4N6F | Genus

Total Genus 82

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	82
sequence length	242
structure length	242
Chain Sequence	DEPWLKIGAREFRSRILVGIEQYDSVPLVRDVLNAAGADVFITTVDPDNRRSSLLLMDLADELPLDDFTWIGTTSFARTKESALRSARILRDSLGIEILKLDVRGDDNTPDNAGTVEAARELRAEGMELLPFILPDLATARALEEAGCAALRVMASPVASGRGIANPAAIRELIEQIGIPVVVEGGIGSARHVAEAMELGASATLVNTALVRAESPLLMAAAMRQAALAGLLSYESGPMPEV

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Co-opting sulphur-carrier proteins from primary metabolic pathways for 2-thiosugar biosynthesis. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Putative thiosugar synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Amycolatopsis orientalis
total genus	82
structure length	242
sequence length	242
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2013-10-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF05690	ThiG	Thiazole biosynthesis protein ThiG

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4n6fA00

3OBKA 3W2MA 3TJXA 4ZQNA 3DFPA 3P61A 3MBFA 5FEXA 4YL2A 4DF2A 3EEGA 4YLWA 1OYBA 3QMTA 4KWWA 1NVMA 3MHFA 1OFRA 3GDKA 3FKKA 2YW4A 3LHYA 4N9DA 3O05A 1WDWA 2WSYA 4O53A 4PFMA 2PCQA 3NL2A 4POCA 5F2GA 1ZAJA 5I3JA 1ZY9A 2NZLA 4FIRA 1SW0A 1A5SA 5KITA 3P74A 3W1MA 5K9XA 4RXFA 1HTIA 1H63A 4CQ9A 3RK8A 3E96A 1H7OA 4HT3A 1AMKA 4IMCA 4KFPA 5KMYA 4ALDA 1OVDA 4RX0A 3QPYA 4WXZA 3FYPA 5A8GA 4HNTA 1P5BA 4OGZA 1RQHA 3GB6A 3LTSA 1SU5A 4NNCA 1LRTA 1F74A 2YSWA 1UJPA 4DXVA 2C16A 3CB8A 4OV4A 4S2CA 3BGJA 3ZWSA 1TPC1 4WD0A 3KAOA 3LDVA 4UNLA 4MYAA 1XC4A 3NL5A 3SI9A 1Q6OA 4K36A 1ADOA 4MKNA 1ZFJA 5T26A 3DI1A 4LVBA 3WK3A 4JTEA 4CNOA 1F2JA 1KTBA 2FLIA 3UD6A 4WOQA 2VC6A 4X9SA 2A6LA 4O1CA 3I6RA 1IIHA 1VCGA 2NV2A 4XBSA 2ZZ3A 3HGSA 3B05A 4MYXA 1WAUA 2V5BA 5I3HA 2C18A 5J5RA 2C13A 4QISA 1OK4A 1FWSA 1WA3A 1ZNNA 2I14A 3TA6A 1I2QA 3NQGA 3T55A 2PE4A 1W5OA 4TMBA 3CPRA 2NXHA 2C1HA 1MSSA 3NL6A 4WXYA 4IMDA 1TV5A 1N8FA 1Z44A 3TCEA 1A50A 3M47A 2ZZ7A 3O16A 2GJNA 4GUJA 3UY7A 2QJGA 1DQWA 2W0UA 1HG3A 4IMGA 1UBSA 1S5WA 1XBVA 3WJYA 4CCEA 3QSTA 1SSGA 2YFNA 2VELA 1RV8A 2X1SA 3NM3A 1KFBA 