4HIBA

Crystal structure of human orotidine 5'-monophosphate decarboxylase complexed with cmp-n4-oh
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
ELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKCHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Novel cytidine-based orotidine-5'-monophosphate decarboxylase inhibitors with an unusual twist.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 95
structure length 256
sequence length 256
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2012-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4hibA00
1K7XA 4RK8A 2WNNA 3IEBA 2E5DA 4MLRA 1MEWA 1F6KA 1OYAA 4HIBA 3QZEA 8TIMA 3S0CA 2V8ZA 3L21A 3L67A 1XBVA 2HSAA 3NPVA 3PUOA 4ZQOA 5SWUA 3ABOA 4IXHA 1PHWA 3O05A 3N3MA 4O14A 3VNDA 4NJJA 4YLWA 1TPUA 3EWYA 3RK8A 3TSDA 4JICA 3LHVA 1K3UA 2J9XA 1H62A 1TPWA 2Y6ZA 4PL2A 1NAL1 4LC8A 4JYEA 3U8GA 2OT0A 3M5VA 1FCVA 1ZENA 1LROA 1Q6QA 3W7CA 3MBDA 5BW6A 4AHPA 3DHFA 1IXQA 2Z1BA 5HWJA 4HNTA 1KM3A 3S1XA 1XCFA 4JYFA 3LCLA 1SFJA 5D38A 1ZJIA 2VFDA 4IGHA 3PBUA 4O18A 1XBZA 2QJIA 3L2IA 4FXRA 1LTDA 1XFBA 2VFIA 1LCOA 1TRDA 1FXQA 4XWUA 1TPDA 1QPRA 3EX1A 4B5NA 3LHWA 4YXGA 4PTNA 3TUUA 2ZZ4A 1OF6A 1SZNA 1JCNA 2NX9A 5LKYA 1QOPA 3LV6A 2EAWA 2NV2A 2XN1A 3JRKA 3LV5A 4RZ6A 4JDYA 5BMXA 3M5ZA 2CLHA 3QH2A 1KFBA 4BFAA 1HL2A 4JGDA 4LS2A 5C5YA 4EOUA 4P61A 3EXTA 5K2ZA 1YADA 3GVGA 2NXIA 3W73A 2DZXA 3G1SA 4AWUA 3LM7A 3R13A 4WUIA 5EYWA 1QWGA 1RR2A 3MI6A 3R5EA 4MVAA 1UUMA 3MJYA 3GIYA 2Q8ZA 3CIWA 2ZZ7A 2WNZA 1IIHA 3SI9A 1EUAA 1LBLA 1OHLA 3B06A 4IPIA 4MY8A 3MP3A 4WD0A 3W1LA 3OEXA 1G4PA 3VE9A 1L6SA 4Z0JA 1HFBA 4LC6A 2RH9A 3LHYA 5D05A 1DORA 4ZZ9A 2V5LA 6TIMA 2AAMA 4NJHA 4YL2A 4QIUA 2ZA3A 1J5TA 4JX4A 2P0OA 4O1CA 1K8XA 1W3IA 4I7VA 3DFPA 3NO5A 3S5ZA 4YWIA 2CLIA 3PVFA 3PSWA 1NVMA 3DENA 5F2GA 5F2MA 5EL1A 3RU6A 4A22A 3LCXA 3QFEA 2RFGA 4JX6A 2GUUA 4NUWA 1DQWA 3SSJA 1WDWA 3P8JA 3GAKA 1LORA 1JUBA 2O7QA 2HS6A 4EIVA 3ATZA 3LXAA 4O16A 3OHIA 3SIZA 3CB8A 1B4EA 1GYLA 3KVJA 3TDFA 3W85A 