4M7SA

Crystal structure of semet btrn in an open conformation
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
249
structure length
214
Chain Sequence
MDKLFSMIEVEVNSQCNRTCWYCPNSVTGEMDPALYKTLMEQLSSLDFAGRISFHFYGEPLLCKNLDLFVGMTTEYIPRARPIIYTNGDFLTEKRLQTLTELGIQKFIVTQHAGADKEKVVYLDHSASKANMSCMVPSNLAVVTVLGNVLPCFEDFNQKMVMGNIGEQHISDIWHNDKFTSFRKMLKEGHRGKSDLCKNCNNVSVQTEEQYDYV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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connected with : NaN
molecule tags Metal binding protein
source organism Bacillus circulans
publication title X-ray analysis of butirosin biosynthetic enzyme BtrN redefines structural motifs for AdoMet radical chemistry.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BtrN
total genus 71
structure length 214
sequence length 249
ec nomenclature ec 1.1.99.38: 2-deoxy-scyllo-inosamine dehydrogenase (AdoMet-dependent).
pdb deposition date 2013-08-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13186 SPASM Iron-sulfur cluster-binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4m7sA00
2J9ZA 3W2JA 4OT7A 2EGZA 4FNRA 3HGSA 1XI3A 4I7UA 4QM1A 3UWUA 1PCKA 1QAPA 3DFTA 3GKFA 4UFJA 3PSVA 4R53A 2NXGA 1EPXA 4NX0A 3B06A 4ML9A 1EUAA 3MYPA 1THFD 3IV3A 5AN7A 1UUOA 1W5PA 3KVLA 4NJHA 4WY0B 4DO5A 2WV8A 4OQVA 5E1QA 2A7RA 1K7XA 4DF1A 3M41A 3BG5A 4BI6A 4JX6A 4N02A 4CNOA 4K6AA 4UIOA 4X22A 1V5XA 3O06A 2ZRWA 4FF7A 2QAPA 1LBLA 5G1TA 4BF9A 2ISVA 4O4VA 2TPSA 2YX0A 2WQPA 3TQ0A 3UNDA 2DJXA 1JQXA 3ATZA 4MKNA 1RVGA 5DXYA 4UCGA 4P2VA 4O11A 4NNCA 3MWAA 5I3GA 1TRDA 1OFAA 1ZJIA 1XBZA 1IXNA 1AMKA 2O7QA 3QEZA 4PFMA 3BO9A 3OVRA 5LNVA 3Q94A 5F2IA 2NV2A 4QIUA 2OT0A 3PWAA 1FXQA 4UUIA 3KRUA 1G7VA 3IVSA 4ADSA 2C6QA 5FEPA 1FDYA 5K9XA 4NZFA 4M19A 1R2TA 1A5SA 4E38A 4ZQPA 3PUEA 1LOSA 3S5OA 3NPVA 1I2QA 2ATMA 4HPXA 4O8RA 4MYAA 4WXZA 3MP5A 4H4IA 1W3IA 3KOFA 3K30A 3GNNA 3G0XA 4MY1A 1NSJA 2ZRUA 3M9YA 3L2IA 3P74A 1V7YA 2VEMA 3F4NA 2J24A 2QUVA 2ZTJA 5F2MA 1DJNA 5HINA 1HO4A 1QFEA 1OFQA 3INPA 3W7LA 2E6FA 3MYOA 4YCPA 4IQLA 4JTLA 2ZDRA 5K4ZA 1F5ZA 5FF3A 3W7KA 1SZGA 4FNPA 4UTWC 1KM1A 