4JR5 | Genus

Total Genus 167

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	167
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
publication title	Structure-based identification of ureas as novel nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt) inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus	167
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-03-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4jr5A02

3W07A 3TKFA 3W1TA 4O1BA 3A23A 4O0KA 3SFKA 1SO6A 1Q6LA 1YXDA 1WBJA 2OZ0A 5IBXA 3S1UA 2QR6A 3DFQA 1G4EA 1GVRA 2CLMA 3RK8A 4UUIA 2ZBTA 3I6RA 3LM7A 2CZ5A 4WY0B 1XDMA 1OHLA 1EPXA 1VHNA 3TAKA 4XZ9A 4UTWA 3P60A 3DHDA 3ZS4A 3L0KA 1OFOA 3C3NA 4O11A 3VE7A 3W85A 2E77A 2CLLA 3G1AA 4NU7A 1L2UA 3W2MA 3B03A 3SR7A 4LUJA 3ATZA 3W1RA 4RJEA 4Z1BA 1L6WA 1FCBA 3RFAA 1FWSA 1XC4A 2H3DA 5L6UA 3NGJA 1EWDA 1U5JA 3S0CA 2ZQ0A 1EP1A 1C29A 3EWYA 2Y6ZA 5DXYA 1JCNA 3CU2A 1ICSA 4KFNA 4UIOA 2Y63A 1I2RA 5AN7A 3M5ZA 3MWAA 3LLFA 2HMCA 1IXQA 2Y62A 3BLEA 3W2UA 3VFLA 5DBUA 4Y6GA 4CNOA 3H53A 4PEKA 1Q6RA 3DKLA 5F2MA 1VYSX 4FX8A 2DJLA 3F03K 1VYPX 3QSTA 3PG9A 1FDYA 2A7PA 2FPTA 5DY3A 3RU6A 3T44A 1OFAA 1OABA 4KFOA 3MP4A 4BK9A 1LZOA 1ZJIA 4N6FA 1KV8A 1VLIA 3TCEA 4WOZA 3O1NA 3ZWSA 3L21A 4UFLA 1EP2A 4K7VA 3P8IA 2DZUA 1Y0EA 1FDZA 4OT7A 3IIPA 2PC4A 1DORA 3QF0A 1TPVA 5D2YA 3C2OA 4JYEA 1W5PA 4ZQPA 4M6QA 2RDWA 1TYGA 2WOQA 1IIHA 5J5DA 1K7EA 5D33A 3EB2A 4IX2A 1S3HA 3FJ6A 4U4MA 3OHIA 3VCRA 3IVSA 3SIZA 4N2YA 3PUDA 2Z6JA 2BLEA 4UTKA 1QPQA 4NZJA 4UTJA 5HQEA 3RLUA 4JDYA 5FF2A 4LRTA 1B4EA 3W1NA 4UTTC 4HPJA 3OIXA 1HTIA 2EPHA 3G3MA 1VGAA 1I4NA 2DJXA 2A6NA 3N2XA 1P0NA 3B8DA 1OFDA 1UUMA 4AHQA 5G2HA 3UXAA 1G69A 3C2EA 3PBYA 2YDAA 2QKFA 3WK0A 4AXKA 1OF8A 3DFNA 4YCOA 1IIGA 4MZ8A 3G1YA 3MUXA 5K9DA 2Y7EA 1IF2A 3BG3A 5LNUA 1T0OA 3UWZA 3BLFA 2A7RA 4LV4A 3A9IA 1YPFA 3QFEA 3GDTA 4WZHA 2ZZ7A 4X9SA 2ATSA 4K8HA 3U8GA 3IGSA 3FIGA 1KFCA 2GQAA 3KOFA 1DQWA 1N7KA 4JN6A 4WUIA 3CM4A 5LSMA 3M16A 