4M7SA

Crystal structure of semet btrn in an open conformation
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
249
structure length
214
Chain Sequence
MDKLFSMIEVEVNSQCNRTCWYCPNSVTGEMDPALYKTLMEQLSSLDFAGRISFHFYGEPLLCKNLDLFVGMTTEYIPRARPIIYTNGDFLTEKRLQTLTELGIQKFIVTQHAGADKEKVVYLDHSASKANMSCMVPSNLAVVTVLGNVLPCFEDFNQKMVMGNIGEQHISDIWHNDKFTSFRKMLKEGHRGKSDLCKNCNNVSVQTEEQYDYV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title X-ray analysis of butirosin biosynthetic enzyme BtrN redefines structural motifs for AdoMet radical chemistry.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BtrN
molecule tags Metal binding protein
source organism Bacillus circulans
total genus 71
structure length 214
sequence length 249
ec nomenclature ec 1.1.99.38: 2-deoxy-scyllo-inosamine dehydrogenase (AdoMet-dependent).
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13186 SPASM Iron-sulfur cluster-binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4m7sA00
3G1YA 3G8RA 3QF0A 4A2SA 3IGXA 3W73A 4H3DA 1QOQA 1RR2A 1X8FA 2W79A 2NWSA 4WD0A 3F4NA 2TPSA 1MEHA 1QDSA 3JR2A 1SFLA 1KLYA 4WJEA 4FEZA 1TPB1 1W1ZA 4YCPA 1W5MA 1KTNA 5TIMA 1OFPA 1JCLA 4CQAA 3NG3A 4XBKA 5K4ZA 3IIOA 1JJKA 3LHYA 4O16A 2HTMA 1G4PA 2QCEA 3BG9A 4UFIA 1OYBA 4J9JA 5CZJA 3INPA 4JDBA 5EYWA 2Y61A 3FKRA 3L0GA 2NXHA 1YPIA 1B9BA 2J27A 1E51A 1LBMA 1CW2A 2P0OA 1R30A 4O19A 5KMYA 1KFJA 1OX6A 5HUPA 4O0ZA 4YXGA 1W54A 2X1RA 4WOZA 2PE4A 4ONVA 1GPWA 1OYAA 3KRUA 2PURA 3L65A 3W1QA 5F4WA 1W5NA 1TPFA 4LS2A 1SZGA 3U2OA 3LCXA 1KM1A 3FYOA 3PAJA 3PB0A 3SW6A 2C13A 4IX2A 2RDUA 4XQ6A 3WK0A 4UUIA 3UPWA 3LBCA 2R91A 2QDGA 3UXAA 4KFOA 1SZNA 3NVTA 4AWTA 2YW3A 1F73A 3N2MA 1KW1A 4A3UA 2ZA1A 1LORA 3I7SA 5A8GA 4BF9A 5FEPA 3GXTA 4GXMA 2Y7DA 3CIWA 4RX0A 4GUHA 3CWNA 4UMBA 1GYNA 3PSVA 1FWRA 1HTIA 3C2VA 1DV7A 3GDRA 1W3IA 2QJHA 2NLIA 3W70A 3R13A 4XKYA 4RLIA 2BLEA 2ZQ0A 4ZVJA 3W7IA 5CPNA 3W1NA 2X16A 4RJEA 2CW6A 4ML9A 4GNJA 3M9YA 2E09A 5F4SA 3W07A 5E93A 3L68A 5DY2A 1O95A 3L2IA 3SGUA 1G67A 1T0OA 5U4NA 1F05A 1VYPX 2AGKA 3ABRA 3LTYA 3R89A 3UWVA 3TW7A 2WNNA 