4L4LA

Structural analysis of a phosphoribosylated inhibitor in complex with human nicotinamide phosphoribosyltransferase
Total Genus 166
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
166
sequence length
481
structure length
472
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 166
structure length 472
sequence length 481
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4l4lA02
1LM1A 2GQ9A 3RK8A 1YTKA 3TJLA 3C8FA 2ZFAA 2A6NA 2A6LA 3DU0A 1JJKA 5HWMA 3P67A 4FNTA 1VCVA 4FHAA 3OVQA 5G1YA 3P81A 5DY2A 3DKJA 1CX9A 4K8HA 4NJJA 4A29A 3GDRA 4WZHA 5I3GA 3QMRA 1RR2A 2GVJA 4O57A 2CLMA 2V81A 1H7WA 3M43A 4O53A 2H6RA 1KBIA 1QPNA 2YYUA 2Y62A 1XKYA 3M5XA 1QR7A 2WQPA 2C15A 1N55A 3KFTA 4JY9A 1VYPX 2WSYA 1WBJA 4JTSA 1DQXA 2ZTJA 1LBLA 3MI2A 2PE4A 3F03K 3IEBA 1R46A 4O16A 4PA8A 2VFGA 4GE8A 2C1HA 4CQAA 1ICPA 1JUEA 4QNEA 2W79A 4M19A 2VEMA 2VFHA 1SZFA 3UWZA 3L65A 3B0UX 1NVMA 3H53A 2YSWA 3TDFA 1Q6OA 4I9AA 5FI8A 3AO0A 3C4UA 3STFA 1W31A 3W87A 1KFJA 6ALDA 2YPIA 3W1RA 1SW7A 2CZFA 1Q3NA 4CNNA 4BI7A 3LCIA 4OU1A 4FIRA 1S5VA 4KFPA 3UNDA 3NG3A 4LT9A 4ONVA 1OFBA 3TNOA 1AMKA 3LXCA 3T4CA 4JTLA 3EEGA 5KZDA 3P84A 5LHEA 2Q8LA 3W1XA 1JUKA 3W85A 1FCQA 1R2RA 4UTLA 3TA6A 3B0PA 4JXCA 3MI6A 1ME7A 3W84A 1DKWA 2LLEA 2ZRYA 3HPXA 4UR8A 1NF0A 1OF8A 1VS1A 1KA9F 1IXQA 4U4MA 2R14A 2GJNA 1QFEA 3DKLA 5LNWA 4GUFA 1IXNA 1L9WA 5G2WA 3BVJA 5I3JA 5L9FA 3PBUA 4O0KA 4XKYB 4YMZA 2PRMA 1ZHAA 3GKFA 4S2BA 3DI0A 3UPWA 1PE1A 2CLEA 3EX2A 1AL8A 1F73A 4UXDA 3WK3A 5E0KA 1SW3A 1ZFJA 5LHFA 5TIMA 4B5NA 3W76A 2GJLA 3LHVA 4PCFA 3MHGA 5CGQA 1UB3A 4MKNA 2VEIA 1MEWA 3LXAA 3L21A 1IIGA 1O5XA 3HG2A 3CWOX 1LYXA 4UMCA 2G95A 2HSAA 3S5OA 1TPC1 1W1ZA 2X30A 2Z0IA 2CW6A 5AC7A 2YYTA 3IV3A 5CPOA 5FF3A 4GUGA 2YDAA 3P5YA 1HFBA 3EX1A 1VHCA 1MEIA 3Q2DA 3HG4A 