4IWW | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	247
structure length	246
Chain Sequence	PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSVRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMMDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEITDENDLDIALRIGARFIGISSQDDETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVADSGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKELIL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Computational design of an unnatural amino Acid dependent metalloprotein with atomic level accuracy. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Unnatural Amino Acid Mediated Metalloprotein
molecule tags	Metal binding protein
source organism	Sulfolobus solfataricus
total genus	91
structure length	246
sequence length	247
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date	2013-01-24

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4iwwA00

2Y61A 2GUUA 5HWNA 3LTYA 1RQHA 1ZALA 4A3UA 3MUXA 2W0UA 3NM3A 3LLDA 5CSRA 4RJEA 3NDOA 3WFAA 1WYIA 3CIXA 1H60A 3IGUA 1WQ5A 2GVGA 3BLFA 4HSNA 4LVDA 5J5DA 2PRLA 5D02A 2E6AA 2B0MA 3TNOA 3NQ2A 4UTKA 3W07A 1H51A 1GTEA 1KLZA 2YZRA 4MZ8A 1P4CA 4O50A 1UBSA 4MFDA 3O16A 4JEQA 2WNQA 2QF7A 3N9RA 2PRMA 2H8XA 3LM7A 3NPVA 1YTEA 2ALDA 4MLRA 3UD6A 3LCXA 4HT3A 4IOTA 4OV4A 5EL1A 4EF9A 2YPIA 1YLVA 4JS3A 4HN4A 4IMFA 2FDSA 4H4IA 5LZLA 3W1PA 4RKAA 4GE8A 3DKLA 4GRSA 4UMAA 5CZTA 3NOEA 2CFFA 1XKYA 4FEZA 2VFIA 1TV7A 4O14A 1ONRA 5DLCA 2Y7FA 2PCQA 1L6WA 2QDHA 4QISA 4JD4A 1KV8A 2B7QA 4MZ1A 4N6FA 3T4CA 4LVGA 4N2YA 5G1TA 5KSWA 3H55A 5KMYA 5F1VA 2YFNA 2NWSA 3TROA 2B4GA 4MKNA 3G18A 4PL2A 1YXDA 1F5ZA 4W9TA 1KFLA 3M41A 1GVOA 5DBUA 4EVZA 3MP4A 1TQJA 4JIPA 4IMCA 1R46A 2JGQA 4UFIA 1KM4A 1H1YA 3DHFA 2E6DA 5LHEA 3NVTA 1H7PA 3UQNA 3CWNA 5AHFA 3FJ6A 2QAPA 2XN1A 1BKSA 2FB3A 1RVGA 3KVMA 1TPB1 2FFCA 1LRNA 1H7WA 4O18A 4XBKA 1XBZA 1UJPA 3MI6A 4AMAA 2CLHA 3QPYA 1H7RA 1UASA 3HGRA 3CWOX 4LRSA 5K9XA 3PF3A 5I3FA 3W2MA 2DORA 1Z41A 3FJLA 1XM3A 1OX4B 4O0KA 4JTLA 2V0TA 4BF9A 4MY9A 1W0MA 1K8ZA 2F84A 2C14A 3RLUA 3IRDA 2CLKA 1XFBA 2ATMA 