4HZ6A

Crystal structure of bglb
Total Genus 176
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
KKFPEGFLWGAATSSYQIEGAWNEDGKGESIWDRFTRIPGKIKNGDSGDVACDHYHRYEQDLDLMRQLGLKTYRFSIAWARIQPDSSRQINQRGLDFYRRLVEGLHKRDILPMATLYHWDLPQWVEDEGGWLSRESASRFAEYTHALVAALGDQIPLWVTHNEPMVTVWAGYHMGLFAPGLKDPTLGGRVAHHLLLSHGQALQAFRALSPAGSQMGITLNFNTIYPVSAEPADVEAARRMHSFQNELFLEPLIRGQYNQATLMAYPNLPEFIAPEDMQTISAPIDFLGVNYYNPMRVKSSPQPPGIEVVQVESPVTAMGWEIAPEGLYDLLMGITRTYGKLPIYITENGAAFDDQPDQSGQVNDPQRVGYFQGHIGAARRALADGVDLRGYYAWSLLDNFEWAEGYSKRFGIIYVDFETQQRTLKQSAQWYRDVIANNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into the substrate recognition properties of beta-glucosidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Uncultured bacterium
total genus 176
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4hz6A00
2NW0A 5I23A 5D9MA 5I79A 1KQZA 3WENA 4TX6A 1VJZA 1JZ2A 2PC8A 1RPKA 4V2XA 4UZSA 4W86A 2WKGA 1TE1A 3MUY1 1UZ4A 2A3HA 3AIWA 2VMFA 1R8LA 3F5JA 1A3HA 4BQ4A 2XM1A 4JKKA 3W53A 2TAAA 4W5UA 4LX4A 3VTRA 1E4NA 1E40A 4N0RA 4AD0A 5FL0A 1BGAA 3SUTA 4LQ1A 1ZBKA 4D6FA 3VMOA 1WDPA 2W92A 1VBUA 3K8KA 5F7UA 1E6NA 3PN8A 3B9AA 3VKKA 2X0YA 1WZKA 1E4LA 4BA0A 4HMEA 5DMYA 3MSGA 4AY1A 1BYDA 1EDGA 5EB8A 1CPUA 2G3MA 1OGBA 2Y4SA 4UQDA 4BS0A 3WF1A 3ZIZA 3GM8A 3O2LA 4CN1A 2EBNA 1E15A 1NOFA 3W28A 1KBBA 1MQQA 5LYRA 1NOWA 4MJ4A 2YKKA 1LL6A 5CSYA 4OIFA 1VEOA 1ZS2A 2ZXBA 3AROA 4DM1A 2E4TA 1HVQA 4KGJA 3WDQA 2CCRA 3TONA 5BYWA 3RIKA 1OIFA 2G3NA 2W5FA 2XSBA 1ITCA 3CUFA 3TTYA 4PTXA 1U33A 2YOCA 4WKFA 3AXXA 4HOXA 2YA1A 3EMCA 4M82A 1UA3A 3BAXA 3W0KA 2HISA 5FOOA 3NSMA 3M6DA 4HPGA 2D3NA 3AIQA 4CGTA 2FHFA 3OLGA 4LXFA 1HL9A 1HIZA 1UD2A 4A3HA 1E3XA 3APGA 3SCPA 4OOZA 1JF6A 2WMFA 4LGXA 2D0GA 1FH7A 4AIEA 1M01A 4C7GA 1C3FA 4KH2A 3B9DA 1WCGA 5LA2A 4J27A 2PBGA 2XIIA 3WBAA 1ODZA 2Z1KA 2DT1A 3WQ5A 2YDSA 3TTSA 1V6VA 1W1YA 4OKDA 2VUYA 4PMDA 3A4WA 2A3CA 5GQBA 2BVTA 2WPGA 3ZSTA 3K46A 1N82A 4IPNB 1J0HA 1FHLA 2V3EA 2E0PA 5I0DA 1DWJM 1E6RA 4B3LA 2VVNA 4BCEA 3TP4A 2CKRA 4YHEA 1JD7A 2ZUSA 1Q6GA 2VZUA 2WZEA 1M7XA 1RH9A 2DSZA 3OA5A 2CYGA 