4LS1A

Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (dhodh) with dh03a312
Total Genus 143
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
143
sequence length
365
structure length
365
Chain Sequence
TGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPNTAGLRSLQGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human dihydroorotate dehydrogenase (DHODH) with DH03A312
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 143
structure length 365
sequence length 365
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2013-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4ls1A00
3GDMA 3P8IA 4BI5A 3HGRA 3PM6A 1VYSX 4FHAA 4CNNA 1JQVA 4FIRA 1OFPA 4Q4KA 5AYZA 2B7PA 2DZPA 3LI0A 4RX0A 1G67A 1SSDA 3TXZA 3PY2A 3ZWTA 2WNQA 3SZ8A 4CNPA 3KVMA 1WV2A 3TFXA 4GUGA 1GVFA 3EX1A 2GVGA 3PBWA 4JYEA 2H8ZA 4FXSA 3MI6A 3W1AA 1DV7A 1UUOA 4RCXA 6TIMA 3M9YA 4RZ5A 1ZENA 4LV9A 4JN6A 1TMHA 1HO4A 4JY9A 3GX9A 3FLUA 1TPC1 1W5OA 3UPWA 1QOQA 1C29A 3BGJA 1W3IA 2QCCA 3QRHA 5IBXA 4ZQMA 1AG1O 5LHFA 3JS3A 1XDLA 1S5TA 3UWUA 3S6DA 4JD4A 3S8HA 1S5WA 4MZ8A 2ZZ3A 1L6YA 3P60A 3UZ5A 1OF8A 1G69A 3DHFA 4YMZA 2X1UA 4FXRA 3M5ZA 1OG0A 2A21A 3S9YA 1H61A 1Z48A 1F74A 1OYBA 1VH7A 2GJLA 4O10A 4RKAA 4JTLA 3CLMA 3W72A 3I7QA 4AMAA 1Q6RA 2XN2A 1VPXA 3NM3A 1IF2A 3HPZA 4YLWA 2A5HA 1YDOA 3MP4A 2ZZ6A 3DHDA 3EX6A 4OV9A 4RLIA 3W7EA 5DN1A 3IIPA 2A7PA 3MYOA 3WK3A 4ZL1A 4JNMA 3STCA 1B4EA 1H62A 4ORIA 3LB0A 3MHFA 5KSWA 3TSDA 1FQ0A 1W0MA 1XBXA 1RVGA 2NX3A 1LCOA 1SPQA 1VC4A 3NOEA 5K7JA 1DL3A 3TXVA 2FPTA 5CGQA 4Z1CA 3MP3A 2R94A 3I6RA 4MJMA 2VENA 5FEZA 2Y89A 3LM7A 4P61A 3M5VA 1AK5A 2P10A 5D04C 1WQ5A 2OCZA 4MYXA 3NVTA 1SZFA 2QUUA 1UJPA 4MFEA 3S5NA 3I68A 2F84A 1JR1A 1ZCOA 4NJGA 5CPNA 5DCDA 2ZRZA 1D9EA 4XBKA 3CWNA 2DZTA 2C18A 1V7YA 2ZRWA 2PRLA 1L2UA 5LNUA 1RR2A 3BLEA 