1R30A 5EA9A 3LCHA 4RV8A 3GXPA 3NQGA 1QNVA 1VLIA 3ELFA 2FB3A 5G5IA 5HMSA 4P2VA 3A22A 4QAIA 4CLMA 5K3VA 3MWAA 5HJLA 1ME9A 4LNYA 3NL3A 3W1LA 2CLHA 3GNNA 4XQ6A 1HTIA 2X1TA 4ZQRA 2H8ZA 1EUNA 3CTLA 1KM1A 2AGKA 3TQKA 3HF3A 3DFOA 3O6YX 3BLEA 4UTWA 1W5QA 4WXYA 2QCGA 2WOQA 2Y89A 5LNRA 4IUOA 4RR4A 2J27A 1FWSA 3LRKA 4JX5A 3PB2A 1W5OA 3GR7A 1TO3A 4M7SA 2E6YA 3WJXA 3EWWA 5G4WA 2B7QA 2QJIA 1SFJA 1CI1A 3R12A 4AHPA 1W8SA 2XFWA 4N9DA 1B9BA 3EX4A 1W5NA 5E1QA 1VCGA 2B7PA 3PS7A 1DL3A 1JULA 3MJYA 3TE9A 3MHFA 2WSRA 2YR1A 4MFEA 5KSWA 4MLJA 3HGRA 1UUOA 1GVSA 3LTSA 3M16A 3G0SA 3NYZA 2VEKA 3UY8A 3W1TA 1V5XA 4IQLA 3UWWA 4M7TA 3WK0A 5HWJA 3G0UA 1WQ5A 4IXXA 2Q3RA 3P8IA 3PF3A 1YYAA 1L6YA 1SZNA 3OIXA 4UFMA 4DF2A 1LP6A 4LVGA 3QYQA 4O4WA 1AL7A 1VYRA 2YX0A 5EKYA 4I7VA 2YCEA 1YDNA 2WNNA 1MZHA 3SGUA 1G67A 5G2HA 4IXHA 2VEPA 1LBFA 4NJGA 4JY8A 1C8VA 4ZQNA 4EVZA 4O54A 4TMCA 3LV6A 4CNPA 3W22A 3D0CA 1W37A 3PC0A 4D2JA 4JTKA 4L4MA 4GNJA 4UTUA 1RQBA 3TMLA 3W7NA 4HSNA 5AC8A 5IBXC 1WOBA 1KFLA 2FPVA 4RK8A 2Y88A 3G1YA 1JR1A 1VYSX 2ZRVA 2Y7FA 1H63A 2P1FA 2NX1A 1FCVA 2V2HA 5HNRA 2WO5A 2VELA 4IMCA 1K7XA 5CZ0A 3QQ0A 3UD6A 4N4QA 3W1PA 2CLFA 3HO8A 3WJWA 3N3MA 4FX7A 5IM51 1LTDA 3TW7A 1EP1A 1SQ7A 3NDOA 1OK6A 1VJIA 1DHPA 1B4KA 3GDMA 3OVRA 1KTBA 1VHNA 3KX6A 1FBAA 3W1QA 1VLWA 2J9XA 3EWUA 2ATMA 1ZNNA 3FS2A 5HR6A 1DV7A 4I7UA 1GVQA 3EXSA 5K9DA 4YCPA 3EB2A 2RHGA 1O5KA 1XBXA 5D09A 1RQEA 2YXGA 2A21A 4ZVJA 4R53A 5EMUA 2VENA 1FY6A 2NLIA 1P4CA 2A2IA 3ATZA 1QMLA 5BOOA 3DXIA 5HULA 4Q32A 3QF0A 3TUUA 2QCEA 1OX4B 2GQ8A 3KXQA 5H91A 2C0AA 3DI1A 1C9DA 1LOSA 2Z1BA 1EX5A 2DZSA 3DH7A 4WUIA 1H7PA 3NAVA 1XUZA 3GVGA 4WY0F 3L67A 5EYWA 3CIXA 3WK1A 5D2VA 4Z0JA 4IX0A 4DEFA 1QPOA 2E6AA 4LUIA 4UTTC 3NQAA 1G7VA 4O17A 1GTEA 3UXAA 3TH6A 3NPVA 4UTIA 4LS2A 3GDTA 3DAQA 