2Y89A 3GYEA 4KKXA 3TK7A 1SQ7A 4L4MA 1B4KA 1TJRA 1YXYA 4NJJA 5FEZA 2GOUA 1PCKA 3PSVA 4CCCA 5EMUA 3QYQA 3IIVA 3LGEA 3UWYA 1K02A 4LV4A 4K36A 2ZA3A 3KRUA 3BGGA 2GQ9A 2Y7DA 4Y8FA 2WV8A 3F1QA 1S3HA 4NNAA 4UTIA 2KZHA 4EF8A 5KZMA 1F7BA 4PC8A 4N4PA 1G4SA 3DZ1A 2XN0A 4PFMA 4LT9A 3CT7A 1PS9A 3O6CA 3O06A 4BI5A 3P5YA 4KWVA 3N2XA 3L0KA 1OK4A 1PV8A 1B57A 3L65A 5AB3A 1FQ0A 3O6DA 1TYGA 1VS1A 3QSRA 3TJXA 3KXQA 1Y0EA 2W79A 2I14A 3CEUA 3BLEA 2BSLA 4O11A 5U7SA 3NPWA 1N7KA 1LTDA 3W2KA 1TPEA 4WXZA 2C1HA 4GNJA 1G4PA 4IX2A 1YTDA 2OCZA 3W22A 1JCJA 5D32A 1W3NA 3NXFA 1CX9A 4NXKA 3JRKA 5CGQA 2NX9A 2C16A 2E5DA 4ZQCA 3I6RA 4XBSA 3TR2A 3WK2A 1K8YA 2QCGA 4UNLA 2J27A 4B5NA 1TQXA 2A0NA 4NZFA 3CEPA 3EXTA 3M44A 3GDTA 2ZZ5A 1FDZA 3NO5A 2VFEA 1Q45A 5G2HA 5AYXA 1MXSA 1XXXA 2Y62A 3P81A 4OBTA 2D73A 3QW3A 3W1RA 5C2XA 3L67A 5G2WA 3GR7A 4ADUA 2GVLA 1TJPA 4UR8A 1NSJA 3ZS4A 1QOPA 3SECA 2Z1BA 1QAPA 4AHOA 1C8VA 1ME9A 3THQA 3I7QA 3V1PA 3WK1A 1NF0A 2VELA 3NR0A 1ZJIA 4QQ3A 3HG3A 2V82A 3DXIA 3OVQA 1SUXA 3VE9A 1K7EA 3LHUA 2PE4A 4KWWA 4L4LA 3M5YA 4BWLC 3NZ1A 4GBUA 4A29A 1VR6A 3STFA 2WJZA 1NEYA 1XUZA 2X1UA 2VKZG 5C6MA 1PHQA 1GVRA 3CHVA 4ORIA 3HG4A 2BWGA 1FDYA 4UTLA 3W7DA 2NXIA 3C2VA 1OYBA 2EF9A 2B7NA 1FWTA 1KV5A 3T55A 2FPVA 1F2JA 2QCDB 4M19A 1EEPA 1L9WA 4O4VA 4WD0A 1RZMA 4ZQMA 4N9BA 4LVAA 1SO3A 4GUJA 1KBIA 4FNTA 2JBMA 3N34A 2QUUA 4KFOA 4HPXA 1TIMA 1G4EA 3ATZA 3EWYA 4UTMA 2C18A 1XBXA 3TCEA 3SGUA 1Q6LA 1H61A 2QCEA 3P61A 3R12A 1E51A 2A6NA 3PG8A 4JTHA 4X3ZA 3I7RA 2FB2A 5KINA 4OGZA 3A5FA 1TPFA 4CLMA 3CB8A 2LLEA 1I2PA 4BR1A 3M9YA 3GLCA 1TRDA 3EWBX 2EAWA 1LRQA 3W7EA 2FPTA 4QAIA 4MJMA 1Q6RA 1FWWA 1W5NA 3KRZA 4A2RA 3EXRA 3F4NA 3B8DA 4LVFA 3M5XA 3R89A 3C8FA 5IM51 1A50A 5HUOA 3LDVA 5K4XA 3KRSA 3KHJA 2NZLA 2VEMA 1VYRA 1T99A 3W1UA 5FESA 1FWSA 4CCEA 3UXDA 4CNPA 2Y7GA 3IIZA 1QCWA 1UUOA 1GTHA 1VGAA 2NXHA 2QJGA 1K8XA 1G6CA 3MMTA 4RCXA 3VKJA 3P5ZA 4XQ6A 4M7TA 3TQ0A 2VFDA 1H63A 2DZXA 2Y7EA 5EPDA 3TE9A 1GOXA 1QWGA 3A23A 3B0PA 3FKKA 1PHWA 4DO5A 4HNUA 1KTNA 3FEMA 1XBYA 3HPZA 2YGYA 2WNZA 1BTMA 3NM1A 4GUIA 4FX7A 2NLIA 2J9XA 2YR1A 3MYPA 4UTTA 3EKLA 1R47A 1HTIA 4OHQA 