4HU4A

Crystal structure of eal domain of the e. coli dosp - dimeric form
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
258
structure length
247
Chain Sequence
RLVLGAALKEAISNNQLKLVYQPQIFAETGELYGIEALARWHDPLHGHVPPSRFIPLAEEIGEIENIGRWVIAEACRQLAEWRSQNIHIPALSVNLSALHFRSNQLPNQVSDAMHAWGIDGHQLTVEITESMMMEHDTEIFKRIQILRDMGVGLSVDDFGLPVTEIKIDKSFVDRCLTEKRILALLEAITSIGQSLNLTVVAEGVETKEQFEMLRKIHCRVIQGYFFSRPLPAEEIPGWMSSVLPLK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structures of the catalytic EAL domain of the Escherichia coli direct oxygen sensor.
pubmed doi rcsb
molecule tags Signaling protein,hydrolase
source organism Escherichia coli
molecule keywords Oxygen sensor protein DosP
total genus 61
structure length 247
sequence length 258
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.1.4.52: Cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase.
pdb deposition date 2012-11-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00563 EAL EAL domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.450 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel EAL domain 4hu4A00
4HJFA 4Y9MA 4F48A 3GFXA 4Y8EA 4LYKA 4KIEA 5M1TA 3HV8A 3GFZA 3S83A 4AG0A 5MKGB 4LJ3A 2W27A 3GG1A 4J40A 2BASA 3GG0A 4FOUA 3SY8A 3PJXA 4FOKA 4Y9NA 4RNFA 3PJUA 3GFYA 4HU4A 2R6OA 4RNJA 3PJTA 5MF5A 4FOJA 4Y9PA 4HU3A 4Y9OA 4F3HA 3HV9A 3N3TA 4ES4A 3PJWA 3KZPA 3U2EA 4RNHA 3TLQA 4RNIA 4AFYA 4Q6JA 5MKGA 3PFMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FUYA 5JBDA 4BR1A 1K70A 2PC8A 3COTA 4O15A 1F3WA 2XZ7A 2VRJA 3W7MA 1GOXA 2IPWA 2VEKA 4CQBA 1NELA 2VZOA 1S5VA 4JFWA 5A69A 1ZJIA 4HIBA 1DTUA 2NQHA 2E9LA 2E77A 2OLHA 1SJDA 1U5VA 5DT5A 4PRTA 1MNZA 4FI4A 2WM0A 2QJMA 3F03K 3BO9A 3EX3A 1N7KA 2YB4A 2OJPA 