4N6EA

Crystal structure of amycolatopsis orientalis bexx/cyso complex
Total Genus 80

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
DEPWLKIGAREFRSRILVGIEQYDSVPLVRDVLNAAGADVFITTVDPDNRRSSLLLMDLADELPLDDFTWIGTTSFARTKESALRSARILRDSLGIEILKLDVRGDDNTPDNAGTVEAARELRAEGMELLPFILPDLATARALEEAGCAALRVMASPVASGRGIANPAAIRELIEQIGIPVVVEGGIGSARHVAEAMELGASATLVNTALVRAESPLLMAAAMRQAALAGLLSYESGPMPEVAA

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase/biosynthetic protein
source organism Amycolatopsis orientalis
publication title Co-opting sulphur-carrier proteins from primary metabolic pathways for 2-thiosugar biosynthesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative thiosugar synthase
total genus 80
structure length 244
sequence length 244
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4n6eA00
2V8ZA 4NJIA 3MBDA 3DU0A 1VR6A 3EX6A 3G1SA 1OFPA 1GOXA 4NNAA 3EWXA 3V75A 2H8XA 3M44A 5CZSA 3BLEA 4CNOA 5LKYA 3HQ1A 1XBZA 2NUYA 3ABQA 2CZDA 4RJEA 2ZA1A 3MI3A 3WJXA 2ZDRA 4O1CA 5AB3A 1RQEA 2ZZ7A 3L65A 1H7NA 3M16A 4MZ1A 3O05A 4JDYA 4XQ6A 1XKYA 4JYFA 3LXBA 5DXYA 4JYDA 3JS3A 1VJIA 1TQJA 4NNCA 3UQNA 4MOZA 1V7YA 2EKCA 4UTHA 3B05A 4KWWA 4EIVA 5CPOA 2QCEA 4XTDA 5L6UA 2YYUA 1I2PA 1SR9A 2ZRYA 1L6SA 3GAYA 4M6VA 5G2IA 1P4CA 4HIBA 3EEGA 3TQKA 1ALDA 4JX4A 5C5YA 3U8GA 3IGXA 2C16A 3P80A 5BNKA 3DHDA 4A22A 4PL2A 4Y6GA 3A21A 5IBXC 3TFCA 2YW4A 1LOSA 4WJEA 3FLUA 2E5BA 1Q3NA 2Y7GA 3W7IA 2WQPA 5D2VA 3DFOA 4O10A 4ML9A 1KV5A 3GKFA 3S1UA 5IM51 2QEZA 5L9FA 3GNNA 3O1NA 1I45A 3SGZA 2Y85A 2QUVA 5LZLA 1KFEA 5KZMA 4JDBA 1TB3A 3FOKA 5EMUA 4PODA 1WOBA 3PBUA 1QPRA 3W74A 1EB3A 4HN4A 2ABAA 3N9SA 2CZFA 3IIXA 4A2SA 4FHAA 4PL1A 2O7SA 4DEFA 2CLIA 1FBAA 1SZNA 4CQ8A 1J5TA 3ATYA 1QWGA 2R14A 2J24A 5I3KA 3W7PA 1MEHA 1SW7A 4DO6A 1F74A 2QCNA 3GDMA 3W2NA 1DVJA 1I2NA 1W3TA 1A5SA 1OFQA 1KM5A 5F4SA 3LLFA 1LDCA 4IQLA 1OFBA 3P74A 2ZRZA 3QW4B 1GVRA 2Y88A 1RZMA 3DBPA 2I9EA 4OGZA 1SFJA 3TA6A 2HS6A 3BW4A 1G6CA 4UTWC 2DZWA 3ZWTA 4AB4A 3PBWA 1EWDA 2ZYFA 1IXQA 1DQWA 4JY8A 1F76A 1ZHAA 5AOUA 4JIQA 2QKFA 