4N6F | Genus

Total Genus 82

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	82
sequence length	242
structure length	242
Chain Sequence	DEPWLKIGAREFRSRILVGIEQYDSVPLVRDVLNAAGADVFITTVDPDNRRSSLLLMDLADELPLDDFTWIGTTSFARTKESALRSARILRDSLGIEILKLDVRGDDNTPDNAGTVEAARELRAEGMELLPFILPDLATARALEEAGCAALRVMASPVASGRGIANPAAIRELIEQIGIPVVVEGGIGSARHVAEAMELGASATLVNTALVRAESPLLMAAAMRQAALAGLLSYESGPMPEV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Lyase
source organism	Amycolatopsis orientalis
publication title	Co-opting sulphur-carrier proteins from primary metabolic pathways for 2-thiosugar biosynthesis. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Putative thiosugar synthase
total genus	82
structure length	242
sequence length	242
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-10-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF05690	ThiG	Thiazole biosynthesis protein ThiG

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4n6fA00

4OV4A 4DF1A 2RHGA 5D2TA 2VENA 3QM3A 2Z1BA 3PY2A 3LCHA 3CEPA 3UWYA 3HGRA 3VE9A 4YXGA 2NX9A 4FF7A 4HPJA 3GDRA 4NNBA 1SSGA 3NAVA 4MLJA 3GZ3A 5AHNA 2Y6ZA 4DO5A 3OVPA 1TJRA 2NLIA 3EEGA 1VC4A 2ZZ2A 3MP3A 1XDLA 1RQHA 1FCQA 2AQWA 5K9XA 6ALDA 1OX5A 2CLHA 1EIXA 4N2YA 3QPZA 4FB7A 4IXHA 4GUFA 5J5RA 5CPNA 5AN7A 1Z42A 1YYAA 3VFLA 4I7VA 2TMDA 3BLEA 1NF7A 4WQ6A 5HWJA 3BW2A 4Y6GA 3EWZA 3EX3A 4IX2A 2C13A 4JX6A 1GTEA 1TIMA 4ZVJA 4GUIA 3N14A 1TTJA 1O5XA 3TXZA 2OZ0A 4Z1CA 4TX9A 3W7HA 4FNSA 4NX5A 1HO1A 4PL2A 4FIRA 4NT0A 4MLRA 2CZFA 5D09A 3WK1A 1I2RA 1J5TA 4E0CA 3IRDA 1EB3A 2NX1A 1Y0EA 1B4KA 3EWXA 4RXGA 1GJPA 4I9AA 2EHHA 3UPWA 4O28A 3NR0A 3HGJA 2C18A 1ALDA 2QUVA 3DAQA 3KVMA 3O07A 3TH6A 4TMCA 3W1TA 2WNQA 3F4WA 4MKNA 3RK8A 2C15A 1AL7A 5HQEA 1IXNA 4Z1AA 3NQGA 2VFFA 5FI8A 2BZNA 4LC8A 2JKPA 3B05A 4NNAA 4O13A 4Z0SA 3T55A 4IMCA 2CLEA 2B7OA 4EF8A 4A2SA 2DORA 3U6WA 2H3BA 3NQCA 4AXKA 1TPWA 4AWSA 4UFLA 4M6PA 2WQPA 3I6RA 4XTIA 2QDGA 3W2KA 2YDAA 3L5MA 3W2LA 4N9BA 2RDUA 1WOBA 3A24A 3QH2A 5F4XA 2NX3A 4ZQRA 1HTIA 4IGHA 3P61A 3B04A 4IPIA 1ZENA 4RZ5A 3DENA 3G1HA 1F05A 2A7RA 4RXFA 