1L9WA 5D8ZA 4O1EA 4W8BA 3VDAA 2SFPA 1ITUA 3NM1A 4PEKA 4WVXA 3ANVA 4OV4A 3CEUA 2DVXA 3ARRA 2WO5A 2ZQ0A 5CC3A 1LOQA 4YHEA 5CC5A 4RE0A 3R0UA 4M5PA 1OFAA 3AZTA 1TKKA 3VC6A 1EIBA 1FBAA 3W7PA 2J9ZA 1NTHA 5HUOA 1EX1A 4DPPA 1UR9A 1T8XA 5DANA 3MSYA 2X2GA 3M9YA 4J35A 4H9XA 2PTYA 2GPTA 1JD9A 2JGQA 1HL9A 1WDPA 2DGAA 4XBJA 2AL2A 1KFBA 4K8HA 4KCWA 7REQA 3OU8A 2ZRWA 3IACA 3I6TA 4M1RA 3UVIA 3RLUA 2CPUA 2BGQA 2FH6A 2YL5A 3LEPA 1A5UA 2ZA3A 4GIEA 4Q7BA 3PZOA 4IGSA 1MEHA 4JTCA 4YVPA 4DJEA 2BHZA 4MJ2A 3MI6A 2CNCA 1LBFA 1SR0A 4AHOA 2J47A 4DQWA 1I1WA 4Q4SA 3CL7A 4MPQA 1HXJA 5IFTA 4H7ZA 2G50A 2PMQA 3SJNA 2DFAA 1LORA 3GC4A 2FPTA 1V6YA 4HK6A 1GPFA 2VURA 5DMYA 2CIPA 3RAOA 2R1LA 4US6A 2PTWA 3QMSA 1BTMA 4HK5A 3HPXA 4MWAD 1TTQA 3GG0A 1XYBA 1LQ0A 3HB9A 2PDIA 3NSNA 3LM3A 2DZWA 2BBFA 3ITVA 1DJNA 4NYYA 2CETA 3VNYA 1VIZA 4EPDC 2QIWA 4HKPA 4RE3A 1MDRA 4X2RA 1LUCB 1LCOA 2P10A 1FTXA 3AMKA 2VEMA 3IGUA 5D4YA 3TU9A 2QCLA 3U5YA 4QX4A 5FF2A 1CB7B 3BSGA 3CGTA 3ES7A 3H2MA 3ANYA 4U10A 2PB1A 2R1MA 4GIYA 1W32A 4B5VA 4DHGA 4HN4A 4B5WA 3WK2A 4ACYA 1A4LA 4WZHA 3TNOA 2Y8VA 1SO6A 2P8BA 4KW2A 2NW0A 1EHAA 3VIKA 3W88A 3MCOA 2YYTA 1P0NA 3NG3A 1G1YA 3W0KA 3AROA 1FDZA 5C5YA 4IFKA 1CNVA 1GQIA 1DEDA 1H2JA 3DX5A 1B0IA 4LY4A 2CW6A 1QOQA 2VR5A 3HGRA 1ZLPA 3WH9A 3CU2A 3PK7A 1BVNP 1XRSA 3GFZA 5AZ1A 3GG7A 3TC3A 3VM5A 1NH6A 2XWEA 3AFBA 1YLVA 3KM8A 3ANUA 3E96A 2JEPA 1O60A 2ZX5A 4QXIA 5CQ1A 4IJRA 3MU7A 2JEQA 5L6UA 5BWAA 1JCXA 5FEPA 2YYUA 4MYXA 1AZ2A 4GO8A 1A5KC 5TAOA 1BXBA 4BFAA 1CB2A 3L67A 3PC0A 3VGBA 3L2MA 4B16A 1D3CA 5EB8A 1QNVA 1QO5A 2ZUTA 1BKHA 1LJYA 5EBAA 3I3EA 3VIOA 2X09A 3GG1A 3PHAA 3E38A 4OBTA 4CQAA 1QT1A 3EDFA 1OIFA 2WYSA 3TYAA 4TX8A 5HINA 2NT0A 4BEQA 3UGVA 1POKA 2LLEA 3W7IA 2YCLB 4ZCWA 3PBWA 3W2MA 3W7DA 1LF1A 1E9ZB 1T41A 3SRDA 