4IPLA

The crystal structure of 6-phospho-beta-glucosidase bgla-2 from streptococcus pneumoniae
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
469
structure length
460
Chain Sequence
TIFPDDFLWGGAVAANQVEGAYNEDGKGLSVQDVLPKGGLGEATENPTEDNLKLIGIDFYHKYKEDISLFSEMGFNVFRTSIAWSRIFPKGDEEEPNEAGLKYYDELFDELHAHGIEPLVTLSHYETPLYLARKYHGWVDRRMIHFYEKFARTVLERYKDKVKYWLTFNEVNSVLELPFTSGGIDIPKENLSKQELYQAIHHELVASSLVTKIAREINSEFKVGCMVLAMPAYPMTPNPKDVWATHEYENLNYLFSDVHVRGYYPNYAKRYFKENDINIEFAAEDAELLKNYTVDFLSFSYYMSVTQSALPTQYGLVNPYLESSEWGWQIDPIGLRIILNRYYDRYQIPLFIVENGLGAKDQLIKDELNNLTVQDDYRIQYMKEHLLQVAEALQDGVEIMGYTSWGCIDCVSMSTAQLSKRYGLIYVDRNDDGSGTLNRYKKMSFTWYKEVIESNGESLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural insights into the substrate specificity of a 6-phospho-&[beta]-glucosidase BglA-2 from Streptococcus pneumoniae TIGR4
pubmed doi rcsb
molecule keywords 6-phospho-beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 178
structure length 460
sequence length 469
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.86: 6-phospho-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2013-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4iplA00
4OBSA 2EPNA 3FXYA 3CMJA 3W4RA 5A8MA 2JF6A 2WXDM 3GXFA 3CHDA 2PC8A 2UY2A 5FCZA 1BVZA 1UZ1A 1E3ZA 1BYAA 2VC9A 1BFNA 2WVUA 4PBGA 3IANA 1AQHA 4HZ8A 1HXJA 3WF0A 4KRUA 5I79A 3WNNA 3NJ3A 8A3HA 4JZ5A 1UWIA 2WKLA 1BGGA 3W37A 4AD0A 1MVYA 3WUFA 4D6JA 2WMHA 4W89A 4HPGA 1QBAA 1VFOA 1WZLA 3MUIA 1CECA 3DYPA 4TVDA 1JNDA 3AFBA 2ZWZA 3RM9A 5I23A 2O9OA 3M07A 4X0NA 4QCFA 4P7QA 3AIVA 3SCRA 5ABHA 3VDHA 4AW7A 3AYRA 2GJPA 1FH7A 3L2LA 1V3KA 2W92A 2XG9A 4KGLA 1WDSA 3ARWA 4J3XA 5EMYA 5AYIA 3WUBA 4YN5A 1UD8A 1C8YA 1J11A 4IISA 4EAMA 1BGAA 5DT5A 4PSPA 1SYTA 2JIWA 3ALFA 3CUIA 2G4FA 1DWHM 3CGTA 3IJ8A 4V28A 4U33A 5BYWA 1TUXA 4LYRA 2W5FA 1C92A 3VIGA 3WEOA 1JZ7A 3PZGA 3T2QA 1B30A 3WNPA 3GNOA 2WKGA 1UKTA 5FD0A 2QV4A 1NOWA 1PX8A 