4JS3A

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with 057
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with 057
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 135
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4js3A00
2Y7DA 1F6PA 1H60A 1K8XA 1XDLA 1ICSA 4IMDA 1OF6A 4HIBA 3SGUA 3QPZA 1MSSA 1YXDA 4AB4A 4O1CA 3NQ2A 5FF0A 4A2SA 1R2SA 3E12A 4FNTA 1FWNA 3TQ0A 3E49A 4P2VA 1OVDA 2DP3A 2Z1BA 1ME8A 4HSNA 2JGYA 4BWLA 4JGDA 1O5KA 2A0NA 2A2IA 2JKEA 2G97A 3P84A 5I3KA 1VQTA 3NR0A 3BG9A 3VCRA 4DEFA 2AGKA 5LNVA 4BI6A 3SI9A 2VFDA 2QCNA 4Y6GA 3L0GA 1TRDA 4KWWA 1ZCOA 4C1KA 2QAFA 2H3DA 1TCDA 3QSRA 2Z6JA 4XBKA 4I9AA 3GR8A 3H55A 4S2CA 3QQ1A 3T40A 5EY5A 5LNWA 3LRKA 1F05A 3BG3A 3W7HA 4LS0A 1PV8A 4XQ6A 5DN1A 3N19B 3LTYA 3EEGA 4DF0A 4DQWA 5TIMA 1OFOA 3RLUA 1SO3A 2V2HA 3BGJA 1G4TA 1YPFA 3L5AA 2B7NA 1CI1A 2V2DA 3L0NA 1WBJA 3OVQA 3DH7A 3MHFA 4H6KA 2PCQA 1AW2A 1KTCA 2C16A 4IXHA 4PC8A 1UJPA 4ZL1A 5LNRA 4DO6A 3TSDA 3C2VA 4GUFA 1NF7A 3TW6A 4MVAA 5D2YA 4UTMA 4CQ9A 3W1NA 1LZOA 2QJIA 2E5BA 4O19A 3N9RA 1NFBA 3PSWA 4O1AA 3E02A 4ZQMA 3F4NA 4UMAA 2YDAA 2OT0A 3PBUA 4KFPA 3I65A 5CPOA 3T7VA 1W5QA 2CW6A 4XUGA 2JKAA 3G3DA 3EWUA 3M7WA 5CZ0A 3IVSA 3MWAA 3W7RA 1YTEA 3W7JA 2QCHA 2PE4A 3LCHA 1FY6A 1ZY9A 5AB3A 1AL7A 2CWNA 3HG4A 1LYXA 2RDUA 1TREA 3LHZA 3W2KA 3HG3A 1IXNA 1OFAA 1W37A 2WSYA 3G1VA 3CIWA 3DU0A 4QNEA 1KV5A 5DELA 4JD4A 3W2LA 5IBXA 4PH6A 2ATSA 1OJXA 3W74A 2Y61A 4GJ1A 1H7WA 3W1PA 4N4PA 3R12A 4R34A 5KITA 4N9BA 4K8EA 5FEXA 1L6YA 1TPWA 1L9WA 2HSAA 3G1YA 1W5MA 4MY9A 6ALDA 3QPYA 4PODA 4E2BA 4A29A 5FESA 4IPIA 3LBMA 2YFNA 4QQ3A 4WXYA 2DZSA 3FKKA 2V30A 4MIMA 3F03K 4S1FA 3V1PA 3NL2A 3NQDA 2ZFAA 1KLZA 3LHVA 4UFLA 5AC7A 3KRSA 1T0OA 5MHBA 4LWWA 2FDSA 3HOJA 4UTHA 4BFAA 4JXCA 3SZ8A 4DF2A 4FEZA 3QH2A 4KFNA 1B9BA 4MZ8A 4NJJA 1TTPA 4LVGA 4HT3A 4L4LA 4MY8A 4EF8A 3A5FA 2CZDA 1A5BA 1AL8A 4WX2A 3JR2A 4WXZA 1YLVA 3KXQA 4MYAA 5K9CA 4H3DA 1H7OA 2FFCA 4NNBA 1I45A 3P80A 