4LC6A

Crystal structure of the mutant h128q of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor bmp
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
222
structure length
222
Chain Sequence
DVMDVMNRLILAMDLMNRDDALRVTGEVREYIDTVKIGYPLVLSEGMDIIAEFRKRFGCRIIADFKVADIPETNEKICRATFKAGADAIIVHGFPGADSVRACLNVAEEMGREVFLLTEMSQPGAEMFIQGAADEIARMGVDLGVKNYVGPSTRPERLSRLREIIGQDSFLISPGVGAQGGDPGETLRFADAIIVGRSIYLADNPAAAAAGIIESIKDLLNP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the mutant H128Q of orotidine 5'-monophosphate decarboxylase from Methanobacterium thermoautotrophicum complexed with the inhibitor BMP
rcsb
molecule keywords Orotidine 5'-phosphate decarboxylase
molecule tags Lyase/lyase inhibitor
source organism Methanothermobacter thermautotrophicus
total genus 85
structure length 222
sequence length 222
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.1.1.23: Orotidine-5'-phosphate decarboxylase.
pdb deposition date 2013-06-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lc6A00
4YCPA 2OT1A 2NLIA 4HKPA 3B0VC 1KFCA 2NWSA 2Y7DA 4MY8A 5SWUA 3KXQA 1Z44A 3FYOA 3SFKA 1Z42A 3W76A 3W86A 1W5QA 4H3DA 3N9SA 3FKKA 3A23A 4HNUA 3HPZA 3DAQA 3GR8A 4IMCA 3NL2A 2FQIA 3VFLA 4UTHA 3KOFA 1VPXA 3IIZA 1I4NA 2E6AA 3PUEA 3W7MA 5AN7A 1GTEA 5FI8A 1FY6A 1W54A 4NNAA 4PL1A 2Y88A 4N4QA 4DO4A 3NQ6A 4LVBA 3QQ0A 5D05A 3Q37A 5DBUA 1K03A 1W5MA 2FLIA 3IIPA 2C3ZA 1H51A 2P10A 4O1AA 2CW6A 3LHVA 3M47A 4NX0A 2Y6ZA 2ISSA 3LI1A 4IMDA 1GT8A 4LT9A 2X1SA 3O15A 4UTKA 5HJLA 3UNDA 1SO4A 1OFAA 3W7HA 4ORIA 2ZQ0A 2VFGA 3JR2A 2ZRWA 3WJZA 1TJRA 3CWNA 4UTIA 3S1VA 3G1VA 5AB3A 2NX1A 1S3HA 4O28A 4M6VA 3SECA 3PS7A 4RCXA 1CI1A 3MWAA 3LERA 1O5KA 3TQKA 5IBXC 4WOQA 4QNEA 1XXXA 3NDOA 3LBCA 2ZCGA 5ABTA 2ZFAA 4UFKA 3BPWA 4O8RA 2Y70A 3RF9A 4KWVA 4L4MA 1FCUA 3P5YA 1N8FA 3HGSA 3C2FA 1DHPA 5LKYA 1N7KA 2DU2A 1G4SA 1TTJA 1H7WA 1TJPA 1ZNNA 2YPIA 4Y96A 2JBMA 3LRKA 5BOOA 5LHEA 1G4TA 2R94A 4RXGA 1GG0A 4BWLC 3W1QA 3LOTA 3UD6A 5TIMA 4BI6A 1GEQA 1OFBA 3N14A 2V5LA 5K9XA 3E9AA 3GIYA 3LCGA 4GUGA 5U7SA 3DKJA 3TDFA 4RZ6A 4A29A 2OX1A 3W1NA 4FX7A 1VYPX 3QZEA 