3PBWA 1G67A 1SSGA 5A8GA 4XTIA 3NG3A 1W3NA 3U2OA 1GTEA 2TSYA 3LHYA 1D9EA 3PG8A 3NA8A 1D3GA 3GKAA 4NJKA 5CZJA 2OMAA 2CLHA 1JUBA 2F84A 3W2LA 4UTWA 4WY0F 5A5WA 5AYXA 2V81A 1FXPA 1S5VA 3UWVA 1JQXA 3HG4A 3W6YA 3LXCA 4L4LA 2EAWA 1UB3A 5HQEA 1LCOA 2NLIA 3FKRA 2GJLA 1TQJA 5CPNA 1H7NA 2PC4A 4RJEA 1LP6A 3PR2A 1H1ZA 3IV3A 1WBHA 3PB2A 3H54A 5D33A 2FB3A 4IX2A 3M43A 3QSTA 2FDSA 3GAYA 5H2ZA 2QCFA 3W7IA 3ELFA 2QUTA 1OF8A 3HIJA 4LRTA 3DFTA 5F1VA 1W1ZA 3GB6A 4GNJA 3Q94A 2RKXA 1X1ZA 4UTWC 3L5LA 3WJSA 2ZZ7A 5GVJA 4Y90A 4JIQA 4O15A 3TUUA 4YCOA 5DCEA 3CIWA 3MYOA 4MJMA 1ML1A 1U83A 1KBJA 1OYAA 2NX1A 4IOTA 4I7UA 4EOUA 5FEPA 4AWUA 5L6UA 1OFQA 3T44A 1UCWA 2DZTA 3JS3A 2ZRZA 2QCLA 4A22A 1ZY9A 3GDKA 4JGDA 3IVSA 3BVJA 5D09A 3W1LA 4HT3A 3UXAA 1KM1A 4ICNA 3TSMA 2ABAA 1VYSX 3W73A 4RKAA 4NNCA 5FF7A 1V5XA 3QEZA 5CPMA 4UMAA 4FNUA 3V1PA 1KLZA 3PBYA 5LHFA 4CNPA 4O0KA 2A1YA 3FIGA 3W7LA 3O15A 4IMGA 4O18A 1EP3A 4LTSA 4DO6A 3M5VA 3UWYA 2C1HA 1FCBA 3IGUA 3QFEA 4NQ1A 1A53A 1VHCA 3LDVA 1UJPA 3TJLA 2A85A 1XBZA 3GLCA 1TTPA 2CZDA 3EXTA 3W2JA 3LV6A 3MWAA 1SW7A 3TXZA 1QO5A 3DGRA 3MP5A 3PUOA 2LLEA 1KFKA 2WNNA 1Q6QA 3LHWA 1ME8A 4Z1BA 4UFKA 3S1XA 4RZ6A 5CG7A 4D2JA 4CLMA 3EX1A 2ZZ6A 3FKKA 5HUOA 3RNDA 3W7QA 4NJGA 3W86A 2D73A 4EIVA 4UMCA 4O1AA 2J9YA 1A50A 1B4EA 1RV8A 2V5LA 4M19A 5G4WA 4R34A 3E12A 3VE9A 4O11A 1ZAHA 1P0NA 5G1YA 1SO5A 4BI6A 1FDZA 3WK0A 3GXPA 2X1SA 3H55A 3S8HA 3S6DA 4IQLA 4LW7A 3CU2A 3PF3A 2G97A 3NQDA 2CWNA 3PUEA 4GWEA 4WOQA 4UTMA 3KAOA 2E6YA 1QPQA 1MO0A 2QUVA 2XFWA 2V9DA 2VXNA 2NUYA 3WK2A 5DCDA 1BKSA 3GDLA 1QO2A 1SU5A 3UY7A 5LZLA 1NSJA 2I9EA 2H3DA 3TU9A 2Q8ZA 4FX7A 4LT9A 4MFEA 4ZZ9A 2C15A 1W5OA 3MP4A 4FIQA 1OX4A 1QPOA 3OVRA 1K7FA 3SJ3A 3P5ZA 3Q2DA 