6ALDA 1K8ZA 3C2EA 3W3OA 1KA9F 2NWSA 3DU0A 4JD4A 2JBMA 1R2SA 2JGQA 2FFCA 3L5MA 4O4WA 1ZCOA 3P67A 2PC4A 3BLFA 1GVRA 1FXQA 4LWWA 1SZGA 1TPWA 4GUGA 4O50A 2ZA3A 2V9DA 3NQ6A 4MFEA 2X1RA 4JICA 4S1FA 3C4UA 2E6YA 3HGOA 3TV8A 3W1NA 4CLMA 1OABA 2BZNA 4JDYA 2CLMA 1K8XA 2IQTA 2VEMA 4NJGA 3G1XA 3HPZA 3KVKA 4AWUA 5CZTA 3M9YA 3DZ1A 1L9WA 5DN1A 4JN6A 3W73A 1FBAA 3KVJA 1PHWA 4EIVA 2VFEA 3OIXA 1XFBA 3NQFA 1KM6A 1TO3A 1GYNA 4BWLC 1JQXA 3LRMA 3L0GA 1V5XA 3A24A 3PUDA 4UTTC 3HGJA 3W2KA 3UZJA 3LCGA 3UNDA 4O17A 1G7UA 2G95A 3N14A 2VEPA 4IMEA 1YDVA 2ZA2A 5DY3A 3STEA 1K02A 4WJEA 3TSMA 1K3UA 1F7BA 1D3HA 1K7XA 5F2IA 3NDOA 3PF3A 4J9JA 3P8JA 3NPVA 3W7RA 3OEXA 3UY8A 3IIZA 2YZRA 2R94A 2EKCA 3C2OA 5C2XA 3U2OA 2GJLA 3M5VA 5EPDA 2EPHA 4GFSA 2QAFA 4H6KA 3CIXA 3IIVA 2DZUA 4JR5A 4Z1BA 2Y62A 5CZ0A 1QO2A 3A21A 4LW7A 5F4XA 3EWUA 4GUIA 4AEOA 1P1XA 4ZQCA 3TXVA 3PVFA 3BG3A 1G6CA 3B04A 2DU2A 3GAYA 2QCDA 4E38A 2NXGA 2ATSA 5AHLA 5LHFA 1WBHA 1OJXA 1ALDA 1VHNA 1EEPA 2C3ZA 1L6SA 2R91A 1X7FA 3G0SA 3A9IA 4O8RA 2B4GA 4BI5A 4A2SA 3P8IA 1FCUA 4EF8A 2WKJA 3C52A 3EWBX 5EA9A 1CI1A 3W1TA 4K38A 3RNDA 1DL3A 4RCXA 5IBXA 3KXQA 1JJKA 1R2TA 3LOTA 4RK8A 5D2VA 4UTIA 1LLWA 3HBLA 4FX8A 3G3MA 3CTLA 3FKRA 1VCVA 2GQ8A 3YPIA 3FOKA 3BLIA 1XUZA 3STGA 3F1QA 4JIQA 3M1ZA 5K4ZA 5E93A 5AHEA 3UPWA 4U4MA 3NQVA 5EL1A 3ATZA 3W1LA 1PIIA 3SW6A 5KZMA 1MO0A 4YXGA 4UTWA 3NOEA 1GTEA 1AK5A 1KFJA 4AHPA 3LCFA 4JEQA 1PVNA 3ZFHA 4Q4KA 5CZJA 1Q6RA 1RR2A 3BK0A 5FF2A 3ABOA 3T40A 3PBUA 5HMSA 3LLDA 2FQIA 2RDWA 2E68A 3PB2A 5D30A 2Q3OA 3C2RA 5EYWA 2WJZA 4CQAA 4NU7A 3TK7A 4MIMA 4IX0A 1SO6A 1T96A 4JYDA 3C0JA 3ELFA 3QSRA 4UFIA 3KVMA 1QWGA 4AF0A 3EB2A 3HOJA 3OG3A 3W7GA 3LCWA 1QPQA 3NG3A 3S5OA 1G4SA 1BKSA 2HTMA 1I2PA 1H60A 1W5MA 1KM2A 4MOZA 2PRHA 1TIMA 3EXRA 5C6MA 4AXKA 5LKYA 3DXIA 3N9SA 1RQEA 2ZCGA 4JGDA 3ZWTA 2VFIA 1O4UA 1SR9A 1VQTA 3TROA 3C61A 3NGJA 3DFSA 1YYAA 3PUOA 4MPQA 3JS3A 4XUGA 1O5XA 3F4WA 3MP5A 5D09A 4UTLA 1WQ5A 1UB3A 1TPUA 2E09A 1GPWA 1YADA 1W5QA 3W2JA 4FX7A 3FEMA 1FDJA 1KV5A 3TC6A 4DELA 1C8VA 2VFFA 2ZRVA 4N6FA 4O18A 1XBYA 2QEZA 4O10A 2Y63A 6TIMA 5LGZA 2BX7A 3HG2A 1OF8A 2JK2A 