4LVDA

Fragment-based identification of amides derived from trans-2-(pyridin-3-yl)cyclopropanecarboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 168
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lvdA02
4MY1A 1Q3NA 1MZHA 3GXTA 2WV8A 3PVFA 3BW2A 3ATYA 3N9SA 3NZRA 4FNRA 1SU5A 1W5OA 3O16A 2H8XA 2Z6IA 4LWWA 5L9FA 2GJNA 1Z44A 3ABSA 3OIXA 3MI3A 1OFOA 3ANYA 2PURA 1GJPA 4JX6A 5CPNA 4ZQRA 1VLWA 4HNVA 4RV8A 3LI1A 1AL7A 2QCFA 3EX1A 3LB0A 1F73A 1JULA 1XKYA 3C2EA 2XN1A 2YPIA 3GXPA 5F2LA 2QCDB 3PB2A 4NX5A 2E09A 1Q6LA 2CLIA 4BI6A 3LRLA 3NA8A 1VHNA 1TRDA 5DLCA 5HULA 2BX7A 4IGHA 1W3NA 3C56A 3HG5A 1VLIA 1XXXA 1F6PA 3IIOA 4BF9A 2YW4A 4UFKA 3UWUA 2ZZ2A 3W07A 1K8ZA 1DHPA 3BO9A 4NNBA 2QCLA 2JBMA 2AAMA 3UXDA 3FKRA 1QOPA 3TKFA 2VXNA 4FHAA 3TE9A 4MKNA 3W74A 1ZENA 2HTMA 5AYYA 3T78A 5G1YA 4JTSA 5HWNA 5C54A 1DOSA 3GK0A 3ABOA 3IEBA 4IMGA 1A53A 4E2BA 1FDJA 3BW4A 4CNOA 3L2IA 4RJEA 4OWGA 1TPFA 1DV7A 2YW3A 4MZYA 3USBA 3EX6A 2Y7GA 4UNKA 3W76A 1R46A 5DN1A 3BG9A 2ZZ6A 1H7XA 3CWOX 2C15A 4O57A 3PUOA 3KFTA 3HF3A 1GYNA 2R14A 3HIJA 1UBSA 3NL5A 3NYZA 1G6CA 4AHOA 3F4NA 1SZFA 2WPBA 2Z1BA 1N8FA 4IJBA 1ZJIA 1QPRA 2VC6A 3EX2A 5G2HA 2JK2A 3HMJG 4Y9AA 4LUIA 1P1XA 3IVUA 1Z42A 1A5SA 2RFGA 3P74A 4JXCA 1IIGA 1OYBA 1ZNNA 4LY8A 3KAOA 5LNVA 3QFEA 1G7UA 3N19B 3P62A 1VCGA 4WY0F 5DY2A 2E6DA 4JY8A 3VFLA 1FBAA 1T99A 3YPIA 1QNVA 3MI2A 1DQXA 5DCDA 2DZSA 4A2RA 5J5DA 2CZFA 2BLEA 4BWLA 2VOMA 1RR2A 1DJQA 2A1YA 3HGOA 1KLZA 3KVLA 5D2WA 5TIMA 8TIMA 3M7WA 2A7RA 4TR9A 4HHPA 1YXCA 5F4XA 3I65A 2J24A 4YLWA 3V75A 3F4WA 5K2ZA 4K39A 5BMXA 2QDHA 3IIVA 3N9RA 3NQ2A 2BXVA 2ISWA 4MJMA 2R94A 3TC7A 1KFKA 1AK5A 4WQ6A 1KLYA 3EWXA 5LGZA 4UTHA 5EY5A 4E2DA 2QKFA 2QUTA 1TQXA 2QCHA 3CTLA 1YTDA 4O11A 4O4VA 4DBEA 3HOJA 1EA0A 3CQ0A 4K7YA 5SWUA 4NNAA 4GBUA 4AWTA 3QMRA 3MWAA 1B3OA 3B05A 1VGAA 3W2KA 1K8YA 5D32A 3DH7A 3DBPA 3KVMA 1PIIA 2RKXA 4UTWA 3B0VC 1CX9A 4OGZA 3LRMA 3O6CA 