4LVDA

Fragment-based identification of amides derived from trans-2-(pyridin-3-yl)cyclopropanecarboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 168
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
168
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 168
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lvdA02
3LM7A 3DAQA 3UD6A 1KBIA 4NU7A 5DY2A 3W73A 5LGZA 1ZJIA 4E38A 5C55A 2ZQ0A 3LI1A 2A6LA 3ABSA 2NUWA 4J9JA 3KFTA 1DJQA 2VFDA 3W7IA 3NDOA 3FFSA 4JGDA 1MSSA 3CPRA 1OFBA 3UWWA 3BG9A 3M43A 2UV8G 4CQ9A 1MZHA 1XL9A 1X7FA 4JY9A 1W5OA 4E0CA 2B7QA 1SZNA 4O57A 1TMHA 3WJSA 4Z1AA 3A22A 1H60A 1GWJA 3E49A 4WUIA 1LCOA 1OVDA 5T26A 3B03A 1OX4A 3W2KA 3E9AA 3LCFA 4DBDA 3P5ZA 3L2IA 3BVJA 4IXXA 3W7JA 3N9SA 2Y7GA 2QJGA 3UXDA 4DXVA 1JCLA 4O53A 4YWIA 1GQNA 1TPEA 1THFD 1X1OA 1DVJA 3I65A 1EX5A 1FCBA 4MY9A 1I8JA 3LCXA 3L66A 1PVNA 3G1VA 1K8YA 2ALDA 6ALDA 3G0XA 4NJKA 4UTJA 3DKJA 4DO5A 2ATMA 3T7VA 1EWEA 2J88A 3GDMA 1OFQA 2OT1A 3ZS4A 3QC3A 1CW2A 3B06A 4GUIA 3NZ1A 1H7RA 4IMEA 3HIJA 3MI2A 4XBKA 4RX0A 1A5SA 2BLEA 3OIXA 3GYEA 4ZVJA 4QQ3A 5SWUA 4ORMA 1MEHA 3W1LA 4OBTA 3KX6A 2ZRUA 3DXIA 3KVMA 1TJRA 4R33A 4ZZ9A 3G1FA 2FTPA 2WJZA 3HJZA 1OFPA 1SW7A 3GDRA 3DFTA 5HWNA 3P84A 4UMBA 3AO0A 3LRKA 4KFOA 3O06A 5EY5A 4JDYA 1FWTA 2O7QA 1NSJA 2VEKA 2DJXA 4POCA 5CGQA 1VHNA 3ZR4A 1OFOA 2QCDB 4Z0JA 4H3DA 3KXQA 3SJ3A 4UTIA 1VCGA 3MP4A 4QITA 2ZZ1A 3M9YA 3M44A 3S6DA 2WQPA 1KFJA 2D73A 2NWRA 2RHGA 4GC4A 3TXZA 5E1QA 3E12A 4TR9A 2B0MA 3UQNA 2BTMA 2ZA1A 3NQMA 1F7BA 4K6AA 2A21A 3G3MA 3VI2A 4MZ8A 1TPC1 1M7OA 4U4MA 4EOUA 4Y8FA 2ZCGA 5EL1A 5LNRA 2H3DA 4UFKA 3W83A 5AC6A 3PB0A 4IMFA 4MIMA 4HPJA 4QIUA 3EX1A 3G3DA 4NJGA 4O15A 1W3NA 3WJWA 1H61A 3HF3A 2PE4A 4BI5A 4NXKA 1OHLA 5AHIA 1LLWA 3EB2A 5A5WA 3HOJA 4A2RA 1SW0A 1GEQA 4KFNA 3W22A 1MEWA 3PM6A 3UWVA 2NXHA 2QAFA 1HG3A 3VFLA 3LCLA 3MHUA 5HUPA 4WY0A 3K30A 5LGXA 3PAJA 3HPXA 1FBAA 3P82A 3TXVA 3INPA 2J9ZA 2E09A 3MW7A 3O6CA 