3NQ7A 3W1MA 1QNVA 4XBSA 4RKAA 2QUUA 4YCPA 1JULA 3FYOA 1HG3A 2GVJA 4S2BA 1KLZA 1JVNA 4UMAA 3S1VA 2DZSA 3HG4A 1TO3A 4CNNA 3P5YA 5LHFA 2YW3A 5D2VA 1ZHAA 4P2VA 4E2BA 2ZRZA 1OABA 2E1DA 4GE8A 1O94A 4JY8A 3M43A 3HG5A 4FXSA 3TAOA 3HMJG 1GZGA 2B7QA 1LYXA 5D03A 3W7GA 1KV5A 2Y7EA 3LCIA 3THAA 4DQWA 3RNDA 3SY5A 1XI3A 2ATSA 3A24A 5U7SA 5E0KA 4BWLA 3GXNA 2HTMA 3NQ8A 4NZFA 3L0NA 3G1FA 3M41A 4AB4A 2VEMA 4PEKA 1WAUA 4IX2A 2JKEA 2E09A 3P61A 2ZZ5A 4K38A 2F84A 4K39A 3HB9A 4HNUA 3WK3A 4JTKA 3BGGA 3FKRA 2CZDA 3NGJA 5L9FA 1I8JA 1XM3A 1KBJA 1FX6A 3NQVA 4XTDA 2RHGA 3GNDA 1JJKA 4LUJA 1FWNA 3UZ5A 1SR9A 4EF9A 2ABAA 2AGKA 1Z44A 2QCFA 3NQAA 1LLWA 3S8HA 1QPOA 5AC7A 4X9SA 3TH6A 3TROA 3C2EA 4ORMA 3TXVA 5A8GA 5I3GA 4UTMA 1TSIA 1RQBA 4DF1A 3W86A 2YCEA 3EXRA 1WOBA 1WXJA 3MMTA 3O6CA 3PULA 3SJ3A 5EPDA 1G7VA 3S6DA 3CPRA 3U2OA 4GNJA 2V2HA 1GTHA 1FCUA 4Y90A 1RQEA 4XBKA 1YXDA 2CZFA 3BGJA 3UWUA 3TSMA 1TV5A 3HGJA 4LS0A 3WK2A 1SW7A 1XXXA 4GUJA 3S1WA 4I7WA 2A1YA 1ME7A 3OVPA 2NUXA 3DHDA 1EA0A 4AH7A 5F4XA 1D3HA 1JCXA 4RZ5A 4CNOA 2E5BA 3C2VA 4ZVJA 4M7TA 3A22A 1K8YA 4N6EA 4MJZA 3IRDA 1C29A 1R47A 1TREA 3W83A 1GG0A 3NQDA 1XBXA 3E12A 3H53A 4FX8A 4LUIA 1S5WA 1GVSA 4UFLA 1XKYA 3EWBX 4ADTA 3WK0A 1GYNA 4EF8A 3FIGA 2J9YA 3TAKA 1OFEA 1G4TA 3TSBA 4BI6A 5G2WA 2TYSA 5CPMA 4FNTA 3IIXA 1KM4A 2VFEA 2Z6IA 1OFBA 5H2ZA 1AMKA 2NWSA 2CLMA 3UPWA 2QCNA 2QR6A 1VLIA 2FB2A 3N34A 3A23A 3ZWTA 3KFTA 1IXNA 2Y7DA 4HPXA 2PURA 2Y62A 3OVRA 3E02A 2Y89A 3DBPA 4UFKA 5CZTA 1BWKA 4ZQRA 1S5TA 2JK2A 3HG3A 4UTKA 1W1ZA 2ISVA 2E6AA 1BWLA 4N6FA 3FJ6A 1R2RA 1XC4A 3LTSA 3FLUA 3NZRA 4OV4A 4KKXA 3M9YA 5DCEA 1O60A 3GDRA 3IIOA 4ML9A 1TPB1 4X22A 3GXPA 5AHFA 1MEHA 1VS1A 1VYSX 2TRSA 2Z0IA 5FF0A 4X3ZA 1NF7A 5DXYA 3TJLA 5CZ0A 4HSOA 3ZFHA 3Q94A 1GOXA 3TMQA 3OIXA 1H7PA 1V7YA 3PG8A 3GNNA 4DBDA 3W22A 1DJQA 4GRSA 1TTJA 1YTDA 2VELA 3JR2A 3LTPA 3LRMA 4DO6A 3L0GA 2A6LA 3GDLA 5LNSA 3W2UA 3W1TA 3TXZA 2YDAA 1KTNA 3B04A 1W37A 4O28A 1K7EA 3LCGA 1VZWA 4FNRA 3QJAA 2DZTA 1O95A 4I7UA 2HS8A 5DBTA 1A5AA 