4L4MA

Structural analysis of a phosphoribosylated inhibitor in complex with human nicotinamide phosphoribosyltransferase
Total Genus 164
50100150200250300350400450020406080100120140160
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
164
sequence length
480
structure length
471
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE
50100150200250300350400450400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 164
structure length 471
sequence length 480
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-06-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4l4mA02
4LC6A 3G1XA 1PS9A 5K3VA 1KTNA 3IEBA 3L66A 3MYOA 1R46A 2ZFAA 4AMAA 4IOTA 3O1NA 1IGSA 1C29A 4WY0B 1KM0A 1DQWA 3W7HA 4OBTA 1QAPA 1FWSA 1L6WA 1Z42A 2WPBA 3NM1A 4FNPA 3Q58A 4NZFA 3KVLA 3UWWA 4MYXA 3BW4A 1H50A 1CX9A 1BTMA 5CGQA 4M5PA 2YFOA 3G18A 1A53A 3DFQA 1DORA 3PS7A 2BLEA 3NPUA 4NX0A 3RLUA 3LCIA 3W75A 5C2XA 1JCXA 4C1KA 3LRKA 4ZMGA 3NOEA 2JGQA 3P7YA 3INPA 3PF3A 4MJZA 2GVJA 1EWEA 1WQ5A 4AVFA 1LOLA 4MVAA 4WZHA 4FX7A 3FS2A 4MKNA 1Y0EA 3STGA 1JRBA 1M5WA 1VCFA 2YPIA 2GUUA 4A2RA 1KM3A 1ZNNA 3QJAA 2Y7EA 1AW5A 2YDAA 3W1XA 1O5KA 4RX0A 4CQ9A 5AB3A 3NL5A 1FXQA 2DZTA 3FKKA 3BO9A 1RR2A 1JCMP 1S5TA 1NFBA 2Y62A 4LW7A 4BK9A 1KFCA 4N9BA 1EWDA 4K37A 2V8ZA 2GQ8A 2VC6A 1YTKA 4N4PA 4WXYA 4A22A 3ZFHA 5F2GA 2E09A 2R91A 2RDUA 4KFOA 3M16A 4IXHA 3NEVA 1W3NA 3ELFA 4LVBA 1XBXA 2Q3OA 1TB3A 1TPVA 3BARA 1H7RA 4BFAA 1YPIA 2EF9A 1HUVA 4JYEA 1KV5A 2J88A 3L65A 3LXBA 3TSDA 1OJXA 4PL1A 2Y7FA 4M6PA 4QIUA 2P0OA 4O4WA 1T99A 1G4PA 5U7SA 1ZAJA 2ZTJA 1TPWA 1W31A 3DKJA 3O16A 2Y6ZA 1PVNA 3HG2A 4ORIA 2HS6A 3O15A 3TMLA 3BW3A 4MYAA 3S1VA 3NZ1A 1BWKA 1FWRA 1VH7A 4UC5A 4QISA 3MHFA 3QPZA 4GXMA 5C55A 4NUWA 2YFNA 3GKFA 4GE8A 3PULA 1FDYA 4E38A 2FPTA 1H61A 3UZJA 5KINA 2C3ZA 5LKYA 3SGUA 5I3FA 3TNOA 