4HSO | Genus

Total Genus 128

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	128
sequence length	345
structure length	345
Chain Sequence	PTDDIKIKEVKELLPPIAHLYELPISKEASGLVHRTRQEISDLVHGRDKRLLVIIGPCSIHDPKAALEYAERLLKLRKQYENELLIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHLDGTFDINFGLRQARSLLLSLNNMGMPASTEFLDMITPQYYADLISWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGNLKIAIDAIGAASHSHHFLGVTKAGHSAIVHTGGNPDCHVILRGGKEPNYDAEHVSEAAEQLRAAGVTDKLMIDCSHANSRKDYTRQMEVAQDIAAQLEQDGGNIMGVMVESHLVEGRQDKPEVYGKSITDACIGWGATEELLALLAGANKKRMARA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Neisseria meningitidis expresses a single 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase that is inhibited primarily by phenylalanine. pubmed doi rcsb
molecule keywords	3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase
molecule tags	Transferase
source organism	Neisseria meningitidis
total genus	128
structure length	345
sequence length	345
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date	2012-10-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00793	DAHP_synth_1	DAHP synthetase I family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4hsoA00

2CZDA 2QCGA 3S6DA 1LRQA 5C2XA 3LCWA 4K7YA 2B7QA 5CSSA 5AC6A 1X1OA 3NQCA 5K9XA 3TSBA 3HPZA 3NO5A 1Z42A 1DVJA 4PODA 1JJKA 4OT7A 3LHYA 1F6KA 2Y88A 2ZRWA 4JIPA 4FO4A 2X30A 4K38A 4LVAA 3P62A 4QSHA 4HPXA 3GAKA 1H1ZA 3M6YA 3GDTA 4TIMA 4IPJA 4JX5A 5KZDA 4MY8A 4O17A 3L0GA 4AMAA 2NXHA 1L6SA 2NX3A 1JCYA 4PC8A 4IUOA 2FPTA 3BW2A 3MP5A 4FIQA 4DELA 1AL8A 3W70A 1PHWA 1TPB1 3KFTA 2F84A 1DJQA 2ZZ6A 3QW3A 1FWTA 5D02A 1L2UA 3UWZA 2CLEA 3PG9A 2E6DA 3EWWA 3IIZA 5D2YA 4UTIA 3G8RA 5AHNA 5F4SA 3IV3A 1ZFJA 3JRKA 2CZFA 3UQNA 4WY0A 4YXGA 3CM4A 3MUXA 1NF7A 5F1VA 4MYAA 1WA3A 3O63A 4IMFA 3IRDA 3PF3A 3ZWSA 1IXQA 1KM5A 5LHEA 1K7EA 3M47A 1YDNA 2C15A 3MHUA 5KTLA 3NVTA 2CLOA 1TPWA 4JTSA 1A5SA 3AO0A 1GG1A 1QMLA 