4MVA | Genus

Total Genus 97

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	97
sequence length	255
structure length	255
Chain Sequence	MRHPLVMGNWKLNGSRHMVHELVSNLRKELAGVAGCAVAIAPPEMYIDMAKREAEGSHIMLGAQNVDLNLSGAFTGETSAAMLKDIGAQYIIIGHSERRTYHKESDELIAKKFAVLKEQGLTPVLCIGETEAENEAGKTEEVCARQIDAVLKTQGAAAFEGAVIAYEPVWAIGTGKSATPAQAQAVHKFIRDHIAKVDANIAEQVIIQYGGSVNASNAAELFAQPDIDGALVGGASLKADAFAVIVKAAEAAKQA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structural, kinetic and proteomic characterization of acetyl phosphate-dependent bacterial protein acetylation. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Triosephosphate isomerase
molecule tags	Isomerase
source organism	Escherichia coli
total genus	97
structure length	255
sequence length	255
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2013-09-23

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4mvaA00

3W2KA 2QJIA 5KINA 3QSRA 5G2HA 4CNNA 1FDYA 1YLVA 2DZSA 1SFJA 1FX6A 4JDBA 5I3GA 3C8FA 4ICNA 4AVFA 1W5NA 2ZRWA 4JX6A 1JUBA 2V5BA 4Z0SA 3WFAA 4WJEA 4I7UA 2ALDA 3R12A 2Z0IA 3DBPA 1TREA 3UY7A 3MI2A 4CQAA 5BNKA 4WZHA 3GDLA 3NM3A 3LOTA 1KTBA 1W54A 5AHEA 5HQEA 2G95A 2VEMA 5F1VA 4NJGA 5CPNA 1O60A 3HIJA 4JTKA 4JDYA 4PODA 3Q2DA 1TPEA 4BR1A 3O6DA 3S8HA 1D3GA 5HWJA 2C16A 3I7SA 1BEUA 1ZENA 4RLIA 4IWWA 2J9YA 1JR1A 4HN4A 2FB3A 5CZTA 1L6SA 3FYOA 3M5ZA 2A0NA 2YPIA 3LLFA 1VCGA 3S0CA 1QOQA 3MBFA 3WJYA 1F05A 2YFOA 3TV8A 2C13A 5BMXA 4C1LA 3LCHA 1DBTA 2CU0A 3W88A 3ANYA 4LVDA 2HS6A 3LCIA 4QM1A 4MJMA 3L2IA 1GZGA 5FEPA 4QQ3A 1UCWA 3UQNA 1GTEA 4FEZA 4BK9A 4HPXA 2ZQ0A 4ZQMA 2PURA 2ZZ1A 4LVAA 1EUNA 3RU6A 3BPWA 1EUAA 2A2IA 1F7BA 2JKPA 5LHFA 3L67A 3UZJA 4YCPA 2RH9A 1SO6A 4LV4A 3V75A 2C18A 2YR1A 2Y7DA 4S2CA 1VPXA 5D38A 4LTSA 5A8GA 3M41A 1PE1A 1V7YA 1LROA 4XZ9A 1NEYA 2EF9A 5D03A 1ADOA 3N14A 3PBWA 4P2VA 2DU2A 4LC6A 4UNKA 1S5TA 3G18A 1FCBA 1EP2A 3UD6A 3DFQA 4K8EA 4XQ6A 2E5DA 1G67A 2E6AA 2HTMA 1WDWA 1UBSA 3KVMA 4PL2A 1LDCA 3GR8A 3FLUA 5CPLA 4NX5A 3NAVA 4QSHA 4NUWA 5L6UA 1JRCA 5C2XA 1GVSA 4AAJA 5IM51 4O28A 2VXNA 3EWXA 2VEIA 2YZRA 1EWDA 4IGHA 4GNJA 