4J9JA

Structure of designed hisf
Total Genus 76

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
240
structure length
227
Chain Sequence
LADKVIINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVAIDAKRVDGEFMAFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLASGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAFLAGADKVSINTAAVENPSLITQIAQTFGSQAVVVAIVAKRVDGEFMVFTYSGKKNTGILLRDWVVEVEKRGAGEILLTSIDRGYDTEMIRFVRPLTTLPIIASGGAGKMEHFLEAF

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYS1 (3-6)S5 (71-75)AH8 (178-188)AH1 (8-12)3H2 (47-49)AH2 (14-22)3H1 (26-28)S3 (41-46)TIV2 (37-40)AH3 (57-67)AH5 (111-120)AH4 (88-95)TIV4 (158-161)S7 (124-127)AH6 (129-133)3H3 (147-149)S8 (150-159)S9 (162-167)3H4 (168-170)S10 (172-177)O1 (207-209)AH9 (209-215)S2 (29-38)S4 (51-56)TIV3 (76-87)TI1 (95-98)AH7 (135-145)S11 (192-197)S12 (223-225)S6 (102-105)TIV1 (22-25)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase
source organism Thermotoga maritima
publication title Establishing catalytic activity on an artificial ( beta alpha )8-barrel protein designed from identical half-barrels.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF
total genus 76
structure length 227
sequence length 240
ec nomenclature ec 4.3.2.10: Imidazole glycerol-phosphate synthase.
pdb deposition date 2013-02-16
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4j9jA00
2G5WA 1TSIA 5LNUA 4GC4A 2J9YA 2NXGA 3G8RA 1SZFA 3MI2A 4MZ1A 3DI1A 4JYEA 1RPXA 1YLVA 3WJWA 3W88A 4IMDA 1N8FA 4JTLA 3MUXA 2V30A 1OVDA 3S5ZA 1MXSA 4HKPA 3YPIA 3RU6A 4MLJA 4XKYA 3VI2A 3LHTA 1FCVA 3HB9A 5HWMA 3LCLA 3M6YA 2GQ8A 1SZNA 1OYCA 4O17A 2CZEA 4P2VA 3EWXA 1ZY9A 4IOTA 3UXAA 2WNQA 4R34A 1W37A 1TPDA 4OHQA 1ZNNA 1LRQA 4LVAA 4OBTA 2E6AA 3E12A 1I4NA 3C8FA 4UTJA 1FXQA 1HO1A 3O16A 3CEPA 5HUOA 3B04A 4H3DA 1H7PA 4WY0B 2Y7FA 3IIZA 2B0MA 1KA9F 4LW7A 3W7RA 4K38A 3TIMA 3KRSA 3C52A 1OX4B 2E5BA 3E02A 3QW4B 1KTCA 4XTIA 5DCEA 4WJEA 4GJ1A 3A5VA 4NNCA 1XI3A 5EPDA 2OT0A 1OFPA 4YWIA 2QCNA 4O57A 1VLIA 5I3GA 3P67A 3STGA 1TPH1 4MPQA 5LNVA 3MWAA 1R30A 3W7CA 3P62A 1O60A 2FB2A 2X1TA 4O1BA 4GUHA 1ICSA 1SW0A 4NJHA 4NNBA 4EOUA 1J4EA 2QCCA 2AGKA 3IIVA 1CI1A 1ALDA 