5FF2A 3TSBA 4UNLA 1P1XA 3L65A 1W1ZA 2VFIA 3NQ8A 3I7QA 4RR4A 1W3TA 4DF2A 3PUOA 1W5PA 2J27A 2H8XA 1KFKA 3ABQA 5G2IA 4UMCA 2LLEA 3ZWTA 4WXYA 2A1YA 4HHPA 4PODA 2GJLA 1LORA 2ISSA 2FPVA 3G24A 2Y89A 3GR8A 1ALDA 2PCQA 2ZRZA 3W1RA 4FNPA 3DFOA 4IJBA 4JICA 3GNNA 5EPDA 4N02A 1DV7A 2WSQA 2GPTA 4ZQCA 4O4VA 1ONRA 2NWSA 3DHDA 4FO4A 2NX3A 3TA6A 3IV3A 4PL1A 1IXOA 1QPOA 2C18A 2CFFA 3PUEA 4CCDA 1F76A 1GTHA 1XCFA 2E1DA 3PC0A 1OYCA 5J5RA 5TBOA 4Z08A 4FX6M 1EP2A 3NEVA 3BLIA 2EKCA 1IF2A 2DP3A 3PG9A 1GZGA 4UUIA 4FXSA 1OYBA 4PC8A 3TIMA 2QCFA 1SSDA 4LT9A 1K02A 1JCJA 3QJAA 4RV8A 4JYEA 4M5PA 3G18A 5DCDA 5EBUA 1KM1A 5IBXA 1EUAA 4CLMA 3S1WA 1JR1A 2RDWA 3EKZA 1R2SA 2A6NA 1H1YA 1X1ZA 2X1RA 2X1UA 1A50A 2YYUA 4AHQA 1GTEA 4GFSA 3OBKA 2X1TA 4O12A 3SW6A 2A5HA 4FNSA 2JGYA 4R34A 3UWYA 1VRDA 1ME9A 1Q6OA 4JTUA 4B5NA 1FXQA 1J4EA 3GXPA 3GLCA 3WK0A 3WJXA 2QCCA 4O17A 1P5BA 2ABBA 2X30A 4LRTA 3LTYA 4A2SA 1ZAJA 3MBDA 1JULA 1YXDA 3A24A 3KHJA 4AXKA 3E0IA 1F05A 3A23A 1JCYA 3GZ3A 3FKRA 1B3OA 3NPWA 3L0GA 3M0ZA 3GKFA 1W5NA 3IIOA 3C2FA 3NR0A 3QQ0A 4RCXA 4NNAA 4R53A 4M19A 1VCVA 1A5AA 1ZNNA 2YSWA 4O1CA 4DO4A 3BGGA 5D33A 1P0KA 4N2YA 2YZRA 4JR5A 1T96A 2Z0IA 3NA8A 1QMLA 3W7QA 1AG1O 2QAPA 5CPMA 3RF9A 3PWAA 3TDFA 1VLIA 3HGJA 3NZRA 4QJ1A 2A7PA 3U2OA 1UJPA 5DY3A 1L6YA 5KZDA 3PS7A 2QUVA 3W86A 2C14A 2TMDA 1UASA 4NX5A 4AWSA 3TJXA 1X6UA 1PV8A 4Z0SA 3G1XA 5F4SA 4JTLA 2DZPA 4TO8A 1CI1A 4AAJA 3QSRA 3V1PA 1DQWA 2NUYA 2PRMA 3DFNA 1QR7A 1OFAA 2YFNA 2RH9A 1ME8A 3NL5A 5I3JA 3WFAA 1HTIA 4LRSA 4UR8A 5AHFA 3EWYA 4S1FA 2XN1A 3LV6A 4NXSA 2WO5A 2Z2UA 4DPQA 3U6WA 2YCEA 4XTIA 5F2IA 2G5WA 1F5ZA 4DQWA 2ATSA 3NXFA 3W87A 4X2RA 1RZMA 1IXPA 1WX0A 4G1KA 5EYWA 2DORA 3DFSA 4NZJA 3S9YA 2WKJA 1TPB1 3TQ0A 3SY5A 1I2QA 2JBMA 1TREA 3B8DA 5I3KA 4UTUA 2NLIA 4DEFA 1BTMA 5AYZA 2DZUA 3A5FA 2CLMA 4PL2A 3WK2A 3W1QA 3IIZA 5TIMA 2V81A 1M6JA 1E51A 4EIVA 3OVPA 1ZY9A 3LXCA 3HB9A 1O60A 4JYFA 2QR6A 1PCKA 2J9XA 2NXGA 1VZWA 5AHNA 1LBLA 