4K7YA

Oye1-w116t
Total Genus 151
50100150200250300350020406080100120140
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
151
sequence length
399
structure length
399
Chain Sequence
SFVKDFKPQALGDTNLFKPIKIGNNELLHRAVIPPLTRMRALHPGNIPNRDWAVEYYTQRAQRPGTMIITEGAFISPQAGGYDNAPGVWSEEQMVEWTKIFNAIHEKKSFVWVQLTVLGWAAFPDNLARDGLRYDSASDNVFMDAEQEAKAKKANNPQHSLTKDEIKQYIKEYVQAAKNSIAAGADGVEIHSANGYLLNQFLDPHSNTRTDEYGGSIENRARFTLEVVDALVEAIGHEKVGLRLSPYGVFNSMSGGAETGIVAQYAYVAGELEKRAKAGKRLAFVHLVEPRVTNPFLTEGEGEYEGGSNDFVYSIWKGPVIRAGNFALHPEVVREEVKDKRTLIGYGRFFISNPDLVDRLEKGLPLNKYDRDTFYQMSAHGYIDYPTYEEALKLGWDKK

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
AH9 (330-338)EMPTYTI1 (11-14)3H1 (15-17)S2 (25-27)S5 (110-116)S12 (342-345)S3 (31-32)TI2 (49-52)TI3 (82-85)TII2 (43-46)AH1 (52-61)S4 (67-74)TVIII1 (61-64)TIV7 (380-383)TII3 (63-66)3H3 (119-121)AH3 (124-130)AH4 (145-154)AH6 (197-202)TII4 (249-252)S7 (159-160)AH5 (163-183)S6 (135-136)TIV2 (138-141)TIV3 (203-206)3H4 (237-239)S8 (187-191)S10 (284-288)TI'1 (193-196)TI6 (245-248)TI4 (204-207)TII'2 (254-257)TI5 (211-214)AH7 (217-235)S9 (240-244)TI7 (255-258)TI8 (289-292)TI10 (304-307)TII6 (300-303)TVIII3 (290-293)AH10 (347-352)TI9 (294-297)TII5 (298-301)3H5 (310-314)TI12 (339-342)S11 (320-323)TI11 (326-329)TIV4 (323-326)AH11 (355-362)AH12 (388-394)TIV9 (382-385)TII7 (379-382)TI13 (395-398)TII1 (3-6)S1 (20-22)TVIII5 (373-376)AH2 (91-107)AH8 (260-278)TVIII4 (292-295)3H6 (371-373)TIV8 (381-384)3H2 (77-79)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces pastorianus
publication title X‑ray Crystallography Reveals How Subtle Changes Control the Orientation of Substrate Binding in an Alkene Reductase
doi rcsb
molecule keywords NADPH dehydrogenase 1
total genus 151
structure length 399
sequence length 399
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2013-04-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4k7yA00