2E5DA 3UY7A 5D33A 3W74A 2A21A 3TSBA 1K8XA 2VXNA 3TKFA 4IUOA 2J9ZA 2OJPA 2Y63A 3W7OA 1P0NA 4UFLA 1SZEA 1A5SA 4K6AA 1IXNA 3U6WA 1I2RA 4QM1A 2YCEA 2Y7EA 4RX0A 3UPBA 3EB2A 3GNDA 4YCPA 3FKKA 1QOQA 4OU1A 4UFIA 4M6PA 2ZZ1A 3R89A 1SPQA 4O15A 1L6WA 3M47A 4K7VA 4AWTA 1H7NA 1DKWA 1KFBA 1O94A 5E0KA 1LOLA 1W3IA 4UTLA 1YPFA 1M5WA 3CB8A 1MSSA 2ZTJA 3B4UA 1FDJA 4JTHA 4DPQA 1MEIA 3KVKA 1JUEA 5LNSA 2CZ5A 4FF7A 4GRSA 3BPWA 3R12A 1M7OA 1DJNA 1SFLA 3ZWTA 4N9EA 4LS1A 4GFSA 2W6RA 4N4QA 5F4WA 3N3MA 4UFHA 3PS7A 2A7NA 3Q94A 4Z1AA 1TTQA 4PA8A 3F1QA 1TV7A 3OG3A 7TIMA 2WJZA 3B06A 4JY8A 4OV4A 4I9AA 1JCYA 2B7PA 4AVFA 1EA0A 2H90A 3DFOA 3S8HA 3LBMA 3LTSA 4ZQRA 3GXTA 4RXFA 1ML1A 4JTGA 5DY3A 3LXCA 4UC5A 1VR6A 4LU0A 5DLCA 4JR5A 2VENA 3RMJA 2BZNA 4RKAA 4ZVJA 4LUIA 2ZQ0A 3LI1A 4PFMA 2VELA 4EVZA 4Y96A 1OJXA 3NOEA 1Q6RA 4XKYB 4CCCA 3F03K 4E0CA 1YXCA 4TIMA 4LVBA 4YLWA 3UWWA 1F76A 3AO0A 1HG3A 5J5DA 3TMLA 4UNLA 3R5EA 3TMQA 1B4KA 2ZRWA 4E2BA 4WQ6A 4QAIA 4DXVA 1M6JA 5MHBA 1O5XA 3S9YA 1JUBA 4LV9A 1LM1A 1D3HA 2A6LA 3CHVA 3LHVA 3NL6A 3FLUA 1IIGA 3LTYA 3UNDA 1ZCOA 2CLIA 1PCWA 3O6DA 1EB3A 4QJ1A 4EWND 1MO0A 4FXRA 1O5KA 5F2LA 2HS6A 5AHNA 3W7LA 2ZZ4A 1JRBA 1N55A 3D0CA 5FF2A 3PUEA 1B9BA 2DZTA 1VGAA 4ZQCA 5AYZA 5F4SA 1FDZA 1K8YA 3BW4A 1YTKA 1YDVA 4MYAA 3HGJA 1KM6A 3FA5A 3Q2DA 2CLOA 4H4IA 3EX2A 4ADSA 2Y7DA 5HNRA 1L9WA 4BWLC 2E6FA 1PVNA 1VCGA 3KXQA 2H3DA 1C9DA 1KM5A 2Z6IA 3WK0A 1ZAHA 3SFKA 3W2LA 5KINA 3NQVA 3W7MA 1TYGA 2FDSA 1OABA 4MIMA 1VHNA 4FX6M 3ABSA 4LTSA 3EWWA 1JR1A 2XFWA 1DQWA 3EXTA 2JGYA 1TPWA 4HNVA 1TQXA 3C4UA 4HIBA 1TREA 4AF0A 3LCGA 5K9XA 4K39A 1TTPA 4OWGA 3P61A 5AHEA 1T96A 3TXVA 4BI6A 3G3DA 3W7PA 2Y88A 1YTEA 1WBHA 4NVTA 3NL5A 4X3ZA 1GTHA 4AXKA 5AC8A 4O0KA 3B03A 4BI7A 2A4AA 1WOAA 3C3NA 2Y70A 3T55A 3W84A 1H1ZA 4GUJA 1KLYA 4UTUA 5FF3A 1T0OA 1ZENA 2H8ZA 3NM1A 1TV5A 1R2SA 2A7PA 1RQBA 4MY9A 1I2QA 5KITA 3N9SA 2C6QA 4JTTA 3QSRA 3RK8A 3BG9A 4JN6A 2EF9A 2DZPA 4BI5A 1TTJA 3GZ3A 3M9YA 3DFNA 1KFJA 4G1KA 5CPLA 4A29A 2QR6A 1Z44A 4A2RA 3G3MA 3QEZA 1S5TA 1FCUA 3HJZA 3G18A 4MFEA 5ABTA 2C3ZA 2AAMA 3HIJA 3P7YA 3TSDA 2ZZ5A 5FI8A 4U4MA 2DP3A 1KFKA 4JIQA 3I7SA 2QCDA 1DHPA 3RF9A 4RZ6A 4O18A 5LHFA 2B7QA 3PBYA 5K9CA 5C5YA 1Z41A 3TK7A 1NVMA 1TPFA 