4LX4A

Crystal structure determination of pseudomonas stutzeri endoglucanase cel5a using a twinned data set
Total Genus 111
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
111
sequence length
322
structure length
322
Chain Sequence
DWPVNDEGGLALHGVNISGAGFAPHITPGKNGTHYFYPEKKHFKYYADQGIRLIRFPFIWERVQHSLDSGLNFDQIRLLKKTLDLAAQNGQKVILDMHNYGRYHGELIGSSKVPYEAYASVWRKLAERFKGHPGLLGYDIMNEPHSTVGLWPGAAQAAVDAIREVDDQTLIFIEGERWSSAYHWPLVNANFLINDPADRLIYEAHLYFDDDFSGKYMAQTSRNIDPMIGVERARPFIEWLQKHGQKGFLGEYGIPDDLPEAAQAMDNLLAYLNDNCVPSAYWAGGPGWGTYKLAIEPRNGKDRPQMELMRKHLANDCTAIGP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the Pseudomonas stutzeri beta-1,4 endoglucanase determined at 1.6 A resolution using a twinned crystal.
rcsb
molecule keywords Endoglucanase(Endo-1,4-beta-glucanase)protein
molecule tags Hydrolase
source organism Pseudomonas stutzeri
total genus 111
structure length 322
sequence length 322
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2013-07-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4lx4A00
2BY2A 5ABGA 4UQCA 3VIFA 4QFUA 1JZ2A 1KWKA 3TP4A 1TMQA 1PX8A 1CYGA 1E6XM 2C7FA 4FK9A 1J12A 3CGTA 4J28A 1V3HA 3NSMA 1OD8A 4XB3A 1G1YA 4D6DA 2WK2A 3OBAA 2ZICA 3EDFA 4TXEA 4UOJA 3WD3A 3SCTA 3W28A 5CLTA 1BAGA 4PEEA 3U5UA 4UFIA 4TVCA 4BS0A 1HJWA 1CBGA 3VGEA 1YQ2A 1UH3A 1H3GA 1FH9A 2XGIA 2DPEA 5LA0A 3HU7A 1A47A 3AHVA 1IZJA 4EAMA 4WIWA 3WF1A 1UKOA 1ISWA 3AS1A 4QLKA 4JIEA 4AZCB 4V27A 1UD8A 3VPLA 1H2JA 3QOMA 3CUFA 4JL1A 4QCEA 1E6QM 3WD4A 2VR4A 4GZIA 1BGAA 1S46A 3A6OA 3GZAA 1E73M 5IHSA 4FMVA 1VBUA 1QI2A 1VFUA 5FOOA 2W92A 2VJXA 3WUFA 1OT2A 4PMNA 2D1ZA 5D4YA 3W53A 3II1A 1WDPA 3PZQA 1C91A 3NDYA 4UQDA 2WLZA 1MW1A 3CH9A 4JHOA 1EQCA 3EMZA 1V3IA 3W29A 4CGTA 1KQZA 5DO8A 1A3HA 1J0KA 1V6WA 3WEOA 1VIWA 5DMYA 4KRUA 4AZGA 3L4TA 1US2A 1NQ6A 2J25A 5A8QA 1M7XA 1ISYA 4D71A 2DDXA 4C7GA 2WC3A 4W8LA 1EO7A 4AXNA 2BHUA 3A4XA 