4N42A

Crystal structure of allergen protein scam1 from scadoxus multiflorus
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
272
structure length
272
Chain Sequence
GNLDIAVYWGQNFDERSLEATCDSGNYAYVIIGFLNTFGGGQTPALDISGHSPSGLEPQIKHCQSKNVKVLLSIGGPAGPYSLDSRSDANDLAVYLFNNFLLPPGHSENNPFGNAVLDGIDFHIEHGGPSQYQLLANILSSFRLKGTEFALTAAPQCVYPDPNLGTVINSATFDAIWVQFYNNPQCSYSSGNAEALMNAWREWSMKARTKKVFLGFPAHPDAAGSGYMPPAKVKFHVFPAAKKSYKFGGIMLWDSYWDTVSQFSNKILGDGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of allergen protein scam1 from Scadoxus multiflorus
rcsb
molecule keywords Xylanase and alpha-amylase inhibitor protein isoform III
molecule tags Hydrolase inhibitor
total genus 91
structure length 272
sequence length 272
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4n42A00
3TTSA 3UEQA 2E9LA 4TVDA 3W82A 3OLIA 4CU7A 1V0MA 1EIBA 2VZSA 5ECUA 2VCAA 3G6MA 1HJUA 1E73M 1P6WA 3EMCA 3TOPA 1AVAA 1H3GA 1NP2A 1WDSA 5I77A 4GI8A 2YBUA 1JFHA 2NSXA 4ACYA 3NDYA 4PCSA 3VGGA 4AZBA 1B3VA 1E5NA 1V6UA 2IUZA 3OB8A 3POCA 3WH9A 1BFNA 2J7EA 4W5UA 5BRQA 5JBFA 5GNYA 1C7TA 4HMCA 4HZ7A 3WKZA 2WC4A 3SEPA 1E6PA 4F66A 4ATLA 3BSHA 1ZJAA 2VR5A 1PIGA 1QW9A 2G3NA 5FIPA 2BNJA 2WHJA 1C91A 3F5JA 3BAYA 3VD7A 1OM0A 1HJQA 5I24A 5A6BA 2EO7A 1QI4A 2VQUA 1MQQA 4XZWA 5BCAA 5I23A 1BYAA 2NT0A 3FAWA 4TTUA 1HKIA 2F2HA 2ZICA 2BVYA 4AY1A 4CU8A 2PWGA 1CDGA 3K1DA 4Z2GA 1B9ZA 3AIBA 1GCYA 2CKRA 4TVUA 3AHYA 4W89A 4ZE4A 5AC5A 2VI0A 1B31A 1TA3B 1H0GA 4GZIA 3WBAA 4JIEA 3RM4A 3WENA 2O9RA 3FHAA 1VFFA 3VMOA 4QDMA 2JEPA 1CPUA 1UWSA 3GNPA 1BGAA 3HU7A 3UG4A 3WNOA 5D9NA 2FHFA 4WK9A 1H09A 5JUVA 1ITCA 4Z2IA 1W1TA 2WWDA 3CZJA 1L8NA 3MU7A 2VX4A 1MQRA 2UY3A 1FHLA 2W61A 1QHPA 3BLKA 4PMRA 2CHOA 4H7VA 2EPKX 2VC9A 3L4ZA 4QP0A 3BAIA 1NP0A 1GOOA 1R86A 2WBGA 1O6IA 1CGUA 4BZYA 2ZX9A 4W7UA 5I5RA 3EYPA 2MANA 4OUEA 3RIKA 1ZBCA 