5BRPA 2CBUA 2WHMA 5AC4A 5JBDA 1E5JA 1ZBVA 3WNLA 2EXOA 4U2ZA 3T2OA 3W53A 1JAEA 1QNSA 2IUZA 4PMUA 1JL8A 2ZUSA 4LX4A 4PMRA 4TTUA 3ZQ9A 1O6IA 3SCOA 1KXHA 2A3HA 3VX1A 1EQCA 1QPKA 2D0FA 4Z2GA 4OUEA 3W28A 3L4TA 3N04A 3U5YA 1VFUA 2X1IA 2CBIA 4TOQA 2JE8A 2ZXDA 3RCNA 5CGTA 1E6ZA 1J10A 2BHZA 1EDTA 4EKJA 1FHDA 2J4GA 3VVGA 1I1WA 2ZXQA 3WD3A 1V3IA 1MFVA 2ZIDA 2RGMA 3AIEA 3OLDA 5BXPA 1CGVA 4MB4A 1CYGA 2EPKX 3A4WA 4GZEA 4QLLA 5A6LA 4HA1A 3WD2A 4MJ2A 5I6SA 1B90A 3CMGA 1HIZA 4PMDA 1MW1A 2VVSA 4OOZA 1B31A 3L4ZA 1BG4A 4AEFA 6A3HA 3F4VA 2V5DA 2B31A 2PB1A 1PPIA 2ZUVA 4Q22A 1DWJM 2CERA 2QPSA 1U2YA 3AQUA 1KWKA 4Z2HA 4J28A 2ZUTA 1NQ6A 1J0HA 3ARTA 2CCRA 3ARPA 4B3LA 3W26A 3K4AA 1GW1A 2IXUA 4F8XA 3W81A 5HPCA 2E40A 1FFRA 4P8WA 3WELA 2JF7A 2W62A 3SUVA 3MO4A 2ZXBA 1QHOA 3AMLA 1KCLA 1W9DM 4ACZB 2O9TA 3AHVA 1UWRA 4BQ3A 1KCKA 2BFGA 3I3BA 3D5HA 5DEZA 1FP9A 1V03A 3WNOA 2EQDA 2MANA 3AZSA 1TVNA 1ECEA 3VINA 3WNKA 2OYKA 4BQ4A 2GFTA 1FH9A 3WD1A 3WKZA 1E9LA 3ZJKA 5FL0A 4HZ7A 1C3FA 1C90A 2J79A 4KMQA 2HVMA 4CD5A 3PZOA 2O9RA 1M7XA 3KEHA 4WIWA 1CBGA 1UWTA 4PMXA 4WLCA 2ZUMA 4Q7NA 1EDQA 5D9OA 3WQ4A 2VZVA 4X9YA 3W6LA 2JIEA 4UCFA 3VD3A 8CGTA 4D72A 1UD6A 1PEZA 2VJXA 5AC5A 4DWSC 1LL4A 2DSKA 3A4XA 3DC0A 1ZL1A 1GOKA 2JALA 2Y5EA 1JZ6A 4W85A 1V6WA 2NW0A 1JFHA 3WDJA 2NT0A 4FLOA 3TTYA 1D2KA 4BQ2A 5HBFA 2XSBA 5BXTA 3IJ9A 2ZX8A 3WH9A 2CKSA 1V6YA 3ZT6A 3GZAA 3UG5A 3VGEA 1GPFA 2DDXA 5C8BB 1W1VA 3AXIA 3NUKA 4QDMA 1CEOA 1PIGA 1TE1A 2XVLA 1VEPA 4GI6A 1UKSA 4EE9A 5I3DA 4OOUA 3SCSA 3VGFA 1V3JA 1CXEA 4H7VA 4JHZA 4JFWA 1UD2A 3TP4A 2D1ZA 2VT0A 5HDRA 1MXGA 2WM0A 4XUYA 1QW9A 3CUGA 1JI2A 5CLTA 3AISA 4DUXA 4M56A 1UKPA 3W6MA 1HT6A 3CO4A 4HZ6A 1UA7A 4XZWA 1E6XM 1BYDA 1H5VA 3AS0A 3WH8A 3BC9A 4UQAA 3CZJA 2DSWA 1QNOA 2IXVA 4YHGA 5IFTA 1Q6DA 1HN1A 5LA2A 2DH3A 1E6PA 1E6QM 3G6LA 4DWSB 4MB1A 3OIHA 3WDIA 1CXLA 1DEDA 4GXPA 3MANA 1QVBA 3L4YA 3UEQA 2XIBA 4HTYA 4EANA 3MUY1 1JD7A 3BSGA 1CDGA 2J25A 5EB8A 4GZIA 