4K7VA

Oye1-w116a complexed with (r)-carvone
Total Genus 149
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
149
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLAVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X‑ray Crystallography Reveals How Subtle Changes Control the Orientation of Substrate Binding in an Alkene Reductase
doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces pastorianus
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
total genus 149
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2013-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4k7vA00
3W72A 2W0UA 2WOQA 4MJMA 1OVDA 3P8IA 1KTBA 4M6QA 3PBVA 1PS9A 2PCQA 1Q6QA 1M6JA 3A23A 4IJBA 1TV7A 2VFHA 3TQ0A 1VR6A 1A53A 3W1LA 3AJXA 4DPPA 1JQVA 5DXYA 2AQWA 1H63A 1WDWA 2YX0A 2C16A 3TQVA 2KZHA 3CC1A 1WAUA 3IIVA 3HOJA 2EF9A 1BEUA 3GDTA 4K7YA 3WK0A 3PG9A 3MI2A 2TMDA 4EF9A 5G5IA 2CLKA 2QCNA 4O57A 5I3FA 4O10A 3BPWA 4JX4A 4JTJA 2WV8A 3P81A 1XUZA 4Z1DA 3E02A 2E09A 2HS8A 5FF4A 2PC4A 1BKSA 1BWLA 3LCLA 3W2JA 4O1DA 3UWVA 3OA3A 3TX9A 4UMAA 4YMZA 2ZFAA 1EIXA 4AWUA 1S5WA 2JKEA 2ALDA 2RDTA 4GFSA 3G1FA 3BARA 3EWZA 1MEWA 3Q2DA 1TIMA 3CQ0A 4KFPA 3NQ8A 3C8FA 3TMLA 3GAYA 1C9DA 2QKFA 2V2DA 4TR9A 3GKAA 1L9WA 4L4MA 1TMHA 3CB8A 3L0KA 3KHJA 2RFGA 5BMXA 4WX2A 2V9DA 4AH7A 1OABA 5EY5A 3TIMA 1NSJA 3DKLA 5HUOA 5ABTA 5D04C 2QEZA 1TV8A 4PTNA 5DXXA 5LNRA 1YDVA 2QDHA 4IMEA 4UTWA 1AW2A 2RH9A 1JVNA 2E6DA 3E12A 1ZAIA 3UZ5A 3SZ8A 3H54A 4UNLA 4N9BA 2NX3A 2J24A 5F4WA 1EWEA 3A21A 1X7FA 3L5MA 4LS1A 3ABQA 3HJZA 3SY5A 4UTTC 1C8VA 4JN6A 3GKFA 3UWUA 3TQKA 3FOKA 3CLMA 3PBYA 1WQ5A 2E5DA 3NQGA 4NNBA 5K2ZA 3P67A 4AHQA 1ZHAA 3D0CA 5FF0A 5LNSA 5DELA 3U2OA 3BGJA 3LCIA 1W5QA 4N2YA 4O16A 1XXXA 1GQNA 1YTKA 3O6YX 4LOCA 3RU6A 3M44A 3C4UA 4GUHA 5KZDA 1DHPA 3HGRA 2BWGA 3PUDA 1KFCA 