1F73A 4G1KA 1I2RA 3ZR4A 5DELA 1ICPA 4RXFA 4UR7A 4PTNA 3UY8A 1RD5A 2V81A 1RQEA 4I7VA 1SZNA 3TIMA 1IIGA 3IV3A 3DFTA 4DF2A 1EP1A 2NX1A 3RU6A 1NAL1 2J88A 3G8RA 3C6CA 2OJPA 4Q4KA 1WX0A 5AHEA 3OBKA 4OQVA 4ZL1A 4PA8A 5A5WA 2ZZ2A 3GKFA 3TSBA 4ADTA 2I9EA 4MUZA 2TYSA 4JTTA 4ZZ9A 2NX3A 1YPFA 1J2WA 5CSSA 3HJZA 4C1LA 2HSAA 2CZFA 1IXPA 2NUYA 1KFJA 1N55A 1OFDA 3NPUA 3NQMA 3LB0A 2RFGA 4IQLA 3LI0A 2DZUA 4GUHA 3EB2A 3GZ3A 4Z1CA 2R94A 4POCA 2UV8G 3S9YA 3PBVA 3T7VA 5D04C 4XWUA 3MYOA 4TMCA 4K8HA 3RK8A 3T78A 3WJXA 1LOLA 5CPMA 2CLLA 1OFEA 2QR6A 1OFBA 1DHPA 3L5AA 5F4WA 3BVJA 3QC3A 5AC8A 2GQ8A 3QM3A 3CC1A 2A6LA 2NV2A 4Q32A 3LCIA 1YYAA 2HMCA 4NUWA 1KTCA 4O52A 1NFBA 1K03A 4K7VA 4IXXA 1M5WA 1Z48A 1YDNA 4O19A 3QEZA 5BMXA 3ANYA 3NA8A 3NQDA 1F74A 4UUIA 3M6YA 3LHTA 3E96A 2ZQ0A 1ZAIA 4HNVA 3TC6A 5HWMA 1TCDA 1HG3A 3S5YA 1H5YA 1KA9F 3W7LA 2YYTA 1WV2A 1ZFJA 2VC6A 1O60A 2A1YA 4OT7A 3EKZA 3E02A 4BFAA 1WXJA 3SI9A 3HBLA 3LRLA 4YWIA 2EHHA 1PVNA 3IGSA 2V2DA 2YCEA 3P62A 3NAVA 1DL3A 1EIXA 2CU0A 2GJLA 3FOKA 5TQLA 2G97A 3ZFHA 4N9EA 2FPYA 3C56A 3GDMA 2R91A 3L2IA 1SW3A 1S5TA 2X1SA 1TPVA 5LNUA 2QCLA 2V2HA 1JRBA 3O07A 3ELFA 2DJLA 5F2IA 5I3KA 4S1FA 4FNQA 4LU0A 3LV6A 5CZJA 3KAOA 4PCFA 3VI2A 5DXYA 4JX5A 4JR5A 4OWGA 4YL2A 2OT0A 4EOUA 1OX4A 1SW0A 2GVJA 3PAJA 4XUGA 4CNOA 3DU0A 5K4ZA 5F2MA 2IQTA 1F05A 1VHNA 1QDSA 2CZ5A 2WKJA 5BNKA 2ABAA 3LXBA 5E93A 1ZHAA 4BI7A 3CU2A 3P82A 2X1RA 1F76A 3PB2A 4AEOA 4DO6A 3DKJA 3QPZA 1GVQA 4WX2A 2A85A 3TFCA 1VPXA 4GXMA 1TO3A 3SR7A 3KX6A 4WQ6A 3B0UX 3MI3A 4HKPA 4PEKA 4O16A 1O95A 3HGSA 1XI3A 4X22A 1TSIA 4HNTA 4O1BA 1ICSA 3LTPA 1U83A 4NJIA 4IWWA 4Y6GA 1QR7A 1KFEA 3OVRA 2DZVA 2WSRA 3G24A 3PC0A 3PR2A 4O17A 3W23A 2VENA 4UMCA 5DCBA 4FNPA 5HMSA 3F03K 1DQXA 1AK5A 1GEQA 4K6AA 4RZ4A 2CW6A 2X16A 5HWJA 1EPXA 3S0CA 1OABA 2J6XA 2V8ZA 3W86A 2G95A 2WOQA 1DOSA 4NVTA 2V5BA 3LCFA 3O8AA 2E6FA 3HIJA 5I3IA 3GXTA 1KFCA 1AL7A 3LHZA 3TW7A 3EWXA 5I3HA 1W5MA 4YCOA 3B4UA 1G4TA 3HG2A 3PM6A 1SO4A 3TAKA 5LNSA 1TB3A 4M5PA 3SW6A 3W84A 3MWAA 4OV9A 5H2ZA 3NQ8A 1BEUA 3OG3A 1OVDA 4NQ1A 4TR9A 5D03A 1LYXA 3LCHA 2YSWA 3W2UA 3KVJA 2RHGA 4AF0A 1LCOA 