1WZMA 4B9ZA 1RP8A 5CLWA 2VZOA 1GQKA 1PAMA 3KL0A 1HJUA 2VI0A 2DIJA 3UERA 3PZTA 2X05A 1M03A 4DWSD 3RDKA 2QMJA 3CZGA 3WN6A 4JFUA 5D9NA 1CPUA 5I2UA 5A6BA 1JI1A 1PX4A 1GQJA 1E56A 5A3HA 1UOKA 3VMNA 1ITXA 3CIVA 4E2OA 1QHPA 1CGUA 2WZHA 3L4XA 2YOCA 4AC1X 4W8LA 2CHNA 4QLJA 1JYVA 4U3AA 4URIA 4B9YA 2FH8A 4CCCA 3HN3A 4PTWA 3DHPA 2DPEA 4UFHA 3VIPA 3EMZA 1YQ2A 1I1XA 1QNQA 3WDQA 1B1YA 4H8VA 2XVPA 3CZLA 5EFFA 3WL1A 1SMAA 2JEPA 1CZ1A 4UFMA 2ZUNA 2VCCA 4B15A 5JUVA 1R7AA 5BWFA 1DWGM 2Z1KA 3AXXA 4C7GA 4AMCA 4HMDA 1OT1A 1CLVA 1BTCA 1QOXA 1LJYA 2E9LA 4P8VA 5IHRA 1M01A 2BHYA 2X0HA 2F8QA 1VBRA 1H09A 3PTMA 2PWFA 3ZT7A 1W32A 4PMOA 4HA4A 3NDYA 1ZS2A 3LPGA 2DH2A 2DQXA 1LL6A 3WIJA 2CETA 4CN4A 2G3MA 3WF2A 2YL9A 2E8YA 3W25A 1UYQA 5CPSA 3VDAA 1HP4A 4NRRA 1OD8A 5A1AA 4UQCA 5A6JA 3OLEA 3CUFA 1XV8A 3SUTA 4DM1A 2PWGA 1B0IA 3KL3A 4XV0A 4GIAA 3POHA 4M29A 2QMKA 1K9EA 1OM0A 1NWUA 3GTNA 4W7WA 3NSNA 4JFVA 3UETA 1B9ZA 1UUQA 2PWEA 3M7SA 1ISVA 3APGA 3OLIA 3ZR5A 2VX6A 1H11A 1TG7A 2D0HA 1EHAA 4M1RA 4AZBA 1VEMA 1E0XA 4DM2A 2WLZA 2YBTA 2DSZA 1KR0A 4UR9A 2V5CA 1V02A 1H41A 2EEXA 1E72M 2YIHA 1JD9A 2JEQA 4IUGA 1EHNA 1K9TA 3QHOA 1QHZA 1XD0A 4MB3A 2G41A 2XPKA 1GVIA 1LG2A 2V38A 2WW5A 2PWDA 5M17A 4FF5A 5CGMA 4AWEA 4MAZA 1CENA 3K46A 2YJQA 1US3A 1XCWA 2X09A 2YLLA 3ZM8A 4WKAA 2FHCA 3THDA 1GNXA 4AY1A 2XWDA 3BAYA 1W3JA 4H8HA 2X0YA 4MPKA 1VENA 1EO7A 4GZJA 4A3HA 4PCSA 1UHVA 2XIIA 2VOTA 2BVDA 6TAAA 3PZVA 4MDOA 3CPUA 3BAKA 4M81A 4UZUA 1EDGA 3II1A 2V3FA 4L4OA 1Q6CA 4ZXOA 5A2CA 3E1F1 4A4AA 1GCYA 2J62A 3RM4A 2ZX9A 1E70M 3NIYA 1UR4A 1H1NA 1J0YA 2XGBA 1PZ2A 1XYZA 4OZOA 2VZTA 3K4DA 4E8CA 5DO8A 1WZKA 1XSJA 3VGDA 5JBFA 1MQPA 1XSIA 1W9UA 3RMEA 5FOOA 1E1FA 2UY5A 2VMFA 5A94A 4BA0A 2WMKA 4AIUA 2OSWA 5A6AA 4OJYA 1ISYA 1JG9A 5DT7A 3BAXA 3BAWA 3WD4A 1GQLA 1UD4A 1B2YA 3W29A 1R86A 1VJZA 3A47A 1VB9A 3EDFA 4U2YA 5DF0A 2ZE0A 4J3SA 5E6ZA 3L4UA 4CGTA 5D4YA 5TD4A 3QHNA 2YL5A 4M24A 3SCQA 1PIFA 1PZ3A 2FGLA 3U7BA 2WWDA 