4MY1A

Crystal structure of the inosine 5'-monophosphate dehydrogenase, with a internal deletion of cbs domain from bacillus anthracis str. ames complexed with p68
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
362
structure length
349
Chain Sequence
SNAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSGGLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKLVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLESHPHHVQITKEAPNYS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase, with a Internal Deletion of CBS Domain from Bacillus anthracis str. Ames complexed with P68
rcsb
molecule keywords Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Bacillus anthracis
total genus 102
structure length 349
sequence length 362
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date 2013-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4my1A00
1JJKA 1YDOA 4XUGA 1G7UA 2ISVA 1QR7A 3S5NA 1W5NA 2QEZA 3NM3A 3O1NA 1YXDA 3QC3A 2GVJA 3C6CA 1S5VA 1XUUA 3W2MA 5C55A 2ZZ7A 1DJQA 1JULA 3SZ8A 3WK2A 2OT1A 1LBMA 2Y88A 2E6AA 4IXXA 5FF0A 2Z1BA 1O60A 4BK9A 2P1FA 5G4EA 4K7VA 3N9RA 1TJPA 3BG3A 1FDZA 3FLUA 3DI1A 3LXCA 3P81A 5LNUA 3EWYA 3M7WA 2D73A 1J5TA 4TMCA 2JBMA 3W22A 3TXZA 1P0KA 2H8XA 3P62A 4CCCA 1O94A 3W2NA 1SW3A 4XKYA 4I7UA 2YYTA 3NL6A 4MFEA 4IWWA 2NUYA 2O7QA 2JK2A 1W0MA 2OX1A 1EP1A 1PL9A 3NPUA 3OVRA 3E02A 2RDWA 2O7SA 4DEFA 3UZ5A 2EF9A 3RK8A 1ME9A 1GYNA 3M5VA 4AWUA 2DJLA 3LCFA 1OG0A 1OVDA 1W56A 1JUKA 4LS2A 4N6FA 4LUJA 4ONVA 3SY5A 4E38A 4AF0A 1W54A 2DORA 4JR5A 3TAKA 3TH6A 4AHPA 1LORA 2WPBA 3Q37A 2P0OA 1C9DA 3I7RA 4B5NA 3PSWA 4W9TA 3M47A 4JYFA 2A6NA 1H61A 3GKAA 2VFFA 3PULA 2J9XA 5LGXA 3TXVA 3N2MA 4GFSA 1VCGA 3W23A 2Q3RA 2CZEA 4MZYA 5I3KA 3VNDA 5H2ZA 3QQ1A 1W1ZA 1SO3A 1OYAA 4XZ9A 3LOTA 5K7JA 4ZZ9A 3VFLA 3PM6A 2RFGA 1M6JA 1YTKA 2E1DA 4QSHA 4MLJA 4UC5A 4WXYA 1WBJA 4ZVJA 3W83A 5LHEA 4NJJA 3PBVA 1XDLA 1OFDA 3QEZA 4TU1A 4AAJA 5F4XA 2YW3A 4PC8A 3NM1A 2V2HA 4IPJA 1H5YA 1F74A 1UCWA 2LLEA 3W7GA 4O18A 4RK8A 1SO4A 3MWAA 3L66A 1NF0A 1IGSA 1GTEA 4BFAA 3EWUA 5SWUA 3P8IA 