4IQLA

Crystal structure of porphyromonas gingivalis enoyl-acp reductase ii (fabk) with cofactors nadph and fmn
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
313
structure length
312
Chain Sequence
MNRICELLGIEHPIISGGMVWCSGWKLASAVSNGGLGLIGAGSMHPDNLEHHIRSCKAATDKPFGVNVPLLYPEMDKIMEIIMREHVPVVVTSAGSPKVWTAKLKAAGSKVIHVVSSATFARKSEAAGVDAIVAEGFEAGGHNGREETTTLCLIPEVVDAVNIPVVAAGGIASGRAVAAALALGADAVQVGTRFALSEESSAHEDFKAHCRRSVEGDTMLSLKAVSPTRLLKNKFYQDVFAAEQRGASVEELRELLGRGRAKQGIFEGDLHEGELEIGQAVSQISHAETVAEIMVDLVDGYKRSLAGMPTEI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural characterization of Porphyromonas gingivalis enoyl-ACP reductase II (FabK).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Enoyl-(Acyl-carrier-protein) reductase II
molecule tags Oxidoreductase
source organism Porphyromonas gingivalis
total genus 110
structure length 312
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.1.9: Enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase (NADH).
pdb deposition date 2013-01-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03060 NMO Nitronate monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4iqlA00
2NX3A 1W3TA 3GB6A 1TMHA 3O16A 2ZZ4A 3LHZA 3TMQA 4PTNA 3A22A 5BW6A 3THAA 4WY0F 2NX9A 1NAL1 1OYAA 3I7QA 1IGSA 3I7RA 1VCVA 5CZJA 1VLIA 4HSNA 4EF8A 5IM51 1T8XA 2A7RA 2ZRXA 2ATMA 3W9ZA 1QAPA 4NJJA 3B06A 3MUXA 3FYPA 4RV8A 3TCEA 3GXPA 3L5MA 4UUIA 4ONVA 3CEPA 3W2JA 4AWTA 3ATYA 4RX0A 2FIQA 4A2RA 1L2UA 1LM1A 3STFA 4O11A 2WSQA 3HJZA 3GDLA 5AB3A 3TA6A 1THFD 3FLUA 3W7CA 4IMGA 4NXKA 3G1XA 1M5WA 4X2RA 3TV8A 1SW3A 2VOMA 3GYEA 3BG5A 4UCGA 2CWNA 4WOZA 1OABA 3LRKA 2A7PA 1SZNA 3BGJA 4OQVA 3LHUA 1NF0A 3U2OA 4EIVA 4BI6A 4NJKA 1D9EA 2ABAA 2W6RA 4UR8A 2NX1A 3O6DA 4JYEA 4L4MA 1H50A 3W1LA 4JIQA 3UZJA 4RXFA 3MP4A 1X1ZA 3TFCA 3L5AA 1QFEA 1AW1A 1OFEA 4LWWA 3M1ZA 3IGUA 1TIMA 3OVRA 3INPA 2NV2A 3FKKA 1IXQA 4S2BA 1GQNA 4NT0A 4JGDA 4KFNA 2VFDA 2QR6A 4I7WA 1OX6A 3M7WA 1OJXA 1A5BA 4UFMA 3C2RA 3L0KA 5AC8A 5J5DA 4RKAA 3NDOA 1DVJA 4FEZA 1F74A 2WPBA 1KBIA 2GOUA 2CZFA 4IMDA 3CM4A 4YL2A 4R53A 3W72A 1XDLA 3OVPA 4FNRA 4GUIA 4NXSA 3L0GA 4IPIA 