4JN6A 5CSRA 2JKAA 1LOQA 4JY9A 2H6RA 1FCVA 5AC6A 2WJZA 2PRLA 3GXNA 2PCQA 1P4CA 1LOSA 2FJKA 2J9YA 3W1UA 5C55A 1W37A 4JR5A 3M47A 3MBDA 3H55A 3NEVA 2NV2A 3GNDA 3E9AA 1YYAA 1LTDA 3W6YA 4LS0A 3LCWA 3CEPA 1UCWA 3RNDA 1T0OA 3JRKA 1MEIA 5LZLA 4JEQA 3L67A 4AEOA 3A9IA 2DZPA 4P61A 3OG3A 3A23A 2ZTJA 3CWNA 2HSAA 6TIMA 3TAOA 1XC4A 4K37A 3L0GA 1JCXA 3TFCA 1V5XA 3P67A 1YXYA 3UWYA 4UFLA 3FEMA 1ZCOA 2ZZ1A 1XUUA 2DZWA 3UY7A 2NXIA 3CIWA 5AYZA 1WOBA 2J9XA 1KV5A 3M0ZA 4QISA 4K36A 5EYWA 1BTMA 4TO8A 3TCEA 3O6DA 1TCDA 4EWND 3P7YA 1KBJA 1WXJA 2Z0IA 3LCFA 1R47A 3R5EA 4RLIA 4JICA 3W1MA 1OG0A 1GZGA 4EVZA 4O0ZA 4R53A 5MHBA 2Y61A 4E0CA 5FEWA 2P10A 3LI0A 1H61A 1RD5A 2C3ZA 2OJPA 2QJGA 4MLRA 4OQVA 4HPXA 1PE1A 5IM51 1JJKA 3RF9A 2V82A 3DHDA 4BK9A 1RPXA 2CLFA 3VI2A 4ORMA 2ZZ4A 3SI9A 3BV4A 2RDWA 4XBKA 2NXHA 1ZAHA 3TSDA 2FB2A 2E5DA 2A2IA 2V0TA 4N6EA 1LRNA 3ZR4A 2VEPA 1WYIA 3DFSA 1OJXA 3SECA 4R34A 1FDZA 4JYEA 3GDLA 3NQCA 3QSRA 3UWVA 4LOCA 1LRQA 4JTIA 4KWWA 4LT9A 4UTMA 3NZ1A 2GOUA 3HG2A 4ZZ9A 3W1NA 3RMJA 3W86A 4CCDA 1FCQA 5AC7A 4RR4A 1OX6A 4WUIA 3T55A 4A2SA 2ZRXA 3LTSA 4FNPA 1NF7A 3C61A 3KHJA 4JYFA 4GRSA 3W7EA 1H1YA 3GR7A 1EP1A 3UY8A 1YDNA 2YR1A 1EP3A 1OFAA 1G4PA 4N6FA 2CLHA 3JS3A 4X9SA 2P0OA 4R7JA 5G5IA 3W2LA 4BI7A 4KFPA 4NJIA 3TQ0A 3UWWA 4CQ8A 2EAWA 3W1TA 1I4NA 3KRZA 4UTJA 4GUIA 3V1PA 5FESA 3N2XA 1YPFA 3MBFA 1GPWA 1JRBA 4TU1A 4U28A 2X16A 3GLCA 4WY0A 3QQ1A 3EWZA 4WZHA 2W6RA 3EKZA 2V30A 5KZDA 5F4SA 1EUAA 3B8DA 1VCVA 4LRSA 1AW2A 4NNCA 2QEZA 3OVQA 3BVJA 1BEUA 1KFBA 4KWVA 4GUJA 4ML9A 3TH6A 3P84A 4G1KA 5I3JA 1HTIA 2Y7DA 4UR8A 3M5YA 1SO6A 4FX7A 2VKZG 4UFHA 3U6WA 5ABTA 4RX0A 1KM3A 4LV9A 4ZMGA 3LXCA 4AH7A 5LNSA 3FFSA 2FB3A 4FNUA 4GNJA 5BOOA 2ABAA 2OT1A 3DENA 3N73A 3WJYA 1F74A 4JDBA 1B9BA 1FWWA 1ZFJA 1WDWA 4NT0A 4RXFA 4MVAA 1QPNA 1TPVA 2Y7FA 3UXAA 3BG5A 2CLEA 2QCDA 2WSRA 4UC5A 1YTKA 1D3GA 2NX1A 4ADSA 2J27A 1G67A 4JTTA 1SQ7A 3LHWA 1WV2A 1KFJA 