1OYAA 4S1FA 3WFAA 1HG3A 3C6CA 2Q3OA 2C14A 4ZVJA 4JTEA 4FNRA 3BGGA 3P61A 5F2LA 3ANYA 3QEZA 4LTSA 3WK3A 4BK9A 3HG3A 5LNUA 3O06A 3DFTA 2QUTA 4MLRA 1A5SA 6ALDA 1FXPA 1KM0A 2P1FA 4HNNA 3R13A 5E93A 5CPLA 3BLEA 3DH7A 3QQ0A 5AHMA 5LKYA 2ZA3A 4DPQA 1WX0A 3W87A 1KM4A 1SO6A 3STCA 3O63A 1I2QA 4PC8A 4LVGA 1EP2A 1OYCA 3TJXA 2H90A 3NM3A 3Q37A 4L4LA 4X22A 4M6PA 1K7FA 5FEPA 1CI1A 3W7MA 3G0SA 4LC6A 3V1PA 1W54A 4ML9A 2XN2A 2X30A 4JYFA 1UUMA 1W3NA 3W1UA 3LX9A 4MY1A 4IMCA 1Q45A 1QR7A 2GJLA 4Z1AA 4TMBA 2PRHA 3UZJA 1JJKA 4IPJA 1CX9A 1NVMA 1JUEA 1BTMA 4U28A 1TQJA 2E68A 1DKWA 2X1RA 1F2JA 4JY9A 4NU7A 4UTIA 2OX1A 4QNEA 5EL1A 2NXIA 1AG1O 5I3HA 2JKAA 2H8ZA 1P0NA 3GX9A 4RXGA 5AHNA 1H7WA 1C29A 3VCRA 3W23A 1JCLA 2HTMA 2QCEA 3NA8A 3MYOA 4A21A 1XBZA 4GUIA 4UFKA 1HO1A 3GXNA 3ZFHA 1K8YA 4A3UA 1OFQA 1TCDA 4MUZA 2YSWA 1FBAA 1RZMA 1LLZA 3PAJA 3LV6A 2VFFA 2Y63A 1VGAA 1SQ7A 2OMAA 1SW3A 1ME9A 1SUXA 1V7YA 2QCGA 3W22A 3VE9A 1DL3A 5F2GA 2WNZA 1TSIA 2E5BA 5AHLA 1GOXA 3P62A 4KWWA 3PB0A 3L5LA 3THQA 2H3DA 5AHEA 3F1QA 1ADOA 3H53A 3LHZA 2EPHA 5DLCA 5IM51 3W7KA 1YXCA 5F4SA 1ZALA 2R14A 4QJ1A 1VHCA 1G69A 2ZZ7A 4A22A 3GR8A 1H7RA 3Q94A 3H55A 5AB3A 4WY0F 1TO3A 1U5JA 1VS1A 1NF0A 2Y70A 3LRKA 1KM1A 1SO4A 3JS3A 4PCFA 4CCEA 4AHOA 1LOSA 2ZDRA 3W7PA 3W7DA 1KLYA 4UXDA 5C55A 2TPSA 3CT7A 4AAJA 3I6RA 4KFOA 1GVQA 4R34A 3O6CA 4OWGA 2QCDA 1TYGA 1JUKA 1Q6LA 1QCWA 3NZRA 3PUEA 3LBMA 2G95A 3U8GA 2ZRYA 3OHIA 5AC8A 1G6CA 3T44A 4N6EA 1IIGA 3W2UA 1IXOA 3PR2A 2WNQA 3QMSA 3IIXA 3NNTA 3R2GA 1GG0A 4N02A 4TIMA 4DXVA 5KSWA 4OHQA 3HG5A 5MHBA 3UY7A 1T0OA 4YLWA 1G7UA 1LYXA 5BMWA 1EP3A 3NQFA 2ZZ1A 5F2MA 3A22A 4JD4A 1DJNA 1X8FA 5CZ0A 3R8RA 2DORA 1LP6A 3HGJA 3NQVA 1K7EA 5CKSA 1LBMA 5D03A 3TJLA 3TXZA 4RJEA 3MP3A 5F1UA 4OE7A 3LTPA 1TREA 3L65A 1R2TA 1ZENA 4UTHA 3TSBA 3T4CA 4TMCA 2V5BA 3GZ3A 3N2MA 4QITA 5HNRA 3QRHA 