4IXXA

Crystal structure of s213g variant dah7ps without tyr bound from neisseria meningitidis
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
KIKEVKELLPPIAHLYELPISKEASGLVHRTRQEISDLVHGRDKRLLVIIGPCSIHDPKAALEYAERLLKLRKQYENELLIVMRVYFEKPRTTVGWKGLINDPHLDGTFDINFGLRQARSLLLSLNNMGMPASTEFLDMITPQYYADLISWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGNLKIAIDAIGAASHSHHFLGVTKAGHSAIVHTGGNPDCHVILRGGKEPNYDAEHVSEAAEQLRAAGVTDKLMIDCSHANSRKDYTRQMEVAQDIAAQLEQDGGNIMGVMVESHLVEGRQDKPEVYGKSITDACIGWGATEELLALLAGANKKRMARA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Neisseria meningitidis expresses a single 3-deoxy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase that is inhibited primarily by phenylalanine.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-deoxy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase
molecule tags Transferase
source organism Neisseria meningitidis
total genus 127
structure length 340
sequence length 340
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2013-01-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ixxA00
2DZPA 3MHFA 1H61A 1SU5A 2J24A 4I7WA 2CWNA 3LV5A 3SY5A 5C54A 5BNKA 5J5RA 2P0OA 1QFEA 3CQ0A 1JRBA 1KM2A 4Q4KA 2EAWA 2NLIA 5LNWA 2NWSA 1PL9A 5G2WA 3OVQA 3P81A 3W2LA 1AL7A 1KM0A 1LLWA 5FEXA 1X6UA 3M0ZA 2C3ZA 3VE9A 3TW6A 1NF0A 5IBXC 1I2OA 1ZCOA 2A5HA 1F76A 1ICSA 4M6PA 5D2VA 2V5LA 3EX1A 3DU0A 3W1RA 2YYUA 4TO8A 5BOOA 4FNUA 3M5YA 1WA3A 3GDRA 1H50A 3LHZA 3ZFHA 4K7VA 5G2HA 4MFDA 4FF7A 5D02A 4GRSA 1CW2A 3PF3A 2ZQ0A 4UR8A 3WJZA 1YDOA 2RH9A 2Q8LA 1L9WA 4GFSA 1W5PA 1R46A 2Q8ZA 2VFEA 5DXXA 3S0CA 1OYBA 3NL3A 1TTIA 2GVGA 3LCWA 4PCFA 2VFDA 3SIZA 2ISWA 5KITA 1Z48A 4HPJA 2C13A 3W76A 4NX5A 2V30A 5DCEA 1S5VA 3EKLA 4K36A 3C2FA 3W88A 1H7OA 3M16A 3CEPA 4O10A 5AHMA 1OJXA 4X3ZA 3DENA 5F4WA 1I4NA 3IVSA 4JTIA 4ORIA 3U6WA 1FWTA 2I1OA 3TSMA 4MLJA 3NQEA 1KM5A 3G0UA 4GC4A 1XBVA 1U83A 5G2IA 