2D1ZA 1BLIA 1E0WA 1HJXA 3VGDA 2E40A 2VVSA 2VOTA 3WDPP 1EQPA 2OWCA 4J3TA 3WD0A 1WPCA 3EDEA 2W4XA 3I3DA 2ZICA 3AS2A 2BVYA 1CXHA 1A47A 1MW3A 3KL5A 3OGSA 2X09A 3ZJKA 1IZJA 5IHRA 5AYBA 1UKQA 1MW0A 1V6YA 4E8DA 1NOUA 5C8BB 2QHAA 1B0IA 3VGBA 2J7HA 1BVZA 3DYPA 1UQYA 3VX0A 1MWOA 3ARUA 4M56A 1DP0A 1TVNA 5CGTA 1V02E 4H8HA 4P7LA 1QHPA 3ARSA 3VD3A 1E5NA 4FLSA 2ZX8A 5A8QA 4WJXA 2J47A 3BXWA 4XZWA 3ZJ6A 2IXUA 2OYMA 1JZ8A 3FAWA 3WY1A 2ZX9A 3T09A 3WNPA 3VU2A 2FH8A 4PSPA 6CGTA 2BHUA 3CHEA 3SCUA 4UQBA 3QHNA 2WB5A 5HDRA 2J7BA 3T0AA 4FK9A 2W66A 5A1AA 2WCSA 3W25A 5DO8A 1H4PA 1BG9A 2VCCA 1BYAA 2XHYA 5D8ZA 2CBVA 1W32A 1L0PA 2GK1A 4QLJA 4DWSA 1DWIM 1V0MA 2WBGA 5HXMA 3O9NA 1QOXA 1B2YA 5E9AA 1MFUA 1HX0A 3AS0A 4HU0A 2OSXA 1VRXA 4M29A 4AZ6A 2DH3A 5EFDA 5KZ6A 2OSYA 4HMDA 2VX7A 3L4ZA 3WL0A 2J79A 3F5KA 1UR4A 3BMVA 2EPLX 3PZOA 2DIJA 1J0IA 1IZKA 2XGIA 1GZJA 3QOMA 4R27A 2D22A 3NDZA 3DECA 2O9TA 1DHKA 4MB1A 3F5LA 5BXTA 5M03A 3WMCA 3VDBA 2EPMX 3AHYA 1UD4A 1S46A 1UHVA 1J0ZA 1UD5A 1RP8A 1M03A 2QPUA 1UYQA 1C8XA 3UR8A 1US3A 2VNCA 1HJUA 4MDPA 4ACZB 1CGWA 2QV4A 1J0YA 9CGTA 1G9HA 1U30A 1VBRA 3FAXA 1MYRA 4U3AA 3GH4A 3L4TA 4H04A 4UOJA 1HJWA 5EBAA 2ZXQA 5LA0A 4PMVA 2WVSA 4GINA 5JIPA 5A8MA 1K9DA 1W9UA 1QW8A 4PSRA 5HPCA 2YBTA 3VINA 5LA1A 1GOWA 1J0KA 4JFSA 3BAKA 4BQ3A 1E9LA 3WSUA 1W1VA 4J3WA 4PEEA 1GONA 1GOKA 1LG1A 3MUZ1 1B3ZA 2Y24A 4CU7A 4F9JA 2A3EA 1VFOA 1B1YA 1UG6A 3W24A 3WKZA 1OSEA 2XG9A 2J77A 3A3HA 1E0XA 1E6SM 1G1YA 2XFYA 3ZMRA 2J4GA 2BXZA 3WUBA 2UY2A 2UY5A 4V28A 1LLOA 3AI0A 3VM7A 4D6HA 1I1WA 1K9EA 3MMDA 3WDHA 4TOQA 3IAQA 3WN6A 1W3JA 4MDOA 1H5VA 5D8WA 2DGAA 4HOWA 2DT0A 4AZCA 2D0FA 1GOMA 5HOSA 1XD0A 3N18A 3VNZA 5IHSA 2IUZA 2GSJA 3WH8A 5DF0A 1HKJA 2O9RA 3U57A 1XYFA 1P6WA 3PZMA 1JYVA 1GCYA 2X1IA 1ZBWA 4GQRA 1D3CA 5JBFA 4X0NA 5IDIA 4AMCA 1H41A 3W27A 4CD6A 1BYBA 1NWSA 1UH2A 2FGLA 2J8FA 3BLPX 3SCVA 1VFUA 2W91A 3ARYA 3KE0A 2WCGA 1H1NA 1MQPA 4CVUA 4KGLA 4X9YA 4JL2A 4EAMA 4LYPA 1OGGA 3BAIA 4DUVA 1L8NA 2VX4A 3WQ4A 3SUUA 2J7DA 3CHCA 2V5DA 1H3GA 2V38A 3DYOA 4UQAA 1UWRA 3VIKA 4AWEA 4EKJA 3LPFA 2G8ZA 3TOPA 3ARWA 