4IPLA

The crystal structure of 6-phospho-beta-glucosidase bgla-2 from streptococcus pneumoniae
Total Genus 178
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
178
sequence length
469
structure length
460
Chain Sequence
TIFPDDFLWGGAVAANQVEGAYNEDGKGLSVQDVLPKGGLGEATENPTEDNLKLIGIDFYHKYKEDISLFSEMGFNVFRTSIAWSRIFPKGDEEEPNEAGLKYYDELFDELHAHGIEPLVTLSHYETPLYLARKYHGWVDRRMIHFYEKFARTVLERYKDKVKYWLTFNEVNSVLELPFTSGGIDIPKENLSKQELYQAIHHELVASSLVTKIAREINSEFKVGCMVLAMPAYPMTPNPKDVWATHEYENLNYLFSDVHVRGYYPNYAKRYFKENDINIEFAAEDAELLKNYTVDFLSFSYYMSVTQSALPTQYGLVNPYLESSEWGWQIDPIGLRIILNRYYDRYQIPLFIVENGLGAKDQLIKDELNNLTVQDDYRIQYMKEHLLQVAEALQDGVEIMGYTSWGCIDCVSMSTAQLSKRYGLIYVDRNDDGSGTLNRYKKMSFTWYKEVIESNGESLF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural insights into the substrate specificity of a 6-phospho-&[beta]-glucosidase BglA-2 from Streptococcus pneumoniae TIGR4
pubmed doi rcsb
molecule keywords 6-phospho-beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 178
structure length 460
sequence length 469
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.86: 6-phospho-beta-glucosidase.
pdb deposition date 2013-01-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4iplA00
4FF5A 2VCCA 2DPEA 3WH7A 1KGUA 4AEEA 2EPLX 2E4TA 2JIWA 4RE3A 2FHCA 3AHVA 4DWSA 2VT0A 2G3IA 2QPSA 2D1ZA 4HOWA 1K9FA 2XVPA 1J11A 4W7WA 2XJ7A 1KWKA 1BYAA 2FDMA 3VIOA 5A6SA 1BGAA 4FK9A 2YL9A 3I3BA 1C8YA 4AD1A 1DP0A 3GH4A 3HJEA 4KRTA 1GZJA 2GK1B 1IZKA 4BQ3A 3W81A 3U57A 4F8XA 3PZNA 4CCCA 4UFHA 1XD0A 3OLGA 2DSKA 4MB1A 4CGTA 1LF1A 3AIRA 1OWQA 1R87A 3ZOAA 3SCUA 2E3ZA 1PX4A 3ARWA 3F5JA 3JUGA 2ZE0A 2ZUVA 4P7QA 1RD6A 3CBWA 1ISYA 4OOZA 1JI1A 1QBBA 1KR0A 4OZOA 2WSKA 4CU8A 3I3DA 2DT0A 3OGSA 1JZ4A 4PSPA 1EHNA 4D6GA 3AXXA 5FCZA 3VMOA 4LXFA 3KZSA 2VZTA 2J25A 1R7OA 1QBAA 2PB1A 1MFVA 4Z2GA 1E15A 1FOBA 1UKTA 1H2JA 3VU2A 1WCGA 2BV9A 4OOUA 4MJ2A 1BG9A 1QI4A 1F4AA 3VVGA 4CN4A 1HVXA 5KEZA 1PJ9A 4CD5A 