4MOZA

Fructose-bisphosphate aldolase from slackia heliotrinireducens dsm 20476
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
316
structure length
316
Chain Sequence
PKITRDQVKVPADVLADARETYIDNYMKATQGTGRLMLFACDQKVEHLNGDFYGEGIDISDSDPEHLFKIADQGVCGVMAGQRGLIARYAADYPNVNYLVKMNSKTNLVKTAQDDPYSPQLHDIEAVLAMRDNGVNVVGLGYTLYLGSEYEATMLAEAGQLVAQAHEEGLIVVLWIYPRGKAVGKDEKAPTTIAGAAGVALCLGADFVKVNPPVATEDKTSAENLAVASAAAGRTGLVCAGGSTVEAKVFLQQLHDQIYIGGASGNATGRNIHQRSLDEAVRLTKAISAITLADYDVDRALAVFNGEEDFALHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Fructose-bisphosphate aldolase from Slackia heliotrinireducens DSM 20476
rcsb
molecule keywords Fructose-bisphosphate aldolase
molecule tags Lyase
source organism Slackia heliotrinireducens
total genus 104
structure length 316
sequence length 316
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4mozA00
3S1WA 2BSLA 1JCYA 3KVMA 3ABSA 1TJRA 3BK0A 4X9SA 3B8DA 2QF7A 2Y7GA 5D05A 3M7WA 4ADUA 1EA0A 3T55A 2B4GA 3LRKA 4MYAA 3W73A 3IV3A 2H3DA 1RQBA 4KFOA 1JUKA 4PODA 2A7NA 4UNLA 4GFSA 2GVGA 2CLEA 3OVRA 4ZVJA 2YPIA 4YL2A 1G7VA 1SR9A 3NQ6A 1M5WA 3W2KA 1MSSA 3QFEA 1QMLA 1VYSX 4K7YA 2ABAA 4WXZA 4JS3A 1G4SA 4JTEA 4QIUA 2A6NA 3NQ2A 4K39A 5CPNA 5DXXA 4UFIA 1I2OA 2J9XA 5D38A 4UTWA 5BRBA 3H53A 4MJMA 3G0SA 3TW6A 3O8AA 5BNKA 4MKNA 4AF0B 5F2GA 3RF9A 4E38A 2Y62A 1ZAJA 2C6QA 3GDKA 1JQXA 4OV9A 1FDYA 4O13A 3NL6A 3LCGA 3W7CA 5HUPA 5F1VA 1OFQA 1OF6A 1XXXA 4HT3A 3LXBA 1TMHA 1SSDA 3P81A 4RLIA 1K7FA 2YR1A 1DOSA 1DHPA 1K3UA 1JJKA 4Q33A 3F03K 3L5MA 3M0ZA 5CGQA 1IXQA 4FO4A 4A22A 1QNVA 1VQTA 3FA5A 3GX9A 4QNWA 2H8ZA 4NT0A 3QSTA 4NX0A 5I3GA 2ZQ0A 4GC4A 1SZGA 3UXDA 3CTLA 3MP3A 5FF0A 3TJXA 3TFCA 2YSWA 4EOUA 4Y6GA 1QPRA 3TMLA 5HJLA 3Q58A 3KXQA 2WSRA 3FOKA 1XCFA 5CZ0A 2QDHA 4NJKA 1TCDA 1JQVA 1TTIA 3QZEA 1A5BA 4LV4A 5KINA 4CQAA 1LBMA 4RZ4A 3QQ0A 1OFDA 3G8RA 4RZ5A 5J5DA 4MY8A 4PH6A 1R47A 2ZRXA 4UC5A 4BF9A 1VGAA 3ELFA 4ORIA 2NWRA 1EX5A 4Z1DA 3OBKA 3NA8A 4WX2A 3L0NA 1P0KA 3EX4A 1A5CA 1PIIA 3LTYA 3N2XA 3DENA 1QDSA 3W23A 2NUXA 2ZZ7A 4Z1BA 4C1KA 3STFA 2DU2A 2EGZA 