4UCGA 1X6UA 3M5YA 2WJZA 1K7EA 3BLIA 2A7RA 3NQEA 1PV8A 4XBSA 2DZSA 5EA9A 4QQ3A 4O19A 2C14A 3W7OA 3NEVA 3LRMA 3O07A 1T96A 2CLKA 2ZBTA 2HSAA 3CEPA 4HPJA 2FQIA 4N2YA 4N9DA 1ZALA 3E12A 4MIMA 3SGUA 3L0NA 2JGQA 3P67A 4XKYA 2DU2A 3OEXA 5H91A 2TYSA 4Z1BA 3LHTA 4BF9A 3NL3A 4OWGA 3L9CA 4RZ6A 3SSJA 2ZZ7A 4WOZA 2TSYA 3QSTA 4GUFA 4RJEA 1OK4A 2J9YA 4A29A 2Y7EA 6ALDA 4L4MA 2GVJA 2XN1A 2OT0A 2ZA3A 3UD6A 1W1ZA 3GKFA 2V2HA 4JX5A 3NPWA 1QWGA 3TMQA 1TQJA 1VQTA 1AMKA 1T8XA 1TPFA 4O50A 1XM3A 4JTKA 4O57A 5EY5A 2C13A 1I45A 4KFOA 3HO8A 2FIQA 4NNBA 1EB3A 2V2CA 5FESA 3UZJA 4WXZA 2CLMA 4ORMA 4ADUA 5IBXC 4NXSA 3QEZA 4PL2A 1P4CA 4CQAA 1LOSA 3A5VA 3NQFA 4LVGA 2ZZ1A 3NQVA 1OFQA 2NXHA 4NUWA 4GUIA 3W87A 4MFDA 4YCOA 2V5BA 3KXQA 5LZLA 1JCYA 1LROA 2LLEA 1R46A 2NX1A 3TKFA 3FJ6A 1W37A 2ISVA 3QM3A 5D33A 4ZQCA 4HNUA 3EWYA 2VFGA 3WK0A 3NQDA 1I8JA 3DFQA 1YXCA 3IIZA 5F2IA 1TTQA 1CW2A 1O60A 5FF2A 4LRTA 2ATSA 2E5BA 4TMCA 3NQ6A 4UTKA 4LC8A 3CQ0A 3LTSA 4OV4A 4R7JA 1MO0A 3BPWA 1WYIA 1Q6OA 4K8HA 1FXPA 3VCRA 3M41A 3S1UA 1K7XA 3E49A 3NL2A 1GOXA 1RV8A 2V30A 2VC6A 4NX0A 3L5MA 1DJNA 4CNOA 4JTFA 1G4TA 2Y85A 3GNNA 2Y7GA 3EX4A 2B7QA 1P0KA 4U28A 3DXIA 3SR7A 3QH2A 3C61A 1SUXA 2YZRA 1E51A 1IIHA 4IOTA 2OT1A 2Y7FA 3TQKA 4DEFA 3WJYA 4FNRA 3LCLA 1SR9A 3GKAA 4LS0A 3S5ZA 3TDFA 3VKJA 1KV8A 4HHPA 1I4NA 1SW3A 4O53A 4UR7A 2ZZ5A 1GPWA 4N02A 2PCQA 1AW5A 3C2OA 3QPYA 4N4QA 4AHOA 3NQ7A 3Q37A 1VGAA 4Y8FA 4HN4A 3MUXA 1LOQA 2YYUA 3A23A 1YDNA 2JKAA 3QW3A 3TK7A 3PC0A 3NL5A 3STFA 2ABAA 1TB3A 2PRMA 1W5NA 1P1XA 2QCNA 3ATYA 5DXYA 5BW6A 3G0SA 3M44A 1GT8A 3E96A 1QDSA 2WO5A 3SIZA 3BO9A 1K3UA 4JY8A 1TRIA 3UWWA 2QAPA 2H8XA 2TMDA 4UMAA 3PAJA 1TJRA 1XI3A 4QSHA 1OX5A 3PVFA 4JX6A 2X30A 4JXCA 5I3IA 1XXXA 2WSQA 4JTSA 1WDWA 4PC8A 4HNVA 4GUHA 2CU0A 3D0CA 1VCGA 4MLRA 3P74A 1KTCA 5CZJA 1F5ZA 3UY8A 1QCWA 