1N55A 3TE9A 2V30A 2V2CA 3W1RA 5LNWA 1IF2A 1Q6QA 1SO3A 4BI5A 4UFIA 4MY8A 3IIXA 1TTPA 2ZZ1A 2OT1A 4M7TA 4XBKA 4ADSA 3M47A 3A23A 3DFQA 2A0NA 4K39A 4RXGA 3DFSA 1VYRA 1L6WA 4LC6A 3IIPA 1XUUA 2ZA3A 4JTFA 1PL9A 5LHEA 2CLEA 2NUXA 3LERA 2A2IA 4O19A 1DJNA 3LHVA 3G8RA 4LNYA 4BK9A 4OGZA 3TQKA 4KFPA 3R13A 4XKYA 4O0KA 1IIHA 1S5TA 3SGZA 1RQHA 3QZEA 4LVGA 3UD6A 2P10A 1TPEA 3ZFHA 1OX4A 1LCOA 1W5NA 3EWBX 3C3NA 4LOCA 1WYIA 3DFTA 3USBA 3NQFA 5I3JA 1H7XA 4N02A 4UTTA 1VH7A 2C14A 3P61A 3PBYA 2TMDA 4K36A 2FQIA 3UWVA 3OIXA 4NJHA 3VCRA 4O1AA 4JTTA 3EWZA 2A5HA 2YYUA 4N9DA 4JIPA 2JKPA 3ANYA 4JX5A 4Y96A 5EL1A 4UR7A 2DZUA 3A24A 3GR7A 3QYQA 3L2IA 3FOKA 3CQ0A 2FPYA 4BF9A 4WY0B 2PE4A 2WNZA 3P67A 3Q2DA 3STCA 4CQ9A 3EWWA 1ZAIA 1B4EA 2GQAA 4UMBA 4GC4A 1W31A 2YR1A 4QM1A 5HUOA 4ZQNA 2YDAA 1RQEA 1TRDA 2EHHA 1TTIA 1VCFA 5DBTA 3NOEA 5HQEA 2J9XA 1GTHA 3PUDA 1KM2A 5AN7A 1EA0A 2QCEA 3RU6A 1ZNNA 2DJXA 4WXZA 1LDCA 3G1FA 2ZYFA 4O12A 1JRCA 3HPXA 3P5YA 3T4CA 3W1XA 4CCDA 3W1AA 2VFGA 2EGZA 5EA9A 2P0OA 3DFPA 3CWNA 3DHFA 1FXPA 5FF7A 4DO6A 2OZ0A 1FDJA 4GNJA 4LVDA 3N9RA 4O8RA 3S42A 2QAPA 3NXFA 4UTUA 4L4LA 3DKLA 4H4IA 4Q32A 3GR8A 1P0KA 3C6CA 1TPDA 3PC0A 3M5YA 1M6JA 1IXOA 1ZY9A 3ABSA 3NQCA 1K03A 1QDSA 2ZRVA 1XFBA 3HGRA 2OJPA 3MP3A 4G1KA 3HPZA 1WV2A 3HF3A 2ZFAA 1K7XA 2C1HA 3HB9A 1UUOA 1ZAJA 2ZTJA 2VFFA 3PAJA 5AHFA 4QAIA 4PODA 3M16A 3GDKA 3TKFA 2LLEA 3E0IA 3KHJA 4KWVA 3PG8A 4AHQA 3RMJA 3BPWA 2Y7GA 3TMLA 4NJIA 5ABTA 3P74A 1GVRA 4J9JA 2IQTA 4K8EA 1H60A 2YYTA 3DFNA 2ZBTA 3DAQA 2ISVA 4CNPA 3E12A 1NFBA 3VE7A 2FPTA 2JGYA 3M5ZA 1KFJA 1Z42A 5IBXC 1H5YA 5EY5A 2QF7A 5TBOA 3ZWTA 3BLEA 4NX5A 1B4KA 2E09A 3EX6A 5BOOA 2ALDA 1AW2A 4FXRA 5U7SA 4ZMGA 3WK3A 3NQ6A 2ZRYA 3S5OA 1K8ZA 1KLYA 2QCNA 4JY8A 3WJZA 1TPFA 1XBZA 1CI1A 2GJLA 5DELA 4JYFA 1G4SA 3STEA 2NXGA 4YCOA 3L66A 4JTEA 4YLWA 2ZZ2A 2X16A 4DEFA 4WD0A 5HWMA 1DBTA 1SR9A 3L9CA 2WJZA 2GUUA 1YTEA 3NPWA 3G1VA 1O94A 1UUMA 3TQVA 2QJIA 1I2RA 1GVQA 1LBFA 4RJEA 4IX0A 2I14A 4X22A 2A1YA 4NNBA 2V9DA 4MFEA 5CPLA 3C2OA 1M7PA 2GJNA 4MZYA 5HWJA 3UPWA 3FYOA 3UWUA 3S5YA 1Q6OA 4UTHA 3W71A 3DZ1A 2DJLA 1A5AA 2J9YA 3IRDA 5EBUA 3OHIA 5D04C 3PB2A 3W7QA 3QFEA 5KMYA 