1A5BA 3KOFA 4ORIA 3SIZA 5AC6A 1D3GA 1U5JA 3VE9A 4UFKA 1QAPA 3DFNA 3NR0A 2X1UA 4BK9A 5BW6A 3LHZA 2V5LA 1YXCA 4PA8A 5TQLA 2CLEA 2B7PA 5C54A 1VYRA 1H7RA 4LV9A 1PCWA 1ICSA 1QOPA 3W2JA 5I3JA 2NWRA 1XM3A 1EP3A 2FDSA 5FEXA 5ABTA 4NX0A 3LRMA 3TSDA 1OFDA 5EY5A 1KFCA 4R33A 2CLIA 2XN0A 1ZY9A 4UIOA 1Q6OA 4FX6M 3LHWA 1B4KA 2YPIA 2J24A 3TQ0A 1GVSA 3L5LA 3QMTA 4BWLC 4CNOA 2E5DA 2Z6IA 4UR8A 4H6KA 4IQLA 1NEYA 3LTPA 3GR8A 3BW3A 4QSHA 2NUYA 3TFCA 4O15A 5K7JA 1FBAA 1QPQA 1SZFA 1A53A 3CWOX 3O63A 1YDNA 3MP3A 2Y7EA 2JGQA 2B7OA 5LSMA 2DZVA 2FTPA 3LHVA 4R7JA 4RZ4A 3MYOA 4OHQA 4O50A 4UTTC 2FLIA 4QIUA 1TPDA 1AW1A 3GX9A 2NX1A 5I3IA 4PEKA 1FXPA 3C2OA 3M5ZA 4UTKA 2V2CA 3BW2A 4N9BA 4I9AA 1UUOA 1P4CA 1H7XA 3N19B 2V82A 3GR7A 3LI0A 1JCXA 4S1FA 1L6SA 4HNUA 1AW5A 4IJBA 4NJJA 2NX3A 4LWWA 3VI2A 3N9RA 1KBJA 3FEMA 1HUVA 1EPXA 3EX1A 3C6CA 1CX9A 1FCBA 4JTTA 5D2TA 1KM4A 4LOCA 2CLOA 3H53A 5DN1A 2FPYA 2W6RA 1KFEA 3AO0A 3B4UA 3FLUA 3CHVA 5KZMA 3NL3A 3HPSA 4MPQA 2QCCA 3NPVA 5DBUA 2YFOA 1G7UA 5CG7A 1HO1A 3MJYA 4OGZA 4NNAA 4JYEA 1OFEA 4JIPA 5FI8A 2B7QA 3W71A 4NJKA 3W7OA 2ZRWA 3EWUA 3FYPA 3L66A 2QCFA 3BARA 3QPZA 4KKXA 3EWYA 2NUWA 3EWBX 3KRSA 5D05A 2CZDA 1EP2A 3R5EA 1X7FA 3GK0A 3IIZA 3O6YX 4K7VA 3NNTA 5LKYA 4DO5A 4O12A 3RLUA 2YYUA 4DXVA 4O13A 1SO5A 3CQ0A 1TTPA 2CZ5A 3S1XA 3TDFA 3W2KA 3M44A 5AHFA 2GOUA 2E77A 2NXIA 3BVJA 1A5SA 1T96A 3LHUA 1ZAJA 2YR1A 5FEWA 4N2YA 3MO7A 4X9SA 5K2ZA 2WKJA 4WY0A 2QCMA 1WA3A 3U8GA 3SGZA 3FFSA 1XC4A 4Y8FA 3W7GA 2C18A 3DH7A 5I3GA 4IX0A 4NQ1A 3UWZA 1AG1O 1IXQA 1I2NA 3LRLA 3NQ6A 3QM3A 2D73A 3KVLA 5CPOA 2DZSA 1UBSA 3BW4A 4CQ8A 4UR7A 1GVOA 4M7TA 3OVRA 1GVQA 1EWEA 5F2IA 1O94A 3LXCA 3PS7A 4I7VA 1UASA 1GT8A 4Q4KA 3P7YA 3LDVA 1H7WA 3DHDA 2ZCGA 4UTWC 1LTDA 3A5FA 5FF4A 4ZL1A 1SSGA 3W2MA 2B7NA 4FIRA 2WNQA 1QNVA 2ZA3A 1H50A 4C1LA 4PL2A 3TKFA 4OV9A 5KZEA 3UY7A 4AH7A 5HQEA 1K8XA 1H1ZA 3IRDA 3W7PA 4UCGA 1LRQA 5IBXC 5DY3A 3M1ZA 4JTIA 3O05A 3GVGA 1ME8A 3HF3A 1JVNA 1Z41A 3TJXA 3UZJA 1UJPA 4Z1CA 3NQMA 2Y62A 3LCHA 3W7CA 3MYPA 1K7FA 1KM3A 3NEVA 1TPC1 1IIHA 1EA0A 2C19A 3QEZA 3GB6A 3ABSA 4AXKA 3TAOA 1TJRA 4HHPA 