4IX0A

Computational design of an unnatural amino acid metalloprotein with atomic level accuracy
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
247
structure length
246
Chain Sequence
PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSVRASRQRPIISLNERILEFNKRNITAIIAEYKRKSPSGLDVERDPIEYAKFMERYAVGLSILTEEKYFNGSYETLRKIASSVSIPILMMDFIVKESQIDDAYNLGADTVLLVKILTERELESLLEYARSYGMEPLIEITDENDLDIALRIGARFIGISSQDDETLEINKENQRKLISMIPSNVVKVADSGISERNEIEELRKLGVNAFLIGSSLMRNPEKIKELIL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Computational design of an unnatural amino Acid dependent metalloprotein with atomic level accuracy.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Unnatural Amino Acid Mediated Metalloprotein
molecule tags Metal binding protein
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 95
structure length 246
sequence length 247
ec nomenclature ec 4.1.1.48: Indole-3-glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2013-01-24
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ix0A00
3BG5A 1I2OA 1XCFA 3S5ZA 3FOKA 1BWKA 2E68A 3NPWA 5U7SA 3GXNA 5CPNA 1R30A 2B7OA 3W1QA 4FXSA 1A5BA 2DU2A 5AHMA 5AB3A 1Q3NA 4YCOA 1KM6A 2E6YA 3A9IA 2PE4A 3BGJA 1W5QA 1EWDA 3PC0A 1TPDA 2Z6IA 3M5VA 4XBKA 4UTWC 1LTDA 3JR2A 2CZ5A 3QW4B 1FWWA 1THFD 1T99A 2HSAA 2H8ZA 2C18A 5D2WA 2J24A 1ME7A 5I3GA 1JULA 1PV8A 3GR8A 2WOQA 3DI0A 5G1TA 5K9DA 2A7NA 1QPRA 4OHQA 4O4VA 4FO4A 2P1FA 4GUFA 3OHIA 3IIZA 2AGKA 3ATYA 4IMEA 4A22A 4KKXA 2A1YA 3KFTA 1GOXA 2E6FA 4QNEA 1KTBA 1RQHA 3F03K 3M1ZA 3W22A 2ZZ1A 1ML1A 3PY2A 4CNOA 1UUOA 1YADA 1B4KA 1LOSA 3EX3A 3L68A 2D73A 3LOTA 4C1KA 4AXKA 2H3DA 5IM51 3EKZA 3A23A 3BW4A 3G1YA 3S9YA 3DFOA 1Q6LA 2G97A 1EP2A 4N9EA 3N2XA 1A5CA 3A5FA 3CM4A 3KVKA 5L6UA 3HGOA 5DLCA 1K7EA 1QNVA 1F73A 3O05A 1TPEA 3T55A 2DZWA 4M6PA 3MP3A 3HPXA 1TRIA 4O8RA 5EKYA 4ZQNA 5CZJA 4GUIA 4OGZA 3PUDA 3V75A 5GVJA 4AF0B 2RKXA 4R33A 3QMSA 3M0ZA 4UTMA 1KM2A 3LCXA 1K8YA 2V81A 4JICA 5CPOA 1TV8A 2QCEA 5EY5A 1MXSA 4O1AA 2WO5A 3QQ1A 5DXYA 1ICSA 3LCWA 3G3MA 3LHYA 2CLKA 2JGQA 4JR5A 4NQ1A 3GLCA 2QCFA 4LW7A 1HG3A 1SPQA 3WK3A 