4LVFA

Fragment-based identification of amides derived from trans-2-(pyridin-3-yl)cyclopropanecarboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 165
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
165
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 165
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lvfA02
4RXFA 2B4GA 3M44A 3A23A 4WQ6A 1UCWA 4GUIA 4RZ5A 3CHVA 1TTJA 3E96A 4DBEA 2FFCA 4JXCA 2ZDRA 4FNRA 2VKZG 1FDYA 3NQ6A 5AHLA 1QPQA 4DF2A 4FO4A 5HULA 4WOQA 4BI6A 3PF3A 1G4TA 1A5SA 4NUWA 4LTSA 2R8WA 2JK2A 3TA6A 4GNJA 3A5FA 2YDAA 2FPVA 4FB7A 1S3HA 1WBHA 3LOTA 2Y7FA 3S6DA 3E49A 2E1DA 3C61A 5FF4A 4K7YA 2C13A 1UUMA 1DBTA 1LLWA 4O12A 4XBKA 2R14A 3GR7A 4FIRA 1WOBA 3NO5A 4LY8A 1DORA 1C8VA 3W74A 4FEZA 1TPH1 2RH9A 4WXYA 2AQWA 4ZQMA 1JJKA 5HUPA 4N6EA 1PHWA 2X1SA 4LUIA 2ZRYA 1MO0A 2ATSA 3HGRA 1ME8A 5DXXA 3BLEA 4KKXA 3S1WA 4A2SA 5CZJA 3UWUA 3M7WA 3Q37A 3BARA 4ZZ9A 3GR8A 4UTHA 1FY6A 2NX3A 1Q6LA 3TNOA 1H7PA 4LVBA 3M5ZA 1ALDA 3RLVA 2P10A 4H6KA 1VYRA 3HMJG 3IVSA 5LNRA 4UTMA 1O5XA 3NXFA 1QWGA 3B4UA 3FJLA 1OF8A 1H7RA 1P0NA 1GEQA 3KVKA 1FWNA 3QRHA 1LOLA 1OG0A 4X9SA 3LI0A 2OX1A 5I3HA 1K3UA 4GFSA 3STEA 1NSJA 4OE7A 2YW4A 3OEXA 3NL5A 3KOFA 1QOPA 3EX4A 1MEWA 1UBSA 3QW3A 4FIQA 1YDNA 1A50A 1TPFA 2C19A 1H7OA 1YPIA 4DELA 4N9EA 3PULA 3G0SA 2EKCA 1UB3A 3ZWTA 4TMBA 2YZRA 2I1OA 5FF3A 1AW5A 4ONVA 3LTPA 4NX0A 4MKNA 1WQ5A 4UNKA 5D2TA 1OYAA 3TW7A 4LV4A 3W3OA 3JR2A 2LLEA 3FLUA 4CNNA 1K8XA 1TV7A 1T0OA 1PHQA 3GLCA 3W1TA 4JTTA 3P5ZA 2Z2UA 3F1QA 1I2OA 1TJRA 3TK7A 3GDMA 2C18A 1U5JA 1EP2A 1BWLA 3MO7A 4MFDA 1FCQA 3UXAA 3W75A 4ZQOA 3TSMA 3L68A 5F2GA 2NV1A 1K03A 3UPWA 2DZUA 3C2EA 3MMTA 3N14A 3QPZA 4M5PA 3STFA 3NAVA 1QO2A 1I4NA 1XUZA 3N2XA 1I2QA 1M6JA 3NM1A 4Y90A 4AHPA 3L66A 2B7QA 1IF2A 3N73A 4K36A 5EA9A 1EB3A 2CFFA 3B0PA 2PCQA 3PBUA 4A21A 1W1ZA 4OGZA 3OHIA 4M19A 4O4VA 3GNDA 1X8FA 5DBUA 5CZ0A 4JX5A 3Q58A 1F05A 1SO6A 1WYIA 2V30A 5AHFA 2V2HA 5AYXA 