3N18A 1W9XA 5A2BA 5EB8A 4W84A 4EANA 4P8VA 1VIWA 1JZ5A 1E5NA 1B3WA 4TVUA 1B3YA 3BAXA 1OM0A 3ZR6A 3MUAA 2NSXA 4N0RA 1UG6A 1SMAA 4KGLA 2WYSA 4P7NA 5A8OA 3AHTA 5FL1A 1XSKA 3OLEA 4CCDA 4PTXA 2D22A 1OGGA 1G0CA 1FH9A 3GZAA 4XUYA 1KXQA 3O2LA 2JEPA 5A3HA 5E70A 2XGIA 4MB3A 2A3EA 3MU7A 5CG0A 3HN3A 3EDFA 5CSYA 1M7XA 3WF1A 3CUIA 4EE9A 3OGRA 4F9DA 3W24A 2X0HA 1C93A 3BMVA 5EFFA 4JFUA 1HKMA 1OIFA 2J47A 4D6CA 2X0YA 6A3HA 3ARZA 4X0VA 2W63A 4QAWA 3SCPA 1VEOA 1BPLB 4PYSA 2V3FA 2J7FA 3OLIA 2D0GA 3CHFA 5E6YA 3WDPP 1C8QA 1ISZA 1W9VA 1ZBKA 4PTWA 3TTSA 1UOKA 3A4XA 1WKYA 1HKKA 5EMYA 4PMYA 2VUYA 4W7VA 3WN6A 4M8UA 3N15A 4PUEA 3PTMA 2GVYA 3L4UA 3A4WA 1R86A 5AYBA 1B9ZA 4RE4A 3IAPA 2YDQA 3WDRA 3UEQA 4AZIA 4W8BA 4CN1A 1ZB5A 2VX7A 1KGWA 2RGLA 5BCAA 3VX1A 3A6OA 5DEZA 2VZSA 4HPHA 1XRVA 1OT2A 4S3JA 1PEZA 3TP4A 2TAAA 3S6TA 1JZ8A 1UWUA 1EO5A 1CPUA 2A3HA 2XWEA 4OBRA 3N1AA 4OUEA 1QHZA 1H0IA 1UR2A 4L4OA 3DYPA 4PMDA 5BRQA 2GUYA 2GJRA 3W53A 3KEHA 1GW1A 2EPKX 1JD7A 3VGHA 5JBFA 1KXTA 3WBAA 1XSJA 5HNNA 1EDQA 4AZGA 1GQKA 3AXHA 1XYZA 3PHAA 1HJQA 1BVNP 3WQWA 1ZBCA 1XYFA 5CQ1A 3WNKA 3L4TA 3AHYA 4GO8A 4TOQA 3PZOA 1UH4A 3WNMA 2A3BA 3VDBA 4URIA 1NWRA 1TVPA 4WLCA 3M07A 1TG7A 2EBNA 1JNDA 5BYWA 2GFTA 3EDKA 4MNKA 3VIIA 1MVYA 4D6HA 1ITCA 4BA0A 4M81A 2J62A 3TA9A 3L4ZA 1W9UA 4UZSA 2Y24A 4W93A 3EMZA 5IDIA 4B15A 4B9YA 4LQ1A 3BSHA 3AOFA 4AISA 1OD8A 2BXZA 5AC5A 3RJYA 1S46A 5E9AA 1GVIA 2O9OA 1QNPA 2GDVA 5CZKA 3N12A 1JAEA 1WE5A 2ZWYA 3FY1A 4DM2A 2CBUA 3GBDA 1DHKA 3ZJ6A 5JBEA 2DSUA 3WNOA 1K6AA 1W3KA 1R8LA 2BVDA 5DT5A 2VZVA 4AZ6A 5A6BA 2WM0A 1O6IA 2XHYA 3F4VA 5F7UA 1NOFA 3QHNA 1CGTA 1C7TA 1FHDA 5D8WA 1UKOA 3ARXA 1W3JA 1C7SA 4UFKA 1YHTA 2XSBA 1CGWA 4ZE5A 3PZMA 2OYKA 1MFUA 2VR5A 3CGTA 1MQPA 4IUGA 3POCA 4E8CA 4UR9A 3OG2A 1E6QM 1JDDA 3MV01 1PIGA 4H8VA 1CXFA 2WZHA 3AZSA 1V02E 4WKHA 4AD4A 2ZUTA 5IHSA 2ZXDA 3VIJA 2Z1SA 3CUGA 2BFGA 2YA0A 3FAXA 5BXPA 2G3JA 1EOKA 1GHRA 3QOKA 2BNJA 4UQCA 1AQMA 4Q22A 3SUUA 