4HIBA 3FFSA 4NNBA 1TPUA 4JTTA 2ZA2A 3JRKA 3UWVA 4MLJA 3KXQA 1F76A 1IIHA 1W0MA 5LNRA 1EIXA 4LVFA 1ICSA 2OZ0A 1F2JA 4FNQA 4CCEA 3PUEA 3QF0A 4UTJA 1ZAJA 4MFDA 4PTNA 4JN6A 1H7RA 4ALDA 4JYEA 3EWYA 1P0KA 1TPFA 4ZQRA 3DGRA 4M5PA 1ICPA 5AC6A 1SO3A 4LVBA 4NNAA 1OFEA 1H1YA 1NF7A 1VYPX 1Z41A 1B4EA 1TTIA 4YLWA 4YXGA 4NNCA 1GYLA 4FIRA 4M6QA 5BW6A 1QCWA 1SZEA 2FFCA 1TTJA 5I3HA 1Z42A 2ZDRA 1WV2A 3PS7A 4CNPA 5KTLA 3PBUA 3W1TA 3KAOA 4NT0A 4LC8A 1EP3A 1H7OA 3A9IA 1Q3NA 4IMCA 3GNDA 2E09A 3UPWA 3O07A 5EKYA 5BOOA 5K4ZA 3T78A 2Y85A 4OWGA 2ZZ7A 3S5ZA 1JQVA 5CKSA 3BLIA 5F2IA 3LXBA 5F4WA 1R2TA 3N19B 3PB2A 1RQHA 2JGYA 4CQ9A 3GZ3A 1SQ7A 4K39A 3QMTA 2V2CA 2TMDA 3W2JA 3A24A 2OT0A 3SI9A 1DORA 3S9YA 1DL3A 1M6JA 2FPYA 3P80A 2GQ8A 1JCXA 3W75A 3VCRA 1OJXA 3NL6A 3W7QA 1ZY9A 1Q45A 4UTHA 4IX0A 1H1ZA 1QMLA 3EKLA 2Z2UA 5F4XA 3MYPA 2VFHA 4N4PA 3TQKA 1GG0A 5AFDA 1HL2A 4RCXA 3MBDA 5I3FA 3PUDA 4RX0A 3ABQA 2YFNA 3W23A 4N6FA 1G7VA 1QWGA 5E1QA 2CW6A 1FBAA 1RVGA 3B0VC 4GC4A 2NZLA 1GTHA 3MHGA 4DO4A 2PC4A 2X2GA 3UYCA 1XUUA 4O52A 3TKFA 4E0CA 1KLYA 3UXDA 1YTKA 5HMSA 3GB6A 3GDKA 3S5YA 5FEWA 8TIMA 3A5FA 1H5YA 3A23A 3I7RA 3B0UX 1QO2A 2PE4A 3STEA 2ZTJA 1XBXA 2P1FA 2P10A 1TPB1 4AB4A 1PIIA 4OGZA 1MXSA 3EB2A 5TBOA 1QNVA 2VFGA 3WK0A 3P5ZA 5F1UA 3TAOA 1A5AA 5HULA 4BI6A 3TXVA 2QCNA 3P84A 4OBTA 1F6PA 1W5QA 3IVUA 1HO4A 3FYPA 3W7KA 4CQ8A 1O95A 1OK6A 1Q6OA 5I3JA 2RDUA 2FQIA 5G4WA 1FUYA 1DOSA 1VZWA 2YYUA 4LY8A 1XC4A 1GJPA 1FCVA 4ADSA 1QR7A 5AHIA 4NQ1A 1T96A 1TPWA 2GUUA 2VEPA 2WOQA 4K38A 4PCFA 1G7UA 4PEKA 3I68A 3W7HA 3MP5A 3L0KA 5DLCA 1VJIA 4FNRA 4UTIA 4L4LA 3W3OA 5D09A 3W6YA 4KWWA 3MI3A 5E0KA 1XUZA 1DJQA 3R8RA 3O05A 4TU1A 3DI0A 1VRDA 4TX9A 4CNOA 1W5OA 2YCEA 1TPVA 1QOPA 1LRTA 3V1PA 3P8JA 4DBDA 3NPVA 1TQXA 1LYXA 1W3TA 2J6XA 4Y96A 1EA0A 4BFAA 3LCFA 1YTDA 3CT7A 3LHZA 3IIVA 4X22A 4ADTA 1W5PA 1NAL1 2Q3RA 2Q8LA 3NQEA 3E96A 3G0UA 3F4WA 4DO6A 2GOUA 2QUVA 1SW0A 3BW2A 3E9AA 4O17A 3BGJA 1HFBA 4UMBA 2A85A 1WOBA 2ZFAA 3B8DA 2ATMA 3GLCA 4MY9A 1OVDA 4FF7A 2I9EA 5DXXA 4FNPA 3L21A 4UMAA 4JYDA 3OVRA 1C9DA 1VH7A 3NGJA 3NQAA 4HNUA 1KM5A 4O0ZA 3QPYA 1OFPA 4LWWA 