2A21A 5I3IA 3L67A 1W1ZA 4UTUA 4BFAA 1VYRA 4ZQCA 1O94A 5LGZA 1TTQA 3P60A 1I8JA 4JYDA 3W6YA 5D32A 3W3OA 3RK8A 4LY8A 2XN0A 2VEIA 4NNAA 3PS7A 4UFLA 3RFAA 5HWMA 1Q6RA 4NXSA 3PVFA 2QAFA 3TA6A 4TO8A 1MO0A 2QF7A 2QUUA 2I14A 2O7QA 4ORMA 4EIVA 2RKXA 4LNYA 1AMKA 4UUIA 3JRKA 7TIMA 3C2RA 3VI2A 2V0TA 4IPIA 4JNMA 2DJLA 2FTPA 1F6KA 5H91A 4C1KA 3TV8A 4E2BA 2A0NA 4DF1A 1Z44A 3OVRA 1IIHA 4XKYA 3CM4A 4GWEA 3M6YA 2WPBA 2A5HA 3IVSA 3STEA 4NXKA 1M7OA 5LHFA 4GE8A 3EWUA 3R5EA 2DZXA 1ICSA 2I9EA 1GTEA 4OV9A 2Y6ZA 4N4QA 3B03A 3CWNA 5CZJA 5HWNA 3S9YA 1XCFA 4OGZA 1H1YA 4FF7A 4H4IA 1D3GA 3LB0A 1K8XA 3NM1A 1BWKA 4QISA 4O1BA 5D2WA 4XBKA 3G1XA 2NUXA 4RCXA 1LTDA 1ONRA 4O11A 3EX3A 4O15A 3CIXA 1ICPA 4WY0A 3P8JA 4R53A 1QO5A 3S6DA 3TFCA 5LNWA 2ATMA 5L9FA 3BW2A 4JTUA 4E38A 3M16A 4ORIA 2A6LA 1N8FA 4J9JA 4O14A 2B7NA 1ZAHA 2C13A 3W7HA 2NXGA 3OIXA 1GVOA 3TE9A 1VC4A 4N9EA 3W07A 2RDUA 4OT7A 5D09A 2TRSA 3C61A 1X6UA 5F4XA 4HN4A 4I7VA 1G67A 1QPRA 4MYAA 3TC6A 3UXAA 1FWNA 1GWJA 1F6PA 1OFEA 2C0AA 3B0PA 2DZWA 5CPOA 3EXTA 2QJIA 3ABRA 2V8ZA 3NQAA 1O60A 1DV7A 1W8SA 1UASA 1WXJA 2DZTA 4K37A 3QSTA 3FJ6A 1YPIA 3TSDA 4E0CA 4JX5A 2F84A 3MYPA 5IBXC 1TPFA 4LS2A 5G2IA 1KV5A 2OJPA 3W71A 4CQAA 4O0ZA 4EOUA 5A5WA 1X1OA 2PURA 3B4UA 2QCMA 4MZYA 2D73A 5K7JA 3TKFA 4CNOA 1FWSA 3HF3A 2ISVA 4M5PA 3A24A 3P80A 1G7VA 4JICA 2VKZG 1YADA 3S1UA 4JTSA 5F2IA 1A5CA 4IX2A 2A4AA 1QNVA 2ZZ4A 3C2VA 4UTTA 3I65A 3BV4A 1XDLA 1EB3A 1SW7A 3TNOA 3W2NA 1LRQA 3FA5A 2EAWA 2ZYFA 2WKJA 2PE4A 3M0ZA 2FJKA 3HGOA 4KWVA 1H1ZA 4FO4A 1GVFA 3GDKA 3W7GA 3KVLA 3EB2A 4R7JA 3EXSA 3SI9A 3M1ZA 3G1SA 3RLUA 3TSMA 2HMCA 4XUGA 1O95A 1JUBA 4ZQOA 5K4XA 4FIQA 2YFNA 1AK5A 3G1YA 4O28A 3LRLA 3CWOX 1LROA 1JULA 3SIZA 3U6WA 2E6YA 2WNNA 3N14A 1KBJA 4RK8A 2J9XA 4BWLC 1UJPA 3GDLA 1MXSA 5G1YA 4I7WA 3P7YA 4UCGA 5AOUA 4YWIA 3W7EA 3TAKA 3G0UA 2OCZA 