4MJMA

Crystal structure of the inosine 5'-monophosphate dehydrogenase, with a short internal deletion of cbs domain from bacillus anthracis str. ames
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
362
structure length
328
Chain Sequence
SKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSESGGIKDIEKVIEFPNSAKDKQGRLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIGRQFKVYRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase, with a Short Internal Deletion of CBS Domain from Bacillus anthracis str. Ames
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus anthracis
total genus 81
structure length 328
sequence length 362
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2013-09-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4mjmA00
5HULA 3W6YA 4LOCA 2E6AA 4NJJA 4NXSA 4FNTA 1BWKA 3W7HA 2JKPA 1X8FA 5G5IA 2JGQA 3W7LA 3HPZA 4PL2A 2VFDA 1KBJA 3MYOA 1RQHA 3DBPA 3IIOA 1SFLA 3L66A 3N19B 4PA8A 3DI1A 3U8GA 5AYYA 5FEXA 2TMDA 1NVMA 1ZNNA 1ZALA 4J9JA 2ZTJA 3W2LA 1XL9A 1KM1A 2NX1A 1Y0EA 3BW3A 5EMUA 4I7WA 3W7MA 3QW4B 1LBLA 3VCRA 4ZMGA 1DQWA 4KFOA 1YXDA 2FB3A 4BF9A 3WK1A 2V0TA 4O16A 3G1YA 3W86A 1K3UA 4GRSA 1S5VA 3TMLA 4Z1AA 4UTMA 3L5AA 3CM4A 1A53A 1PV8A 4DF2A 4WXYA 3W7DA 6ALDA 3QSTA 3EXSA 1GVOA 5I3HA 5FF0A 3P8IA 4AF0B 3O1NA 2C1HA 3W1QA 1UJPA 5D2YA 4LS2A 4JY8A 1V7YA 4M7SA 2XN0A 3UD6A 2C14A 3B0UX 3CTLA 1B4KA 3LLDA 4FNSA 2PCQA 5KZMA 3UWWA 4GBUA 3ELFA 1EP1A 3TUUA 2QR6A 2X1TA 1P1XA 5FF7A 1LP6A 3ZWSA 4BWLA 1O94A 5HR7A 3S5ZA 1TTPA 4WZHA 4DO5A 1YTDA 3RU6A 5CZTA 3DHDA 3PR2A 1GG0A 1L9WA 5CZ0A 1OX6A 3HPXA 4GUFA 5TBOA 1SZEA 3STGA 3M6YA 1MEWA 3NQCA 3KRUA 4CNOA 1QFEA 1VPXA 2BTMA 3PUOA 1SW3A 5IBXC 3N2XA 2VFHA 3TK7A 1YPFA 5CKSA 2WNZA 3NL6A 3G24A 4FX8A 1GVQA 1PS9A 5CPOA 3I68A 1A50A 4UFMA 4OHQA 3N3MA 2AGKA 3RNDA 1KFKA 1IXOA 4UFIA 1SZFA 4W9TA 2VEIA 