4FNSA 2V0TA 4LS0A 1VS1A 1UUOA 5EYWA 4O50A 3VNDA 2VENA 2ZA1A 2GQ9A 3LI0A 1VGAA 4KKXA 1P5BA 2J27A 1I2RA 3QRHA 3N9SA 4IUOA 3W2MA 2ZRZA 2E5BA 3IVTA 1JCYA 4RV8A 3O6CA 3NPWA 4X3ZA 2CZEA 2QJGA 5KMYA 4JIQA 4NZFA 4MFEA 5TIMA 1NSJA 3S1WA 2B7PA 2V81A 3MP4A 5AHMA 3TMLA 1VR6A 3PG8A 2A5HA 5D2XA 3W1RA 4FIQA 3TSBA 2E5CA 1OF6A 3MO7A 1TPDA 3S6DA 4O54A 1ME9A 2PCQA 4UFKA 2BWGA 3G1VA 3STCA 1OFQA 1LM1A 2DJLA 5FI8A 3TSDA 5D02A 4DPPA 3R2GA 3NQ7A 2EKCA 1DHPA 1I2QA 1RD5A 4BWLC 1KA9F 5D2VA 3Q94A 4Z1DA 4PA8A 3NG3A 5G2WA 2EAWA 4JTEA 1GOXA 5LGXA 3DU0A 2Y7EA 3ZR4A 3IIXA 4UTWC 2CLEA 2NXHA 1GVRA 2WPBA 4LV9A 3HOJA 1IXPA 2QUTA 4Y9AA 3CEPA 4WOZA 3RF9A 5K9CA 2BZNA 4FX7A 4O15A 2X1SA 3M6YA 4LW7A 1EPXA 1KLZA 3W1LA 4LS1A 4WY0A 3M47A 1OABA 1TO3A 3PC0A 1T0OA 3ABSA 3GIYA 3UY8A 4JTHA 3UWWA 2QCCA 3N34A 5EPDA 1SSGA 3NQDA 4DF0A 3UWZA 3DFNA 2TPSA 3G1SA 1TTPA 5G1TA 1HUVA 4GBUA 3INPA 5J5RA 2W0UA 3RK8A 4IQLA 4ORMA 4Y6GA 3PF3A 4AXKA 4M7SA 1ONRA 5SWUA 3WJZA 2GPTA 2QF7A 4O1DA 3DKLA 2WNNA 4TMCA 3BO9A 4OV9A 4EIVA 1P1XA 1RQBA 3DFOA 3UXAA 3L5MA 2BSLA 4ZQNA 3T7VA 1WX0A 6TIMA 1J5TA 4C1KA 4RKAA 5H2ZA 1A50A 3LRKA 3W7RA 5DBTA 4NX0A 2NV1A 5G5IA 1GG1A 3EWWA 1VHCA 1LRQA 2ZRXA 5BMWA 2CZ5A 3C2EA 3NVTA 3G1FA 4LRTA 4JX5A 1PHWA 3OBKA 2VELA 4IJBA 4JTGA 1BKSA 2FPVA 3ABRA 3QJAA 2H8XA 4JGDA 3ZS4A 3CWNA 1C29A 1JJKA 1S3HA 3LHYA 4AHPA 2V8ZA 1FQ0A 3NL3A 4H6KA 5D30A 4N2YA 4OT7A 5G4EA 3LV5A 3E0IA 1D9EA 3HGRA 4ZL1A 1WOAA 3BG9A 2ABAA 1T99A 1GPWA 2NLIA 2CLMA 4DELA 4AEOA 2RDTA 5D2WA 4N4QA 1N7KA 2PRLA 4WUIA 1VQTA 3LDVA 1X6UA 3QPZA 2QCDB 1D3HA 3GXPA 2AAMA 5K4XA 3ATZA 1AW5A 1FDZA 1TPC1 4O4WA 2GJNA 3N2MA 3LHWA 4R33A 3WJWA 4QITA 3GYEA 3TQVA 1TCDA 1JRBA 3L0NA 3LRMA 3LRLA 5K3VA 4HT3A 2DZWA 3S5NA 2QCFA 4UTTC 5KZDA 1PCKA 4HHPA 1YYAA 3TQ0A 1YDOA 1ME7A 3ELFA 3D0CA 2QUUA 3HGSA 2Z6JA 4GUJA 1XFBA 1M5WA 4AF0B 3SSJA 1PV8A 3AO0A 4EOUA 2XN2A 1KV8A 2J24A 3NPUA 2J9XA 2ZZ3A 1DKWA 1DQWA 3K30A 3QQ1A 1GQNA 2V9DA 3C3NA 2YW4A 1G4TA 2XN1A 3IIOA 3QEZA 2ABBA 4AH7A 4RXFA 3QSTA 5BRBA 2CZDA 1QO5A 3GNNA 3G3DA 1ZCOA 3WK1A 1N8FA 2H3BA 1DJNA 2CLOA 4DXVA 1O5KA 4UR8A 3TK7A 3N2XA 2ISWA 4O14A 1QPNA 