2WMKA 1SFSA 3UEQA 4IUGA 5GNZA 2VZVA 4NSBA 6CGTA 3GH4A 3OGRA 5AYIA 1F4AA 1PZ2A 3CZEA 1UHVA 4H41A 1CGYA 1G5AA 4OIFA 2GK1B 2DSZA 3SCWA 1XSIA 2DH3A 5GQBA 1NOFA 2J7FA 3ZQ9A 3AJ7A 3ECQA 3AIBA 4IPNB 5A3HA 4YN5A 1IT0A 2B31A 3CTTA 4AD2A 3CIVA 1J9YA 3ZR5A 3W38A 1UR8A 3WIJA 4L4OA 4W85A 1WCGA 4MNKA 1G01A 2EJ1A 1TG7A 1Q6GA 3VMPA 1E40A 1NARA 4AYSA 1K9TA 2E8YA 2J47A 1QBAA 8A3HA 3ZJKA 2FGZA 2TAAA 2Y24A 3BGAA 3EDKA 1HVXA 1UH4A 1NWSA 1UQYA 5LA1A 4BQ4A 1OGSA 1HT6A 1V02A 3FAWA 4P7RA 2OLHA 2QF8A 1BQCA 3UG5A 4TVUA 3WF0A 1KCLA 3L4YA 4NF7A 3WFLA 1BSIA 2BXYA 4OUEA 4P8UA 1DWGM 2PWFA 3KE0A 3SCRA 1UWSA 1PEZA 4KWUA 4MNJA 1JXKA 4URIA 3VDHA 3PZTA 1V3LA 1ZS2A 5CQ1A 4Z2JA 4UR9A 7TAAA 5CPQA 7A3HA 5CLWA 4GZEA 1LQ0A 2QHAA 5A1AA 3CBWA 1MVYA 1UWIA 5E6YA 3WELA 4B15A 4IPLA 4AIEA 3BC9A 1E3XA 2XFFA 3W0KA 4TTGA 4D6CA 3WMCA 2AAAA 2J78A 2WMHA 2GVYA 3VD9A 1EIBA 3MUIA 4HMEA 1JD9A 4ZENA 3EDJA 3W27A 3TOPA 3GXFA 4QLLA 3M46A 3WNLA 3GH7A 3OG2A 4ML4A 4W5UA 3VX1A 1N82A 4MNLA 3FNDA 5BXPA 1CXFA 3VIKA 1HF6A 1CLXA 4M1RA 3BXWA 1KR1A 1LG2A 2JEQA 4CCEA 2F8QA 1G94A 1BPLB 4C7DA 5FL0A 3AIVA 3WF4A 1XHGA 4JFTA 1XD1A 4H8UA 4F79A 1AVAA 3WD2A 1GNXA 3MMWA 2YOCA 3PZVA 4LXFA 3T0DA 2GJXB 1LF1A 2OWXA 3UR7A 5BRPA 5BXTA 3AHXA 1M01A 1WZKA 3OLGA 2WANA 5HPCA 3ARTA 2VQUA 1NWTA 1XV8A 4AWEA 4M82A 1FH7A 2X8RA 1UYQA 1WDRA 3S2CA 1C90A 4MNMA 1HP5A 2D0GA 1EO5A 3NSNA 1JFHA 3VMOA 1CENA 1NWUA 2EO7A 4M24A 2XFRA 4WKAA 6TAAA 2G3JA 2WZHA 1NOUA 3D3AA 1QNPA 2VZOA 3N18A 2UY4A 4AD0A 3AIQA 1ISZA 3AI0A 2JEPA 1PJ9A 3NYDA 1B3XA 1HVQA 1R7OA 2J7DA 3IJ9A 3U7BA 4CN1A 1JZ4A 1HJXA 1HNYA 3CUGA 1B3YA 1DHKA 1V0NA 5IHRA 2WPGA 4PMDA 3AMKA 3FAXA 1SMAA 1W9XA 4E2OA 1JFXA 2FGLA 3MANA 3NCOA 3GTNA 1V02E 1BYAA 1CEOA 5I0DA 2WMIB 4HU0A 2VX5A 2CETA 4PYSA 4ATDA 1WDQA 1E1FA 1E55A 1J0HA 3BLPX 1XYFA 2ZWYA 3WDPP 2QMKA 3K4DA 2YDQA 5BYWA 1JD7A 3GNOA 4FLQA 2XWDA 2DSKA 4CD6A 3GYCA 5FIPA 1GOMA 1NWRA 1CWYA 4PRWA 5I78A 3IAQA 1GZJA 4AZCA 