4LS1A

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with dh03a312
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with DH03A312
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 143
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ls1A00
2CLHA 4Y9AA 1VZWA 1W5PA 3PSWA 1Z41A 4H6KA 4Z1AA 1SSGA 3WK1A 4WD0A 3W87A 2GPTA 4MFDA 4O11A 4OE7A 2ZYFA 4O57A 4R33A 1JCLA 2B7NA 2WNNA 3GDLA 3W7DA 4LT9A 3BLEA 3V1PA 4O14A 1ADOA 5CG7A 3G0XA 5D02A 3RF9A 2DORA 3GLCA 2J9XA 4NQ1A 4FNTA 5G4WA 2UV8G 4KWVA 3H54A 2P10A 2VENA 4B5NA 4K36A 5IM51 3L0KA 1IXNA 4JDYA 4C1LA 3C56A 3YPIA 4A3UA 3L0NA 4FIQA 3BW4A 1MEWA 4X22A 3HMJG 1GVOA 2Y7FA 5DXXA 3V75A 3S1UA 5AFDA 1VHNA 3G22A 4ML9A 5DXYA 3UPWA 1FBAA 2OX1A 2ZZ1A 3GYEA 4MKNA 1NSJA 3LB0A 5LNUA 5CPNA 4LV9A 3W71A 2PE4A 5HUPA 4JTSA 1JCNA 4WY0A 4E2BA 1KFJA 4LRSA 4JEQA 2WOQA 3W2NA 2YPIA 3MJYA 3W7KA 2QCCA 5EY5A 4CLMA 1SFJA 3GR8A 3MHUA 1L2UA 3DHDA 1DHPA 1JUKA 5U4NA 5GVJA 4PL2A 3TCEA 1DOSA 2FFCA 5I3GA 4DEFA 2HS8A 4NNAA 2WPBA 2NX9A 2FB2A 4JR5A 2TSYA 3NPVA 3LBCA 5AYXA 1NF0A 4OT7A 1VLWA 4FEZA 1OX5A 2CU0A 3NQAA 2DU2A 3IGUA 2ISWA 3H53A 3E12A 3P67A 3BK0A 1HO1A 2AQWA 2PRHA 2PC4A 1YXCA 4UTUA 2NUYA 4ZQMA 3IIOA 3THAA 5G1YA 2Y61A 4ORIA 4O50A 4EOUA 4YCOA 2QEZA 3U8GA 4PODA 3W7MA 1K7EA 5D03A 4CCDA 3LCWA 1I2OA 1JUEA 1KV5A 4NXKA 5HUOA 1ZNNA 1FCBA 3QW4B 3QMSA 4Q33A 1EEPA 3U2OA 2R14A 3DFNA 4AH7A 3TMQA 3QYQA 3PY2A 3W1MA 2GJLA 1RPXA 4RZ4A 5F2GA 4HPJA 4JTFA 1TPFA 2OZ0A 4O28A 2KZHA 3PBYA 4JD4A 2EAWA 2NWRA 1W54A 4WUIA 3IEBA 4Z1CA 4DPQA 1OFPA 1QMLA 2C18A 3UNDA 4MVAA 3W74A 5LNSA 4DQWA 4IGHA 1C8VA 2Y85A 1LBMA 4AWSA 1Q6RA 1K8XA 4IMEA 5G2IA 4R34A 1GVSA 5TBOA 1JCXA 1AW2A 3SZ8A 3G3MA 3T4CA 5I3HA 3DH7A 1GQNA 4KFNA 1YPIA 1GYNA 5HMSA 1T8XA 2DZXA 1EB3A 1W31A 3KVJA 5DN1A 2G97A 3O06A 3DAQA 1BWKA 3NQEA 2YSWA 1VYRA 4R7JA 2Z1BA 5D37A 3P74A 2A5HA 2ZZ3A 1QCWA 5KZEA 1H7PA 3PBUA 1UB3A 3C8FA 4GXMA 4UUIA 2ZQ0A 4TO8A 5HINA 