3M6YA 3NQ8A 3W9ZA 3WJXA 4OGZA 5CPOA 3C4UA 3HIJA 4JDYA 2GOUA 3SW6A 1LROA 2X16A 3TK7A 1ICPA 3TSBA 3ABOA 4UTMA 4O14A 3BLIA 4MLRA 3FEMA 1KBIA 4DBEA 1VYPX 1ME7A 5C5YA 5FI8A 3GNDA 3NZ1A 5AHIA 1TPVA 2TYSA 3LCWA 3VNDA 2NXIA 1ZAJA 3M5XA 3W1MA 3C56A 1OK4A 3UWYA 3C0JA 2H8XA 4MYXA 3I7SA 3BLEA 1I45A 1YDOA 3M0ZA 4LVDA 4O18A 3B0VC 3A5FA 4JN6A 4BI7A 3LTYA 4AH7A 4DPPA 4UFLA 5BW6A 4DXVA 1VCFA 3OVPA 1Z48A 4AHPA 1K8XA 3THQA 1IXOA 2CU0A 3W1UA 4LY8A 2C16A 2QDHA 4LTSA 2CLIA 4K37A 2C13A 3GXNA 4MIMA 3N9SA 4NUWA 4O1CA 1UBSA 1G4SA 2VKZG 3B8DA 1PE1A 5G4WA 3C2OA 4LVGA 1LM1A 1T96A 4JGDA 3FJ6A 3ANYA 1LCOA 1UB3A 4N9EA 3KVJA 1DKWA 3LCFA 3QPYA 2ZZ4A 1GT8A 2Z1BA 3IRDA 6ALDA 3G8EA 5DCEA 4FX8A 5D33A 2JK2A 4G1KA 3NQ2A 1FCBA 4IJBA 1QPOA 4E2DA 3QZEA 1ICQA 5AC7A 1U5JA 1D3HA 3N19B 3PB2A 1N7KA 3MBDA 3C8FA 3UPWA 5KTLA 2RDWA 1SFJA 2X1UA 3LCXA 1DQXA 3OIXA 3W88A 1FWWA 5BNKA 1PHWA 1TRIA 2VEPA 4WJEA 4O4WA 3BG3A 1M7OA 2ZZ1A 3WK3A 1WAUA 3P82A 3I6RA 2DZSA 4PCFA 1L6YA 2GQ8A 4YLWA 2ZRVA 4MJZA 4DO4A 1GYLA 3DFQA 3PUDA 3MMTA 3C2EA 3CEPA 1TTQA 1OF8A 1GWJA 2J27A 1BWKA 3NQGA 3DZ1A 1YPIA 5HMSA 5TBOA 1ZAHA 4IOTA 1VLIA 1W1ZA 3NM1A 3BW2A 2Y88A 1MSSA 4S2BA 4Y8FA 3ABQA 4JS3A 4LC6A 4K7VA 3T55A 3DAQA 3GX9A 1H1YA 1K03A 4RCXA 1FXPA 3G24A 5LNUA 2YYTA 4NT0A 4RXGA 4Z1AA 4OHQA 2Y89A 3FKRA 4HSNA 5DCDA 2X1SA 4O16A 2DORA 4OBTA 4IX0A 1VLWA 3S1VA 3GLCA 1FBAA 4O52A 2NUWA 3V1PA 2DJLA 3L21A 3GAYA 1VPXA 3W2LA 3LTSA 5FF4A 5FESA 5I3IA 1GVOA 3UWZA 4K7YA 3PBWA 3W1LA 2E5CA 2NUYA 2FPVA 3BLFA 1W3NA 3GDTA 3HPSA 1P4CA 1UASA 3R89A 4B5NA 3THAA 1OYAA 4CCEA 3MI3A 4O0KA 2VOMA 4O15A 1AW1A 1B4EA 3PAJA 3CEUA 2J9YA 1OFRA 2CZEA 2CLKA 3LCHA 1WA3A 1KM6A 4GUJA 1TMHA 4BWLA 4YL2A 5TIMA 2FQIA 2W79A 3MO7A 1QPQA 4MFDA 3RLUA 1MEWA 1AW2A 2DZUA 4W9TA 4TMBA 5IBXC 1KFKA 4N9CA 1F74A 1QNVA 3M5YA 1EUNA 1QCWA 2JGQA 4DF0A 1U83A 1Q6OA 1S5WA 1NFBA 3MP3A 1TIMA 1SU5A 4XZ9A 4O10A 3D0CA 1CX9A 3IGXA 2A6NA 5DY3A 1TJRA 4FNSA 1VYRA 1MEHA 4IMCA 5CPMA 5CZJA 1L2UA 5K2ZA 4OV9A 3ZR4A 3RK8A 4UMAA 4CNNA 2OCZA 4CNPA 1IGSA 2VELA 1YPFA 4RKAA 2ZTKA 5A8GA 5G2WA 3DU0A 5KMYA 3EX3A 5LHFA 4QNWA 1K7FA 2V81A 1OX5A 4NNAA 3P80A 4S2CA 3RFAA 3QMTA 2VEKA 