1CX9A 2Y7GA 2QAFA 4WD0A 2Y89A 1H7OA 2LLEA 1WOAA 3KVJA 3G1DA 4WY0F 3MI6A 1M5WA 3QF0A 3IEBA 3S1VA 3TKFA 3O63A 2ZDRA 4GFSA 1TB3A 1HFBA 2AQWA 1E51A 3LV5A 3W2LA 3OEXA 1M7OA 2ZBTA 3NZRA 4MLRA 2QCGA 3AO0A 3KRUA 3O6DA 1P5BA 2GUUA 4IPIA 1W3NA 3R13A 1FCQA 3NEVA 4E38A 1S5TA 1M7PA 4M7TA 1PCKA 4AWUA 4X2RA 3S6DA 4O28A 5G1YA 3FYOA 4X22A 3RF9A 2ZQ0A 3TX9A 3L2IA 6ALDA 5CZSA 1FUYA 2A7RA 3LGEA 3UWWA 3TMLA 2ZA1A 1CI1A 5CSSA 4XQ6A 4AHQA 4K39A 3WFAA 3W87A 3PBVA 5K4ZA 2OX1A 2OZ0A 1JCMP 4QM1A 5D2TA 2FIQA 5H91A 4RZ5A 4UNLA 2Y62A 5I3JA 1XKYA 5T26A 5TIMA 3B0PA 1XL9A 2YW4A 2OJPA 4GNJA 4DO5A 1G67A 5CGQA 3C2OA 5HR7A 3W1MA 3SECA 4LWWA 4JTUA 1FXQA 4IUOA 2TYSA 1N55A 1EA0A 2ZZ6A 3WJYA 4LT9A 1K7FA 3O1NA 2FTPA 3CPRA 4FNQA 4RK8A 2R14A 1VS1A 3O15A 3MUXA 4H6KA 3EWBX 3TE9A 3NA8A 2A6LA 1GTHA 1KFKA 4Y9AA 1GZGA 3SI9A 3LTSA 4UXDA 2NX9A 1I8JA 1B9BA 1QO5A 1T96A 4BWLC 3M47A 3MWAA 2Y6ZA 3S42A 3EEGA 5D05A 3S5YA 1ZAIA 1MZHA 5DBTA 1WX0A 1GYNA 3NPVA 5FF2A 1D3GA 4MJMA 2Q3RA 3PB2A 3UD6A 1SW3A 3C2RA 1TQJA 2NZLA 1Z48A 3DHFA 3N9RA 3W7GA 4ADSA 4BF9A 4CCDA 4FXRA 3JS3A 3UY8A 3UY7A 3UWZA 4FIRA 2XN0A 1K7XA 4NXSA 3TFCA 4O0KA 4RJEA 3SGZA 1W37A 3LTYA 4QIUA 5AC7A 1HL2A 3DFQA 2VXNA 4UC5A 3HF3A 1JCYA 2Q3OA 4L4LA 5G4WA 6TIMA 5K4XA 4YCPA 2X30A 3MO7A 2VFHA 4QISA 1OFDA 1TMHA 1W5PA 1L6YA 3MYOA 3I65A 4I9AA 3OA3A 5A5WA 3IVUA 3W7NA 1RQBA 1OFOA 3G1FA 1ZAHA 3BVJA 3C2FA 5HUOA 3NM1A 3N14A 4HPJA 1TIMA 4NJGA 4N6EA 3IRDA 5LSMA 5F4SA 3HGJA 3MYPA 3MHFA 4ZQOA 1KTNA 1TTIA 1W5MA 3EWXA 5CZTA 3GKFA 1JRCA 2C15A 4K36A 3DU0A 2YPIA 4AHOA 4RKAA 2PRHA 1Q6OA 3L5AA 1FCUA 1LRNA 3GK0A 5E0KA 3B0VC 4CQ9A 4E0CA 4QNWA 1QAPA 3JRKA 3LHVA 1IXPA 1VJIA 3O8AA 3W7HA 2X1RA 3W3OA 1XM3A 1JCNA 5LZLA 4QITA 1KM3A 4LUJA 1P4CA 1TO3A 5F2MA 1A50A 4WUIA 3VCRA 3M43A 5LNRA 5LNUA 4UFHA 1ZFJA 2E6AA 5AC8A 3BV4A 1FX6A 3ZR4A 3ANYA 2E77A 1GQNA 3BW2A 5AYYA 3RNDA 3BO9A 3EWZA 3DGRA 1NF7A 3WK1A 1OHLA 3GXTA 4MUZA 1MEWA 3EWUA 4Z0JA 2UV8G 4HIBA 4LC8A 2ZTJA 3NG3A 5BNKA 3TH6A 2CLIA 3WJXA 4QJ1A 2DJLA 1DHPA 3CIXA 3GAYA 2YSWA 3ELFA 4NZFA 1J5TA 2Y7EA 1KFEA 3LRKA 4N9BA 5KTLA 2FB2A 3MI3A 1TTJA 2Y61A 3P5YA 4OT7A 2DP3A 5HULA 4AB4A 2NWRA 