3U7VA 4KRTA 3AIWA 1SR0A 2IXUA 2J74A 1J9YA 4DUWA 5BROA 5E9AA 3UETA 2DIEA 3NDZA 3ARZA 1CXIA 3WDHA 4MB3A 4AMCA 2WWCA 4HA3A 1HJWA 3TA9A 3CUFA 1VFMA 3N15A 4W8LA 2ZOXA 4PUEA 3GXFA 3WMCA 3ZJ8A 3QOKA 3IK2A 1GQIA 1J0JA 1LF1A 3AIRA 3WUEA 3WQWA 2UY5A 4GO8A 4KRUA 2WHMA 2WCSA 1KGUA 1UR1A 4M82A 3RCNA 1FA2A 1V08A 1X6NA 2QMKA 4F8XA 5EFFA 4AIOA 4AYSA 2E3ZA 3BCDA 1EGZA 1VB9A 4PRWA 1CXHA 1KGXA 3RILA 2HISA 3VD4A 3CMGA 3HN3A 1E15A 2VCBA 1BLIA 1VFOA 2DPEA 2JEQA 1AQMA 2XSBA 4PTVA 3VD3A 4RL3A 1VBUA 4P7LA 4HZ6A 5LYRA 1ZBVA 4MNMA 1WDRA 2GSJA 1XSKA 3AHXA 4AZIA 2YA1A 1W9UA 5A6SA 1B3WA 1GQJA 2WVSA 5C8BB 1UR2A 1ZJBA 3ZMRA 1C8XA 2WPGA 1JZ5A 3LMYA 2V3EA 2PWFA 5CPTA 1GHSA 1Q6CA 3WSUA 3OZPA 2WC3A 5I2UA 3F5LA 2E9BA 2O9PA 1UH2A 2DT3A 4PSRA 4UQBA 2BY0A 5E09A 2O9OA 4E2OA 1E40A 3S2CA 3GNRA 1QI3A 3TP4A 2QF8A 2DQXA 1DP0A 4B3LA 3W27A 1CZ1A 4AD0A 2J8FA 3PZUA 1N82A 2XYLA 3BAJA 1NWTA 2C7FA 1HL8A 4LYPA 3WDJA 4TX6A 4YHGA 1H49A 4YN5A 3NCOA 4MPKA 3GXDA 3OGVA 4A4AA 4A3HA 2G3IA 2CESA 3PN8A 1NM9A 2C0HA 2G4FA 2CITA 4Y7EA 5CGTA 2XWEA 5A94A 4GQQA 3ALFA 1E1FA 4WJXA 4AW7A 3AMCA 1JIBA 4L4OA 2J4GA 1R85A 4UFIA 3SCOA 4AZ5A 2ZX6A 1PPIA 2GFTA 3AMGA 4JCLA 3THCA 5A6JA 2OYLA 4RE3A 5F7UA 4AD1A 4JAWA 1ISWA 3T2PA 5I6SA 3GH4A 1HXJA 3WNPA 1J0YA 4QLLA 1EO7A 3SCQA 2CEQA 5BXTA 1JI2A 3WD4A 3MMUA 4PEEA 1NOUA 4PTMA 4CD5A 1W9DM 5C71A 1JYXA 3HJEA 1XRVA 4MADA 1VIWA 3BCFA 1R8LA 1C92A 3WMBA 4PBGA 1Q6GA 3EBVA 3EMZA 4CN1A 2WM0A 5M17A 1W1PA 3AI0A 4AZ7A 2X0HA 1B0IA 2EJ1A 1WPCA 5I78A 3WDPP 3AXXA 3RM8A 1UH3A 2WMIB 1V3LA 4CU6A 2VO5A 1W3KA 4JL1A 3UR7A 1BPLB 2IXVA 4OOUA 4GKLA 3SCWA 1IZJA 1UWIA 3S6TA 1UHVA 5A69A 2XFYA 3PTMA 3TTYA 4P7RA 4UFKA 4WKHA 3IAPA 1V0NA 1V3KA 4QFUA 4W87A 1QNPA 1LG1A 5TD4A 2XWDA 2GJXB 3KL0A 4ZFMA 1CXKA 3AHZA 1CWYA 1E6RA 2WKGA 3DYOA 1DWHM 2VMFA 5CXPA 3AS2A 3PHAA 4QCFA 4NI3A 1XSIA 3IJ7A 2QLYA 4WSKA 2RGLA 4CN4A 