3SECA 1KM4A 4ZL1A 3N9SA 1SO4A 3MP5A 1TPFA 1EB3A 3L5MA 4UNKA 3W7HA 3NQDA 2JKPA 1G7UA 4WJEA 4M6QA 3W7GA 5C5YA 4TU1A 3OVPA 1FCBA 2A0NA 3U8GA 1AW2A 1A5AA 4RJEA 3SIZA 4ICNA 5DLCA 4CCEA 3OEXA 1IXOA 4TX9A 1OG0A 3W7PA 4FNRA 2H3DA 1TPEA 3R13A 5F4SA 1ZAIA 3F1QA 2W0UA 3P61A 4FXRA 1D9EA 4JS3A 2ZZ4A 1F76A 1NF7A 1ICQA 1S5WA 2B7OA 4UTKA 4E2BA 3GXNA 3C2FA 5FF0A 1Z41A 4AWUA 4TMBA 3W7DA 2ABAA 4FNSA 2YFOA 3HPZA 4UR7A 4BF9A 4Y90A 3W7IA 5I3FA 4ZQPA 3TFCA 3N9RA 3QW3A 3O8AA 5FEZA 4MYAA 2ZRUA 1Q6QA 1WAUA 5KZMA 1FWTA 2OT0A 4FEZA 4HIBA 4N2YA 3T40A 4Q4KA 3BPWA 3KRZA 1XC4A 3TU9A 2JGYA 1SO5A 3NQFA 4O11A 2BLEA 4IGHA 4JEQA 3NQ2A 1DJQA 1YTDA 1P0NA 3M41A 1IGSA 3W6YA 1FDJA 4E0CA 1XUUA 3S5ZA 3HOJA 2QAFA 3O6DA 2A7PA 2TRSA 2V30A 2ZA3A 1JCLA 3W2UA 1ZENA 3WJSA 1XBVA 4XBSA 2DZTA 1S3HA 1XL9A 4Z1BA 2HMCA 1TSIA 3CHVA 4O15A 2V8ZA 3CWNA 4OGZA 1RVGA 3LHTA 4NJKA 4NNAA 3S5NA 4LS1A 2V5LA 3NQEA 1VRDA 4K7YA 3GLCA 1I2NA 4NNCA 5D2YA 4Y9AA 2ZA2A 4LV9A 1S5TA 3L66A 4H3DA 4HN4A 2CLIA 3IGXA 3H55A 4JTJA 1JQVA 1TPWA 2EHHA 3NQ8A 1YADA 4DO5A 1Y0EA 3BG5A 4EF8A 3LX9A 3G1HA 4PH6A 2A5HA 1X1OA 4KWVA 1QPRA 1LZOA 4MPQA 1E51A 4GJ1A 3W70A 4X3ZA 3W83A 3C3NA 2DZXA 3JR2A 3F4WA 4LY8A 2HTMA 2VFDA 1TPB1 1J2WA 2QCDB 3B8DA 4Q33A 4NX0A 3W2MA 5FF7A 1GYLA 1TQXA 2PCQA 4GUHA 1TB3A 1TYGA 1XBYA 3HBLA 3QM3A 2W6RA 1TTQA 2BX7A 2NZLA 3MP4A 1FWNA 3UYCA 1HUVA 3W71A 1KM3A 3TX9A 4AEOA 3W75A 1W3IA 3GX9A 3B4UA 1QWGA 3L0GA 3L5AA 4NQ1A 3S6DA 3R5EA 4FNQA 3EXRA 2Y85A 2BSLA 1ZCOA 1JCYA 2E5DA 2V2DA 4U28A 3ZR4A 2TMDA 2CZDA 1ML1A 3OHIA 3LCGA 5D03A 3PBVA 3STCA 4RX0A 3P60A 3N73A 5MHBA 2QDGA 3T78A 1OVDA 3GDLA 5TBOA 4JTFA 3W7LA 4DQWA 1RZMA 2Y6ZA 2RH9A 1PS9A 4UIOA 5D38A 4UFLA 1X8FA 3QEZA 5A8GA 1WXJA 3NPUA 3QMSA 4BWLC 4LRSA 2TPSA 1EP3A 2A85A 3GNDA 2C18A 1XXXA 3U2OA 1QOPA 1EWDA 4BFAA 3VE7A 