4QDMA 2UY2A 4UZUA 2CERA 2DIEA 4WSJA 1BYBA 3VGHA 1FHLA 4W7UA 3BAYA 3VD4A 1J0ZA 3WH6A 7CGTA 3CMJA 1CGUA 1KXTA 2HISA 2ZOXA 1JZ8A 4RE2A 3AHTA 1CGXA 2VOTA 2CKRA 4AD1A 2J79A 8CGTA 1CXEA 5ABHA 2D22A 1JF5A 2DH2A 1M04A 3VU2A 4B9YA 2DIJA 5TD4A 2ZXBA 4M81A 3AICA 2BY1A 1E4MM 1GHRA 2WZIA 2A3EA 4Y7EA 1R7AA 1KGWA 4AMCA 5E9AA 3FXYA 1GQIA 2BS9A 4C7FA 1C7SA 2DSWA 3IAPA 3B9DA 3PZUA 2XG9A 2W67A 5E0FA 1V03A 1GVIA 1M53A 2Q8XA 4YHEA 1VF8A 5D8ZA 3ARZA 1W1TA 4W8BA 3T0BA 1GOWA 2W63A 1BF2A 2NT0A 2C8NA 3FHAA 2DEPA 2UY5A 4A3YA 3JUGA 4V2XA 4LQ1A 2UWFA 3CO4A 3GDBA 4OOZA 4W84A 4MAZA 5CGMA 4GO9A 1XYZA 2BV9A 2JF7A 2J4GA 1EDQA 1QI4A 1E70M 3NIYA 2WM0A 2HVMA 1BLIA 1QHZA 2G4FA 4CVUA 5HOSA 2JFEX 1UD5A 1X6LA 4ZFMA 3AS0A 4W86A 1C7TA 5I6SA 2WAGA 4AZ5A 1W1YA 2XHYA 4JCLA 3VIPA 3N17A 1HL8A 1NOWA 3N9KA 1DTUA 4ZE5A 2PB1A 1VFOA 3GH5A 2YKKA 4EANA 4PSRA 2G3MA 1DWIM 4MAVA 4AEFA 1Q6FA 2E3ZA 4MJ2A 2WZEA 4CU6A 3VIHA 3RDKA 1EGZA 2J7EA 2IXUA 4PTVA 2NSXA 3WQ5A 2Y5EA 1FFQA 4H04A 5I23A 1GUVA 3UR8A 1ZBCA 4PUDA 1R85A 4EE9A 3CZGA 3WQ4A 4F66A 2ZX7A 2WHLA 4GIAA 3HMCA 1MFVA 3S6TA 4MDOA 1WE5A 2QLYA 2VNCA 1MW2A 2DSVA 3IK2A 3DYOA 3EYPA 2FHCA 3UESA 3MO4A 4CD4A 2O9RA 4KGJA 2V3FA 2CPUA 2VZTA 4PN2A 3TONA 3WUEA 1V0MA 2FH6A 3K1DA 3VOCA 3TTOA 4WLCA 3CZKA 3AZRA 1W91A 1K9FA 1B2YA 2C0HA 1R87A 1QI0A 2D2OA 3WN6A 1PIFA 3WEMA 3ZT6A 4UFKA 4HU8A 3AMCA 3BSHA 1XCXA 3KWXA 4J7RA 1B31A 3D5HA 4MJ4A 1E5JA 1KR0A 1SMDA 4UZSA 3T2PA 3TA9A 4N42A 4AISA 1EXPA 2E40A 4U2ZA 1C8XA 1JDDA 2GJXA 3SUVA 5A8MA 3N15A 1D2KA 1GHSA 2J7BA 3ZOAA 3M07A 4J27A 3UETA 3WKZA 4WJXA 1DEDA 1QNOA 2DT0A 1MQRA 2CESA 5E6ZA 4NRSA 4GI6A 1ISVA 3WDHA 3W6MA 1L0PA 2XPKA 1ITCA 3K8LA 1MQPA 3WH8A 3WD1A 4XZBA 4WKHA 2XWEA 2G3IA 1UA7A 3I3DA 1VENA 1Q6EA 4JFWA 1WB0A 4U31A 1QI3A 2RGLA 5CJ5A 3QHNA 1GJUA 2VX4A 2XIIA 1LLOA 4R5EA 1UWQA 1UD4A 3NUKA 2BFGA 1XGZA 3ALFA 2CEQA 4GQRA 3VDAA 1K6AA 2CYGA 1E0WA 2Z1SA 3QOKA 1GOIA 2DT2A 3L4XA 2BXZA 3MSDA 