3LTPA 3DBPA 3EXTA 4KKXA 3EB2A 4JR5A 4PL1A 1THFD 4GFSA 4GRSA 4DELA 4QITA 1RZMA 3W7RA 3HGSA 5DXXA 3G1SA 1D3GA 4NJIA 1AW2A 1TV5A 5BNKA 1K8XA 2E6YA 4IMDA 1YTEA 4MPQA 1ZHAA 1JCLA 3DFSA 3L2IA 1TQXA 3SECA 5D02A 3NPVA 1ML1A 1A53A 1KBJA 4JTHA 3W22A 3DKJA 3GXPA 1GTHA 3R13A 1W5QA 3W71A 1F73A 2Y6ZA 2YX0A 4HKPA 1EA0A 4AXKA 3L67A 4GC4A 4UXDA 1DHPA 4LUJA 3MHGA 3E9AA 1LLZA 1M7OA 1TPEA 3VI2A 3TE9A 2FPVA 3DFOA 1RQEA 1PE1A 2BLEA 3AO0A 4JEQA 3EX2A 2Y88A 1G4SA 2O7SA 4JTIA 4ZQPA 1HG3A 1QO5A 1P5BA 3W7QA 4O13A 2W0UA 1YTKA 3ZWSA 1LYXA 1VLWA 1WXJA 1X1OA 4UR8A 1OX4B 3QW4B 1LM1A 1KFEA 3W85A 2Z2UA 4N4PA 3ELFA 4S2BA 1F05A 4DF1A 1GG0A 4NNAA 3T78A 4O52A 3GDRA 2CLLA 4W9TA 3C2FA 3UXDA 3BV4A 1L6WA 2FDSA 1P0NA 2FLIA 5F4XA 3BG5A 3HPSA 5KITA 5LSMA 2QUTA 2CZEA 5HMSA 3WK1A 4LWWA 1X8FA 3F4NA 3O06A 4BK9A 3O15A 5HINA 3P82A 1W8SA 3SY5A 2ZRXA 4CLMA 3N34A 3HPXA 1OFOA 4M5PA 2Q8LA 1KFLA 1UB3A 3WJZA 3DKLA 3IVTA 4FX6M 5LGZA 3NGJA 5MHBA 4K7YA 2V8ZA 4OQVA 4Z08A 3W7MA 3TJLA 4WZHA 3G8RA 4IWWA 4AEOA 3B0PA 5D37A 3B05A 5KZEA 1H60A 3LDVA 3W7CA 2AGKA 1PCWA 4YCPA 5KINA 2ABBA 3BW3A 2V0TA 2NXGA 2ZTJA 3FJLA 5A8GA 3O6YX 5DBUA 3V1PA 4O14A 4B5NA 4DO4A 3QYQA 2RDUA 3KRSA 4MY8A 8TIMA 1TIMA 1ZFJA 2X1RA 1QPQA 2R8WA 1I2PA 1K03A 4NU7A 2ZRUA 2G97A 2A6NA 5C5YA 1Q45A 3HG2A 2Y62A 1H7WA 4UTJA 3A22A 1K7FA 1ALDA 3O6CA 4LVAA 5AHEA 2B7NA 1IGSA 2C16A 4TO8A 1R30A 2FPYA 7TIMA 1L6SA 4ICNA 1NSJA 3FYPA 5F2GA 2NLIA 3LCWA 3WJSA 4LS1A 3ZR4A 5K2ZA 4IMCA 4O4WA 3NR0A 1EP1A 4HPXA 3N3MA 5AHNA 4JYDA 1DBTA 4ONVA 2YDAA 3W74A 1Z42A 2CW6A 5LKYA 2PC4A 1HL2A 2DP3A 2RHGA 3UNDA 1TJPA 1K8ZA 3IRDA 3PR2A 2A6LA 4E0CA 4MY9A 4IPJA 2Z6JA 2ISSA 4DPPA 1H63A 1LP6A 4JTUA 4O28A 3Q58A 4ZQRA 3W23A 2Y63A 4JTEA 1SO4A 3W6YA 1QAPA 5D2VA 4GUJA 3B4UA 1VYPX 3FIGA 3N2XA 3CC1A 3O8AA 3HOJA 1F6PA 4QM1A 4ZMGA 3TQ0A 4TIMA 5FEWA 3THQA 4AWUA 