2B7PA 2KZHA 1FXPA 3C2VA 5EYWA 2NX1A 4AEOA 3WFAA 3KX6A 5D38A 1YDVA 4AAJA 2WOQA 1ME8A 3G1FA 1RQEA 4HNNA 1LZOA 1JULA 5GVJA 3WK3A 3GIYA 3WK0A 3NR0A 4I7VA 4JYFA 2GQ9A 2ZA3A 3W7RA 1WAUA 2H90A 3NQ2A 3E96A 4MLRA 4MFDA 4GUGA 1N8FA 4XTDA 5D32A 3W1MA 3MP4A 4A3UA 3NQ8A 3F1QA 2CZDA 2B0MA 2Y7DA 4LNYA 2RDTA 1JCLA 3NPWA 3W1LA 4K8EA 4LS2A 1GJPA 2CLFA 1JCNA 1HG3A 1I2NA 4TR9A 2PRHA 1EP1A 1W56A 1KM4A 3P60A 4Y6GA 4ICNA 3EXSA 1XUZA 3CQ0A 3CWNA 5DCDA 1OX6A 3LXAA 3S5OA 4U28A 1TPB1 2QUTA 1M6JA 3OVQA 2H3BA 3S5NA 1TREA 4LOCA 2QAFA 5AC7A 1OF8A 5CG7A 4WOZA 2PRLA 2E5DA 1OFPA 2ZDRA 1J2WA 1M7OA 1EIXA 1MO0A 2NX9A 1K8ZA 1O5XA 1NVMA 1XXXA 5IM51 2RH9A 2WNZA 5CPOA 3M1ZA 1KLYA 5D2WA 2J9XA 1KBIA 2E68A 3SSJA 2A0NA 3RNDA 1LTDA 1XDMA 1LOSA 3BK0A 3HG5A 8TIMA 1VHCA 3LCGA 2CLOA 1Q6LA 3VFLA 5LHEA 3UYCA 4NX5A 3G22A 4JIPA 2F7FA 3QF0A 4NNAA 2VEMA 2QR6A 3GDKA 5FEWA 1VLIA 1K3UA 3DFSA 3DI0A 1LRQA 1RZMA 2I14A 1K03A 2AAMA 3MBFA 3MP3A 3SZ8A 4M6QA 3RU6A 3KOFA 2PC4A 2CWNA 3W76A 3PY2A 3UD6A 4DO4A 3MI2A 1R47A 1HL2A 4GJ1A 4K38A 1GG1A 4PL2A 3I65A 1HO4A 2EPHA 3FOKA 3C8FA 4HPJA 5FF0A 3C56A 4NNCA 3W1TA 3SFKA 5DXXA 2B7QA 4AWTA 4BI5A 4UUIA 5J5RA 2DZSA 4WQ6A 1H7NA 1VPXA 3QZEA 2Z1BA 5I3GA 3N2XA 4NJIA 4LWWA 3V75A 5C54A 3NQ6A 2BTMA 4CNNA 3W1PA 3PSWA 1RD5A 1XBZA 3WJXA 4IUOA 3C61A 4LUJA 4KKXA 5FF7A 4JYDA 3HJZA 5I3JA 5EBUA 1LM1A 3PBWA 3MP5A 2HTMA 3NQGA 4JXCA 2FTPA 2WSYA 3DFOA 3W1UA 3GKAA 3I6RA 4WJEA 1YDNA 3NQDA 3M47A 1OYAA 3CM4A 1VYPX 5H91A 5F1VA 5HULA 4N4QA 3M5XA 3TKFA 1LRNA 4FHAA 2E1DA 2A2IA 5F4WA 1I2RA 5L6UA 3S1UA 5G2HA 2ZZ3A 3PBUA 1JCYA 1FQ0A 4KFPA 2P10A 4I7WA 5E1QA 4HNVA 4PEKA 3UWVA 4JD4A 2Q3RA 2X1UA 1G4EA 5HINA 3LGEA 7TIMA 5FF2A 2A4AA 1GVOA 4MY9A 3GAYA 2HS8A 4AHOA 4IJBA 1ZHAA 1FWNA 4GUJA 4JTGA 2J9YA 3W9ZA 5LNRA 5EKYA 1YXCA 3AJXA 3G3MA 3GXTA 3CEPA 3N2MA 2CW6A 2VEIA 3V1PA 1TQXA 4K36A 