2R94A 1HO1A 2NXGA 3TKFA 1TCDA 4UTHA 3PUDA 3BGGA 1Z44A 1H1YA 1GTHA 1X1ZA 2C19A 3S1UA 4O52A 5F4WA 1FDYA 4WY0B 3I7QA 4UUIA 3ANYA 1UBSA 1GG1A 4PODA 1KW1A 3UY7A 4GXMA 1N7KA 2XN0A 5KINA 4FX6M 1Q6RA 1TV5A 2EAWA 1AG1O 5AOUA 4DELA 4EWND 4LVAA 4BK9A 3LHZA 4MJMA 3LCXA 4EIVA 1R47A 2ZTKA 5F4XA 4J9JA 5D2TA 1GWJA 3PR2A 3S1VA 3UZ5A 1W5PA 2ZCGA 1FDZA 3E9AA 1SZEA 3BG3A 2BXVA 5K9XA 4JYFA 4YXGA 2OX1A 1R2TA 5AFDA 4K36A 2C3ZA 3OA3A 4ORIA 1W56A 3Q37A 4P61A 3A5FA 1O60A 4NT0A 4ZQCA 2DJLA 1SU5A 1OFPA 2V82A 1LROA 3EKZA 3LV5A 3GIYA 2AQWA 2B4GA 2OZ0A 5F2LA 4LWWA 1Z42A 5I3HA 3RLUA 1QO5A 5KITA 1ONRA 3ZFHA 1G6CA 3ATYA 4AF0A 1OFOA 2NX3A 2PRHA 1TTPA 2PC4A 2O7SA 5J5DA 3IRDA 1EPXA 1YTEA 2GVGA 1JRCA 1TV7A 3N2MA 2ZZ2A 3TC7A 3EWBX 3SR7A 1LCOA 4R33A 1PCWA 1K8ZA 3CEPA 1TQJA 1OHLA 2Y7DA 4EOUA 1XFBA 1OFEA 3W9ZA 3VNDA 3R2GA 5CZTA 4LVFA 1UCWA 2Z6IA 1AW1A 3ZWSA 1KLYA 3V75A 3I7SA 1PV8A 3LCWA 3NEVA 3P74A 1GG0A 4Y96A 3FOKA 2GPTA 4AWTA 2J24A 4AHQA 3ABOA 4RZ6A 2E6FA 5DXYA 3NL6A 5AYXA 1SPQA 4XTDA 3GKAA 3UZJA 3PWAA 4O1DA 3RFAA 4CCCA 3P8JA 1KFBA 3KVLA 3LHWA 3WK2A 3MO7A 4A22A 2X1RA 4RZ5A 2Q8ZA 4GBUA 4QNWA 1KFCA 2H8XA 2JGQA 4FNUA 3BO9A 3O07A 3G1VA 3FFSA 4ML9A 2VFIA 5FF2A 4YL2A 1HG3A 3L5LA 1W54A 5IBXA 2RFGA 2QEZA 3M5VA 2NUYA 2WNQA 3FJLA 2DZPA 2ZQ0A 5CG7A 3KVMA 3FEMA 3G1AA 3T55A 3NPWA 1H51A 3W2JA 4FB7A 5FESA 3CEUA 3EKLA 3B05A 3IVUA 4MY1A 2VKZG 3B03A 4ADTA 3ABRA 1H7NA 2E6DA 4GRSA 3W7EA 5BW6A 3IVSA 3P62A 3RU6A 3NQCA 4S2CA 3C2EA 3G24A 4NX5A 2RDTA 3G8EA 4O50A 4WOZA 1XBZA 5D04C 1FXQA 3P7YA 3KRUA 3FKKA 3LRMA 4LTSA 1EA0A 5CKSA 4TR9A 4Z08A 5F2GA 1GVFA 3TR2A 1D3GA 4OV4A 4JR5A 2I14A 1BEUA 1OJXA 4YCOA 3NZ1A 3PB0A 3LI0A 3CPRA 1I2QA 2P0OA 1J5TA 2QCFA 3NGJA 5D05A 2I9EA 2NX9A 3TJXA 4NZFA 4PL2A 2VXNA 3DENA 5K9CA 4UMAA 4NXKA 1JRBA 3NM1A 1I8JA 4JD4A 