2X1UA 4JYEA 2YGYA 1TQXA 2CLLA 4LV4A 3G3MA 2Y88A 1T99A 3DHFA 3ZWTA 4PA8A 4D2JA 3PY2A 3BLFA 2HS6A 3TFXA 1OJXA 3LXCA 4IOTA 1JRBA 2CLMA 3UWWA 4AF0A 2QUVA 4B5NA 5EKYA 2NUWA 2NX1A 2X2GA 3KVJA 3UY8A 4ZQPA 2ZA1A 1B4EA 1UB3A 1H61A 3W1MA 1D3HA 1LOQA 1K3UA 3W7JA 1OK4A 4UNKA 2VFDA 1H62A 1I2NA 5E1QA 2NXHA 4XTIA 3NYZA 1EPXA 3NVTA 3S1XA 3HPSA 1J2WA 2GQAA 4HSNA 1PE1A 4BF9A 1JCNA 4NT0A 4IX0A 1TTJA 3ZWSA 3QYQA 4HPXA 1K03A 5F1VA 3PSVA 2DZUA 1TTIA 3UWZA 3LLFA 1U83A 1VCFA 2XN1A 3NPXA 2CZEA 3QC3A 3GVGA 3DENA 3WJWA 4JX6A 2ZZ6A 1KFJA 2CLOA 4K39A 1PHWA 4S2BA 1B57A 4HPJA 2VFGA 4O53A 3FYPA 3MP5A 1TPVA 3E0IA 1L6SA 3TXVA 4YCPA 3SSJA 4TU1A 4O8RA 3W7CA 4XWUA 1EX5A 1THFD 4CLMA 4UTMA 1AL8A 1KTNA 2A7PA 1PCWA 3UYCA 5LHEA 2J6XA 2LLEA 1LM1A 3HMJG 3FEMA 4DF0A 1G4TA 3I7SA 4R33A 1OX4B 3QPYA 3G3DA 1OFDA 3WJXA 3KVKA 5DY2A 4CQ9A 3GIYA 4DBEA 5AC6A 4QM1A 3W7OA 2NUYA 1FXQA 1P4CA 4G1KA 1K8ZA 1YDOA 1G4EA 2OT1A 4UFJA 1FDJA 3M9YA 3UNDA 3B05A 1MEHA 3M47A 2JGQA 5AYYA 4HNUA 2Z1BA 1F05A 1W3IA 3LHYA 4MJZA 2J88A 3UD6A 3O16A 2BLEA 3I7RA 2ZBTA 3QSRA 1LBFA 4JEQA 2WSYA 2YZRA 3DFOA 2X1SA 3L0NA 1ZCOA 1IGSA 5G1TA 3K30A 5DN1A 4LUIA 4NX0A 1R46A 5G4WA 3UWQA 1J5TA 3QMRA 1H50A 2QCHA 2NLIA 3QMTA 4QIUA 3RMJA 1VYSX 3FKRA 4FX7A 3QZEA 5D2TA 1ALDA 2FDSA 3M5YA 3FIGA 3IVUA 3TUUA 1RVGA 1VYPX 4ZZ9A 1XBYA 3B0UX 4KFNA 1RPXA 3LTYA 5AN7A 5AC7A 2C1HA 3ABOA 2CW6A 4DO6A 5LZLA 3TCEA 5J5RA 4GNJA 4K8EA 1F7BA 1VQTA 1WYIA 2Q8ZA 1B9BA 3EX6A 2X1TA 4LVAA 3LOTA 2A6NA 4UTWC 4AMAA 5CPMA 1B3OA 5D2YA 5KINA 3EWBX 4WOZA 5CSSA 1H7PA 4HT3A 1XFBA 2C19A 3DKJA 4XZ9A 3LHUA 2ZRUA 4KKXA 1RR2A 3EWYA 4ICNA 5L6UA 3VFLA 3TU9A 1KM5A 1GYNA 3PB2A 1TPEA 4PODA 1FDYA 3ATYA 3N34A 4FX6M 1Z41A 3KRZA 2OT0A 3NO5A 1KM3A 5EYWA 3W2LA 3T40A 5HQEA 3OVQA 3UPWA 3LCXA 4IMGA 4QNWA 2R91A 6TIMA 4JIQA 5C5YA 4A2SA 1RQEA 4RZ5A 1P1XA 2YDAA 3P5YA 4JIPA 