4K37A 3TSBA 4BI7A 5DCEA 1SO5A 5F4WA 3OIXA 1O94A 3TC7A 1KTNA 2P1FA 1XBVA 4LRSA 2I14A 4UIOA 1H1YA 3NXFA 3KVKA 1H51A 4IX0A 2J9XA 1XL9A 1TPH1 5HR6A 3CM4A 3W2JA 5J5RA 3PUEA 4KFNA 1DKWA 3RLUA 3N73A 1JUKA 4N9CA 5FF0A 3DH7A 3T55A 1FUYA 2CZDA 3C4UA 2V81A 1ME7A 1KM2A 1R2TA 5G1YA 2QCDB 2A7NA 4AHQA 3N9RA 3T7VA 5D38A 3UPBA 1SZGA 2C19A 5KTLA 3MI3A 1GVQA 1JULA 4JIQA 3W1PA 3LHWA 3C2VA 4NJHA 4KWWA 2QCEA 5L6UA 2VFEA 3C2EA 2QCMA 2NWRA 1TO3A 3LHZA 5ABTA 5HUPA 4LNYA 3P5YA 3O05A 3YPIA 2NUYA 3QC3A 1IXQA 1IIGA 3G1FA 3Q2DA 1SFJA 1XDMA 3I7RA 3ZFHA 5T26A 5K4ZA 1M7PA 4M6PA 5TBOA 5CG7A 4NX5A 2A0NA 1KFKA 5I3KA 3LCXA 4I7VA 5CSRA 1VS1A 2H3DA 3P8JA 3VE9A 2J27A 4L4LA 4OHQA 5AYXA 1PL9A 3HBLA 1I2OA 2GVLA 3LXCA 2GPTA 3TA6A 3OVRA 4A3UA 4JDBA 3OA3A 3W9ZA 5EMUA 1VCVA 4IXXA 1VCFA 5F4SA 1YXYA 4HSNA 3QMSA 2DZVA 3MYPA 2DJXA 4NZFA 2Q3RA 3LLDA 5CPMA 1FXQA 1G6CA 4LVBA 4FNSA 3MBDA 2V9DA 1TCDA 2QKFA 3R8RA 4QAIA 5AHLA 1SO3A 4TR9A 1S3HA 3HB9A 4UFLA 3G1DA 4JTTA 3W2LA 2VFIA 1H7XA 2VFHA 1KBIA 4S2CA 2A1YA 2E5DA 2YYTA 3ABQA 1GVRA 3QMRA 4RXGA 1U83A 3E02A 3B03A 3C0JA 3TUUA 3ABRA 1J5TA 3FS2A 1N8FA 5F2MA 3GB6A 1HO1A 1PIIA 4WX2A 1ME8A 3BLFA 4EWND 3CU2A 3TNOA 5HWMA 1CX9A 5K9CA 3V75A 4LC6A 2OZ0A 1GVOA 1JRBA 2J6XA 1C9DA 4LVFA 3UXAA 3NDOA 2DORA 1KA9F 2ISWA 3Q94A 4UFKA 2C0AA 1LOLA 5K4XA 5FF3A 1OFAA 5G2HA 1GJPA 4DBEA 3BW4A 1TRDA 3ABSA 4PODA 3G3MA 3SGZA 3QSRA 3UWZA 5DY3A 2RFGA 1QFEA 3N14A 5AHFA 1MSSA 5GVJA 3L65A 1QMLA 1HTIA 1ICPA 2EKCA 3KOFA 3LHVA 3PB0A 3PWAA 5AC7A 4ZQOA 1YLVA 4O16A 5DY2A 4C1KA 3G1YA 1ZY9A 3A9IA 3W7DA 5FEPA 1XUZA 1DJQA 2V2DA 5FEXA 3PF3A 2GQAA 2TRSA 3G1VA 4MVAA 2DZXA 3GDTA 1GEQA 3JRKA 3W07A 3WK2A 4FB7A 1MEHA 4O1DA 1N7KA 4WQ6A 2FJKA 3L66A 4LOCA 2D73A 4IX2A 4H4IA 2TPSA 4PH6A 2WNNA 1SSGA 3NG3A 3QQ1A 1LLWA 1BEUA 3LX9A 3S42A 1KLZA 4H3DA 2B7OA 4FNTA 4WOQA 4QJ1A 3LOTA 