4JYFA 3A22A 3NQ8A 4JTGA 3QRHA 1YXCA 5FEZA 4ZL1A 3LX9A 1XUZA 2V82A 2H3BA 2C18A 3MI3A 1C8VA 2QCLA 3N2MA 1RQHA 2H8ZA 3P7YA 1UASA 1K8YA 1KFEA 1NF7A 4K37A 3WJZA 4JTSA 1KV5A 1OFPA 1H62A 4FNQA 3SJ3A 3L66A 1FBAA 4GC4A 3W2KA 1LP6A 1FWWA 4LVDA 4JEQA 2ZRXA 5BMWA 3P5ZA 3NQ7A 1OJXA 2ZZ5A 3FOKA 2FIQA 1KFJA 3LXBA 3LI0A 5D02A 3UY8A 1ONRA 1PCKA 4YWIA 4UFJA 1K03A 1X6UA 2WQPA 4Y96A 3OVRA 3PB2A 1PVNA 3MW7A 2ABBA 3CQ0A 3G24A 3GDRA 4JD4A 4ZQOA 2CU0A 4FXSA 3AJXA 4NXKA 5HULA 3W72A 4A22A 4E38A 4R7JA 5KZDA 3W7NA 1DHPA 3W7HA 1DBTA 4R34A 5BW6A 4Z08A 4Y90A 4FNUA 3WK3A 3W7KA 3TFCA 2VKZG 3GNNA 3PF3A 3HQ1A 3LBCA 4DF1A 3I7SA 3G1SA 2Q8ZA 5KMYA 3N9RA 2C6QA 1JCXA 3LCLA 3IVTA 4NT0A 3UWYA 1SZFA 1YTDA 5G2WA 1S5WA 3ABQA 3WJWA 3EWXA 1GWJA 1QDSA 1W31A 2RFGA 4FB7A 5LKYA 1H7PA 3NPXA 3LHZA 4ALDA 3G1VA 3UWVA 3W6YA 4DBEA 1KA9F 3MBDA 1TPEA 1OG0A 3W1XA 3W7LA 3G0UA 5MHBA 1NVMA 3C52A 7TIMA 1K8XA 2ZRUA 3NQDA 3PBVA 4O10A 1SW7A 5G4WA 1DJNA 4ZQMA 3HPSA 4O16A 2B0MA 1VCVA 3P80A 3HO8A 5EL1A 2FFCA 4IXXA 3IVUA 5I3JA 2YXGA 1GJPA 5FEXA 2C3ZA 4LC8A 1GYNA 3EWWA 3QQ1A 4FNPA 2WO5A 1Z48A 4HKPA 3IV3A 1DL3A 3UNDA 3DU0A 3DBPA 3F4WA 1SW3A 4CCEA 4A3UA 3W2LA 4N9CA 2TPSA 3NQAA 1QPRA 2FJKA 2CZEA 1P0KA 2BTMA 5CPOA 2Z1BA 3L5LA 5F1VA 5I3HA 2BWGA 4MY1A 3FKRA 3G1XA 5T26A 1P5BA 4MYXA 1GVQA 4EVZA 1S5VA 3KHJA 4E2BA 3QW3A 2GPTA 5F4WA 3B05A 5CSSA 3S42A 1FY6A 2NWRA 3M5YA 3VKJA 4AEOA 4O50A 1PE1A 5U4NA 4AWSA 3C4UA 3NO5A 4NNBA 3MO7A 1F73A 4MY8A 2TYSA 4QNWA 4LRSA 4ML9A 1OX6A 4FF7A 3FA5A 3GZ3A 3U2OA 3I68A 5DXXA 3NG3A 1KW1A 1UCWA 1LRNA 5FEPA 1W5QA 4UTLA 4DXVA 5AB3A 4G1KA 1QFEA 3C2FA 1JQVA 2X2GA 4AHOA 4GUJA 2VEPA 3N9SA 3NL6A 5KZEA 2VEMA 1GG1A 3W7EA 4IXHA 3ZWTA 1OFBA 3HB9A 2YW4A 4RK8A 1TMHA 3W1UA 2RKXA 3GB6A 1QOPA 4O1CA 4OE7A 5FI8A 2O7QA 5D2WA 4CNPA 4LS0A 1PHWA 2QJHA 2RH9A 3LRMA 2NX9A 3LV6A 1H63A 3PUOA 4Z0SA 4N4QA 5C5YA 3BG5A 4UTTA 3P62A 1ZCOA 2DU2A 4M7SA 4KWVA 3LBMA 3LHTA 3R5EA 3KVLA 1H51A 2J9YA 3B0VC 3TX9A 4TMCA 4I9AA 3INPA 3E9AA 5BMXA 1FQ0A 