3GDKA 1TV8A 2QDHA 5GVJA 2QUTA 1NSJA 1B57A 3NM3A 4JX6A 4K7VA 3G22A 1P5BA 4RCXA 3W73A 4WQ6A 3PG8A 4AHOA 4LS0A 2E68A 4UTTA 3LB0A 1L6SA 1T99A 3LLFA 4IJBA 1BWKA 4JYEA 4XKYA 4ZMGA 2V0TA 4OHQA 2CFFA 4A2SA 3W2NA 5AYYA 2ZA1A 3S1XA 1JCNA 3OG3A 1JVNA 4ADSA 3MYPA 1OX5A 1LLWA 2PURA 1GT8A 2QJHA 3LI1A 3FKRA 2GUUA 3JS3A 3NQ6A 1HO4A 4N6EA 3O06A 4O14A 3HG3A 1SFLA 2DZWA 2DZVA 1B3OA 1GJPA 3O05A 2ALDA 3JRKA 5AHFA 4MZYA 3P82A 5U7SA 3ZS4A 1GEQA 1QAPA 1SO3A 3LERA 1LLZA 1L6WA 5I3IA 3THAA 5C6MA 4M6VA 1JCJA 5CZSA 1J4EA 4CQ9A 1P0KA 1JQXA 3E02A 1FQ0A 2HS6A 3PAJA 2ZDRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3U9I A;  3PNZ A;  2F6K A;  3TJL A;  4J3V A;  3P67 A;  4FNT A;  1VCV A;  5AZ0 A;  3PFM A;  2GSE A;  2PLM A;  3GDR A;  3F5K A;  3RO6 A;  4DHG A;  2GVJ A;  2GGE A;  2CLM A;  4B5S A;  4CUC A;  2AL2 A;  3G1R A;  2H6R A;  7A3H A;  1KBI A;  4C65 A;  1FFR A;  1JIB A;  2FDM A;  4DZH A;  3KFT A;  3P3B A;  1EZ2 A;  1UUQ A;  3H12 A;  3MI2 A;  3V35 A;  5IOB A;  4FMV A;  2OWC A;  4Q3M A;  1M65 A;  1JZ2 A;  1ICP A;  1JUE A;  3GFZ A;  3BUR A;  5FL0 A;  2VFH A;  4CQB A;  4UTF A;  1W32 A;  5C0Q A;  2ZUN A;  4AZG A;  3B0U X;  4HA3 A;  4G9P A;  1Q6O A;  3H2E A;  4I9A A;  4JKM A;  1UD5 A;  4IP4 A;  1KFJ A;  3VKB A;  3PFR A;  2YPI A;  3AMK A;  3JZU A;  3BAN A;  3KM8 A;  3VM7 A;  1OFB A;  2Y8V A;  1AMK A;  1QNS A;  3EEG A;  3EDF A;  1A0D A;  1TCM A;  1NWT A;  4H9V A;  1FCQ A;  4UTL A;  3TA6 A;  1NU5 A;  1DKW A;  4UR8 A;  2GZX A;  3TYU A;  1VS1 A;  1KA9 F;  2SFP A;  1AD4 A;  4H2C A;  4GUF A;  3SCN A;  3PN8 A;  3CZE A;  3T0D A;  2Y8K A;  7CGT A;  2HNH A;  3WF2 A;  3CAQ A;  2YA0 A;  4YMZ A;  1ZHA A;  1QAS A;  1PE1 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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