3INPA 3MBFA 2WV8A 4O57A 3K30A 2C6QA 3SFKA 3N73A 4O0KA 3B4UA 2ZTKA 2GJLA 1X1OA 1FDYA 3EWUA 4XUGA 5D2YA 4BR1A 3GR8A 4JTFA 4MLJA 5EKYA 3QM3A 3SW6A 3LHUA 5CKSA 2TSYA 3NL3A 2FPTA 4TO8A 2A85A 1CW2A 5FESA 4NNCA 3B0UX 5G4EA 3T40A 2RDWA 3DH7A 1R2TA 4HNVA 4LNYA 3T7VA 3C8FA 1TCDA 1F05A 4RJEA 5FI8A 5AHNA 2NZLA 3TC6A 4BK9A 3TC7A 4Q32A 3PS7A 3QEZA 3EEGA 1IXPA 3QQ0A 2UV8G 2PRLA 3W1AA 2R14A 3IIPA 3EKLA 2E6DA 3E96A 4M7SA 5TBOA 4QAIA 3N9SA 2W6RA 5G2IA 4UTUA 3UD6A 3W23A 1Q3NA 4OT7A 2Z2UA 2RDUA 1F76A 3KOFA 3FKKA 1KM6A 5GVJA 3NG3A 1D9EA 4RCXA 3GDKA 5KZEA 5HWNA 4UTHA 3HGOA 2ZZ2A 2BXVA 1I2QA 1OX4A 4CCCA 2EHHA 1KFKA 3IGSA 3DFTA 5IBXC 4TMCA 1W54A 2YYTA 3C4UA 4GWEA 4JN6A 1EX5A 2CFFA 1W5MA 4OQVA 3EX6A 1AK5A 1CI1A 5KSWA 3G3MA 2W0UA 2D73A 3IVTA 1DKWA 4GUHA 4Q4KA 1L6WA 1M7OA 3N9RA 4HHPA 1N8FA 4IPJA 4UC5A 4KWVA 5F1UA 1W3TA 4Z0SA 2P1FA 4ZQNA 1F7BA 3DKLA 1H7XA 3FS2A 1RZMA 3HGSA 2C16A 3MI3A 3I7RA 3PSVA 5DXXA 2Y63A 3DAQA 4OHQA 4IOTA 4FIRA 5KZMA 4UTIA 3W7OA 2XFWA 2I14A 5D2WA 1YLVA 2Y61A 1FBAA 2ZRUA 2QCCA 4K7VA 1IIGA 3TQ0A 4CQ8A 1Y0EA 2ISSA 3PWAA 4OE7A 2C14A 1L2UA 3HG2A 1YXYA 3KX6A 3P84A 1WV2A 1EWDA 1TPEA 3LI1A 2B7PA 3PB0A 1C8VA 3N14A 3TFXA 1GG1A 4CQAA 5BOOA 4M5PA 2I1OA 2ZRXA 3CU2A 3W75A 5AHLA 4EVZA 1GVOA 3BG5A 4JIPA 2FQIA 2J6XA 3KHJA 1OYCA 1AL8A 3G1VA 1ZALA 2HMCA 4NXKA 1TPC1 5KTLA 2B7OA 4MFEA 1TB3A 2WQPA 3ABSA 5G1TA 5DELA 2J27A 3NQ2A 2V0TA 3P7YA 1R30A 4FNUA 4M6QA 5AN7A 4HNNA 2Q8LA 2R94A 3BO9A 4R34A 3KAOA 4Y96A 3L5LA 3STEA 1OX6A 3HPZA 2CZ5A 1OFQA 2ZCGA 1AL7A 2X1UA 3M44A 3C0JA 3LDVA 4AXKA 4O50A 3LXBA 3LERA 3GK0A 1P0NA 4K8HA 2G95A 2RKXA 4UR8A 5EBUA 4IMEA 2QDHA 1VCVA 4WOZA 3UZJA 2CLKA 2QCMA 3ELFA 1A5SA 4TMBA 2GVGA 2VXNA 5C54A 1FWRA 4JTLA 1EB3A 3CLMA 3EX2A 5C6MA 3DU0A 3E49A 2FTPA 4MPQA 2QCHA 3C2OA 1P4CA 3FEMA 5HUOA 3W7IA 1X7FA 1TIMA 2C0AA 3LOTA 2TMDA 1XUUA 4O12A 2QJGA 2E6YA 1KM5A 4JTUA 1OJXA 4GJ1A 2OT1A 1X6UA 1YDOA 1UASA 1NF0A 3O1NA 4DO5A 4E0CA 3W7NA 2BSLA 4FEZA 3G1DA 3C3NA 5KITA 1H1ZA 2C1HA 3GX9A 3KRUA 3NYZA 4DELA 3KRZA 