5G4EA 3HG2A 1XKYA 1LDCA 3GB6A 4ZQMA 5FF7A 3LHVA 5EPDA 4O52A 5D2VA 4RKAA 2Z0IA 4LVFA 1GJPA 1GEQA 4X2RA 1DJQA 4FNUA 3W1AA 3BG9A 1SFJA 1H7XA 4A29A 1R2RA 3KRSA 1OYBA 5KMYA 1MEIA 3W74A 1LORA 4FNQA 1YTEA 3TROA 4O17A 3LDVA 2ABAA 4O12A 3OEXA 2F7FA 4K38A 4N9CA 3L21A 3KFTA 3W84A 5KZEA 3LXBA 2HSAA 3ZS4A 1ICQA 3TR2A 4UTJA 2QCCA 3G18A 3IEBA 5I3GA 1HTIA 4YL2A 1H51A 1O5KA 3HQ1A 2E1DA 1W37A 4JR5A 4EVZA 2Y61A 4CCCA 3INPA 4JTKA 3MUXA 5C2XA 3MMTA 1I4NA 3QM3A 3GYEA 1S5VA 3PULA 2YYUA 3C0JA 1FY6A 1T8XA 1IXNA 3MHFA 4FEZA 4DELA 5CGQA 2GVLA 3DI1A 4M6VA 3LV5A 1F5ZA 1LBLA 1G4SA 2J27A 1P5BA 2VELA 2CLHA 4RR4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3W72 A;  2W0U A;  1GQK A;  3OW1 A;  4GJI A;  2WWD A;  1KTB A;  1B0I A;  3L2L A;  4D6F A;  3GXD A;  2NVC A;  3TQ0 A;  1VR6 A;  1A53 A;  3AXK A;  4NZ3 A;  4DPP A;  1JQV A;  4MAD A;  4Z2J A;  2QF8 A;  2YX0 A;  1BPL B;  5IDI A;  5C9U A;  3TQV A;  3WDI A;  1AH0 A;  1JND A;  2PLM A;  1DWA M;  3VZY A;  1RA0 A;  3QTP A;  4EF9 A;  4BZY A;  2CLK A;  3RPD A;  4O57 A;  1AD1 A;  5DRC A;  3PJX A;  4JX4 A;  1J0Y A;  3CV2 A;  3P81 A;  1EL3 A;  3WQW A;  3H70 A;  4Z2K A;  2HS8 A;  4IIE A;  5FF4 A;  2C1I A;  2NW0 A;  1BWL A;  2J74 A;  1EA9 C;  1QW8 A;  2DSU A;  3KCL A;  4DBU A;  4UMA A;  3TTS A;  3EOO A;  2ALD A;  1TA3 B;  2RDT A;  2HZG A;  1TIM A;  2NVA A;  4ATW A;  2E40 A;  4NRS A;  3S9Z A;  4IGN A;  4J2M A;  4TR9 A;  3UR8 A;  3GKA A;  1L9W A;  1MUC A;  2EG8 A;  1TMH A;  3L0K A;  3KHJ A;  1V0N A;  4RW5 A;  4LB4 A;  1FWD C;  1OAB A;  2DVT A;  5EY5 A;  3F5J A;  3TIM A;  2PDC A;  2UWF A;  1UOZ A;  4AZ7 A;  5JBF A;  4PTN A;  1L8N A;  2ZXB A;  3ARU A;  1DTN A;  3QKZ A;  4IME A;  4Z2H A;  1VJS A;  4LF1 A;  4DBS A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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