2IQTA 4UC5A 5D2XA 4DO6A 1G7VA 3W7HA 2EAWA 2VELA 1JRCA 4OE7A 1GG1A 2ZRVA 2R14A 4ADSA 3IEBA 4IQLA 2I1OA 5LNRA 1W31A 2WPBA 4IMGA 1Q6QA 2QCGA 4LY8A 3EWXA 3STGA 2E6AA 4G1KA 3GXTA 4M19A 1NVMA 3SI9A 3HG5A 1X7FA 1R2RA 4LS2A 5AHMA 3UWVA 4M6QA 2ZTKA 4O0ZA 3S1XA 4JYFA 3S5YA 2P0OA 3HMJG 1ONRA 1GYLA 1W56A 1I2RA 4JDYA 4C1LA 3B0UX 3L21A 4NT0A 3P80A 1CI1A 2J9ZA 1K02A 1FWTA 4NQ1A 5EBUA 5F1UA 3QPZA 3A5FA 4E38A 1Q3NA 3P61A 4JTGA 2ZCGA 3RNDA 1TSIA 3W84A 3HGOA 1EP3A 5K3VA 1YYAA 1Q6LA 2CLFA 1VHCA 1H1ZA 3CT7A 2BZNA 3TIMA 1T99A 3DGRA 3MO7A 4O1AA 3G1HA 3W1QA 4GBUA 5HR7A 1D3HA 3S5OA 2VXNA 5LNSA 1ZAIA 3IVUA 4DQWA 1OYCA 3CIWA 3VE7A 4N6EA 4K6AA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GDM A;  3OIH A;  3HGR A;  1VYS X;  4HA1 A;  4CNN A;  4Q3M A;  4FIR A;  1OFP A;  3SCT A;  2DZP A;  4RX0 A;  3RN6 A;  4J1O A;  3CQJ A;  3AIU A;  2WNQ A;  1JYW A;  3EA2 A;  3CPU A;  1XIS A;  3AMG A;  3MA8 A;  4GUG A;  2DGA A;  3EX1 A;  4FXS A;  3MI6 A;  1A80 A;  1UUO A;  3PHA A;  6TIM A;  2OKT A;  1TWI A;  3WF1 A;  1WE5 A;  1DQU A;  3CZK A;  2PPG A;  3FST A;  4QE5 A;  1VP5 A;  1Z69 A;  5LHF A;  3JS3 A;  1MW1 A;  1XDL A;  3UWU A;  5BXR A;  1L6Y A;  4R3U A;  3KLL A;  3WLO A;  2WBK A;  3UYI A;  4IP7 A;  4YMZ A;  3KCL A;  3M5Z A;  1JDD A;  1VH7 A;  2GJL A;  1XLG A;  4V1X A;  2DVU A;  3ZSS A;  1EEX A;  3VYL A;  4HVX A;  2HJP A;  3HPZ A;  2BVD A;  3M6D A;  1EA9 C;  4YLW A;  3DHD A;  5DN1 A;  3EX6 A;  3IIP A;  4ATW A;  4JNM A;  2PWE A;  1WPC A;  3LB0 A;  1Y65 A;  2A3L A;  4Y9P A;  1LCO A;  3OVG A;  4WKA A;  1O1H A;  1K9T A;  1A4L A;  3CAV A;  3TOP A;  2A79 A;  2FPT A;  1ZBV A;  3I6R A;  4MJM A;  2Y89 A;  3LM7 A;  4DAI A;  3M5V A;  4PBE A;  2OCZ A;  4MYX A;  1Q6D A;  3NVT A;  1JPK A;  3AYS A;  5E6Y A; 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