4RZ4A 1F74A 3O1NA 2BXVA 4LUIA 5HULA 4LUJA 5E93A 3HPXA 3LRMA 3GDMA 4Z1BA 1VCFA 3O63A 4MKNA 1G4PA 1VYPX 1XBXA 1A5SA 1KFEA 5AYYA 2G5WA 3C3NA 1KM6A 1TYGA 4DO5A 4JS3A 1Z48A 4Z08A 2ZRUA 4AHOA 2NXGA 2PC4A 1WOBA 3HO8A 2Y7GA 3EB2A 1JUBA 1VS1A 3FEMA 5KZMA 2Q8LA 1XC4A 2D73A 3IIPA 2J88A 3LCFA 2WSRA 1SZGA 3BLIA 1PIIA 3SECA 1QPRA 5AFDA 2FB2A 4N02A 3QM3A 1WXJA 4OU1A 5K3VA 1ZALA 3LCLA 3PBWA 2A21A 2DZPA 3IGSA 3ZWTA 3BG5A 1LTDA 1XL9A 2J9ZA 1F2JA 4YCPA 1H63A 5DBTA 3LCIA 2ISWA 2W6RA 4UTWC 1QFEA 3I6RA 4XZ9A 3NQFA 3BLFA 2QKFA 3P60A 4O50A 4O4VA 1B3OA 3EWYA 3G1HA 4EF9A 1YPIA 3SW6A 1YTKA 1VYRA 3PVFA 1N7KA 1J4EA 3CT7A 3PF3A 3LM7A 1G4EA 1Z41A 2TPSA 3M6YA 5KTLA 2YYUA 5DBUA 3S9YA 3PB0A 4X22A 4K7VA 5T26A 2QEZA 4JTJA 3TCEA 2RKXA 4IMEA 8TIMA 1QO2A 4IMFA 4ZVJA 3GXNA 3WJSA 2GJLA 3NYZA 1LOQA 1XBZA 2YW4A 1GVOA 3NQGA 4A3UA 5D37A 1XDMA 2WV8A 1QPNA 1QDSA 3SJ3A 1Q6OA 3TU9A 2CZFA 1FWWA 5L6UA 1K7EA 1EA0A 3G1DA 1TPDA 2WQPA 1HFBA 4LV4A 3RF9A 1TPVA 3KVMA 4JIPA 3BW4A 1SW0A 1LM1A 2ZA1A 4K8HA 3CWOX 3M9YA 5CPLA 1K7FA 5A5WA 3E96A 3W84A 3S6DA 1M7OA 3PULA 4ICNA 3KFTA 1QWGA 3W7MA 4QITA 3WFAA 4GC4A 3CQ0A 1TMHA 4MJMA 4M5PA 1K8ZA 3L2IA 4PTNA 5TQLA 4FNQA 4FX8A 2VFIA 2YSWA 3ATYA 3NZRA 3G8EA 3TAKA 2JGQA 3STGA 3R89A 4K39A 3B04A 1R30A 5D32A 3IVUA 4NUWA 3G8RA 1SU5A 4HN4A 1GQNA 1FDZA 3W88A 4JR5A 4A22A 5AYZA 3DKJA 5CPMA 1O94A 1RD5A 4UTLA 5K4ZA 3LDVA 2Y7EA 1WOAA 3M41A 4OHQA 1JCJA 5C2XA 4UR8A 1Q6QA 3W1LA 1T96A 3CEPA 2C15A 3NDOA 2ZZ1A 4ZQOA 1PVNA 2V2CA 1LRTA 1FWTA 3IGUA 3HGJA 4TR9A 5HWNA 5FEPA 3M5VA 2KZHA 3U6WA 2PRMA 3S0CA 3GDTA 4AWTA 5G5IA 3GDLA 5CPNA 4U4MA 1O95A 3ABQA 4MFEA 1C29A 3G18A 4JNMA 3NQEA 1RVGA 1Q45A 2ABAA 4NZFA 4KKXA 3CB8A 3LX9A 4MLRA 1KFLA 4ML9A 3KHJA 1KM1A 4UFKA 2Q3OA 2DZTA 2X1UA 3LBCA 3RFAA 3RLVA 5D04C 2V81A 5CZTA 2A1YA 2QUTA 3P8IA 2X1SA 3UY8A 4QSHA 2GVLA 3YPIA 2CZ5A 3NL3A 1THFD 4NT0A 2EAWA 4AEOA 4FNSA 4HHPA 1HTIA 5LGZA 5D03A 5FEZA 2H8XA 3QJAA 4OWGA 1W3NA 2NX1A 2FPYA 1ML1A 4JTTA 3EX2A 