1UB3A 3NQMA 4PC8A 2DJXA 4UTHA 3W2MA 4WY0F 3W7GA 1GYNA 4MOZA 1LBLA 4LT9A 2E5CA 1OX5A 2NWSA 3M43A 1LLZA 3W7PA 4O52A 3BPWA 1SSDA 3W87A 1I4NA 3EXRA 3DHFA 3U8GA 3OVPA 4CQ8A 2V0TA 3W7OA 3HQ1A 4UTUA 4IMEA 4O28A 1VGAA 2XN2A 5K7JA 4IWWA 2VEPA 1TRDA 2OJPA 1QPQA 1L6YA 1T96A 2I1OA 3HGSA 2Y7GA 5FEZA 1AG1O 1S5WA 3VNDA 3H55A 3W70A 2OX1A 1R2TA 3TQKA 1SZNA 3LTPA 2TMDA 3M5ZA 4H4IA 2ABAA 3T40A 2ZZ7A 1O94A 2Y89A 2R14A 1OFRA 3R13A 1H1YA 2G97A 5LNWA 3P5YA 1W5OA 1TTPA 5AHEA 3IVSA 1Q45A 3TQ0A 4DEFA 3TQVA 2QCDA 1T8XA 3THQA 2Y85A 4AHPA 4O12A 3A21A 2DORA 4DO6A 3PWAA 2JKEA 4Z1DA 4GUIA 1JQXA 3C2RA 1F6PA 4ZQRA 3GDTA 2PURA 5IBXC 1FX6A 1UASA 1RV8A 3QH2A 2Y70A 3W7KA 3M5VA 4WOQA 3SIZA 1GQNA 3R8RA 3MMTA 3LTSA 2V30A 3O6CA 3A24A 3P8JA 3QQ0A 2QUUA 4AF0A 1I2OA 5KTLA 3HO8A 1XKYA 4J9JA 4JICA 3SR7A 3UWZA 3GDLA 6TIMA 2CU0A 1H7XA 5D33A 5AYXA 1H51A 4FNRA 3ATYA 4IPIA 1A5SA 1F76A 3O8AA 1HTIA 3B0PA 5KSWA 1H63A 4ADSA 3M44A 2YYTA 1YXYA 2RKXA 1AL7A 5DELA 3VE9A 2VFDA 5AYZA 3Q94A 5I3IA 4NJJA 3C6CA 4CCEA 1ZALA 1SQ7A 3LHZA 1MZHA 4L4MA 1SSGA 2Y61A 3B03A 3W83A 1P4CA 1WBHA 1B57A 1V5XA 3MBDA 4O1BA 4BF9A 1GVQA 4JN6A 3CEUA 3WK2A 2CLLA 3DZ1A 1OFOA 4WXZA 4I9AA 3S6DA 1MXSA 4NXKA 4TMCA 3GYEA 4Y8FA 3TU9A 1Z48A 4MZ1A 3DI1A 4TIMA 3M41A 3CTLA 3DXIA 1TPUA 3PBYA 3EX2A 1Z41A 5AHMA 3FYOA 5HQEA 4P2VA 4RZ5A 3PM6A 4LUIA 1QOQA 2QCNA 3P74A 4UTJA 4NQ1A 1I8JA 2NLIA 4UTTC 1K7EA 4FX8A 3B4UA 2J6XA 1PCWA 1RPXA 3DFPA 4XKYA 5F1UA 1XFBA 3LBCA 1P0KA 5KZEA 3W23A 1KTBA 2P1FA 4JY9A 3W7JA 4L4LA 1GOXA 5F2IA 3VI2A 1SZGA 4TU1A 1DOSA 2WKJA 1L2UA 3W1RA 2V5BA 3S0CA 5HWJA 1DJQA 3G1SA 3NM3A 3KAOA 4ML9A 4UNLA 1GVFA 3LXCA 5F4SA 3HGRA 1GYLA 3L21A 4GWEA 4R7JA 2A6NA 2A5HA 3CIWA 3C0JA 4FIRA 3DHDA 2V5LA 2ZCGA 1B3OA 4YLWA 1KFLA 2X2GA 2C1HA 3N14A 1MEWA 3NVTA 4QAIA 2XN1A 5K4XA 1BWLA 4ADUA 4LV4A 2ZZ6A 3KHJA 3H54A 1K7XA 