1NSJA 1FQ0A 1SPQA 4WXYA 3GX9A 1XI3A 3BGGA 3MW7A 3B4UA 4Y8FA 3M41A 2ZA2A 1U83A 1RPXA 1XKYA 3QQ0A 4XKYB 5G5IA 3N9SA 4AHPA 3MI3A 3THQA 4K8HA 3T7VA 1KA9F 3C0JA 4O16A 2NZLA 2QCDA 1N8FA 3O05A 3TXVA 1LYXA 2H8ZA 5FF0A 4BR1A 4O53A 3UYCA 2DZSA 2VFIA 2Z6JA 4EVZA 7TIMA 3HQ1A 3LTYA 3P60A 2Q8LA 3S5NA 4EOUA 1H7OA 1PE1A 1RD5A 2DZVA 2Q3OA 2B7NA 1SW0A 3S1VA 5AFDA 4AF0A 1IXPA 3ABQA 3HOJA 3WJSA 4GWEA 3C4UA 4R7JA 1OK6A 4RCXA 5KZMA 1X1OA 3NL3A 3ZR4A 1TCDA 1ICPA 5KITA 3NPUA 3DBPA 2V2HA 3F4NA 3P5ZA 4N9CA 3T44A 4S2CA 3W22A 5LGXA 5AOUA 1VHCA 3NAVA 1SU5A 1O5KA 3CC1A 3L67A 1AK5A 3R89A 3DENA 1H7RA 1IIGA 4UTKA 5F1VA 1K02A 4AEOA 3HO8A 4UFHA 4E2DA 4Z0SA 1H62A 5DBUA 3UWQA 5LKYA 1WX0A 2QCMA 3SY5A 2H8XA 1P5BA 1ME7A 1F5ZA 4QQ3A 5FI8A 3G0XA 1GZGA 2G5WA 2VFEA 1SO4A 3DH7A 3Q37A 3VKJA 1JVNA 2BZNA 3CLMA 4DF2A 1OX5A 1OFPA 3W76A 4O1DA 1KFBA 1SW7A 4O4WA 2Q3RA 3L21A 2VEKA 3BV4A 1ME9A 4JXCA 4ORIA 3MMTA 3NQGA 3DGRA 1L6SA 3LB0A 2VEMA 1RQBA 1JCMP 2ZDRA 2ZTKA 2C16A 3WFAA 1F73A 3ABOA 3ELFA 4O4VA 5I3IA 2OCZA 1P1XA 1FWNA 4ML9A 3HBLA 1DOSA 2RDTA 2V81A 3NQEA 2A85A 2F7FA 1XL9A 4PA8A 3SJ3A 1R47A 2PRLA 3W86A 3V1PA 3LRLA 4JTUA 2Z6IA 1EUAA 4AWUA 1ADOA 3SECA 1N7KA 4CQ8A 1VQTA 3FJLA 3I65A 3LTPA 4XTIA 4JTHA 1G4EA 5D02A 1KM1A 1ICSA 1GVOA 4OV4A 3IGSA 4C1KA 4AWSA 2YW3A 3KVJA 1I4NA 3W87A 4LT9A 4K6AA 3LCHA 2A7NA 3W1MA 1QMLA 3HGOA 2GVGA 2DZXA 2J27A 3W2KA 4LVFA 3G1SA 3G1HA 2E6AA 1KLZA 1FDYA 1FXQA 3QMTA 4O13A 5C2XA 5FF4A 5D38A 1KTBA 1Q3NA 4BI7A 3LLFA 5EKYA 2Y70A 2QUTA 1AL8A 1S5VA 2AGKA 2AQWA 4NU7A 2JBMA 4HPJA 2Y63A 3QRHA 1W0MA 3LCLA 2E1DA 3R8RA 5K9XA 1VHNA 5LZLA 2A6NA 3MWAA 5F2IA 3U8GA 2V82A 3SR7A 3KXQA 4NUWA 3GXTA 1OFDA 1KTNA 3W7DA 5D2XA 4MFDA 1OF8A 4LU0A 3FJ6A 3W83A 4ZVJA 1Y0EA 4IQLA 3DI0A 4JR5A 4BFAA 1KV5A 1OYCA 1MO0A 1Q45A 4MYXA 1LZOA 3GIYA 3OEXA 4LRTA 5LNUA 5J5RA 1ONRA 1DQXA 3GVGA 2EF9A 1C29A 5FEXA 5T26A 3LHTA 4DF1A 2J24A 3NM3A 1SZFA 5F2LA 5AHEA 1F76A 2RHGA 5F2GA 4CLMA 4DPPA 3I68A 2ZRUA 1QPOA 3NQAA 1F05A 2VENA 3PWAA 4MYAA 5DCEA 3S5ZA 5DN1A 2I9EA 2Y6ZA 4JTGA 4JTSA 4LVBA 3LCWA 1DHPA 3G8EA 3TUUA 4GUGA 1VS1A 1FCQA 2VC6A 1EEPA 4DO5A 3P8JA 4UMCA 3NZ1A 3LCIA 1Z41A 1BTMA 3LI1A 3MHFA 5CPOA 1EUNA 