2PCQA 4FNSA 4ZMGA 1RQBA 3UQNA 4AWSA 4LS2A 3MBFA 5EL1A 3W2MA 3CT7A 2TMDA 3W7HA 3HGRA 1ZJIA 3GDKA 5EPDA 4HNVA 4RR4A 3GYEA 4GRSA 4TIMA 3NPWA 5CZ0A 2P10A 4AVFA 3L66A 3U2OA 1LZOA 4TO8A 3L0GA 4DPPA 3MYOA 3M1ZA 4XTDA 2NUYA 2NXGA 4IWWA 4LOCA 1K8XA 1C9DA 3C2VA 4O1BA 4Y90A 3LI0A 3UZ5A 3DFQA 4BWLC 1H1YA 4RKAA 1XCFA 1R47A 3CEUA 2QDHA 4HSOA 4JY8A 1TV8A 4JTJA 5FEPA 1O95A 2A5HA 3R12A 2VENA 5LSMA 4A3UA 3S1XA 1TQXA 1UB3A 2DZTA 3DBPA 1YTEA 2WSYA 1VCVA 3NA8A 3W7RA 5FF3A 1BWLA 2C13A 3NQFA 1SO4A 5IBXA 4MY1A 3M6YA 1DQXA 3EB2A 4I7VA 1KTCA 4LW7A 3M44A 3NL6A 2QCCA 4NQ1A 3TQ0A 5CGQA 2V2DA 4GXMA 1NF7A 5DELA 4WX2A 2QJHA 4HNTA 2X2GA 3LCIA 1HUVA 2EHHA 5J5DA 1W56A 4FEZA 4A29A 3NM3A 3FS2A 3QM3A 3PBVA 1LLZA 1W0MA 1KA9F 3QYQA 3PUOA 4N6FA 4RCXA 3ZFHA 2EGZA 1YDVA 3QMRA 3LOTA 3S5YA 3WJSA 4N02A 1GYNA 4XKYB 4K6AA 3S6DA 3L67A 1KFEA 3VFLA 1SO3A 3JRKA 2NX9A 2CLMA 1SSDA 4FXSA 1F7BA 3LCGA 3TCEA 3TDFA 4NX0A 3A5VA 2QJIA 2VFHA 3KHJA 5F2MA 1DQWA 2GQ8A 2V0TA 4LS0A 5D2VA 4Z1CA 1HO1A 1TPFA 3B03A 3LRKA 3E49A 4MLRA 2Y70A 2ZFAA 1GG1A 6TIMA 4DPQA 1S5TA 2ZYFA 4UTJA 1VRDA 1PIIA 1KTNA 1QPQA 4ZVJA 1B4KA 1TJPA 4LTSA 3E9AA 2V5BA 1QO2A 3MI3A 4OE7A 5FEWA 2RDUA 5CSRA 3L5MA 1VLIA 4K7VA 1EUNA 3N2XA 2I9EA 1KFCA 4N9BA 4O15A 1MEIA 4LVBA 3O15A 3F4WA 5AFDA 2VELA 1N7KA 1VYRA 5G2WA 1RVGA 3N2MA 3G3MA 1MEHA 1JCYA 4O1DA 2ZTKA 5DY2A 3KVKA 1OX6A 4PEKA 4E2DA 3GNNA 4UC5A 4LRTA 4Z08A 6ALDA 1WX0A 4M6QA 3SGZA 1LCOA 2CW6A 3R8RA 5EBUA 3BPWA 3O05A 5D38A 3NQDA 1SW3A 3TAOA 1G6CA 1TO3A 4DQWA 1ZAJA 3IGXA 2DU2A 3C6CA 8TIMA 3WJWA 5DBUA 3TC6A 1UUMA 3PSVA 2UV8G 3M5XA 1W5NA 1G7UA 5CPNA 4LT9A 3GIYA 3W1AA 4FB7A 2QUVA 3WFAA 1ZAIA 3BGGA 1CX9A 1JCLA 3PBYA 1TREA 2RFGA 5A5WA 3NZRA 1W37A 5L9FA 3LCHA 4JYDA 3LHZA 5AOUA 5K4XA 3OBKA 4IMCA 1TQJA 3G1DA 1DL3A 3G1VA 5AYXA 1TCDA 5CZSA 2QCEA 1GQNA 4A2RA 2WSQA 2H90A 5F1UA 3BW3A 3IIVA 1WA3A 3RFAA 1L6WA 2NX3A 2WSRA 2ATSA 2VFFA 1FDJA 3LCXA 1YTDA 1OFPA 2CLKA 1QDSA 2X1SA 3H53A 5CZJA 2QCDA 2PRHA 3T40A 2VEMA 1VZWA 1OK6A 2QDGA 1P4CA 4HSNA 3EWXA 3NQCA 3P61A 2E77A 3HGSA 2C1HA 3QQ1A 4R33A 5AB3A 1Q6LA 1XDMA 3BG5A 2JKEA 1NEYA 3TH6A 5BMWA 2GPTA 2V30A 1C29A 1UUOA 1XBVA 4PA8A 2J88A 1SO5A 1SQ7A 3LI1A 4YCPA 4GWEA 3QW4B 5KZEA 1QAPA 2KZHA 2ZA3A 