3KL0A 3AYSA 2GSJA 4L4PA 1K9DA 3PZMA 2V3EA 1KWGA 5CPSA 3CLWA 1EOKA 2BVYA 1J11A 2WMFA 4LX4A 1JNDA 1JZ7A 3O9NA 3WQVA 3ARSA 2D0HA 5HDRA 1JYXA 3SCUA 4UQEA 2WMIA 3BAJA 2E9LA 5D9NA 2VC9A 3RO8A 4TX6A 5DF0A 1UWRA 4PTXA 2V5CA 4CVWA 3ZSSA 3DYPA 4MDPA 1CDGA 2W66A 3L4ZA 5EFDA 3G6MA 4WK9A 3B9AA 1RH9A 2RGMA 5BCAA 5JUVA 1H0GA 4WSKA 1HJUA 2CBVA 2WBKA 5CSYA 4PMQA 4PCSA 4X0NA 3ZM8A 1LL7A 1ZJBA 2EEXA 3A3HA 3CUIA 4D6EA 1CZ1A 2F2HA 1HKIA 3DC0A 3WH9A 5AC5A 4P7OA 1WPCA 3FW6A 2WB5A 3WUGA 1E56A 2VX7A 4JFUA 4H8HA 3QHMA 4BQ2A 5A2CA 1WDSA 1NH6A 3SURA 2PBGA 4J3UA 4B3KA 2E9BA 4U2YA 2WCGA 5A6JA 1DWHM 2XYLA 3F5JA 3IJ8A 3VIJA 3VNYA 1B30A 4PMXA 1B90A 3N12A 4P7QA 1OM0A 4M80A 1BHGA 2VCCA 4AC1X 4CD5A 1VFFA 3UG4A 3WQ8A 1CLVA 3ZJ8A 3CHCA 3N11A 2J75A 5M3WA 1C3FA 1GQLA 2WYSA 4IM4A 1V3KA 2VUYA 1B9ZA 1CTNA 2YL6A 4HZ7A 4N0RA 1GPFA 1HKMA 1TVPA 3ARVA 5LYRA 4AZ6A 1JI1A 1GQJA 1QNRA 3L4VA 2YA2A 1C93A 4MB5A 2D20A 1E9LA 3W26A 5EMYA 1V0KA 4ZEPA 4D6IA 3IANA 4XX6A 2J7CA 1KXVA 1BTCA 2ZUNA 4EKJA 2YDRA 1ZL1A 1MXGA 1TFVA 2ESCA 2D3NA 1ESWA 4J3XA 1UZ4A 3N04A 1UUQA 3WY1A 4MB4A 1FP9A 2QPUA 3EDDA 2WWDA 1Q6DA 4H8VA 4PMVA 1VFMA 3CHFA 1JZ3A 5M5DA 2J8FA 3K8KA 1WO2A 2NT1A 1KFWA 3PTMA 1HKKA 3VD7A 4CD8A 3VKKA 1ITXA 4DUXA 2ZXQA 1PZ3A 3VGDA 3OIHA 4MB3A 3SIMA 4MB1A 1VRXA 3AZSA 1E0XA 3EMQA 3WBAA 4D6HA 9CGTA 3O6AA 2WC4A 3TTSA 3AMLA 1MFUA 4AZ7A 1JXJA 1OSEA 4GXPA 4XUYA 3OLIA 3AMDA 3TTYA 2ZXAA 1VEMA 2E8ZA 3BAWA 5ABFB 5FCZA 3ALGA 4B3LA 4JKLA 2BNJA 2AOSA 2WHJA 3WDIA 2ZUWA 3OZOA 5D9PA 1CGVA 3WL0A 2WC7A 4D72A 4YPJA 1BYCA 1US3A 3BCFA 2X0YA 2VCBA 2GDUA 4Z2KA 4FLOA 1AQ0A 4HMCA 4PMRA 3FHQA 2ZXDA 1HIZA 3J7HA 4PBGA 4UOZA 1W2VA 3THCA 1MYRA 1TVNA 2W62A 5CSUA 1WZAA 4KRTA 1E4IA 2DSUA 4BQ5A 3AOFA 1UQZA 2BVTA 3N1AA 3WBEA 5C8BB 2ZX6A 2VURA 3PZOA 4HOZA 4QP0A 4P8XA 4UFHA 1NP2A 5DFAA 1LL6A 4MTVA 3BMWA 3WMSA 1KXQA 1HJSA 3QHOA 1CECA 4P7LA 2VR5A 2VI0A 4FLRA 4KH2A 4S3JA 3VM5A 3WUBA 3VDCA 4UOQA 3VM7A 