1MZHA 3FS2A 3LHZA 1JCYA 1FWSA 1LROA 1C9DA 3JS3A 4JX6A 1M5WA 2C1HA 3L5LA 4GWEA 1JUBA 3IVUA 5LGXA 1TQJA 4UFMA 3TFXA 3QSTA 2WV8A 2KZHA 1A5BA 3SGZA 1RQBA 3W1MA 3UQNA 2PE4A 3GAKA 1NVMA 3P61A 4N4QA 4QSHA 2V2CA 3T78A 1SZGA 1SW7A 4K8HA 3O8AA 4I7WA 2V82A 4H4IA 3QMSA 5K4ZA 3B04A 4FX6M 3CM4A 5F1UA 2XFWA 4DXVA 3VKJA 3NL3A 4LU0A 3HPSA 1RQHA 1YXDA 1L6YA 1F5ZA 2X1RA 1SU5A 1KLYA 4UMAA 3LV5A 4N9DA 4JY9A 5HWNA 4CNPA 2RHGA 4KFNA 3FIGA 3RFAA 4NXKA 1XL9A 1VRDA 4BWLA 4Q4KA 4O4WA 1W3NA 4BR1A 4GRSA 3TQ0A 1F6PA 3HPZA 3F4NA 2ZCGA 3STCA 2HTMA 2XN0A 2ZZ5A 4O14A 2F84A 4NQ1A 5D03A 3MYOA 3R8RA 3I7SA 1XBVA 2RDTA 4JD4A 2BXVA 2DU2A 3EXTA 2PRLA 3IRDA 4WD0A 3TH6A 5LKYA 1KBIA 1L6WA 4UFLA 3CQ0A 3HGSA 2ZRUA 5F4WA 2ABBA 4BI7A 5AN7A 5LSMA 1D9EA 2ZRWA 4A29A 4JTJA 1X7FA 1FWTA 4UR8A 4RCXA 1TPB1 3BVJA 4QNEA 5IBXA 1KFLA 4OV9A 3TC7A 4WZHA 3UZJA 3T55A 2BWGA 4EF9A 1KM3A 4N2YA 4Q32A 3MP3A 2H8XA 3LLFA 1KA9F 3TW6A 4NJIA 2YW3A 4AWTA 4XWUA 3IEBA 1FBAA 2FB3A 1Q45A 3KVMA 1G4SA 3R13A 1GTHA 4IPJA 1N8FA 2RDUA 1GZGA 3U6WA 3W1RA 4NJHA 3HGJA 5I3JA 1H61A 4MUZA 3FKKA 1MEIA 2ZA1A 4HIBA 4Z1BA 1NF0A 1XDLA 4O19A 3QC3A 4ICNA 5C6MA 1VPXA 1FXQA 3FYOA 5CSRA 3UZ5A 2BTMA 3GIYA 3R89A 3B06A 1YTEA 3A9IA 4MY9A 3B0VC 4NJKA 1PL9A 1YTKA 4Z0JA 3UWZA 4AH7A 2W79A 3BLIA 1I2RA 2JKEA 4MZYA 4O50A 5AC7A 3W7RA 1M7OA 1XBXA 1KM5A 3M16A 4BF9A 1F7BA 5C5YA 1NFBA 4UIOA 1XI3A 1J2WA 2VOMA 4W9TA 1L6SA 1AL8A 3LV6A 4JGDA 1N55A 2WSYA 1QCWA 2WQPA 2VELA 1GQNA 2QCNA 3UYCA 2QCFA 4NT0A 5K2ZA 2G97A 3TV8A 4FXRA 1QMLA 2OMAA 1DQXA 5CPNA 3DFOA 3GKAA 2CLOA 4JTSA 2J9ZA 1AMKA 4FXSA 4XTDA 1KFEA 1H7NA 3QFEA 1JUKA 2H3BA 4ADTA 1Q6QA 2JKPA 3LRLA 3QSRA 2FTPA 3SSJA 3TDFA 1W0MA 4MPQA 3RNDA 3W9ZA 3ANYA 3HPXA 3TIMA 3DENA 3P82A 3OVQA 4TO8A 3Q94A 3R12A 3BO9A 1QR7A 4PL2A 3IVTA 4GUJA 2HSAA 3BG5A 4JIPA 2R91A 1U83A 4AXKA 1W5NA 2ATMA 1LBLA 4IUOA 3W22A 5J5RA 2G95A 1K7XA 4UC5A 1NF7A 2Y6ZA 3FA5A 2PRHA 1SO4A 2PRMA 3TE9A 3EX6A 3QMTA 3VCRA 1H5YA 1O95A 3OG3A 