4LVAA 2RDWA 5DN1A 2WNNA 5L9FA 3JRKA 4H3DA 2H8ZA 1EP2A 2QCGA 2G5WA 3TSBA 4NNBA 3CLMA 1W0MA 3PUEA 5D03A 3UNDA 4CLMA 4UNKA 2QUVA 3LBMA 1OK4A 4FXSA 4ZZ9A 4PTNA 3NQCA 1D3GA 2QCMA 2G96A 5LNVA 4DPQA 1OYCA 3TXVA 2I9EA 3W71A 2BSLA 3OIXA 5E0KA 5AHFA 4HPXA 3DKLA 1ZAHA 4JTTA 4MLJA 4KFNA 3DGRA 3BW2A 5ABTA 1X6UA 2QCLA 3ZWSA 2ALDA 5A5WA 3JR2A 4YWIA 3LLFA 3SW6A 3C3NA 3CWOX 2QCFA 2Y63A 4JEQA 1TRIA 1ME7A 5CZJA 3I7RA 1KFBA 3M9YA 4X22A 2GPTA 1KBJA 4O16A 4XBSA 1GVSA 2D73A 3P82A 3NQ7A 1N55A 4YCPA 2V82A 1LP6A 3W7LA 4RZ6A 4UTWC 2WQPA 1ICQA 4JTFA 2OMAA 5IBXA 1BKSA 3QC3A 5K9DA 1QDSA 3GNDA 1D3HA 5FI8A 3VCRA 2E6AA 4K7VA 4JTLA 4M6VA 3L5LA 4ZQNA 4C1LA 2WV8A 1BEUA 1JUBA 2FB2A 3L2IA 4FX6M 5KITA 1H62A 1Q6QA 5EPDA 5CKSA 4HNUA 1WV2A 2JBMA 1AK5A 2HMCA 5G2IA 1A50A 2TRSA 4FEZA 4IGHA 3NL2A 2A85A 3OHIA 1ZCOA 1FCBA 4I7UA 1E51A 1IXOA 1DQXA 3HIJA 1QPNA 5E93A 1V7YA 3GLCA 4H6KA 4ADTA 1XDLA 5AC6A 1TPEA 1TYGA 2CZEA 3EWZA 2ZRYA 1L9WA 4UFIA 1A5CA 3FFSA 3P81A 2FIQA 3NL6A 3IIZA 5HUPA 2OT1A 4UTMA 4RV8A 4UFHA 3TJLA 4JS3A 3S1WA 3MI6A 1UUMA 1VZWA 3A23A 1OF6A 3HG4A 1KTCA 3LCLA 4GUHA 1TPDA 3W86A 2ZYFA 4HKPA 1W5PA 2DZVA 3GR8A 1IXQA 2ZZ5A 4QM1A 2CLHA 2JKPA 2BZNA 4OT7A 4UMBA 3IIOA 3GDRA 3BGGA 1OYBA 1KLZA 3E02A 4HSOA 4O1CA 2IQTA 3LRMA 4CNPA 2AQWA 3THAA 4EIVA 2NV1A 3LRLA 3S5YA 3BG3A 2EHHA 3NNTA 3FA5A 1IF2A 3WJWA 2W0UA 4FNTA 2C6QA 5D2XA 4BR1A 4OGZA 3QMTA 2ZBTA 4UTTA 1SW0A 5K2ZA 3TC7A 3TMQA 2E6YA 2QJHA 1XCFA 4MZYA 3KFTA 4YL2A 1L6SA 3IGXA 3L0NA 5CSSA 1OFAA 4FF7A 3CT7A 3I68A 5F2MA 2C16A 5KZDA 5DCEA 3QSRA 4RJEA 3GDMA 4JTKA 3BG5A 5F4XA 1R2SA 4R33A 2NZLA 3G1YA 4O18A 1B9BA 2OZ0A 3UXAA 2YXGA 3ABOA 1C8VA 1TQJA 1NAL1 1AMKA 3LB0A 4MPQA 3NQEA 4IX2A 2NX3A 3NGJA 5HWMA 3W7MA 2YW3A 1YADA 1THFD 3S42A 4RXFA 3R89A 4OV9A 3NXFA 1TJRA 4RZ4A 5D2VA 4M7SA 1K8XA 2J27A 1TPH1 1W5NA 3R5EA 1GTHA 3OEXA 2CZ5A 