4LVDA

Fragment-based identification of amides derived from trans-2-(pyridin-3-yl)cyclopropanecarboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 168
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lvdA02
2PCQA 3LB0A 3KX6A 2OZ0A 1DVJA 3QMSA 4UR7A 5DBTA 3I6RA 4CNOA 5HR7A 2VFDA 1JCMP 3GXNA 2G97A 2Y89A 2YCEA 3NM3A 5G2HA 2DORA 1XUZA 3IV3A 3C2OA 3NQVA 1QPQA 2ISWA 4NJHA 1NFBA 1ZJIA 5AC8A 2YR1A 2C1HA 4IMFA 4UC5A 4IMGA 3HBLA 3L0KA 1VQTA 4JEQA 1ME8A 1SZEA 5K2ZA 4RXFA 3O1NA 3W2JA 3Q2DA 3HIJA 2ABAA 2ZDRA 3O6YX 5KINA 1FY6A 2GQAA 4YCPA 5BMWA 1QNVA 1Q6LA 1KM6A 5AFDA 1TQXA 4DELA 2BX7A 4OV9A 4E38A 4Z1CA 4N6FA 3H55A 2ZZ1A 4LVBA 5HINA 4UCGA 1TJRA 1J2WA 1G6CA 2C18A 4LS0A 2NX9A 4PH6A 2O7QA 4DQWA 1ZY9A 3LHWA 4RX0A 3HJZA 1GEQA 4Z1BA 4JNMA 1UUMA 2Q3OA 5TIMA 1RPXA 4PODA 3IGXA 1ZALA 3V1PA 2CLFA 3P7YA 4AMAA 3PBUA 1H63A 2FIQA 1YXCA 1JQXA 2V2HA 2DZVA 3ELFA 3W87A 4IMEA 2ZCGA 5I3GA 3W7IA 4MUZA 4X22A 3LBMA 2H6RA 3IIVA 3W7JA 1VCVA 2ZA1A 2X1UA 4K38A 3BW2A 4LW7A 5E93A 3NQMA 5DCEA 4Y8FA 4MKNA 4ICNA 4NJGA 3FS2A 2WSRA 3LCWA 1Q6QA 1O5XA 3N14A 1MEWA 1L6YA 4O1AA 5AHEA 3NO5A 1RVGA 2BXVA 5F4XA 1LCOA 3P5ZA 3M6YA 1HO4A 3F4WA 4IJBA 3DKJA 1LORA 4ZZ9A 3L68A 3F1QA 3G1XA 3LLFA 5HWNA 1YXDA 2ZRZA 2B7OA 3IVSA 1F6KA 3GB6A 1G69A 5H91A 5D2WA 3O6DA 1IXQA 2PRMA 5G2IA 1TV5A 1NAL1 3HPSA 3M43A 2LLEA 1IXNA 3IIXA 4O57A 4WJEA 5AYZA 2RKXA 3USBA 2Y62A 2YPIA 3HG2A 4H6KA 2C6QA 2C14A 4GWEA 2OT1A 3O15A 1V7YA 5G1YA 3HGSA 4JTHA 3WK1A 3WJYA 2QF7A 5K9DA 1CW2A 1SFLA 1GVRA 4POCA 3C52A 5I3HA 3R8RA 4I7UA 2Y85A 4HPJA 4X2RA 1CX9A 2GQ8A 1H62A 2QCFA 4MPQA 5LHEA 3W1UA 4NNCA 1TTIA 3TXZA 4K8HA 3Q37A 1I2RA 2FDSA 3K30A 5I3JA 5CGQA 2NLIA 1H51A 3DENA 3VI2A 2H8ZA 3EB2A 4FIQA 2H8XA 1KBJA 1DBTA 3CQ0A 1XM3A 2RFGA 3PSVA 2GOUA 5F2LA 2XN1A 3NXFA 3B0PA 3NQ8A 4UFLA 4CNPA 3BG9A 1HUVA 2GUUA 4NZJA 4A21A 3TC7A 5LSMA 3QW3A 3RF9A 4H4IA 3GXPA 3HGJA 3DAQA 3T7VA 1K7XA 4IGHA 4K6AA 2RDUA 