3GDKA 4UTWA 3BG3A 1TYGA 4O10A 5AHMA 4IX0A 4R53A 2RFGA 1LROA 2ZRYA 3O16A 4LU0A 2CZDA 1TTIA 2YFNA 3DGRA 3IGXA 3G1XA 1Z48A 3KFTA 3NR0A 4Z0SA 1ZAJA 3M16A 1TSIA 1A5SA 1U83A 3TMQA 3D0CA 3NO5A 2FPVA 2HS8A 2WPBA 4H3DA 1W3TA 2E6FA 1AG1O 3GB6A 3M5XA 4ML9A 2B7QA 3A21A 5DXXA 3CU2A 2OT0A 1DJNA 4UTKA 2QUUA 4MLRA 4PH6A 5K9DA 2QCNA 5TIMA 1XBXA 2WKJA 2J88A 1VCVA 5K7JA 1NEYA 2VFIA 3LCFA 1F5ZA 1OG0A 1W54A 1O5KA 4K39A 1FCVA 2P10A 4UMAA 2CZFA 4FNPA 2QCEA 4I7UA 4P2VA 1QOPA 2O7SA 4ICNA 1EUNA 3UXAA 2G97A 3UQNA 1E51A 3UZJA 3LTYA 5G2IA 3SFKA 1TRIA 3HGSA 5CG7A 1AW5A 1UASA 5I3KA 4NQ1A 1FWNA 1SZGA 4QNEA 1YADA 1YYAA 4OE7A 4PEKA 8TIMA 3PF3A 3SI9A 3QQ0A 2GPTA 5MHBA 3MMTA 1DHPA 2G5WA 3ZR4A 2Z6IA 2YYTA 4LV9A 5KSWA 4DF1A 4IGHA 5E1QA 1RZMA 4AB4A 3W7IA 2GJNA 2J9ZA 4N2YA 4B5NA 2NX9A 1JCMP 2TPSA 4X9SA 3LCHA 1TPC1 4FX7A 2QF7A 1IGSA 3PSWA 4HNNA 1KBIA 4Z1BA 3I7QA 1G7UA 4UTUA 5BMXA 4CCCA 4KKXA 3MP3A 2NX3A 3TX9A 1I4NA 5CSRA 2RDUA 4ORIA 4LS1A 5DCDA 1KA9F 3EB2A 4GFSA 5D2WA 3KRSA 4Y90A 1VCGA 3S5YA 3O63A 3PBVA 4FF7A 4RK8A 3B0VC 2C19A 3NQ8A 3P62A 1F05A 1TMHA 4D2JA 2ISSA 2J27A 5AHNA 3GVGA 2ABBA 3NNTA 3DZ1A 4O13A 3HF3A 4MUZA 3LHUA 5HQEA 4O8RA 2YYUA 2F84A 4S1FA 4JTSA 3W7RA 3MI2A 5D2VA 1DVJA 4JTHA 3UXDA 1X6UA 3F1QA 4JX6A 3OIXA 2V2DA 1IIGA 2ZCGA 3FFSA 4DBDA 4NT0A 2H3BA 4PC8A 2I9EA 3I7SA 3W74A 3UWVA 1JCYA 3GNNA 3STFA 3NDOA 4N6EA 3TXVA 1ZFJA 3S9YA 3DFQA 2G96A 1RV8A 4QISA 2Z1BA 1MSSA 3ZWTA 5E93A 3NPUA 1F2JA 3TDFA 4E0CA 3C2FA 5D33A 3OVPA 1MEIA 4JX5A 1K7EA 4XKYA 5CSSA 4C1LA 1IXQA 1W3IA 3QFEA 5F2LA 4GWEA 3USBA 2DJXA 1NF7A 5K2ZA 1TV5A 2CW6A 4MJMA 5BMWA 5DLCA 5HJLA 4CLMA 4JGDA 2FQIA 3SECA 4Y96A 4IMDA 1IXNA 5AC8A 2A2IA 1SSGA 3HG5A 3BW4A 1HO4A 3GZ3A 3LTSA 4DO6A 1W31A 1G67A 1HO1A 4IPJA 3PM6A 2A4AA 3ABRA 4IWWA 1VYRA 3G1HA 1SW7A 1SO4A 3TC7A 1RD5A 1EP3A 3HGOA 4WY0A 1F74A 3TW7A 3SSJA 1DQXA 1RQEA 1EWEA 1ICSA 