4O15A 2HMCA 1SO5A 1O5XA 4N4QA 4BWLC 3V75A 1CX9A 4FX6M 2QCDB 4ZQRA 3LM7A 3GLCA 4UFLA 3WJYA 5HMSA 3O15A 5HWNA 3QM3A 1L6YA 4LS0A 4RLIA 4N6FA 5K2ZA 4I7VA 4E0CA 3HGSA 1YDVA 3S1WA 1H7WA 4O17A 4UNLA 1K8XA 1ICQA 4IJBA 1FCUA 3T55A 4Y6GA 3TJXA 1FWSA 1S5WA 4AF0B 3BK0A 3NZRA 4CCCA 3UXDA 3QSRA 3M43A 1I45A 1JR1A 2ZZ6A 4OHQA 5G1TA 3LXBA 4AB4A 1GWJA 1R46A 3W73A 3GK0A 3MHUA 2QCFA 1HL2A 4M7SA 4Z08A 3KFTA 2BTMA 2BX7A 1J5TA 4IXXA 4XWUA 2YW4A 3KRZA 4MY1A 3SZ8A 1D3HA 2EKCA 4DXVA 1DV7A 3GNDA 3VI2A 4QNWA 2P1FA 4OT7A 5G4WA 1HO1A 2ZZ5A 3ATZA 1SUXA 1SZEA 1VYPX 1YDNA 3SSJA 5D05A 1E51A 1I2OA 5E0KA 5CKSA 5L9FA 5DCDA 1QR7A 4POCA 4IPJA 3TH6A 2FDSA 2E68A 4OE7A 5C5YA 2YX0A 3Q94A 4TU1A 3TAKA 5CSSA 2WO5A 4NNAA 3IVUA 3BO9A 2ZZ7A 2ZA1A 3HPSA 1YADA 3OG3A 4Z0JA 3PM6A 4GFSA 3KVKA 4AVFA 5SWUA 3YPIA 4O1CA 3F1QA 3KRSA 4N9EA 1W37A 3PULA 4HSOA 5EMUA 1V5XA 3EX3A 1JUBA 3TR2A 5G2WA 5BNKA 1AG1O 1JJKA 5AHLA 3EWYA 5G4EA 1VCGA 1KFKA 3NQMA 1WOBA 3BG9A 2ZQ0A 3W3OA 4B5NA 5E1QA 2TYSA 1EP1A 3LXAA 1FCBA 3QMRA 1HTIA 5DCBA 5L6UA 4HPXA 1MEIA 2FPVA 2A4AA 5A5WA 4AH7A 5MHBA 3WK0A 4WOQA 4QNEA 5FF3A 3UPBA 2A6LA 1XBVA 3EXRA 1F6PA 5TIMA 3L0NA 3QF0A 3UZ5A 3A9IA 3M5XA 3W1PA 3BW2A 1AMKA 2V8ZA 1A50A 4DF0A 4K38A 2JK2A 4HT3A 2NWSA 3EKZA 2RFGA 4FNPA 4ADUA 3MBFA 5AYXA 3P82A 2GPTA 2V5LA 1GTEA 1DKWA 1XDMA 1WA3A 2C3ZA 1QOQA 4ICNA 1S3HA 2CLIA 2DZTA 2BSLA 2UV8G 5DY3A 6TIMA 3Q58A 5KZDA 1JRBA 2CLHA 4QJ1A 4JX4A 5K9CA 4KWWA 1OFOA 1EPXA 3EWXA 3TU9A 3S1XA 1O60A 3PBVA 2Y62A 3S0CA 1KFCA 1G6CA 3W7RA 1BKSA 3GAYA 1Q6LA 1TPH1 2VELA 2VXNA 5IBXA 4E2BA 3E9AA 3DI1A 1SFLA 2H90A 2VKZG 2VEIA 5DLCA 1VLWA 3DFOA 1ZJIA 4CNOA 1Z44A 1QPRA 3RFAA 2TSYA 2PURA 4NZJA 5C6MA 1JULA 2QUVA 1LRQA 5BMWA 2PCQA 1EWEA 1UCWA 1JUKA 2Z2UA 4GUHA 3OA3A 5HINA 3O07A 4OV9A 4GJ1A 1M7OA 1PHQA 4JTJA 1FDZA 3LHYA 3BW3A 5HNRA 5D37A 5LNRA 1EP2A 2Z1BA 2J9ZA 1JCNA 1KFLA 2CZDA 3HG5A 5FESA 1QOPA 4IMEA 3W7PA 4IMFA 4Z1DA 3HG2A 4Z1BA 1FWRA 1XBXA 5AC6A 3LGEA 1HO4A 2DP3A 4MLJA 5FEZA 2CLFA 4N4PA 4O57A 4DBDA 3M6YA 2E5DA 3KVMA 3PF3A 3DXIA 5F4SA 1VR6A 3EX1A 2WOQA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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