3A5VA 4O52A 3M5XA 3HBLA 4UFLA 3TCEA 6TIMA 3F1QA 4RZ6A 3BGJA 3MI6A 2QDHA 3M41A 1LM1A 4AF0A 4I7WA 2E6AA 4CCEA 1SQ7A 3O05A 1I2NA 5K3VA 3GXTA 3C56A 2DJLA 3FEMA 5IM51 1ICSA 3KVJA 3TKFA 4JN6A 1QO2A 1XBVA 1VHCA 3GVGA 3GAKA 4QM1A 3SI9A 3TW6A 2E5DA 4FNRA 5L6UA 4ADTA 5ABTA 4YXGA 3W84A 3MYOA 1W31A 1AL7A 2DU2A 1NVMA 3NQVA 1JJKA 2CW6A 3LCIA 1YYAA 3LRLA 4EF9A 4AHPA 2OJPA 3OHIA 3PB2A 3NQDA 2V5LA 1FUYA 2NUXA 4YCPA 3QFEA 3T40A 2GQAA 3KVLA 3PSVA 1TO3A 1D9EA 2NXIA 4IMCA 2Q8ZA 4UTTA 3LRMA 3NNTA 1RQBA 2EHHA 3P74A 4ZQPA 1YDOA 3M5ZA 2AQWA 3H55A 1MO0A 1PHWA 2H90A 4OWGA 4JTHA 2CU0A 1G4SA 2V9DA 4N9EA 1TPFA 1TV5A 5E93A 3NO5A 5G2HA 5K7JA 3RU6A 3P81A 1GG0A 4DO6A 3B4UA 3MMTA 1U5JA 3O63A 3TSMA 1AW5A 1LBMA 4YLWA 5D03A 3NPUA 2QCGA 3MWAA 3S8HA 2JKAA 3LHTA 3W7PA 4WZHA 3HG5A 2G95A 4JXCA 3NQCA 4JS3A 3JRKA 2NX1A 1JCNA 5D2XA 5K9CA 3DGRA 4CQAA 1H7WA 3UWUA 3D0CA 4UNKA 7TIMA 3MBFA 3EWBX 1PCWA 2FQIA 4UFMA 4LC6A 3W23A 3W7GA 5AC7A 3N3MA 3LHYA 3NVTA 3B0UX 2XN0A 4XUGA 4XBSA 2GJNA 2ZZ7A 1BWLA 4PEKA 2Q3OA 5G1TA 3A9IA 1VCFA 3EEGA 4LC8A 3TJLA 2RKXA 1W5MA 1OX5A 1LBFA 1GPWA 3G1AA 3FKKA 1WDWA 5C6MA 2R91A 3U8GA 4LS0A 2QUTA 3NPVA 3LOTA 1LP6A 1XC4A 3Q2DA 3RMJA 3UPWA 2BX7A 1SO6A 5CG7A 3P80A 5EMUA 1FWRA 3FS2A 5FESA 5HNRA 2W6RA 1TV7A 3ATZA 3T55A 3CM4A 1S5WA 5F1UA 1GYNA 1QCWA 2EGZA 4IPIA 1M5WA 4LVDA 2ZZ4A 1KV5A 2E5CA 1TTPA 3FYOA 5KINA 3EX3A 1RR2A 4LUIA 1JRBA 4Y9AA 1F2JA 1KTNA 4JDBA 1XUZA 4JTKA 4JEQA 4MYAA 1IGSA 3G8RA 3L9CA 3W70A 3OA3A 2QJHA 4O19A 4FXRA 2RFGA 3TC7A 4JTTA 3CU2A 2HMCA 5HQEA 1Z48A 4IUOA 4K8EA 2E6YA 4W9TA 3NQ7A 1I45A 5K4ZA 1P4CA 1J2WA 3R89A 1QO5A 1K7XA 1QOPA 5F1VA 3T44A 3NQ6A 2YW3A 3ABRA 3TFCA 4O14A 1JCMP 3EXRA 4NJIA 3C61A 2Y62A 4BFAA 3TQKA 2WPBA 3CB8A 1HO4A 5HR7A 1VGAA 2GUUA 3EX6A 3ELFA 4GNJA 4ORIA 3Q94A 3ABOA 3V75A 1PHQA 4CQ8A 4KFPA 2V5BA 3KAOA 4Q4KA 1M7PA 1Q45A 1SO4A 2Y85A 2QF7A 4RZ5A 1EB3A 4I7UA 3FA5A 1ICPA 4LW7A 3FLUA 1HUVA 5TQLA 4ZL1A 2AGKA 1QNVA 1O5KA 3FYPA 2FPYA 