4M5P | Genus

Total Genus 157

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	157
sequence length	404
structure length	404
Chain Sequence	SSVKISPLKDSEAFQSIKVGNNTLQTKIVYPPTTRFRALEDHTPSDLQLQYYGDRSTFPGTLLITEATFVSPQASGWEGAAPGIWTDKHAKAWKVITDKVHANGSFVSTQLCFLGRVADPAVMKTRGLNPVSASATYESDAAKEAAEAVGNPVRALTTQEVKDLVYEAYTNAAQKAMDAGFDYIELHAAHGYLLDQFLQPCTNQRTDEYGGSIENRARLILELIDHLSTIVGADKIGIRISPWATFQNMKAHKDTVHPLTTFSYLVHELQQRADKGQGIAYISVVEPRVSGNVDVSEEDQAGDNEFVSKIWKGVILKAGNYSYDAPEFKTLKEDIADKRTLVGFSRYFTSNPNLVWKLRDGIDLVPYDRNTFYSDNNYGYNTFSMDSEEVDKELEIKRVPSAIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Residues Controlling Facial Selectivity in an Alkene Reductase and Semirational Alterations to Create Stereocomplementary Variants. pubmed doi rcsb
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Scheffersomyces stipitis
molecule keywords	NADPH dehydrogenase
total genus	157
structure length	404
sequence length	404
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-08-08

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00724	Oxidored_FMN	NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4m5pA00

1SZFA 1JUBA 1ZJIA 1G4SA 3F4NA 3KX6A 1H60A 1G4EA 3ANYA 4WOZA 3Q37A 1N55A 3PBYA 2OX1A 3CQ0A 4EVZA 3TJXA 4UFIA 1MEHA 1OFRA 3TXVA 5K7JA 2HSAA 1M7OA 1QOPA 3KHJA 1XC4A 3W6YA 4CNOA 5U4NA 4JDYA 4IMDA 1JR1A 3DFPA 4NU7A 3KRZA 4M7TA 2ZRUA 5BW6A 2ZYFA 1WXJA 3L5MA 3W75A 3L21A 4JGDA 1W3TA 1MXSA 5EPDA 2BSLA 3GR7A 4OHQA 1GQNA 4JTUA 1K3UA 3B05A 5FI8A 3NL2A 3W88A 3P82A 3TR2A 4FXSA 3G1VA 2O7QA 2NXGA 1TPDA 3NL5A 3P84A 3IIXA 4JS3A 3SSJA 4FX8A 3LXBA 4E0CA 1A5CA 2CFFA 3W1XA 4EIVA 2ZZ1A 4PL2A 2YYTA 1B57A 1EUAA 3C3NA 4N9DA 1KA9F 4O14A 4O1DA 1JCXA 3PSWA 3MI6A 1VPXA 4RX0A 3W1TA 5F2GA 3W72A 3CHVA 2FLIA 2VENA 4N9CA 4UTMA 2CU0A 1KFLA 4AWUA 2R94A 5LNVA 2R91A 4XBSA 3N34A 4AVFA 1O60A 4N4QA 1DKWA 5EMUA 3DGRA 3G0SA 3NQMA 3W70A 1P4CA 4QQ3A 4BI5A 3IVUA 1LBFA 1WAUA 2WNNA 1DV7A 3ZS4A 4RLIA 3FEMA 4JYFA 3LCGA 2J27A 3GDRA 2C0AA 1OYBA 4C1KA 2WKJA 2HMCA 2ZFAA 2ZZ2A 1VCVA 3PG8A 1EWEA 1BWKA 3C61A 3VE7A 2NX3A 3P67A 2RDUA 3U6WA 2Z6IA 2NXHA 3TC7A 3PUOA 3W7NA 4ZVJA 