4AVNA 6ALDA 1XRTA 1K6AA 1PIFA 5GNYA 3AWNA 3UG3A 3WIJA 3GTXA 4JTLA 4GUIA 1SO3A 4C7DA 1XLLA 3WQPA 2ABBA 1VFLA 4G1NA 3IGSA 2G3NA 1AFSA 1XIGA 1YPIA 4NYUA 4Q32A 1VAHA 2FVMA 3VUPA 1E9LA 4ZTXA 1PX4A 1JPIA 4MB5A 3RHGA 3E2VA 3URQA 1YMYA 3CUHA 4I90A 1A80A 1S5TA 3GNRA 1YIXA 3N3TA 3NVTA 1UD4A 1XKJA 2JGYA 4K8EA 3SRFA 3USZA 1UJQA 5FACA 3VM7A 1J0JA 2DIEA 3AISA 3SZ8A 2VC7A 4JTAA 3E5BA 3TMLA 3ZWTA 3B8TA 4FP1A 1HKWA 3VE7A 1PCWA 4FOJA 4DYJA 4QDMA 3EX4A 3ENLA 4UQDA 4K1WA 2A4AA 3HQOA 2GVEA 5EMMA 1V3JA 5CZ0A 4CNTA 3LZ5A 2Y6ZA 3LLDA 3DI0A 4FSAA 1M03A 4GUFA 3XINA 3SCSA 1VIWA 3RCYA 4DZAA 2J7BA 5KZEA 1RBLA 1XLFA 5XINA 3FY1A 1XD0A 3WCZA 1O68A 3UXIA 3WLSA 1R85A 3L68A 2HVOA 3CAKA 2WC3A 1R8LA 1ML1A 3LCIA 4PR4A 4RPQA 4OZOA 1XXXA 4ATWA 3EMCA 5CG0A 5EMJA 2VEIA 4GRSA 4NRRA 3R11A 3LGDA 4GABA 3ZJ6A 1ZB5A 2Q8ZA 4JTTA 2IPFA 4MNKA 3NYZA 2AMGA 5LSMA 1EPVA 4AD5A 4PZVA 2ZXDA 4EWJA 4JCLA 4HTYA 4HNVA 3AUOA 1AJ2A 1EA0A 1UR0A 4E8DA 1N82A 1A3WA 2EPMX 1PVNA 1BFNA 2RDTA 2X05A 4REQB 3TKFA 3EOLA 3L2LA 4H8VA 5D2TA 3P14A 4GQBA 1ITXA 1WP6A 3H53A 3MHGA 4HU8A 4QDPA 4GNVA 2A7RA 2XSBA 1YE4A 1UW9A 4HHHA 2VOTA 2PWHA 1Z42A 3K5XA 3QHNA 3EWYA 1AG1O 1AQMA 1ZTVA 9RUBA 1VEPA 3AXIA 3F5KA 4O54A 3ZVHB 1M7PA 4CD6A 1CI1A 2ALRA 4JXCA 2DSVA 1H4PA 4LAMA 1C3FA 4UTWC 3DC8A 3MSDA 1HGYA 4KWUA 1W91A 4IPIA 1XBZA 1EKOA 1SVDA 4CU7A 3HGJA 3PANA 1TQXA 2VX4A 3B97A 1HIZA 4CD8A 4XAZA 3MV11 4YTUA 5F7UA 3TCEA 2HE5A 1OFPA 3TQVA 3T81A 1O7AA 3G1AA 4H8HA 2HEJA 3CO8A 3VVGA 3ZJ8A 3UZZA 1HL2A 3QGVA 1SPQA 3CUZA 3E0LA 4OGZA 4R85A 4BI7A 4R3UA 4LALA 1A5CA 1YXDA 2X40A 1OG6A 3OYZA 2W66A 4GQQA 1RHCA 4F9JA 4E4FA 2OPJA 2Y7FA 4TTUA 2EPKX 2QGHA 5TQLA 3OODA 5JIPA 3NGFA 2R94A 3WBXA 4HHPA 1EJUC 2TRSA 3VD3A 1E9YB 4DBWA 4WHBA 6XIAA 4I6KA 3CM4A 2E6FA 1JI2A 1KFLA 1RJPA 2PD9A 