1A5CA 3NQMA 3S42A 4S2CA 3TNOA 4UTWC 3IVSA 4EOUA 1M6JA 1GOXA 3IIPA 2TYSA 1W54A 1LBLA 2V5LA 3LLFA 1NSJA 4UTUA 1B57A 1I8JA 3NVTA 4O1BA 2RDTA 4UMCA 4XTDA 4CCEA 1YADA 5EKYA 3MW7A 3B04A 4JX5A 4O4WA 3LRKA 2CZDA 1C29A 3NPUA 3MP3A 2YYUA 2HS8A 3I7QA 3EXSA 3I7SA 2QCGA 2WSYA 1GVOA 3EEGA 3N2MA 3HB9A 4I9AA 3UPWA 3HGJA 3W1LA 2Q3RA 1CI1A 3W71A 5LKYA 4OU1A 5EBUA 1GT8A 4UFJA 1TTPA 1G4SA 3S1XA 3G8EA 4O1AA 4PTNA 3G3MA 3DKJA 4LS2A 4Z1DA 4HKPA 2VFDA 2C16A 4YXGA 3MP5A 3QPYA 1H5YA 3RK8A 4ONVA 2NWRA 3W1PA 1XCFA 1AMKA 2PRMA 4QITA 5DELA 2EF9A 2VFEA 3BW3A 2RDUA 1I2PA 1IF2A 2VFHA 3O15A 2ZZ5A 3Q2DA 1TPWA 2ZRZA 3W7PA 5G2WA 2E77A 4IQLA 1RV8A 2YCEA 1PCKA 3W7LA 3WK2A 1L9WA 5G2IA 5F2GA 1C8VA 1EEPA 1Z48A 3M16A 1OFRA 1MEHA 5CPLA 3NQEA 1O94A 3Q94A 5C5YA 1UASA 1FCBA 3UWZA 3NL6A 1WBJA 2FPYA 3MHFA 1OFQA 3R89A 4HT3A 1FWTA 1GVFA 1UUOA 4NXSA 5FF7A 2ZBTA 3CB8A 3O6YX 1ME9A 2GJLA 1Y0EA 1OFEA 3MYOA 1K8XA 1JQXA 2C0AA 3FIGA 1W1ZA 1SZGA 2YYTA 4UTKA 1XDLA 1S3HA 4NJKA 5AHIA 6ALDA 5LNRA 4FEZA 4MY9A 3CPRA 1E51A 2WOQA 1KFLA 2V81A 3W7CA 3HQ1A 3VE9A 2FPVA 4O8RA 2B7NA 1EX5A 2NV1A 3W87A 2X1UA 2A6NA 1NVMA 1T8XA 3A5VA 3OHIA 3W9ZA 1OF6A 4FXSA 2B7PA 3TAKA 5D05A 1K03A 3UZJA 4GXMA 4TX9A 4X3ZA 3UYCA 5E1QA 4UMBA 4GUHA 4N9DA 5HUPA 5I3FA 3TFXA 4HNTA 3LCLA 1PV8A 3G8RA 3L65A 3A22A 3TROA 3TV8A 3G1HA 3OEXA 5I3IA 1LRTA 4FIQA 4ICNA 2W79A 1YPIA 5LHEA 4ZQPA 1GQNA 1H7NA 4DO5A 5AHLA 1W31A 3LGEA 4TMCA 2VFIA 1VYPX 5TBOA 2C14A 4Z0JA 4I7UA 4DEFA 5D2XA 2BTMA 3LBMA 1X6UA 3R12A 1W5QA 1XI3A 1DORA 2NUYA 5F2IA 2ZQ0A 1K7XA 1SUXA 3WJZA 1F5ZA 3SSJA 1C9DA 4IX2A 2NUWA 1VYSX 3KRUA 3OVPA 3GKFA 5D30A 1Q6OA 3W2MA 5F1UA 4QSHA 2E6FA 3LLDA 1MSSA 4RZ4A 5BW6A 1SZEA 4NQ1A 3QZEA 4JTJA 1BWKA 1O95A 1F7BA 4JYDA 4RXGA 3T40A 5EMUA 5J5RA 1XUZA 4MUZA 4DPPA 2YFOA 1SO4A 3O07A 3E96A 4QNEA 3A24A 5CG7A 7TIMA 2CZ5A 3GDTA 5TQLA 1XBVA 3IIXA 3P61A 3W84A 1OVDA 4WXYA 1QOQA 2E6AA 1IXNA 2VEMA 1F2JA 1QMLA 5LNUA 4RCXA 