4N6EA

Crystal structure of amycolatopsis orientalis bexx/cyso complex
Total Genus 80

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
244
structure length
244
Chain Sequence
DEPWLKIGAREFRSRILVGIEQYDSVPLVRDVLNAAGADVFITTVDPDNRRSSLLLMDLADELPLDDFTWIGTTSFARTKESALRSARILRDSLGIEILKLDVRGDDNTPDNAGTVEAARELRAEGMELLPFILPDLATARALEEAGCAALRVMASPVASGRGIANPAAIRELIEQIGIPVVVEGGIGSARHVAEAMELGASATLVNTALVRAESPLLMAAAMRQAALAGLLSYESGPMPEVAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
S1 (15-17)TIV1 (13-16)AH7 (200-209)TIV2 (16-19)TI1 (30-33)AH1 (36-46)EMPTYS4 (50-53)S6 (108-111)TI4 (115-118)AH4 (122-135)O1 (144-146)S7 (138-143)TIV3 (174-177)AH5 (147-156)S8 (161-164)AH6 (177-186)TII1 (167-170)AH9 (226-246)AH8 (218-222)AH2 (66-72)AH3 (90-104)S5 (79-83)TI3 (84-87)TIV4 (194-197)S10 (213-216)S2 (20-22)S3 (26-28)3H1 (75-77)S9 (191-194)TVIII1 (223-226)TI2 (56-59)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Lyase/biosynthetic protein
source organism Amycolatopsis orientalis
publication title Co-opting sulphur-carrier proteins from primary metabolic pathways for 2-thiosugar biosynthesis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative thiosugar synthase
total genus 80
structure length 244
sequence length 244
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF05690 ThiG Thiazole biosynthesis protein ThiG
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4n6eA00
4XUGA 4ZMGA 1JCJA 3OVQA 4DEFA 3STEA 3A5VA 1LP6A 1I8JA 2I1OA 1JUBA 1OABA 2R14A 2X1SA 3DFNA 1KTBA 1SFLA 2WSRA 1VRDA 2X1RA 4NVTA 4O14A 1T0OA 2WV8A 3C2RA 3KRUA 2E09A 5C2XA 2Q3OA 1GVQA 2RDUA 3DKJA 5D05A 1QWGA 5CPOA 5AHIA 5AYXA 1VYPX 3E9AA 5DBTA 4RV8A 4JN6A 3S42A 1XUZA 1X6UA 2OCZA 1SSDA 4M6PA 2ZBTA 3EXTA 3S6DA 2JGQA 3N34A 2E6DA 2ZZ5A 3LBCA 3U6WA 2VXNA 4PTNA 3DI1A 3GXPA 4IJBA 3M5XA 1XKYA 4RX0A 1UB3A 3VCRA 3M43A 3ZR4A 1DORA 4O15A 3PC0A 5K4XA 2QCMA 2W6RA 4J9JA 4N02A 1J5TA 2NX9A 3W1RA 3DAQA 2C18A 2FB3A 3BGJA 3UWVA 1KM2A 1FQ0A 1RQBA 5KZEA 2Y7DA 2XN1A 3PY2A 3EWBX 3EX2A 4NUWA 2DZPA 3TKFA 2C14A 4JICA 4QQ3A 4RR4A 4MY8A 1MO0A 1BKSA 1FY6A 2TMDA 3PG9A 4IPJA 5AB3A 4ZQMA 1W3TA 3SY5A 1VQTA 5U4NA 4H4IA 2NX3A 4XQ6A 1OYAA 4BK9A 3EX4A 4Z0SA 4JTGA 