4IOTA 2ZTKA 3TAOA 2ZYFA 3SGUA 5E1QA 2ZRWA 3IIVA 4TMCA 4PCFA 1QOQA 1QFEA 1TQXA 5D2XA 4UIOA 3R8RA 1X6UA 2CLLA 5KTLA 4H6KA 1KTBA 4GUGA 3HG5A 3A24A 5D03A 1SZNA 4N6FA 4TMBA 4N9CA 5BW6A 3OVPA 2P1FA 1QAPA 4QNEA 4JD4A 5AHMA 4AF0A 4WQ6A 4L4LA 1TQJA 3W7MA 1VRDA 3A21A 4WY0B 3QEZA 4BFAA 1G4PA 3ATYA 5F1UA 4WD0A 2CZDA 3FKRA 3T44A 4ZZ9A 1IXOA 3S1XA 3QSRA 5HWNA 1MXSA 3WJYA 5DCEA 3BG3A 1RD5A 1KTCA 4GUFA 3TNOA 4IJBA 5T26A 4JY9A 3RMJA 4HSNA 5KZEA 2ZRUA 3WJXA 4XKYB 4RV8A 1H1ZA 1R2SA 3HMJG 2QUUA 3M5XA 3LV6A 1RV8A 4ZL1A 3E12A 4LT9A 4WXYA 1SW7A 3W1LA 2GJLA 5CPMA 1NAL1 4O52A 2E5BA 2X1TA 2C13A 2Y70A 4O4VA 3TSBA 4ZQCA 4CCEA 3VNDA 4IGHA 1HL2A 3DFOA 4FHAA 5KZMA 2QCEA 5CSRA 3C52A 5FF2A 5HQEA 4KFNA 1H1YA 1W5OA 2GQ8A 1B9BA 3LV5A 1O5XA 1FY6A 1YPIA 1JULA 3B03A 2DZXA 4AMAA 4JDBA 1W37A 1QCWA 1WQ5A 2CWNA 1GT8A 5FF4A 1H7NA 3EKZA 3HQ1A 3FFSA 5F2IA 3CIWA 4CNPA 4P61A 1S5WA 1V7YA 5AYZA 4K36A 3W88A 2TYSA 2Y88A 5D09A 5U7SA 2VFHA 3E0IA 1TTQA 4Y8FA 5LHFA 3THAA 4DO6A 2QCDB 4PTNA 4JYEA 1M6JA 1NEYA 1VPXA 4O0KA 1J5TA 4AXKA 4FIRA 1FX6A 3NQVA 4UFHA 1UB3A 1ZY9A 2DJXA 3SR7A 3FS2A 3W1QA 3LTPA 3L5AA 2XN2A 1NVMA 2HMCA 4HNVA 3DAQA 4FIQA 5D2VA 3QMTA 2VFDA 1K8XA 2E6YA 2V82A 3LXAA 4OBTA 3N3MA 1OHLA 4PL1A 2YGYA 4IMGA 1FWNA 2W79A 3OVQA 4GRSA 5L9FA 4YCPA 2WSYA 1K8ZA 3TROA 5ABTA 2Y7EA 3TKFA 4H4IA 1QO5A 2H8XA 3G3DA 3NPWA 1WXJA 3Q37A 3W7EA 4IPIA 2NXIA 3NL2A 3I6RA 3W1PA 2ISVA 1LOQA 4EF9A 3UNDA 3QW4B 1FDJA 1VS1A 4JX4A 3VKJA 5F2LA 1IF2A 1PCWA 3MP5A 3TXZA 1H51A 3PB0A 4XKYA 1ICSA 1JUBA 3QRHA 2Y61A 4JX5A 4LS0A 3O16A 3GZ3A 4FXRA 3MP4A 3DI0A 3C2VA 1OYCA 3CT7A 3HG4A 5CSSA 4I9AA 4QJ1A 4GUJA 1EWDA 3JS3A 3W22A 1W8SA 4AHPA 1BKSA 1CX9A 1KFJA 1KBJA 4A3UA 4AHQA 4NXKA 4O1DA 4ONVA 4QITA 3M41A 1T0OA 3MI6A 4KKXA 3OA3A 5HINA 4NNCA 4BI6A 1VCVA 1C8VA 1KM4A 4OU1A 1ZALA 4DO5A 2X16A 3QH2A 1OX4B 1JCXA 4K8EA 3QMSA 4UTHA 2ABBA 2CLOA 3JR2A 3P8IA 3NZRA 1J2WA 3KOFA 4YMZA 4IUOA 3C2OA 4D2JA 3Q94A 1TPDA 4ICNA 3F4WA 4AEOA 2W6RA 3TC6A 2CFFA 1ZJIA 3LDVA 1WBJA 5LNUA 3UWYA 4XBSA 5I3IA 1OG0A 1UUOA 2QCDA 2A6LA 5D2TA 4M7SA 5K9CA 2BLEA 1AL8A 4LV9A 3NEVA 