1XBVA 2ATMA 2Y7GA 1LRNA 4GWEA 1I2QA 1D3HA 3GXTA 3QQ0A 3Q2DA 3UY7A 1EIXA 1TTJA 1VCGA 1I45A 3HGRA 3BW2A 1WOBA 1ONRA 1ZNNA 2OT1A 4JTSA 2V5LA 3UXDA 5FESA 3L66A 4AMAA 3TDFA 4JNMA 4A21A 2Y63A 3LTYA 3TH6A 5DLCA 4S2CA 4Y6GA 2DZWA 1T0OA 1H1YA 1B4KA 3C8FA 1VHNA 3HG3A 2VFGA 4JD4A 3GVGA 4LW7A 1L6WA 3BW4A 4JX5A 1GVQA 3O15A 3YPIA 1X8FA 2TSYA 3LTPA 1V5XA 5D2XA 2B7NA 1B4EA 4H6KA 3DU0A 1ZCOA 3P5ZA 1KLYA 3W7HA 1JCJA 4MJZA 1WX0A 2W6RA 4JTJA 5KZMA 3S8HA 3G0UA 5EA9A 3SR7A 3EX4A 4M6QA 4JTGA 4ZQNA 2JKEA 1QWGA 1VLIA 3N9SA 4O0ZA 3NZRA 3EWBX 4Z1AA 2RDWA 4O28A 2XN1A 1LBMA 4W9TA 3C6CA 2WV8A 3GNNA 1O95A 3GX9A 4MYAA 1I2PA 1SO4A 3W23A 4MJMA 3T55A 4WQ6A 2CLHA 5D2YA 4FNSA 1QPNA 5KZEA 1FDZA 2OCZA 5TBOA 1GTEA 4AWTA 1SUXA 2V2DA 5L9FA 3W87A 5J5RA 1BKSA 1XBXA 3A22A 4JTHA 1QO2A 1J5TA 3EB2A 1WQ5A 2CLMA 4UTHA 3EKLA 4UCGA 2CLKA 1VZWA 4JX4A 2CZ5A 2JKPA 3PVFA 4O53A 5FF3A 5GVJA 4MZ8A 4UTWC 1Q45A 3NAVA 4JTIA 1FWSA 3WK1A 3DKLA 5AC7A 3Q58A 3M44A 2H8ZA 1O5XA 2QCHA 4LY8A 3OBKA 4U4MA 4O17A 2VKZG 5LKYA 4RJEA 4A3UA 4K36A 3U2OA 3WJSA 4XBKA 3TSBA 1G6CA 3VKJA 2CLFA 3O6YX 3IIPA 5DELA 1QFEA 3IIOA 4POCA 3ZWTA 4N9BA 4IXHA 1T96A 2ZTJA 2NV2A 3OVQA 2DZXA 3TFXA 3GKFA 2FIQA 1SFJA 4JX6A 4CNNA 1OX4A 5K2ZA 3GDTA 4WXZA 3ATYA 3E02A 2W79A 2X16A 4OV4A 4UMBA 4UMAA 5DY3A 2P0OA 4HNVA 2HTMA 3NDOA 3TSDA 1R2TA 3THQA 5K4ZA 3S5NA 1TPFA 2WQPA 1RZMA 1K8XA 1H7XA 3L0NA 3C56A 3TSMA 3W2JA 3L5LA 3FYOA 6ALDA 2ZZ6A 2X1TA 4RZ6A 2VOMA 4AH7A 4FNPA 1FDYA 3STEA 1UASA 3S1XA 2Y62A 2JK2A 3G8RA 1EWDA 2DORA 3L65A 3PF3A 3P74A 3OVPA 1FCQA 2A0NA 3LHTA 5A5WA 5I3HA 1O5KA 4UFKA 2FTPA 1A53A 1Z41A 4UIOA 2B4GA 2QUVA 4UR8A 2QUUA 4RCXA 3W7MA 3N19B 1SPQA 3CIWA 3G18A 3GXPA 1KBIA 5CPNA 1EX5A 2QF7A 3W1QA 1YDNA 2C15A 3FJ6A 3E0IA 4JIQA 4HPJA 1TPB1 4GE8A 3BGGA 3W73A 2J9ZA 1FWWA 3QW4B 3DH7A 1OFQA 1SW7A 4QAIA 4R33A 3Q94A 3GDKA 3ZWSA 2Y88A 1KM0A 3PB0A 4FHAA 3UPWA 4UNLA 5EBUA 4NX5A 3S1UA 3K30A 3BLEA 4AF0B 4DQWA 3HG4A 1PHWA 1TPVA 3S5YA 1HFBA 1H61A 3IRDA 1C8VA 3JR2A 2QAPA 1A5SA 1G67A 2CLLA 1LP6A 1XXXA 3VI2A 1WYIA 5LHFA 3PR2A 3EWYA 4N2YA 3RU6A 3IGXA 3UWQA 1QPOA 2EKCA 1WBJA 1KFKA 3DAQA 3E96A 2G5WA 3DKJA 2QKFA 2TYSA 2A7RA 5AHEA 3T7VA 4LC8A 