4IUOA 1KLZA 4RR4A 3LI0A 1KBIA 3LDVA 3P8JA 4LUJA 3SR7A 3DENA 5CSRA 1PCKA 4UMBA 2JK2A 2Y7EA 4YMZA 1EUAA 3GB6A 5EPDA 4DELA 1PL9A 3M43A 4I7UA 2HMCA 4S2CA 1OX4A 1XFBA 3L21A 3QEZA 3FYPA 3I7QA 4CCCA 1LRQA 1XM3A 4PC8A 3M47A 3MBFA 2Z2UA 2YXGA 4XKYB 1KFEA 3OHIA 2R91A 1AK5A 1QO2A 1VCGA 5DBUA 2B0MA 1H7XA 3S8HA 3FJ6A 1XCFA 2B4GA 3QRHA 3W07A 3GDKA 3NXFA 4POCA 3GAKA 3UWYA 3W1XA 3BG3A 1QR7A 4PEKA 4YCPA 1L6YA 4LVDA 2FJKA 3R12A 2BX7A 1VYSX 3O63A 1EP2A 1I45A 2PRLA 4AAJA 5F1VA 1R2RA 3Q58A 1P1XA 3PUEA 1Q6OA 3A21A 2Y89A 3P80A 5D05A 5AC7A 3MHGA 4WXZA 3P5YA 3CLMA 4UTWC 4N9DA 1EUNA 2DZTA 2X30A 4IOTA 3B4UA 2DZWA 5C54A 3CTLA 3BVJA 1GWJA 3G1VA 2Y6ZA 1OFRA 4QQ3A 3GKAA 2NXHA 1XBZA 1JVNA 2BWGA 2QJGA 2P1FA 3O6YX 2A7RA 3KX6A 4GUHA 5AHLA 1AG1O 3E02A 1A53A 3OIXA 4JTLA 4HNVA 3BG9A 4N6EA 3B0UX 4MZ8A 5K3VA 1H1ZA 3LCIA 4NT0A 2JKPA 2C0AA 1IXPA 2YFOA 3NNTA 3PVFA 5IBXA 3WJZA 1KFBA 1UUOA 2OJPA 1W3NA 4Y8FA 4EVZA 3GVGA 3NM3A 3QC3A 3IIXA 4DXVA 1FDYA 2NX3A 5FEXA 1WAUA 1DKWA 3PSVA 5KSWA 2ZA3A 1I2PA 1JQVA 2X16A 5I3JA 3BLIA 3L67A 4ZZ9A 1WBHA 3HG4A 3UPBA 1ALDA 4Y90A 1ME8A 3LHZA 2EKCA 4NNBA 4OU1A 1FWWA 3NQVA 3LTYA 1H50A 3N19B 3W7LA 4IPIA 3I7RA 1SZEA 1M7PA 2FB3A 1OFAA 2GOUA 2WJZA 3NA8A 2ISSA 1QNVA 1D9EA 2X1TA 3MMTA 5D33A 1R2TA 3G24A 3C2EA 3NDOA 4M7TA 1B3OA 1VCFA 2QF7A 1M5WA 4JDBA 1KM0A 1FCQA 1CI1A 1XXXA 2H6RA 2XFWA 5G5IA 1OYCA 3T55A 4BR1A 1EP3A 4KWWA 2QCLA 2CWNA 3SI9A 5FF3A 3QPZA 5CZSA 5CZTA 4K37A 3USBA 1YDVA 3LI1A 4RV8A 2WSQA 2ZDRA 3NYZA 2B7PA 5H2ZA 3QQ0A 4O4VA 3WFAA 3PG9A 4DO5A 3G3DA 1I2QA 1JCYA 3DFPA 3W73A 1S5TA 4E0CA 2VEPA 5KMYA 3G1AA 4JX6A 1H60A 2VFFA 3IGXA 1YYAA 4GC4A 3UY8A 3RLUA 4FXRA 1B57A 4LOCA 1QO5A 4JYEA 1F7BA 3H55A 4AF0A 4JTGA 1TTQA 4FNUA 5U7SA 2J9ZA 3IVUA 3SFKA 1D3HA 5LZLA 3LCHA 1TCDA 2TYSA 4M6VA 3U6WA 2Q8LA 2QKFA 3WJYA 3BLFA 3W23A 5I3IA 3NZ1A 4M7SA 4AHOA 4BI5A 4CNPA 1RV8A 3P60A 2F7FA 4K8HA 1Y0EA 4H4IA 1SO5A 2ZA2A 4RCXA 4IPJA 3TE9A 3S1WA 2NZLA 