4L4M | Genus

Total Genus 164

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	164
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	164
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-06-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4l4mA02

3MP4A 3O8AA 3WK3A 1WOAA 1RV8A 1K7FA 1QWGA 1XBZA 2QUVA 3BARA 4PA8A 4FXSA 3EX3A 3IIPA 2ZRXA 5LNSA 3W1UA 3T55A 3M6YA 5DBUA 2AQWA 3UXDA 3QM3A 3W1XA 1XUZA 4EF9A 2A85A 5G2HA 4LTSA 5J5DA 2X16A 3W73A 3W7IA 2R14A 4Z1DA 5KTLA 2GVJA 1RD5A 3BPWA 5CZTA 1W54A 1A5BA 1WBJA 4O4WA 5FEPA 4LS1A 1TV5A 3P82A 4MYAA 3LRMA 4JY9A 1RPXA 1TSIA 4LS0A 3PS7A 3PUOA 2P1FA 3HPXA 2O7SA 3UYCA 3LHVA 4UMCA 3HGJA 5HINA 4IMGA 4K8HA 1YPFA 4UNKA 1TTJA 1BWLA 3PULA 3IIVA 1EWDA 5E0KA 4XBKA 3N3MA 1TJPA 3NM3A 2CLHA 4KFOA 2DZXA 3G8RA 3W2MA 4N4QA 4AB4A 4ZL1A 4ICNA 3MHFA 3MHUA 3SZ8A 2YW4A 5AC7A 5K3VA 3TIMA 5D2YA 1ZNNA 4O1BA 3VNDA 1W3TA 3NQGA 3LCLA 3N2MA 2QUTA 1PCKA 5EL1A 3GK0A 3O15A 4AAJA 3ABQA 3F03K 2X1TA 3H54A 3RLVA 5G4WA 4NJGA 4Y96A 4KWVA 1LM1A 3DFQA 3MHGA 1RZMA 3M5ZA 1O4UA 2I1OA 1KTNA 3TA6A 4IPJA 3TQVA 3EX2A 5G4EA 1KM3A 4M6PA 4N4PA 5CSRA 4PTNA 5I3HA 1VHNA 4AHPA 3S6DA 4ZQOA 3W7QA 4K36A 4HNNA 3CIWA 3P61A 5SWUA 1NFBA 3G0XA 3G1VA 3M7WA 1QFEA 4NX5A 2Q3OA 1WXJA 4Q32A 3BW3A 3KHJA 3G1XA 1VR6A 4PL1A 2ZQ0A 3E96A 5G2IA 4IX2A 4LNYA 5CPNA 1UJPA 3UPBA 1SO5A 5GVJA 5LKYA 1KM5A 1ICQA 5FEXA 3SI9A 5A8GA 3L67A 4IMFA 3RK8A 4DBDA 1K3UA 3IGSA 1YLVA 3CPRA 3N2XA 1AMKA 4LWWA 1OK6A 1T96A 1SFJA 5CG7A 3ZWSA 3GDTA 2V2CA 1VC4A 1G7UA 4JEQA 4DO5A 1EP2A 2ISVA 2J9XA 3OBKA 2XFWA 2EKCA 5CZJA 5FF4A 2FJKA 2H8ZA 2VEKA 3P8IA 1I2OA 4M6VA 4DF1A 3W7HA 2C1HA 1GQNA 3ZFHA 2YDAA 4JR5A 3NQCA 4LVBA 5LHFA 1M6JA 1OX5A 3LGEA 1JULA 4O8RA 4O50A 3BG3A 3THQA 3YPIA 1YPIA 3W7NA 1WAUA 1KV8A 3STEA 3R2GA 4E0CA 1BTMA 1FXQA 1WV2A 1VCGA 3DFSA 2VFEA 3TAKA 2F7FA 4FX7A 3ZS4A 2TRSA 4LC8A 3UNDA 1O95A 3TX9A 4O0ZA 1XFBA 2CW6A 1H50A 2Q3RA 3HGRA 5DXYA 3R12A 1EB3A 