1JVNA 4KFPA 4EWND 5D2VA 1TQXA 1VQTA 3W1PA 2C16A 4JY9A 4RLIA 1ICQA 1D3GA 2XN0A 1F76A 2NWRA 2J9ZA 4A2RA 1QOPA 3M16A 4NQ1A 2J27A 4WY0B 1LORA 3PG8A 4UTJA 1LBMA 3A5VA 3C2VA 1NFBA 4JTLA 1ZHAA 1N8FA 2Y85A 3C2FA 3GNDA 3WJWA 5FI8A 2Q8LA 1PIIA 3H53A 5HR6A 5IM51 2HS8A 3EWBX 1LP6A 3IGXA 1SU5A 1KM2A 2CZ5A 2QCNA 2FQIA 1HO1A 4UTUA 2PRHA 5AC8A 1FQ0A 3GK0A 1DOSA 4GUIA 2QEZA 1IXNA 3G22A 4N9BA 1SR9A 3NZ1A 4ZQOA 4GNJA 3LHTA 4PA8A 2E09A 1D3HA 3E12A 3NL5A 4WUIA 3RFAA 4LVFA 3OVPA 4LC6A 5HMSA 4FXSA 4XUGA 1B9BA 4OGZA 2VEPA 2YXGA 4JYDA 1YPFA 1ICSA 5D09A 5G4WA 4O16A 3W1NA 2CZEA 2NV2A 2A85A 2DZTA 3N73A 3S1XA 3MJYA 3LBCA 3W74A 1KFKA 4RZ5A 4XKYB 2AQWA 4A3UA 2Z1BA 1VH7A 3FOKA 3ZFHA 1W0MA 5LHFA 3LDVA 2JGQA 1ME7A 1ZNNA 4K39A 4WQ6A 3W1TA 3LRLA 4CQ8A 2E6AA 1THFD 1YTDA 1SO5A 3L0NA 3DFTA 4JS3A 4RXFA 1OFBA 1GVOA 3DENA 3PBUA 3NM3A 1KA9F 4POCA 3LTYA 4JTTA 3CPRA 4P2VA 4AAJA 5TIMA 1Q45A 4AH7A 3NA8A 4UTHA 4M6VA 1XFBA 1VR6A 1EA0A 2QUUA 4GXMA 1TPFA 2R8WA 2VEKA 4M5PA 1UUMA 1BTMA 2H8ZA 4OHQA 5EMUA 1UCWA 3BVJA 4NU7A 2B7NA 3QMRA 4KKXA 4JTGA 2FFCA 3L66A 4UFKA 3DKJA 4IX0A 1Z48A 3GKFA 4UUIA 1XBYA 1G69A 4PEKA 3PUDA 2RFGA 1R47A 5AOUA 4MUZA 4MFEA 2OX1A 3PB2A 3LOTA 1DJNA 3TV8A 3D0CA 3W86A 2CFFA 4Q4KA 4RZ6A 3L5MA 3PUOA 4FNQA 1EWEA 2VFGA 3S5ZA 3P82A 2OT0A 1JUEA 2W0UA 4UTWA 1ZENA 1B4KA 5I3FA 1DQXA 3GLCA 1SO3A 4NZJA 4IQLA 1W1ZA 1R2RA 4NXKA 3LERA 2QDGA 2EKCA 3STFA 5IBXA 2E68A 1T8XA 5A5WA 3SGZA 3KRUA 4M19A 1NAL1 3P67A 3G1YA 1TMHA 1G4SA 4NJJA 1QFEA 4NT0A 5TBOA 3W72A 1MEIA 2NUYA 3LXBA 2EPHA 2DJXA 1YTKA 4XBSA 1VHCA 3MI6A 3LRKA 3TC6A 2EAWA 1VZWA 1KM6A 1OX6A 4JX4A 2QDHA 5FF2A 4GWEA 2R94A 2ZZ3A 3TQ0A 4ALDA 1GYNA 1PV8A 4UFHA 2C19A 4NUWA 1X7FA 4LT9A 4IMGA 3C4UA 3BW3A 4MLJA 3KXQA 1M7OA 1XBZA 4S1FA 2G95A 1G6CA 5DXYA 3KRZA 3LHUA 4JEQA 1O95A 1TRIA 2QJGA 2I1OA 4Y8FA 4MZ1A 1GT8A 1YADA 2GQAA 4A2SA 1QR7A 3NQEA 5CZ0A 3FJLA 3TSDA 3W85A 3TIMA 1I2RA 5CPNA 1OYAA 4JTFA 1D9EA 2HTMA 1KV5A 4GUJA 3W9ZA 5LSMA 2VOMA 3GXTA 