2ATSA 4UTKA 1W31A 1XUUA 3W1NA 3KRZA 3G1HA 1C29A 2GVJA 3O16A 2PURA 2YSWA 3W85A 4WOQA 5H91A 3GR7A 3NNTA 2W0UA 4TO8A 1C8VA 3S1UA 3W6YA 2Z0IA 1NVMA 3BGJA 3IGUA 3TR2A 5K4XA 4L4LA 1TTIA 2Y85A 2BLEA 2V0TA 2VFGA 3CC1A 4ADUA 1KLZA 1SZNA 2ZZ6A 2I1OA 3B04A 5U7SA 3T78A 2A7NA 3E12A 1F73A 1DQWA 1ICSA 1VQTA 2YFOA 3STCA 3GK0A 3M44A 4JTEA 1OF6A 4S1FA 4A3UA 2OX1A 5DXXA 4RR4A 3S1WA 1RQHA 3BG9A 1KM0A 3L9CA 1SO5A 3STGA 5EYWA 1EWDA 3HGJA 3LCIA 3SIZA 1VR6A 2CWNA 3E9AA 2H3BA 5D32A 4LV4A 3LHTA 2VFHA 2ABBA 3PM6A 3GXTA 3NAVA 3VFLA 3G22A 3L68A 5F4XA 1H63A 2CZ5A 1DHPA 4AAJA 1TREA 2Q3OA 2X1TA 1W56A 3EWBX 3HPZA 1YDVA 1YXDA 3L0KA 5J5RA 1TPH1 3OA3A 3TW6A 5AYYA 1DVJA 4LU0A 4BI5A 2C15A 1TSIA 1TPC1 3B4UA 3BV4A 1H51A 1JCYA 3B0PA 5C6MA 4EVZA 4FEZA 4DBDA 1H7OA 4HN4A 4U28A 2Y7GA 4EIVA 3W1PA 1KFCA 3MW7A 1TPEA 1KM2A 3IGSA 1ONRA 3SGZA 3P61A 3W84A 3TW7A 3C2RA 1VYSX 3EKLA 4YCOA 4WQ6A 3L0NA 4H3DA 1P1XA 3DFNA 2CZDA 1TO3A 5BMWA 1H7NA 5AC8A 2ZZ5A 1XC4A 3IVUA 5LKYA 3S8HA 3W86A 5D2VA 1W5QA 3W72A 2YW3A 5DCBA 1SQ7A 4XTIA 1G69A 3B03A 2ZCGA 3W7RA 1FCQA 1GVSA 1NEYA 1JQVA 3LHWA 1PIIA 4Y9AA 3FFSA 3IEBA 5D03A 1EEPA 1ZNNA 2ALDA 3P84A 3W7GA 4UNLA 3PUOA 1LZOA 3W71A 4A2RA 4MZYA 2VENA 5DBUA 4NXKA 1HUVA 3TSMA 3W83A 1IIHA 3B0UX 3UPBA 2JKPA 2YYUA 5SWUA 3DH7A 3S6DA 3W2UA 2YXGA 5DN1A 2C18A 1F2JA 1TV7A 4PC8A 4M7TA 3CIXA 5EBUA 1W37A 4YWIA 1SO4A 4YMZA 4ZQMA 2VXNA 1Z41A 3TU9A 4DPQA 2VC6A 2Y7EA 1OFEA 5KITA 1P5BA 3G1VA 5ABTA 5K3VA 1G67A 3O63A 3F03K 4QITA 1I4NA 4D2JA 3FOKA 3GDLA 2V8ZA 1KBJA 3BVJA 1R2RA 3EX2A 2TMDA 4HNUA 1KFBA 1WXJA 1KM3A 1XBYA 5F1VA 3SZ8A 1M5WA 1KLYA 3U6WA 4LVFA 3TUUA 3LDVA 4AEOA 4LS0A 1AL8A 3U8GA 1DBTA 4MZ1A 1JRBA 2Z6JA 5BMXA 1FWTA 2DZXA 2AAMA 3EX4A 3LXBA 4Q32A 2WJZA 3HPXA 5BOOA 3FYPA 3TH6A 3UY7A 5D38A 3KX6A 3EX6A 3L5AA 1I2PA 2A6LA 5D02A 2A0NA 4X2RA 3NA8A 1SUXA 1KTCA 1T8XA 3N3MA 1O4UA 3LHZA 3MI6A 4NXSA 3C61A 4ZVJA 1G4EA 4CCCA 4JX4A 1UJPA 4KFPA 3P62A 3KXQA 1YTDA 3I7RA 3TMQA 1TPFA 1OX6A 3H55A 3M7WA 4PODA 4CQ8A 1JUKA 3LV6A 4LOCA 1XDMA 4RZ4A 5D30A 2QCFA 2CLOA 4MJMA 4O19A 2PRLA 3ZFHA 4XUGA 5K9CA 4K38A 2V5BA 5EA9A 4N6EA 4AMAA 3EB2A 4HKPA 1EIXA 3VKJA 2QCEA 1BKSA 4LT9A 