4HSOA 3STEA 2A7NA 2GQAA 1W1ZA 4MPQA 3C4UA 3SGUA 5EMUA 4MYXA 2G96A 2DZVA 1IXQA 1XKYA 4ZQRA 1XBYA 4HNTA 3VCRA 3BGGA 3S0CA 4NJGA 3UZJA 3BPWA 4L4MA 4M6PA 4A29A 3ELFA 5HULA 1KV8A 3PM6A 2D73A 4BWLC 1TPB1 3HOJA 2X1UA 1BTMA 4GE8A 3G8RA 1KTCA 2ABBA 3PBWA 2O7QA 2H8ZA 2WV8A 4HIBA 2XN0A 4MIMA 3TQKA 4FNRA 4UFHA 2JKEA 4OV9A 2OT1A 4IXXA 5FF0A 3TSBA 2Z6IA 1X1ZA 4QJ1A 3JS3A 3FEMA 4IMDA 4ZMGA 4Z0JA 3WJXA 5LHEA 2CLOA 5D04C 1UCWA 2ZBTA 4JNMA 2NLIA 3S9YA 4QISA 4LW7A 5D2TA 5F2MA 4A2RA 3RFAA 2BSLA 4XTIA 3STCA 3L5LA 5BOOA 4JX5A 1TPWA 2QCDB 1P4CA 1TPC1 2ZFAA 5LNVA 1GZGA 1OF6A 1PS9A 4DPPA 4BK9A 4GUIA 3EX3A 1XI3A 4IX2A 4ZL1A 1JQXA 3EX4A 1O5KA 3RNDA 3F03K 3P7YA 1H7WA 2EGZA 2A85A 1VCVA 2QCDA 4UFKA 1ZAJA 1HUVA 3GXNA 4N9BA 4LY8A 2YR1A 3R2GA 4N4PA 4K38A 3P81A 1I8JA 4MY1A 2G95A 3C52A 1TQXA 3W2JA 5BW6A 3PWAA 1S5VA 1OFOA 5K7JA 1ICPA 1Z48A 2CLEA 3TA6A 3DFSA 3EWUA 4ZQOA 5K4ZA 4RZ6A 4LNYA 3EX1A 3L9CA 3F4NA 1B4KA 5ABTA 3BV4A 1A5CA 3M7WA 2V5LA 5LNRA 3LBMA 4M5PA 5AYZA 1P0NA 3W3OA 3W2LA 1ICQA 1LBFA 1ZENA 4WOZA 1X6UA 3A22A 2QUTA 3W7HA 3CPRA 5DCDA 3O07A 4A21A 2FIQA 3PS7A 4JTHA 4L4LA 1UUMA 5C5YA 1GVRA 1KM3A 1LM1A 4D2JA 2ZZ2A 3EEGA 5E93A 1KFLA 2C1HA 1W0MA 3MYPA 1PV8A 3TMLA 1I4NA 3QSTA 3BGJA 3P62A 4IMCA 1L6SA 4NZFA 3BW3A 1KBJA 5D38A 4JTKA 1AW5A 1OVDA 3THQA 2DZUA 5F2LA 4X3ZA 1GT8A 2CLKA 5T26A 3PUDA 2W79A 4QNEA 1E51A 2I14A 3CEPA 1YPFA 1T0OA 4G1KA 3W2UA 2E5DA 4AHQA 4TIMA 1Z44A 5EBUA 3W1NA 1QAPA 4ONVA 2BXVA 2JGYA 4AWTA 3I7SA 5I3KA 1X1OA 3NL6A 2ALDA 3FKRA 2A1YA 3S5YA 1WBJA 1ZAHA 1WOAA 1TPVA 4GFSA 4O13A 4FX7A 4LVGA 1SSDA 1LTDA 4P2VA 4JTUA 2Y7GA 1M6JA 2E5BA 1VRDA 1K7FA 2GUUA 3G1FA 1SO4A 2Q3OA 4JXCA 2WNQA 3A5FA 1PIIA 5DY3A 4AVFA 3W7NA 2J9YA 1P5BA 3JRKA 4NJKA 1TREA 4UR8A 1MO0A 4CNOA 4EIVA 1G67A 1NEYA 5HWMA 1LROA 4Z0SA 5LGXA 3EWBX 3S42A 2YZRA 5E0KA 2TRSA 3UQNA 2OT0A 3NEVA 3IV3A 5CPMA 2NUWA 3M1ZA 1NVMA 4N9CA 3JR2A 1BKSA 3M5ZA 1FX6A 1DORA 1ZAIA 2YYUA 5E1QA 3L5MA 