2FPYA 1P1XA 3CC1A 4WD0A 2AQWA 4ADSA 4RZ5A 2QCNA 3W1PA 2V9DA 5DCEA 1LROA 2R8WA 4UMAA 2DP3A 1KM0A 4QIUA 4IPIA 1O60A 3L2IA 3W7PA 3TC6A 3W88A 3C6CA 4MFEA 2NUYA 1TO3A 2J6XA 2WSQA 1Q45A 3BG9A 1TPH1 1TJPA 4K7YA 3GAYA 3STFA 4O19A 1H1ZA 4AB4A 2PRHA 1DQXA 1W8SA 1SZNA 2NUXA 2QDGA 3LCHA 2GJNA 2ZYFA 3LGEA 3BK0A 1ZALA 3CWOX 4U28A 4XWUA 5D2TA 2B4GA 4PCFA 2A21A 1YDVA 2NZLA 4MJZA 5DCDA 3E49A 2H90A 3E96A 1K8ZA 3DFOA 4TO8A 2W79A 4DO6A 2AAMA 1N55A 4MLJA 5D32A 2FDSA 2WNZA 4B5NA 3TQ0A 3W22A 1NEYA 4BR1A 5F4XA 4L4MA 2EKCA 3T55A 5BNKA 1WOAA 5I3GA 1F6KA 3LCGA 1OK4A 1DJQA 2Y7DA 4UMBA 1Z44A 4O4WA 1LORA 1OYAA 1XUUA 3M43A 1G7UA 3N19B 4S1FA 1KFLA 3S9YA 3V75A 5AC6A 1SFJA 3I7RA 4ONVA 1ICPA 3FLUA 1PHQA 3W87A 3HG5A 3O63A 1PS9A 3LRLA 1KFKA 2G5WA 3LCXA 4HHPA 1XBVA 4TX9A 3TSBA 4ADUA 4CQAA 5LHEA 2NLIA 5AHLA 3E0IA 4QITA 1MXSA 1I2NA 1LBFA 3MHFA 3TUUA 3PAJA 3CEUA 1KLZA 1AMKA 2V30A 3QMSA 2F7FA 3PY2A 1RR2A 1W5NA 3LXCA 3M47A 4Z1DA 1W0MA 2J27A 2HS6A 2JGYA 5DELA 4A21A 1ZFJA 1OX5A 2WSRA 3KX6A 3T7VA 1IXPA 1GEQA 1SO5A 3NM1A 4MJMA 4O52A 2Q3RA 5I3KA 3CIWA 3TMLA 3G22A 5AFDA 1W56A 4LUIA 1ME8A 2H8XA 3EX1A 2QCCA 2QCHA 4A2RA 3SECA 2GJLA 6TIMA 3JR2A 5F2IA 2ZDRA 2FB3A 2X1TA 3SGUA 4ZQRA 3QYQA 5CPLA 2KZHA 1PV8A 3P5YA 1XM3A 5G1TA 3W1LA 3KXQA 8TIMA 1BWKA 4I7VA 4N9DA 1FDJA 3NYZA 3TH6A 5LNSA 3STCA 5E1QA 1E51A 2QAFA 5EYWA 2A6LA 4N9EA 3RLVA 1VQTA 3P84A 5EBUA 1QPNA 2OT1A 3NNTA 3GNDA 4LNYA 1ZAJA 4NUWA 2YYTA 5DN1A 4Z0JA 1KBIA 1B57A 2VFGA 1I45A 4Q33A 5HUPA 1IXOA 1VCGA 2X1RA 1VRDA 1OVDA 4BWLC 5K4XA 2A0NA 3OG3A 3DFPA 3O8AA 1RZMA 1TRDA 4JTFA 5HR7A 3QMTA 2A1YA 3TSMA 1J2WA 2C19A 4GXMA 2CLHA 3TFXA 3KRSA 1JUEA 5TIMA 3DGRA 4P2VA 3L68A 4UTHA 1ZHAA 3HJZA 4JX6A 4JX4A 4UFHA 1TIMA 1TPB1 3O05A 4LT9A 2I9EA 4RZ4A 3ABRA 4EIVA 1IXNA 2ZZ1A 5GVJA 3HG4A 2QCGA 3W71A 1TTIA 2WSYA 4GRSA 2YFNA 3NQFA 1H7WA 1ADOA 2QCEA 3MP3A 1VCFA 3EX6A 1G67A 2OT0A 5AHIA 1KM3A 1LOQA 5G1YA 2E68A 3FEMA 5K9XA 4UTUA 1ZENA 4DPQA 5FF0A 2G95A 1TV5A 1YYAA 3OA3A 3QPZA 4RKAA 