3C2FA 3E02A 2V8ZA 2HMCA 4BR1A 1LRNA 4YL2A 2VOMA 1SO4A 3HGOA 2EF9A 4O13A 3BO9A 1F73A 1FCQA 1Z42A 5F1VA 3TROA 4MJMA 1B4KA 2H3DA 3IGXA 3QF0A 1TV8A 3IV3A 2D73A 3W1TA 3PB2A 3QPYA 4Y9AA 1EWDA 4O10A 1WAUA 1KFKA 5DY2A 5H91A 2ZZ1A 2Z1BA 5FF7A 4RZ6A 3MP3A 3IGSA 1XC4A 5D37A 3W7MA 3STCA 3DXIA 5K9DA 3W83A 4Z1CA 1TRDA 1XBVA 2YGYA 3GYEA 4Z0JA 3TA6A 1ZY9A 4FX6M 3P5YA 2EAWA 3TQVA 5IM51 2YFOA 5AYYA 1OG0A 5KINA 3ELFA 4DF0A 1KM5A 2CLLA 3MMTA 4ALDA 2A5HA 2RDWA 4OT7A 1ICPA 1W8SA 1ONRA 1FWRA 2J6XA 1OX5A 1VLIA 4JTIA 3HGRA 1WOAA 5D2YA 3EX1A 3O6YX 4HIBA 4JXCA 3N3MA 4O11A 2ZA1A 3W71A 4BI5A 2QDGA 2H6RA 1FWNA 1KA9F 2R8WA 2Z2UA 1EP1A 4O16A 1GVOA 4QJ1A 4UXDA 3QSRA 4LV9A 1EPXA 5LGZA 3MBDA 1GJPA 3GKFA 2P0OA 1ZENA 5HR7A 4NNAA 1PIIA 4JY9A 5AC8A 3LHVA 1TSIA 4XBKA 5TIMA 3FOKA 4O54A 4DO6A 2CZEA 4TMBA 3G8RA 3DHDA 4JYFA 5LNWA 1JCMP 1AG1O 1PL9A 4MUZA 4HSOA 3W85A 3F03K 4Y96A 3LERA 2J9XA 1EA0A 1LM1A 3HMJG 4IMGA 4A21A 1F6KA 3EWYA 2BSLA 1S3HA 4LNYA 4N4QA 3ABQA 3YPIA 1G7VA 1MXSA 1G4EA 1KFLA 1W5OA 2X2GA 3AO0A 1OX4A 3E12A 1F74A 3FS2A 3NVTA 5F2GA 4JTTA 2YXGA 3OG3A 2HTMA 4GNJA 2QCLA 2W0UA 3W86A 3PWAA 4ML9A 5LSMA 3IGUA 2ZRYA 3S5NA 1H60A 3L65A 4FIRA 1F2JA 3MI6A 3QJAA 1J2WA 3LTPA 4MYXA 2A85A 2NWRA 2BTMA 3B0VC 4NQ1A 5AHNA 2C1HA 4GUJA 1QMLA 3ZWTA 3UY8A 2E6YA 3W2JA 3LHYA 2FPYA 4KKXA 1KM0A 3DBPA 1ZFJA 4UFKA 1I2RA 1G6CA 1QCWA 5HJLA 3W75A 4MFDA 4WD0A 4IX0A 1RV8A 3NZ1A 3OIXA 4MZ8A 4DPQA 2OZ0A 1OX4B 4I7WA 5FEPA 5CG7A 2FTPA 3I7SA 3W2KA 1LBMA 4N9EA 4CQAA 3N2XA 3EWUA 3B03A 1GVFA 2Y70A 1O95A 4MPQA 3CLMA 4HN4A 4MY1A 4NZFA 3W7DA 2QCFA 2NV2A 2QCGA 3G0XA 1EUAA 5KTLA 1ZAHA 4UNKA 4R34A 4AHQA 1SO6A 1UJPA 1R30A 2HS8A 4XZ9A 2WPBA 4FNRA 4GE8A 3LB0A 1LLWA 4O12A 1M6JA 3NQFA 4LT9A 4Q33A 5GVJA 3T7VA 1HL2A 3TU9A 5IBXA 4UR7A 3GAKA 4O19A 3I68A 4K36A 2V5BA 1KV5A 1K7EA 3B8DA 3GDLA 4CNPA 4JYEA 4IMEA 1TREA 3W6YA 1GQNA 4O53A 3HJZA 3L0KA 3C6CA 4XKYA 1DJNA 1OHLA 1VH7A 2JKPA 3GZ3A 1KM1A 3W2UA 3N73A 3HBLA 4I7UA 5DY3A 1KW1A 5CZTA 1H63A 1XL9A 3UNDA 3GNNA 2FB2A 4M6QA 3EKZA 3HG5A 3W72A 3E96A 2Z6IA 1MEHA 1FDJA 3KVKA 2XN0A 1SZEA 5FI8A 4GJ1A 5FF0A 4XTDA 3S1WA 4HPXA 4JIQA 2ZRXA 2Q8LA 3BW2A 1TQXA 4KWWA 2ZDRA 1TV7A 4RJEA 3BG3A 2TRSA 4FXSA 3NPUA 4JEQA 5HUOA 4UR8A 5D04C 4IXXA 