1VPXA 2VEKA 3I65A 4LVBA 3NL3A 1U5JA 4FX6M 4W9TA 1JR1A 4TMBA 4FX8A 5DCEA 1H7NA 1ME9A 1GTHA 3L68A 2ZRYA 3GIYA 5AYYA 5CSSA 1TYGA 3N14A 3GDRA 3SECA 4Y6GA 5F1UA 3LHVA 1F76A 4FNSA 3TAOA 1SW7A 1S3HA 3LLFA 5EYWA 4NVTA 1KA9F 3LERA 3TV8A 4PFMA 3A9IA 4GBUA 5CPOA 4ZVJA 4LS2A 4LUIA 1LYXA 5F4SA 2F84A 2RH9A 1V7YA 1OHLA 4U28A 3C61A 3P8IA 4K7YA 4S1FA 1OFEA 1WXJA 3BARA 1ZCOA 4PA8A 3CB8A 3TDFA 3W84A 4JY8A 3S1XA 2PCQA 4BI7A 1TPH1 3LTSA 3NQCA 1IGSA 4JICA 4C1KA 1TJPA 5AOUA 2CLFA 4MLJA 1XUUA 5EKYA 2V2HA 1LOSA 1O60A 3QW3A 2X1SA 2ISVA 3NVTA 3KXQA 3PC0A 5G4EA 3M5VA 4CCEA 2C19A 2EHHA 2VXNA 4HNUA 4UTKA 3GXPA 5C2XA 1TRDA 1GG0A 1XL9A 3M6YA 4ZQCA 4YWIA 5CPLA 3LCLA 2FPTA 2ZZ5A 3ABRA 3OVRA 3TX9A 5AHMA 3QZEA 5L6UA 2E6FA 2R8WA 4MJMA 1MEHA 1PE1A 3LHWA 1OG0A 1VHCA 3IRDA 3OBKA 4QITA 1EPXA 4UCGA 3HF3A 4JN6A 3EX6A 3W6YA 1NAL1 3KRUA 2NWSA 4XKYA 4FHAA 1EWDA 3ATYA 4O4WA 1C9DA 2QAPA 3E9AA 5CGQA 4UTTA 8TIMA 3TKFA 3PUOA 3O16A 3IGSA 2QJIA 4O52A 5IBXC 2R94A 3MP4A 1WOBA 2JKAA 1JRBA 2CZFA 3M5XA 3NGJA 1HFBA 3OVQA 1PCWA 2C13A 4Q32A 2FPVA 4O17A 2QCGA 1WQ5A 5FESA 2DZPA 1OYBA 4K6AA 4U4MA 4GJ1A 4RJEA 3TH6A 3INPA 2Y7DA 4IX0A 5I3FA 4ALDA 1ZJIA 5HJLA 1M7OA 2ZZ7A 3UWQA 1WYIA 3DFQA 1ME7A 2CFFA 3MW7A 3OVPA 1THFD 1I2NA 4RXFA 2Y63A 2J6XA 5D32A 2E5CA 2V9DA 2V8ZA 3BO9A 3T78A 1H5YA 1CX9A 2OCZA 1JJKA 4O12A 5FEZA 2C6QA 4FO4A 3TJLA 1JRCA 3VNDA 3N2MA 1NF7A 1F5ZA 2X2GA 1KM2A 2E1DA 1V5XA 4MZYA 1G4EA 1SR9A 1I2RA 3G1DA 4WX2A 3W86A 1VR6A 3G0UA 3TFXA 2CW6A 3GX9A 3TROA 1CW2A 1TSIA 1L9WA 1MEIA 4O10A 1TPUA 4UTWA 2AAMA 2NV2A 4UMAA 5CZJA 3TSDA 3SGZA 3C2RA 4KKXA 1FDZA 1K3UA 1YXDA 3NQGA 4NJHA 2RKXA 3RMJA 3W7QA 5L9FA 4EWND 5LSMA 3IIPA 3DFTA 5FF7A 2FDSA 4UTLA 4H3DA 3OEXA 3SW6A 1TTPA 4NNCA 3UWVA 3NQ7A 3KHJA 1UBSA 3G18A 1T99A 2ATMA 3FFSA 3EXRA 2RHGA 5SWUA 3MYOA 4IQLA 1LDCA 1KW1A 1WDWA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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