3W2NA 1Q6OA 1SW0A 3UXDA 1K8ZA 3Q58A 3O6CA 3T78A 3NL6A 5T26A 3S1UA 1H61A 5J5DA 1JULA 1ME8A 2BWGA 3LXCA 3C56A 5IBXC 3BG5A 1LBFA 1X8FA 2RHGA 1OX5A 1RPXA 2PRMA 1FCUA 2TRSA 1KFJA 2RKXA 2W79A 3TSMA 2Z2UA 1EP1A 2YYUA 5D33A 5KZEA 2FJKA 3TE9A 3AJXA 1KLZA 3LTPA 2A1YA 5CGQA 3EKZA 4PL2A 2A21A 1EB3A 3LCHA 4PCFA 4LWWA 5LZLA 4HT3A 3SIZA 4MFDA 4I7WA 3EXSA 1TO3A 3W7KA 2C1HA 3KVKA 4JYFA 3C2OA 2ZBTA 4QAIA 5EBUA 5HUOA 5FF4A 1IF2A 1I2OA 1PHQA 5K3VA 1FDZA 3SECA 1XCFA 5I3GA 4LS2A 3W7HA 4CLMA 1I45A 1BEUA 2AGKA 1KV8A 1C29A 2FPVA 1P1XA 1QO2A 3N14A 5BW6A 3ABOA 1J5TA 1WDWA 3PS7A 2ABBA 3W23A 3VKJA 3CIXA 2V30A 4GBUA 1H7XA 3TJLA 4PH6A 3BGGA 1KLYA 2G97A 5AHMA 1KM1A 2V8ZA 1I4NA 3EWUA 1U5JA 2OMAA 3G3DA 2YFOA 2QKFA 1FCVA 4N4PA 4JTHA 4CCDA 4M7TA 2BTMA 1W5PA 4Z1BA 4UCGA 3F4WA 2QCCA 4ONVA 5U4NA 4FX8A 3A21A 1O4UA 4ZQPA 3TXVA 1LRNA 3NQFA 3BLFA 3PULA 3S5OA 4O1CA 5CSRA 1OFDA 3KAOA 4O1BA 2KZHA 5F2MA 3LHWA 5HR7A 5DELA 1MZHA 1S5WA 1FWNA 1OFQA 3CEPA 3R89A 2DZVA 1OFAA 1GVFA 4H6KA 1L6WA 4UXDA 4ZMGA 4RV8A 1TSIA 2OZ0A 1HUVA 2ABAA 4IGHA 3QEZA 3I65A 5HULA 1GVRA 1PE1A 4HSNA 3GX9A 4JDYA 4RCXA 3TK7A 3RMJA 1G4TA 3W7PA 3A23A 4HKPA 3NAVA 3W1MA 5G2IA 3L65A 4YMZA 3QC3A 4JY8A 4RXGA 1A5BA 1JQXA 2RDTA 5FEWA 4MZ8A 3M1ZA 2HMCA 3BARA 1B57A 1JRBA 3GR8A 1F73A 4TR9A 1OVDA 3L5AA 3P84A 1H60A 5LNWA 1AW1A 2NXIA 1W54A 4E0CA 4UTMA 1WAUA 1YLVA 1TTJA 3N2XA 4UIOA 3IIPA 1NF0A 1VLIA 4QQ3A 3MWAA 4RK8A 5CPOA 1UASA 1GZGA 3ELFA 4O0ZA 2YSWA 1W5OA 3N9SA 3W7MA 3BW4A 2ZTKA 1KBIA 1LRTA 3CEUA 1ME9A 3B05A 3GXNA 1S5VA 4NX0A 1OYCA 2Y70A 3O15A 2ZDRA 3FS2A 1TPUA 4LNYA 3PWAA 3R8RA 1A50A 1XUUA 3B8DA 2CLHA 4AXKA 3HG5A 4N9DA 3S8HA 2GOUA 5KITA 3GDKA 3LRMA 4PL1A 1G4PA 4OE7A 2QCEA 2BSLA 2A6LA 1B4EA 4UFLA 3W7NA 3FA5A 1IXPA 5FESA 3STGA 4KWWA 1O60A 3G18A 4ZQNA 1IIHA 1FWSA 3HBLA 2QCDA 2X1UA 3O07A 2V2HA 3NM1A 2FPYA 3KHJA 4CNOA 3UPBA 4S2CA 3W7JA 3KVLA 2Y7EA 3L0KA 3PVFA 2A4AA 3P61A 2YFNA 4H3DA 2GVLA 3H54A 1VC4A 5F4WA 1S3HA 1H7NA 4ZZ9A 3UWYA 