4C1LA 4O1DA 1H1YA 2CLHA 4K8EA 2YZRA 1OFDA 3LI0A 1W37A 3HMJG 4WXYA 1I2QA 3QQ0A 3GDKA 1CI1A 4YWIA 1QCWA 1O95A 1YLVA 4MY9A 2G5WA 4FNTA 2FPYA 3W7OA 3TC6A 2QAFA 2RDWA 1MSSA 1WA3A 4X3ZA 1ZNNA 3H54A 4LW7A 2HMCA 4EOUA 1I2RA 3FJ6A 1W3IA 3ABRA 1K8XA 1FWNA 3TC7A 1VCFA 1A50A 4CNPA 3LHYA 3M0ZA 2EF9A 3MHFA 3TV8A 1TPUA 4EF8A 2Q8ZA 5EY5A 3W7NA 4CNNA 5D09A 1VS1A 3W7RA 1OABA 2QJIA 3B03A 4QISA 1KBIA 3W7JA 3BW2A 3G8EA 5I3JA 3KOFA 3O63A 1HL2A 4UTMA 4WZHA 4RX0A 4WY0F 5LHFA 3VFLA 3KXQA 1KM4A 3PG8A 2ALDA 3FYPA 4CCDA 2F7FA 3LCXA 3TX9A 1Q45A 3G1XA 1M5WA 4IX2A 1H51A 4AHOA 3T4CA 4JXCA 3DFQA 2ZRUA 3B0UX 1DKWA 3NO5A 3EWYA 3C56A 4ADSA 5TBOA 3DZ1A 4I7VA 1W54A 3PWAA 3N2MA 2FPTA 1R2RA 3L21A 3MHUA 4DXVA 3KVKA 3DENA 1KLYA 3CC1A 3M41A 4ZQPA 1PE1A 3LCLA 5BW6A 3SIZA 4YCPA 1Q6LA 4CCCA 1LORA 1OG0A 4JD4A 3SGUA 3NL2A 1ICQA 4NU7A 3FFSA 1L2UA 3W85A 3PY2A 1UCWA 3NQ6A 1Y0EA 1HO1A 3E9AA 4JTGA 1DBTA 4WY0B 1NF7A 4A29A 1KFBA 3W7EA 1AK5A 3P67A 3S1VA 3GK0A 4O12A 2GVJA 5FESA 1P5BA 2Z2UA 3GDTA 2E6FA 4K8HA 3O6YX 4M6PA 3IIVA 3NEVA 3FYOA 2FDSA 4XWUA 3TK7A 2KZHA 4AH7A 3VE7A 1QDSA 1H1ZA 3TXVA 4UFLA 4XBKA 3S1WA 2Y62A 3WJWA 3TKFA 2WO5A 3P62A 3OA3A 1KM6A 1SPQA 1SW3A 4N6EA 4UR7A 1D3HA 6ALDA 3BW3A 2P1FA 1A53A 2XN1A 5FF2A 5H2ZA 4FIQA 3QQ1A 4HPXA 3LB0A 1DOSA 1WV2A 2YFNA 4PC8A 4M6QA 3OG3A 2ZBTA 5DCEA 1HUVA 1QAPA 3O6CA 4MZ8A 1C9DA 2V81A 4UNKA 1R2SA 2ZA3A 3H55A 4OWGA 3NQDA 4RK8A 3OEXA 2V2DA 3O06A 1VPXA 4ICNA 4IGHA 3OVQA 1TO3A 1SW0A 5AHMA 5FEWA 1EWEA 2E6YA 1P1XA 4JTUA 2CLEA 3IV3A 2H3DA 4M7SA 3MWAA 5E1QA 4JYEA 1MEWA 3DFNA 1QO2A 2OJPA 2WSYA 3N34A 4UTLA 4ORMA 4AMAA 1W56A 4JICA 1FWRA 3W1NA 1OVDA 1R2TA 3KVLA 1ZALA 4JTTA 1G4PA 3ATZA 4MYXA 2C1HA 3OVPA 2NUXA 1N8FA 5D2YA 4N02A 1GVQA 2V2CA 1XFBA 3NL5A 3W73A 3W9ZA 4M7TA 4LUJA 5CKSA 3DKLA 1VGAA 2QCDB 1OF6A 3YPIA 3E0IA 3IGSA 5HINA 1LLZA 4Z1CA 3TQ0A 1VC4A 1JQVA 3HO8A 4BK9A 1WYIA 3NR0A 4LS0A 1S5TA 5G1YA 5G4WA 5LNSA 2E1DA 2GOUA 1XCFA 3P5YA 3W23A 5CPLA 3M5YA 4UMCA 1DHPA 3PUOA 2DZUA 2QCMA 4K38A 4GXMA 3W2LA 2Y61A 3FS2A 2BTMA 1P0NA 3LHZA 1L6YA 3L5AA 2PRHA 3Q94A 4XTIA 1WAUA 2YW3A 