3VINA 3SCPA 4DWSB 3QGVA 4F79A 1EO5A 5KZ6A 1E3ZA 2XIBA 4HPHA 4UQ9A 5IFPA 1OD0A 2W4XA 1E43A 1QHOA 1WB0A 1NWRA 3RM9A 3N18A 2E4TA 1WO2A 1J0KA 1GPFA 1R87A 3CHCA 3QOMA 2D23A 1CECA 1JNDA 3IANA 2XM1A 1CGTA 5A2AA 4MB5A 1FH7A 1XC6A 2D0FA 2FHBA 2VZOA 3DECA 4W7VA 4HU8A 2YA2A 2XTKA 1DHKA 3SCNA 3MV11 3BH4A 1JZ2A 1UD2A 1EQPA 5D8ZA 3VM5A 1WZLA 3GTNA 3W26A 2J62A 3ZR6A 4W85A 3CTTA 2PBGA 3BSGA 2BY3A 5I0DA 1BYCA 1KR0A 3O2LA 5CSYA 2DT2A 2YDSA 1F4AA 1O7AA 1MW3A 3VDHA 3ZIZA 3ZT5A 1C8QA 5ABFA 5ABEA 4QLKA 3GH7A 4GZJA 4AZCA 1CXFA 3SCSA 2QMJA 1HKKA 5D9MA 2ZUNA 2VX5A 1UWQA 1QI0A 1MW0A 1HJSA 4ZXLA 3F4VA 2W62A 4XZBA 1ITXA 3WF4A 1BAGA 2FGLA 1W3JA 1UKTA 2AAAA 4HA1A 4F9DA 4J3UA 2XFFA 2ZX5A 4P8UA 1MFUA 5GQBA 3L2MA 2VX7A 1UR0A 3ARSA 5A8QA 5BYWA 2WNWA 3CZ8A 1MWOA 2VURA 2V3DA 4OBRA 4BQ5A 3D5HA 4AD2A 3W53A 1EDGA 2DSZA 3OZOA 4P7OA 1PJ9A 1W1YA 3AS0A 4U5KA 4AC1X 5CSUA 4UQAA 2JIEA 4J3XA 3VUPA 4EAMA 1BSIA 3A3HA 4ATDA 5CGMA 3SUTA 2AOSA 2WB5A 1KFWA 5FOOA 1WZMA 3N17A 3W4RA 2VRJA 1NOFA 1LL7A 4HZ8A 2J78A 2VJXA 3VIJA 5FL1A 2YDQA 3WUFA 2V38A 4OOZA 1H1NA 5E6YA 1EQCA 2WLYA 1GOQA 1CNVA 3AIUA 2E8ZA 1XYZA 2D0GA 3WF1A 1WNOA 3KEHA 4H2CA 1VRXA 1JYVA 1JF6A 1V0KA 4H8UA 3MKKA 1KXTA 4AZ6A 2WCGA 1CGVA 1ODZA 1U33A 1QNSA 2ZXQA 4URIA 1HP4A 1BYBA 1QNRA 3A4AA 3AIVA 1LG2A 3ARVA 2EPMX 1WZAA 4IISA 3NUKA 1H41A 2GDUA 3E1F1 1V02A 1CYGA 5DEZA 2WAGA 2VZUA 3II1A 1D7FA 3ECQA 3CLWA 1Q6DA 2ZXBA 2J7GA 8A3HA 3AMDA 1OT1A 1PBGA 2YL6A 4FLOA 2DH3A 2YL9A 2XIIA 5ABGA 1DEDA 2Z1KA 4CD7A 5M3WA 5DO8A 4PMNA 3AOFA 1MW1A 3FXYA 2PBOA 1EDQA 1E4MM 3OGRA 1C8YA 2DSUA 3U7BA 4PUDA 5CLTA 5A8NA 4Q7NA 3ZSSA 4FK9A 1QPKA 2PF0A 3GNOA 3K4AA 4Q22A 1QNQA 3O6AA 3N12A 4D71A 1KCLA 3JUGA 4P7QA 1E6ZA 3VIMA 3SUUA 5IXEA 3WH8A 1K6AA 3PZVA 4P7NA 3AZRA 2VVSA 4J7RA 1TE1A 1VF8A 1J18A 5A6LA 1OGSA 2BFGA 2OSXA 2ZUMA 4UZUA 1H4PA 5CG0A 4ACZA 1HX0A 4J3SA 4NF7A 5C70A 