2ZRUA 3PUDA 4BFAA 3SFKA 4FIQA 2Y7EA 3W7GA 3UY7A 1DL3A 4S1FA 4N6FA 3B05A 4IUOA 4Z1DA 3LCHA 1TPFA 5LGXA 1PCKA 1QPQA 1VPXA 2A2IA 3INPA 4XKYB 2YW3A 3PS7A 1XDLA 1AK5A 2Z6JA 1TYGA 2HSAA 5DBUA 2C6QA 4N9DA 3TR2A 3V1PA 1ZNNA 5F4SA 2G95A 1SO5A 3MYPA 1DOSA 1KLYA 5I3GA 1S5TA 2ZRZA 2E77A 3P60A 4R33A 3LHTA 1TO3A 3HF3A 3GIYA 3BGGA 1XBXA 4TMCA 3MI2A 3HIJA 1A5CA 5AHEA 5HMSA 1VR6A 1FXPA 3EWXA 4ICNA 3TSDA 1ME8A 2Y63A 1WOBA 4GWEA 3W1NA 1MZHA 1ADOA 3ABOA 3SZ8A 2C3ZA 3L21A 3TMQA 2Y85A 3BG5A 5F2MA 1TQJA 4RXFA 4JX6A 2LLEA 2J9ZA 2NXHA 1D3HA 3DFTA 4TO8A 1FDZA 2XFWA 3SW6A 3GKAA 3L2IA 5D33A 3EKLA 1H1YA 3P80A 1K02A 4I7VA 1K8YA 2OT0A 3MHFA 3SIZA 2PCQA 4E0CA 4UTWC 1NFBA 2QAPA 4BI7A 3GDKA 3NL6A 1DV7A 1WA3A 4NJGA 3CEPA 2QUTA 4JX5A 1AL7A 2FIQA 3MUXA 5G2HA 4MIMA 3LCGA 3BARA 3IVTA 4U28A 3R12A 4O52A 1UBSA 3EWWA 3STGA 4OGZA 1WV2A 3LRMA 4Y90A 3CWNA 3NAVA 4HSNA 2CFFA 5HR6A 4N2YA 2O7SA 4EF8A 3QYQA 3NOEA 2X1TA 4NT0A 3NNTA 2AAMA 3TAKA 3W74A 1TB3A 1H7PA 1TJPA 2A1YA 4JTJA 3A21A 3G1SA 4K38A 4E2BA 2QCCA 3FA5A 3GDRA 3LCIA 1P1XA 1FWSA 1SUXA 1JCNA 3CIXA 1O5KA 3RK8A 2OX1A 4UTLA 3TCEA 4UC5A 2Y61A 4BWLC 1JQVA 2GQ8A 1B4EA 1H51A 1QPRA 1WBHA 5CZJA 1ZJIA 1L9WA 5L6UA 2QR6A 5E93A 1I4NA 3T78A 3UWQA 1GEQA 5G2IA 4FNQA 3H54A 3NO5A 2C13A 3W73A 4IGHA 3L9CA 2DJLA 1C9DA 2TPSA 2X30A 3S1VA 4A22A 3WJYA 1TPUA 5KZDA 1FCUA 3BK0A 2DZSA 1A53A 3SECA 1PHWA 2NWSA 1KM3A 2ZZ2A 1F76A 5F1UA 1OFOA 1VCVA 1A50A 3PSVA 3TX9A 3B0PA 4NX5A 3W7HA 3KX6A 1IIGA 5DXXA 2Y7FA 5D2XA 3G1DA 4BI6A 3M5YA 1Q45A 4LVDA 2V5LA 2GVGA 4JDYA 3LRLA 2YFNA 3QM3A 3R8RA 3QRHA 3W7NA 3WJWA 2BWGA 4POCA 1C29A 4O18A 1RVGA 3P62A 4G1KA 2B7NA 2VFDA 5KMYA 2XN2A 4LS2A 2Y6ZA 1XBZA 4NZJA 2VEIA 2AQWA 1K7XA 3WJSA 1SW3A 1F6PA 4UIOA 1YDNA 1M5WA 1VCGA 1K3UA 1RQEA 3W2LA 1ZAIA 3NM3A 3TAOA 1V7YA 3NGJA 3G0SA 2VENA 1PE1A 2CW6A 1SO3A 3T44A 3OEXA 2YPIA 1EUNA 1S5VA 3UZ5A 4K8EA 4CQ9A 4DO5A 1QOQA 5SWUA 4U4MA 3GXNA 3G1FA 7TIMA 1ICSA 1DQWA 1AW1A 5AHLA 3P81A 1YTKA 3UXAA 4M5PA 1KFBA 2QKFA 1XCFA 3CPRA 3WK0A 4P61A 1QDSA 3M5VA 1OK4A 3TJXA 2JKEA 2NUXA 1MEIA 2WNQA 3TK7A 3M47A 4O28A 4AHPA 3NQDA 4CNOA 4UTTA 3S5OA 2C16A 1KTCA 1O60A 3IEBA 4OU1A 5LNRA 5AFDA 1FWWA 2WNZA 2E6FA 2A6NA 4HNTA 4GUGA 3NG3A 4O1BA 2QCNA 3W7EA 3DHFA 6TIMA 5FESA 