3G1XA 5K9XA 3ABOA 4UTIA 3I7QA 5K7JA 3RLUA 5C6MA 1KFJA 2OJPA 1I4NA 3LBMA 1H7PA 5BW6A 1WQ5A 3UWQA 1KFBA 1I2RA 3PBUA 3BLEA 2YFOA 3GR8A 3BW2A 3W7PA 3IVTA 4UTLA 2V2CA 2QF7A 1KTBA 2DP3A 5LHFA 3QSTA 3CIWA 3QF0A 5LNSA 4M7SA 4BI5A 1WXJA 2RH9A 4DO5A 1K8ZA 1OFQA 2Y61A 4PTNA 1SO6A 4M7TA 2FB3A 4MY9A 1IXNA 4WJEA 2Y89A 4K8HA 1EPXA 1D3GA 3ABRA 1LBMA 4GNJA 1KBJA 1FCQA 1QWGA 1HO4A 2OX1A 2QEZA 3O6DA 2XN1A 1J4EA 4JTHA 5U4NA 3LHTA 3W1UA 3TR2A 3LXAA 3W6YA 5BOOA 3EWZA 3I7SA 4FXRA 3F03K 3M5YA 3GAYA 4CQ9A 4UTWA 2B7QA 1SW7A 1OVDA 2OT1A 3OIXA 3STFA 4UFKA 2G95A 1TV5A 4IPIA 1KM2A 3W3OA 3P5YA 3WK2A 3TJXA 2I1OA 3FA5A 1PE1A 1EX5A 2JKAA 1LRNA 5D02A 1JUBA 4YCOA 5BMXA 4JTUA 3A24A 3K30A 2NXIA 2X16A 5K2ZA 3HPXA 3RLVA 3V75A 2J9XA 3GX9A 3RK8A 4QJ1A 2TPSA 2DZPA 3O07A 4P2VA 1UBSA 1QMLA 2C16A 3C61A 3M16A 3SZ8A 3SR7A 3UWYA 3FYOA 3FYPA 3W2UA 4C1LA 1FXPA 3IIPA 4MOZA 2VEPA 1WYIA 3EWUA 3G1SA 3MMTA 3NQEA 4G1KA 4RZ5A 1GPWA 1VS1A 3DFOA 3OA3A 1PL9A 1A5CA 1YYAA 5KMYA 3HGOA 4A2SA 4EWND 1O4UA 2LLEA 3W84A 5FEZA 5FF0A 1YXYA 3I6RA 2YYTA 4JIPA 3CWOX 4MZ8A 3S9YA 1O5XA 3UY7A 2P1FA 4ORIA 4JR5A 4UTUA 3DKLA 3G0SA 3WJXA 1O60A 1LORA 2VEIA 4JN6A 3M43A 2VFGA 3W2LA 2ZRVA 4JTTA 2WQPA 3NR0A 5J5RA 1W8SA 3BK0A 1FWNA 5DXXA 4I7UA 4KWVA 2DORA 4H4IA 1M7OA 1LRTA 5F2LA 4UR7A 2R91A 1WAUA 1QPNA 4DF0A 4PFMA 3LTYA 3LHUA 4UMAA 3CEPA 5F1VA 3CC1A 4OT7A 1DJNA 3Q2DA 5FF2A 2WNZA 5D32A 3W1RA 3MJYA 1TV7A 3DFSA 3PWAA 1OYBA 1XUUA 4UXDA 1T99A 1Z44A 1OYAA 2C0AA 3DFNA 4O1AA 4TMBA 1Z41A 3LX9A 4S2CA 1QR7A 3JR2A 4JY9A 4Y6GA 2FLIA 3G1HA 3CIXA 2B0MA 4AWUA 1F2JA 1KW1A 4JD4A 4NJKA 2QCMA 2YSWA 3RU6A 3CQ0A 4FIQA 2EKCA 2CWNA 1KM5A 2V8ZA 2NUXA 3W7LA 1DV7A 1X1OA 3MWAA 4BI6A 2EPHA 1H63A 3S1UA 3O1NA 3HO8A 3E96A 2ALDA 1L6SA 1P5BA 3W1PA 3C2EA 7TIMA 1WOAA 3EX6A 3ZR4A 3A21A 1VYPX 2NUWA 5HUOA 1RZMA 2NV2A 1R46A 3Q58A 3WK3A 1TIMA 1L9WA 3BARA 4X22A 2DZUA 5HULA 2QAFA 1ALDA 2E5CA 1LP6A 1B4EA 4MVAA 4XBSA 2W0UA 5GVJA 5C54A 1SW0A 1EIXA 4Z1DA 3HQ1A 3QPZA 1H7RA 3G3DA 4PL1A 4JDYA 3UPBA 3IIOA 4DF1A 4HT3A 1FCVA 3VE9A 4CQ8A 1AG1O 2YYUA 4AHQA 4DELA 3P80A 5D2XA 4MFEA 2NZLA 3W7CA 2GVGA 