5K4XA 2ZRXA 3DKLA 2H6RA 2WO5A 3GDLA 4C1KA 3BO9A 3C61A 2ISVA 2E6YA 3OG3A 5E93A 1BEUA 1W3TA 4AEOA 5AHLA 3GNNA 3KHJA 1XUZA 2ZZ1A 4WJEA 3USBA 4EWND 3NEVA 4BI5A 3STGA 2JGQA 5K4ZA 2QDHA 2Y70A 4ORMA 3P8IA 1KLYA 4UUIA 5CZJA 4P61A 3M7WA 1RQEA 3MI2A 3T55A 1TPWA 2V2CA 2DP3A 4RXGA 1EP3A 3LLDA 4KFNA 3B04A 4XTIA 1QAPA 4QJ1A 3QW3A 3HGRA 2JGYA 4FX6M 2CLIA 1TPUA 4IOTA 4O1BA 5KINA 2QEZA 1VZWA 1W54A 3A22A 4ALDA 3THQA 4DPPA 2C1HA 1X1OA 3M5ZA 3ELFA 5KMYA 1QO5A 5K2ZA 4LOCA 5LNVA 3QQ1A 1M7PA 1G4SA 2C15A 3B0UX 4HNUA 4LU0A 3KVKA 3MI6A 2NUYA 1HO4A 3CIXA 4UFLA 2BLEA 3BW2A 4N4QA 2V82A 1JULA 2B0MA 4AHQA 3GB6A 4ICNA 4MYXA 2PRMA 4YL2A 3WFAA 1VYSX 3P74A 3LTPA 4MZ8A 4IMDA 5TQLA 3MBFA 1V5XA 3UY8A 1JJKA 1FCUA 1QCWA 5CKSA 1K02A 3P82A 5D2XA 4Q32A 3W7RA 3TFCA 5D33A 4X2RA 1TV8A 2ABBA 3BG5A 3GXPA 2ZRYA 5DELA 4UTMA 4NJKA 3ZWTA 3DFSA 2H8XA 2WSYA 4O17A 4C1LA 1TPEA 1IGSA 2E77A 2FQIA 3NL5A 3EWUA 3PBWA 3TQVA 3M44A 3IGXA 1DL3A 4U4MA 2YDAA 2Y6ZA 5CSSA 5AHNA 4WOZA 1K3UA 3UY7A 3W7IA 4ADSA 5LNRA 2GVLA 3C2OA 3KFTA 4RR4A 4IPIA 1DQWA 1EPXA 3HB9A 1KFLA 1XCFA 3IV3A 1VCVA 2JKEA 1XXXA 3WJWA 1BKSA 2DZXA 2H8ZA 4CNNA 1I45A 1QPNA 4GUGA 1VCGA 1IIGA 3CT7A 4NJIA 3QMRA 2B7OA 4MFEA 2YFOA 1JCYA 4O1AA 3QSTA 2WNNA 5F2GA 3CWNA 3LCIA 1UJPA 4NJJA 4PL2A 3PS7A 2HS6A 4CNPA 3A24A 1RV8A 2DJLA 2ZRZA 4HNTA 5KSWA 3ZS4A 4B5NA 3YPIA 3RLUA 1FCVA 2CZDA 3ATYA 3DFPA 3W2UA 1HUVA 4G1KA 1VGAA 3DI0A 4UFKA 1H7PA 2NV2A 3IVTA 4S2BA 2JKPA 5D30A 1W56A 2XN1A 4MZYA 1F7BA 2QAPA 3PSWA 1GG0A 2WSQA 3W1QA 4IX2A 4UTHA 3PY2A 1OFBA 5C5YA 1QMLA 2ZBTA 4ZQOA 3G1AA 3MWAA 3TDFA 1TPH1 3UXAA 4TU1A 3V1PA 3STEA 5CZSA 5BW6A 3L67A 4GWEA 4IUOA 1YXCA 1DOSA 4YXGA 1G7VA 1P4CA 4JIPA 5LGXA 1ZHAA 5CPLA 1SW0A 4LV9A 1NFBA 3NQGA 4QQ3A 3H53A 4N2YA 1KFBA 1R47A 4Y8FA 1BTMA 3HGJA 2KZHA 3MW7A 4LVFA 4O50A 3PG9A 5AC7A 3Q58A 1TYGA 4FNPA 1DBTA 3N9SA 5DBUA 1YDVA 4MPQA 4H4IA 2IQTA 3NM1A 3KRZA 3UXDA 1C9DA 2A7PA 3KVLA 2C18A 4O4VA 3SI9A 3W1MA 2ZTJA 