4P7NA 3RO6A 1CXFA 4Q8UA 1EHNA 1BD0A 2ZXQA 5HNNA 3NQEA 3F4VA 5I5RA 2O55A 3CTLA 4G7FA 1D7KA 3INPA 3RGTA 4X3ZA 4IIDA 2FHCA 1DIEA 3MHFA 2OU4A 2DSUA 1VR6A 1E0UA 2CLOA 3OGRA 4OBRA 2CXGA 2EKGA 1WV2A 1G9HA 2Z0IA 3OGVA 3JUGA 1W5NA 1IIGA 5TF0A 3RLHA 1FQ0A 1B4KA 3ABQA 1PAMA 3AXMA 1JF5A 1O5RA 1ISXA 1JF6A 2RGMA 4AZIA 1UJPA 3UWZA 5T8GA 4H6RA 5AC8A 5H91A 2O56A 4DUOA 3LI1A 1B54A 2PRLA 3R1ZA 4O11A 1PKNA 3UW6A 3ALGA 1T99A 3CV6A 2F8QA 1WDQA 3MUY1 4N0RA 4C6KA 1XBYA 1PTGA 5DCBA 3H2NA 3TWBA 3QOKA 3I10A 4JIQA 3KL5A 3L23A 1F76A 3DKJA 2WHMA 1KM4A 3UEQA 4DWSB 1QTWA 2V3DA 3NZRA 1B3YA 3HPZA 2HBVA 3BTNA 1XUUA 3GC2A 3QZEA 4YXGA 1XF0A 3LMZA 4DI9A 2BFGA 1HJQA 5BMXA 1YYAA 3QMTA 3NQ8A 3TA6A 2C19A 4M7TA 2XVNA 3T4CA 2Y0FA 3S1UA 1OSEA 4DM1A 3AMDA 1ZPTA 4GWEA 1TFVA 3FIGA 3C56A 4GC3A 1AH0A 1FWDC 4L7ZA 4PMVA 3VPLA 1LBMA 3P8IA 4EWND 4ZQRA 1NWTA 2GQ3A 3TYDA 3PUOA 2PDFA 1JFXA 5AC6A 2J66A 5C9RA 4DJDA 2V3GA 1Q2RA 1TJRA 1E0VA 4WJXA 2PWEA 1EB3A 2V5JA 4GD0A 4AQLA 3PJTA 3UZXA 3EB2A 1J93A 1LM1A 2VDHA 2E40A 3VNIA 1XLEA 4K3ZA 2J7GA 3P74A 3ZT6A 3G5EA 4M7SA 2G4JA 4E3VA 3RRAA 2VVNA 3T7VA 3CIWA 3II1A 5A95A 4M19A 1R0MA 3VKKA 3L5AA 5C9UA 4PMQA 1KM3A 3BAIA 4QDWA 4NAEA 1GOWA 1A0DA 3VK5A 4S2BA 3W07A 1GORA 1B30A 2Q71A 1RLCL 1V7AA 5KMYA 2RDWA 4HCHA 5EY5A 2QCDB 3U3HA 2BODX 1CLXA 1JDFA 5I7GA 3SY8A 1GVIA 2Z4GA 2FQIA 4Q22A 3G1YA 1DORA 3O07A 5ENLA 5GJPA 3GVQA 5EFDA 4OECA 1H7NA 3PFRA 1J0KA 5KZ6A 5DMMA 4Q6JA 4A2RA 3BV7A 3NFUA 1P6BA 3DERA 1RVKA 3W73A 4DJFC 2CHNA 1WUEA 4GCAA 3M7WA 5LNSA 1ECQA 4NJHA 1YPFA 1P43A 1C8XA 3RK8A 4JEQA 3W2JA 2VGFA 3R8GA 3M5VA 3K1GA 2RHGA 3BLDA 2V5DA 3MP4A 4Q8WA 1OABA 3P80A 3U8GA 1WAUA 4I5RA 3DH7A 2Z26A 3WD4A 4L65A 1F8MA 1GJPA 4I5XA 3W72A 3WUGA 4L1GA 6A3HA 4I7VA 1J8VA 4OBSA 4DXKA 1RA5A 3EPOA 4PULA 4AYGA 4UNKA 