4FEZA 3W7CA 4ZMGA 1IXOA 1GVFA 3W7EA 4O12A 3PBUA 5AOUA 5C2XA 2BWGA 1F6PA 2ZQ0A 1H7WA 3EX2A 1ZAHA 2VXNA 4NJJA 4TMBA 3W7RA 5D37A 1X1OA 4QJ1A 1Q6OA 1Z48A 4NNAA 5J5DA 2A85A 4WY0B 1PIIA 4K8HA 4CCDA 5D2WA 4GUIA 2Y85A 5CZTA 2RH9A 4MLJA 3LCHA 2PRLA 5CSSA 3LCFA 4O1BA 1KV8A 1ML1A 1Q6RA 5G2WA 3HPSA 5HNRA 2DJLA 1THFD 3M16A 3TKFA 3SECA 3N73A 3LCIA 4HKPA 1W1ZA 1FXPA 2OJPA 3M41A 4ORMA 3ATZA 1ADOA 2Y70A 1KM5A 3G1DA 3PB2A 3THAA 3OHIA 3CLMA 3KAOA 3HG5A 4O4VA 4O16A 2YW3A 4UTIA 4R34A 3BVJA 3MMTA 3S1VA 3QYQA 4K39A 3W7DA 5ABTA 2ZZ7A 3QQ1A 5E0KA 1OHLA 2X1SA 2FB3A 1XI3A 1NVMA 5G5IA 3A21A 5FEWA 1YXDA 3OG3A 2H3BA 2NX9A 3NPWA 1GT8A 2PCQA 1NAL1 2Y6ZA 5G4EA 2NUYA 3NQEA 3USBA 1SZGA 1G4TA 1T8XA 3LBCA 1W0MA 5DBUA 3NQ2A 3W7PA 1YYAA 2VFFA 3P62A 4BWLA 4Z1CA 1SZNA 3S5ZA 3TQ0A 2BZNA 3A24A 1E51A 2TRSA 1DBTA 4TO8A 3EWXA 3GK0A 1XKYA 5AHNA 3GIYA 2ZZ3A 4GUGA 4K37A 3FS2A 4CNPA 2ZA1A 4Y8FA 3TROA 3O05A 1OF8A 1P5BA 3S5OA 3N2XA 3O8AA 4UXDA 4JYEA 1KBJA 5FF0A 2V2CA 3W71A 3F03K 1QAPA 3P7YA 3B0UX 2ATSA 2FDSA 3PUDA 1SQ7A 2OMAA 1FY6A 2PE4A 1X7FA 1I2RA 4NZJA 2QAFA 3TUUA 2A2IA 1Q6LA 3EXSA 4L4MA 1U83A 3MP5A 4JY9A 3IEBA 5I3GA 8TIMA 4GFSA 1FXQA 4E38A 1XDMA 5EY5A 3UXAA 4MY1A 3LI0A 2QJIA 1F76A 1XM3A 5HWNA 3W74A 4GXMA 2NUXA 1J4EA 2GQ9A 1VJIA 3BV4A 4P2VA 1C29A 3SZ8A 4Q33A 4FB7A 1DQXA 1UUOA 3G24A 3EWUA 4O18A 4PL1A 4JTKA 2YCEA 3W3OA 4LS0A 3MBFA 2JBMA 1SSGA 4TR9A 3AO0A 4NJKA 3GB6A 4H3DA 4ORIA 4JYDA 4RKAA 3TCEA 2Z0IA 3A23A 3C2FA 5AYYA 1JCNA 3C2EA 3NPXA 3NXFA 3M0ZA 3L5AA 1BEUA 3G3DA 3T44A 4NXKA 1MO0A 4M6VA 5D04C 1WDWA 3HGJA 2V5BA 2AQWA 1RV8A 3MHFA 1H51A 3RLUA 3W7QA 4OE7A 1AL8A 4A2RA 5DCDA 2EF9A 1TJPA 3S1WA 5HMSA 3M7WA 5IBXA 4Z0JA 3ABRA 3G22A 1JCYA 2Q8LA 1VGAA 4JDBA 4G1KA 5LGZA 1H1ZA 1W3NA 1R46A 3OVRA 4RXFA 4U28A 3DI0A 3NO5A 2FPVA 4KFPA 1GG0A 3TU9A 2Z6JA 1DJQA 5DCEA 1ME8A 2B7PA 3PAJA 4O15A 1HL2A 4WD0A 1XBYA 2E09A 4XQ6A 2E68A 1K8YA 1L9WA 4DEFA 3IGUA 5DN1A 3NQ7A 3LHVA 4NUWA 4HIBA 4ZQPA 5G2IA 4HSOA 3KRUA 2A6NA 1GWJA 1MSSA 5CG7A 1H5YA 5TIMA 3W1NA 5DY2A 4NZFA 1ALDA 1TCDA 1VHCA 3RNDA 1JULA 2C13A 4MKNA 2ISSA 2B7QA 4IX0A 3NQ6A 1ZALA 2JKAA 3I7SA 5DXXA 1LOSA 3VE9A 1MEWA 3W07A 1YADA 3QMSA 2YZRA 