3L2MA 2XUCA 3AIRA 3RJYA 3RIKA 2W5FA 1BG4A 2W91A 1JYWA 1HJQA 5GPRA 2YDSA 2EPKX 3RILA 2OSYA 1DWJM 1W2PA 3B8SA 1ZBVA 5A69A 1XCWA 3POCA 1G0CA 4AW7A 3GXIA 3PTKA 5BXSA 3WF2A 3WEZA 1GCYA 1KCKA 3SUSA 2EQDA 3BMVA 1C8QA 4GO8A 2G41A 3WENA 1EOMA 1D7FA 4HPGA 3AQUA 4GQQA 3MSGA 1UR2A 4H7VA 5IXEA 5E70A 3QGVA 2WVVB 1XC6A 1V6XA 3EMCA 1WZLA 4UQAA 2WVSA 3MMDA 3VUPA 1I1XA 2QV4A 2YBUA 5BROA 4PMOA 3W6LA 4KMQA 5A8NA 2JE8A 4B9ZA 3VGFA 3VO0A 3RCNA 1QOXA 4MPKA 3W4RA 2WSKA 1PX4A 1H49A 3OZPA 5JBEA 2A3HA 2O92A 2FDMA 1MXDA 1JI2A 4TVDA 1HX0A 1F4HA 1B3ZA 1X1NA 1IZKA 1WAWA 4W89A 4YHGA 3BH4A 3CHEA 4ACZB 1CGTA 1TZ7A 1NP0A 1W3LA 1ZB5A 2WXDM 1KXHA 4J3VA 5A6AA 3HN3A 2W4XA 3L4WA 3UERA 3ARRA 4AIOA 4PCTA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BY2 A;  5ABG A;  4UQC A;  3VIF A;  4QFU A;  1JZ2 A;  1KWK A;  3TP4 A;  1TMQ A;  1PX8 A;  1CYG A;  1E6X M;  2C7F A;  4FK9 A;  1J12 A;  3CGT A;  4J28 A;  1V3H A;  3NSM A;  1OD8 A;  4XB3 A;  1G1Y A;  4D6D A;  2WK2 A;  3OBA A;  2ZIC A;  3EDF A;  4TXE A;  4UOJ A;  3WD3 A;  3SCT A;  3W28 A;  5CLT A;  1BAG A;  4PEE A;  3U5U A;  4UFI A;  4TVC A;  4BS0 A;  1HJW A;  1CBG A;  3VGE A;  1YQ2 A;  1UH3 A;  1H3G A;  1FH9 A;  2XGI A;  2DPE A;  5LA0 A;  3HU7 A;  1A47 A;  3AHV A;  1IZJ A;  4EAM A;  4WIW A;  3WF1 A;  1UKO A;  1ISW A;  3AS1 A;  4QLK A;  4JIE A;  4AZC B;  4V27 A;  1UD8 A;  3VPL A;  1H2J A;  3QOM A;  3CUF A;  4JL1 A;  4QCE A;  1E6Q M;  3WD4 A;  2VR4 A;  4GZI A;  1BGA A;  1S46 A;  3A6O A;  3GZA A;  1E73 M;  5IHS A;  4FMV A;  1VBU A;  1QI2 A;  1VFU A;  5FOO A;  2W92 A;  2VJX A;  3WUF A;  1OT2 A;  4PMN A;  2D1Z A;  5D4Y A;  3W53 A;  3II1 A;  1WDP A;  3PZQ A;  1C91 A;  3NDY A;  4UQD A;  2WLZ A;  1MW1 A;  3CH9 A;  4JHO A;  1EQC A;  3EMZ A;  1V3I A;  3W29 A;  4CGT A;  1KQZ A;  5DO8 A;  1A3H A;  1J0K A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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