4JGDA

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with dh03a016
Total Genus 140
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
140
sequence length
364
structure length
364
Chain Sequence
GDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with DH03A016
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
total genus 140
structure length 364
sequence length 364
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4jgdA00
3LRKA 1X1OA 2XN2A 1VZWA 1NF7A 3NL6A 5HUOA 4IPJA 2DZPA 2QCMA 1K8YA 1OF6A 1Q6LA 1SZNA 4UFHA 1H63A 2OJPA 5MHBA 1HO4A 3BLEA 1G7VA 2QCDB 1LP6A 4ML9A 5TBOA 3Q37A 3QPYA 5EBUA 3QW3A 2A0NA 4JDYA 1OYCA 2DZSA 3HG4A 2H8XA 3CHVA 4FIRA 5BOOA 3SECA 1IXPA 3NYZA 4WY0B 3B4UA 3OIXA 2CLEA 3NQVA 2XN1A 3SR7A 2WSQA 1N55A 4TU1A 4HNNA 5IM51 1G67A 2PURA 3F1QA 3NQCA 4UTTC 4N9CA 5AYZA 3VE9A 4LVAA 3TE9A 2AQWA 1FWNA 1QOPA 1D9EA 3MMTA 3L9CA 3MBDA 1KM4A 4WJEA 4O52A 4XUGA 5D2WA 4RK8A 4WD0A 2ATMA 3E0IA 1QOQA 1I4NA 3UZJA 1XL9A 2VOMA 2ZRUA 4H4IA 1WAUA 2ISVA 1BWLA 2YYTA 1VC4A 3NQ2A 4ADUA 3CB8A 2Y7EA 4RJEA 5BMXA 4UTUA 2HSAA 5AHFA 2V8ZA 1KFLA 3QM3A 4HPJA 1TCDA 4OV4A 2C1HA 3OA3A 3R2GA 4NJKA 3VKJA 1K8XA 3FEMA 3ZFHA 1GTEA 4FHAA 2QJHA 3QMTA 1GG1A 2C0AA 2X30A 1PE1A 3DGRA 1EP3A 1YTEA 1NAL1 4JTJA 3LTPA 4CQ9A 1NFBA 3CIXA 5G1YA 2DJLA 4DPQA 2P1FA 2VFIA 4C1LA 4IXXA 1Z41A 4YXGA 3NR0A 4DQWA 3TMQA 3S1WA 3HPXA 2PE4A 3AO0A 3DFQA 1TPWA 5J5RA 3O05A 2WNNA 1S5WA 3UWWA 1XXXA 3V1PA 3PSWA 1S5TA 3G3DA 3Q2DA 1H7WA 3BGJA 1RV8A 1SO3A 2TSYA 4WY0F 3PULA 3S5OA 3IGSA 4BF9A 4M5PA 2QDHA 4GC4A 3NEVA 4TX9A 2GOUA 4JR5A 3NL3A 4OWGA 4ONVA 4RXGA 3TC7A 3NG3A 3VCRA 2CFFA 3RK8A 1LOSA 1FBAA 5D2XA 5KZEA 1W5MA 5F2IA 1CI1A 3PB0A 3SGUA 1A5CA 1DVJA 2B7OA 3TC6A 5LHFA 4AWSA 1FXPA 1TYGA 2G95A 3INPA 3MP3A 4IUOA 4JY8A 2BXVA 3P8JA 5DLCA 1M7OA 3MYPA 4GUFA 3Q58A 4RCXA 3STGA 5BMWA 5H2ZA 4HIBA 2EF9A 4JYEA 3TX9A 2Y63A 4L4LA 4LC8A 4WUIA 1XDMA 3O06A 3M47A 3HIJA 4GUHA 1V7YA 3F4WA 1LOLA 1ZALA 1VYPX 2BZNA 1M6JA 