3A4AA 1OIMA 1J0ZA 2PBOA 3GXMA 4WJXA 2Y2WA 3U5UA 1W1YA 4PMQA 3B9DA 3CUJA 4D6DA 3U57A 4EK7A 4AZ7A 1BAGA 5DFAA 4QLKA 2WHKA 1ISWA 1LF1A 2D2OA 3SCTA 3ARUA 3GBEA 5BXRA 5M03A 1DWIM 3AHXA 3U7VA 1U33A 1NP2A 2YKKA 1CXHA 4U3CA 1UR1A 3ZJ8A 5JBEA 2GK1B 3VMPA 3SUWA 3TONA 1DHKA 3LMYA 1TZ7A 2OWWA 2G3JA 3ARSA 2XFRA 1GZJA 1JDDA 3AHTA 3FAWA 2VL4A 5IFPA 3KL5A 1GVYA 4AZ5A 3IAQA 3KZSA 4IPNB 3QHMA 4JKLA 4UFKA 4PSRA 3MMDA 4ACZA 3ARVA 3WH6A 4E8DA 4ATWA 4IM4A 3HU7A 1JNEA 2E8ZA 2EPMX 2O92A 1V08A 3LPOA 3WMBA 3WQWA 1HVQA 3WBAA 3KE0A 1W2VA 5DMYA 1N82A 7TAAA 3WQ6A 4PEEA 2VR4A 1W9VA 2CBVA 3UR7A 3VIJA 2Y8VA 3ZT5A 1JDAA 1HNYA 1UD3A 1WKYA 4ZFMA 4UFJA 3WDRA 1Y7VA 4ML4A 2E9MA 1EO5A 1E6RA 2BHUA 1E15A 1PJ9A 1C91A 1XSKA 1UR8A 4B16A 5ABFA 4W8AA 3W0KA 4AD5A 3CLWA 4BS0A 4L4PA 1X6LA 3EDDA 4KRTA 4NZCA 5E6YA 2XTKA 2J7BA 1MW3A 1MQQA 4PUEA 1BPLB 1C8XA 1JXJA 4GO9A 2J7HA 4PYSA 1XRVA 1V0LA 3RILA 1V6VA 5CSUA 3AIUA 2WB5A 3J7HA 2EPOA 3VU2A 3ARYA 2W61A 1BSIA 1JXKA 2PF0A 1UG6A 4PN2A 3PTQA 3BLPX 4AZGA 4WKHA 3AHZA 3TA9A 2WZIA 5C70A 1MQRA 3MMWA 2E3ZA 4GO8A 4YHEA 5JIPA 1HX0A 4RE3A 4LXFA 1L8NA 1QI5A 1NARA 2OSXA 2HISA 5ABFB 5KEZA 2DEPA 1LG1A 3WF1A 5D8ZA 1E6NA 2EBNA 3OB8A 1CGYA 4W7VA 3AS3A 4NF7A 2D22A 3WBEA 2BS9A 2PWHA 3PZNA 2VTFA 4UFLA 5GNXA 2OYLA 2W63A 2BY3A 2W66A 5A2AA 1CTNA 1DWFM 4W88A 2VVNA 3ARQA 4XX6A 4PTXA 1HJQA 3VGHA 2QPUA 3WMCA 3K8MA 1DTUA 1OB0A 1JAKA 2G3IA 4A3YA 4ZENA 2GJXA 1C7SA 3W24A 4R27A 5BRQA 4DWSA 3ARXA 2UY4A 1R7OA 4R5EA 1ZU8A 2Z1SA 3FNDA 4LYQA 3MMUA 4Z2JA 1HKJA 4JL2A 1KXQA 2XSAA 3LPFA 3QGVA 4AZ6A 1LLOA 2UWFA 2WHLA 2C8NA 1SMDA 4HPHA 1LWJA 5IDIA 4JFTA 1NM9A 1LWHA 1IT0A 5HNNA 4QAWA 3VM7A 1AMYA 1JIBA 1G94A 5FL1A 3LPPA 2J8FA 5I5RA 4F66A 1CWYA 3RO8A 1U30A 5EFDA 2DGAA 1XD1A 1GOWA 3TTOA 1E5NA 4P7NA 4UQDA 1NOUA 1GUVA 1OSEA 1AQ0A 2QF8A 4OBRA 3AROA 1FP8A 1Q6GA 1SR0A 5A6KA 4JHOA 2GJXB 1JZ3A 1OT2A 3M46A 3OLGA 3DYMA 4M80A 1WAWA 1S46A 3OGSA 5AYBA 4CKQA 2OSYA 4CUCA 1GOOA 1KQYA 1J18A 2WVVB 