3HGSA 5HWNA 4GJ1A 2F7FA 1P0NA 1PCKA 4BF9A 4M6QA 4IJBA 5DCBA 5KMYA 3RNDA 2Z0IA 1XI3A 5AYYA 3M0ZA 4DBEA 1JQVA 2I9EA 2QCDB 3W87A 3UY7A 4JYEA 3I6RA 1SZEA 2YW3A 3HIJA 4O14A 2J6XA 3V1PA 3ZR4A 4BFAA 4TX9A 3SZ8A 5AC7A 5D30A 3UWQA 3VFLA 1GVSA 3U2OA 3FYOA 2VENA 3NXFA 1RQEA 1X1ZA 4DO5A 3RF9A 3S5YA 3N9RA 4UMBA 2FB3A 3MO7A 1K7XA 2IQTA 3NGJA 4ZQRA 2Y62A 4BR1A 5TQLA 1F05A 2E5DA 2TYSA 3L21A 1JUKA 1SW7A 2ZTJA 3O06A 3MP3A 4WOZA 3TA6A 1NVMA 2YCEA 3V75A 4Q33A 2NX1A 3W75A 3FLUA 3QQ1A 1T99A 3UD6A 3EXRA 1F74A 1TJPA 5LGZA 3A5FA 3BG9A 2OJPA 4JTEA 3QPZA 3T44A 2VC6A 4GUHA 4J9JA 1T0OA 4Q32A 2V82A 1GJPA 4YCPA 1H7RA 1FWWA 1Y0EA 3W7EA 3E9AA 1TPDA 1IXOA 3MYOA 2G96A 3G1AA 5F2IA 2C6QA 1YXDA 3NYZA 1OFOA 1JUBA 3UY8A 2A7NA 5D2TA 1EP3A 1OFEA 1G7UA 5DCEA 1KFLA 4JDBA 3GVGA 4ZQCA 4IMCA 3I68A 1DV7A 1RVGA 4MY9A 4ADSA 4BWLA 4TMBA 3W1LA 3GYEA 3QMSA 4Y96A 4CCEA 4UMAA 4UNLA 1MO0A 4DO4A 5AHEA 4LS0A 2OT1A 3W2KA 3W2MA 5DBTA 4LUIA 1E51A 4AWTA 3DKLA 3FKRA 4E2BA 4K36A 3C3NA 2GJLA 4G1KA 4UR8A 4N9EA 5EA9A 2C3ZA 5HNRA 3OHIA 3WJXA 1EEPA 5GVJA 3R12A 4UTKA 2ALDA 3FIGA 3MW7A 3S0CA 3EKLA 1EWDA 4FNRA 1SZFA 1ALDA 2JKAA 2NZLA 1KM4A 4Z08A 3TFXA 4JGDA 3DXIA 4O57A 1XXXA 2J9YA 3G1XA 2RDUA 3USBA 3R5EA 2E6YA 1Z41A 4XQ6A 4O4VA 3E96A 4FXRA 2WSQA 2GPTA 4GRSA 4AEOA 3C6CA 5CZSA 2DU2A 1U83A 4N02A 4JTKA 3SSJA 3T4CA 4CCCA 3VE7A 4NXSA 4U28A 1PS9A 3HQ1A 1WBHA 2JKPA 3KRSA 5EKYA 3M5ZA 4R7JA 3LCGA 1ZJIA 2QUVA 3DFOA 5G2HA 5AHIA 3W7OA 3WJYA 2A6NA 2WSRA 3EWYA 3L68A 1YYAA 5E0KA 1I2PA 4Z0JA 4JN6A 6TIMA 3DFSA 4IMEA 3DZ1A 1GQNA 2CLLA 2ZZ5A 1IIGA 3NPVA 4LRTA 1GTHA 3N19B 4O50A 4OBTA 2V9DA 2B0MA 4BWLC 2Y7FA 2FIQA 3GAYA 3B0PA 1GVQA 3LB0A 3NPWA 3S1WA 3NL3A 4HN4A 4O28A 3QFEA 1R2TA 1WXJA 4I9AA 5AN7A 5EL1A 1EIXA 2A5HA 1QWGA 4AWSA 3THQA 3FYPA 4QNEA 2NV1A 3W3OA 3EX3A 4MJZA 4LOCA 1G4EA 6ALDA 4RX0A 3GDMA 2VFHA 3L9CA 4JR5A 2W6RA 2VFIA 1DKWA 1TCDA 1R30A 3WK1A 3BGJA 1L6YA 2EHHA 3PSWA 3BPWA 2PRLA 3P80A 4HHPA 3G0XA 1ZCOA 3TR2A 3G0SA 2WOQA 