4FXSA 4WXYA 2GOUA 3NGJA 2KZHA 3THQA 1GG1A 3GDTA 3T40A 3S42A 1OHLA 3E49A 2NV2A 1JUKA 3EX3A 1YDOA 2E68A 2TRSA 3OVRA 1X7FA 1WA3A 3LCIA 2FTPA 5D03A 4R7JA 2ZBTA 3NQCA 2JBMA 3TE9A 2H3BA 2QKFA 1GVRA 1LLWA 3R2GA 1OG0A 5LKYA 1F7BA 2CLKA 1P1XA 3BW3A 4ONVA 1XBZA 2Z6JA 4UTIA 1NFBA 1PV8A 3L0GA 3O07A 2C16A 3IGUA 1V5XA 5DXXA 3TQVA 2WNZA 3NQGA 1GEQA 3MMTA 2PURA 4IPIA 4K8EA 1F6PA 3W1PA 4YXGA 3PG8A 3PSWA 1A5AA 4TMCA 3FEMA 2FIQA 2BTMA 1UBSA 5EYWA 3LGEA 4I7VA 3DAQA 3W2NA 4IX2A 3UWQA 4UTMA 3QSTA 4M6QA 2YXGA 3M0ZA 5CSSA 2C0AA 2QJGA 2ALDA 5G2HA 1RD5A 4D2JA 2ZRXA 3GDMA 3NZ1A 1BEUA 1KLZA 4DF0A 3OVPA 3GYEA 4AF0B 3DGRA 4LRTA 4O16A 4DEFA 1FWWA 4JYDA 2NXIA 4NJJA 4O10A 4HNUA 2OX1A 1W5OA 1RZMA 1GG0A 4XZ9A 3W75A 1OFDA 4DF1A 2Z2UA 4MOZA 4I7UA 1QR7A 2A2IA 2DZWA 5HWJA 3CWOX 3M41A 3EXSA 1TRDA 1OFBA 3LERA 5K2ZA 1QPNA 3A9IA 4M19A 5U7SA 3A22A 4DELA 2GJLA 2PE4A 3LX9A 1W31A 1VYSX 3STFA 3I65A 3MI6A 4RZ4A 2YW4A 3I68A 5DBUA 1OX5A 4O13A 4N6FA 3LOTA 3LRKA 3W1TA 3O1NA 2ZRYA 2ZRZA 3M16A 3QZEA 3IVSA 4OE7A 2WSYA 1XDMA 3W1QA 1KM4A 1VH7A 4ZQMA 1HTIA 3FJ6A 1TPB1 3G1XA 1ADOA 1FCQA 4Q32A 2RHGA 5H2ZA 1RQHA 4ZZ9A 1P0KA 5D09A 5D30A 2W79A 3I6RA 4QNWA 3W76A 3P8IA 3GX9A 4UUIA 5HINA 3SECA 1B4EA 4QNEA 3EWBX 1JCXA 3W7IA 3G1AA 1UUOA 3L66A 2GVGA 3CM4A 1G4PA 2QCDB 2NXHA 3SI9A 3PAJA 3W7QA 5C54A 3DBPA 2ZCGA 1G6CA 2PRHA 4M7TA 4UTHA 1FUYA 3TR2A 1K7XA 1H61A 3G0SA 2DZVA 3B8DA 5U4NA 2EPHA 2DJXA 1FWRA 3GXPA 5D2YA 2ZZ3A 3MHFA 1WBJA 4UMCA 5EL1A 4NUWA 5G1YA 3BG3A 5HMSA 1N7KA 4Z0SA 3C2EA 3NR0A 3C2FA 3BARA 4GWEA 1M7PA 1WOBA 1LDCA 1R2TA 1LRNA 3F4NA 4O4VA 3DH7A 1O4UA 3GB6A 2VFIA 3QF0A 3LHZA 1OF6A 1VJIA 3NQ2A 3ZWSA 4LNYA 3B05A 1GZGA 1LORA 1PCKA 4H6KA 1THFD 3P8JA 2X1SA 1KFEA 4ZQNA 4AEOA 2BX7A 3SW6A 1OFOA 3CPRA 1GWJA 3OIXA 3O6CA 4JTIA 5C2XA 3BW2A 3EKLA 2C13A 4WY0F 1SR9A 3DZ1A 4GXMA 4K36A 5CGQA 2P10A 3O63A 3CTLA 2PC4A 4UTTC 1Z48A 4O11A 5D37A 3KHJA 1RV8A 2PRMA 3LCFA 5LZLA 1VLWA 4UFJA 4CLMA 4A22A 2JKAA 1F73A 4WOZA 5BMXA 2Y62A 4ZQOA 1HFBA 5CPOA 1IIHA 3NVTA 4HNNA 4KKXA 1TCDA 4IMFA 2VFGA 1XUZA 3DHFA 3U8GA 4LOCA 1WAUA 4GUGA 1SO6A 3QYQA 5FESA 3L5MA 4JTKA 3G24A 4JS3A 1QMLA 4MY1A 3PY2A 1FDYA 1JCMP 1MEWA 3OVQA 2CFFA 3C61A 3L0NA 4O53A 3T7VA 1G4SA 2PRLA 5FF4A 1PE1A 1UJPA 