1KV8A 3O15A 4ORMA 1XFBA 1BTMA 1XL9A 1KM5A 4LY8A 2A6NA 3DXIA 1G69A 1Q3NA 1Z42A 2DZUA 3P61A 3TUUA 1JUBA 1IIGA 2V30A 4M6VA 1JUKA 4WXYA 5DCBA 1LOLA 4O14A 1OK4A 3DFQA 2ISSA 4EOUA 3F1QA 4MFEA 1K8YA 4O17A 1KA9F 1A5AA 2V2DA 1HO4A 3A5VA 2QUTA 2ZA2A 2DP3A 1KLZA 5LGZA 1W56A 1TV7A 3E9AA 3W88A 3MHGA 5AFDA 1I2QA 2VFIA 1VC4A 1I2OA 2YDAA 2ZYFA 2ZZ4A 3L0NA 3BG5A 1W37A 3PG9A 1RZMA 1Q6QA 3B0VC 3M16A 2WSQA 3GXPA 4JTJA 1XUZA 5A5WA 2W0UA 3LERA 2ZZ2A 1W5OA 1OFRA 3OG3A 4IMCA 3SI9A 5DXYA 4GC4A 2E5CA 4CLMA 2C16A 2CLFA 1K02A 3H54A 3P8JA 1THFD 3KVMA 7TIMA 4GUFA 3H55A 3YPIA 3F4WA 3UNDA 3CPRA 3ZWSA 3B06A 2DZTA 2A6LA 3IVTA 3TH6A 1H63A 1PHWA 2CLLA 3ZR4A 1FY6A 1AL8A 4FX8A 1JRBA 1FQ0A 3LCGA 5G1YA 3TE9A 3IIPA 4LVGA 2V0TA 4IXHA 4S2CA 3G18A 4NJIA 3G1HA 1TB3A 1XBYA 3AJXA 4WXZA 5EBUA 4OQVA 2JBMA 1EX5A 3NA8A 4MOZA 3DFPA 4AF0B 4S2BA 3W23A 3W2NA 1MEIA 3STFA 3QJAA 3S0CA 3CLMA 3IVUA 3RLVA 1YXDA 4LRSA 4LC8A 4RXFA 2A4AA 4KFNA 5C55A 3W1XA 2WSRA 2QCNA 3KRZA 2V5BA 3W1RA 1QR7A 4M5PA 1JCNA 4Z1BA 3C2EA 3NGJA 4JX5A 3W7EA 2YW4A 4IPIA 1F5ZA 3S42A 1ADOA 4O1BA 1WAUA 3P84A 3W1MA 3O6CA 4CCEA 1KM2A 1I2RA 4XBSA 1U83A 3SR7A 5HR6A 3NL6A 3EX3A 1RV8A 3FJLA 5EA9A 4JICA 1C29A 1RQBA 4OBTA 2HMCA 3W1AA 3W85A 4N6FA 2OCZA 4FNSA 4MVAA 1VLIA 1ML1A 3LCFA 3HJZA 3FA5A 4Z0SA 4Q32A 2QAPA 3M47A 1F6PA 4ZQRA 1ME9A 1JR1A 4UNKA 4Y6GA 3QQ0A 1B4EA 4HSNA 4FXRA 5DELA 2A5HA 5EL1A 3Q2DA 4TR9A 5D09A 3VNDA 4FXSA 4NZFA 1SO3A 4O4WA 3BGJA 1TYGA 1BEUA 3T4CA 2ZZ1A 1ZNNA 5AYZA 2CLHA 1DJNA 4O1DA 3P67A 1WBHA 4JTEA 5HWNA 3P80A 2RKXA 4BWLA 2X1TA 1PHQA 3NQCA 5G5IA 2QR6A 1M7PA 3NQDA 5F1UA 4IMEA 5CZ0A 1P1XA 1SZEA 2GQ9A 2H90A 3QC3A 2J9XA 2RH9A 3DAQA 1DOSA 3GDLA 3LXAA 2Y63A 4PFMA 3M6YA 5CKSA 4UTTA 4NZJA 3TR2A 3DI1A 2GVGA 3LOTA 3HOJA 1K7XA 1WBJA 5G1TA 3LGEA 5F2GA 1OFQA 3QSTA 1ICPA 4X22A 3N2XA 1R2RA 1TIMA 3NQEA 2YFNA 2A21A 4EIVA 1JUEA 1L6WA 3T7VA 2ABAA 2C14A 4M19A 1KM6A 4E2DA 2FIQA 2QEZA 4UXDA 3QW4B 1NVMA 3P8IA 2ZDRA 1AK5A 3LCWA 3DU0A 4I7UA 1W5QA 1OYCA 3TMLA 1FDJA 4O18A 1G4TA 2C3ZA 3O07A 2H6RA 2A7NA 2YSWA 1UB3A 2V9DA 4JXCA 4N9CA 2G96A 1RPXA 4OV4A 1TSIA 3G0XA 3L0KA 3W83A 