5C5YA 2V82A 4JYEA 4O4VA 5K4ZA 3QZEA 1UBSA 5EKYA 1TQJA 3M7WA 1PIIA 1F74A 3CPRA 3G3MA 4FX6M 5G4WA 2E6AA 1SO5A 3N19B 4MY8A 5C55A 1QO2A 4O14A 5EY5A 5EMUA 3IVUA 4GXMA 1KBIA 4Y96A 3LB0A 3TJXA 1ADOA 5CZTA 4JTFA 4BFAA 3HG4A 4IMDA 1F73A 4CNPA 3NQVA 1SZNA 2Y63A 4PEKA 4PODA 1W5NA 3A22A 3UZ5A 3LOTA 1FWWA 1ZCOA 2GUUA 3S1WA 1LTDA 2J24A 4FO4A 1BTMA 1SZGA 3N34A 3L0NA 1EUAA 3S9YA 4I7WA 1G7VA 3W1NA 3BG3A 1DQXA 3STEA 4DBDA 1TTQA 3W83A 1UB3A 1D3GA 1F76A 4UXDA 3RLUA 3KRUA 3KVKA 5AHFA 1W3TA 1VJIA 4OGZA 2CU0A 2X30A 3ELFA 5LSMA 2QCGA 2A7PA 1LOQA 5FESA 2V2CA 3P80A 4E2BA 3LV6A 3NZ1A 5LGZA 3LM7A 4O19A 3M9YA 3C2EA 4ML9A 2Y7DA 1DV7A 2DZVA 3QW4B 4LUIA 1SW0A 3OG3A 3S5OA 3C56A 3HPXA 1LM1A 5AB3A 3N2XA 3EWBX 1ME9A 4WOQA 1YDVA 3O16A 4FNPA 3AO0A 8TIMA 3UWUA 1R2RA 1W1ZA 1P0NA 4GC4A 4JTLA 3NM3A 1TV7A 1C9DA 3ABSA 4O0KA 1OFBA 1CI1A 4R53A 2HS8A 1XBZA 3WK0A 4LU0A 3W2NA 1BWLA 5TBOA 3F4NA 2C16A 2ZZ3A 1VGAA 1W5OA 1X6UA 3EX1A 3UZJA 2QCDA 5G4EA 3M5ZA 3GDTA 1TO3A 2DZWA 4QNWA 1TCDA 3NQ6A 2H3DA 3IIZA 1FWNA 3DFQA 4LVFA 3F1QA 1PE1A 2E09A 3RMJA 3NPWA 3GIYA 1LP6A 3WJYA 4CNOA 4FNQA 4O52A 3G1AA 4LVAA 4GBUA 5SWUA 2A6NA 4MZYA 1NF0A 4FXRA 4Z1DA 2E68A 4UTLA 3KAOA 5LNWA 1TRDA 1ZNNA 3PB2A 1M7PA 1IGSA 5KZMA 3CIXA 2XN2A 5K7JA 3N9RA 2Z6JA 2GVLA 5HR6A 1WAUA 4CQ8A 4XBSA 3I68A 3A23A 3G1VA 1K7EA 2A7NA 1EPXA 1TPC1 1K8YA 3W1LA 3N9SA 3O6DA 1JUBA 3P60A 4UCGA 4X2RA 4LW7A 5IBXA 1KV5A 3W71A 1S3HA 3A5FA 2FDSA 3GLCA 3M47A 4OU1A 1WOAA 2VELA 1SU5A 3BARA 3O06A 3L5LA 4EVZA 5HUOA 5CPOA 1XBYA 4KFOA 3KVJA 4HN4A 1R2TA 3ABOA 3TW6A 3QSRA 1R2SA 5G2WA 3W2UA 5I3IA 3KXQA 3G0UA 3TC6A 1TPUA 2IQTA 2ZA2A 2NUWA 4JEQA 1M7OA 3NQ8A 2CZ5A 3NQDA 3G0SA 3G22A 1A5CA 5KINA 2OT0A 3HPZA 1OG0A 4RK8A 3FJ6A 3VCRA 1GVFA 1KFBA 3L21A 1TPB1 3A21A 1QNVA 3F03K 3P74A 3BK0A 1G4EA 3KRZA 1EA0A 3ATZA 1H63A 2WSYA 3NDOA 3CEUA 3P7YA 4XUGA 1FXPA 1OX4A 3GYEA 5CG7A 1L6WA 4GJ1A 5FEZA 3EB2A 1LORA 4EIVA 4JR5A 4ALDA 4E2DA 2E5DA 3SSJA 3YPIA 3W7IA 1H5YA 4FNRA 3BW3A 1I2PA 3MI3A 5BW6A 2NXIA 2ZA3A 1SQ7A 1JRBA 3P84A 1Z41A 2EF9A 4JTSA 3W1MA 2HTMA 4PCFA 2CLLA 4W9TA 1K02A 2R14A 3HG5A 3NQMA 1K8ZA 1VH7A 3GVGA 2RKXA 