3EWBX 3W71A 3P81A 3DHFA 2DJLA 3USBA 3S0CA 1XDLA 3BPWA 2YPIA 2NUWA 3A5FA 2W0UA 3C52A 4LTSA 5AHNA 5I3IA 5LNWA 3W1UA 1YTKA 4IXHA 3HF3A 1TRIA 1ICSA 3UWWA 4LV9A 3EX3A 3KRSA 3UWUA 1A5AA 2V30A 1XXXA 3P8IA 3G1FA 3NG3A 1VCGA 3QM3A 3E96A 3OBKA 1MXSA 4E2BA 4O28A 5FEXA 4AHQA 1HO4A 1LOLA 2QCDA 3W7LA 1NVMA 2WSRA 1ZFJA 4ADUA 2A21A 3O8AA 4AEOA 1F2JA 2V5BA 3LCIA 5HWJA 4HNUA 5FEPA 1Q6RA 3W7MA 2ZZ2A 3C2FA 5D33A 3HGOA 4OHQA 4JN6A 1AL8A 1OHLA 1G69A 4LVBA 4UIOA 4O4WA 3NA8A 2PE4A 3QEZA 3DI0A 3F03K 3VNDA 3R89A 4XBSA 1WBHA 4YCOA 1R47A 3BG9A 4JTHA 3F4NA 1W5OA 2NZLA 4N6FA 3MW7A 4OV9A 4Z1DA 1T0OA 2HSAA 3HGJA 3LM7A 2P0OA 1WDWA 2ISVA 3QF0A 1CW2A 1ONRA 1UUMA 1RPXA 1L9WA 2ATMA 1LROA 1C29A 4IMFA 2YXGA 2FB3A 4O4VA 1K7FA 3NXFA 4TU1A 4LVAA 4MYAA 4B5NA 3O07A 4P2VA 3NAVA 3NQEA 4FX7A 3C2RA 1JCMP 4UFIA 2E77A 2ZRWA 1TV5A 1D9EA 1EUNA 2WNNA 5FF3A 1D3GA 2H3BA 3R8RA 3STGA 4NJHA 1T96A 3T78A 2ZA2A 4NVTA 1Z48A 3S1XA 3VI2A 4HPJA 3MBFA 1BWLA 4O18A 1X1OA 2RDTA 4QM1A 4AAJA 2XFWA 3GNDA 3N14A 4LU0A 4MY8A 3SECA 3THAA 4MY1A 2GJLA 3S5ZA 1SO5A 3LOTA 5G2HA 5CZTA 4CCEA 3NQMA 3W7HA 3M43A 5EYWA 2HTMA 4TIMA 4X22A 3N9RA 3GR8A 1OYCA 1RV8A 2JGYA 5LNRA 1TJRA 1RQBA 1KV8A 2B4GA 1A5CA 5CPMA 4MFDA 1TV7A 1GVOA 2TSYA 3S8HA 3C61A 5FEZA 4Z1BA 5D05A 1PL9A 3W2JA 1E51A 2EPHA 2E5DA 1TREA 1FCVA 5KMYA 4HT3A 3H53A 3W1MA 3U2OA 3PF3A 2QJHA 2QDHA 1W3NA 2FJKA 1SO4A 4Z08A 2RFGA 1TTQA 3LBCA 5F2IA 4FX6M 2CZEA 2A85A 2GPTA 1EEPA 4HSOA 2YSWA 4O13A 1TTPA 3DGRA 2ZRXA 3M7WA 2GQAA 2OZ0A 3LLDA 1M6JA 2YR1A 2QR6A 3TXZA 1JUBA 5DCDA 2A6LA 5D32A 1QR7A 1KFCA 4CLMA 2YX0A 3TMQA 3ZFHA 1O60A 4O14A 2C15A 5E0KA 2DP3A 5AYYA 3HIJA 3GKAA 2ZZ6A 3UYCA 2C14A 4LC8A 3IGUA 1GTHA 3C8FA 5D03A 5SWUA 3BVJA 3G18A 1HG3A 1VLWA 5U4NA 4L4LA 4UTKA 3ANYA 2C3ZA 3RMJA 1KW1A 5T26A 1KFLA 2XN2A 4PTNA 3NM3A 3TIMA 4DF2A 3LTPA 4ZQCA 1XBYA 3GXNA 4E2DA 1KTCA 4PFMA 2ZZ1A 4RZ4A 3SR7A 5E93A 2BXVA 1DJQA 1EPXA 2C19A 5AHIA 1R46A 4NNBA 3TSMA 1TPH1 1KBJA 3DH7A 1H7OA 4ZVJA 2YYTA 2J9ZA 3OIXA 3LHUA 3OHIA 4MJMA 4WOZA 3S6DA 1LOQA 3DXIA 1B4EA 3T40A 1NFBA 3W1LA 4N2YA 4JNMA 3HGRA 2VOMA 5F4XA 