5K2ZA 4FXRA 1VZWA 4GC4A 4O54A 1SPQA 2GVJA 2NX9A 3IEBA 1YXYA 2H6RA 5IM51 5FEPA 3MHGA 1H61A 3TUUA 3CWOX 3BW2A 5AYXA 4Y6GA 4XTIA 5AHNA 3P5YA 2ABBA 2DZVA 1SUXA 1F76A 1HFBA 1IF2A 1O5KA 3W7PA 2YYUA 2A7PA 1R47A 2D73A 4OV9A 3L5AA 4LUIA 1OFOA 5F2LA 3G1SA 2QF7A 2G97A 1TPB1 3USBA 2X2GA 3VCRA 2GVGA 4Q33A 3TQVA 3LERA 2ISWA 2CLEA 3HF3A 2H3DA 4UFLA 1XM3A 5AC6A 5HULA 4U28A 4UFHA 1AL7A 3RU6A 3G1DA 1MZHA 3EX4A 2V2HA 3OVPA 4LVFA 5AN7A 1QR7A 3TQKA 4LNYA 3LI1A 3W72A 3VKJA 4XKYA 3MHUA 1VYPX 2O7SA 4RXGA 2I1OA 2QCMA 4ICNA 4MZ8A 5D2TA 1FDYA 5DCEA 2QAPA 5LSMA 1LOQA 2FIQA 3G24A 4QNWA 1RD5A 2ISSA 4M19A 4Y9AA 3S9YA 2ZA1A 1J2WA 5EY5A 1G4PA 3U6WA 4JIPA 5HR6A 1PS9A 4JS3A 3LV5A 3TFCA 4DO6A 1VYSX 2YX0A 1EWDA 3IIXA 2J88A 1YXDA 3W1AA 3N2MA 2ALDA 3GKFA 1PHQA 1TV8A 3L0NA 2QKFA 3GIYA 3GZ3A 2P0OA 1BWKA 1T8XA 5I3IA 3MJYA 3PG8A 3GXPA 3R89A 1TPVA 2WV8A 1TSIA 3GDMA 1CX9A 3HB9A 3BO9A 4UTUA 3NQ2A 3W7LA 1GVOA 3HG3A 4MZYA 2ZZ6A 1OYCA 5J5DA 2QCHA 3BVJA 2Q8ZA 5G4EA 4O0KA 3C6CA 3TMQA 2YFOA 5CPLA 1B4EA 1IXPA 4FX6M 4OWGA 5DLCA 4DBDA 2PRLA 1XBZA 1S5TA 1MXSA 5D05A 1W1ZA 3LHVA 3L5LA 2OZ0A 5D2YA 3E0IA 3TNOA 5KZEA 1QAPA 3LCHA 3W70A 4UTHA 4LOCA 5CSSA 1IIGA 2Q3RA 4IXHA 5KZDA 1JULA 3INPA 2DJLA 4JTLA 5F2MA 1B3OA 3MO7A 4K6AA 5AC8A 4ZQMA 5KTLA 2J9YA 4I7WA 2E5CA 4N2YA 2CFFA 5L6UA 3JRKA 3WJWA 1G7VA 5H91A 1TTQA 2J24A 5DBUA 2QDGA 1WV2A 4Q32A 2VEKA 4CCCA 1H50A 3MYOA 5G2IA 4EOUA 4M6PA 3IRDA 2YYTA 3MBDA 3HQ1A 4HNNA 1RVGA 3LHWA 3LXAA 4HN4A 2Y70A 3E9AA 4K8HA 1ME7A 3STFA 1YTKA 2YXGA 3M6YA 1W56A 4RZ4A 4JTJA 5FEWA 2VFDA 3P60A 1GOXA 1H7WA 2YDAA 4O12A 1M7PA 3M16A 1OK6A 3KRSA 3TSBA 3TMLA 2X1UA 2I9EA 3PSVA 2BTMA 3TDFA 1LBFA 1DVJA 2DZWA 1QPRA 2A0NA 2J27A 2Z0IA 2RFGA 3BLEA 1VGAA 4IPIA 3CLMA 1VS1A 2CW6A 4QIUA 4XZ9A 4JTTA 2ZQ0A 3S42A 5D37A 3VE7A 1IXOA 3UYCA 4FNPA 1K7FA 4O1AA 1GTHA 3W86A 5D2WA 1GVQA 3NXFA 3NPXA 3LBMA 3QW3A 1W3TA 5DELA 2QCNA 2OCZA 3B06A 2GQ9A 4ML9A 3WK2A 3G0UA 5H2ZA 4AAJA 4ZQRA 8TIMA 1S3HA 3W7CA 2ATMA 1QPNA 5G4WA 4GXMA 1QOQA 4KWVA 1KBJA 2AQWA 2ZRUA 5G2HA 3ANYA 5BNKA 4GRSA 3M7WA 2TYSA 2XN1A 1KLYA 4UXDA 2WNZA 4MUZA 1JUEA 3TQ0A 3W9ZA 3I7SA 3UQNA 