2B7OA 2B7PA 4UFLA 1S5VA 4P2VA 1KLYA 2QCCA 1TQXA 3TSDA 2WOQA 5FEWA 3K30A 1QPRA 3PBUA 1XI3A 3NL2A 3GXTA 3LLDA 4OV9A 4DXVA 3VE7A 3S42A 2VFHA 4HT3A 4BF9A 4O28A 3LERA 3PF3A 4PODA 3GNDA 1OABA 1LOLA 4EF8A 4QNEA 1B4KA 3MYOA 4HSNA 2J88A 5CKSA 4IOTA 4FNPA 4S2CA 1OYAA 1VQTA 4IQLA 3P62A 2JGQA 2VKZG 3S1UA 3LXBA 4O1AA 3NZ1A 1QAPA 1C9DA 2OMAA 1QDSA 3O6DA 2DZSA 3LHZA 2FPTA 3M5YA 2ZZ4A 1KV5A 1VJIA 4QJ1A 2X1UA 4MY8A 1WBHA 3SJ3A 3G3DA 1H1ZA 3O07A 4EIVA 3T7VA 1KFKA 4QSHA 3KRZA 5AB3A 3QJAA 4OHQA 3WK1A 3KXQA 1I2NA 3W72A 1H62A 2PCQA 4BI5A 3WK2A 1LBLA 4S2BA 4H6KA 4RLIA 4FIQA 1LLZA 3VCRA 2C13A 4E2DA 4A29A 4JIPA 2E77A 1H7XA 5CSSA 1N7KA 4GUGA 3W7GA 3RU6A 3NVTA 4Y8FA 4N6FA 1EP1A 3GXNA 3DXIA 3NO5A 2NWSA 2LLEA 4O4VA 4Q33A 4N9BA 2NUWA 4FEZA 1FDZA 1HTIA 3S5OA 4P61A 4Z1BA 4NQ1A 1ALDA 2NUYA 1PL9A 3PBVA 1MZHA 4MFEA 4JYDA 3QPYA 4RK8A 1ONRA 3DI0A 3MI6A 5F2GA 2Y62A 2G95A 3TW6A 4RX0A 4PCFA 3GIYA 4TMCA 3P5ZA 3ATZA 3P8JA 1QOPA 4ADSA 3KVJA 1DQWA 3PWAA 4GXMA 4JTLA 2P10A 4UTKA 3LBMA 4Z1AA 1GT8A 1SSGA 3SW6A 2G96A 2DJLA 5U7SA 3EX1A 4LUJA 4O14A 3HPSA 4MLJA 1G4PA 2GOUA 2ZBTA 5J5RA 4QM1A 5D2TA 2HS6A 1VYRA 4MZ1A 1DBTA 5EKYA 2W79A 1JCNA 1WX0A 3LRLA 1HL2A 2GJLA 3LXCA 3DHDA 4JTTA 4NJHA 3HF3A 5AYZA 3FLUA 1FY6A 4IX0A 4N02A 1KM2A 4PFMA 2FB2A 2J24A 3G8EA 2J9YA 1SQ7A 5LNWA 4E38A 2Y89A 1F05A 2YSWA 1PHQA 3B03A 3O1NA 4WXZA 1FDYA 2QCEA 3PG9A 3QW4B 4X22A 4DF0A 3W85A 4XKYB 3KVMA 1C8VA 1KFJA 4OU1A 4TMBA 3A5FA 5H91A 4MJZA 1EPXA 1FXPA 4MZYA 4FHAA 3RMJA 2FPYA 4U4MA 2H90A 3L65A 5G2WA 3R89A 2VENA 3BG5A 3QSTA 2ZZ1A 2J9ZA 2NV1A 3W1AA 2QCDA 1OX6A 1JQVA 1OFBA 1JCJA 3TJXA 5KINA 3W7OA 5FF3A 1L6YA 1LBMA 5HWNA 1MSSA 1R2TA 4XTDA 3CHVA 4NXSA 5EA9A 3CT7A 4BI7A 1AL7A 3TROA 3OVQA 2PRMA 4XQ6A 2FPVA 1ZJIA 3C0JA 1W1ZA 3O06A 3STFA 1A5CA 4O12A 2CLEA 2A21A 1TQJA 5K2ZA 2QKFA 3G1FA 3W83A 1I2QA 1KFEA 1NVMA 3C2OA 5AN7A 1PS9A 1QO2A 3LV6A 2ZZ6A 4ADUA 3GB6A 3U6WA 3PSVA 1GVOA 2A6NA 3IIOA 3FS2A 