4KWUA 3WF3A 1JZ6A 1V6XA 1V3LA 3WF4A 1XSIA 4PMNA 2YL6A 3FW6A 5BXRA 5A69A 2VRKA 2JE8A 1DEDA 5A6KA 2V5CA 3ALGA 4RE4A 5AC4A 4YHGA 1W1PA 4ZEPA 2DIEA 3WF2A 3QOKA 1WB0A 3LPOA 3AXHA 4D72A 4AEFA 1EQCA 1D2KA 3POHA 3WEMA 2CETA 2WZIA 1OM0A 3I3EA 1KXVA 3M07A 4AD1A 2EO7A 1UR8A 2O9PA 1B90A 2Z1SA 1KCLA 3A4AA 1E5JA 4OBRA 5CPSA 4HU8A 2CNCA 4Q7NA 1UR9A 4XUYA 3WIJA 3VIHA 3VIMA 4WKHA 3ARPA 3MKKA 4CU6A 1M53A 4QLLA 4HZ8A 1GQKA 1JFHA 2JIWA 2WMJA 3WDIA 1X6LA 4QDMA 4M81A 2FHBA 1JF5A 1VJSA 1KXTA 4WSJA 3CO4A 2ZE0A 1FOBA 3OGRA 4M24A 3II1A 1IT0A 4XX6A 1YHTA 2WMGA 3VGFA 2C0HA 1GUVA 5I77A 1K9FA 2YL9A 2WMHA 4BQ2A 1WZLA 1B3WA 1ISWA 1UWSA 3VVGA 2E3ZA 5M17A 3G6MA 1OWQA 2D0HA 1PZ3A 3N1AA 4JFWA 4FLOA 4KRTA 2YLAA 3AQUA 1EHAA 5I6SA 3NUKA 5GNXA 1UWIA 3AOFA 1NP0A 3SURA 1C91A 4U5IA 1LG2A 4OOUA 3GXDA 4P7OA 4E4PA 4JHOA 1XHGA 3VGEA 1J10A 4E8CA 4CU8A 2VT0A 3A4XA 4U31A 4D6DA 1LL4A 2WKLA 4TTGA 3QHMA 1GNXA 1QBAA 1K9TA 5A6MA 2VX5A 1XC6A 3ECQA 1DTUA 1EIBA 4UFKA 3UERA 4X0VA 5A3HA 1BVNP 4ACZA 4D6GA 3RDKA 4N42A 1XH0A 1M04A 4PMXA 1EDTA 3CZJA 1KGWA 3AXIA 2YLLA 4Z2IA 3ZO9A 4BF7A 3VM5A 2JEQA 1GW1A 2EPKX 2G41A 3L4WA 4M8UA 1Q6EA 1NWTA 3FHAA 3BSGA 3OLEA 4PMYA 1CGYA 1HJQA 1EOKA 4FLQA 4UNIA 2DT3A 5CPTA 1EH9A 3CUIA 5JBEA 1ZBCA 3ALFA 3T0BA 4EE9A 4MB4A 5A94A 4PMZA 3WUGA 2ESCA 1CGXA 4CUCA 1E6XM 1LL7A 3ARXA 4P7QA 4H8VA 3AMKA 4W87A 1V3IA 1JYNA 1AQ0A 3WBEA 4AZCB 1E73M 3VOCA 1NM9A 1CXEA 1V08A 3G6LA 3OZOA 2ZX6A 4L4PA 2ZIDA 2D3LA 3MUIA 1HKMA 2QPSA 3MANA 3RJYA 3QR3A 4Z2JA 1UWTA 3W37A 5A95A 3M7SA 4JHZA 4LPCA 1CLVA 3VDAA 4TVDA 4HOZA 1NP2A 4PBGA 2GDUA 1W91A 2VRQA 2WZHA 3L4VA 2J8GA 2WWCA 1EO5A 1GPFA 4U2YA 3PZTA 4DWSD 1F4AA 2BY3A 4HMCA 3AISA 4MPKA 4QP0A 1R87A 2V3DA 2BV9A 2ZXDA 4MB5A 4F8XA 4UCFA 4W8BA 1OGSA 4NRRA 3EMQA 1JYWA 1BGGA 5A2CA 1XCWA 4PTWA 2C8NA 4K68A 2VO5A 2VQTA 3W6MA 2CBUA 5D4YA 1V3KA 1C7SA 2E9BA 1QI5A 5BCAA 4ZFMA 2BFGA 2X05A 7CGTA 2YJQA 3OG2A 3T2PA 4J7RA 5HPOA 2YDRA 1MXDA 2WXDM 1GOQA 2YA2A 3BCDA 1XYZA 3EBVA 3GDBA 2YBUA 3SCQA 3SUSA 3AZRA 3K8MA 3SCWA 4TX8A 2WVVB 1BAGA 4PCSA 2X8RA 2EJ1A 1TCMA 4OZOA 3LPPA 5A6JA 2WC4A 5AC5A 2DDXA 