4GJ1A 1LLZA 1LTDA 1PS9A 4Q32A 1LDCA 2ZRWA 3QW3A 4UTLA 5C2XA 3IVSA 3GDLA 3M7WA 4D2JA 3PBWA 1C9DA 4M7TA 3THQA 4LNYA 2A0NA 4JTIA 1YLVA 3M47A 3HG2A 3STGA 3P8IA 1AK5A 5AHMA 3QF0A 3QZEA 4X9SA 4O11A 3MHFA 1RQHA 5KITA 3L5AA 3UY8A 2C3ZA 1ICQA 5FF4A 1EP3A 3G1HA 3HO8A 3W7RA 1RV8A 4GRSA 1Q6QA 1W3IA 1EIXA 2YYTA 3WK3A 1B4EA 1TTJA 1WOAA 3DU0A 2E68A 1R30A 2V8ZA 1W37A 3TX9A 4IGHA 1FX6A 3SZ8A 5LSMA 5CZJA 2ABAA 3F03K 1WBHA 1QPRA 4UFJA 4O0KA 2OMAA 3HG3A 3B0VC 1A5CA 3B04A 3PR2A 3PVFA 2DZXA 1SR9A 1KTCA 3LERA 3NQAA 4WOZA 5FEZA 1MXSA 3RNDA 4ICNA 5BRBA 1RD5A 4NQ1A 3NQGA 5AOUA 2B7NA 3N34A 3GDTA 3C2VA 3LDVA 3UPBA 1VLWA 1VYPX 4O1BA 2GQ9A 1SPQA 5F2MA 4QNEA 1YADA 2J9YA 2HS6A 4IX0A 3IEBA 2R14A 4L4LA 2A7RA 4LS2A 4S2CA 2ZA3A 4A3UA 2QCDA 4FNTA 3T78A 5C54A 1PIIA 2GVLA 1I4NA 3TR2A 1UBSA 3BLFA 3W74A 3G1YA 3TC6A 3UY7A 4ZMGA 2OZ0A 3GKAA 1BKSA 4MYXA 3R2GA 3SGZA 3QMSA 2VC6A 4Q33A 3C6CA 1KM4A 4Y6GA 1TPUA 4LWWA 3A21A 1V5XA 4O54A 3W71A 4QNWA 2YPIA 3EX4A 3B0PA 4XKYA 1G6CA 3SR7A 3LCHA 3MO7A 1VS1A 4M6QA 3QW4B 5G5IA 4ZQMA 1A53A 2FB2A 4MKNA 1XBYA 4CNPA 4Z1DA 4BI6A 5D02A 4WX2A 1R47A 2OCZA 2FDSA 2O7SA 3LBMA 3W1UA 3GAYA 2ZZ6A 3BK0A 1H62A 5KMYA 3C0JA 1K8ZA 4IXHA 2A4AA 4HPXA 2ZFAA 2R94A 4FF7A 4O28A 3CWNA 5HWMA 1R46A 3NGJA 5LNVA 4FEZA 3W1NA 4H6KA 1KTBA 1TTQA 3UWQA 2ZZ3A 5LNWA 3QMRA 1K7FA 1FDJA 3R8RA 4WXZA 1H7XA 2JGQA 3GB6A 5D2TA 3W1MA 3PG8A 3CIXA 1VYSX 1B57A 3QH2A 3GX9A 3KOFA 4OQVA 5IBXC 2H8ZA 3NYZA 2DZWA 3KVKA 1YTKA 3W1PA 4JNMA 2BXVA 4OV4A 2QCNA 1FWNA 3QYQA 4LVGA 2WV8A 1OF8A 5G1YA 4OV9A 3GXNA 4LTSA 3G22A 5U4NA 3C3NA 3EWZA 2F7FA 5DLCA 2VFHA 1G4TA 1KM0A 2EPHA 3AJXA 1VJIA 1W54A 1PE1A 1WBJA 4C1KA 3IGSA 1ZAHA 4AF0B 5D09A 2XFWA 3S5OA 4HNVA 3C52A 3NG3A 5AYXA 1SSGA 3I6RA 1W0MA 4JX5A 3TE9A 4BWLA 1WQ5A 3HG4A 4HIBA 2Q8LA 1Q6RA 3C2RA 5AYYA 2ZA2A 3S1UA 2W79A 3IVTA 2EAWA 2FFCA 3MP3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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