1TPC1 5AHEA 3PG8A 3EXTA 3DHFA 1W0MA 3M5ZA 2WKJA 1FDYA 2PRHA 4PL1A 2ZRVA 1M7PA 3W7NA 2X1SA 1KBIA 5K4XA 1TB3A 2X30A 1SFLA 4QIUA 2TRSA 2Y89A 1FWSA 2BSLA 1SR9A 3NO5A 2ZRWA 3HPSA 3CT7A 2UV8G 5IBXA 2E6YA 2C19A 3LXBA 3SR7A 4NZJA 3W23A 1TJRA 3FLUA 1P0NA 4Q33A 1XFBA 3QH2A 5U7SA 3NQDA 1SW7A 5KZEA 1NAL1 2G96A 4DELA 3ZWSA 3G1SA 3L68A 1PL9A 3L21A 4JNMA 5FF3A 3S1UA 3THAA 1GVRA 1RQHA 2EPHA 4XBSA 3LM7A 3G1VA 5CZ0A 1W5NA 3N34A 4Y8FA 4Q4KA 4RZ6A 4NJGA 4MJZA 4X22A 2Q3OA 1H1ZA 2B0MA 4N9BA 4CCCA 4D2JA 1GTHA 1PVNA 2ISVA 2EHHA 2G97A 1TO3A 3QMSA 1TPH1 4YWIA 1FY6A 2O7QA 5LNWA 3L5AA 4IMDA 4MYXA 2QJHA 1IIHA 3M43A 1R30A 2B7QA 2XN2A 1THFD 1JCMP 1SW3A 1U5JA 3JR2A 5DBUA 3RU6A 1B4KA 3R2GA 1KFCA 5DY3A 1ALDA 5FEXA 2BWGA 5G4WA 4LVBA 3NDOA 4O16A 5G4EA 2PC4A 1O5KA 1CW2A 4N9CA 4O1CA 3W2UA 3NR0A 2NXGA 3I7RA 4UTIA 4FF7A 1H63A 3P81A 4M6PA 3W2NA 5DXXA 4C1LA 1P0KA 1IGSA 3WJXA 4UTLA 1HO4A 1LZOA 1WX0A 4TMBA 4QM1A 2ZA2A 1OHLA 4WXZA 4JX4A 3LHVA 3FJLA 3H54A 4Z1AA 1HL2A 3B06A 2DZTA 1UB3A 4HNUA 4JDYA 1ME8A 3LV6A 1BKSA 3KVKA 2NZLA 2DORA 3I6RA 3IGUA 4MFDA 3P8JA 5HR7A 2ZA3A 1I45A 1HFBA 3MUXA 5FF4A 1O60A 3NNTA 4LV4A 2VEIA 5HUOA 2VFGA 4O0KA 1YDVA 3G0UA 4W9TA 4IMEA 3L5MA 1A5AA 4PCFA 1R2SA 3MP4A 3UQNA 3TW7A 2V5BA 4GE8A 2BZNA 2CFFA 3S5YA 1Z41A 4J9JA 3TXZA 2GPTA 4LNYA 3WJSA 1HO1A 3GYEA 4O54A 2G95A 3BLIA 3OVRA 5BNKA 3H53A 3IGSA 1L2UA 3QRHA 5EL1A 4CQAA 2ZRYA 1WAUA 3DGRA 1EUNA 3LX9A 2FDSA 1IXQA 2FQIA 1VR6A 3D0CA 3E02A 1OYAA 3KXQA 1DJNA 3S0CA 1JQVA 3L66A 3TW6A 4PL2A 4A3UA 1XDMA 3DFPA 3R13A 4QNWA 3NQGA 3QPZA 4EF9A 1FWRA 4PODA 3QC3A 1YXDA 1I2QA 4IWWA 5KSWA 4O15A 3STFA 1AW1A 1H7WA 3GB6A 3GIYA 4DXVA 4AWSA 2VEKA 1EWDA 3BPWA 5D2VA 3TIMA 1O4UA 3ATZA 3QMTA 1EP2A 1VJIA 1SW0A 4HIBA 4UR7A 1BWLA 3GDRA 3NPVA 2CWNA 1VQTA 5KITA 4FNQA 5CZSA 2NUXA 4XWUA 1SO3A 1N7KA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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