1EEPA 4M7TA 3S1XA 4PL1A 3S0CA 4HSNA 5C5YA 2CLHA 3BG3A 3MP4A 1UBSA 3W7OA 1DQWA 3W9ZA 2NXGA 1WXJA 3MMTA 2BTMA 5AYYA 4PTNA 3I7SA 3NPVA 4UTIA 3QMRA 2I9EA 3UWWA 1XCFA 3G1DA 4DF0A 1A5SA 2GVLA 2FFCA 2WNZA 2G5WA 3E02A 2IQTA 4RZ4A 3PF3A 3W07A 3P62A 5C6MA 2BLEA 3CHVA 5AHFA 5CPMA 3UQNA 4ADTA 3W72A 2Y7GA 4AXKA 6TIMA 3PB2A 3LCHA 1C9DA 4MJZA 3O05A 1X1OA 3R12A 3G1SA 3IGUA 4RR4A 4QSHA 4DF1A 4K7YA 4N9EA 2W0UA 1MEHA 2Z6IA 1VPXA 2E6AA 1PCWA 1XDLA 2QCEA 3INPA 5D2XA 3FYPA 5K9XA 5FF2A 1C8VA 3G0XA 3NQAA 4XUGA 3R89A 1KFKA 3HOJA 5K3VA 1VHCA 3TAKA 1W3IA 1OX4B 1Y0EA 1SQ7A 4JD4A 3C2EA 3QJAA 1LBMA 5F1UA 1QAPA 2CLIA 4NU7A 2QUVA 4AWTA 5HWMA 4JR5A 3DGRA 3M0ZA 3S5YA 3NZRA 4QQ3A 3SECA 4JTGA 3M5VA 3C6CA 4RV8A 1R2SA 1XDMA 3P8IA 2NUWA 2VXNA 1F05A 3NNTA 3MI3A 3M7WA 3HPZA 3W74A 3WJXA 3R2GA 5J5RA 4N4PA 2WOQA 4QISA 2EHHA 3PB0A 4ZL1A 4OE7A 3GDRA 5BMXA 3PUOA 1GVFA 4H3DA 3EWUA 4NX0A 3MP3A 3DFPA 5CSRA 3C8FA 4NZFA 5G5IA 1PIIA 5CG7A 1SSGA 1TYGA 4UTTA 5E0KA 3FKKA 5AC7A 4P2VA 3LCLA 1YTEA 2H90A 3PM6A 5LNVA 1SO4A 2EKCA 3GYEA 4CCDA 1SFJA 3S5NA 5LZLA 2OT0A 2OCZA 3EEGA 5U7SA 1BWKA 1A5CA 1TPH1 4C1LA 1WYIA 3KVMA 2EF9A 3OVPA 4W9TA 2QUUA 1GPWA 4YWIA 3EX2A 5KZMA 4UTTC 2CW6A 1W5QA 3LGEA 4I7VA 3IRDA 2V2DA 3G22A 3SI9A 1KLZA 2HTMA 1NVMA 4JDYA 2FPVA 3PAJA 4WY0F 1Z44A 1LRNA 3W2NA 3EWYA 1LOLA 3SGZA 2J6XA 2V5LA 4IXHA 5E1QA 1FDZA 3LV6A 2E6FA 3BLIA 4FEZA 1L9WA 5LHFA 1KM2A 3UD6A 1ZFJA 3U6WA 1PS9A 3DHFA 4RJEA 1K3UA 4O0KA 1QOQA 1I2OA 3DI1A 4ZQOA 3FJLA 3WK0A 4BI6A 1KFBA 4RXGA 3UZ5A 1SR9A 4LRTA 1YTDA 3NQ7A 2WSYA 1K03A 3V75A 3IIPA 2UV8G 1LDCA 4LC6A 3W88A 2YX0A 3N73A 4JN6A 3L65A 2Z1BA 3FKRA 3FA5A 5AYXA 3KHJA 3LHVA 3TMLA 3EX4A 1OFBA 5D2YA 3TW6A 5T26A 4WXZA 1DJQA 2XFWA 3VFLA 1FX6A 5AHNA 2WQPA 3C2VA 3IVTA 2QKFA 3WK2A 4DXVA 4M5PA 5EY5A 3TJXA 3W7PA 3JRKA 3FIGA 1U5JA 1PHQA 3TE9A 3B4UA 2QCNA 1SW3A 2AQWA 2BZNA 3PBVA 2E5CA 1A53A 1ZNNA 3MI2A 4GUIA 3ANYA 1OK6A 2OX1A 3NPWA 1AW5A 