2PRHA 4JTJA 3NNTA 3UY8A 4WOZA 1ZCOA 3LI0A 4M7TA 3IIPA 4NNBA 4P2VA 1KM0A 3DI1A 4N9EA 4M6PA 1IXNA 1XDMA 3KHJA 1O4UA 3IVSA 4JGDA 4S1FA 4NJHA 4HNTA 1GTHA 4XTIA 4HPJA 2FIQA 4QSHA 5LSMA 1VC4A 3QYQA 3HOJA 4ALDA 2GQAA 2PC4A 3N14A 1QR7A 3WJSA 1A5SA 1Q6OA 4NX5A 1L6YA 4LY8A 2Q3RA 3BLEA 5CG7A 3S5NA 4TX9A 4E2DA 3W76A 3P82A 1G4EA 2I9EA 2TMDA 1KM5A 3W9ZA 3H55A 1VHNA 1H7RA 1AW1A 5BMXA 2FPYA 3HF3A 2OZ0A 3FIGA 3GLCA 5DY2A 3B0UX 4LOCA 4U4MA 1OYAA 3PSWA 3W7NA 4TO8A 1HUVA 1IXPA 2YYTA 2VFEA 3IVTA 4WOQA 2FB2A 1KBIA 1UJPA 2E68A 3GAKA 3HGOA 2R8WA 4J9JA 2XFWA 3C56A 3S8HA 1PL9A 2B7OA 1F05A 4MPQA 5DXYA 1L9WA 4JN6A 3KRZA 2VOMA 3M44A 5F2MA 2A21A 4K7VA 1HO4A 2HTMA 3W6YA 1KFLA 2QCNA 5CPOA 3PUDA 3ZR4A 2FFCA 1OX4A 2QCHA 3TK7A 3F4NA 3GDMA 4LWWA 5HNRA 3H54A 4WZHA 3W72A 3SY5A 1LP6A 1G69A 5D2YA 1YDVA 1SSGA 2RDUA 5LNVA 1GEQA 3DKJA 4PEKA 5FESA 1EUAA 1FQ0A 1I2PA 2DZVA 2F84A 4O14A 5D37A 1XFBA 4DF1A 3W7JA 3MJYA 5I3JA 2OCZA 1LOLA 2CZ5A 2ZDRA 2H6RA 1WA3A 1OVDA 4JTKA 4GWEA 1C29A 1I8JA 1GVRA 1PHWA 1QPOA 3TIMA 3CPRA 1LTDA 4MOZA 4OE7A 3G1VA 1U83A 2NXHA 3M5YA 2TSYA 3W2NA 1SQ7A 1H7XA 3SECA 3BV4A 4UTLA 1LM1A 3EKLA 4HPXA 4IMEA 3BO9A 1H62A 2R91A 4UMBA 1AMKA 1YLVA 1JR1A 3LCFA 1VLIA 4E2BA 3LI1A 5D32A 2AGKA 2KZHA 2X1UA 3WK2A 3TC7A 1I2NA 1JCJA 1LOSA 3EXSA 4UNKA 3UPWA 5G1TA 1KM6A 2WV8A 1D3GA 3PC0A 2GVJA 3HPXA 4JTLA 3STEA 1ZAHA 1EEPA 1IGSA 3T78A 2TRSA 1W5NA 3TJLA 4IQLA 2C16A 3CB8A 4S2BA 3MI2A 5AYXA 4CCCA 4LVBA 1VCGA 4ZQPA 1HTIA 3EXTA 1SO5A 1KFEA 1SO4A 3FJ6A 3W83A 2ZA1A 4N9BA 3C6CA 4AWSA 4FNSA 3LHWA 1SFLA 4E0CA 1XKYA 3NR0A 1VZWA 3PBVA 3PUEA 4RXGA 1OFOA 3G1DA 1SU5A 4GBUA 1BWKA 1RZMA 2GOUA 4CCDA 2FLIA 4LRTA 4IMCA 4MZYA 4FNRA 1UASA 4QQ3A 4LUJA 2DZTA 2J6XA 3LCXA 5HUOA 4O18A 1H7PA 4NU7A 2ISWA 3DFTA 4HKPA 3DKLA 3LRLA 1O94A 4R33A 1FCVA 3SJ3A 1YXYA 1M7OA 4ZQNA 3G22A 3HPZA 4IMFA 2ZZ3A 3O1NA 2DZWA 1JUEA 1YXCA 3EEGA 3ABOA 1W3NA 3PM6A 2OMAA 3P61A 1ME8A 1VH7A 2O7SA 4ZMGA 1T8XA 3RLVA 1SO6A 3TV8A 1F73A 1JCMP 1W3TA 3BG9A 3YPIA 3NOEA 2A7RA 5CKSA 5KSWA 2E09A 4FX6M 1DORA 3OHIA 5DCDA 3KVKA 4BI5A 1EWEA 4JIQA 4MZ8A 2FQIA 1AG1O 