1E73M 2VVNA 4U31A 1IZJA 4UQBA 2WVTA 3UG4A 1E4IA 1MQRA 2VRKA 2WVVA 3MUZ1 1US3A 4W7UA 3WF0A 1ITXA 3QHOA 1CXHA 1UQZA 1VFFA 3AJ7A 3EBVA 3W82A 3ZJ7A 3T2QA 4D6FA 2E8ZA 4X9YA 1BTCA 3CHDA 1E0VA 1NWSA 1QI5A 2WKLA 2JF7A 4TX8A 4MNJA 1QW9A 1LL4A 2IXVA 2NT1A 4NRSA 2CESA 1W2VA 3CHEA 1EIBA 3WF4A 2V38A 3AHZA 4WKAA 3GYCA 1K9TA 3VM5A 2CKSA 1JAKA 1BGGA 4TTUA 3MUY1 2O9PA 3WKZA 3WFLA 2WVVB 5CPQA 4J28A 1HJXA 1BSIA 5A8MA 1J0IA 1LLOA 1V0KA 4IPNB 4LYQA 1Q6DA 1KBKA 4A4AA 3NCOA 4HP5A 4XZWA 6TAAA 1JYNA 2GJXA 1W2PA 7A3HA 1DWGM 2BVYA 1WDSA 2EPOA 3AQUA 3WH6A 3CZKA 4NF7A 1G01A 4MPKA 2OWWA 2DIEA 1XD1A 2E9BA 2V3GA 2CIPA 1J0JA 2JALA 1E40A 1AQHA 4J3VA 2YIHA 4M80A 2W62A 1BYDA 5E0FA 3U7VA 1UKPA 1JG9A 4L4PA 1MW2A 1W3LA 3AS1A 3VILA 3VD4A 2OYMA 1WDRA 3L2LA 5DFAA 2VZOA 2ZXBA 2V5CA 3RMEA 2Y8KA 3VDCA 1F4HA 4MNLA 3EMCA 3PTQA 5LA1A 4JKLA 4Q7NA 1B3VA 2ESCA 2GJXB 5A6MA 2WNWA 1E6NA 4LYPA 3RCNA 2WANA 1NOWA 3BH4A 1UQYA 2PF0A 1HXJA 3B9DA 1HP4A 1W91A 1QPKA 5I77A 1E4NA 3GH7A 1A3HA 4CD7A 3GXMA 7CGTA 2XVKA 1MW3A 4P8UA 2WBKA 5EFDA 2DGAA 4TX6A 2FH8A 2ZX7A 4HMEA 1VFMA 2XPKA 1BVZA 4UQDA 1JNEA 2GSJA 3U5UA 3RDKA 4AIEA 1J0ZA 1J01A 1VBRA 3WD3A 1E0XA 1W1YA 2YDRA 1KGXA 3NIYA 1J12A 1V0LA 1GONA 5BRPA 1B30A 1R7AA 3MANA 2CXGA 2GDUA 5A6KA 5ABEA 3DC0A 5A8QA 1MXGA 1B0IA 3BAIA 1A47A 2BY2A 3GDBA 3ZO9A 1CBGA 3U5YA 4K68A 5I23A 1V0NA 3OA5A 5BXTA 1UA7A 2VZUA 2XIBA 1UUQA 2XGBA 2PWFA 3ARTA 3SCWA 1UH3A 2DT2A 2WHMA 3AIQA 5BWFA 4AD2A 3OZOA 1OB0A 3VOCA 1C90A 4IM4A 4BZYA 1JXKA 2WMIA 4J3XA 8CGTA 1QI0A 3POHA 3NUKA 2VQUA 5D9NA 1MXDA 3WNLA 3K1DA 1KB3A 5AY7A 1AQ0A 2XYLA 4J7RA 2IUZA 5A95A 4LPCA 4DWSB 1J0KA 2VX4A 1CENA 1OBAA 4V2XA 1XSIA 1LJYA 3ARUA 4GZIA 1M03A 1E55A 2WZIA 1EQPA 2J7DA 4UFJA 3SCOA 2A3AA 4UQ9A 3BLPX 4KH2A 4YPJA 3A47A 4JFWA 4TVCA 3N17A 3VIFA 1UR8A 3AIBA 4JZ5A 1V3LA 1E43A 4GQQA 4FLQA 2WW5A 4XB3A 1KXVA 2XTKA 4WIWA 3VPLA 1E0WA 4Z2KA 1QI3A 3VUPA 1XH2A 2WMIB 3EDEA 1FFQA 2J7GA 3SIMA 1E71M 2WB5A 3ZT5A 3WH5A 3WQ5A 3WF3A 