1W5OA 3G1AA 3L68A 2RFGA 5FEWA 1G7UA 4DBEA 4UTUA 1W1ZA 5KSWA 1MO0A 3O15A 2ZYFA 1JRBA 3NL6A 5AHFA 3LTPA 5LNUA 5FF4A 5H2ZA 3PBVA 2O7QA 4JYDA 2TSYA 3Q2DA 5AHMA 5BMWA 4N9CA 1SPQA 2AAMA 1I4NA 1NEYA 3V75A 4QISA 1R47A 1GVRA 1XBYA 1FCUA 3LLFA 1J2WA 1NSJA 2CLFA 3LV5A 4Z1AA 3DI0A 2VEPA 3C2EA 1AK5A 4IX0A 3STFA 2YFOA 4AWSA 2E1DA 3PG8A 3TQVA 4GUGA 5K4XA 1V5XA 3NQ8A 1TJPA 3NA8A 3B06A 1Q6RA 3QMTA 1HL2A 3PR2A 3MP5A 3MMTA 1W8SA 1KA9F 1H50A 5HNRA 3W7LA 4UMBA 3G24A 3BARA 4EIVA 3OIXA 4TIMA 1QO5A 3HBLA 1G69A 1UUMA 4TMBA 1VRDA 5I3GA 4WD0A 4FF7A 1FBAA 2NZLA 5CZSA 2QUUA 1OYBA 4MOZA 3GK0A 5CZJA 3P74A 3S5ZA 1EP2A 1OFDA 3W3OA 4UTWA 2Q3RA 3N14A 1L6SA 2X16A 1OK6A 1EWDA 3TMLA 4CCDA 5H91A 1K7XA 4ONVA 3GAYA 2GVJA 4BF9A 4AF0B 4YCOA 3M16A 3KOFA 2XN0A 3EX3A 4P61A 1W54A 3KVJA 3EWBX 3UWYA 1IIHA 1BWLA 1RQEA 4RR4A 4GE8A 4MYXA 3ZS4A 5LGXA 1ADOA 2J27A 2A6LA 1TPH1 4PFMA 3QMRA 4S2BA 4O13A 1RQBA 2DZWA 5KZDA 3CIXA 4O28A 2WSQA 3QW3A 4BK9A 3KX6A 1DKWA 4RX0A 3IIXA 1P0NA 1YDNA 1TO3A 4BI7A 2CLLA 3SY5A 5AHLA 7TIMA 3NVTA 1BKSA 1HG3A 4YL2A 2NX3A 1G67A 1A5AA 4LS1A 3MBDA 1JCMP 4QNWA 3L21A 1PE1A 2TYSA 3LOTA 1KM5A 1M5WA 2DJLA 1UBSA 1ZNNA 3O16A 1JR1A 1A50A 1OX4A 1QOQA 1G7VA 3UWUA 1X8FA 1EUNA 2E5DA 1XXXA 2B0MA 3CLMA 3PAJA 4AF0A 2E6AA 3OVPA 3T44A 3ZWSA 2WPBA 4ZQRA 3MUXA 4UUIA 5F4SA 3C2OA 1GG0A 2GOUA 3PBYA 2Z0IA 2BZNA 1TIMA 3NEVA 1I8JA 3W1QA 4IQLA 2Y89A 2E6FA 4XWUA 3TSBA 4IJBA 4Y96A 2WOQA 1H7RA 4O53A 5LNSA 3B0UX 4LC6A 4O57A 2B7PA 3L66A 1M6JA 1GG1A 3M5YA 4R33A 4MLJA 3LHWA 1BTMA 3MYOA 4LVBA 1EUAA 2XN2A 4UFMA 3E9AA 2RDTA 2GQ8A 3NXFA 3F4WA 4LW7A 5AYXA 2QDHA 1F76A 3GNDA 3L67A 1WQ5A 1OABA 1B4EA 3VE7A 1FWRA 1SZNA 4Z1CA 2R8WA 5G2WA 4FB7A 2GPTA 3MJYA 1ICQA 4GNJA 1AG1O 2W0UA 3S1XA 4NNCA 2A4AA 4O0KA 3WJXA 2EPHA 3DBPA 1AW1A 4JX5A 3GDRA 1Q6LA 4IMGA 5HMSA 4O12A 2YPIA 4Q32A 4RK8A 2QCFA 3W9ZA 4O54A 1FCBA 3W2NA 2YXGA 3UZ5A 5HINA 3W6YA 3SSJA 4LNYA 1JCYA 3TXZA 3A23A 2V5LA 2Y88A 4MFDA 1P0KA 3CM4A 3UWWA 3ABSA 5AC6A 