4MY8 | Genus

Total Genus 104

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	104
sequence length	345
structure length	335
Chain Sequence	NAMWESKFVKEGLTFDDVLLVPAKSDVLPREVSVKTVLSESLQLNIPLISAGMDTVTEADMAIAMARQGGLGIIHKNMSIEQQAEQVDKVKRSGGLLVGAAVGVTADAMTRIDALVKASVDAIVLDTAHGHSQGVIDKVKEVRAKYPSLNIIAGNVATAEATKALIEAGANVVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQLTAVYDCATEARKHGIPVIADGGIKYSGDMVKALAAGAHVVMLGSMFAGVAESPGETEIYQGRQFKVYRGMGSVGAMEKGSKLVPEGIEGRVPYKGPLADTVHQLVGGLRAGMGYCGAQDLEFLRENAQFIRMSGAGLLE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Crystal Structure of the Inosine 5'-monophosphate Dehydrogenase with an Internal Deletion of the CBS Domain from Bacillus anthracis str. Ames complexed with inhibitor Q21 rcsb
molecule keywords	Inosine-5'-monophosphate dehydrogenase
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Bacillus anthracis
total genus	104
structure length	335
sequence length	345
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature	ec 1.1.1.205: IMP dehydrogenase.
pdb deposition date	2013-09-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00478	IMPDH	IMP dehydrogenase / GMP reductase domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4my8A00

3C0JA 1UCWA 5IBXC 2ZA2A 1P0KA 5DLCA 3QZEA 2X1TA 1M6JA 1OHLA 4RR4A 4OT7A 1DBTA 3VE7A 5C2XA 1W31A 2GQ8A 5FF4A 4LS1A 4UTTC 2QUTA 2E6DA 2FPTA 1P0NA 2BTMA 4HIBA 1XDMA 4MZYA 1Q3NA 4I7VA 5EA9A 7TIMA 3KVJA 4E0CA 1G7VA 3GDTA 3EWXA 3M6YA 3W86A 1FUYA 4KWWA 4IX2A 3A5FA 4CNPA 2YX0A 5D38A 3TQVA 3I7QA 3W1XA 2E6FA 2CZDA 3G1HA 3I7SA 1XDLA 3EB2A 4PL2A 3HPXA 1U83A 5I3KA 3ABSA 1L9WA 3QM3A 5AHLA 4N4PA 2DP3A 1VLWA 2NXHA 1CI1A 2Y7FA 5K4XA 1A53A 3T44A 3W74A 4EOUA 3BG5A 4ADUA 3L0KA 4UTTA 3GKAA 3W1TA 3PB2A 1PIIA 3OHIA 5HWNA 1GTHA 5GVJA 1QFEA 1HUVA 4UFJA 3BG9A 5AHFA 1SO3A 5D32A 1NFBA 3M16A 3GAYA 2NX3A 5EKYA 3I6RA 2Y6ZA 4P2VA 1XC4A 3OEXA 3TFXA 1VYPX 4JICA 3FS2A 3W1PA 3NQ8A 1OX5A 3TKFA 3KAOA 2YGYA 3LHTA 3O8AA 3S42A 3T55A 3F4NA 4YWIA 1EEPA 4RJEA 4H3DA 4DELA 4AF0B 3DI0A 3GVGA 3TROA 4IWWA 4IQLA 3W84A 3B05A 3WJXA 2ZRVA 4GBUA 4OE7A 2V2DA 2PRMA 3W7MA 2YFOA 1YDNA 1W5PA 4DF0A 3N9SA 1QPOA 