3DXIA 1L6YA 5CPNA 5I3JA 3LCGA 1XDLA 4FX8A 4XTDA 4TMBA 3VE7A 3MP5A 3DAQA 3DFQA 2Y62A 1KM3A 1FQ0A 2V5BA 3HO8A 5D2WA 2EGZA 2QCLA 4M19A 1LORA 3GX9A 2GQAA 3NPWA 3TQ0A 4IQLA 1IF2A 3G8RA 3NO5A 3S1XA 4KFPA 4UFHA 1GQNA 5H91A 4HNVA 5AHFA 3NPUA 3PWAA 2Z6JA 3I68A 1ME8A 1JCNA 1LTDA 3SJ3A 1WBJA 3W9ZA 3O63A 4BF9A 1LBMA 3SGZA 3LXCA 1SW3A 4NNAA 2VENA 1LBFA 2ZA1A 3QFEA 3W1UA 2F7FA 3W7DA 3C4UA 3TW7A 2CZ5A 3D0CA 1GTHA 3W1AA 3EWBX 2QJIA 2V8ZA 3L66A 3GDKA 1OYCA 4UMCA 4N9EA 1T0OA 4ADTA 2YR1A 1KBJA 3GDTA 3L2IA 4KWWA 3TIMA 4RZ5A 4KWVA 5AB3A 3W71A 1H7XA 3N14A 1EIXA 2OX1A 4QSHA 3N3MA 2DJXA 1F73A 1VPXA 1K8XA 3TC7A 1JQVA 5AYXA 1SQ7A 2DZWA 4NVTA 4ADUA 1EUNA 1JR1A 3OEXA 4YMZA 5TIMA 8TIMA 4AWSA 1XDMA 3EWYA 4UTTC 1KTBA 2GVJA 4NXKA 5D32A 1P5BA 4AH7A 1MXSA 1KFKA 5L6UA 1W0MA 3NQ8A 4JR5A 4D2JA 1RR2A 4UMBA 2VC6A 4XUGA 2OT1A 3CWOX 3G1FA 3SGUA 4I7VA 5F2MA 3S6DA 1FWWA 4E2BA 2GQ8A 3SSJA 1EWEA 4IMFA 4HNNA 3W1NA 1SZEA 2HS8A 5U4NA 1WBHA 5DBTA 4NZJA 3P8JA 1LRTA 1K03A 3O15A 1KM4A 4MVAA 4TX9A 2Y63A 1GPWA 1LDCA 1F6KA 4HIBA 3B4UA 1TJPA 4EF9A 5C6MA 2QCFA 5G1YA 3GK0A 4EF8A 5AC8A 1QPOA 2VEIA 3CHVA 5A8GA 3QPZA 2FPYA 3QYQA 1FDJA 2Z1BA 4DEFA 4LC6A 3EXTA 1S5WA 4MY8A 1VRDA 1IXPA 3ZR4A 3LI0A 2X2GA 4GUJA 3L5LA 1AK5A 1OVDA 1XI3A 3L0NA 4O0KA 3UWYA 2A2IA 1ONRA 1R2TA 2LLEA 2ZFAA 2ZDRA 1ML1A 3ABSA 1LZOA 1ZALA 3DFOA 4JTJA 3N2XA 3BK0A 5CPMA 1SPQA 3ATZA 3BW4A 4ZZ9A 3PC0A 4OHQA 3MYPA 3IIVA 1SZFA 1SO3A 4Z1BA 1OF8A 4Y96A 1E51A 1W8SA 2WSRA 5EA9A 5FF2A 4A21A 3UPBA 4FXRA 3W1LA 3S8HA 3GAKA 4PEKA 3C3NA 1PIIA 2WPBA 3T4CA 1U5JA 3A23A 4LWWA 5I3GA 2HTMA 3GR7A 3GXTA 4UXDA 1SUXA 2D73A 2PURA 5HWNA 4UTWC 1EP1A 1Q6LA 2ABAA 3CTLA 3W7PA 1TV5A 3W7LA 2BZNA 2W0UA 4HSOA 1B4KA 5HINA 2H3BA 5I3KA 1OFAA 2NUXA 1QPRA 3NG3A 5IM51 3LLFA 4JNMA 2E6AA 4LRTA 2FIQA 4O57A 2O7QA 4N6FA 3G1SA 1ZAHA 4UTWA 2YW3A 3U2OA 3FFSA 1KV8A 2QUVA 1DKWA 3HGOA 4R7JA 5HUPA 2VFGA 4XQ6A 3KRSA 5K9XA 1H7RA 1AMKA 4K37A 4M7SA 2ZZ3A 3ABRA 