4JR5 | Genus

Total Genus 167

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	167
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structure-based identification of ureas as novel nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt) inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus	167
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-03-21

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4jr5A02

1T96A 4OE7A 2NWRA 3JS3A 3PBWA 2H3DA 3QH2A 3LI0A 1RVGA 4HKPA 4N6EA 4JTLA 2ZZ5A 1FCVA 2V0TA 3FFSA 5E0KA 2Y7EA 2Z1BA 4B5NA 4O10A 3M5YA 4EIVA 3N9SA 5AB3A 1SW7A 1QPOA 5TIMA 2X30A 1WYIA 2DORA 3O07A 4M6VA 3MBDA 4UFLA 3SY5A 5K7JA 1FDZA 3EX1A 1MO0A 4MZ8A 3ZR4A 2FPTA 4Z1AA 5G4WA 3GAKA 5DCBA 1PS9A 1LROA 1TPB1 3F03K 2VFGA 2WKJA 4JTUA 1GVRA 1MSSA 1GQNA 4UC5A 1TO3A 3EWYA 5D2YA 1K8XA 3QRHA 3WJWA 2CZFA 4LWWA 3DAQA 2G97A 4TR9A 1TPEA 1PCKA 1LYXA 1GTHA 3VKJA 5SWUA 3LRKA 1TMHA 1VLIA 5A5WA 4K8HA 4Y8FA 1AL8A 1JCXA 1FWTA 2TRSA 4O1DA 3W7KA 2QJGA 1A53A 5C55A 4JTJA 3QYQA 1PHWA 5I3IA 3W7PA 2J9XA 1UBSA 5DCDA 2FPVA 3DXIA 5FF7A 1LORA 5LNVA 3EB2A 1XBXA 1RQHA 3W2MA 3W74A 3IEBA 4YLWA 5DLCA 4OV4A 3UYCA 3O6DA 4O13A 1XI3A 3A22A 3ZFHA 3ZS4A 1G4SA 2V2HA 1XCFA 3LERA 1XBZA 3LBCA 3O63A 1LOSA 5K9DA 4M6PA 2RDUA 4A22A 2YPIA 5D30A 2OCZA 3TX9A 3T55A 4QJ1A 2CU0A 3MWAA 2QCGA 1W5OA 4XQ6A 5CZSA 3FKRA 4IMCA 3DHDA 1KA9F 1PL9A 1Q6LA 3LXCA 4HSNA 4OU1A 4UTHA 4GUJA 5AHNA 3S1XA 4IJBA 4LVBA 3LTPA 2E6YA 2PC4A 3BW2A 5K9CA 1T99A 2GJLA 3GIYA 3W71A 5KZDA 3CPRA 4J9JA 1MXSA 1KFLA 2PCQA 1G67A 3KRSA 1JCJA 2QUUA 3BG5A 3LM7A 4DXVA 1C9DA 2QCCA 4DELA 3IVSA 1O5KA 2EPHA 1EPXA 2X1TA 3N2XA 3GVGA 2QDGA 4BK9A 1DJQA 3Q94A 3NL3A 1H51A 2BTMA 1MZHA 2OT1A 3CC1A 3QPYA 2EGZA 1B9BA 3QSRA 3O1NA 4MLJA 3WK0A 3OBKA 1K7XA 4Y9AA 4E38A 1LOLA 1JQVA 2H8XA 3NXFA 3TFCA 5T26A 2B4GA 4JR5A 1KFCA 3Q2DA 4FX7A 3W1XA 1O4UA 2VKZG 1XUUA 1O5XA 4NUWA 4HNVA 2NUWA 4ADUA 2V5LA 4I7VA 3TSMA 4DO5A 4PFMA 3DKLA 3S5NA 1OF8A 4LY8A 5AYYA 