5DBTA 2P1FA 3QMTA 3W22A 2DZPA 4LVDA 3HMJG 4JXCA 1YXCA 3PUEA 4UTWC 4N9EA 2QKFA 4IJBA 2DZWA 3P60A 4UTJA 1K8ZA 3GDMA 5EPDA 5AYZA 3LHVA 4K7VA 3P67A 1XBYA 4YCOA 4YMZA 4AHPA 4ZQCA 4RR4A 5LHEA 2WSQA 1QDSA 4IXXA 4AHOA 3O06A 1WX0A 2GVLA 4LVBA 4JN6A 3G3DA 5HUOA 3P5ZA 4WUIA 3T78A 1LZOA 3CIWA 4KFNA 3STEA 2GOUA 2KZHA 1KFEA 1GYLA 3NL3A 3JR2A 5IBXA 1GEQA 4O1DA 5J5RA 1HTIA 2NUYA 3LRKA 2YW4A 1JQXA 5U4NA 3G0UA 3O15A 4GUIA 1VHNA 5KZEA 3DFTA 3GXPA 4UMCA 5FF4A 4MKNA 3KX6A 1FY6A 3GR7A 1KLZA 3T4CA 2YGYA 3NQVA 1H63A 2X16A 5EL1A 2H3DA 2A7RA 3HJZA 3RLVA 1OYCA 3GAYA 3M5ZA 3B05A 2NUXA 1X1OA 1J2WA 3R13A 3I7RA 4AXKA 1OFRA 2JGYA 2QUTA 4HSNA 4NX5A 4ADTA 4H4IA 5KMYA 2YSWA 3HOJA 1LBFA 5AHFA 3NG3A 3O8AA 1ZAHA 3LHWA 2B7NA 3UPBA 4AVFA 3IIZA 1H7OA 1W5MA 2VEPA 2DZSA 2HS6A 3NA8A 1LOLA 5C5YA 3PWAA 1OFDA 2BX7A 2ISWA 1T0OA 2NV1A 1YLVA 1M5WA 2J24A 4WQ6A 4IMCA 2ZZ7A 1GPWA 2PRMA 2CLFA 1ALDA 1A5CA 1OFEA 3IGUA 3CIXA 5LNWA 4ALDA 5A8GA 1ZHAA 2ZZ6A 1JQVA 1K7FA 1PE1A 3W23A 2Y7FA 1JCJA 3LHYA 1D3GA 4OWGA 1GOXA 1WA3A 1GYNA 3RK8A 1VCFA 2NWSA 1LBMA 2NWRA 4ZQPA 3W88A 1QO2A 1KW1A 3CWOX 2YZRA 2PRHA 2IQTA 1EWDA 5F1UA 3GX9A 3O6YX 1GTEA 1TQXA 3KVJA 2CLOA 4CQAA 4FB7A 3STCA 3DENA 3NQ7A 1WAUA 3M0ZA 2YPIA 3L0NA 4I9AA 4IX2A 4AEOA 4IQLA 3SR7A 4OV9A 4X3ZA 4NVTA 3N9RA 3JS3A 4WJEA 1PVNA 3LBCA 1A5BA 3LDVA 1HG3A 3MBDA 3NQ2A 3UWYA 1SSDA 1JJKA 1I2QA 3VFLA 1U5JA 1JR1A 5CGQA 4ZQRA 1QMLA 4DXVA 3LCXA 5FEPA 1OX5A 2ZFAA 4JDBA 3PS7A 3ABOA 1JCLA 3C2OA 2WSYA 1LORA 1SR9A 5BOOA 2YW3A 3SW6A 3F4NA 1LM1A 4L4LA 3G22A 3PB2A 3Q58A 1W5PA 2X1SA 1WBJA 1LRQA 4O1BA 4JTIA 3S42A 5CPNA 3IIVA 1O95A 1WV2A 3R5EA 3LGEA 4RXFA 5BRBA 3TW6A 3NYZA 4GE8A 4O50A 2VC6A 3NZRA 2V2CA 3UPWA 4YL2A 4FIQA 1LOSA 2QCLA 1SW0A 3W73A 1UB3A 4S2BA 3BLIA 3W7CA 4OBTA 3G1FA 2D73A 2EF9A 2VEMA 2GVGA 1WOBA 2Z6JA 3WJYA 1VQTA 2WNNA 1HFBA 1NAL1 4HKPA 3UNDA 1KM0A 1I2OA 3MUXA 