2CBVA 3AFBA 1OIFA 1XV8A 2XM2A 2GUYA 4W84A 5D9PA 3MMWA 4BQ4A 2DSVA 1W2VA 2VZTA 3ZQ9A 3T08A 4UOQA 2OLHA 5DT5A 5E70A 2A3BA 1GNXA 4FLSA 4E8DA 2CETA 2D20A 3CO4A 2EXOA 2PWEA 4J28A 2CCRA 3VOCA 6CGTA 4MAZA 1GUVA 1B3XA 2UY2A 4GO9A 1KGWA 1A3HA 2YOCA 4TXEA 3DHPA 3W38A 4EKJA 4CVWA 5CZKA 1NQ6A 1LLOA 4MDOA 1ODUA 1Q6EA 1EA9C 1PX3A 1FH9A 3CZGA 1UZ4A 4R27A 5HPCA 2BS9A 3WUBA 1HP5A 1BHGA 5FD0A 3M7SA 1YQ2A 1GOWA 1PEZA 1AQ0A 3W28A 3UCQA 2A3EA 3SUWA 1RP9A 2D0HA 3MV01 3ZO9A 2ZUWA 3VVGA 3DC0A 5BRPA 4UTFA 1NWSA 4X0VA 4LXFA 2ZE0A 3APGA 4H8HA 3IAQA 2W92A 3FAXA 4LGXA 1K9TA 1OGGA 3AYSA 3MMDA 2XUCA 2WMFA 5CPSA 2VNCA 1MW2A 3ARTA 1XCXA 2OSYA 2X0YA 4W88A 3W29A 4DM1A 2ZUUA 5EB8A 1DWGM 1E55A 2QPUA 1S46A 4P8XA 1Q6FA 4UQDA 1EHAA 2QPSA 4MAVA 4F9JA 1XH0A 2W63A 3BC9A 4AIEA 4WKFA 2YBTA 2CNCA 3PZGA 1AMYA 2OWWA 3U5UA 2J7BA 3WD0A 2WW5A 2J8GA 5JIWA 3MSGA 5ABFB 1CGXA 4AZCB 1H0IA 4UQEA 3PZQA 5A2CA 3WELA 4OZOA 1G1YA 2E9MA 4L4PA 1KR1A 4Z2JA 4NZCA 1GZJA 5A8OA 2O9TA 4LX4A 3GYCA 5I79A 4B15A 4B9ZA 1VJSA 2F8QA 3AHVA 2VQTA 1HF6A 2XFRA 4UCFA 1V02E 5ABHA 3PBGA 1E56A 1LL4A 3VIKA 2E40A 2WVTA 1V6VA 1CGYA 2XVKA 1ISXA 1E9LA 3POHA 1UQYA 3OLGA 5HNNA 1GOKA 2BV9A 4M1RA 1K9FA 3ARXA 4AEEA 4JCMA 5CQ1A 1RP8A 2PB1A 4MB4A 1E1EA 1PIFA 3I3BA 3WFLA 4PMYA 4JFWA 1UYQA 2DIJA 4UFHA 5FL0A 3BGAA 1UD6A 3SUSA 4M80A 3AZSA 1E71M 1HT6A 2DH2A 1EOMA 1I1XA 1KWGA 3RJYA 4M81A 4MNJA 2WVVA 3VX1A 3WDIA 5E6ZA 2VCCA 1JZ6A 1JDDA 3SCUA 2E8YA 4HU0A 4JFUA 3TTQA 3L4TA 4D1JA 2GJRA 3ZOAA 4R5EA 3VIHA 2CKSA 1V6XA 2DSKA 2ZIDA 3ALGA 4LYRA 3NIYA 2WBKA 4PYSA 3W81A 2WZEA 1FOBA 1KBBA 1J12A 1G01A 3ZM8A 4AISA 4M29A 5JIPA 1JZ7A 1QBAA 1D3CA 3VNZA 1B30A 3L4UA 1JAEA 2BXYA 3PZOA 2CBJA 3T09A 4M56A 1BF2A 3N11A 1UWTA 1MQPA 4HMDA 1HL9A 1YHTA 1VEMA 4ZEPA 1FP8A 2PI6A 5HXMA 1QBBA 1TFVA 1V03A 3KL3A 4KH2A 3HMCA 1E6SM 2ZXDA 5GNXA 4LYQA 5GNZA 3AJ7A 2BVDA 3GXMA 3EMQA 