1F2JA 3WJSA 5AC8A 4K36A 3LCLA 2EAWA 1GTEA 1THFD 4FNRA 1O60A 1TTQA 4TO8A 3KVMA 3I68A 2VFFA 1N7KA 3G24A 4MFEA 3O15A 5AC6A 3YPIA 1B4EA 3GDLA 4JGDA 1G69A 3E12A 4O15A 4LVDA 1HL2A 3L0GA 3O6CA 2NXHA 1PVNA 3EX2A 1SUXA 4QNWA 4DO6A 3NQCA 1VZWA 5F2MA 2ZBTA 3LB0A 1EP2A 3W75A 5CGQA 2FB2A 2V2CA 1X1OA 1TPFA 1AW1A 4NJGA 2TMDA 2GJNA 2OX1A 1TV7A 1KFBA 3NA8A 4BWLA 3AO0A 4UTKA 1JRBA 1YDVA 4FO4A 3VCRA 3G1DA 2Y70A 1RQBA 1UCWA 3MO7A 5HR7A 4JTFA 3JR2A 4X22A 2OT0A 1J5TA 4MZ1A 4QITA 1H61A 1NSJA 3PUEA 3STGA 3TMLA 2WO5A 1FDYA 3D0CA 4NX5A 3PC0A 4CCEA 3B06A 4UTMA 1TV8A 3C61A 5DELA 4RJEA 2TSYA 5G1TA 2F84A 4MVAA 5DY2A 2Q3RA 2P10A 1DHPA 1K02A 4GWEA 2D73A 1OX4B 3RFAA 3TAOA 3M47A 3THAA 3W7QA 1VH7A 3W1UA 5I3GA 3VI2A 3S5YA 3TXVA 2FIQA 4A2RA 1BEUA 3BG3A 4CQ9A 3W1PA 3TXZA 3LOTA 3FJ6A 1H60A 2XN1A 4RLIA 1L6SA 5C54A 2V9DA 3L65A 4UTWC 3M7WA 4WOZA 3FA5A 4HHPA 5J5RA 2YGYA 3A21A 3M0ZA 1D9EA 4JN6A 1KM5A 1LTDA 1WX0A 2VFHA 1N8FA 1VHCA 1TIMA 1OFDA 2Z6JA 3GDMA 4M19A 4LNYA 4JTSA 3KAOA 1LRQA 3EKZA 2H6RA 3S0CA 3DFPA 3MW7A 4JNMA 1ZAIA 2EF9A 3WK3A 4AHPA 3ABQA 3BO9A 1I4NA 3NO5A 4MLRA 4UNKA 7TIMA 1I2OA 4IXHA 2ZRVA 3CWOX 2QCLA 3USBA 3OG3A 5FI8A 1W8SA 3IV3A 5AFDA 3B0VC 2E68A 2ZTKA 1IIHA 2Y7DA 4NNAA 3VFLA 3PSVA 2HS6A 1ONRA 4LVFA 1QOPA 4ADSA 4EWND 2VELA 3R2GA 1SZEA 3NQ7A 2FPYA 4HT3A 4UTJA 1H7WA 3C2FA 4KWVA 5AC7A 5DBTA 2Z6IA 4WXYA 4JIQA 3LLDA 3NL6A 1KV8A 2CW6A 4GUFA 1VLWA 3LHTA 4O4WA 3N9RA 2PRMA 1GVOA 2X1UA 4UR8A 3TC7A 1N55A 3RMJA 5KTLA 2OJPA 3RK8A 3HG3A 3S1VA 2VFEA 3EKLA 1X7FA 3B4UA 4M5PA 1QAPA 4JDBA 3INPA 4M6QA 3Q58A 3L67A 3DKJA 1KM0A 3KFTA 4IXXA 5I3JA 4GUIA 3GXTA 3PVFA 4KKXA 3BLFA 3PM6A 1K3UA 4GJ1A 3LCGA 5LHFA 1QPRA 3NQVA 3HGSA 2V30A 3CU2A 3QMSA 3SSJA 1XL9A 4LW7A 3MP3A 3EX3A 1JRCA 1W31A 1FCBA 2ZRYA 1Z44A 2BLEA 5D2VA 1HO1A 4DQWA 2QCMA 1SZNA 2Q3OA 3LXAA 5FF3A 4AAJA 3KOFA 1KM4A 1D3HA 1U5JA 2I9EA 3B04A 3G1HA 1H50A 1KV5A 1UJPA 2V2DA 3LCIA 4UMAA 3HGOA 2NX1A 4O18A 1Q6RA 2C6QA 4FB7A 1S5TA 1XDLA 5D32A 1TREA 4IMDA 