3EEGA 3M16A 3KRZA 3NPUA 3LCHA 4IQLA 3G0SA 3I7QA 4E2DA 2H3DA 4MY8A 4AHOA 1HUVA 3STEA 3W7NA 4YL2A 1G6CA 4P61A 3IRDA 2V5BA 1QPOA 4MOZA 2PRMA 1GYNA 4NNAA 4XTIA 3QMSA 1EIXA 3UY7A 3EB2A 3EKLA 4NZJA 3WK3A 4O1CA 5G4WA 2QUVA 4NJJA 1KM1A 3W2JA 4RZ6A 3EX3A 4UUIA 1TV5A 4R33A 1I2PA 3SY5A 2ZTKA 1A50A 4YWIA 2NV2A 3ATZA 1WA3A 1P1XA 1Z48A 1SSGA 1W3IA 1LYXA 1GEQA 1FWTA 3P67A 3LXAA 3SFKA 2Q8ZA 3F4NA 2EPHA 5I3HA 3FJ6A 2H90A 4A2RA 4JTEA 2YFNA 1TPUA 1KLYA 3B05A 4UNKA 5CPMA 4EF9A 4LUIA 3KVJA 3LB0A 5AHIA 3LCIA 1WDWA 3TXZA 3UPWA 3VE7A 5C5YA 1DQXA 1FX6A 2F84A 2RKXA 4O13A 2OMAA 4N9BA 4HNVA 3W7JA 3OHIA 4IMCA 1WBHA 4XWUA 3UXAA 4UMAA 3NQ8A 2GJNA 4XQ6A 4KKXA 3MI2A 4DBDA 3FKRA 3OBKA 1W1ZA 4PC8A 1KFBA 3CC1A 4K7YA 3W87A 1KM5A 1TREA 1LTDA 4X2RA 1G7UA 1LZOA 3C3NA 4UFLA 3EWWA 1OX4A 2FFCA 4LU0A 1I8JA 2E6DA 2WKJA 3R89A 3GR7A 3H55A 3G1SA 2NXGA 3RFAA 1N8FA 3LM7A 1MXSA 3LCGA 1G4PA 2ZZ1A 5AHMA 3UWQA 3M5VA 3HO8A 5F2LA 4IXHA 3W7QA 3B04A 3M7WA 4UTWC 4JTTA 3NQDA 1FDZA 3O16A 2V2DA 5D09A 3STCA 3S9YA 1VJIA 3C2FA 2VFHA 1TPH1 4FNSA 2CLFA 3GK0A 3PBYA 2UV8G 4M7SA 2TYSA 2Z6JA 3S0CA 3TIMA 4MY1A 3KXQA 3C8FA 4WQ6A 3N9SA 1JCNA 5U7SA 4ORIA 5KZMA 3L67A 2QUTA 4JIPA 3W7DA 1H7XA 1FWSA 2B7PA 1RPXA 2CLKA 3EXSA 3NQAA 4JGDA 1VYRA 4ZQCA 5AYXA 1LRTA 2QKFA 4ADSA 4IMDA 1XC4A 3P5ZA 5LNWA 2CLHA 5TIMA 3AJXA 5HQEA 2F7FA 3FIGA 3QFEA 1W3NA 3W7OA 4TO8A 3WJYA 2ZRXA 2OT0A 3DU0A 3CT7A 2QJIA 1DQWA 1X8FA 3KFTA 3NOEA 1SFLA 4NJIA 5AYYA 3C2RA 5AC7A 4Y8FA 3ABQA 3TFXA 1KFJA 4WZHA 3RF9A 1FCVA 2BLEA 3W7GA 1ZAHA 2QCDA 1GTHA 3N2MA 3P82A 2NX9A 1FCQA 1UASA 1QR7A 2C15A 3DFSA 1Z44A 5F2GA 1EUAA 3O07A 5DXXA 1VGAA 4WY0A 4RZ4A 3W7EA 1F76A 5K7JA 3S5ZA 1FCUA 2PC4A 1TIMA 3O6YX 3LTSA 3U8GA 1J4EA 3EX1A 3IIXA 4QNWA 4EVZA 1NF0A 1JCLA 4MVAA 4RLIA 1TRDA 2CZFA 4K38A 5HWMA 1PIIA 5AN7A 4O0KA 3ZS4A 3L0NA 4WXZA 3SIZA 3B8DA 1P5BA 3RLVA 3GDTA 3DI1A 3NGJA 2X1TA 4PFMA 3W2UA 2CW6A 1DV7A 3NPVA 1LBFA 1H51A 4LRTA 4LTSA 3S1UA 4AWUA 1TTQA 2HMCA 2Y61A 2A4AA 2XFWA 1KM6A 1THFD 