2VKZG 5KZEA 4JEQA 4FNUA 1YPIA 1F7BA 4MOZA 1UB3A 2E5DA 5I3FA 3BO9A 1TPWA 4JTIA 4MZYA 1A53A 3W84A 1K7XA 1LTDA 3IV3A 1FCBA 3LRLA 1AL8A 1THFD 1W5NA 1OYBA 4UR7A 2C6QA 3NQ2A 2E77A 2X16A 2GOUA 2C15A 3GXPA 1ICPA 3TW7A 4CQ9A 4QIUA 3NPUA 2GQ8A 3OHIA 1TPEA 4GNJA 1M7PA 3M5VA 1TSIA 5K9DA 1S5TA 3EX1A 5HNRA 4JY9A 1P1XA 5BRBA 3B8DA 3TUUA 1NF0A 4AMAA 2Q8ZA 2GVLA 3UWWA 4TU1A 5EL1A 3PAJA 4DF2A 1LP6A 8TIMA 4ADTA 2H6RA 4FNRA 3N9RA 4AVFA 3CPRA 3JS3A 4XTIA 5C55A 2Z6IA 1MEIA 3CIWA 3BK0A 5LGXA 1Q6RA 2B4GA 3C3NA 3UWQA 4JN6A 1LBMA 1HTIA 1HG3A 4AWTA 3IIXA 2OMAA 3ZS4A 2RHGA 4LVAA 2BLEA 3CT7A 2FTPA 4UTUA 1NEYA 4IX0A 2JKPA 4BI5A 5HR6A 4UMAA 3OIXA 5CG7A 1JRCA 3UXAA 2Y61A 1RD5A 1UUOA 4YMZA 3BW4A 3O1NA 3E02A 4NUWA 4D2JA 4JTTA 4UTJA 3NPWA 1JCMP 2CLLA 3W1XA 5G5IA 1U83A 2E5CA 1IXQA 2H8XA 3O6CA 3O06A 1OF8A 4LVDA 2Y85A 4NU7A 1X6UA 3W7LA 4DF1A 1DQXA 3I68A 3GXNA 1TO3A 3BARA 3QMTA 1LLZA 3CQ0A 2I9EA 1TPFA 3EWBX 1SFLA 4O4VA 2CU0A 1IF2A 4AEOA 3T44A 1JQVA 4UCGA 1JCNA 3LI0A 1TCDA 4UTWA 3W9ZA 3YPIA 2X1TA 1SZGA 1GQNA 1ME8A 3MJYA 5CPNA 1OX6A 4MYXA 4UMCA 3C8FA 5HWMA 2E6YA 5C2XA 1YADA 2GVGA 2ZA1A 5EY5A 5CPOA 2B0MA 3D0CA 3RK8A 2ZRXA 2ZZ5A 5DY3A 3W6YA 1ZAIA 3K30A 2ZZ1A 4DXVA 2WSQA 1F6PA 2RKXA 3FFSA 1SW0A 5GVJA 2ZRZA 1TTIA 4FX6M 5D2VA 4ZQCA 4DELA 3M9YA 2PRMA 1FX6A 3UWYA 2NUXA 3G8RA 3C2OA 2I14A 4HPJA 3ABOA 4JTHA 3TROA 3KVMA 1W31A 1HL2A 5D2WA 3GAKA 3STCA 4IUOA 1B4EA 1VC4A 2ZTJA 1OX4B 2ZRYA 5G1TA 3ZFHA 3S8HA 4K7YA 3HBLA 4O18A 4JTSA 1N55A 5KZMA 3GDLA 5HINA 4K38A 1FWWA 3DFPA 3MP5A 5C6MA 1VS1A 1XI3A 1ZAHA 3AJXA 1FCQA 4BR1A 3W7KA 1VLIA 1OFEA 3SGUA 1XDMA 4I7VA 3MI6A 4I7UA 2QEZA 3ATYA 1P0NA 3G3MA 3IIVA 1TV8A 3P82A 4AAJA 3G1XA 1VQTA 3I6RA 3LCHA 4JR5A 5AHIA 4O53A 1YXYA 4Z08A 3SSJA 3W07A 1JCYA 4CQ8A 2HSAA 4TIMA 3WJWA 2G97A 4UMBA 2X30A 1AK5A 4QSHA 1VCFA 4Y9AA 5DXYA 1SO6A 3FKRA 1YTEA 4O15A 1Z48A 4AWSA 4IQLA 3L0GA 3L67A 4IXHA 3P81A 3PF3A 1M6JA 1A5SA 1UUMA 3QC3A 1QCWA 1M7OA 2D73A 1OVDA 5A8GA 1BEUA 4JXCA 4QAIA 1A5AA 3OVRA 4IWWA 2TMDA 4C1KA 4OHQA 1DKWA 1JUEA 2J24A 1I2RA 4O1DA 4QQ3A 1EA0A 3E0IA 4NZFA 4NNCA 1TB3A 4LS2A 1SUXA 3TQVA 4WXZA 3OBKA 2YCEA 4UFJA 2JKAA 