2ZA3A 3QF0A 3SJ3A 5FF3A 2ZZ1A 2PCQA 4EIVA 4N9EA 4K37A 3R8RA 3PY2A 2B0MA 4FNUA 4CCEA 1TPDA 1NFBA 3S0CA 3RFAA 4X3ZA 4JIQA 3UY7A 2E77A 3USBA 2BWGA 4HKPA 3BARA 3UZJA 3PG8A 3ZFHA 3CC1A 3TCEA 4O17A 5CSRA 1R2RA 3S5OA 3O6DA 3IGXA 4FXSA 4HN4A 4FB7A 3G8RA 2ZZ4A 3W73A 1KV8A 3TA6A 4GRSA 1TPB1 1GOXA 3FFSA 1L2UA 3QZEA 2CLIA 3S42A 3WJZA 1WX0A 1LBFA 5D32A 3U6WA 1GVFA 1JCYA 4O1AA 2JGYA 4JDBA 5FF2A 1W37A 3TC6A 3HF3A 1BKSA 5D2XA 3S1UA 3KRSA 3TK7A 5E93A 5DN1A 2Y70A 5DLCA 4UNLA 5D02A 3TIMA 1Z48A 4A21A 1OX6A 1ONRA 3LHTA 5G1TA 4R53A 4GUIA 3GR7A 4A2RA 1G6CA 2ABBA 2YW4A 3FYOA 2VKZG 4FF7A 3BW2A 1XL9A 3NL3A 4RZ6A 4WQ6A 4AWTA 3SSJA 4O57A 2NX1A 1LTDA 3B06A 3SW6A 4UFLA 2V2DA 1XM3A 1IF2A 4LU0A 2YFNA 1I2QA 4DO4A 2FIQA 1CI1A 4S2CA 3LHVA 2X1RA 3GB6A 2QJGA 1JCNA 3CIWA 2V2CA 1C29A 4PA8A 3LCIA 3W72A 4RLIA 5K4ZA 1JRCA 3NQVA 3FIGA 3WJXA 5C6MA 1IIHA 4L4LA 3AO0A 3G1AA 4UR7A 3MMTA 2WV8A 4NZFA 1KM2A 4ML9A 2C14A 1AW5A 4LVGA 3O63A 1OX4A 2G96A 4LVFA 2YR1A 1TPFA 1SU5A 1UJPA 3L67A 4JGDA 3EX6A 1FCBA 1F05A 1SO6A 3LI0A 4DF0A 3IEBA 2BXVA 3G1DA 5FEXA 1EWEA 3VI2A 3TDFA 1XBYA 3LM7A 3NEVA 3GLCA 3PBUA 2WNQA 3C52A 5HJLA 2FPYA 4LNYA 4MJMA 2ZFAA 3TUUA 3G1HA 1JCXA 5CPLA 4ZQNA 2QCCA 1VHCA 2NWRA 4O4VA 3QW4B 1I45A 3P67A 4PEKA 3MHFA 2C3ZA 3C0JA 2VEIA 4NX5A 4ZL1A 3M43A 3B0VC 4LS1A 2C18A 1QPNA 3HG4A 3QPYA 2EGZA 3U8GA 1R46A 2F84A 3GDMA 3FKKA 4FX8A 2HTMA 5AHEA 3BVJA 3EX2A 3B0UX 5KSWA 4LVBA 3MBDA 4RX0A 4PCFA 4O4WA 3HPSA 2Y63A 4TR9A 1OX5A 1GQNA 3UD6A 1K7XA 4LC8A 3HGJA 1DVJA 2TRSA 3O07A 1ZHAA 4JTIA 2G5WA 1W5OA 5AHMA 3R5EA 4JYEA 1K8YA 3GKFA 3DKJA 2W6RA 1Q6LA 1OK6A 1S3HA 2ZTJA 3CM4A 3B0PA 4RR4A 3DFPA 3M5ZA 4ZQMA 3CTLA 3LRLA 4WOZA 3CIXA 1OYCA 1RVGA 4Z1DA 5AFDA 6TIMA 4UTKA 3MP4A 2VC6A 1ZNNA 4LY8A 4UFHA 3UWUA 1EUNA 4OV4A 4DELA 1JVNA 5FF4A 3QQ0A 2PRMA 2A21A 4JTHA 3LCXA 3FJLA 4MYXA 1VYSX 5TQLA 1F6KA 2Z6IA 4NJHA 1FY6A 1GWJA 2GJLA 4BF9A 2QUTA 5HULA 1YADA 4O8RA 3BW4A 1AMKA 1ZY9A 2HS6A 3NQMA 3MJYA 2OZ0A 4M6VA 1YTDA 4JTUA 3LTYA 1X1OA 4QM1A 4HNVA 3UY8A 4MIMA 3TU9A 2RDTA 3W6YA 3ZR4A 3W7RA 4NQ1A 4IPIA 2QCMA 3N14A 4DQWA 2VFDA 3LCWA 2ZRUA 