3DBPA 4RZ6A 3CWOX 1FDYA 1YLVA 3LLFA 2BLEA 2CW6A 4WY0B 1OX5A 3LCIA 3R89A 3GXPA 2QDGA 5D09A 1Z41A 2HS6A 3TC6A 2CU0A 4UUIA 4LNYA 4MY9A 4O18A 3I6RA 4WX2A 5DBUA 4RX0A 3DFSA 3G18A 5BW6A 1G7VA 1KBJA 1PVNA 2RHGA 4JTLA 2FPTA 3RU6A 2R94A 3NOEA 1RQEA 2HTMA 1MEIA 3NQAA 2C14A 8TIMA 1Q45A 3G1HA 3TXVA 4HN4A 1PHWA 1IIHA 3Q94A 1SQ7A 3P74A 3LRMA 1PS9A 4A29A 2AAMA 5C5YA 2VFEA 2O7SA 1ZNNA 3NPXA 4M6QA 2ZFAA 1VQTA 3LB0A 1W56A 4ZL1A 2ZRXA 3G8RA 2OMAA 5FEPA 3LX9A 4PL1A 4K6AA 1BEUA 1VYPX 3IIVA 3W7LA 3QEZA 5LGZA 3VI2A 2CLEA 3TAKA 3LCLA 3HMJG 4U4MA 2XN2A 1OFAA 4Z08A 2JBMA 2VENA 2DJXA 1H7NA 3QC3A 3P81A 3GR7A 3W72A 1G7UA 1IXNA 3GYEA 3C0JA 4LTSA 4N02A 2NXHA 1OK4A 3GDTA 4K38A 3KXQA 4Z1AA 1FWRA 4PODA 1AL8A 4O50A 2TSYA 4PFMA 5TQLA 1SW0A 3IGSA 1ME8A 4BFAA 3E0IA 4FNRA 4EOUA 4JTGA 3P84A 4UFIA 4NJKA 2W79A 1VYSX 3FS2A 2WQPA 4PTNA 2X1TA 3W1PA 4O19A 4P2VA 5CPMA 5KZDA 3HJZA 4LRSA 1TJPA 3PUOA 5D32A 1L9WA 3TU9A 1QR7A 1S5VA 4EF8A 1H62A 1XFBA 3HBLA 3PBWA 5IBXC 2QJHA 4R53A 4RXGA 2VEIA 3C2EA 3PG9A 3SR7A 1YTDA 3HOJA 3O6YX 3EKLA 4K7VA 5DY3A 2QR6A 3HG3A 4WY0A 4X9SA 1LLWA 1OF8A 2PRMA 2GVLA 3Q58A 5K9CA 1X8FA 1JUEA 3TSMA 1EIXA 3W7IA 4JDBA 1JJKA 2A2IA 3UWQA 3EX2A 2H3BA 3EX1A 1IIGA 2VFGA 4PA8A 1LDCA 2OT0A 3PBUA 2FLIA 3NQDA 4DF1A 1VLWA 1IXOA 1I2RA 4I7VA 1ICPA 1S5WA 2R8WA 3OVPA 3NQ8A 4IXXA 1LP6A 4Y6GA 4UTLA 2V8ZA 3QJAA 2X1UA 5EYWA 3B4UA 5FI8A 3W07A 1X1OA 4IJBA 4FX8A 2B7NA 3EX6A 5FF4A 4JIPA 4GJ1A 3DXIA 4TMBA 3TSBA 3QMRA 2ISWA 1R2SA 3DENA 3W2UA 3TFXA 3TW7A 1OFQA 4MVAA 3GVGA 4Z1DA 1TV7A 1XBVA 5EA9A 3QPYA 2QJGA 2ZTKA 1G4SA 3UYCA 4AAJA 3G1SA 4IPJA 3G0UA 4MLJA 3PB0A 1RPXA 4Q32A 4NU7A 4A3UA 1KV8A 4KFNA 5LNSA 2E5BA 2KZHA 1VHCA 1U83A 4WZHA 2NV1A 3W7CA 5G2IA 2RDUA 2TPSA 3NQFA 5E93A 2VC6A 4M5PA 1PHQA 1H1YA 1F05A 5U4NA 3SJ3A 2CLMA 5LNWA 4GUJA 1LCOA 4PH6A 4JX4A 2YGYA 4TO8A 3W1NA 3L5LA 3UWUA 5D04C 3H54A 1SU5A 5L9FA 1QOQA 5MHBA 1JRBA 5G4EA 3EXTA 1LOLA 2C16A 2NLIA 4UTKA 1W3TA 4JY9A 4LVDA 3FIGA 4OE7A 1KV5A 1JUKA 3G0SA 1SFJA 3QYQA 4LOCA 1SO5A 3N19B 3TK7A 1H7RA 2V30A 3LI0A 4O13A 3HO8A 4LVBA 4YLWA 4QSHA 4MJZA 3U8GA 3T78A 1PE1A 2E5CA 4NT0A 4M7SA 1LBFA 1EEPA 2ZZ2A 