3CHVA 3STFA 1TPH1 4BI7A 4UC5A 3OG3A 1KW1A 3MI2A 3VCRA 1YTDA 4DBEA 3KX6A 1OG0A 1TPDA 1CW2A 5BNKA 2QF7A 5H2ZA 2ISVA 2CLKA 4EVZA 1PCWA 1KBIA 1ZFJA 2BSLA 3BV4A 2A1YA 3LHZA 1H60A 4CNOA 3HF3A 1XFBA 2A85A 4N02A 2DZPA 4ADSA 1KLYA 4HNNA 2TYSA 3WJYA 4EF9A 1PL9A 2Y7FA 1VLWA 3TSDA 1Q3NA 1FWTA 3Q58A 1TPVA 1TRDA 3W75A 4IGHA 1L6YA 3W7IA 4WY0A 4UTTC 2E68A 2WNQA 3B0UX 1G7UA 1GPWA 2JK2A 4RLIA 3HMJG 3QPYA 4UFLA 4AHPA 2C0AA 5IBXA 4NX5A 1AL7A 5I3HA 3RNDA 1MXSA 3G0UA 2R91A 4JYDA 3KRZA 4ZVJA 3W23A 1QFEA 3G3DA 4HSOA 3CLMA 2E5BA 1L2UA 1C8VA 1WYIA 1AG1O 2WNNA 4GC4A 4WD0A 2B7QA 4LOCA 1K7FA 2A6NA 4Y90A 4HHPA 4JX6A 3EEGA 4WZHA 3NQEA 2CLFA 3G1FA 1ZJIA 2Q3OA 3SZ8A 3KAOA 1YXDA 3TXVA 1LOSA 3S5ZA 4BWLA 4LU0A 1X1ZA 4Q33A 2Z1BA 2Y62A 1SO3A 5E0KA 2Y89A 4PEKA 3LX9A 3TAKA 5F4XA 3PC0A 2CFFA 3W7QA 4BFAA 3M16A 4IMFA 2A7RA 1KM2A 4O50A 2FPVA 1YXCA 5K4XA 4JGDA 3MHFA 2G96A 1XUZA 4PL2A 2E09A 3TXZA 1QWGA 2J9YA 3GB6A 3SGZA 1T96A 3NQ7A 5AC6A 1EWEA 2WNZA 3P8IA 4R7JA 1ONRA 2CZDA 4M7TA 1KLZA 2QCMA 2A6LA 2C1HA 3IGXA 4ZQOA 4TX9A 2UV8G 1B9BA 3W73A 3LCLA 4ICNA 1OX4A 4O19A 1DL3A 1IIGA 2OJPA 3Q2DA 3P67A 1XBZA 4S1FA 5CZJA 1ICSA 3O05A 2EHHA 3CWOX 3VNDA 2J27A 3LHUA 1TRIA 1OFRA 3T40A 3W7EA 3FIGA 1FWSA 3F1QA 4LS0A 4O13A 3EX6A 1SFJA 3LCIA 1FXQA 3LRMA 4XKYA 2BXVA 5DBTA 3IIOA 3BGJA 4EOUA 5LSMA 3N34A 2CLMA 3ABRA 2QKFA 3LB0A 4POCA 1LOQA 4ALDA 2V0TA 4NJHA 3G18A 3TJLA 5BMXA 4WOZA 3UYCA 3OEXA 2VEPA 4K8EA 4LV9A 4AHOA 3O6YX 4DQWA 2OZ0A 5G2HA 1KFBA 3S0CA 1EP3A 1H7NA 1X7FA 1DVJA 2CWNA 3M43A 4JTJA 1P0KA 2RFGA 1EP2A 1O4UA 4O4WA 3T55A 3GAYA 3P7YA 1RR2A 3T78A 4IX2A 3R8RA 3QJAA 3RLUA 4IXXA 5LHFA 3S1WA 1TTQA 3OVPA 1TV5A 3AO0A 4EIVA 2YDAA 3B03A 2ZDRA 1MZHA 3MO7A 3W2UA 4IMGA 3W1RA 1RPXA 1TQJA 4RZ4A 1PV8A 3DFTA 3NNTA 3LCXA 5KITA 3UZJA 4FIRA 2GQAA 4O57A 1MEHA 2EAWA 3C6CA 4Z0JA 3GLCA 1QAPA 3PBWA 5J5DA 3TIMA 1R2RA 2H8ZA 3ABQA 3LCWA 1O60A 4AF0A 1YTKA 5DCBA 1G6CA 1YPFA 1Z41A 5F4WA 5F2LA 4GRSA 1F5ZA 1SR9A 3W3OA 4MPQA 3O16A 4NZJA 4CNPA 1X8FA 5D32A 1EP1A 4G1KA 3TFXA 3GKAA 2ATMA 2R8WA 3LXCA 2VFEA 3DFQA 1GYNA 3PB2A 1WBJA 3O8AA 4N2YA 1KTCA 4M19A 1T99A 4DEFA 2NV2A 4IPIA 5D30A 1JCXA 