3L9CA 1JJKA 2ZZ2A 1GEQA 2DZUA 1JRCA 1ME9A 3W76A 4ZQPA 2OMAA 3LHUA 5CKSA 1SO5A 3DAQA 2DORA 3MP4A 3NQ7A 3UXDA 5IM51 4NJIA 3LHTA 5CGQA 2Y70A 1H7PA 4QJ1A 3SR7A 4FNPA 3GB6A 4RZ5A 1I2PA 3TC6A 4LTSA 3W2UA 1W0MA 3W70A 1I2OA 4JTLA 3W85A 3JRKA 3G3MA 3VNDA 3BGGA 1VZWA 1MEHA 4E0CA 1XUUA 2C14A 3TC7A 4M19A 2YW3A 1PHQA 1TV7A 2X30A 2CLEA 3EWZA 1FXPA 3Q58A 4O11A 4TO8A 1XBVA 1GPWA 5KMYA 3G0XA 4LRSA 5A8GA 4K6AA 4NX0A 1X1ZA 4YXGA 1B57A 1EIXA 2QJGA 5E1QA 5D2XA 4OGZA 3DENA 3W1AA 1KFKA 2WKJA 4FO4A 1DHPA 4EWND 4UFJA 5I3HA 1ZAJA 4O16A 2CLIA 2NV2A 1CW2A 2C0AA 1LRNA 2WO5A 4JDYA 4Z0JA 5DXXA 1NAL1 1D9EA 3HPSA 3W71A 3W7IA 3QFEA 2LLEA 4NXKA 2Y85A 2PRLA 2QCLA 3CU2A 4R53A 4ZQNA 3C61A 4XKYB 4OV4A 3T78A 4UMCA 3TFXA 1DQWA 2FPVA 2C19A 5HJLA 3SIZA 5DXYA 1VPXA 2RH9A 2I1OA 3THQA 3S5OA 2BLEA 3FYOA 3L5MA 5DCDA 5D2TA 3UWZA 4WJEA 1GWJA 1A53A 5C54A 3DFSA 1KLYA 2A6NA 3GZ3A 3LGEA 3LXBA 3P5YA 4O17A 2A7RA 3GXPA 1TTJA 3MI6A 3W1UA 5EYWA 2E6DA 1SSDA 5AOUA 5FI8A 4JX4A 4IMCA 2F84A 1TPEA 1H1YA 1ZFJA 3BW3A 1PCKA 4GBUA 1VLIA 1WV2A 2WJZA 1TPC1 1JCXA 4JIQA 4XKYA 1W3IA 2DJXA 2ZQ0A 5ABTA 1Q3NA 3A9IA 4JTKA 4AH7A 2ZRWA 2J24A 2R94A 1LP6A 2VOMA 5FF3A 3W72A 3C56A 1W5NA 2C13A 1V7YA 5SWUA 5F4WA 5I3JA 3PSVA 1WA3A 1KBIA 3VI2A 4BR1A 2VFFA 4JTUA 1W3TA 4JEQA 3VFLA 4OT7A 3ATZA 4FNUA 4E2DA 4IPJA 1AMKA 3HGSA 1T8XA 2ISSA 3N2MA 2WNNA 4Y90A 4X2RA 4YWIA 3CTLA 3GAKA 3MI3A 2EF9A 2CLHA 3JS3A 4UNLA 1F7BA 3ANYA 3FA5A 3S1UA 3FJ6A 1DOSA 3TE9A 3GYEA 2YYTA 2E09A 4NJHA 4A2RA 4N4QA 2YZRA 2ZDRA 4WUIA 2A85A 5FF2A 5G4WA 3CWNA 4UTTC 1OFBA 3W7DA 1SW3A 5D2VA 4Z0SA 2NLIA 4O8RA 4Z1DA 5AN7A 4UTIA 3UWVA 2NXIA 4TX9A 3P5ZA 4KFOA 4Q4KA 2B7OA 3W1XA 3C2FA 2NUYA 2ABBA 4WOZA 3MP3A 5LSMA 1YDVA 2CLKA 2J9YA 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 1SSG A;  1GZG A;  5CSS A;  1O60 A;  5CSR A;  3BW2 A;  3C0J A;  5LHF A;  1TJR A;  3FKR A;  5BMX A;  2C6Q A;  1TQX A;  4FXS A;  3M5Z A;  1JCL A;  2FLI A;  2I14 A;  4Q33 A;  3ELF A;  3G0U