1H5YA 4O15A 3WJSA 5C54A 4UMBA 4YXGA 3A22A 3GNNA 3W83A 4AHPA 2CLOA 3DKJA 3FYPA 2QUTA 4JTTA 3TV8A 3FLUA 3F4NA 3N73A 4OQVA 1VR6A 4LV4A 3UZ5A 3Q2DA 3KRZA 2ZRWA 2Y85A 2FQIA 3IV3A 1A53A 3FJ6A 1FWTA 4NZJA 3CQ0A 2WJZA 1B57A 1QMLA 4LS0A 1L6WA 4UTUA 4Q4KA 3HGRA 1XXXA 4XTDA 4AH7A 3LHZA 1H63A 4R7JA 3W7QA 2A4AA 3DFTA 4ADTA 3C8FA 3KVLA 3M5YA 3ABRA 3R2GA 4O1BA 3W6YA 2NX1A 3TR2A 5AC6A 1HO1A 1KFBA 3LCGA 4ZQRA 2GJNA 1AW2A 3G22A 1QCWA 4Z1BA 4UTTA 1PIIA 1DOSA 3CIWA 3SFKA 3PSVA 1JVNA 2C13A 3LBMA 4ZVJA 3S1XA 3GZ3A 5DY2A 1VGAA 5DXXA 4CQ8A 4ML9A 1NEYA 1SZEA 1YTEA 1KFJA 1VCFA 2A6NA 3W2NA 3BG3A 3DH7A 3BGGA 2NXIA 4UMCA 1KFLA 3GKAA 3IGXA 4MZYA 2BZNA 3NL5A 3C6CA 4S2BA 4UFMA 1O4UA 1YTKA 1H7XA 3LDVA 1Q6QA 3VNDA 2CLLA 2IQTA 4D2JA 1OVDA 3F1QA 3LXCA 2ZRVA 3N9SA 4MY1A 4M6VA 2J9XA 5K7JA 3W7DA 1ZENA 1V5XA 3A21A 1WQ5A 4JTIA 5C55A 2NUWA 2GQ9A 2ZRUA 4JX5A 1M6JA 4EIVA 3W1TA 3W1UA 3W73A 3I7SA 3W1XA 3L5MA 3TIMA 1TPC1 1GG1A 3L65A 3SZ8A 2V2HA 3B05A 3O07A 1O95A 1ALDA 1LBLA 2Z0IA 1KTCA 1X1ZA 4JTKA 3BLIA 1GTEA 1TJRA 3CU2A 5I3KA 3GAKA 5K3VA 1TTQA 3L67A 2ZZ3A 4AWTA 4LV9A 3LRLA 1D9EA 2EGZA 1MO0A 1KM1A 3W1RA 5A8GA 1JCXA 3W7JA 4NVTA 3BLEA 3NDOA 1GVOA 5AHIA 4PCFA 4XBSA 1C9DA 1Y0EA 3NQVA 5CG7A 2Y7DA 3TROA 1DV7A 4TX9A 5F4WA 4O4WA 1PCWA 2TMDA 3W76A 1U5JA 3DAQA 3FFSA 5FF3A 2CLFA 4O1DA 1C8VA 4JX6A 2EKCA 4YL2A 1IF2A 1DJQA 3S5NA 5FEWA 1LOQA 1OFPA 2R91A 2VFFA 1G69A 1C29A 3NYZA 5TBOA 1SUXA 1NAL1 3EB2A 3VFLA 3MW7A 3ZWTA 5DN1A 1X6UA 3S1UA 3R12A 1IGSA 2DZVA 3NQGA 3GX9A 2Z2UA 2XFWA 4JS3A 2O7QA 3STCA 5BRBA 4R34A 2QUVA 2YFOA 3OVRA 4HNNA 5G2WA 4MKNA 4DPQA 4UTWA 3I68A 3LTPA 4JNMA 3K30A 5HINA 5K9XA 1GVQA 4AMAA 3HPZA 5J5RA 4TR9A 3W71A 5FF7A 1UB3A 1QWGA 1RV8A 1UJPA 5C6MA 1EB3A 1A5SA 2W6RA 1FXPA 3P62A 4DBEA 2ZZ5A 3BW3A 3W7RA 1TPH1 1EP1A 4UFLA 4ZZ9A 4LS2A 5I3HA 4DXVA 4WQ6A 1VZWA 2X2GA 3UNDA 1NSJA 4MFEA 1R46A 3KX6A 3ABQA 1LM1A 3NXFA 2B7QA 3R8RA 4S1FA 4FX7A 4IMGA 1F7BA 4RZ4A 4JGDA 1ONRA 1FQ0A 1DQXA 4WOQA 3A5VA 2J6XA 2WKJA 4OBTA 4YMZA 4UR8A 2BTMA 2ZA2A 5F2LA 4UMAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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