5KMYA 5K9XA 3I7SA 4BWLC 2FTPA 3FFSA 1KTBA 1UJPA 1EB3A 3KHJA 2E5DA 4IPIA 2LLEA 2C18A 4LV9A 2NX1A 4Z0SA 1NSJA 2NZLA 1ZY9A 3BARA 1TO3A 3M1ZA 5DY2A 4QIUA 1TB3A 2Q3OA 2ZZ2A 3DI0A 3C4UA 2NUYA 3N34A 4EOUA 3HG3A 1NEYA 1L9WA 2H8ZA 1J2WA 4NJGA 2FPTA 3JS3A 3UXDA 4N9DA 1MO0A 1ZFJA 2JGYA 2YXGA 3TXVA 3G1VA 1UB3A 4GUIA 4X9SA 4Q33A 3LBMA 1VCGA 5DCEA 4DF1A 4GFSA 3HGJA 1GQNA 3LHWA 4LS2A 1FCBA 4OBTA 3NM3A 2V2CA 3CM4A 5FEWA 1XUZA 3WK0A 5HWJA 1VRDA 3THQA 4HN4A 3THAA 3BG3A 4M6PA 3TSBA 2ZRZA 1DKWA 1SW3A 1X7FA 1K7XA 1IIGA 1FUYA 1U5JA 4XTDA 1J5TA 2PCQA 1K02A 1ZJIA 4O50A 5FF7A 1QFEA 4OQVA 4TIMA 5KITA 3SSJA 2CWNA 3LXCA 3QEZA 3W72A 3VI2A 5AC6A 1KA9F 1IXQA 2IQTA 3W1AA 5DELA 1S5VA 2JK2A 3NQFA 3NO5A 2CLIA 3FKKA 1VCVA 3W1LA 3I65A 5FEPA 1K7EA 1RR2A 1GVQA 2ZCGA 2G97A 3N73A 3NPXA 3BVJA 4WOQA 1F6PA 3T7VA 4DEFA 4O19A 2ZZ7A 1O5XA 2A2IA 2A7NA 1SUXA 2TMDA 2QCEA 4B5NA 4FNTA 1TPB1 1HL2A 3NQEA 5AHEA 2RH9A 1GG0A 2Y70A 1MEIA 3UWVA 3C2OA 2NUXA 3VFLA 2J6XA 2C16A 3IIPA 1RD5A 4EF8A 2GQ9A 2YCEA 3BK0A 4K39A 5CG7A 2CZEA 5EKYA 2Q3RA 3CWOX 1VR6A 3IV3A 4IWWA 1XKYA 1WQ5A 4HHPA 3UQNA 2Y6ZA 2PRLA 4IJBA 2E77A 3KX6A 2XN0A 3NXFA 4FX7A 1VHCA 1KM2A 5C2XA 1Q6OA 1FY6A 3G1AA 3G8RA 4DBEA 5AB3A 5HJLA 2H3BA 1QMLA 1W5QA 1WXJA 3QZEA 5E1QA 3QRHA 1AW1A 3TROA 4LS1A 3LV6A 3G3MA 1EWEA 3CWNA 3L0KA 2I14A 1V5XA 2Y89A 1RQEA 1TTJA 2X16A 2E6FA 3MUXA 4UTIA 4E2BA 4LOCA 3WK2A 4A2SA 1DORA 1W37A 4K8HA 1YTDA 4O15A 1K3UA 3QC3A 4OHQA 2P0OA 2RDTA 7TIMA 1BWKA 1ML1A 3QSTA 1IXOA 3W9ZA 1H60A 1MZHA 3GXTA 3A24A 3EXRA 4WX2A 2C13A 1PV8A 3SGZA 3NDOA 3MI3A 3NQMA 4NXSA 2X1SA 3M43A 1LOQA 1B4EA 1XCFA 3TK7A 3W7CA 3GB6A 1R47A 4JEQA 4WOZA 4AMAA 3U6WA 2Z0IA 4BR1A 3MWAA 5D32A 5F1VA 1PHWA 1GYLA 2DP3A 1JCYA 5D05A 5K2ZA 2RDUA 1H50A 1OX6A 5HUPA 2QJGA 1TPVA 4UNLA 4H3DA 5D37A 3TFCA 3LBCA 3W1NA 5DN1A 1H62A 5H91A 2VFGA 2ZYFA 1ADOA 2GJLA 5EYWA 4JTFA 3KVMA 3EXTA 1EP2A 3O6CA 3LCLA 4NZFA 5EL1A 1H5YA 3FYOA 1LRQA 2E6YA 5C6MA 1L2UA 4E0CA 4DELA 4Z1DA 4PL2A 1XUUA 3QQ1A 