1TV8A 3P74A 4AWUA 2EGZA 1LBLA 2QJIA 3UXAA 1TREA 1KBJA 4O13A 1ZAJA 1ML1A 3W83A 3QJAA 4NJHA 1XUZA 3BG3A 3N34A 1K8XA 2CWNA 5I3JA 2PURA 4ZQMA 3P8JA 2HSAA 3DI0A 3QQ0A 3SR7A 1FDYA 4L4MA 4ZVJA 4A21A 5K7JA 1YDOA 4CNPA 1OABA 1TPEA 4NNBA 3HGJA 4UFJA 2PE4A 5H91A 3U6WA 2BX7A 3JS3A 1W56A 2YZRA 5E93A 3QSRA 3F1QA 2FB2A 3NEVA 1BWLA 1HO4A 3W76A 1UB3A 2V81A 3Q94A 4FNSA 1SZGA 3B0UX 1H63A 1YDVA 2YW4A 2ZFAA 2PCQA 3U8GA 4FHAA 5G1YA 3TFCA 1VGAA 3CTLA 4WZHA 3G1HA 5HUPA 2ZZ7A 1I8JA 1UBSA 2HS6A 2E1DA 4LVBA 1TPC1 3TQVA 1VS1A 2DZPA 1W31A 2BLEA 4LUJA 4MOZA 1K03A 3FFSA 3THAA 3TMLA 4UTWC 3UWUA 4NJIA 3WJSA 4NNAA 4UTTA 3DFNA 4EIVA 1KTNA 4LV9A 1EUNA 4HNNA 1J4EA 1G7VA 4IXHA 3CWNA 3TCEA 2A2IA 3NL2A 1OK6A 4LVDA 4CQAA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 2CZD A;  2QCG A;  3S6D A;  1LRQ A;  5C2X A;  3LCW A;  4K7Y A;  2B7Q A;  5CSS A;  5AC6 A;  1X1O A;  3NQC A;  5K9X A;  3TSB A;  3HPZ A;  3NO5 A;  1Z42 A;  1DVJ A;  4POD A;  1JJK A;  4OT7 A;  3LHY A;  1F6K A;  2Y88 A;  2ZRW A;  4JIP A;  4FO4 A;  2X30 A;  4K38 A;  4LVA A;  3P62 A;  4QSH A;  4HPX A;  3GAK A;  1H1Z A;  3M6Y A;  3GDT A;  4TIM A;  4IPJ A;  4JX5 A;  5KZD A;  4MY8 A;  4O17 A;  3L0G A;  4AMA A;  2NXH A;  1L6S A;  2NX3 A;  1JCY A;  4PC8 A;  4IUO A;  2FPT A;  3BW2 A;  3MP5 A;  4FIQ A;  4DEL A;  1AL8 A;  3W70 A;  1PHW A;  1TPB 1;  3KFT A;  2F84 A;  1DJQ A;  2ZZ6 A;  3QW3 A;  1FWT A;  5D02 A;  1L2U A;  3UWZ A;  2CLE A;  3PG9 A;  2E6D A;  3EWW A;  3IIZ A;  5D2Y A;  4UTI A;  3G8R A;  5AHN A;  5F4S A;  3IV3 A;  1ZFJ A;  3JRK A;  2CZF A;  3UQN A;  4WY0 A;  4YXG A;  3CM4 A;  3MUX A;  1NF7 A;  5F1V A;  4MYA A;  1WA3 A;  3O63 A;  4IMF A;  3IRD A;  3PF3 A;  3ZWS A;  1IXQ A;  1KM5 A;  5LHE A;  1K7E A;  3M47 A;  1YDN A;  2C15 A;  3MHU A;  5KTL A;  3NVT A;  2CLO A;  1TPW A;  4JTS A;  1A5S A;  3AO0 A; 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4HSOA

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