1OYCA 3TFCA 3CQ0A 5EL1A 3EXRA 5FF0A 3TU9A 3QZEA 4O0KA 2QCEA 4A3UA 2FIQA 4UFLA 3GAKA 1ME8A 5LNVA 1TRIA 3W1XA 1AW1A 3THQA 1K8XA 5KITA 4NJJA 3UWUA 4AHQA 2WKJA 5U4NA 2WSRA 3T44A 2C15A 3KRSA 3TDFA 5AHLA 5CGQA 4CLMA 2I1OA 3M5YA 1GEQA 4I9AA 1TV8A 5FF7A 1GVOA 1RV8A 3OHIA 1B57A 4QNEA 3L5AA 1E51A 2Y89A 3CM4A 1KBJA 2QDGA 3HBLA 3GDRA 2A21A 3S42A 4MY8A 4XKYB 5E93A 3W1NA 1H7NA 1GVQA 3UWYA 4QJ1A 4RJEA 3C2RA 3NO5A 3IIZA 1KM2A 5J5DA 4R7JA 4WXZA 3IVSA 3PG9A 4K37A 1MEWA 2LLEA 2A6NA 1EB3A 2CLFA 3M7WA 4UCGA 3HO8A 2Q8ZA 5DCDA 5I3KA 1R30A 2Y7GA 3RNDA 2NWRA 4NXKA 2CLIA 4BI7A 1NVMA 2NXGA 3STFA 5KZEA 5LNWA 5LZLA 3QW4B 1SFLA 2WJZA 3PUOA 3N3MA 4MOZA 3TH6A 2HMCA 3HPXA 3M9YA 1GT8A 1KTCA 1HO1A 4LS2A 3CLMA 1W5MA 2CFFA 4GUGA 3LV6A 4A2RA 4ZQOA 2XN0A 3NQCA 3W85A 1KFEA 3W7CA 5TQLA 3G1YA 4QISA 1W3NA 1LTDA 1SW3A 4JNMA 3PWAA 3L66A 2E6DA 3BV4A 4IPJA 3PAJA 1TPH1 5LSMA 3SGUA 3W7PA 3NQ2A 3LTYA 2B7NA 2OX1A 3B05A 4IXXA 5LNSA 2QCGA 1AK5A 1H7WA 4UFHA 1H60A 1UASA 3G24A 4Z08A 3GAYA 4M6PA 3NXFA 3T40A 3W71A 3W7GA 1RR2A 1PS9A 1LCOA 3LXCA 2RFGA 3W7OA 1Q6LA 1H7PA 3L68A 1KFLA 1FWTA 3LI1A 2TRSA 3NQMA 4FNTA 3HMJG 1K3UA 5DXYA 4Q33A 3W83A 1FWSA 3L5LA 4EWND 3IGUA 4G1KA 4WQ6A 3W1UA 1A5BA 1IXNA 4XBKA 2GVJA 3EXTA 4N9DA 5LNUA 4ONVA 1FWWA 4K36A 1AL7A 4Q4KA 2ZYFA 1VCVA 4QAIA 1F74A 3SECA 3M16A 2I14A 1ZALA 2NX1A 3C61A 1TV5A 3NPXA 4JEQA 1ML1A 1UUMA 3NQVA 4UNLA 1PCWA 3P81A 5U7SA 4X2RA 1KFKA 4NU7A 4JD4A 2X1UA 3LCWA 5LGZA 4JTUA 2ATSA 3W76A 1Z48A 3C2OA 4UC5A 3P62A 3H53A 4E38A 3N9RA 1FWNA 2WSQA 3FS2A 3DAQA 2WNQA 4S1FA 1FCQA 5FEZA 4YL2A 5K7JA 4K8HA 3FKRA 3L9CA 2H6RA 5KSWA 3CB8A 1QPRA 5CSSA 2X1TA 5CG7A 2HSAA 1H62A 1TMHA 4UFMA 2A6LA 2W79A 3SFKA 2A7PA 4M6VA 5K9XA 5MHBA 1YXDA 1K7XA 2OMAA 3GK0A 4NVTA 5HNRA 2AQWA 1QAPA 4BWLA 3BK0A 3W7LA 5C5YA 2C14A 3YPIA 4Z1BA 3BVJA 4O16A 1LOLA 4AWSA 3ABOA 1W56A 2YYTA 3MW7A 1VHNA 2GVGA 4RZ4A 1H50A 3DH7A 3S1VA 1LZOA 2B4GA 3W1MA 1JQXA 4GXMA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chain Sequence

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Chord Diagram

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