3NDYA 3ZJ7A 1QHOA 2WSKA 4CD4A 1PX4A 4UFIA 5A6AA 1FHDA 4UQCA 5IFPA 3AJ7A 3KL0A 2XGBA 5AYIA 1I1XA 3PZUA 4TVCA 2F8QA 3WEZA 3UG5A 4OBSA 1HXJA 3ZOAA 2ZUNA 4CD5A 3GXMA 4TTUA 2GJXB 1UWQA 2YL8A 4HZ7A 2DQXA 2CHNA 3VPLA 3IJ8A 3WH7A 4DUXA 2VL4A 2CIPA 1GORA 4GKLA 3D5HA 1C93A 2Y2WA 5CLWA 2XVPA 1J12A 5FKYA 3A47A 1QW9A 1WKYA 3UESA 3ZR6A 3WNOA 3CIVA 1ZBVA 3E1F1 3GBEA 5A2BA 5BXPA 1VB9A 4NSBA 3AZSA 4FF5A 1HP5A 1ZJAA 3GNRA 3BC9A 1KR0A 1PZ2A 1JI1A 3SCTA 2DSWA 4QCEA 4PMRA 4U5KA 3CMJA 4GXPA 1KWKA 2HVMA 1WZMA 3WH6A 4F79A 2ZUTA 3VIIA 1C92A 2EPOA 1OT1A 2ZWYA 3GH7A 2CXGA 2XPKA 7A3HA 1FFRA 2XUCA 3GBDA 1US2A 3VIJA 1KB3A 2OWWA 3SEPA 1HJVA 4D6IA 4IM4A 1JAKA 1NWRA 1TMQA 2A3BA 2OSWA 3NCOA 4AZ5A 4DWSC 4QLKA 1JXJA 5KEZA 2XVLA 1GHSA 2WM0A 1VIWA 3VMPA 1C8YA 2W67A 1C7TA 4QCFA 2VR5A 1ECEA 2WCAA 4NZCA 4JFVA 4UOQA 1TUXA 1ITXA 4XV0A 3WELA 2B31A 2GDVA 3BGAA 1V02A 3GZAA 1E0VA 4PUDA 2A3AA 4H7VA 2C7FA 3K8LA 4P8WA 1J0JA 1I75A 1FH8A 1XSKA 1V0KA 1HF6A 3WNLA 1BG4A 4AZ7A 5DT7A 2J75A 1XGZA 4Q22A 3KZSA 5DEZA 2VURA 4D1IA 3HJEA 1TVPA 4JAWA 2XVKA 3FNDA 1KFWA 1E72M 4JKLA 2QF8A 1GOOA 3BAJA 3WDRA 1RD6A 4V27A 3SIMA 5I24A 2J74A 3CHFA 3N17A 4HA3A 3N15A 3WFLA 1QPKA 2VZTA 3GH5A 1EOMA 2ZXAA 2WHJA 1MVYA 1KXHA 2E8YA 3PBGA 4U3CA 5D9OA 5ABGA 1WDQA 4IUGA 2BXYA 1E70M 1QI4A 1BTCA 2D24A 3KWXA 1TA3B 5GNYA 4W88A 3AHVA 5DFAA 4MNLA 1XSJA 4P8XA 1CGUA 1W2PA 1BHGA 1DWGM 1TR1A 1HKKA 2J62A 1LWJA 4FLRA 4JKMA 1OCQA 4MJ2A 3VX1A 4MTVA 1XCXA 1ESWA 3BH4A 5ABFB 4QFUA 1VFMA 2YDQA 3GYCA 3WEOA 4HTYA 3CH9A 1W9DM 1ODUA 3UR7A 5BROA 4L4OA 3CTTA 1GQJA 5HNNA 1JNEA 1G94A 4W93A 1B3YA 2J25A 1JNDA 1CNVA 2WSPA 2NT0A 4GO9A 4UFJA 2XVNA 5I2UA 1NH6A 1FA2A 3WUFA 2YIHA 3J7HA 1DWFM 1SMDA 2W63A 2ZWZA 3UG3A 1X1NA 4PN2A 1CLXA 4WF7A 1EDQA 2BHYA 3DHUA 2D2OA 2VCBA 3GNPA 2JIEA 1JGIA 2OLHA 3AHXA 2EQDA 1R7OA 1U2YA 1GJUA 2WW5A 3AMLA 5E0CA 1XH1A 1EGZA 1CYGA 5CQ1A 1W3KA 2XFFA 1UH4A 1VFFA 4AZHA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2NW0 A;  5I23 A;  5D9M A;  5I79 A;  1KQZ A;  3WEN A;  4TX6 A;  1VJZ A;  1JZ2 A;  2PC8 A;  1RPK A;  4V2X A;  4UZS A;  4W86 A;  2WKG