1SW3A 4DPQA 3KFTA 1SZFA 4Y90A 3G0UA 3MI3A 3UWWA 2OT1A 3F1QA 2VENA 4O0ZA 1TV7A 3W2MA 5MHBA 5CZTA 3C2FA 3W70A 4JTTA 3W7IA 1P0NA 1XBVA 3P74A 1OX6A 4O1AA 4UUIA 5FEZA 3TQKA 4HNNA 5DLCA 3RK8A 3WFAA 2NUWA 4PL2A 1RPXA 2X1SA 1YPFA 1KV8A 3TCEA 5D2WA 4AWTA 1UCWA 2ZRVA 2ALDA 3LHVA 4UTJA 3OEXA 2NX3A 2YYUA 2ZA3A 4OQVA 3NAVA 2Q8LA 4S2CA 1FCBA 3LXCA 1WOBA 3W84A 1GVFA 3IEBA 3I7SA 3C3NA 3SI9A 2X30A 2JGYA 1V5XA 2ZZ4A 5LKYA 2ZZ2A 4GXMA 3W2JA 1ZNNA 3BW3A 3UZ5A 5F4WA 2EPHA 4HHPA 5KITA 1XUUA 1TPWA 3MMTA 3SFKA 3AJXA 4O1BA 3CLMA 3BARA 5FEPA 5FEXA 3TSMA 1N7KA 3UWVA 5EL1A 3TE9A 3QJAA 4LTSA 3O6CA 3FEMA 2E1DA 3KRSA 2RKXA 3BGGA 3BGJA 3LX9A 3E49A 3NL5A 1S5TA 2GVLA 4RK8A 4WJEA 2NX1A 3IVUA 1W5QA 2ISSA 3LHYA 2V2CA 3P62A 4EF8A 1TTPA 1VCFA 1OJXA 3DFQA 3NQMA 3QF0A 1TV8A 4O53A 4LC6A 1H63A 4I7WA 3P8JA 2RH9A 4XBKA 2FPTA 1XL9A 2NZLA 4A2SA 4JDYA 4LNYA 3WJZA 3LHZA 4GUIA 3MBFA 4O12A 1B57A 2V5BA 4Z1AA 4RR4A 3A22A 3BLFA 4TR9A 3S6DA 3G18A 3LOTA 1X1OA 1T99A 2FTPA 3N2MA 3N9SA 4NVTA 5FEWA 3P7YA 1WYIA 2EHHA 3I68A 3PBUA 3GNNA 4O54A 2AAMA 1GYLA 3VE9A 4FF7A 5D33A 4AVFA 2B7QA 1AW5A 5U4NA 2RDWA 3IIOA 5HR7A 5C54A 3HO8A 4N6EA 3EB2A 3NL3A 3DFPA 4POCA 1H60A 5LNSA 5LZLA 1NF7A 1SW0A 3MHUA 3TU9A 2Y6ZA 2OJPA 1QO2A 1M7PA 3GXPA 1NFBA 4UTMA 3JRKA 3G0XA 1I2RA 4DF2A 2ZCGA 3THQA 3O15A 1OFPA 1DV7A 3GNDA 1ICPA 3WK1A 1FUYA 1YYAA 4BWLC 1QWGA 4AH7A 3B4UA 1IIGA 1MEIA 1TREA 3ATZA 3HGRA 1QPNA 5AC6A 1JVNA 1LRTA 1BWLA 5HWMA 4MJZA 3PWAA 1R46A 4MYXA 5AFDA 2VXNA 1TRDA 1WBHA 2WJZA 3OIXA 3LCHA 3PUOA 4MFEA 5GVJA 3G3MA 4NQ1A 3PY2A 4JTFA 4DEFA 2RDTA 3TQ0A 3MYOA 3NQ8A 4UFLA 2QAPA 5G2HA 3BVJA 5AN7A 3L0GA 2NXGA 4WY0A 3TQVA 3HPSA 2YCEA 3W7KA 1OFRA 1K8YA 1B4EA 1JRCA 3C61A 4N02A 4K37A 4MFDA 5AHNA 1W1ZA 1DJQA 1SO3A 4O8RA 3AO0A 3FYOA 3NYZA 3HBLA 3W87A 3ABQA 2QUVA 2XN1A 3NQAA 3EX1A 4DF0A 2YX0A 3NM1A 1RVGA 2PE4A 2ATSA 3N19B 4AHOA 2Z6IA 3EWYA 3W7DA 2BTMA 4BK9A 1THFD 4JX6A 1OX5A 1DQXA 4DO4A 4FEZA 1TJPA 3GKFA 2E77A 5G4WA 3G1AA 3W1RA 1WOAA 1DL3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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