1F6PA 1GWJA 3WFAA 3L68A 3TCEA 5F2MA 4MLJA 4K39A 3KX6A 2NXIA 1R30A 5K7JA 4FIRA 1EUAA 1SZGA 1TPWA 1OX5A 2G95A 1LP6A 4O0ZA 2VEPA 3QYQA 3P8JA 2R8WA 3TAOA 1VHNA 1FX6A 2WKJA 5I3HA 3WJZA 1AMKA 2Y89A 4BWLA 5KTLA 2P10A 3I7RA 1AW5A 1BKSA 3RK8A 4EWND 4QITA 3NPXA 2Y7DA 4UTTA 1QOPA 3EWZA 4AWUA 4O57A 2EAWA 4UUIA 1GG1A 1YXYA 4BR1A 1BTMA 4YL2A 5TIMA 3TAKA 4WD0A 1LYXA 3I6RA 4JY9A 4GUGA 5CZJA 1WBJA 3QSTA 1AG1O 3NGJA 4QNWA 2I14A 1LM1A 3KFTA 4Q4KA 2CLMA 1O4UA 5FF4A 4OV4A 4OT7A 3TJLA 5HR6A 2QCHA 4DO5A 3G24A 3TQVA 2RKXA 3WK1A 3UD6A 3W75A 2W79A 3TUUA 3QSRA 2JBMA 3PUEA 4QQ3A 4QSHA 3DFTA 3O16A 2ZCGA 3KHJA 3L66A 3BARA 4K7YA 1NSJA 1ZAHA 3JRKA 4PEKA 3NQ7A 4I9AA 3TR2A 3A5VA 1RVGA 5DBUA 3EKLA 4AVFA 2VFGA 2VFDA 1YDOA 2NXHA 2WNZA 4P61A 2BLEA 3B8DA 1TYGA 3UWZA 1H5YA 4S2BA 1YXCA 1SFLA 1GPWA 3HBLA 5KITA 1VYRA 1H7WA 3AJXA 1G4TA 1TJPA 4O17A 1QPNA 1FCBA 4A3UA 3CLMA 3LHVA 4IMDA 3WK3A 5C55A 3BG5A 3HG4A 2AQWA 3CEPA 2FQIA 4XZ9A 1TV8A 4M19A 2F84A 3QZEA 3I7SA 4X9SA 4O1BA 5U7SA 5CSRA 3C2EA 3TJXA 3G3MA 5HMSA 4JTEA 1I4NA 2QJGA 3E02A 3V1PA 3SSJA 4RR4A 4K37A 5HWNA 3ZS4A 4AWSA 4DQWA 1LRNA 2WSQA 3P5ZA 2CLOA 5HWMA 2QUTA 3F4WA 4LRTA 1H60A 5F2LA 3NQ2A 1G7VA 1FY6A 1KM3A 3LCWA 4ZL1A 2E09A 4LUIA 1FQ0A 3LGEA 3G0SA 4H4IA 3GIYA 2GJNA 4LC6A 1I8JA 1K7XA 1YPFA 1FDYA 2ZZ5A 3QC3A 5AC7A 2NWSA 2PURA 1YPIA 4HSNA 1GG0A 3Q58A 5AC6A 3NDOA 4MIMA 3QFEA 1H7RA 2ZZ3A 4DBDA 5K9CA 4AXKA 3L0NA 3MO7A 4HNNA 2VFIA 1H7XA 5H91A 3QPYA 1OFRA 5KSWA 3P82A 1JRBA 3K30A 1W5NA 1Z44A 2IQTA 5CPNA 3L9CA 3AO0A 1TIMA 3HG2A 3W2KA 2E68A 2FIQA 5K9XA 1UJPA 1VCVA 1H61A 1JCXA 1KFJA 1F05A 1EP2A 4Z0SA 3W3OA 1OX4B 4KFNA 4J9JA 1G67A 4GUJA 3Q37A 3SI9A 3BLFA 3PC0A 2JKAA 1H7PA 2NX1A 1LTDA 1TPFA 3WJSA 2GQ8A 4UMBA 1X8FA 1EA0A 3WJYA 3M5VA 3GAKA 2ZTJA 2NWRA 3G22A 2JGQA 4WOQA 5K4XA 4MKNA 5D02A 1W8SA 1JVNA 4RV8A 1WX0A 1YDNA 3E12A 3EX1A 3O6DA 5DLCA 4EF9A 3EXRA 3W87A 1KA9F 3QMRA 4JTSA 4UTWA 3I7QA 3W2UA 1KFKA 4FB7A 4MVAA 2NV2A 2TPSA 4LY8A 3I65A 4ZQRA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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