2VEIA 3ATYA 1OX4A 4O13A 3L5MA 5CPMA 1WAUA 2VFDA 1I2QA 1YTKA 2I1OA 3BPWA 5LZLA 1XDLA 4AWTA 2ZRVA 1ALDA 3W70A 1PCWA 5LNVA 5BRBA 1JR1A 3S8HA 5HINA 4XKYA 2HS8A 1D9EA 4UFKA 2XN1A 4MPQA 3TNOA 3BGGA 1RQBA 4FIRA 3JRKA 2B7OA 3NL2A 4XQ6A 2VOMA 3QZEA 2W0UA 1F5ZA 1ZNNA 3THQA 4UR7A 4ZMGA 2FQIA 5F4SA 3SW6A 5AYZA 2G96A 1LDCA 4M6VA 1H61A 1Q6OA 4PL2A 5G2IA 3G3DA 1R2RA 4UXDA 4TR9A 4JTJA 3CT7A 4CQ8A 3W84A 3MI2A 2JKPA 3F1QA 1SQ7A 3C61A 2C0AA 2CZDA 4XTDA 2ZZ6A 1O5KA 4JGDA 1Z42A 2OMAA 4W9TA 2E5DA 4MZYA 3EKLA 3MP5A 3G18A 1VYRA 2D73A 4L4LA 2CLEA 3UWQA 2NXHA 1G4SA 3QSRA 1VZWA 2WNNA 4Y9AA 2JKAA 2V2DA 1R2SA 2WNQA 2DZVA 4WX2A 1MO0A 3FFSA 4LVBA 1KLYA 1S5TA 3GIYA 1DVJA 4PC8A 2J88A 3M9YA 3NZ1A 1XBYA 1TPDA 2NV1A 5LGZA 1FUYA 1UJPA 2TSYA 3NR0A 4CNNA 3N73A 1GG0A 2A4AA 4J9JA 5HR6A 3LV5A 4BI7A 1WA3A 3ZFHA 4GUGA 5H2ZA 1HUVA 3H54A 4IQLA 1UUOA 1VJIA 2C13A 3CB8A 3MYPA 3CLMA 3TC7A 3DZ1A 1QCWA 3LHVA 3CHVA 5E0KA 2BZNA 2EHHA 2E6YA 4RZ6A 1CI1A 4LU0A 4POCA 1O94A 4HPXA 1L6YA 3UY7A 3GYEA 4TIMA 2E5BA 3EX2A 3MMTA 4LWWA 1OFQA 1G4PA 3GX9A 5DLCA 2V2HA 5F1UA 3TROA 3GXNA 1QOQA 4X3ZA 3NQ6A 4O28A 3Q58A 2X1UA 4ICNA 3JS3A 3FYOA 1KTCA 3UPWA 5AYXA 1F2JA 5K2ZA 2FB2A 5TBOA 4IMCA 5D03A 2GVGA 1SSGA 1T8XA 1V7YA 5C54A 4NNCA 2YR1A 2ALDA 3RF9A 3TXZA 1ML1A 3WJYA 3KRZA 1K7XA 3HF3A 1W3TA 2Y70A 4O17A 3M41A 4AF0A 3DENA 2VC6A 3GXPA 2Y61A 2QCMA 4GJ1A 4MKNA 4YLWA 1W3NA 1KM5A 3R13A 5D2VA 4Y8FA 4H4IA 5CZTA 3HBLA 2YYUA 1Q6QA 1A5SA 4HN4A 5TQLA 5A8GA 1J4EA 3MHUA 1LBMA 3B04A 1AG1O 4M5PA 1G4TA 2XFWA 3TJLA 4CQ9A 4HIBA 4IOTA 5I3FA 1DOSA 1TREA 4K6AA 1YPIA 4X22A 4JYDA 1JCJA 2DZPA 2ZZ2A 2GVJA 5C6MA 4MZ1A 1YADA 1SZGA 2YFOA 3MJYA 3BLIA 1J5TA 2CLOA 1C9DA 1H1YA 1LYXA 5EPDA 3DI1A 3VE9A 3O6DA 3TV8A 2EGZA 4BFAA 4WQ6A 4MLRA 1XBXA 2GQ9A 5BOOA 4GUFA 3USBA 3BW3A 3O06A 3SY5A 4NX0A 1TTQA 3FS2A 5AHNA 3LERA 5D37A 3W76A 3GR8A 4WXYA 5F2GA 1R47A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4JR5A

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