1SMDA 4AZHA 3EDDA 1FH8A 1HL9A 3VO0A 1QNSA 4AZCA 3VNYA 4QCEA 3NDZA 1RH9A 1CDGA 1M53A 4P7LA 1L8NA 1CYGA 3K4DA 1WO2A 5TD4A 1PZ3A 1Q6FA 4PMOA 2WHJA 4MDOA 4D6EA 3PTKA 4AIOA 5LYRA 3IJ8A 3AIVA 4MADA 3AMGA 1VBUA 1H09A 2WXDM 2BHUA 2CBVA 5M5DA 1JYXA 4JKKA 1Y7VA 3ZJ8A 2WPGA 2VURA 3PZGA 2WAGA 1MW1A 3WEMA 2W67A 4HOXA 1CECA 3WNNA 1KWGA 1CLXA 4B3KA 2DH2A 4PN2A 2YBTA 1DWJM 4AZCB 2ZUNA 2E8YA 1V3KA 1I1WA 5A94A 1JL8A 3RILA 5CSUA 2XWDA 3OBAA 3MMDA 1QVBA 1LQ0A 4U33A 3HMCA 3ARRA 1H1NA 1TVNA 2D23A 4KMQA 3BLKA 1V02A 2WMJA 1UR4A 2PWGA 1UZ4A 2WBGA 3AS2A 1V3MA 3IJ9A 4GPNA 2W4XA 4S3KA 2QMJA 4M24A 5A6AA 4W8LA 2CHOA 2W91A 1WNOA 4PRWA 2D3LA 1H0GA 1CIUA 4ZXLA 1DWFM 2DSWA 2J74A 1V3IA 3AMCA 5GNXA 4CKQA 4DWSD 3PZUA 1BFNA 3PZTA 1BQCA 4UZUA 4FLSA 2E0PA 3QHMA 3K46A 4AXNA 3TTYA 1QI2A 1FP9A 1FFRA 1G9HA 1GOQA 1HKIA 2WWCA 2G3NA 5JIPA 2VMFA 4JFVA 3W27A 1MW0A 1ESWA 2OSWA 1MYRA 1D7FA 1CWYA 1JF6A 4N42A 1JFXA 3ZT7A 2BY1A 4F9JA 3T09A 4D71A 3T0DA 3MSDA 4GINA 2D3NA 1V6WA 3CIVA 1DWIM 3WF2A 3W0KA 3G6LA 1KQYA 4TTGA 1JXJA 3WUBA 3PBGA 1JIBA 4A3HA 3T2OA 5CLTA 2WMHA 3GH5A 4WK9A 1ODUA 3IANA 3L4WA 4FMVA 4AEFA 3K8LA 1WP6A 1E3XA 2WMGA 2ZUMA 3OZPA 4CVWA 3SUWA 2J7EA 2XFRA 3CO4A 3W28A 1VF8A 4A3YA 2QPUA 1QNOA 3LPGA 4HA4A 4W87A 5A2AA 3RM4A 1UD3A 2J8GA 4D6JA 2HISA 2UY3A 1ODZA 3WMSA 4JCLA 3ZIZA 4ML4A 2NW0A 1DWAM 3VD7A 1GCYA 3WQ4A 1W3HA 1B3XA 1GORA 4KWUA 4M56A 3CH9A 3AISA 8A3HA 1ECEA 2OSXA 4JHZA 3FHQA 1NQ6A 4GQRA 1SYTA 4TXEA 4Z2IA 3VDAA 1W9BM 3SCSA 2YLLA 2IXUA 1GOOA 2NT0A 3GTNA 4IPLA 1J0HA 4H8HA 1UA3A 1WZKA 1PIFA 3ZSTA 4D1JA 2EEXA 1WAWA 1XC6A 4GZJA 2O9RA 1JDAA 4B9ZA 3WQVA 3BAYA 2J8FA 3MV11 2BVTA 3AS3A 4GO9A 2XFYA 4CD8A 1Q4NX 4AY1A 1GQJA 1DEDA 1FA2A 3RJXA 4UNIA 3QGVA 2XVLA 2WVUA 3A3HA 1HNYA 4AW7A 1JFHA 4HZ7A 1R85A 3ECQA 4V27A 3PZVA 4PCTA 4AD3A 1X6NA 3CUHA 5M3WA 2EPMX 5I6SA 5I24A 4PMVA 1V0MA 2V3DA 4GKLA 5C70A 2CERA 3EYPA 1TE1A 1B90A 1NOUA 4D72A 5E09A 4BCEA 4PUDA 2WC4A 4E8DA 3PZ9A 4W5ZA 2DSZA 4D6IA 