3HPZA 2DJXA 3G1AA 2WO5A 4AWUA 1Q6RA 3W1AA 1TPVA 4MYAA 4X2RA 2QCDA 4NJIA 1W5MA 4JTHA 4IOTA 3VE9A 4EOUA 5AHFA 4GBUA 3W70A 1XBYA 2CLIA 3PM6A 2I14A 4UFMA 2QJIA 5EBUA 2GVJA 4KFOA 1YPIA 3NQCA 1OYCA 3V75A 1FCBA 2V82A 1YADA 2A21A 1VHCA 1B57A 3QZEA 3KXQA 1Z48A 3DFOA 4R7JA 1NEYA 4AWSA 1X1ZA 3EWZA 2CZDA 4AWTA 4UTHA 3L67A 2QJHA 3KAOA 3M1ZA 3PF3A 4MLJA 4QISA 1DJQA 4JTSA 1YYAA 1H50A 2Q3RA 3C61A 4YXGA 3KVLA 1EWEA 4FNUA 5AC6A 3ABRA 4O8RA 2A7RA 2JBMA 2ATSA 5CZ0A 1IIHA 2J9YA 3G0UA 4PC8A 1VS1A 3NQ8A 4W9TA 5HULA 3RF9A 3PAJA 1ZALA 4RXGA 4NXSA 2UV8G 3LCXA 2VELA 1GVSA 2A4AA 3TQ0A 1THFD 3LLDA 3W7OA 3P67A 3W1LA 4A2SA 4WXYA 4O1CA 3AJXA 4UFHA 2QCDB 4UFLA 3QMTA 5BNKA 1SW0A 4OHQA 1SFJA 3C52A 2EKCA 4DPPA 2F84A 1OFPA 2ZRWA 4FO4A 2CU0A 3GR8A 2WSQA 3P74A 2H8ZA 3ATZA 1OF8A 4X3ZA 1W56A 1WBJA 1E51A 1XUUA 3W22A 4JTEA 4O4VA 2C15A 2ALDA 4LS1A 4WOZA 1VHNA 3W2MA 3STFA 4CQ8A 4FX8A 3DFQA 3MP5A 1XXXA 3CM4A 3UWWA 3C3NA 3Q2DA 3F4NA 2R91A 4MKNA 1YXCA 3VKJA 2VEMA 1GG0A 1AW5A 1T8XA 1WQ5A 4TR9A 5KZMA 3FYOA 1L2UA 4FHAA 3U2OA 2TYSA 3W9ZA 3HPXA 2PRMA 3I7RA 4RZ4A 1TIMA 5EMUA 4MY9A 1Y0EA 3I7QA 4WZHA 1VCFA 1RQHA 1H7NA 1IXNA 1GG1A 1NSJA 3OBKA 4DXVA 4I9AA 3IVSA 3O1NA 1GT8A 1EIXA 5I3JA 1H1ZA 1B3OA 4FXRA 4LY8A 2VC6A 5LNUA 1YDOA 1N55A 1VJIA 5CPMA 4WUIA 4R53A 1TTIA 3G3MA 1I2QA 1IGSA 3LOTA 3USBA 1JUEA 4MJZA 5TBOA 3ZFHA 5LHFA 2YR1A 1L6YA 1H5YA 3ANYA 3GXTA 2CZFA 2O7QA 3GAYA 3TFCA 3L68A 1R47A 2DZUA 4LOCA 5LZLA 1IXPA 1QO5A 3TIMA 4MFEA 3T55A 3WJXA 1HTIA 1P5BA 1G4SA 4OE7A 4EF9A 2YYUA 3NQGA 2ZZ3A 2ZZ6A 5K7JA 4B5NA 3TJLA 1R2SA 1H7WA 5CSSA 4FNPA 3VFLA 3Q58A 4E38A 3NA8A 1ALDA 1KFEA 2J88A 3LHUA 4IWWA 3M41A 1DKWA 4QNWA 4LV4A 4UTKA 2NLIA 2NZLA 4P2VA 4O1AA 3S5YA 2HS6A 3CB8A 5LNVA 4JTLA 1A5SA 1OFDA 4GFSA 5E1QA 3GDMA 2ZRVA 1TTPA 1NF0A 3SR7A 3W1MA 3NQ7A 4O4WA 3LV5A 4DO4A 1QO2A 5HWJA 2FQIA 2PURA 5DXYA 3NPVA 4UFJA 5DCDA 1K03A 2Y7GA 4HNUA 1G4TA 3LRKA 3G8EA 1TPWA 2DZVA 1FDYA 3BW4A 4IXHA 5EL1A 5TQLA 3Q37A 3GR7A 1GOXA 3L66A 2WKJA 3NXFA 5T26A 4QNEA 3NQEA 2PRLA 2JKAA 3BW3A 2ZA3A 1W0MA 3HB9A 4NXKA 2GPTA 3A22A 5CPLA 1VYSX 1FX6A 4TIMA 3E0IA 4WOQA 2DP3A 3IVUA 5G4EA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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