A;  1TE1 A;  3MUY 1;  1UZ4 A;  2A3H A;  3AIW A;  2VMF A;  1R8L A;  3F5J A;  1A3H A;  4BQ4 A;  2XM1 A;  4JKK A;  3W53 A;  2TAA A;  4W5U A;  4LX4 A;  3VTR A;  1E4N A;  1E40 A;  4N0R A;  4AD0 A;  5FL0 A;  1BGA A;  3SUT A;  4LQ1 A;  1ZBK A;  4D6F A;  3VMO A;  1WDP A;  2W92 A;  1VBU A;  3K8K A;  5F7U A;  1E6N A;  3PN8 A;  3B9A A;  3VKK A;  2X0Y A;  1WZK A;  1E4L A;  4BA0 A;  4HME A;  5DMY A;  3MSG A;  4AY1 A;  1BYD A;  1EDG A;  5EB8 A;  1CPU A;  2G3M A;  1OGB A;  2Y4S A;  4UQD A;  4BS0 A;  3WF1 A;  3ZIZ A;  3GM8 A;  3O2L A;  4CN1 A;  2EBN A;  1E15 A;  1NOF A;  3W28 A;  1KBB A;  1MQQ A;  5LYR A;  1NOW A;  4MJ4 A;  2YKK A;  1LL6 A;  5CSY A;  4OIF A;  1VEO A;  1ZS2 A;  2ZXB A;  3ARO A;  4DM1 A;  2E4T A;  1HVQ A;  4KGJ A;  3WDQ A;  2CCR A;  3TON A;  5BYW A;  3RIK A;  1OIF A;  2G3N A;  2W5F A;  2XSB A;  1ITC A;  3CUF A;  3TTY A;  4PTX A;  1U33 A;  2YOC A;  4WKF A;  3AXX A;  4HOX A;  2YA1 A;  3EMC A;  4M82 A;  1UA3 A;  3BAX A;  3W0K A;  2HIS A;  5FOO A;  3NSM A;  3M6D A;  4HPG A;  2D3N A;  3AIQ A;  4CGT A;  2FHF A;  3OLG A;  4LXF A;  1HL9 A;  1HIZ A;  1UD2 A;  4A3H A;  1E3X A;  3APG A;  3SCP A;  4OOZ A;  1JF6 A;  2WMF A;  4LGX A;  2D0G A;  1FH7 A;  4AIE A;  1M01 A;  4C7G A;  1C3F A;  4KH2 A;  3B9D A;  1WCG A;  5LA2 A;  4J27 A;  2PBG A;  2XII A;  3WBA A;  1ODZ A;  2Z1K A;  2DT1 A;  3WQ5 A;  2YDS A;  3TTS A;  1V6V A;  1W1Y A;  4OKD A;  2VUY A;  4PMD A;  3A4W A;  2A3C A;  5GQB A;  2BVT A;  2WPG A;  3ZST A;  3K46 A;  1N82 A;  4IPN B;  1J0H A;  1FHL A;  2V3E A;  2E0P A;  5I0D A;  1DWJ M;  1E6R A;  4B3L A;  2VVN A;  4BCE A;  3TP4 A;  2CKR A;  4YHE A;  1JD7 A;  2ZUS A;  1Q6G A;  2VZU A;  2WZE A;  1M7X A;  1RH9 A;  2DSZ A;  3OA5 A;  2CYG A;  2D1Z A;  1BLI A;  1E0W A;  1HJX A;  3VGD A;  2E40 A;  2VVS A;  2VOT A;  3WDP P;  1EQP A;  2OWC A;  4J3T A;  3WD0 A;  1WPC A;  3EDE A;  2W4X A;  3I3D A;  2ZIC A;  3AS2 A;  2BVY A;  1CXH A;  1A47 A;  1MW3 A;  3KL5 A;  3OGS A;  2X09 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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