3GXNA 4MPQA 3IRDA 2QCFA 4UMBA 1KM2A 3G1SA 2ZZ1A 4O57A 3TNOA 1Z41A 1DOSA 3F03K 1JVNA 2C18A 4K6AA 3GAKA 4ZQMA 1FBAA 3G8RA 3TKFA 3WJZA 3FEMA 1LRNA 1LLWA 2FLIA 1ONRA 2WQPA 3R2GA 3GNDA 4K7YA 4Q32A 1NF0A 2Y6ZA 3OEXA 3KVLA 4KWVA 1HL2A 2E5CA 1AL8A 4OQVA 1OFBA 3W1AA 4YLWA 3M9YA 3L67A 5SWUA 3QC3A 4UTTA 2OT1A 3N2MA 1V5XA 1VZWA 5LNUA 4QSHA 4CQ9A 1I2PA 4CNPA 4CNNA 3CQ0A 1BKSA 4YCPA 2CZEA 5HWNA 3PUDA 5C6MA 4RZ4A 2ATMA 2ZA3A 3VE7A 3BG9A 2JK2A 3L0KA 1TPH1 1W37A 4LVGA 4EWND 1SFJA 4DEFA 1DKWA 3CEUA 4XQ6A 3I6RA 3ZS4A 3NQGA 5F4WA 3TH6A 1R47A 2GJLA 2ZRWA 4UTIA 3TA6A 1FWRA 3C52A 5IM51 1G7VA 3A22A 2PRLA 4ZL1A 2OMAA 4HHPA 4HT3A 5KZDA 2YX0A 2VFGA 1SQ7A 1PIIA 2X30A 2JKAA 4LRSA 2E5DA 1ML1A 2R8WA 2DU2A 2WNQA 4LT9A 1XBVA 2FB2A 3PG8A 3DFSA 4PCFA 3LTPA 3LX9A 4R7JA 1O60A 2CLMA 2J6XA 3C61A 3P61A 5BW6A 2CU0A 1H60A 2OCZA 3W7EA 3W1TA 1VC4A 5LHFA 4NJKA 3P81A 1D9EA 5D30A 3W1MA 3IGSA 2VXNA 3I65A 1MXSA 4AF0A 3NZ1A 4Y6GA 4JTGA 5D04C 4BFAA 2QDHA 3GKFA 1XUUA 3ATZA 3EX1A 3EWYA 5G1YA 2YFOA 1TTQA 4A22A 3N9SA 5AOUA 1YDOA 1YXYA 3M1ZA 2Q8LA 3W07A 4UTLA 4LNYA 2DZXA 1YDNA 2ZRVA 1EPXA 5DN1A 1K8XA 3O6CA 2A6LA 1DL3A 1QOQA 4OT7A 4LUJA 1CI1A 1LDCA 4A21A 4JTJA 4AMAA 1VS1A 3S0CA 4MZ1A 1LRTA 5CPMA 4NUWA 3MW7A 4CQ8A 1JRBA 5DCEA 1YDVA 4ZQOA 3C4UA 4O54A 1TJPA 5AHEA 1P0NA 3OVRA 1Z42A 4O1CA 3S8HA 5F4SA 4U28A 2E5BA 1FX6A 5J5DA 3AJXA 4JY9A 2CLEA 4GNJA 1H7NA 1F76A 1VYPX 4OU1A 3LM7A 3W85A 4XBSA 4XZ9A 4ONVA 3FKKA 4AHQA 2ABAA 2TRSA 1EA0A 2CLLA 4L4MA 1W56A 3S1WA 1OK4A 1KFBA 3MBFA 3NOEA 4QIUA 3A5FA 2FIQA 3L9CA 3W7GA 5FF2A 1ADOA 1OFQA 1AW1A 4LS0A 3W1NA 3O6DA 1IF2A 4Q4KA 1I8JA 3NAVA 2V30A 2A21A 2H90A 5AHLA 1T99A 1TTJA 3N14A 4MVAA 3W3OA 1I2RA 1TV8A 1R30A 2NZLA 5I3FA 3PG9A 1J4EA 3TAKA 3PBYA 5AC6A 3LHZA 3W76A 5I3IA 1L6SA 3R8RA 1TPDA 5LZLA 3W7KA 2E68A 5C2XA 2V5BA 6TIMA 3EX6A 4RX0A 1FCUA 4HN4A 1VLWA 4RZ6A 1S5WA 2RDTA 