A;  3IIV A;  3GR7 A;  3WK0 A;  2NUX A;  3DI1 A;  4DEL A;  4LOC A;  4LRT A;  3LLD A;  4L4M A;  3T55 A;  1GTH A;  5EL1 A;  4CCC A;  1QPQ A;  4X9S A;  3NM1 A;  4O14 A;  5F2G A;  2ZZ5 A;  3MI2 A;  3LXA A;  1LOR A;  4UIO A;  4BI5 A;  3UWQ A;  3W7C A;  2E6Y A;  3IRD A;  3VE9 A;  4XTD A;  4UFI A;  1S3H A;  2J6X A;  1N55 A;  4UC5 A;  5HR6 A;  3QQ0 A;  2A7N A;  4NU7 A;  3BV4 A;  3NQ6 A;  6TIM A;  1KBJ A;  4GWE A;  4ORI A;  3FLU A;  3G0S A;  3GLC A;  3SGZ A;  1FWS A;  1VJI A;  3TMQ A;  3W83 A;  4QM1 A;  1J5T A;  1CX9 A;  2ZTJ A;  3UPW A;  3OA3 A;  5HWM A;  4DXV A;  2HS8 A;  1QNV A;  3K30 A;  2JKP A;  1ME7 A;  4FXR A;  2VFG A;  3ABO A;  1KM2 A;  3UQN A;  1VHN A;  3N34 A;  4HNN A;  4NXS A;  5K9D A;  2I9E A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Y7D A;  1F6P A;  5HXM A;  1EFZ A;  1VFT A;  1Z6K A;  3KS6 A;  1OF6 A;  4HIB A;  1RBA A;  1CDG A;  1YXD A;  1RK5 A;  4KT2 A;  3SUU A;  5FF0 A;  3WLJ A;  3FA4 A;  2XG9 A;  2WMF A;  3IV8 A;  4FNT A;  3UXL A;  1FWN A;  3RYS A;  3E49 A;  3WNM A;  1EO7 A;  4WJ8 A;  4B4F A;  1O1H A;  4BWL A;  4JGD A;  2JKE A;  2G97 A;  3CAW A;  4D6E A;  3BG9 A;  3LPF A;  1EHN A;  2AGK A;  5BXT A;  2P50 A;  4D8Z A;  4MAZ A;  2VFD A;  1ZBW A;  2QCN A;  4YU1 A;  4Y6G A;  4GG9 A;  4C1K A;  3O3R A;  2QAF A;  2H3D A;  2F6U A;  3NZQ A;  3OO2 A;  2Z6J A;  4XBK A;  1W9U A;  3GR8 A;  4ZFM A;  4S2C A;  3T40 A;  2YXO A;  4K1G A;  4LH8 A;  4XD6 A;  2OLS A;  1Y8B A;  1F05 A;  3BG3 A;  3RX2 A;  1WCG A;  4LS0 A;  2PMQ A;  4XQ6 A;  1WUE A;  3EEG A;  4DF0 A;  3BGJ A;  1YPF A;  4MDP A;  3M0H A;  3DH7 A;  4H6K A;  4QSF A;  2PCQ A;  1QUM A;  3FHA A;  3UJ2 A;  3II1 A;  4Q8W A;  4W86 A;  4U3C A;  4IXH A;  1JD9 A;  1XRS A;  4NZ5 A;  4OIF A;  5PTD A;  4PEE A;  1NF7 A;  3RUB L;  3TW6 A;  4Z1Y A;  2Z1K A;  2E5B A;  4O19 A;  3N9R A;  2QUN A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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