3EX4A 1M6JA 1LLWA 4RKAA 1ZAHA 3G0UA 1PIIA 2H3BA 4E38A 1FWTA 1X1OA 4X3ZA 3PC0A 4UFLA 1H61A 1GEQA 1H62A 4XTDA 1QWGA 3TK7A 5CSSA 4B5NA 5AYYA 3A24A 4K8EA 4LT9A 3G1FA 3V75A 4WY0B 4YCOA 2F7FA 5HULA 4HNNA 4AAJA 3FJ6A 1TQJA 1DQWA 3VKJA 2IQTA 5L9FA 1XBVA 2ABBA 3HG2A 2VOMA 5E0KA 3WJYA 2Y6ZA 3CIXA 5G4EA 4BI6A 4KFPA 3DFOA 1EUAA 1ICQA 2X30A 3LTSA 2GVLA 4LU0A 4NUWA 1EB3A 3W7LA 1SO6A 3DBPA 3PM6A 4RK8A 2QCDA 4MYXA 2Y88A 3TXZA 3MI3A 4LTSA 3PY2A 3PUDA 2OMAA 1H7NA 3PUEA 1F2JA 3I6RA 2WO5A 4A21A 1IF2A 3TC6A 3IIVA 1JULA 1G4EA 1JCMP 3C3NA 1S5VA 1VHNA 3W9ZA 2GVJA 2DZPA 4UNLA 2GQAA 2OZ0A 2RFGA 5BOOA 5K9CA 2UV8G 4FNTA 4Y90A 1XBXA 3L67A 1VRDA 1XUUA 3SFKA 4UTWA 1FDZA 4JDYA 3ZS4A 5AC8A 3W2LA 3EB2A 2Y85A 1IXNA 1OFAA 3EKZA 3N73A 4IXXA 1DKWA 2QCGA 2XFWA 1CI1A 1MEWA 1VH7A 3RU6A 1UUMA 1O5XA 1K3UA 4C1KA 1JQXA 4MZ1A 2GJLA 3RNDA 3W7NA 2ZTJA 3MHUA 4GUJA 4RXGA 4Y9AA 3CT7A 3M5VA 5IBXA 1TQXA 1OVDA 2LLEA 4JTLA 3P60A 4MFDA 2G5WA 3W1PA 3ATZA 4UTMA 4GUGA 3NL5A 3I7RA 3NQ7A 2V8ZA 2Y89A 2BX7A 3W7HA 1OX4B 3LM7A 1HL2A 3E02A 3I7QA 3VFLA 1I4NA 5FF2A 5K9DA 1FWWA 1SU5A 4N02A 3S5YA 3D0CA 1J5TA 4JN6A 1IXPA 4NX5A 4N6EA 3N34A 4QJ1A 3O6DA 4LVAA 3BPWA 1TO3A 1AW2A 1G7VA 4FF7A 2EF9A 2FPTA 3SSJA 3ELFA 4CNPA 2GPTA 1SW3A 3TFXA 1XCFA 4CQ9A 1QO5A 1I8JA 2PRLA 4JTHA 4CCDA 2ALDA 5LZLA 5HWMA 3G0SA 4UC5A 3P74A 3TQKA 1KV5A 2NX9A 4FNQA 3P5ZA 3W1LA 3T78A 1GG0A 3DHFA 4DBDA 5K4XA 4WOQA 1W5PA 4FHAA 1HG3A 4Y96A 3FS2A 1DORA 4HKPA 2ZBTA 2R14A 3W2UA 1AL7A 4QAIA 3USBA 3HIJA 1OX5A 1RQEA 1ME7A 3BGGA 4UTJA 5D2VA 2Y70A 4UTLA 3BK0A 3MBFA 1JQVA 2H3DA 3GIYA 2VFDA 2JK2A 2R94A 1QMLA 2RDTA 2YZRA 3EXSA 2TYSA 1VZWA 1VCVA 1ZHAA 3DI0A 1W0MA 3ABQA 2EAWA 4D2JA 3HG5A 4K8HA 3NQ2A 5AN7A 3L5AA 5FF7A 2VELA 6TIMA 4ZQOA 3G1SA 5E1QA 3Q37A 1YTKA 3JRKA 4DQWA 3GZ3A 1NF7A 3NZRA 2JKPA 1WX0A 1J4EA 3IV3A 3QPYA 3GNNA 3DKLA 4I7WA 4RV8A 3W7DA 4UMAA 2A7RA 4P2VA 3ABOA 4ZQPA 4HSOA 2XN1A 2NXGA 3TSMA 2DJLA 3QYQA 4O1CA 3M5XA 3STCA 2E5BA 1QPNA 3EWZA 5G2HA 5C2XA 2Q3OA 4LUIA 3CEPA 1R2TA 3T44A 2GQ8A 4RZ5A 2DZWA 2TMDA 3S5ZA 4DPPA 1H7PA 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 