1K02A 1SR9A 3CC1A 5K7JA 3B04A 1EUNA 1AL8A 1GG0A 3AO0A 4LVDA 4I7VA 1FWSA 1OVDA 1SPQA 1WYIA 2ZRZA 3OVRA 3B4UA 3R5EA 4HPJA 2OT1A 4I7WA 1H7WA 3N73A 3QFEA 3NPUA 1Q6OA 5CGQA 4LV4A 2NX9A 5AHEA 4JN6A 4UMBA 3ABSA 3QW3A 5HNRA 2CU0A 1VS1A 4NJKA 4FB7A 4LC6A 4UIOA 2DZUA 1BEUA 1VLIA 1DVJA 4JTJA 3C52A 2V0TA 4GJ1A 4XWUA 2E6YA 3LDVA 2AAMA 2RKXA 4YLWA 4MUZA 2E68A 3A23A 3EX4A 1ZAHA 1A5SA 4UFIA 5DN1A 2A7NA 4HKPA 1M7OA 1MEHA 1B57A 3M1ZA 5C5YA 4JGDA 6TIMA 1CW2A 1KTCA 4OQVA 1M5WA 5FF0A 2V81A 4BWLA 1F6KA 2X1RA 3T40A 3TE9A 4Z1CA 3OHIA 4JXCA 4HPXA 5BMWA 3C2FA 4UTTA 4M6QA 3LRKA 4FO4A 4ZQNA 1H60A 2NXIA 3NL6A 3LI0A 3HO8A 4PH6A 3L66A 5EPDA 1L9WA 4AVFA 1LRTA 3A5VA 1H7OA 4JYEA 3GXPA 4DPQA 3CB8A 2CZFA 3LM7A 5F2LA 1NF7A 1AW1A 1Q6LA 1MEIA 1JCMP 3OG3A 2DZVA 2HMCA 4G1KA 1DV7A 2C3ZA 3GAYA 4GUJA 1QPQA 4RJEA 3S0CA 2EHHA 5K9DA 4NUWA 1FCBA 3G1SA 2Y7FA 2Y88A 5KZMA 2DZPA 2ALDA 3S1WA 1OK4A 1DKWA 1QOQA 3P80A 5D38A 4CLMA 4UTLA 1SZEA 3BGGA 1R2RA 5E1QA 3UWYA 2OCZA 3C4UA 4OGZA 3S8HA 2J27A 4DQWA 6ALDA 4JTUA 2ISWA 1D3HA 1TB3A 1W5PA 3LXAA 1KTBA 1H7PA 3M47A 3QMTA 4HIBA 4GUFA 1KBIA 1TTQA 3WFAA 3TC6A 4LT9A 3LTYA 4UUIA 4WOZA 5CZSA 1X7FA 2TSYA 4UTMA 4KFPA 2YR1A 2ISSA 2QJGA 4XKYA 3L0NA 1OX4A 1GJPA 1TTIA 3HG2A 1WQ5A 3LLFA 2F84A 4WXYA 2GVLA 3KFTA 3L21A 3IV3A 5C55A 3VFLA 2Y63A 1IXPA 4X3ZA 5AFDA 5LNVA 5F1VA 2CLFA 4W9TA 1W37A 1FUYA 2QDHA 2QCLA 2CLOA 1JCLA 4RXGA 2ATMA 3KX6A 2JK2A 5HR6A 2B7QA 2I14A 1P0NA 5D32A 5FEZA 2WNQA 4FF7A 3BV4A 1OFAA 3CM4A 4WUIA 1O94A 3PUDA 4NVTA 1G6CA 1Y0EA 3RNDA 3O16A 1V5XA 3EWZA 5HWMA 5AOUA 5CPOA 5I3GA 3TJLA 3E12A 2HS8A 1P0KA 2VFFA 5CZ0A 4Z0SA 4JTSA 3GNNA 4QIUA 3STCA 3W2JA 1BKSA 4ORMA 5C6MA 4MVAA 3TMLA 3HOJA 1H63A 2ZTKA 3RF9A 4O17A 3CU2A 3FKKA 1J5TA 1EA0A 4WJEA 4L4MA 2Z6IA 2ZYFA 1IXOA 2J6XA 3NPXA 5CPLA 3TQ0A 4UXDA 4NZJA 2CLMA 3W7JA 3L5LA 4UFMA 3CEPA 3C6CA 3TXZA 4PEKA 3DU0A 1HFBA 5BOOA 4BR1A 4ZQMA 1LROA 1G4EA 2WNNA 1XKYA 2HSAA 3F4WA 2Y7DA 4UFHA 