3UY8A 1HUVA 4MZ1A 1TYGA 4UFHA 4FX7A 3QF0A 3O63A 4LVDA 2BTMA 1QPNA 4CCEA 4PL1A 5CSRA 5AHIA 1VLWA 3F03K 3LRKA 4O1BA 4OV9A 1MSSA 3TW6A 4GUFA 5CGQA 1NFBA 1TV8A 1F2JA 2QDGA 4JTGA 1X1ZA 4JR5A 1EEPA 2Y88A 4RX0A 4W9TA 2B0MA 3HJZA 1Q45A 3PUDA 3G24A 1KLYA 4JTTA 3PBYA 3HPSA 3BG3A 4M6PA 1I4NA 1QO5A 1AW5A 3HO8A 3MP5A 4K36A 4UTTA 3DI1A 1QAPA 4O52A 2NLIA 1FCBA 2JGQA 1LLZA 1TTIA 3NL6A 4BF9A 5D09A 4LVBA 2NXGA 5I3IA 3G1AA 4C1KA 3P81A 1ICQA 4O15A 3NM3A 3O16A 1ML1A 1OFRA 1JCMP 4A29A 1GVFA 5A5WA 3B05A 3P82A 2LLEA 5LNUA 4LVGA 4ZMGA 3TFCA 3W7DA 1F5ZA 2C13A 3I7QA 4WOQA 5HUPA 2IQTA 3W2JA 3S5OA 3RMJA 5IM51 3KVLA 2QAFA 3LGEA 4MYXA 2YXGA 4MOZA 1RD5A 4JD4A 2VEIA 5D2XA 1OX4B 2VOMA 3M5XA 5LZLA 4O1AA 4NJKA 3B8DA 2VFGA 1ZAIA 1G4SA 1JR1A 5G4WA 1SO6A 3WJZA 3L68A 5I3FA 4N4PA 4DF0A 1JCJA 3EWXA 4X2RA 4AAJA 1B9BA 2G96A 1H7WA 2JGYA 1ME9A 1YYAA 3LXCA 1SO5A 3PF3A 4O0ZA 3O8AA 1KTBA 1ZY9A 2YYUA 4UFMA 1H63A 1ME8A 1YTEA 4GUIA 4LTSA 1RPXA 4NZJA 1A53A 4RLIA 2WKJA 2QUVA 2O7SA 3O6YX 1ZFJA 2AQWA 4A2RA 4AEOA 4OWGA 2NX1A 2WSQA 5AYXA 3TW7A 2ZZ3A 4ZQMA 4DBEA 3EB2A 1LOLA 4TX9A 2CLFA 2F7FA 2VEKA 4H3DA 3NOEA 1DHPA 4HKPA 1OYBA 1T99A 4JTIA 3DGRA 5AC8A 3QMRA 4AWSA 5KMYA 4PC8A 4RXFA 4LY8A 3NXFA 2BWGA 1M6JA 3BARA 2DU2A 2J9ZA 3I65A 5K4ZA 3W74A 2NWRA 5D37A 2ABBA 3RFAA 1JQXA 2GQ9A 4N4QA 1G69A 4E38A 3G0SA 2ZZ6A 3G1YA 1Z41A 5HMSA 5LHEA 2DZVA 1V5XA 2P10A 1AG1O 4AF0A 2ZRWA 3YPIA 4L4LA 7TIMA 4NNBA 2QCDB 4JY9A 3MO7A 4TIMA 3NVTA 1OF8A 2ZTJA 3WFAA 1A5BA 3N19B 4BWLC 2QEZA 2H3BA 3T78A 1VR6A 3UXAA 3W84A 4QSHA 5E1QA 1I2RA 1KFEA 1Q6RA 2OX1A 5K9DA 2YR1A 4I9AA 4HSNA 1G4EA 2H6RA 3W7JA 4E2DA 1SSDA 1U83A 5DY2A 3LLFA 1W0MA 1JRBA 1QCWA 3A9IA 4Y6GA 1FUYA 5CZJA 1FWSA 3NQFA 3WJYA 4M19A 3G8EA 1SZGA 1S5VA 3UXDA 3R89A 3U6WA 2GPTA 2WSYA 5K7JA 4UR7A 3HBLA 4UTWA 3E9AA 3EKZA 4KWWA 3F1QA 4WX2A 1W3NA 3AJXA 3EX4A 3NL2A 5D30A 1G7UA 4O11A 4O53A 3HOJA 3TV8A 4R33A 3QSRA 4LU0A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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