2Y85A 3W3OA 3TU9A 3P67A 2A6NA 4C1LA 3VFLA 3RFAA 2Y70A 3W7NA 2OZ0A 1OJXA 2E5DA 3LBMA 3HG3A 5G2IA 5FESA 3O16A 1KBIA 4MLJA 3PBVA 1R2TA 1AMKA 2J9ZA 1GQNA 4UR8A 3WK0A 2RH9A 2VEIA 3P5ZA 1SZGA 3W73A 1LORA 1B4EA 1LM1A 3LHZA 3UNDA 5K9DA 4POCA 3NM3A 5CZJA 1ICSA 1H7PA 1QPQA 3UZ5A 4N6FA 5DXYA 1P4CA 4NNBA 3HGJA 4TR9A 1HG3A 1XBXA 2Y62A 3V1PA 2TYSA 3MP4A 3WJZA 4ORMA 1SPQA 1OFDA 4ORIA 1LLWA 2NUXA 4NXSA 4IMDA 3P60A 2WNZA 3M5VA 4JY9A 3C8FA 1EUNA 1GG0A 1AL8A 3CEUA 1LLZA 4NVTA 3M5YA 4Y9AA 2NLIA 3RK8A 3UZJA 1L2UA 5G2WA 3S1VA 2QJGA 2Q8ZA 1TPH1 3SY5A 3GX9A 1MEWA 3DENA 2QUVA 2PC4A 3W85A 4MFEA 1FDJA 2EPHA 1R30A 2PCQA 1VZWA 1GZGA 3MBDA 3V75A 2OT0A 3Q58A 4XKYB 4E2BA 4LC8A 4Z08A 2QCMA 3GR7A 4EF8A 3B06A 3NGJA 1HO1A 1S5WA 3HO8A 3EX1A 1SZFA 3PY2A 2QAFA 2V30A 5D2TA 2CWNA 1YPFA 1XBVA 1C29A 1AW1A 4HNUA 4TIMA 4LTSA 4PL1A 3TH6A 2Y7DA 1Z41A 1HL2A 3GLCA 3ABOA 3A9IA 4AWTA 3YPIA 3QW3A 4H6KA 3STGA 2ZTJA 3NPWA 2I9EA 2VOMA 4R33A 2CFFA 2FB2A 4OBTA 2A21A 4PTNA 5AB3A 3KRSA 3LCFA 3W07A 4BI6A 1W37A 3T78A 3SR7A 3WJWA 4ML9A 1SO6A 3KHJA 3M41A 1KBJA 4GUHA 5K2ZA 5KSWA 3SJ3A 1LOQA 3CC1A 4WUIA 5LHFA 1WOAA 2JKEA 2RKXA 4TX9A 3LXAA 3ZS4A 1A5AA 4X2RA 1H7XA 1EIXA 4RXGA 3VKJA 1K8ZA 3SFKA 3LM7A 4NQ1A 1LRTA 3W1NA 4P61A 4YCPA 1IGSA 4JNMA 1YLVA 4K38A 2NWSA 4ZQOA 4WY0F 2ATSA 3FOKA 1OK4A 3N2XA 3PAJA 5AC6A 3A5VA 1OK6A 3UWUA 5F2LA 2H3DA 3W1RA 3EKZA 8TIMA 3BV4A 5LNWA 3KXQA 1JCXA 4NZFA 3UWVA 1TV7A 3MHGA 2V5BA 4M7SA 4ZQPA 5BRBA 2NV1A 1R47A 3CWOX 3BO9A 4AAJA 3L0NA 4N02A 3LERA 2EAWA 3QQ1A 3QRHA 4QISA 2ISSA 1KM4A 2VC6A 3R13A 3N3MA 2DZXA 1ADOA 2Q3OA 4JTHA 5AYXA 5BMWA 5HR6A 1VGAA 4HT3A 4JYDA 2G5WA 1W5MA 1VR6A 5D09A 1YXYA 4K6AA 4DO4A 3W7EA 4NJHA 3O63A 2BLEA 4RZ5A 3W1QA 5G2HA 3PC0A 1KLYA 3R89A 4KWVA 3HG4A 2I14A 3TK7A 4JX4A 4Y8FA 1ZENA 2C1HA 3S8HA 1LBFA 1VHCA 3E9AA 3UY7A 1RD5A 2CU0A 3LCHA 5DY3A 1PHQA 3WFAA 5LKYA 5KZDA 4N9BA 4HKPA 5LNVA 3MMTA 3NR0A 1KLZA 1MO0A 4U28A 5IM51 3MYOA 3EX4A 5HUOA 2AAMA 5KMYA 3RF9A 3LHVA 1TYGA 3MHUA 4K7YA 4N6EA 4S1FA 3HB9A 2GJNA 3CU2A 1WQ5A 2VEMA 3MW7A 2FDSA 1KTBA 3P82A 4KFOA 4BI5A 4NNAA 5K3VA 3BPWA 4LVDA 3NG3A 1UJPA 1QDSA 3GYEA 3U2OA 2C13A 2YXGA 1NF7A 3PG9A 2IQTA 5DELA 1FDZA 3QYQA 1G7UA 