3FA5A 3JR2A 3TNOA 4O53A 3UY8A 4XTDA 4FEZA 1I2RA 3NQ2A 1SUXA 1KV5A 1M7OA 4MUZA 1BWKA 2QUUA 3KVLA 4K38A 2CLEA 2EKCA 2NX9A 5HWJA 3O6DA 4YLWA 3C52A 3EXRA 1LOQA 5FF0A 5F2LA 4MY1A 3ZS4A 1OFPA 5CPLA 2H8ZA 1QFEA 4R7JA 3W71A 3DHFA 4X22A 2WOQA 3NQMA 3LCIA 2QCGA 5DXYA 3NM1A 4Z08A 5HINA 4XZ9A 4HKPA 1VCGA 3A9IA 3I7QA 3LXAA 4OU1A 3ATYA 2ZQ0A 3VNDA 1Y0EA 1CI1A 5F1UA 3I7SA 3N14A 3NL3A 4BFAA 3P61A 4AF0B 3IIVA 1F6KA 3A5FA 2QCHA 3MYPA 4N9EA 2IQTA 1JVNA 3IIXA 2TMDA 4GUGA 3GX9A 4WXYA 4ZQMA 1YXYA 3G1SA 1OJXA 2A0NA 1K7EA 3NQAA 5IM51 1TRDA 1TJRA 1P5BA 2QCMA 2W79A 2BLEA 1GG1A 3PS7A 4AXKA 4UFMA 3HBLA 3KOFA 1KM0A 3W7NA 4K8HA 3MHFA 8TIMA 4JDBA 4DBEA 3A21A 2CLKA 3EWZA 2EGZA 3NQ8A 1E51A 4MY9A 3C56A 3O6CA 2QAFA 1GEQA 2J6XA 2P0OA 4UMBA 3VKJA 2FPTA 1W3TA 3WK1A 3C2VA 1VZWA 3P84A 3W2UA 3W7OA 3WJZA 4LUJA 3NOEA 3QPYA 2YPIA 3LRMA 3K30A 3LRKA 2RDWA 1F74A 3DXIA 3MHGA 5BNKA 2GOUA 3TXVA 1FWRA 3G0SA 1JUEA 4OV4A 1VYRA 3PSVA 1GVSA 1OYBA 3E49A 4AHOA 2Q3RA 4OV9A 1SQ7A 3W7GA 3P60A 4S2CA 3W1RA 4HNTA 5L9FA 4UTTA 3VCRA 2ATSA 2ZA1A 5F2IA 3E96A 4UTUA 5G2HA 3EB2A 5DY3A 3SECA 3LTYA 3SI9A 3PC0A 1I2PA 1YPIA 1RD5A 2TRSA 1JCYA 2O7SA 3BPWA 3W84A 1H7WA 4LVGA 3BGJA 3W22A 4A3UA 1ZFJA 3R2GA 4B5NA 4RCXA 4JXCA 2QCDA 4A21A 5ABTA 4HNVA 3RF9A 2Y88A 3W1UA 3M5XA 4JY9A 4E2BA 1OFAA 3G3MA 4LC8A 1YPFA 3TAOA 1YDOA 3MBFA 4UFLA 4FX8A 3L5MA 4JY8A 3BLEA 1S5WA 3C2EA 1WQ5A 4PL2A 3C4UA 1TTIA 2GVJA 4Z1DA 1IXPA 4CCEA 3OBKA 3G1AA 4NX5A 1VGAA 2NXIA 3BG3A 3CEUA 5K3VA 4GJ1A 2J27A 1I2OA 2A21A 1RPXA 2H90A 3HGSA 1OG0A 5C2XA 3WJYA 2ZRYA 4IXXA 4UR8A 5K9DA 3R13A 4AAJA 3RLUA 3NAVA 3DKLA 1OX6A 3N2MA 1THFD 1ZHAA 3EKLA 3GIYA 4DEFA 2VFFA 1FBAA 5E0KA 4MLJA 3I68A 3LOTA 5DY2A 2RFGA 3N34A 2E6FA 2FQIA 1SO3A 3VI2A 