4DF2A 2Z6IA 2JKEA 3TFXA 2O7SA 5F2GA 2QCDA 3TQKA 1T0OA 4EF9A 2WSYA 1HG3A 2BTMA 4FXRA 3P8IA 4O1AA 4KKXA 1EP3A 2ZFAA 3EEGA 2V5LA 4RV8A 1TPDA 4OWGA 2PE4A 2V82A 3L66A 4ZQNA 1Z44A 5CG7A 2NWRA 3JS3A 3HMJG 1IXPA 4GUHA 1SW3A 5AYZA 3TC7A 3BW4A 3TAKA 2QCDB 3TCEA 4UTIA 5EMUA 5AFDA 2CFFA 3ZWTA 1DV7A 2RH9A 3HG2A 3L0GA 3NQ7A 3EXRA 5D04C 3W7EA 3Q2DA 1QO2A 1KA9F 4Z1CA 3R12A 1LDCA 1H7XA 3O6YX 3TROA 1GTHA 4RK8A 3TFCA 3W7MA 1X1OA 1C9DA 3U2OA 3W22A 3R5EA 2JKAA 7TIMA 1GQNA 1K8ZA 3W73A 2FIQA 5KZMA 4POCA 1TQXA 4TR9A 1GJPA 1KM4A 1KFLA 3TAOA 1FQ0A 3EWWA 3CLMA 1Q6RA 3PBVA 3CTLA 3TSDA 4IMFA 2P1FA 3SGUA 3NL2A 3KRSA 1YDNA 1G7UA 1FWRA 3W7PA 4NJJA 2DZPA 5HR6A 2X2GA 4TX9A 3W1TA 3QH2A 1QR7A 3GDRA 1KM5A 1OABA 3G1DA 3QPZA 5CZTA 3MP4A 3UWVA 1XBVA 2C14A 1LBMA 4GE8A 1WBJA 1YYAA 1JUEA 2QEZA 3EKZA 4UFKA 2OT1A 3M5VA 5HUOA 4J9JA 4EOUA 3SSJA 3LB0A 1JCNA 3FKKA 1QO5A 5AOUA 5T26A 2ABAA 5C55A 4WXYA 3GZ3A 1ADOA 3LERA 3NM3A 3QSTA 3P67A 3PG8A 2Y7FA 3W75A 2FB3A 1I2OA 1KV5A 4MZ8A 2H90A 1GVFA 4WY0F 3MI2A 4OU1A 2YDAA 4MLJA 3O15A 1A53A 4O50A 2E6DA 2QCHA 1ZFJA 4ZQOA 2BWGA 5LSMA 3G1FA 3MHFA 1SSGA 5IM51 2GJLA 5I3HA 5KSWA 2GQ9A 2WSRA 4Z08A 5F2LA 4JD4A 5H2ZA 4N2YA 2DU2A 3A24A 2YGYA 4UTTA 3NG3A 2XFWA 3I7QA 4PTNA 4JTUA 1QOQA 4GUFA 5CZ0A 2AQWA 4Q33A 4QJ1A 1LOLA 3G1XA 3LCLA 1F6KA 5LZLA 4ORMA 3NXFA 1K3UA 5AHMA 4AF0A 1GVRA 3QM3A 4O12A 3PSWA 1JVNA 3LLFA 3G0UA 3NVTA 4LVBA 1WYIA 3A23A 3T7VA 3QQ1A 4CQAA 1O5XA 3A21A 2BSLA 4NJKA 1OFBA 3NQDA 4N9BA 4AF0B 1A5AA 5LGXA 3UD6A 1QPNA 4HT3A 2ZBTA 3LRMA 4ALDA 2F7FA 4ONVA 4UTJA 4IPJA 5AC6A 1ME8A 1RQEA 4XTDA 3LI0A 3TMLA 5DBTA 1H62A 1LRTA 1SW0A 1JRCA 3A5VA 3EWYA 3T4CA 1OHLA 4NVTA 2NX3A 3LHYA 4O57A 2FDSA 1ML1A 1PHQA 3DXIA 4ZQCA 3QYQA 3LRLA 4JICA 2A4AA 4K36A 4PH6A 1FUYA 3HQ1A 4QSHA 3LI1A 1X7FA 3RMJA 3W87A 3VI2A 3QQ0A 4ICNA 4JTKA 3P60A 4ORIA 1TTJA 1SR9A 3O05A 4O54A 3SECA 3AJXA 2WNNA 3LX9A 4UMCA 3SY5A 4JR5A 2Q8LA 4K8HA 1NF0A 1FWSA 2WOQA 2V30A 4JTJA 3USBA 1SPQA 2D73A 3TV8A 3EX1A 2Y7DA 3KVKA 1D9EA 3CM4A 2QCCA 4FIRA 3F1QA 5D2TA 3DFOA 2R14A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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