1KM5A 1W31A 3PY2A 4JDYA 3PB0A 2ZRVA 4IGHA 3EX3A 2H6RA 3DI1A 2H8ZA 1L2UA 1GZGA 5I3JA 1TV5A 4DF0A 3HPXA 3KVLA 1RR2A 1I45A 3L68A 4DPQA 2H3BA 2A21A 3U8GA 4NX0A 4ZMGA 4JYEA 1OFQA 2JKPA 4KFPA 4DXVA 1A5CA 1I2OA 3W1LA 3AJXA 5G2IA 3W1XA 4JX6A 1SSDA 1FCUA 3G1SA 3O6YX 3WJSA 1QNVA 4MYAA 1V5XA 4UFJA 1OYAA 3JS3A 3N19B 4QNWA 4IMGA 4X2RA 5HULA 1WBHA 1ZCOA 2XFWA 4OE7A 2QCDA 3P84A 5HINA 1PIIA 4BWLA 2YW4A 3PULA 3PUEA 3PWAA 3T44A 3GIYA 3MO7A 3C2OA 4Y9AA 3IVUA 4ALDA 4YCPA 1FWNA 4O28A 4E38A 1JQVA 2JGYA 1VLWA 3L66A 2DZWA 5CPLA 2B7OA 2X2GA 4AB4A 1TPH1 2CZEA 3TMQA 3RNDA 3W7KA 3S8HA 5KZDA 3TJLA 4R33A 3P8IA 1J4EA 3ATYA 1B4EA 2A2IA 2J9YA 1S5VA 5DCDA 3W3OA 3LI1A 3UWQA 1MZHA 4Z1AA 4WOQA 2ZBTA 2QUTA 3UWZA 4O15A 2JKEA 5FF2A 5FF4A 5H91A 3Q58A 2Z6JA 3R8RA 3SSJA 4A21A 2DZTA 2ISWA 4XZ9A 3N2MA 1ZAHA 4JTSA 3DFSA 1LBLA 3KVKA 3Q37A 1YADA 2X30A 1Z42A 3A21A 1KTBA 1JCYA 4Y96A 3DENA 3QJAA 4ZQRA 5AYZA 3W7MA 1OG0A 1SPQA 4JY9A 5D05A 2VFFA 1W1ZA 3QRHA 1DVJA 4AF0B 1VZWA 2RKXA 3NL6A 3GAKA 1SO6A 2ZTJA 3W9ZA 1S5WA 3S1UA 3W76A 2ABBA 3TH6A 4FNRA 3NQAA 1FCVA 4FIQA 5DXXA 1P1XA 1JCXA 2YDAA 4LUIA 3IEBA 4X9SA 2CZDA 3QF0A 3W85A 1QPRA 2TPSA 1AL8A 2Y70A 3TX9A 3HMJG 3NQ6A 3GX9A 5EYWA 4UIOA 3TSDA 3B06A 1SZGA 3DI0A 1UUMA 4GFSA 1X1OA 1I2QA 4FNUA 3NQFA 2QUVA 1TRIA 1EWDA 4QSHA 1Q6QA 2A7PA 3WK0A 4LTSA 1JCNA 3IVTA 3G1FA 4QM1A 1GQNA 4NT0A 1C29A 3MHGA 2G96A 3CLMA 1R2RA 3MW7A 2QKFA 4GWEA 2I1OA 3ZWSA 5LNVA 1GG1A 4O1AA 1SO5A 1QO5A 2DZPA 4RXGA 1W8SA 1TV8A 3DAQA 4RR4A 3THAA 2BZNA 4EWND 4K37A 1ALDA 3NL2A 2PC4A 3E12A 3ABRA 1OFRA 2CLFA 5A8GA 4JGDA 4M6PA 3MI2A 5LNWA 3TC7A 5CPOA 2C0AA 4UNKA 3L0GA 5AYYA 2C6QA 1UCWA 3JR2A 3TA6A 3MP5A 4FF7A 4ORMA 4WY0F 3M16A 5DCEA 3LHYA 1KM1A 4P61A 2QCFA 3BV4A 5BW6A 1AW2A 3L0NA 1P5BA 1P0KA 2EGZA 5FF0A 5HNRA 3STGA 2F7FA 1HFBA 3TSMA 2V5LA 2DP3A 4O57A 1JULA 2JKAA 2ZZ3A 3LX9A 2JK2A 2AAMA 4O54A 3G1XA 5BRBA 4MZYA 1A53A 4IXHA 4AHPA 5BOOA 6ALDA 1EWEA 4UTWA 3RF9A 2WSQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4IWWA

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Chord Diagram

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