1LBLA 4BR1A 3FJLA 1FCBA 3W1XA 3Q2DA 3NNTA 2QCFA 3NZRA 4L4LA 3D0CA 3LHZA 3LXBA 1GVSA 1KBIA 5EKYA 2C19A 3KHJA 3S8HA 4N9EA 5AHIA 3KOFA 1LRNA 1SQ7A 2VEIA 2CZFA 2QCGA 1IXQA 4UTMA 3O15A 4MVAA 4LV4A 1OFDA 2Q8LA 1M7OA 2HSAA 3O63A 1JR1A 3O07A 4JY8A 3PAJA 4QM1A 4KFOA 1FDZA 1GQNA 2ISVA 2B7QA 3TX9A 2X30A 4BI7A 3G18A 3RFAA 4XQ6A 1G4EA 2XN0A 1GVFA 1TV7A 4FXSA 4ZQPA 3G1AA 1X6UA 3W88A 5G5IA 3QEZA 3L68A 4HPXA 3LM7A 3M5YA 1E51A 1O60A 3MMTA 3G22A 4WY0F 4WOZA 1LCOA 3LB0A 4MJZA 3NEVA 4JYEA 1H7XA 3DH7A 3T7VA 3CC1A 5F4SA 4NZJA 3ATYA 2ZFAA 3BARA 3L67A 3PC0A 3V75A 3EKLA 2NUXA 4NX0A 1DORA 1LOLA 4O1BA 3WK0A 3B0PA 4XWUA 1XCFA 4AH7A 2DJXA 5HNRA 3TXZA 5AYYA 2V0TA 1DQXA 1JUKA 4I7UA 2HS8A 2TMDA 1G69A 3E12A 3GKAA 4UMBA 1JRCA 1KM1A 3C2VA 1TTJA 1F5ZA 4IMFA 4IX2A 2A7NA 5HR7A 7TIMA 3M43A 4Z1CA 3LBCA 3IIOA 3N3MA 3G1HA 2QDHA 2QJHA 5TIMA 1G67A 2TPSA 1OFBA 1F6KA 1QFEA 3GDRA 4UUIA 3THAA 1SZNA 3Q37A 5AOUA 1XUUA 2YCEA 4TR9A 3NVTA 2E1DA 2FPYA 1Q6QA 3WJSA 3F4NA 4Z1AA 1BEUA 3HGRA 1X8FA 3GYEA 1ZAIA 4ADTA 2ZZ4A 1VC4A 3QH2A 4RZ5A 2GVLA 4DO4A 2B7PA 1W5NA 3S6DA 1SSDA 1D3GA 2E5BA 5AC7A 1JUBA 3NR0A 1FWRA 5E0KA 1IGSA 2HMCA 4PL1A 1AW5A 2GPTA 4OQVA 2J6XA 4C1LA 1FQ0A 2GUUA 2Z1BA 2NLIA 3GLCA 3NQ7A 3V1PA 1TRDA 4DBEA 3EKZA 2NX3A 4GE8A 1NSJA 1A53A 1PV8A 1UUOA 3QJAA 3GR7A 3NQEA 1H5YA 4L4MA 4G1KA 2W6RA 1IXNA 4IQLA 1TMHA 3VI2A 3I7QA 2WSRA 2ZRWA 5A5WA 1EX5A 3PBWA 3R12A 3TKFA 2FB2A 3W1QA 4FNSA 3UWUA 4MY1A 3MW7A 3OHIA 3QM3A 4JY9A 5HQEA 1ZALA 3SSJA 3LXCA 4UC5A 1DHPA 3SY5A 4UNKA 2ZZ1A 3TFXA 3EWYA 1BTMA 1D9EA 1C29A 3DENA 2QCCA 3FYOA 5BRBA 3TW6A 3TC7A 4JTUA 1X1ZA 2WNNA 3O6YX 3P80A 3DGRA 2C0AA 2R8WA 3TW7A 3LCLA 1G4TA 3GXTA 1FCQA 4N02A 4FHAA 5CSRA 4AHQA 1YTEA 4RR4A 5BW6A 2VOMA 3C3NA 1YTDA 4JDBA 1DKWA 5IBXC 3FIGA 3HG5A 4PA8A 4PTNA 1OX4A 1TJPA 1KTCA 5CPOA 3N9RA 2V2DA 4ZL1A 4HNUA 4N9BA 2AGKA 3A5VA 1FWNA 3P62A 4BI6A 3G1VA 3TR2A 1OFAA 3TIMA 1EP1A 1W3IA 4IWWA 3DKJA 3PS7A 1SZFA 1GG1A 3G1FA 5FF3A 3EX3A 1TPDA 2TSYA 3WK1A 4AWSA 1H7RA 4LY8A 4UFJA 4QITA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4N6FA

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