1SW0A 2J6XA 1NAL1 1IXOA 1FWRA 4K7YA 4Z08A 4K8EA 5I3GA 2DZWA 4E2DA 4CQAA 4YXGA 2CW6A 3LCLA 2AQWA 3LB0A 2NZLA 3L0GA 5GVJA 1TCDA 3QW3A 2Z2UA 3ZWTA 2E5CA 3ABOA 3EWXA 3CB8A 3LHZA 2WSQA 1JUBA 1QDSA 3KXQA 1DV7A 2Q8ZA 3LLFA 1TPWA 3MI2A 4MY9A 2I9EA 3CQ0A 3UPBA 3T78A 1VPXA 4DO6A 3ANYA 2G95A 2ZCGA 3TAOA 3LI1A 1TV8A 1H7XA 1O95A 5G5IA 4CQ9A 2EHHA 3G1VA 1H60A 1QPQA 3W7DA 3S5YA 2QCGA 3NQ2A 1VZWA 1VLWA 2GQ9A 4HNUA 2X1SA 3Q58A 3G1YA 4FXRA 3P84A 1F73A 3M5YA 3HQ1A 2RKXA 5D2TA 5LKYA 1FDJA 1N8FA 1PE1A 3G1SA 2AAMA 3GNDA 4UFKA 4IX0A 1WBHA 5LZLA 1FCQA 2Y62A 4Q4KA 2H8ZA 3GDTA 3MYPA 3NGJA 2FJKA 1GVRA 4BI5A 1QO2A 5CZJA 1ZAHA 5FEPA 3H55A 3LV5A 4OT7A 1BWKA 1A50A 4FX6M 5IM51 4K38A 2C16A 3PB2A 3LRMA 3QH2A 2VFEA 1FX6A 5IBXC 4EF9A 3TC7A 2DU2A 3DFTA 5D03A 1OF6A 5C54A 1D3GA 2VFGA 4KKXA 2H90A 4IMEA 4JTGA 4BI7A 1O5XA 1TV7A 2GOUA 1F76A 4E2BA 4LV4A 1VLIA 1DOSA 1PHWA 3DU0A 3UWYA 1X8FA 4AB4A 1TQJA 1L6SA 3W75A 4GJ1A 3JR2A 5K2ZA 3O15A 5DCDA 4UCGA 2GJNA 1FWTA 2Y89A 2R91A 3MHGA 4TX9A 3B04A 1I2PA 1TMHA 3FYPA 3I7QA 1LP6A 1G7VA 4RV8A 4IGHA 5EA9A 3C2VA 5BNKA 1TTIA 4QAIA 3NQDA 3TROA 3G18A 1XCFA 3NVTA 4UFMA 2VEMA 1GZGA 4CNNA 5EYWA 2CLOA 5D30A 5CZSA 4Z1AA 2VELA 4N9DA 3HPXA 1RR2A 5D2YA 2ZZ2A 4WOQA 2DZUA 5CKSA 5HMSA 2QDGA 1ZFJA 5F4WA 1TYGA 4UIOA 1JRBA 1WOAA 4O0KA 1D3HA 2JGQA 5DXXA 4O15A 2FFCA 5LNSA 4MKNA 4FHAA 1QNVA 3SFKA 5A5WA 1OFRA 1KM1A 1HFBA 1W5QA 2GQAA 5L6UA 1EB3A 1KLZA 4POCA 1TPH1 2B7OA 3LLDA 2TPSA 3QM3A 3DENA 3L5AA 2W79A 4JY9A 1QWGA 3IV3A 4JN6A 1A5BA 3HMJG 1TJRA 3B4UA 4AH7A 1CW2A 1TIMA 5D2WA 3EEGA 3GDRA 2V82A 3THQA 2I14A 4KWWA 4NNAA 3M0ZA 3OG3A 1WOBA 3E0IA 1LOSA 4GBUA 3S9YA 4ICNA 1THFD 4MY8A 2DZPA 1K8XA 5EL1A 5HWNA 4O0ZA 1V5XA 4FIQA 1K8ZA 4WY0B 1SZEA 1H7RA 3NPWA 2NX3A 3A5FA 1RD5A 3HG3A 3ZS4A 1I2OA 3TMLA 5U4NA 1X1ZA 1H51A 4N9CA 2CZDA 1GVOA 3AJXA 3EX1A 2B7PA 2E68A 4UR8A 3BK0A 5G4WA 1JUEA 3MP3A 1TREA 4LS0A 4QNEA 3DGRA 4UTTA 1LRQA 2Y61A 1H7NA 3PR2A 5CGQA 4HPJA 1ICQA 5TBOA 3W76A 2QCDB 5EPDA 5HWMA 3G22A 4MZ1A 1YTEA 4TMBA 2HMCA 5AYYA 1EX5A 3EXSA 2PRHA 3G0SA 4XWUA 4FX7A 1OYBA 3JS3A 2VEPA 3FKRA 5G2WA 3O6CA 