2BY1A 1HKKA 1UR9A 5F7UA 1KGXA 4U31A 4W86A 4H2CA 2AOSA 4IPLA 5C71A 3AMCA 2XM1A 1BYCA 4Z2IA 1QI3A 2WSKA 4JL1A 3QOMA 2FH6A 1CGWA 2F61A 3N11A 1KBKA 5I77A 1DP0A 7A3HA 2ZUUA 4P8XA 1MXDA 1R85A 4W8BA 4M8UA 1WPCA 4UQEA 3WFZA 1TCMA 1UWSA 4ATLA 4JKMA 3SCPA 1W91A 1WDPA 4KH2A 2WPGA 4TX8A 4JAWA 3BMVA 3CH9A 5I78A 4HMCA 1NWRA 2F2HA 2NSXA 3VIOA 1EGZA 4CU6A 4FMVA 3A3HA 3L4WA 2QLYA 5FIPA 5I0DA 3OGRA 4H41A 3ZSTA 2JFEX 4UZSA 3T09A 2XVGA 1C7TA 4JIEA 3UR8A 4FK9A 4BCEA 4AIOA 2DSVA 4D6FA 3GM8A 5IXEA 2CESA 3O6AA 2CXGA 4CD7A 4CD6A 3VMOA 1E6SM 3PZIA 2WWCA 3MUAA 4MJ4A 3ZR6A 1V0MA 4BF7A 1BHGA 3T0AA 1UH2A 3VD7A 4HOXA 4CN6A 2UY3A 4MAVA 1X1NA 3WQ8A 3S6TA 3SCVA 3GDBA 1JYNA 2WCAA 5A69A 1KBBA 2J75A 3SURA 3OZOA 5HPOA 1K9FA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4OBS A;  2EPN A;  3FXY A;  3CMJ A;  3W4R A;  5A8M A;  2JF6 A;  2WXD M;  3GXF A;  3CHD A;  2PC8 A;  2UY2 A;  5FCZ A;  1BVZ A;  1UZ1 A;  1E3Z A;  1BYA A;  2VC9 A;  1BFN A;  2WVU A;  4PBG A;  3IAN A;  1AQH A;  4HZ8 A;  1HXJ A;  3WF0 A;  4KRU A;  5I79 A;  3WNN A;  3NJ3 A;  8A3H A;  4JZ5 A;  1UWI A;  2WKL A;  1BGG A;  3W37 A;  4AD0 A;  1MVY A;  3WUF A;  4D6J A;  2WMH A;  4W89 A;  4HPG A;  1QBA A;  1VFO A;  1WZL A;  3MUI A;  1CEC A;  3DYP A;  4TVD A;  1JND A;  3AFB A;  2ZWZ A;  3RM9 A;  5I23 A;  2O9O A;  3M07 A;  4X0N A;  4QCF A;  4P7Q A;  3AIV A;  3SCR A;  5ABH A;  3VDH A;  4AW7 A;  3AYR A;  2GJP A;  1FH7 A;  3L2L A;  1V3K A;  2W92 A;  2XG9 A;  4KGL A;  1WDS A;  3ARW A;  4J3X A;  5EMY A;  5AYI A;  3WUB A;  4YN5 A;  1UD8 A;  1C8Y A;  1J11 A;  4IIS A;  4EAM A;  1BGA A;  5DT5 A;  4PSP A;  1SYT A;  2JIW A;  3ALF A;  3CUI A;  2G4F A;  1DWH M;  3CGT A;  3IJ8 A;  4V28 A;  4U33 A;  5BYW A;  1TUX A;  4LYR A;  2W5F A;  1C92 A;  3VIG A;  3WEO A;  1JZ7 A;  3PZG A;  3T2Q A;  1B30 A;  3WNP A;  3GNO A;  2WKG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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