4QSHA 3N14A 1D3HA 5F4XA 3FS2A 4CQAA 4NQ1A 2A6LA 2QF7A 2W79A 4Z0JA 2BTMA 1VYSX 3ABRA 3KVKA 2C6QA 3NQ6A 1D3GA 4OE7A 1ZAIA 3MI6A 1H7OA 3IIZA 3Q94A 3P62A 3G1YA 4DXVA 6TIMA 1F6KA 4AF0B 4ZQPA 5EMUA 1C29A 4I7WA 3ZWTA 3O6DA 1SZGA 2CLMA 3JRKA 3P5YA 1SO4A 2QR6A 5IBXA 3G1DA 2WPBA 4HT3A 2E09A 1YDVA 3P61A 2FB2A 3EKZA 2A85A 4O28A 4NNBA 5KSWA 3QF0A 3RLUA 3MW7A 3CLMA 3L5LA 1OF8A 4JN6A 1I45A 3W1UA 3HGOA 4X3ZA 2ALDA 2GUUA 3A21A 4FNUA 4BK9A 1O95A 3L2IA 3LOTA 3LTYA 4LNYA 3W1MA 3A5VA 4MZ1A 1JVNA 3OG3A 5I3GA 3CU2A 3OVPA 1VCFA 5DBUA 5CZJA 2YW4A 1IGSA 1QPRA 1JCXA 2QCCA 1A5SA 3ELFA 2DZWA 4GUGA 3GLCA 4BI5A 3GKAA 3DXIA 5KTLA 1YYAA 1PHQA 3CIWA 3QSRA 2VEIA 4NJHA 1EWDA 4AHPA 3L21A 3E12A 1R2RA 1ONRA 5D04C 1Q6RA 3WJWA 2X1UA 1T8XA 5LNRA 4MYXA 3L0GA 5E0KA 3P60A 4HSOA 2VENA 4S1FA 2Q8LA 1KM3A 3NQGA 1JRCA 5SWUA 1VQTA 3BPWA 4JX6A 3N9RA 4UIOA 4O53A 1HG3A 2VKZG 3SI9A 4UFIA 4JTUA 3W2LA 2E68A 1ICQA 4HSNA 3W88A 3BG9A 5FEZA 2B7NA 4MJMA 2GVJA 3W1PA 1A53A 3HGRA 4JIQA 4LVDA 4RR4A 5FF4A 2E6AA 1KV5A 1A5BA 1JCMP 4D2JA 4O1BA 1OFRA 3G1HA 2NV1A 4Z08A 5CGQA 4MZYA 4O0ZA 3N19B 1A5AA 3FOKA 4O18A 3CQ0A 1JUKA 2Z1BA 2VELA 3A5FA 4CCDA 1KFKA 2O7QA 3P7YA 1JUBA 4S2BA 1S3HA 1TJPA 4FXRA 4DO5A 4PEKA 3DZ1A 2YW3A 5D30A 4JS3A 1ALDA 5D2TA 5G4EA 2A21A 3W7HA 3LX9A 2C19A 4Y96A 1P0KA 4K7VA 1TPC1 2V5LA 5LKYA 3TJXA 5DCDA 3WJSA 3QYQA 2E1DA 1QWGA 2R14A 3K30A 5K4ZA 2O7SA 1GJPA 4OV9A 4JTHA 4Y9AA 1RVGA 2NXHA 4RXFA 1QO5A 3GAKA 4DF2A 3H53A 3T40A 2ZDRA 2VFFA 2J9XA 3PBWA 4R53A 4GXMA 3PUEA 1YLVA 1AL8A 3IEBA 2VC6A 3C0JA 4DPPA 3T4CA 4MIMA 4K36A 1SR9A 2ZTJA 4GBUA 3M44A 3PF3A 2WJZA 4LS0A 5K3VA 1H7PA 1JCJA 1KTCA 1R30A 2WV8A 4JTKA 1K8ZA 3GDKA 1RQHA 1OFBA 4CCCA 2ZZ4A 3BV4A 4QITA 1LRNA 4UTKA 2C14A 3S1XA 1F7BA 2QEZA 3UPBA 2V82A 3UYCA 3CTLA 2QCFA 2GQ8A 1QPQA 5K4XA 1ICSA 3GZ3A 3D0CA 4IMGA 1G4TA 1I2QA 3EX6A 3LRMA 1EP1A 2ZFAA 4BFAA 4CNNA 3EWZA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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