4WY0F 2A2IA 4UFMA 1WDWA 5D38A 3TFXA 1WAUA 1NFBA 3P61A 5FESA 3HJZA 4GUGA 3TH6A 3LHUA 3LDVA 3V75A 4Y96A 3TKFA 1L6YA 3PY2A 1W5QA 3MUXA 3HPSA 1YADA 2E6AA 3RLUA 1VGAA 2BSLA 2KZHA 4K39A 2C1HA 3QQ0A 3PBUA 3IGSA 4EF9A 4WX2A 3LRMA 1YDNA 2RDWA 3TROA 1JCLA 1RQEA 5G4EA 1KM3A 4MY1A 4ZL1A 4JTGA 2DZWA 4JICA 5DY3A 5U4NA 3W2KA 3L5MA 4YL2A 2WPBA 1H63A 4X3ZA 2J88A 5D04C 2QR6A 4JIPA 1NAL1 4QQ3A 4Q4KA 1SW3A 3KVKA 5KITA 1W0MA 4AWUA 1SZFA 1L2UA 4BI7A 5CSRA 2CLOA 1ZENA 1ICQA 2ZA2A 3EWBX 1LCOA 3BGGA 3QMTA 4O52A 2VC6A 4WUIA 5A8GA 1ZHAA 3E0IA 5BRBA 3UZJA 1DORA 3QJAA 5HWJA 3LCXA 2RH9A 1VS1A 4OBTA 3K30A 4RXFA 4GC4A 1JUBA 4ML9A 5L9FA 5H91A 2G95A 3PR2A 3EXTA 1R47A 4LS0A 1FQ0A 1YDOA 1G7UA 1ZFJA 3W1AA 2QKFA 2VEIA 3P5ZA 3UWQA 4BFAA 3NQ2A 3QFEA 3ZWTA 3BW4A 4RK8A 4UR7A 3GDRA 3GR8A 4UXDA 1VRDA 2TPSA 1O95A 1A50A 4X9SA 3NPWA 3OHIA 2BXVA 2B7OA 2Z2UA 3MHUA 5HJLA 3FKKA 3GK0A 3NQ8A 2ISWA 1KTBA 1H7XA 4UTTC 3SGUA 1R2SA 1AW5A 4PODA 3NL2A 2WSQA 4KWWA 4AVFA 3ABRA 1KM2A 4XTIA 1Y0EA 3UY7A 3N2MA 4C1LA 1BWKA 2JKEA 4OWGA 5HR6A 4IMGA 4FNTA 2GVGA 2QUVA 1GWJA 3T7VA 1JCYA 2YCEA 3CIXA 2Y63A 5AHLA 2H3BA 3L9CA 4DF2A 4NJHA 1P0NA 3PBVA 5F4SA 4ADTA 3LV6A 2V82A 4O57A 1FWSA 3W22A 1C8VA 1QWGA 4UUIA 3STCA 4AMAA 1L9WA 4NJKA 2FB3A 1YTKA 2WJZA 3SI9A 3A5VA 4ZMGA 1SSGA 5K4ZA 3CB8A 3UY8A 3S6DA 1DVJA 1TTPA 1IIGA 2Y6ZA 4PTNA 1J2WA 3NNTA 5ABTA 4JTTA 2Y89A 1W54A 5FF2A 3S1UA 1FBAA 3W88A 4JX4A 3P8JA 1OX4A 2A1YA 3TJXA 2R8WA 4TU1A 2EHHA 4JYDA 1OX5A 3G1SA 4FXSA 3W85A 4GNJA 1EB3A 5CZ0A 1FUYA 1OYBA 1OF6A 3FLUA 3TR2A 4ALDA 1GYLA 1IXOA 3MJYA 1ALDA 4O1AA 5FF0A 4DBDA 2J24A 1IF2A 3CEPA 1NVMA 2ABAA 1W5NA 3EEGA 3W7EA 4UFKA 3MI2A 2QAFA 3DI1A 5LNSA 2R94A 4OV9A 3TW7A 3WK1A 3C6CA 1YTEA 3CLMA 1PCWA 2RDTA 1F74A 1SSDA 5I3KA 4CNPA 3C2OA 4ZQNA 2DZTA 2I1OA 5DBUA 3VE7A 2Y88A 3B8DA 3G0XA 3SIZA 5HWNA 3CIWA 2F7FA 1KLZA 1A5AA 2W0UA 1DQWA 5HUPA 3GR7A 5KZMA 2YX0A 4UMCA 4ZQMA 3SGZA 1DQXA 5AYXA 5LGZA 5C5YA 3L66A 1Q6OA 2B0MA 1YPFA 1OFQA 3M6YA 4DO4A 1SO4A 