1L2U A;  3TMQ A;  2EKC A;  1JCJ A;  4NNB A;  3LX9 A;  3KVJ A;  5DXX A;  3O16 A;  3B03 A;  5LNR A;  2P1F A;  2QDH A;  3SEC A;  1Q6R A;  1KTC A;  1TRI A;  4AHQ A;  1JCY A;  2CLM A;  1RD5 A;  3DGR A;  3CC1 A;  3GYE A;  4DEF A;  1VGA A;  1TTQ A;  2E6Y A;  3UPB A;  4N9E A;  5C6M A;  5G2I A;  4QNE A;  2PCQ A;  2QCL A;  4RCX A;  5SWU A;  4UTU A;  3WFA A;  5AHN A;  2J6X A;  4PTN A;  3TU9 A;  4O10 A;  2YCE A;  4JX6 A;  3EWW A;  2V2H A;  1YTE A;  2ZRX A;  2PRM A;  3G3D A;  1P5B A;  2A7P A;  2JKA A;  5D2X A;  3NQV A;  5DCD A;  4ZQN A;  2E6A A;  2ZZ6 A;  5FEZ A;  1NF0 A;  3I65 A;  1DVJ A;  1TCD A;  1S5W A;  3S5N A;  4JR5 A;  2A0N A;  4WQ6 A;  3UYC A;  3TXV A;  1SUX A;  4K39 A;  1LP6 A;  2R8W A;  3BO9 A;  3EXR A;  3S9Y A;  2E6D A;  1B3O A;  1TMH A;  3LB0 A;  3E12 A;  2WPB A;  4AWU A;  3HPZ A;  3DFS A;  2Z6J A;  1BWK A;  3NPX A;  3QMR A;  1G6C A;  3KX6 A;  3E0I A;  3ANY A;  1YXY A;  4BI7 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DG6 A;  3QF0 A;  4H6E A;  4A2S A;  4DLF A;  3IGX A;  1EOK A;  2GVE A;  1RR2 A;  2W79 A;  4Q3M A;  1TIW A;  4C7D A;  1MEH A;  1XFC A;  4YYC A;  4WJE A;  3WO8 A;  4ZGY A;  3A13 A;  3F5K A;  2Y8V A;  1UR3 M;  4DJD C;  3B9A A;  2J25 A;  1Z6K A;  2Z1S A;  1RK5 A;  4XBK A;  3LHY A;  1KRC C;  3KUM A;  4HMC A;  1G4P A;  2QCE A;  5BXS A;  3BG9 A;  3VIF A;  3OQ8 A;  4JCM A;  1U1U A;  3GNO A;  4CEX C;  1XPY A;  3INP A;  4UQE A;  2Y61 A;  1JNE A;  2NXH A;  1YPI A;  1E51 A;  2P0O A;  1R30 A;  2J7E A;  4O19 A;  5HUP A;  5A6K A;  4WOZ A;  1KNW A;  3HN3 A;  2PS2 A;  2G41 A;  3KRU A;  2PDX A;  2QYG A;  1Q6E A;  1W5N A;  2IPW A;  4LS2 A;  3U2O A;  4DBW A;  2YIH A;  1KM1 A;  1EIB A;  4H41 A;  3SW6 A;  2RDU A;  4XQ6 A;  3RLH A;  4UUI A;  2C7F A;  3UPW A;  3ARW A;  3H8A A;  4EXB A;  1UC4 A;  2BNJ A;  4KFO A;  3BGA A;  1V0L A;  2DIK A;  1B2Y A;  3BSG A;  2XG9 A;  3S9Z A;  5A8G A;  4BF9 A;  2OOD A;  5FEP A;  2WQD A;  2PWH A;  3CIW A;  1PZ2 A;  4GG9 A;  4RX0 A;  3CWN A;  3PSV A;  1HTI A;  2DVT A;  1IV8 A;  3CQK A; 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