1EA0A 2AAMA 3B05A 1K7XA 1VH7A 1D3GA 5HNRA 1EB3A 4FIRA 4Q33A 3NPVA 3L5MA 2X1SA 3W2KA 4OGZA 1WAUA 5D2TA 4E0CA 2X1UA 2AQWA 5U7SA 5EY5A 3UPWA 4LS0A 5IBXA 3BG9A 4LVDA 4GUFA 3LXAA 3IIPA 2ZYFA 2CFFA 3H54A 4M6QA 4H3DA 2C14A 2J9XA 3RF9A 3W1XA 1DJNA 4AHOA 4QAIA 3IEBA 4RKAA 1TQJA 2X16A 4JDYA 2Y7EA 3E0IA 4ZQCA 3INPA 3PBVA 2ALDA 3IGSA 3G0XA 1RPXA 1TTPA 1H7WA 1LOSA 3MO7A 1R2RA 1X7FA 3M5XA 3NA8A 2DZTA 1FDZA 3HJZA 1YLVA 4PH6A 3P7YA 5KZMA 1SSDA 4IXXA 1MEWA 1P0KA 4EVZA 3MP3A 1FWRA 3W85A 2Q3RA 4PFMA 1JRCA 1X1ZA 3UNDA 1M7OA 2FJKA 4NT0A 4UFMA 2VEKA 4N6EA 1TRIA 4JIQA 1TCDA 2Y89A 4N9DA 3SECA 3OHIA 3UZ5A 1I2RA 4NU7A 3TJXA 4HHPA 1L6SA 5FEWA 4M6VA 4TIMA 3NQAA 1P0NA 4JYDA 2Y7DA 2E6FA 4YWIA 1RVGA 3LERA 3MUXA 4ML9A 2A4AA 3N34A 4JN6A 3PG8A 1ZJIA 3FEMA 5H2ZA 3DHFA 2HSAA 4UTLA 3GXNA 5EBUA 3NPXA 3B8DA 4L4LA 3HOJA 1G67A 1N8FA 4H6KA 3HPSA 1XUUA 1UASA 5DCDA 1OFOA 1J5TA 2QJGA 1ICQA 2C19A 3IGUA 1LRNA 3VKJA 1NSJA 3P80A 5AN7A 3IVUA 3O6CA 3C2RA 1IIHA 4JEQA 1SSGA 1SFLA 4U28A 3NQ6A 4GNJA 4DO6A 1HO1A 1F6PA 3VNDA 1A5AA 4ZVJA 4K8HA 3RMJA 1DV7A 1G4EA 3V75A 5AYYA 2E5BA 5TBOA 1TV7A 2JBMA 3W2MA 1YXDA 3A5VA 3N2MA 3F1QA 2XN0A 2A7NA 3TMLA 2VFFA 1TO3A 3CU2A 3WJXA 1F2JA 3W7EA 4DQWA 3GR8A 2P10A 4EIVA 5HJLA 2V0TA 5HWMA 1GVOA 5E0KA 4I9AA 3JS3A 2BTMA 3DBPA 1W5MA 4O15A 1FXPA 3E12A 4NZFA 2J88A 3RNDA 4GXMA 2ZZ6A 2A85A 3C2VA 3LTYA 3TNOA 1ICPA 5FF7A 5CZTA 2R94A 4IMEA 3T7VA 3HPZA 4JYFA 1GVFA 2HMCA 1O94A 3KOFA 4FNRA 3L68A 5K9CA 2OCZA 5AHEA 4E2DA 1J4EA 3FIGA 4K38A 3FJ6A 1NEYA 3W83A 4AVFA 5BRBA 5HR6A 2Q3OA 5LHFA 1XC4A 2WQPA 3BLEA 4JD4A 6ALDA 2WJZA 5CSRA 3KX6A 1YTDA 3W72A 4DBEA 3A5FA 1IXQA 1Z42A 3TR2A 1VLIA 3LB0A 2B7QA 4MJMA 3GZ3A 3R13A 5F4SA 3S5ZA 3LCFA 4UTUA 4FIQA 1T96A 4RJEA 3JR2A 2YZRA 2VOMA 1W1ZA 5LKYA 4PL1A 2V2DA 1VC4A 3NOEA 3QSRA 5EL1A 4UTIA 5I3IA 1K7FA 3T44A 2A0NA 3LBCA 4UNKA 2TSYA 1AW1A 1H1YA 5D37A 3O8AA 3TH6A 2Y61A 4AAJA 1FCBA 4S2CA 1QWGA 2B7PA 2ISSA 5D05A 4CCCA 4LT9A 