4RK8A 3MHUA 3IEBA 4M6VA 4IQLA 2RDWA 3QW3A 2DZWA 2A6NA 1VPXA 5LNVA 4O11A 1LOQA 3TW7A 4N4QA 2H8XA 3C56A 4PH6A 1G4TA 4OQVA 4EF8A 3P81A 2YR1A 5AHLA 4BF9A 3HF3A 4JYEA 1JRCA 1D3HA 1KM3A 2ZZ6A 1YTKA 1TTPA 3PVFA 1FDZA 4RV8A 5D2TA 3U8GA 2GVJA 1OG0A 3L0KA 5I3IA 3CHVA 2ZRYA 3UWVA 3ABSA 2FPVA 3LRMA 2VOMA 3NM1A 3FIGA 1RD5A 3OVRA 1VYSX 2W79A 2A21A 2HSAA 5LGZA 4H6KA 4Y8FA 2BXVA 2GJNA 3W76A 1W5QA 2E68A 4LVFA 3W2KA 4UTMA 1HFBA 5KINA 3DI0A 1KM1A 4X3ZA 1MSSA 1DOSA 1V7YA 3SJ3A 1J2WA 4ZL1A 4HN4A 5FI8A 3SIZA 5D03A 3UY8A 2AAMA 3GNDA 5D30A 3N9SA 3V1PA 1JUEA 2E6FA 3KVJA 3P5ZA 1G7VA 4AF0A 1VHCA 2Q8ZA 1WV2A 2J9YA 3EKLA 5AHEA 2A0NA 2CLIA 2YX0A 3L5LA 2CZ5A 2Q3RA 4P61A 1OFEA 2J24A 4WD0A 1P0NA 2YDAA 4O52A 4JX5A 5EMUA 1ZNNA 3FEMA 3W1LA 3I68A 1JJKA 4AEOA 4XWUA 2GOUA 4A22A 2B7OA 2DZXA 2VXNA 1JRBA 3N3MA 1NSJA 1DBTA 3BVJA 2E6YA 4WOQA 5D09A 2WO5A 3T55A 1GVRA 1QOPA 1SZGA 3DZ1A 3FJLA 2JKPA 4ZQCA 2HS8A 2ZZ7A 2WNNA 4AXKA 4GUGA 1U5JA 3T4CA 3TIMA 1SSGA 2OCZA 4UTKA 4E38A 1W3NA 4LVGA 1YDNA 4JYFA 4C1KA 1P0KA 3SSJA 3NQVA 4O1CA 3PG9A 2BSLA 4DF2A 1JULA 1NF0A 1TTQA 1I45A 3W2NA 3TFXA 4K36A 5HR7A 2NV1A 3HGJA 3GXPA 3TU9A 3IV3A 4GE8A 3NPUA 1QNVA 1EP3A 2A85A 1UCWA 2JGYA 2G5WA 1J5TA 3C3NA 4MKNA 3SW6A 2CZEA 1ZENA 3PSWA 1YADA 4H3DA 3F4NA 4XUGA 3QZEA 4CCCA 4MJMA 2ZA1A 1I2OA 3B0PA 1A53A 4O13A 1Q6QA 5IBXC 1A5BA 1GTHA 5AN7A 2FTPA 1EWEA 4POCA 3S8HA 3JS3A 3W74A 2WPBA 1Y0EA 1H5YA 3QPYA 2WNQA 1TPVA 3P8JA 3LM7A 2ZRWA 3VE7A 3GK0A 1GZGA 4R7JA 3MHFA 2H6RA 2ZDRA 3B4UA 3ZWTA 2JGQA 2QR6A 2J27A 3TNOA 3M9YA 1TMHA 4AHOA 3NQ6A 1JUKA 3IVUA 2NWSA 4DBEA 3P67A 4W9TA 2IQTA 4GUIA 5H2ZA 3FKKA 1SFJA 1W31A 5EYWA 5DN1A 5LNRA 1KV5A 1AMKA 1C8VA 1OF6A 1YPFA 4FX7A 3W7OA 4BI7A 3C0JA 4OV9A 3BO9A 3NQMA 2X1UA 2Y85A 3IIZA 3P8IA 1A5AA 4RZ4A 4FNTA 2ZZ1A 4LY8A 3W7MA 2AGKA 3L9CA 1S3HA 5DCEA 1VQTA 4JDBA 1R2TA 1TPB1 2QKFA 3MUXA 4CCEA 3LTSA 3AO0A 5CPOA 3UD6A 1TPDA 4OBTA 4U28A 1LBFA 1B9BA 1GWJA 1XBZA 5KITA 4UTHA 3HOJA 1OJXA 1GVQA 1W1ZA 3EWBX 3VNDA 1G67A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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