2GJNA 1XXXA 3QQ0A 2NX9A 1R2RA 3PUDA 1W5MA 1SW3A 4JTJA 2JKPA 1YTDA 1TPVA 3BGGA 2V2DA 3I7RA 4MZ8A 4MZYA 1YDNA 1KTNA 4GNJA 4LS0A 3QMTA 1W8SA 5TBOA 1W54A 5D32A 3GDKA 1TIMA 1A5BA 1VQTA 3WJSA 2FPYA 2ABAA 2RDUA 5AN7A 5AC7A 2O7QA 1R46A 3QJAA 5K7JA 2YX0A 4IWWA 2CLMA 3WJYA 1A53A 3KVLA 3S6DA 3STEA 1AW1A 4RJEA 3TC6A 5AFDA 4YL2A 5KMYA 2YW3A 3M5ZA 8TIMA 4XBSA 2ZDRA 3W2MA 2F84A 4IX0A 2J88A 3KVJA 5D2VA 3VNDA 3TX9A 1K03A 4B5NA 3KFTA 1PHWA 5D04C 5L9FA 4LVFA 4JNMA 4IXHA 2Q3RA 4BK9A 5LHEA 1I45A 1U83A 4FB7A 3E9AA 5F4XA 3GLCA 4L4LA 2IQTA 1FWNA 4C1KA 1QWGA 1X8FA 4BR1A 4UFKA 1Q3NA 4HSOA 3TDFA 1QAPA 2NLIA 1OFRA 2E1DA 1L6SA 4I7WA 1OF8A 3AJXA 3G0UA 2QJHA 5F2IA 4FNSA 3NQ8A 3Q37A 2Y6ZA 2QCGA 5AHIA 4DPPA 4UXDA 3MBFA 3BV4A 2P1FA 4Z1CA 2DJLA 4PCFA 3CWNA 4MYXA 1ZAJA 3W2KA 4R33A 4WZHA 1KV8A 2HS8A 3NXFA 3IIXA 3N9RA 4JEQA 1BWKA 5DN1A 3ZFHA 3UWUA 5KTLA 5DCDA 3MHGA 5F1UA 2FFCA 3GXNA 3A21A 3RLVA 2DORA 2NZLA 1SQ7A 3LCWA 4N6EA 2DU2A 3PB0A 4NJIA 4FNRA 4FNUA 2V0TA 1Q6QA 1OX6A 4DO4A 3BVJA 1AL8A 2QAPA 3VFLA 1XC4A 4HHPA 1QO5A 1H7OA 1D9EA 4UR7A 2VFFA 3LRMA 2CWNA 3GKAA 2YSWA 2QUUA 4A2SA 1VYRA 2I14A 1F05A 3W70A 4UTWC 4BF9A 1JVNA 2X1UA 4QITA 3MJYA 1G7UA 4IXXA 3M7WA 6ALDA 3IIPA 2RKXA 5CZ0A 3S5YA 2C15A 1LP6A 3TSMA 1D3GA 5D38A 1B57A 5DBTA 4ORIA 2WO5A 4X22A 3W1MA 3G0XA 3DENA 1TV8A 4JGDA 5AHFA 4ORMA 2FB3A 4Z1DA 3UQNA 2ZA3A 4BWLA 3H54A 1GT8A 4AHQA 1LBLA 3K30A 3HGSA 3W1LA 4J9JA 4NJGA 5LNRA 3HF3A 4QIUA 2ATSA 1DOSA 3LM7A 3LRLA 3P80A 3SGUA 4O12A 5TIMA 4Z08A 1A5CA 1OK6A 1GTEA 3S5NA 4Y8FA 4AHPA 2X16A 4RXGA 1J5TA 4FNTA 3O6YX 4O52A 3PBVA 1W5QA 3EWUA 5AYYA 4FNPA 3OBKA 4FEZA 3CU2A 4CNPA 3N34A 3GKFA 2NX1A 3CIXA 3TCEA 1XM3A 3M43A 1LCOA 3SZ8A 5I3FA 4O8RA 3LB0A 3CLMA 3LCXA 3TJLA 1E51A 1F74A 1X1OA 5I3JA 2VEMA 4LV4A 4JICA 1LROA 4JXCA 3L2IA 3W1UA 4S2CA 3QQ1A 3KRZA 3NL2A 1AW2A 3NM3A 1AMKA 5GVJA 3LXBA 3GIYA 2Y89A 1U5JA 2C1HA 4HN4A 1DBTA 4N9CA 5HWNA 3EWZA 4UFMA 2C19A 3R8RA 5SWUA 1NF0A 4NXSA 1RQEA 2QCLA 3NPXA 5KSWA 3G8EA 1MZHA 1VYPX 1G4EA 4EF9A 2J27A 3N2XA 5LNWA 5D2TA 4FO4A 3TROA 4LWWA 3PB2A 3N19B 3IVTA 4PODA 3MI3A 1JRCA 1H60A 3T78A 3W86A 3TFCA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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