2C19A 3LCHA 3AO0A 1SO5A 1Z44A 3NQAA 3IV3A 4O1AA 4WX2A 3HF3A 4IXXA 3LV6A 1NF7A 2NUYA 3QSTA 3QRHA 3I7SA 2ZA1A 5DBUA 3W6YA 1ZJIA 5BW6A 1B4EA 2A7PA 5TIMA 4N9EA 1GWJA 2ZRVA 5BOOA 2QKFA 2VFEA 3ZR4A 1SFJA 3B0VC 5AC8A 1K7FA 5G5IA 4E2BA 1TJPA 1G4SA 2WJZA 3GAKA 2Q8ZA 4O15A 4LVFA 4DBDA 4JTUA 1P5BA 3P67A 1Q3NA 2NUWA 3U2OA 4FNSA 4EWND 4ZQMA 2C15A 1YTDA 4FNQA 3S9YA 4K6AA 1S5VA 4BWLC 5DBTA 3HBLA 3GNNA 1TTQA 3W07A 1KM2A 5G1YA 1D9EA 3EX6A 2XN0A 4XUGA 3FIGA 3TXZA 4M19A 2QCHA 4WD0A 4N9CA 4AWUA 3ZS4A 2ATSA 2J24A 1F6KA 1FWTA 3G1DA 3LHUA 1IIHA 3QW4B 4CNOA 2O7SA 1LLWA 2F84A 2YR1A 3N3MA 5KMYA 4JTHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VFS A;  1W9B M;  3G1X A;  4UBP C;  3B9N A;  3OOD A;  3IEB A;  3MYO A;  2ZFA A;  1NDW A;  3TZN A;  1Y7V A;  3NZP A;  1DQW A;  1D7K A;  4IZG A;  2ZWY A;  1Z42 A;  2WPB A;  1NWT A;  3VIJ A;  2DSV A;  1M65 A;  1ECE A;  5CGQ A;  1R86 A;  4HA1 A;  2PLM A;  4OZO A;  3OHM B;  3NPU A;  4NX0 A;  4NAE A;  3RLU A;  5DX7 A;  1E1F A;  3S2M A;  4HZM A;  4MJZ A;  1EWE A;  1EJW C;  4FX7 A;  3WD3 A;  4EPE C;  4MKN A;  4ZCW A;  4V33 A;  3LPO A;  4HU0 A;  3LPF A;  3AXI A;  4YN5 A;  2PMQ A;  1M5W A;  1ZNN A;  1AW5 A;  4DXK A;  4ATW A;  4AX6 A;  4GI8 A;  3NL5 A;  3AZT A;  2YKK A;  4J5N A;  1NFB A;  4J40 A;  2Y62 A;  1GQJ A;  3T09 A;  1MZR A;  3FST A;  1BF2 A;  4K37 A;  3WG6 A;  4FLO A;  1YTK A;  4N4P A;  3UZX A;  4WXY A;  4A22 A;  5F2G A;  1A3H A;  1W2P A;  3NEV A;  2C1I A;  4LVB A;  4HU4 A;  3RIK A;  4J27 A;  4ZEN A;  2EF9 A;  1QI0 A;  4IIB A;  3L65 A;  3SCU A;  1EJT C;  4DM2 A;  4M6P A;  4BA0 A;  4KWU A;  2ZX9 A;  3BGA A;  1TPW A;  1PVN A;  4PCT A;  3HG2 A;  2VL4 A;  2HS6 A;  3KBM A;  1XIG A;  3N4E A;  3WDP P; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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