4MY1A 4WOZA 3W70A 6TIMA 4BI7A 3ZFHA 5J5RA 1TRDA 4CQ8A 1T96A 4WZHA 5C5YA 1A5CA 3EEGA 3ABQA 3PG8A 2ZZ6A 1EWDA 1XCFA 1I2QA 5H91A 4JTLA 3NZRA 4LW7A 4AMAA 2B0MA 4GXMA 1O94A 1I2PA 3O15A 2FFCA 3O6DA 4NJKA 1QWGA 4O0KA 4PH6A 3B0PA 3M43A 1G69A 1WYIA 1EP2A 3GDRA 2X1RA 3THQA 2Y7EA 5DBTA 5LGXA 3CEPA 3NL6A 2PURA 4MY9A 4HSNA 3ZWSA 2CLOA 3IGSA 3W1UA 3TQ0A 3IIZA 5TQLA 3GDMA 3O6CA 2B7NA 1KV8A 2JBMA 1K7FA 3BLFA 4Q32A 3TSMA 4JTJA 3CM4A 1TPDA 3NEVA 3B8DA 3S5NA 4G1KA 4WOQA 2A6LA 4N4QA 3NQVA 4OGZA 1XBYA 2H3BA 1SO4A 4MZ1A 3LTYA 2TSYA 2X30A 4O15A 1N8FA 3GDKA 3LOTA 4IGHA 3N14A 2Q8LA 1XUZA 2B7OA 1I2NA 3PVFA 4MYAA 1I2OA 1KA9F 5L9FA 2J24A 1G6CA 5A8GA 1LRQA 1TJRA 1ME7A 5K4ZA 5BNKA 2Z2UA 4FNSA 3QC3A 2XN1A 5CPOA 1F5ZA 3ZWTA 4WJEA 3NA8A 1H7NA 1KM0A 2QKFA 2X1SA 5HQEA 5D02A 1WBJA 2R14A 1GG1A 2YZRA 3W7RA 1S5VA 2E5CA 3HGOA 4JTTA 4JD4A 1EUAA 4QIUA 1GVQA 1TJPA 4UC5A 3W6YA 3C2EA 5BW6A 1TQJA 4JGDA 3QSTA 4WXYA 3S5ZA 2G95A 4GUGA 3UWQA 5I3HA 3TAOA 3MYPA 3IEBA 3NAVA 3DBPA 2VFEA 1WOBA 1GVRA 4JR5A 1I45A 3W7JA 3NNTA 1ZAJA 4DO6A 4MZ8A 3RU6A 2PRLA 2G97A 4AB4A 1H7RA 1JUKA 3FKKA 2ALDA 3GZ3A 3H55A 4FXSA 3QJAA 2H8ZA 4GRSA 3CIWA 3W87A 4ZZ9A 1PL9A 3PR2A 4UTKA 1LOSA 4UMCA 5H2ZA 5G1YA 1FDYA 2GQ9A 3P62A 4JTEA 4E38A 3HPSA 2QF7A 2EHHA 5LZLA 4DEFA 1OYCA 4U4MA 4X9SA 1TREA 1DHPA 5D2XA 3FIGA 3TCEA 3LI0A 4FNPA 3FYOA 1SW7A 4UUIA 2X2GA 2OCZA 1JUBA 3W2UA 3N19B 4Y96A 3TC6A 1GYNA 1K8YA 4A22A 3M44A 3I65A 4RXFA 3P8IA 5CGQA 1SO5A 2ZZ5A 1UB3A 1DOSA 1V5XA 1ZCOA 1MEIA 1TB3A 3PBYA 1M7OA 4IMCA 4LUIA 2BWGA 4WQ6A 1FY6A 1Q45A 2X1UA 3NPXA 4O4VA 4KFNA 2HSAA 4K39A 2ABAA 5CZTA 5AFDA 3EWBX 4HNVA 4O8RA 5G1TA 4CNOA 4OU1A 3TR2A 3FLUA 4RX0A 4MVAA 4NJIA 1F76A 4NU7A 1K02A 1VLIA 1GJPA 4H4IA 3DH7A 1JRBA 1KTCA 1TV8A 3L9CA 3LB0A 4Z1BA 2CZFA 3TMQA 5AYYA 3HOJA 4M6QA 3GIYA 1VJIA 1F73A 4XKYA 2VEKA 3G1FA 3QSRA 5HMSA 1H7OA 3M9YA 4FX6M 4FB7A 1YXCA 3GXNA 4FXRA 4RV8A 2CLMA 1XKYA 3TSDA 5AHEA 1H61A 2CLLA 3GKFA 4MFDA 1CX9A 4NZJA 4OWGA 1W56A 2V0TA 2OX1A 3PUOA 4Z1CA 3JS3A 3IIPA 3BK0A 4R7JA 5K9CA 3LCIA 2P10A 2NZLA 1H51A 4A21A 3S9YA 4Z1AA 3BGJA 3LTSA 3G3MA 2FPVA 2ZZ7A 1KM2A 2VFGA 4MPQA 4RCXA 2A5HA 4S2BA 4GFSA 2RDWA 1TTPA 1F74A 2NX1A 2QUUA 4O57A 5C6MA 