1QNRA 5IFTA 3THDA 4QDMA 3BXWA 1WDPA 3MO4A 5A6JA 2J78A 2ZUSA 5JBDA 1G94A 3NYDA 1UWQA 4UFLA 2VC9A 3GNRA 4CUCA 3ARQA 2PC8A 4JL1A 2XVNA 1LWJA 5HDRA 4IISA 4ATWA 4MAVA 1E6XM 3WUGA 4JFSA 1BYCA 4U3CA 1N82A 4LGXA 1XCXA 4AYSA 2DT3A 1HJVA 3VGBA 1GHSA 1W1TA 2YJQA 4DM1A 3U7BA 3AMLA 3L4YA 4GI8A 2FGLA 1C91A 3KE0A 5HPCA 4DUVA 1JD9A 1V6UA 1BYBA 1HP5A 3B8SA 4C7FA 4WSKA 4P8XA 1OCQA 3MSGA 1OD0A 1GJUA 4LYRA 2C0HA 1XHGA 1V6VA 2CEQA 3ZJKA 1GNXA 4PMRA 1OSEA 1CXLA 3BAWA 1XCWA 4CU7A 2X05A 1TR1A 1EDTA 2WMFA 2A3CA 4JL2A 3WDQA 1CGXA 1XV8A 4NRRA 2XG9A 1GOMA 2QV4A 2FGZA 1E3ZA 1OGBA 4QCFA 3MS8A 3WH8A 1UWTA 4JHOA 1UR1A 4W86A 2XIIA 4HA1A 1GVYA 3WUEA 1TZ7A 4RL3A 4AIUA 1O7AA 1KBBA 2Y4SA 3BGAA 3WL1A 2YKKA 4D1IA 2V5DA 4GI9A 4OKDA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4FF5 A;  2VCC A;  2DPE A;  3WH7 A;  1KGU A;  4AEE A;  2EPL X;  2E4T A;  2JIW A;  4RE3 A;  2FHC A;  3AHV A;  4DWS A;  2VT0 A;  2G3I A;  2QPS A;  2D1Z A;  4HOW A;  1K9F A;  2XVP A;  1J11 A;  4W7W A;  2XJ7 A;  1KWK A;  1BYA A;  2FDM A;  3VIO A;  5A6S A;  1BGA A;  4FK9 A;  2YL9 A;  3I3B A;  1C8Y A;  4AD1 A;  1DP0 A;  3GH4 A;  3HJE A;  4KRT A;  1GZJ A;  2GK1 B;  1IZK A;  4BQ3 A;  3W81 A;  3U57 A;  4F8X A;  3PZN A;  4CCC A;  4UFH A;  1XD0 A;  3OLG A;  2DSK A;  4MB1 A;  4CGT A;  1LF1 A;  3AIR A;  1OWQ A;  1R87 A;  3ZOA A;  3SCU A;  2E3Z A;  1PX4 A;  3ARW A;  3F5J A;  3JUG A;  2ZE0 A;  2ZUV A;  4P7Q A;  1RD6 A;  3CBW A;  1ISY A;  4OOZ A;  1JI1 A;  1QBB A;  1KR0 A;  4OZO A;  2WSK A;  4CU8 A;  3I3D A;  2DT0 A;  3OGS A;  1JZ4 A;  4PSP A;  1EHN A;  4D6G A;  3AXX A;  5FCZ A;  3VMO A;  4LXF A;  3KZS A;  2VZT A;  2J25 A;  1R7O A;  1QBA A;  2PB1 A;  1MFV A;  4Z2G A;  1E15 A;  1FOB A;  1UKT A;  1H2J A;  3VU2 A;  1WCG A;  2BV9 A;  4OOU A;  4MJ2 A;  1BG9 A;  1QI4 A;  1F4A A;  3VVG A;  4CN4 A;  1HVX A;  5KEZ A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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