4J3ZA 3T0DA 2DZVA 4HQVA 4PTXA 1H7WA 1R47A 1VHNA 1UC5A 1E5JA 4F0HA 2YA0A 3KTCA 1KCXA 3EA1A 2ISSA 4AWEA 2VL4A 3Q4DA 3QKEA 1G4EA 3R7MA 4ENLA 1J18A 1GGOA 1YE6A 1LP6A 4S3FA 3QF0A 4GPNA 2EPHA 5FF4A 4LB4A 3QW3A 3QOMA 7ENLA 4HZ7A 2CU0A 1Q6FA 5LGXA 2W9MA 3S5SA 5C7VA 1UQYA 4RNIA 2R9RA 2H9AB 1I2QA 3GHSA 3PBVA 1XCXA 4U3CA 1JCLA 4N7QA 1TIMA 4NUWA 4S1FA 2DJXA 3RLGA 4QHRA 5I0DA 1TA3A 4K7VA 3ZQ9A 2VX5A 4XBKA 1QRQA 3BICA 3WQOA 3BW4A 4AZ5A 5BZAA 3WMBA 2QUTA 1QPOA 1WXJA 4JX6A 1E6RA 2QQ6A 4Z1DA 1GPWA 3A5VA 1MFVA 2UY2A 4IMAA 4MY9A 2NQ5A 4RLIA 4X0NA 2E28A 1TPDA 3G3DA 4PBEA 1TVNA 1J5SA 1X96A 3GC5A 3WLIA 1ZALA 2I9EA 1GUVA 1YTKA 3H54A 3ZR4A 1DE6A 4RK8A 4J2MA 3IJLA 4NT0A 3BLKA 4QG8A 3QZAA 4XZ9A 5HR7A 3IAQA 1MXSA 4ASTA 3AYTA 3FA5A 2PTDA 3FGCB 4MLRA 5AECA 3N2OA 2D1ZA 4L9ZA 1Y0EA 3ARZA 6XIMA 2X2YA 4XVEA 3SUVA 4DJFA 5H2ZA 4O4WA 1TV8A 3APGA 1KLYA 3RNDA 3KBSA 4X9YA 3S2NA 3S6TA 4RNJA 4AW7A 5D9PA 4A8NA 3CMFA 3E3HA 1KBIA 4YIWA 1L6SA 1E43A 4IZGA 1H60A 2AQVA 5CBJA 3CT2A 1OCNA 5E0FA 3VZXA 6TAAA 3GTHA 2GOKA 3N12A 1EJWC 1UA7A 1F4HA 3O3RA 4HU4A 4AZ7A 2GGHA 3KVMA 2YR1A 3EOEA 3ZLHA 4UMBA 1XV8A 2B7PA 1NSJA 1BQCA 1V02E 3KTXA 1R3RA 3IIVA 3I4EA 4N4PA 3OA5A 3UXDA 4DJED 4UR7A 1BGGA 4FNRA 4AU0A 3EA2A 1SZNA 5D9MA 1V51A 2WQDA 2X30A 3H26A 4MDOA 2Q09A 3QH2A 3IVTA 5DXXA 4QEEA 1W1YA 3KCLA 5BOOA 3WEMA 2FDSA 4JL1A 5CPTA 1WXYA 3CAWA 4FXSA 1IGWA 5K3VA 2DZPA 1A5BA 2YBTA 1JULA 3DHUA 3SSJA 1KWKA 3OLGA 1LOLA 1AMKA 3ZR6A 2ZRUA 2FTPA 2YKKA 4UFIA 2WHJA 5DMNA 4AXKA 3EWXA 3DFTA 4D1JA 2C3ZA 2INZA 3PTQA 4I9TA 5FL1A 2I1OA 4R7JA 4NNAA 1J4EA 3LSCA 3UP8A 4ERGA 3NQVA 3WH6A 5CPQA 3SRKA 2V8ZA 3LM7A 4HOWA 2Y7EA 2QCFA 4TVUA 1DWFM 4UMCA 4DAFA 2DT3A 1EXBA 3Q37A 4IM4A 1TTIA 3G1RA 2J7HA 1MEIA 4HSOA 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