3ELFA 1ALDA 3P8JA 1SU5A 3DU0A 4L4LA 4O54A 3M41A 3TSBA 1XBVA 4JDBA 4B5NA 1VHNA 2O7SA 1LOLA 5AC8A 3W1AA 2DZWA 2EPHA 4E0CA 3NPXA 1NFBA 1TQXA 4LRSA 3QSTA 4A2RA 4HNVA 4XQ6A 3GNDA 2DORA 5LNRA 1IXPA 4LRTA 4P61A 1B57A 3QYQA 2ZZ6A 5D37A 4O12A 4DO6A 3S1UA 4NT0A 5G1YA 1GZGA 2J6XA 3IEBA 2NZLA 1OABA 4HNTA 4AB4A 4YCOA 3L68A 3MP3A 3QW3A 5U4NA 3PVFA 4UNKA 4CCEA 3PM6A 3B05A 3ZR4A 4JTLA 3DFSA 3P61A 3LM7A 4FNPA 3VKJA 4GUIA 1SW3A 2WSRA 4DBDA 2QCEA 4MZ1A 4GUFA 3LXAA 3WK1A 3EKZA 3HG2A 1FWNA 3MHGA 3W7PA 3GDRA 3W22A 5CPMA 4JTGA 4DPQA 3RU6A 5EMUA 3GVGA 3M44A 3C0JA 3LLFA 4QITA 3IVSA 1PS9A 3TMLA 4J9JA 3NL3A 3NQGA 3NG3A 3O63A 1VCGA 3CC1A 3FOKA 4GWEA 3EKLA 1OFOA 1YDOA 3GDKA 1NVMA 1UJPA 2A5HA 4CNNA 3F4NA 3GYEA 5DLCA 2WPBA 3E12A 3NQFA 1H7XA 1VR6A 2ZZ4A 2DP3A 3MMTA 4MJZA 3B4UA 2HTMA 3O6DA 3IGUA 2LLEA 4FXSA 4MLRA 1KM3A 2NUYA 4NNBA 3I65A 4HIBA 1RZMA 2A0NA 4LUJA 3MUXA 4WJEA 4WXYA 1BTMA 4PODA 2XN2A 4KFOA 3KRUA 1IXNA 4Z1CA 1DJNA 2YW4A 4RK8A 4WY0B 2OCZA 1D3HA 2YR1A 3L65A 1XL9A 3EXSA 2KZHA 5CSSA 1L6SA 3BG9A 4E2BA 3DGRA 4NXKA 4Y8FA 4HT3A 3TKFA 2PE4A 1UBSA 5AYYA 2HMCA 4X9SA 1W5PA 1QNVA 1R47A 1W3NA 2EGZA 3L5MA 3TA6A 5TQLA 1KFJA 4AWUA 5AC7A 1WV2A 4NJJA 1D3GA 4O16A 2QAPA 4OQVA 1T8XA 4RJEA 2AAMA 5KTLA 1R30A 2HS6A 3NQDA 4UTTA 3QF0A 2G95A 1GJPA 4XBSA 2QJHA 1LRTA 2NWRA 1H7PA 2C19A 2IQTA 4RR4A 1PVNA 1I2QA 3G1AA 5CSRA 5AOUA 1AW2A 1NSJA 1F2JA 2AQWA 2BWGA 4I7WA 3L5AA 3THAA 4GUJA 3UWUA 3ZWTA 4CCDA 1QO5A 1ZENA 1TTPA 4MIMA 3NQCA 3W83A 3MBDA 1EUNA 3W2MA 3N19B 3B04A 3NL5A 4HN4A 4W9TA 1S5WA 1KV5A 3EB2A 1SSGA 3OVQA 1AW1A 1OFPA 3LGEA 2Q3RA 2V8ZA 3SW6A 4I9AA 5CZ0A 1JVNA 3A24A 4JY8A 5EPDA 1XM3A 1P4CA 1WAUA 1VH7A 1RV8A 3DXIA 1KFEA 2EF9A 3PY2A 4FO4A 3W74A 2PC4A 3BLIA 3PG8A 3PUDA 2ZTKA 4OV9A 4M6PA 3LBMA 4QISA 3FYPA 1Q6QA 4N9DA 2YZRA 2VEIA 3HG4A 4FNQA 1L6WA 3SR7A 1JCLA 2QUUA 2GJNA 3W71A 4FB7A 4RX0A 2JGQA 2YSWA 3R12A 2Q8LA 2ZYFA 1UASA 3FLUA 4XKYB 1PHQA 2NX9A 5L9FA 3RLVA 3UPWA 1J5TA 3LHYA 4O17A 5D09A 1H1YA 2A7NA 2I1OA 4S2CA 3CEPA 1F74A 4MFDA 3V1PA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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