2Z2UA 3QQ0A 1VR6A 4UNLA 1RVGA 4YMZA 2ZYFA 3MP4A 3QC3A 1WBHA 1RQEA 5FEXA 3QPYA 1B4EA 2Y89A 3E49A 4FIQA 1LLZA 1OABA 2W0UA 4ZQPA 1I4NA 4DPQA 3TA6A 2RFGA 1EP1A 4MY1A 5EA9A 1L6YA 3LI0A 3TIMA 2A0NA 1A53A 1UJPA 1QWGA 3LLFA 4A21A 1XC4A 2P1FA 5EPDA 4Z08A 4Q32A 4HHPA 3IEBA 2OT1A 4IMGA 2E6DA 1PL9A 5DBUA 1Z48A 3TFXA 1SO3A 3QSTA 3PVFA 3WJSA 5FF0A 1AG1O 1KLYA 2J6XA 4PL1A 5KTLA 3HOJA 1QPNA 5I3KA 3KX6A 1DL3A 2FQIA 4DQWA 3WJXA 5G1TA 3G0XA 1A5SA 1WA3A 4DO6A 2HS6A 1Q6RA 1SO6A 4AMAA 1J4EA 1S5VA 4N9EA 4AWUA 3IVSA 1TMHA 3GKFA 4JDYA 1VPXA 3MJYA 4BF9A 1D9EA 1KFEA 4YLWA 4JGDA 3NXFA 2JKEA 3P67A 1OFAA 3L5AA 4MFDA 2BXVA 2FJKA 1F6PA 3M1ZA 4DF0A 4RCXA 1W0MA 3C8FA 2DZXA 4UR7A 1YXYA 4UNKA 1IF2A 1N7KA 2GQ8A 4NJIA 3VE7A 4IJBA 4IPJA 5C6MA 3S1UA 1PS9A 3G24A 2YW3A 4HSNA 3DBPA 2YYUA 1ZY9A 4K7VA 5DXXA 4RR4A 4IOTA 3L66A 3NPXA 1C8VA 5CPMA 2FIQA 3ZWTA 5CZSA 4YWIA 2YW4A 4UMCA 2ZA1A 4CCCA 2P10A 5EYWA 3TUUA 4WY0B 1IXOA 1N55A 4ADSA 3G1FA 3LCIA 1JVNA 1JUEA 4ZQOA 1GVQA 4LRSA 4AHQA 1TPH1 4B5NA 5AFDA 3FJLA 1ZHAA 4IXXA 1MZHA 2Y62A 3OHIA 1MSSA 1KM2A 2NV1A 5TIMA 2JBMA 2B0MA 3L65A 5KZEA 4NNCA 1ME8A 5HINA 3PB0A 1PCWA 4HIBA 2JK2A 2FB3A 4XZ9A 2AAMA 1K7FA 3EX2A 3NZRA 1H7PA 4UFHA 4TO8A 5BMWA 4R7JA 1A5BA 1OFDA 1ZALA 2Y70A 2HSAA 3IIOA 3M16A 5H91A 3PUDA 4PA8A 1K03A 2QAFA 3NL5A 4DBEA 1KM1A 3LCGA 5G5IA 3TR2A 1TQXA 3CWOX 3BG9A 5F1VA 4O18A 1EWEA 2ZRXA 2F84A 4KWVA 1HUVA 2J9YA 4GUGA 1QR7A 4LWWA 2QAPA 3W7GA 2TRSA 1GG1A 1FDJA 1VHNA 2P0OA 4QAIA 5C2XA 1TV5A 3PF3A 4EF9A 2ZRUA 4O8RA 2QCCA 2YCEA 5LNSA 3MO7A 3OVQA 4QIUA 1ONRA 3PM6A 2ISVA 4WD0A 3HBLA 5I3JA 2X1SA 2A1YA 3TDFA 3O05A 1LBMA 2W79A 2A5HA 2O7SA 3GX9A 5CZJA 2OX1A 3W74A 2WNZA 4JY9A 1PHWA 1VYPX 3Q58A 3C52A 4TU1A 3DZ1A 1EUNA 1JRCA 5E0KA 4K38A 4XQ6A 2RDTA 3TNOA 5AHIA 3W7EA 5C54A 3TAOA 2ZZ4A 3PUEA 3LV5A 4RJEA 2QCHA 2YZRA 2GOUA 3CLMA 5D30A 1YTDA 1TPEA 1ICQA 1OYCA 4OV9A 1SPQA 3MHGA 4LOCA 3BGGA 4BI6A 4LVBA 5F2GA 4K37A 5KZDA 3TMQA 5U4NA 4AHPA 1VCFA 1NSJA 5T26A 3GXPA 1TPVA 1YDNA 3NO5A 3QMRA 4M19A 3ZS4A 2WSRA 2C6QA 3STCA 5EBUA 4MZ1A 1FBAA 1G6CA 3GK0A 3UY8A 4IQLA 3S5NA 2B7PA 1YTEA 2QR6A 4TR9A 1H61A 3TC7A 