5F4SA 4O1CA 3UQNA 5G1TA 2YCEA 4O0KA 1LP6A 4O13A 1R30A 1EWEA 3SR7A 3S5NA 3CWOX 1KW1A 3DENA 1X1OA 3INPA 3EWBX 1VGAA 3GVGA 4RKAA 2ZCGA 3QF0A 1ICSA 2QCFA 4MLRA 4UTJA 5AC6A 2ZRWA 3G0SA 1G67A 3FEMA 1VCFA 4U28A 1I45A 3BGJA 3W71A 1GVSA 4YWIA 4XUGA 3STGA 1SZNA 4QNWA 4XBSA 4R33A 1PVNA 2V2DA 8TIMA 2WO5A 2Y7GA 1OFDA 4AWUA 3I65A 3S1XA 3TKFA 2B7NA 1JR1A 3ELFA 2CLIA 4IJBA 2VFGA 3JR2A 1RQEA 2E5DA 4X2RA 2QCDB 3VI2A 2H3DA 2CLLA 3W76A 4BWLC 2CZ5A 1VPXA 3UWUA 3IGXA 3I7RA 1G69A 4DBEA 2YZRA 3G22A 3LI1A 2RDUA 4UTTC 3CEUA 2A4AA 1LZOA 4FNUA 2VC6A 1H7NA 1VZWA 5IBXA 3FA5A 4MIMA 4IXXA 3W7RA 4H3DA 4O10A 3MP5A 1AG1O 4MZ8A 4YXGA 3UD6A 2CZEA 1MEWA 3HBLA 2RFGA 5D2VA 1TPUA 3V75A 1UASA 2QAPA 5EMUA 4R34A 3FJ6A 1FCUA 2EGZA 2Y6ZA 3A9IA 1VCVA 3W2KA 1LBFA 3HGOA 2NUXA 5D05A 5TQLA 4BFAA 2PURA 1F76A 3UWVA 4CCDA 5KZDA 4OT7A 3Q37A 1KM0A 1FWNA 1ZALA 5BRBA 3MI3A 4AWTA 1VYPX 1JUEA 2FIQA 3B0VC 4HNVA 1M7PA 2BLEA 2X30A 1S3HA 1QNVA 1LCOA 5C54A 4UTHA 2I9EA 2E5BA 3CTLA 3DHFA 1GYNA 5EBUA 5AHMA 1GYLA 2WSQA 3P67A 3DH7A 3W7KA 2RDWA 2C0AA 2PC4A 2C16A 1AK5A 3W6YA 3F1QA 1PHWA 3NL5A 3A24A 1G7VA 4JDYA 4FIRA 3TSMA 3U2OA 4AHOA 3EKZA 4GRSA 4HNTA 2C15A 3UY7A 3TDFA 3IRDA 5I3KA 1XUUA 2EF9A 1GTHA 3MBFA 1Z41A 4YCOA 1PE1A 5L9FA 3BLEA 2BTMA 3B05A 5KITA 2BX7A 4TR9A 7TIMA 1Z48A 1YXYA 1GTEA 4JTEA 5I3IA 4NT0A 3M16A 4Y90A 4TIMA 4XZ9A 5D33A 1MO0A 2A5HA 1EEPA 3OA3A 1TRIA 3W2NA 4O16A 4H4IA 2R91A 3O05A 3C3NA 4FX8A 4HN4A 3LCGA 3EB2A 4JTHA 2RHGA 5AHLA 1HG3A 2DZTA 2JKAA 4LU0A 4AMAA 1L2UA 4XTIA 4AF0A 1K7XA 3PR2A 3O63A 1OHLA 2G97A 5BNKA 4CNNA 4M19A 2BXVA 3EXTA 4EWND 3W9ZA 2A1YA 1W5OA 2IQTA 4A21A 4JX6A 5CPMA 1V7YA 4JDBA 5AHFA 1IIHA 4O11A 2ZRVA 3QMRA 4KFNA 1TIMA 3PBWA 3GAKA 3NL3A 3DAQA 2VXNA 3FYPA 3LCIA 4MY9A 2ZA3A 4GWEA 4S1FA 3F4NA 3EWWA 4WY0F 2QF7A 3ANYA 3EEGA 1GWJA 3E0IA 1D3GA 3GDLA 2OZ0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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