3DU0A 1JCXA 3W1QA 3FFSA 2CWNA 1OFEA 1AG1O 3Q2DA 3W2UA 5BRBA 1KM0A 3WJSA 2DJXA 3NL6A 4UFIA 2NX1A 3TAOA 5LHFA 3DFSA 1ICQA 3NQ8A 3G18A 3KXQA 3KRUA 3OVPA 3C52A 4HNNA 3PB2A 5DN1A 4O54A 3QJAA 3P80A 3G3DA 4JYFA 3NA8A 4DPQA 4CCCA 1EP1A 3EWYA 1EWEA 1TPUA 1PVNA 1J4EA 4HPXA 3NG3A 4D2JA 2ZQ0A 4AAJA 2NXGA 4EVZA 4JTKA 3INPA 4ML9A 1KFKA 4JX4A 3F4WA 4JTUA 3N19B 1FCBA 1IIGA 3TQVA 3TMLA 3U8GA 2J6XA 3BK0A 5EY5A 1W8SA 3E0IA 3YPIA 4O16A 4GE8A 4UTJA 3L5MA 1EEPA 4O57A 4MY8A 2RKXA 3MBFA 5HJLA 3S5YA 5D37A 3TR2A 4Y96A 1OFDA 1QOQA 3W72A 3L9CA 3ABOA 4NU7A 1PCKA 2GOUA 3EKZA 4YL2A 3QQ0A 1I2NA 1A5CA 1L2UA 3CLMA 5AHMA 4O28A 3S1UA 5LNVA 3NR0A 3TSDA 1XM3A 3LXBA 3W7JA 5D33A 3OBKA 3RK8A 3MW7A 1VGAA 4Z08A 4GXMA 4UFHA 4OHQA 2A21A 2DZPA 2DORA 3UNDA 1KM4A 3V1PA 2WKJA 1QNVA 4ZL1A 2UV8G 4IWWA 4O1BA 5D04C 3MP5A 1FXPA 2EHHA 3I7RA 3LCGA 4U4MA 4MY1A 4K6AA 3LERA 1G69A 3HBLA 1P1XA 3IIZA 1VCVA 2ISVA 2YCEA 4LW7A 4AB4A 4UNLA 3MP4A 5D05A 4NXSA 2AAMA 5LHEA 5D32A 5HWJA 4Z1DA 5KZMA 2Y7DA 1IXPA 1W3TA 1O60A 5A5WA 5D2XA 4ZQNA 3UY7A 3LM7A 1HO1A 3QQ1A 3U2OA 1UJPA 3OA3A 5K7JA 3O6DA 1F76A 2GQ9A 1VHCA 4JTHA 3C3NA 4MZ1A 1LBFA 6TIMA 3UWYA 1C29A 1OX5A 3N2MA 2ISSA 5J5DA 5U4NA 4NVTA 3FEMA 3EWXA 1SZEA 4IMEA 1KFJA 2H90A 4JEQA 3HG4A 1VR6A 2ZRZA 3CWOX 2YPIA 1SW3A 5CGQA 3LCLA 1RVGA 2Y7EA 2CLIA 4ZQCA 1A5AA 1PE1A 3EWUA 1LM1A 4UTTA 1XBYA 3G3MA 3TU9A 1TTIA 1OVDA 2FIQA 4MLJA 5EMUA 5LNSA 4LS0A 2V81A 3HB9A 1GYLA 2CZFA 3SY5A 2WNZA 3FKRA 3G0UA 1EWDA 2GPTA 1FDJA 2GQAA 3MWAA 3PSWA 2TPSA 1DHPA 3L5AA 4N9BA 5G1YA 4O1AA 4ADSA 2J27A 3V75A 1GT8A 5DY3A 3HQ1A 2CZDA 3GKFA 5F2MA 4RZ4A 1VJIA 5GVJA 1R2RA 3RLUA 5FF2A 3P7YA 1P4CA 4KFPA 2P0OA 5IM51 3HO8A 4NNBA 4K7VA 1ICPA 3GXPA 2J9XA 3UD6A 2QDHA 3EXRA 5CPLA 4PH6A 2O7SA 4UR7A 1EIXA 1XFBA 2Q8LA 1W37A 3KAOA 2VENA 1D3GA 4IXXA 3STGA 4S2CA 4TMCA 1EUNA 2A5HA 2GVJA 3PVFA 1F2JA 1JUEA 1I2PA 2EGZA 1T96A 5AHNA 3BW3A 4C1KA 2QUTA 2HMCA 1W56A 4OU1A 4X22A 3G1DA 4WX2A 3C2RA 4LS2A 1GG1A 