2CW6A 3BLFA 3L0KA 4LY8A 1SZFA 3W85A 4L4LA 1IIHA 5L9FA 2EPHA 5U7SA 4HT3A 4JS3A 2Y85A 3TSBA 3DI0A 3TXVA 1JQXA 2B7NA 5DCEA 4PC8A 3M41A 4WY0F 2VEMA 1QFEA 3CC1A 4HPXA 1VCVA 4GUHA 2VEIA 1QDSA 3QMTA 1UCWA 3MBDA 1UASA 1X1OA 3LCWA 1R47A 1GWJA 1KFJA 4JYDA 4ZMGA 1G4PA 3CM4A 3OIXA 1TREA 2TSYA 2PRHA 4M6QA 3HG2A 3E0IA 3LRKA 4O16A 2VOMA 3W3OA 4WX2A 5L6UA 1TSIA 3FS2A 3LX9A 3W7LA 1XXXA 2H6RA 3C61A 3MYPA 3SGUA 2H8ZA 1H7WA 3NQAA 3OVRA 2QCDB 4P2VA 2QCLA 3STGA 3KOFA 2V2HA 5D33A 3R5EA 4O57A 3W73A 4MYXA 1KTNA 3W87A 4AAJA 3GR8A 1EWDA 4K39A 3T78A 2V81A 3UQNA 1QOQA 1CW2A 1YTKA 2ATSA 3THQA 1B57A 3K30A 3DHDA 2FB2A 1VHCA 3TQVA 4QITA 2A4AA 3LTPA 3LGEA 1FUYA 3R2GA 2WSQA 3P8JA 5AHMA 3U8GA 1OF8A 2OCZA 4KWWA 1W3IA 3QF0A 4DELA 3L2IA 3CHVA 4A22A 4LC6A 1Q6OA 4O1BA 2ZRYA 2FFCA 2CZDA 3HF3A 2WOQA 3PG8A 4JTKA 2G95A 3M5YA 3S8HA 1MEWA 2PRMA 5K2ZA 2J88A 1SFJA 5GVJA 2YR1A 2C3ZA 3C4UA 4P61A 5K9DA 3CWNA 3DKJA 3QEZA 3N3MA 3B4UA 3UWQA 2J27A 1I8JA 4UTWA 3WJZA 1S5TA 5DELA 4N6FA 1T0OA 4N4PA 1M5WA 3W1QA 2EGZA 3NL2A 3G3DA 4GFSA 3NA8A 1ZAHA 4BI5A 2JGQA 5AHLA 3Q2DA 5DXYA 1LBFA 3LTYA 4NUWA 2XN0A 3W7MA 3P62A 3M5XA 1OK4A 1Q6LA 5D2YA 4ZQCA 5HMSA 1QO5A 5BRBA 3LXAA 3FIGA 4ZL1A 2QUTA 2A6LA 4OQVA 1CX9A 2GVGA 5DCDA 3ZWSA 2NXHA 1J2WA 5E1QA 3NVTA 4QM1A 6TIMA 3MHUA 2YSWA 3LHUA 1OK6A 4N9DA 4BWLA 1OYBA 1AL8A 3S0CA 3SY5A 5H2ZA 1ZAIA 4ORMA 1RD5A 3W7QA 5K4XA 3TK7A 3O6CA 3CTLA 1W8SA 2B4GA 2ZZ6A 5I3HA 3H54A 3E12A 1JCLA 1VZWA 2EKCA 4C1LA 3BLIA 2NXGA 3JRKA 4UTIA 5F4SA 3UWVA 2NV2A 3HJZA 2R91A 4J9JA 1ZAJA 3TMLA 2DP3A 2Y7GA 4GNJA 3W2MA 3E02A 2WJZA 4H4IA 3C2FA 2GQAA 3GKAA 3CQ0A 3G1DA 2Q8LA 4X3ZA 1TTIA 2ZZ1A 5AOUA 1IXPA 3DI1A 1YPFA 1XBVA 2JGYA 3MUXA 4BI7A 1VQTA 4IMFA 3EX4A 3SW6A 4LVGA 3NQ7A 4S1FA 4RLIA 3TAKA 1EX5A 1KLZA 2FPVA 4BK9A 4JY8A 4UMBA 1IIGA 1G69A 4DF2A 4XWUA 1TPDA 4JIPA 3W84A 2ZFAA 2CZEA 4FX7A 4JICA 3SR7A 3UXAA 2Q3RA 3RLVA 1S5WA 4YL2A 3W9ZA 2X1RA 4AVFA 5BOOA 1GT8A 3NQEA 1KW1A 1Q45A 2WNNA 2V9DA 3C6CA 1YPIA 4HNTA 5BMXA 1JR1A 4JX4A 4MYAA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4N6FA

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