5G2WA 4EF9A 3DENA 6TIMA 4J9JA 2G95A 2W6RA 1GVRA 1G4SA 3LCFA 5IBXC 3HQ1A 1DL3A 1TMHA 3ZWSA 2PURA 4GRSA 1FWTA 4GUFA 1LORA 3CTLA 3QZEA 3G24A 1Z44A 4S1FA 2DP3A 4A2RA 4LVDA 3HG2A 1Q3NA 2FLIA 3UNDA 2WKJA 4ZQNA 3P67A 5F4XA 1TPEA 1TPVA 4JN6A 3UZ5A 1GPWA 2Y85A 4MYXA 3R8RA 4I7WA 5DCBA 2X1UA 4JEQA 4Y96A 4CNNA 3W1XA 2PRHA 4KWWA 1G4EA 3FJLA 3KVJA 1RR2A 1XC4A 1SW0A 4ZMGA 1O5KA 1G69A 4POCA 2FFCA 4JR5A 4JTTA 1JQVA 3GNDA 3A24A 3NQEA 2QJIA 4WY0A 3RK8A 2C3ZA 1C29A 4TMCA 3EWWA 3W3OA 3G1FA 1ICQA 2PRLA 3L0KA 4OWGA 5HULA 1WYIA 1IXOA 5D2VA 1TPWA 2I1OA 4Z0JA 4IPJA 5I3KA 5KZDA 2YW4A 2Z1BA 1VS1A 3W1MA 1FDYA 2GVLA 3KRZA 1W3IA 1W5QA 1JJKA 3SFKA 1TTJA 2VFIA 1I4NA 2P1FA 3NPUA 1WAUA 1QOPA 5CKSA 5EMUA 3HGOA 2GQ8A 3FLUA 3LX9A 3PG9A 1GWJA 1PIIA 3S5YA 4O14A 5FF4A 4DXVA 1RQEA 2BXVA 3W7CA 3SW6A 3M41A 4JTJA 1NAL1 2YR1A 1DQXA 4AHPA 2DJLA 4ADUA 4S2BA 1K02A 2YXGA 1NEYA 3LCXA 1GVOA 3MW7A 2CZEA 2Y7DA 1JCMP 4WY0B 4O13A 2QJGA 3KXQA 3O6YX 1M6JA 3L68A 4O57A 2Z0IA 1KBIA 1UUMA 3TK7A 1FDJA 5LNVA 2FPYA 4XBSA 5J5RA 3DKJA 4K7VA 1F5ZA 3TMQA 1VJIA 3NQVA 2CZFA 1B4KA 3EX2A 1PCWA 2VENA 1VQTA 3HJZA 4HNUA 3NR0A 3DFPA 3G0UA 1GOXA 4ZQRA 1TQXA 3GXTA 3QMSA 5I3IA 3N3MA 2A2IA 2UV8G 4YL2A 3YPIA 1H61A 2X2GA 4HN4A 2C0AA 4N9DA 1G6CA 2V82A 4QAIA 2CU0A 3C2OA 3W88A 2V30A 4Q33A 3MHUA 1R47A 2E77A 5CGQA 1KTCA 3NPWA 1B3OA 1LRQA 3Q37A 2JKPA 2QF7A 1FCVA 5HR6A 4AEOA 3LI0A 1CX9A 1F05A 1KM5A 1QNVA 3IGXA 3W85A 2RHGA 2QDGA 2YW3A 1XBVA 1EEPA 5I3GA 2CZ5A 5D2WA 4MPQA 4HSOA 2W0UA 1F6PA 4JDYA 3ANYA 2ZA3A 2DORA 2YFNA 1VCFA 4XQ6A 1EPXA 1PHQA 3SIZA 3HMJG 2FIQA 1KLYA 1TV7A 3G22A 1KTNA 1KTBA 3CPRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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