1GVSA 1Q3NA 1SO3A 3TCEA 4IJBA 1TCDA 3HJZA 3C8FA 3P81A 4FHAA 1GOXA 5DCDA 4I7VA 4I9AA 4PC8A 1KM2A 3LTSA 1RZMA 3S1VA 2DZVA 4O1CA 4DEFA 4NZFA 2C3ZA 1R2TA 2RDWA 4QIUA 3NQGA 3O07A 2ZBTA 4YMZA 1HO4A 3BW2A 2VXNA 4O0KA 1VYPX 1AK5A 1J5TA 1W5QA 4UTTC 4R7JA 1DQWA 4HNUA 2ZYFA 1JRBA 1Z41A 3TUUA 1K7FA 2JBMA 2P1FA 2Q3RA 4RV8A 4WY0F 3O15A 2J24A 2NXHA 2FB2A 4QNWA 1GYNA 3W7MA 5D02A 3O6YX 3KRSA 1LZOA 4JDBA 4K39A 4HSNA 3EWBX 4E2BA 1VS1A 3JRKA 3THAA 2TYSA 3L67A 2QJHA 3LHUA 4JN6A 4XQ6A 3W2JA 4G1KA 3BLFA 4QISA 4MFEA 3UPBA 1KTCA 4FNUA 5AC8A 3LCFA 2YYTA 3ATZA 3M43A 1GVFA 2QCDB 1IXNA 1G4EA 2E5BA 4IGHA 4DQWA 3W23A 3W73A 3BG3A 4N02A 3P84A 3UWVA 1W3IA 2QJGA 2GUUA 3M5YA 4ALDA 1WX0A 2YYUA 2VFDA 2CLKA 3FOKA 2G5WA 2ZA2A 1OABA 1X1OA 3EEGA 1WDWA 1QFEA 1RR2A 1ICSA 3CB8A 1VLIA 3I68A 4NJJA 4O0ZA 5DLCA 5T26A 5DELA 3W71A 4C1LA 3LHWA 2E6YA 3SECA 1N7KA 3EX2A 1IXOA 1KW1A 2DZTA 3AJXA 4LC6A 1BKSA 3QH2A 2CLEA 3KVJA 4LOCA 4DPPA 1YDVA 3L21A 3PWAA 1LOSA 3LBMA 4GUFA 4TR9A 4QQ3A 4DO4A 3MI6A 2RFGA 3NYZA 2H8ZA 1QO5A 5AFDA 3W7CA 1OF6A 3G1HA 2NUYA 2C16A 4BK9A 3NQMA 2Y7GA 1EX5A 3ABSA 2G96A 3EXSA 1B4KA 4HNTA 1K8YA 4FNSA 5HR6A 2QJIA 4IMCA 4HN4A 1W54A 2QCDA 3IV3A 3B05A 2Y85A 4N6FA 3EX3A 2ZZ1A 1UASA 1XCFA 4XZ9A 3S42A 5KINA 3PUDA 3QMRA 3IGSA 4MJZA 3TMQA 5DBTA 4JY8A 3VNDA 1GVQA 4Z0SA 3PBYA 1L9WA 4ZMGA 4NNCA 1CW2A 1NAL1 2QAFA 2Z6JA 3DFTA 3NPXA 3B0UX 1AW2A 3MHFA 2J9YA 3HG5A 3IIPA 4FF7A 1JQVA 3QZEA 2YFOA 1B9BA 3M6YA 3TKFA 3TXZA 2FLIA 3G1VA 2PURA 3P74A 4GC4A 2VEKA 1GVOA 1LCOA 4MLRA 3P67A 3P8JA 1H50A 3C2OA 5CZTA 4WJEA 3FYPA 4FNQA 4AEOA 3T7VA 2X2GA 3GDTA 4M6VA 3WK0A 4KWVA 2VFFA 4BFAA 4J9JA 2H6RA 5EKYA 4HKPA 4N9CA 5FEWA 4XBSA 3WJZA 1KFBA 3H53A 3W7OA 1OFOA 1T8XA 2WSQA 5FESA 1ME7A 2ISWA 2E09A 3MJYA 5CPMA 1YADA 4UUIA 1AL7A 1LDCA 4EWND 7TIMA 5SWUA 2CW6A 2VFHA 1R46A 2GQ8A 4LVGA 3I65A 2V9DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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