3G1YA 2XFWA 4L4MA 5LGXA 3MHGA 3KXQA 3W7IA 3CM4A 3R89A 1KBIA 3DBPA 5FF4A 3HPZA 4O54A 1HG3A 1SR9A 1NF7A 3LLFA 1W3TA 3W72A 1YYAA 4HNNA 1YXCA 3NQGA 3TK7A 5BNKA 2AAMA 3CQ0A 4E2DA 4YWIA 3TCEA 5HWMA 1GG0A 3W86A 3DH7A 5I3FA 3G8EA 1TPVA 1H1YA 3ABOA 1W3NA 3HIJA 4MJMA 1ICPA 4ORMA 5AHEA 3M43A 4POCA 3GKFA 4Q32A 2O7SA 4WQ6A 3T44A 3GKAA 3T4CA 1OX6A 2YZRA 2YFNA 1H5YA 3I7SA 3M5XA 4JEQA 4OT7A 3UPWA 5E93A 1R30A 2VOMA 3NQDA 2NX3A 3MMTA 1XXXA 5EA9A 5F1VA 4GBUA 3FYOA 1JUEA 2O7QA 3NM1A 3IVUA 4OQVA 4FNQA 1WQ5A 2E1DA 5L6UA 2G96A 3LRLA 4LV9A 3PWAA 3M1ZA 2EKCA 4O1BA 1RPXA 1TJRA 2JGQA 2ZZ3A 3QMRA 2ZZ6A 5HUOA 3DHFA 2NV1A 1VCFA 2A4AA 3QSTA 2ZQ0A 4TX9A 1PIIA 2YYTA 2QCDB 1QDSA 3UXAA 4O12A 5LZLA 2GOUA 4JD4A 4IWWA 5AHIA 3IIPA 5HQEA 2HSAA 5BMXA 3LHVA 4S1FA 4JTIA 5AN7A 1I2QA 2AGKA 4MY8A 3S9YA 4CNOA 3SJ3A 2CZEA 1C29A 5CPNA 3HQ1A 1P0KA 3UD6A 1T0OA 3G0SA 4BF9A 5F2GA 4YMZA 1F6PA 1NF0A 3P74A 4WY0B 3HPXA 4YCPA 3HGJA 3W7DA 2CLKA 4LRTA 1WOBA 4NJIA 2E5BA 1Q6QA 3L21A 1TB3A 3NL5A 3C56A 3MP4A 2X16A 1TPH1 4RR4A 3NQAA 2NZLA 4XUGA 4O53A 5FEXA 1LBFA 4X2RA 1VC4A 1FY6A 4Q33A 1SFLA 4R7JA 3I6RA 3HOJA 2NXIA 4JTEA 3PAJA 2ZZ7A 3MYPA 1TPUA 4K37A 1H1ZA 5EYWA 3FEMA 4GRSA 1IXNA 4PL1A 4IUOA 4QM1A 1A5CA 4P2VA 2Q8LA 2ZRZA 4RZ4A 4OGZA 1H62A 4JY9A 3A23A 4Z1CA 2V5BA 3RF9A 3LBMA 2VXNA 4FNSA 4RZ5A 4RCXA 2Y7GA 3TDFA 3DGRA 3TE9A 4AHQA 4PCFA 3LHWA 4UTLA 4UMBA 4Z0SA 3G1XA 1YLVA 1I2NA 4I7WA 3STFA 2PURA 3O8AA 4N9DA 4IMFA 4WOQA 3NGJA 1VJIA 1WV2A 3NAVA 5CKSA 3DZ1A 4NNBA 4QAIA 2YW4A 3GLCA 1BTMA 3G1VA 4NXKA 5K9XA 5D2WA 1B57A 3LTSA 4AF0B 4H6KA 3W1LA 3QM3A 1R2TA 2C0AA 4AWSA 4HNTA 5J5DA 3O06A 4AHOA 1O94A 4PEKA 4M7SA 2P0OA 4JTKA 3TQVA 1BKSA 3G1FA 5G2HA 1W56A 2P1FA 2RFGA 3EWUA 2WV8A 4O17A 3GXPA 1F5ZA 2ZA3A 2H90A 2ZYFA 3TNOA 1HO4A 3IIOA 1TCDA 2C19A 3FOKA 5G2IA 3H53A 4R33A 1KM1A 4R53A 1PHQA 5D2XA 1P4CA 4U4MA 1JJKA 5F2IA 2E09A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4JR5A

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