1PV8A 3EX2A 3P5YA 5EL1A 4BK9A 2OT1A 1MXSA 2DZTA 2RDTA 5C54A 2A1YA 5F4XA 4UFHA 3TXZA 3G0UA 4PODA 3W2KA 1OVDA 5KTLA 3C52A 3LLDA 4GE8A 3F03K 4O52A 4WD0A 3HGRA 1KW1A 3G3DA 3LCGA 3TV8A 1K3UA 3FJLA 2EF9A 2XN0A 3DHFA 3S1XA 1SU5A 2RFGA 3SECA 1A5BA 3QQ0A 1SR9A 2O7SA 4CNNA 3S0CA 1TPWA 4JYEA 4LOCA 1F05A 5U4NA 4O28A 4MIMA 5TIMA 2YW4A 1X8FA 3QMSA 3RMJA 4MLRA 2QCFA 1ZY9A 1WA3A 4NNCA 4GNJA 4QQ3A 3UYCA 2XFWA 1G4PA 1UBSA 3BVJA 2BZNA 5DCDA 3HGSA 1PE1A 2E68A 3SW6A 5FF7A 1ZALA 2FIQA 2O7QA 3WJYA 3W76A 3N9RA 3LCWA 1FX6A 3CIXA 4HPJA 3HJZA 3W2NA 4C1KA 4O10A 1ICQA 1JCJA 1KFCA 1TV5A 1JCNA 1XXXA 2FPYA 3LXCA 2HS6A 3W7QA 4Z1DA 1FWTA 2QR6A 5KZEA 3G1DA 1T8XA 1GOXA 4IMFA 3W83A 5TBOA 1GVSA 4UFLA 3MBFA 1TTJA 1SW3A 3HMJG 1CW2A 1K7XA 3G1AA 4DO5A 3M5XA 5SWUA 1FWWA 5G5IA 4ADSA 5BOOA 2E6AA 3OVRA 1FWSA 1H50A 2FJKA 2G96A 5L6UA 5CPMA 1GYLA 1ZJIA 3DU0A 5MHBA 1GEQA 2A85A 3PF3A 1FWRA 2OJPA 5AHNA 2R8WA 5LHEA 3QPZA 1O60A 3NVTA 1H62A 4JEQA 2A0NA 3MHFA 1XUUA 1Q6QA 3M47A 3GNNA 1U5JA 1C8VA 2YCEA 2YW3A 2Z6IA 4K8EA 2ISWA 4QNWA 3TJLA 4PC8A 3EWUA 2I1OA 2GOUA 5I3JA 3W72A 3NXFA 4JTGA 2YFNA 3A23A 4ZQRA 4ZMGA 4WY0A 4LC6A 4UNLA 2QDGA 1TPUA 2NUYA 5CSSA 4JX5A 1FBAA 5LSMA 2VXNA 4NUWA 1YTDA 1L6YA 3HPZA 6ALDA 1KTNA 2QDHA 5HR7A 1UUMA 2ZRUA 2YR1A 4FNRA 4K8HA 3LGEA 3N2MA 3NL5A 3KVMA 4GJ1A 4GUFA 3TUUA 3W75A 1T0OA 4O16A 1Q6RA 2QCDA 3ELFA 1OFOA 1TO3A 4UTHA 5CG7A 2GQAA 3I7RA 4M19A 3TMLA 1ZAIA 2V81A 1JULA 1W3TA 3KVKA 4LS2A 4IPJA 1J2WA 3KVLA 1O95A 3BLIA 4GWEA 5HINA 4LVBA 1ALDA 3THAA 3QFEA 2DU2A 4FEZA 1YTKA 3PSVA 1G4SA 3G1XA 3S1UA 3W7LA 1QCWA 1RQHA 1O5KA 4K37A 1JQXA 1ZAHA 3LHYA 1P5BA 3B0VC 2CW6A 4K36A 2H8XA 2WQPA 4FX7A 3MUXA 4PCFA 2WV8A 3VCRA 2WJZA 5FEZA 5ABTA 2C3ZA 2HTMA 1SZEA 1DQWA 1FWNA 4ICNA 1W0MA 4TMCA 4ZQCA 3TE9A 1H1YA 2Z6JA 3AJXA 1K8XA 4NX0A 4CQAA 1PS9A 3R5EA 4HPXA 3IVTA 3LV6A 3NQGA 4IPIA 4HHPA 4XQ6A 2VFIA 1B4KA 3M7WA 4YL2A 3QEZA 1YTEA 4XWUA 2DJLA 1W54A 1XI3A 3EWZA 1TTIA 5FEXA 4A2SA 1PCWA 3C61A 4UTIA 3G1SA 1VCFA 1F2JA 4MY8A 4WY0B 5CZ0A 5FEPA 1NF0A 3UPWA 1R2SA 1DORA 4GUJA 1YYAA 2YSWA 3EX3A 3ATZA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4MY8A

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