1TPB1 2A21A 3WJWA 2TYSA 3FOKA 2EAWA 1F5ZA 5DXXA 1PCKA 4Z1DA 2J9XA 1KTNA 3QQ1A 3UPBA 3KRZA 3O16A 4JTEA 3G18A 2DP3A 2Y6ZA 2HSAA 5ABTA 1W37A 3BLFA 4DEFA 3HQ1A 4NVTA 1WQ5A 3W1LA 2GQ9A 4FXRA 3LRLA 1H7RA 4MY9A 4O50A 3KVLA 1KTCA 3LTSA 1DKWA 3IEBA 4CLMA 3BGJA 4NJIA 1QDSA 4ZQCA 4AF0A 3GDKA 2CLMA 2JGYA 4PEKA 4XKYA 5EKYA 4CCEA 4IMDA 5HQEA 2HS6A 3N2MA 1DL3A 3TU9A 4K36A 1XBVA 4JTLA 1MSSA 3U2OA 5AHLA 3IGSA 1UJPA 3GNDA 4AF0B 3FLUA 3B0VC 4IQLA 4XKYB 2GVJA 1QPRA 1N7KA 3GDTA 4IX2A 1OFEA 3LV5A 3W1RA 5CZTA 1H61A 1OK4A 4JX6A 4O4VA 1N55A 2YDAA 2ZZ2A 1YTKA 2ABBA 2A1YA 2DU2A 4KFPA 1K8XA 4O19A 3BVJA 4R33A 1VYSX 4A3UA 3ATYA 1EIXA 1X7FA 3NQGA 3P80A 1EP3A 1AW2A 3G1HA 3PS7A 2P1FA 1B4EA 2J9ZA 3M41A 5CZSA 3L0NA 4LY8A 3S9YA 4ORIA 4AWSA 3LI0A 1DQXA 1H50A 1FWTA 1S5VA 4QIUA 3SGUA 4RLIA 3W84A 5G4EA 5FEPA 3MUXA 1WOAA 1R30A 1G4PA 1FCQA 5L6UA 3STCA 5D04C 4DBEA 1TV7A 4ZQPA 5FESA 3MYOA 1W31A 4JYFA 3TQVA 4OBTA 3EX3A 1H1ZA 3DFTA 4ADSA 3TC6A 2CZDA 3QSRA 3CB8A 3A21A 2JK2A 4QNEA 1BKSA 3C0JA 4FO4A 4P61A 3C2FA 1V5XA 4A22A 4OHQA 4O52A 3A9IA 3DFQA 3LXAA 1THFD 4WQ6A 1UCWA 2V81A 2YZRA 4NQ1A 5EPDA 4Z1AA 3TX9A 4WY0A 2YSWA 3W7NA 3S1UA 2NX3A 1JCNA 1R46A 1FWNA 3GR7A 3LCXA 3W7MA 2WJZA 3QW4B 4WX2A 1TO3A 3LHTA 5G4WA 4ZVJA 2J24A 1Z42A 2Z0IA 1OYAA 3M1ZA 3PUDA 3AO0A 3RK8A 3WK3A 4UFKA 2CZEA 4LC8A 4WY0B 1KM4A 3NGJA 3NQCA 5HNRA 1EUNA 1GZGA 1C29A 2VKZG 4LUIA 1MO0A 1R2RA 1IXPA 1NSJA 1WA3A 3TSBA 5K9CA 2Q3RA 3T4CA 2A2IA 1FBAA 4UTMA 4HNNA 2G96A 1GOXA 4XWUA 4WOZA 4LS1A 1HFBA 4O12A 2PRLA 2R8WA 3GKFA 3MJYA 3G1AA 3GR8A 1OX5A 3B06A 1KFJA 1SZFA 3HG5A 4FIRA 2P0OA 2ZA2A 4GXMA 3S5OA 3OG3A 3MHGA 3O07A 3E96A 4O14A 4IPIA 1FCVA 1GVQA 2VEKA 2VFGA 3W7CA 3VE7A 3TJLA 1N8FA 2ZQ0A 4TO8A 4JICA 5F2IA 3LTPA 2ATSA 4LV4A 1Z41A 3QPZA 1O4UA 3S42A 1D3HA 4K7VA 1RZMA 3L5AA 3QF0A 2BWGA 3D0CA 3LX9A 1KM5A 3A24A 2A5HA 3QH2A 1YPFA 2JKPA 1F7BA 3W1QA 2DJLA 3O06A 3GDMA 4GUFA 3TV8A 4DBDA 3NPUA 