2Z2UA 3LCWA 2E1DA 4QM1A 3UWUA 1K03A 3B06A 3STFA 1OABA 3NZ1A 3O16A 3NG3A 1A5BA 4LU0A 1DL3A 1QPQA 3LX9A 5D05A 3UNDA 1ICPA 4NXSA 3CWNA 3QEZA 5FF7A 4YCPA 4NJIA 1DOSA 1S5TA 3QPZA 2DZPA 1W5OA 3OA3A 3IIVA 4X22A 1W5NA 2P1FA 5C6MA 4RZ5A 2ABAA 2DP3A 2PRHA 4UFHA 2A4AA 3UZJA 4M7SA 2WNZA 3LXCA 5KTLA 1TTQA 2V82A 4Z1BA 1EEPA 5I3FA 3NQAA 4LS2A 3ABOA 1ICQA 5FF2A 1SO5A 2GJLA 5LNRA 1PE1A 1T99A 1YTEA 2NV1A 4OWGA 3DFTA 3WJWA 3M1ZA 4QIUA 4OBTA 4UTKA 2ISWA 2Y7DA 3CWOX 2DJXA 4MVAA 3VNDA 3NQDA 5HWMA 1AW5A 4ZQOA 1XL9A 4FXRA 2QCMA 4NVTA 4XKYB 5F2MA 4DELA 5D38A 1Q3NA 2YDAA 4E2BA 1H50A 1D9EA 2J24A 1K8ZA 1H7RA 1JRBA 1VYPX 2H6RA 4N6EA 3NGJA 6TIMA 4MOZA 4LUJA 3O06A 3CTLA 4DO6A 4KFOA 4MZYA 1JJKA 4HNNA 2ZBTA 2B7OA 2QEZA 4YWIA 4IPIA 3TXZA 2ZTKA 1GTHA 3SGUA 2VFHA 1FX6A 1TO3A 5H2ZA 1K7FA 3M5YA 1SFLA 3LI1A 4MFEA 1EP1A 1UJPA 5D03A 1TPUA 5K9DA 2V9DA 5E93A 1ZY9A 1G4PA 4O11A 1NEYA 3H54A 4LVBA 3MP3A 4OQVA 1X6UA 3W2KA 5FF4A 1OX6A 4ZQCA 1KM2A 3CEPA 3WJZA 3TA6A 1FCUA 4UTTA 1LOQA 1C9DA 2QCFA 5DBTA 4HNUA 2GOUA 4S1FA 5KMYA 1KFBA 3CM4A 1M5WA 1OJXA 4GBUA 1TQJA 2EHHA 3GZ3A 2NWRA 5KSWA 1K7XA 4I7WA 2NWSA 2TMDA 3HBLA 4OV9A 1GEQA 4AWSA 3KOFA 2GVJA 3P61A 1GZGA 3STCA 2B0MA 3U8GA 3UWYA 3HPZA 2PC4A 4Y90A 2VFDA 1B3OA 4UC5A 1QCWA 3A9IA 4M6PA 3NA8A 2PRMA 2A6LA 4IQLA 3GYEA 2A5HA 1W54A 5K9XA 1DHPA 2C18A 5F2IA 3SJ3A 3TX9A 1TQXA 5A8GA 1L6YA 2ABBA 2VEPA 3TIMA 3RMJA 4IGHA 4LVGA 4IMGA 3R8RA 3LHZA 1LBLA 4DF1A 4HT3A 4ADUA 1LRTA 1H62A 4GUFA 5D2TA 4JIPA 2ALDA 3H55A 3TQKA 3QMRA 1NF7A 1WBHA 3WK3A 1AW1A 3ZR4A 1SO6A 3DFQA 1LORA 3TAOA 3A5FA 1GJPA 1HUVA 4KKXA 3B04A 1KTBA 3FJLA 1RR2A 4CCEA 5KZDA 4PCFA 3LV6A 3W7IA 1QOQA 3NL3A 2W0UA 2I9EA 1RD5A 1TIMA 4DPPA 5AC6A 5K4XA 5LZLA 5DXYA 1AK5A 2QUTA 3GR8A 4QISA 2FJKA 3PBVA 4AHOA 3MP4A 3DBPA 3N2MA 5KINA 1LTDA 2QDGA 1BTMA 4YL2A 4B5NA 3LRLA 3LTSA 1SO3A 5BMXA 4AAJA 3P81A 4IUOA 1G69A 3NQ8A 4FNTA 5CZ0A 4LRTA 2CZFA 3M5ZA 4DBDA 1UCWA 2A21A 1AMKA 4BF9A 3EXTA 4ONVA 2I14A 3VCRA 4YXGA 2YX0A 4A29A 2J9XA 2NUWA 1F6KA 1MZHA 1JCLA 2CZEA 4GC4A 4LS1A 1SW0A 2GVGA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4M5PA

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