3L68A 1FCQA 4N02A 3QF0A 5LNSA 5LGZA 3B4UA 3S6DA 2RKXA 2OZ0A 4HNTA 1OFAA 4MYAA 5CZJA 4R34A 1W3NA 5AN7A 3HIJA 2V5LA 3L21A 2TYSA 2QJIA 2JBMA 2ZZ3A 3PC0A 5L6UA 1ZENA 1Q6OA 4UNLA 2NXGA 4NZFA 4LVFA 1KV8A 3GLCA 2ALDA 2VEKA 5DELA 3A23A 1FQ0A 1KM5A 3OA3A 1VLIA 5D05A 4TMCA 2W0UA 2YXGA 1FWSA 2ZRXA 5G2HA 1QAPA 3EKZA 1XC4A 1B57A 4M5PA 4LC6A 3M5YA 4FIRA 1C8VA 3EWWA 4UFJA 3FOKA 3BGJA 3HG2A 3W1PA 3TV8A 4DBEA 1OF6A 4H6KA 2Y85A 3NQFA 2QCDB 3YPIA 4GJ1A 2R94A 2Q8ZA 4UTTC 1SO6A 1TJRA 5AHIA 4M19A 3DH7A 3N34A 1YTEA 1WOAA 3G1AA 5K9CA 5U7SA 2ZDRA 2A85A 3MHGA 1T96A 3W1UA 2CZ5A 4N4QA 2QEZA 4N9BA 1TQJA 2C15A 2VKZG 4XBKA 4WD0A 1XI3A 1MO0A 4PL1A 2EPHA 4O4VA 3UYCA 4EIVA 1H1ZA 3NQAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3AS0 A;  1KQY A;  4LF1 A;  2OZ3 A;  1BWK A;  1X1N A;  3W7H A;  1TWD A;  4D8L A;  4G7E A;  5BRP A;  2JGQ A;  5T9C E;  4D6I A;  3W7L A;  3IIO A;  3AS1 A;  4DZ5 A;  3VIM A;  2TMD A;  4WDT A;  1F4A A;  2BAS A;  1ZAL A;  4J9J A;  1XL9 A;  3WD0 A;  5EMU A;  4F79 A;  3S2N A;  1F8I A;  1LBL A;  1FH7 A;  1NP0 A;  3TOY A;  4KFO A;  1YXD A;  5M17 A;  4O16 A;  1E40 A;  4H01 A;  3W86 A;  4GRS A;  5JUV A;  1N8W A;  3VNL A;  3W27 A;  4JFW A;  3W7D A;  6ALD A;  1AJ2 A;  3GHU A;  3QV9 A;  1GVO A;  5I3H A;  1A3W A;  4I9J A;  1JDF A;  5AZ0 A;  4HN8 A;  3ARZ A;  1XRT A;  2CHN A;  3TNB A;  3VNK A;  5A8P A;  5FAC A;  3AHY A;  3R1Z A;  2GJX A;  1V7Y A;  2E4T A;  4F0L A;  2XIQ A;  1B4K A;  4B16 A;  4FNS A;  5KZM A;  3ELF A;  4QHR A;  4MNM A;  4ACY A;  2C1I A;  2X1T A;  3ZWS A;  2JFE X;  1RK5 A;  3OQ8 A;  5M3W A;  3S5Z A;  4Q7I A;  5EMK A;  5EU9 A;  1R38 A;  3DHD A;  1L9W A;  1JI1 A;  1OX6 A;  4F0R A;  3UA3 A;  3KOZ A;  1E0W A;  1DWF M;  4F48 A;  2E25 A;  1MEW A;  3NQC A;  3LPP A;  3CK5 A;  5IBX C;  2VFH A;  3PWI A; 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