2DZUA 1TRIA 4M6PA 5CSSA 1GT8A 3KFTA 3FYOA 3BPWA 1ICQA 1VYPX 3UZJA 1U83A 4HHPA 3ZWTA 3G0UA 3I7RA 1O94A 4FB7A 1A5BA 4ZMGA 1W5PA 4U28A 2QJHA 3C2RA 4U4MA 3T44A 4AHOA 3L67A 1LROA 2DZSA 1LRQA 1L6SA 2V9DA 2CU0A 5K4ZA 3W1MA 3EWZA 3P74A 4Q32A 1UB3A 3W7GA 1E51A 1BWLA 4GUJA 3UXAA 2VELA 2ISSA 3G1YA 2RDWA 3B05A 1YLVA 2WNNA 3O63A 4UMBA 5FEWA 1VCGA 1G4SA 3CIWA 4D2JA 3CEUA 2DZTA 3T78A 4MY1A 3UWUA 2AGKA 3S1WA 3QZEA 1YDOA 4FX7A 4Y90A 2GJNA 3OIXA 3NPXA 4PA8A 1I4NA 1J5TA 4EF9A 3EX6A 4LRSA 4X3ZA 1LBLA 5CZ0A 1TRDA 4BWLA 3NQ2A 5AN7A 1JVNA 1I2NA 3CC1A 2X1RA 3EWWA 4TX9A 4EVZA 3H53A 1K7EA 3BGGA 3TH6A 3GNNA 2ZRUA 2RH9A 3HF3A 3MWAA 4K8EA 3EXTA 4GBUA 1UUOA 4YXGA 5LKYA 2ZZ7A 5DBUA 4L4MA 2A4AA 3W83A 4WXYA 4UNLA 4BWLC 3G1VA 2ZA3A 5F2MA 2DZWA 1PV8A 3BW4A 3A23A 4HNVA 1HTIA 1YYAA 3W1AA 1GYLA 2YFOA 3HGOA 4Z08A 4E2DA 3TIMA 2JKEA 4PL2A 3NA8A 1K02A 4GUGA 3LDVA 3TKFA 4R34A 1F73A 3NDOA 3P81A 5FF7A 1TTJA 3RNDA 3O6CA 1QWGA 2RHGA 1QFEA 4M19A 5HULA 3VCRA 1A50A 5DXYA 4JIQA 3KRUA 5AB3A 1S3HA 3LHUA 2RDTA 1TPEA 1YDNA 3GKAA 2EPHA 1JUBA 1KV5A 2P10A 1M6JA 4QNWA 4ZQNA 1VLIA 4JY9A 2ZTKA 1EX5A 3A5VA 3DI0A 4NJKA 2FTPA 3PR2A 1W3TA 2E68A 1OFAA 5BOOA 1O5KA 2R94A 2C19A 3UYCA 4CQ9A 3CPRA 4MIMA 1PL9A 4M7SA 1PE1A 5FF0A 4BI7A 2E6YA 3KVJA 1I8JA 4O1DA 2A7NA 1OX4A 1M7PA 1XFBA 1SZGA 3BG5A 3QEZA 4DO6A 4LNYA 4X9SA 2WPBA 1XKYA 3W70A 4UFHA 2V5BA 1TTPA 3LI1A 5MHBA 5FF4A 5DCDA 4MFEA 1VH7A 1MZHA 3W7KA 2FQIA 2A7PA 4O54A 5CKSA 1XI3A 4CNNA 4RCXA 4JTSA 3NYZA 5HUPA 4O16A 2VFHA 1FWWA 4BF9A 5GVJA 3W76A 4IUOA 3L5LA 5LNWA 2C13A 1TMHA 4TIMA 4BFAA 5G1TA 3BARA 1OHLA 4GNJA 3NL6A 2ZZ6A 4KKXA 1ICSA 4M6VA 4MOZA 1W5MA 1KFEA 4QITA 1EA0A 1H7NA 4C1KA 2CWNA 1GJPA 1M5WA 4MY8A 4UR8A 2FLIA 1ICPA 1OFPA 3G8RA 4DPQA 4A2SA 2TSYA 3UWVA 1AL7A 3QPYA 1L6WA 4OQVA 4MZ1A 3I65A 4JTJA 3BLEA 3NZ1A 4UUIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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