2FTPA 4GJ1A 2NX1A 4BI6A 4NNBA 3W23A 1Z44A 3IIXA 3MYOA 4CLMA 4O18A 3M1ZA 2QF7A 1VS1A 1QOQA 3NQDA 5EYWA 3M47A 1S5TA 2OMAA 4AF0B 1DQXA 2E5CA 1SZGA 2A6NA 3W7JA 1MO0A 2GOUA 4DO5A 3STCA 3O06A 3VI2A 3N9RA 5DCBA 2V2HA 4Y90A 3LRLA 3QZEA 3NGJA 1K7EA 4A3UA 2I14A 3I7SA 1AW5A 1OX4A 5DXYA 4LS2A 1PE1A 4YCOA 4LVGA 4AMAA 3UWUA 2X30A 4RZ6A 1C8VA 3B03A 1KFJA 1EEPA 3DFNA 1DORA 4MYAA 3G1YA 5MHBA 4JTUA 4UMAA 3UWQA 1FWSA 4NJGA 1O5KA 3NVTA 4MKNA 4JX6A 1WQ5A 2ZZ7A 4UFJA 3NDOA 1H60A 1OX4B 1O4UA 2EHHA 2FLIA 4X22A 1YPFA 5E1QA 3BG3A 2ZTKA 5HULA 3TSBA 4JX5A 1H63A 1B57A 4MY9A 1RQBA 3R8RA 3SW6A 4OV9A 2EPHA 3N73A 3EWXA 4IGHA 3S5OA 3Q94A 1R30A 2QCMA 1WDWA 5F1VA 3GVGA 3QRHA 4IJBA 4R53A 4FEZA 1AG1O 1JVNA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ARY A;  5CJ5 A;  4I7W A;  3SY5 A;  2EPL X;  5C54 A;  3ARV A;  5J5R A;  4UBP C;  3POH A;  3CQ0 A;  1KM2 A;  1VPQ A;  2NLI A;  1DE5 A;  3WBX A;  4PCT A;  2XIO A;  3AYR A;  4OOU A;  4B15 A;  3LGD A;  2WHK A;  1E6P A;  1VFL A;  3W81 A;  1N82 A;  1NF0 A;  1ZCO A;  2P3E A;  1A5U A;  1H41 A;  1ICS A;  3GNX A;  2V5L A;  3EX1 A;  3VAB A;  2YYU A;  4IIB A;  3LHZ A;  2C79 A;  2FZ9 A;  4ICC X;  3W4R A;  1ADD A;  4HZ7 A;  3ZFH A;  4K7V A;  1R0M A;  1WZL A;  1J9Y A;  2WWD A;  2ZC8 A;  2XIS A;  2Z1K A;  1K6W A;  4UR8 A;  5E0C A;  2RH9 A;  2Q8L A;  1W5P A;  1R46 A;  1BF2 A;  3S0C A;  3NL3 A;  1TTI A;  2GVG A;  3Q45 A;  3WDR A;  2GSH A;  4V27 A;  1TJ2 A;  2VFD A;  4KEZ A;  4P8W A;  2GGI A;  3EEZ A;  2OEK A;  4BS0 A;  1QAT A;  2WC3 A;  3QHM A;  5LIU X;  3W76 A;  1S5V A;  3DN5 A;  3C2F A;  1CEO A;  2IPW A;  3L4W A;  4O10 A;  2XSX A;  4MKS A;  3DG6 A;  1EJT C;  3DEN A;  5JH1 A;  3IVS A;  4PMV A;  4ORI A;  5HPC A;  1NTH A;  2I1O A;  4MLJ A;  3NQE A;  1J0I A;  3MMU A;  3O2L A;  3G0U A;  3GRI A;  1XBV A;  5D9M A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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