4MNKA 1SYTA 4HP5A 4XB3A 4IPNB 1DWJM 4DWSD 2XVLA 1IT0A 4B9YA 3WD2A 3QHNA 1ECEA 2YA0A 3MUY1 1HN1A 2J7FA 3T2QA 3AS3A 4TUFA 2WZIA 3ARUA 4ATWA 1OBAA 2GVYA 4LQ1A 3K8LA 1RPKA 3M6DA 1JXJA 5A6BD 1LJYA 3CZKA 3MSDA 4D6DA 1AQHA 3WEMA 1FP9A 1MFVA 1C7SA 3WL1A 3OIHA 1KQYA 4PMUA 3SURA 1OSEA 3OBAA 4J3TA 1GQLA 2WSPA 5EFDA 1F4HA 1KB3A 2ZWYA 2ZWZA 4D6FA 3AIEA 1J01A 1UD4A 4CUCA 1GQKA 3EDJA 3VO0A 4WIWA 3VMPA 4J3VA 1UKPA 4PTWA 2WMKA 1BYDA 2BY2A 3BAWA 2EPOA 3PTKA 2WLZA 3LPFA 3RO8A 2VUYA 1UD5A 2BHYA 2GK1A 4AD3A 5D9OA 4CVUA 4E4PA 2W66A 1VEPA 4J3WA 3ZSTA 4AD4A 4D1IA 1IZKA 1V3HA 5D4YA 4GI9A 2BVTA 5AYIA 1WCGA 3KWXA 4JHOA 5M03A 1GHRA 3EDFA 3WQ4A 1DWIM 4GINA 3W24A 1WDQA 7CGTA 4D6IA 1H5VA 4AEFA 1BG9A 1JYWA 3M07A 2A3AA 1JXKA 1VENA 3CH9A 4JKKA 3QHMA 3GDBA 3VNYA 4BF7A 4W5ZA 1WP6A 1A47A 1E4IA 2VL4A 5DF0A 4HOWA 2FH8A 1W9XA 4GIAA 3AMLA 3M46A 1HKJA 4YHEA 4JKLA 4PMVA 2OSWA 3CZLA 3BAXA 3VKKA 4D6JA 1BVZA 2Q8XA 5HBFA 6A3HA 4TOQA 1ISYA 4CD6A 1J0HA 2WYSA 1LWHA 2D3LA 3WH7A 2E0PA 3VPLA 1JDAA 3U57A 1H11A 4NSBA 5A95A 1HIZA 2XVPA 3ARRA 2WHKA 3VDBA 5BXPA 3CBWA 3CUHA 2VVNA 3W0KA 4WF7A 2V3FA 1QI5A 1C93A 1KCKA 2ZX7A 3AHTA 2Y24A 3TONA 5CLWA 2V5DA 5HOSA 3VIIA 3QR3A 3BAKA 3THDA 2VR4A 3VM7A 4FLRA 1CEOA 3VD9A 2DT1A 4UQCA 3SUVA 2XVGA 1JZ3A 3B9AA 4HA4A 2YL8A 3VIOA 3MUZ1 1ISVA 1UWUA 2G3JA 1KBKA 2EBNA 2X05A 4ZXOA 5LA1A 4H8VA 5A6MA 3GZAA 1B90A 3WY1A 3ZJ6A 5JBDA 4WLCA 4YPJA 1JZ4A 1Q4NX 1UOKA 1WKYA 2DGAA 2C8NA 1QI2A 4M8UA 3LPOA 1Z32X 3D3AA 4CCEA 2NW0A 3WDRA 2AMGA 3GH5A 1QOXA 3LPPA 1JZ8A 2VRKA 5HDRA 2VZVA 1JD9A 2J75A 1M03A 4X9YA 1EHNA 3ZR5A 5BXSA 1HVXA 1E3XA 1XSJA 4OJYA 1W32A 4N0RA 4U31A 4QAWA 4XX6A 3GBDA 5EMYA 4HOXA 3DYMA 4CCDA 2CHNA 1FFQA 1X6LA 2BHZA 2A3CA 5I3DA 1SFSA 3RDKA 2XG9A 2WVUA 2XJ7A 4U2YA 1NWUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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