1KFKA 4QJ1A 4IQLA 1OFQA 4S2BA 1SZNA 1KFJA 4LTSA 3VE7A 4A3UA 2J27A 1TTPA 3MW7A 4RCXA 3E96A 3IVSA 1PV8A 5E1QA 1G4EA 2WNNA 2A5HA 1YDVA 4CNOA 3NQFA 5EKYA 3BO9A 1QPRA 1WDWA 3NL2A 1S5WA 3TQ0A 3W87A 1GPWA 1T99A 1C8VA 4N02A 3LHWA 3UWVA 2QKFA 2WQPA 1HO4A 1KM5A 3W2JA 3ABRA 2Y7EA 4MFDA 3HO8A 3IIZA 2AGKA 3O06A 1XKYA 1VCVA 3NPVA 4D2JA 5AOUA 3CLMA 4GC4A 3FS2A 4C1LA 2FQIA 1LROA 2EKCA 2NUXA 1Q45A 3C2FA 3Q94A 3OIXA 1E51A 1F2JA 1T96A 3PWAA 1GG1A 4LOCA 4N2YA 4DF2A 4EF8A 2V0TA 4L4MA 3IIXA 4O14A 1IIGA 1DHPA 1I8JA 3P60A 1W5MA 3G8EA 5HWJA 3T40A 4OV9A 1K3UA 3QMRA 4FNRA 3UPWA 3A22A 1MSSA 2Y7FA 4LV9A 2V30A 1SR9A 3JRKA 1I4NA 4IMGA 1VC4A 1G67A 1EWDA 4NVTA 3MUXA 4JTFA 4ORIA 4WUIA 4KFOA 3SI9A 3A9IA 5F2MA 3LGEA 2H3DA 2A1YA 4IOTA 3W1TA 5L9FA 1A5CA 2HS8A 1UB3A 4U28A 3TSDA 3NQCA 3BG5A 1X6UA 4BWLC 5AHNA 4M7TA 5J5RA 2V5LA 1ICSA 4UTLA 3W7KA 1TSIA 4CCDA 1L9WA 2WNZA 1FXPA 3NZ1A 2QCDA 2DZVA 1H1ZA 1S5TA 4O10A 4BWLA 3BGGA 1TRIA 2CZ5A 2P10A 1NF7A 3BG9A 5KINA 1Z41A 3DFOA 1A5SA 3PS7A 1KTCA 3HPZA 1LYXA 2R94A 2RH9A 1Q6OA 2E6DA 2ZDRA 1KFBA 3W74A 3GNNA 3NO5A 3F03K 1XI3A 3HOJA 4IMDA 3GZ3A 3UQNA 4RXGA 1D9EA 4JDYA 5D05A 2Z0IA 3P74A 4MY1A 1L6YA 1W31A 5I3HA 3BGJA 4FIRA 1PS9A 5C5YA 3HBLA 1LLWA 2NV2A 4MYAA 2HSAA 1H63A 1KM6A 3M5XA 3PUEA 4PL1A 1AL7A 4HNNA 3I6RA 1ZJIA 1G4SA 4IUOA 3KVLA 7TIMA 1J2WA 3LCGA 3YPIA 4S1FA 1B9BA 3W2KA 3IIPA 4O1CA 2YGYA 3TMQA 3P5ZA 3QMSA 5EBUA 1VJIA 4QIUA 5K9DA 4JTLA 3GVGA 3L5LA 2JKPA 2E6YA 3EKZA 1DORA 1TPUA 4GNJA 3TSBA 1PHQA 3EXRA 1OFBA 3EB2A 4AXKA 2FPTA 5A8GA 2CLEA 3TQVA 3FJ6A 1PIIA 1WQ5A 4YCOA 5BMWA 3DFSA 1JCMP 1FWNA 4UTWA 8TIMA 1AL8A 1JQVA 1P5BA 1XBVA 4Y96A 4A22A 4JX4A 4RJEA 2CLMA 3W7IA 3R89A 1GEQA 3VCRA 1H7PA 2ZZ5A 4HT3A 4PH6A 2V8ZA 3MI3A 2EAWA 3IVUA 4JTTA 3G1XA 3SGUA 3OVPA 3E12A 1WAUA 4R7JA 2B7NA 5FEZA 2FB2A 1UBSA 1SUXA 1QOPA 4OGZA 1JCJA 5E0KA 2KZHA 1Y0EA 2ZRXA 1GTHA 1L6WA 2CZFA 4WZHA 2CLHA 3W1QA 3DHDA 2ZBTA 1N55A 4NNCA 4DO5A 1DL3A 5CPMA 5AC6A 1I2RA 2C1HA 1GVSA 1N7KA 1CX9A 2CFFA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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