4N9CA

Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 171
50100150200250300350400450050100150
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
171
sequence length
479
structure length
469
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIEL
50100150200250300350400450400300200100
050100150Genus Matrix

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Fragment-based design of 3-aminopyridine-derived amides as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 171
structure length 469
sequence length 479
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4n9cA02
3WK0A 3W1LA 4JIQA 4MIMA 4MZ1A 2J24A 4HSOA 4MZ8A 3P82A 3WJWA 3WJZA 2NUYA 1I2OA 1FXPA 3GXTA 1R47A 5I3HA 3LCIA 3W7JA 4KFNA 4BK9A 1VCGA 3NQMA 5U4NA 1G7UA 3P80A 4JTHA 4XBSA 3P5YA 4TU1A 3P8JA 4MJMA 4DBDA 3M9YA 5K2ZA 1BWLA 3LHYA 2J9XA 5I3FA 3A23A 1IXNA 1OX6A 1CW2A 4IQLA 5FEXA 4MFEA 3RU6A 3MP5A 3C4UA 3EXTA 4O52A 1KFCA 4WQ6A 3L5LA 3S1UA 3NO5A 4UTKA 4UUIA 1X1ZA 4OBTA 4BF9A 1VGAA 5TIMA 4DPPA 4K38A 3G1YA 1WX0A 4WY0B 1PL9A 3G1SA 4TO8A 5F2IA 3P74A 5HNRA 3B0VC 1W8SA 1PVNA 4LVAA 4JGDA 3P62A 2YDAA 1Q6RA 3G3MA 1UUMA 3UXAA 1G4SA 1P1XA 5DN1A 5D04C 1LORA 4HPXA 3NM3A 4AWSA 3W1UA 2KZHA 2ISWA 5DY2A 3MW7A 2YW3A 1PS9A 3L65A 5F4SA 2G5WA 3S5OA 4JICA 4HKPA 3O6CA 1VS1A 3L5MA 3W1QA 3TK7A 1FDYA 3P5ZA 1KFLA 3PAJA 3HO8A 5E1QA 1GQNA 5AC6A 1I45A 3C8FA 5F2GA 2H8ZA 1LP6A 3UQNA 3LBMA 2ZA2A 3TH6A 2B7OA 2VXNA 1DBTA 2TRSA 1TQJA 1OABA 4XBKA 4ZMGA 3W73A 5D2XA 1DL3A 2A85A 2CLFA 5CZ0A 1FDZA 4MPQA 1L6WA 3O05A 1GG1A 4JTEA 3VCRA 1VPXA 4LRSA 3M16A 3B03A 4P61A 1Y0EA 1AL7A 4MYXA 5T26A 3Q94A 3W7OA 4O1DA 2CLLA 3TMLA 3VE7A 3EWUA 4N9DA 3LCWA 4FXSA 4O14A 3G8RA 4DO4A 1GVFA 3SJ3A 2H8XA 5EBUA 5HWJA 4R7JA 4LS1A 4UFKA 2QCDA 2QAPA 4O11A 1XKYA 5FEWA 2I9EA 2NXIA 4MKNA 4MOZA 2C6QA 5I3GA 3TW7A 3OVQA 3TXZA 1DV7A 1N7KA 3DGRA 4TR9A 3W74A 1VYSX 3UZJA 1KV5A 3PWAA 3STEA 1I2QA 2G95A 3NR0A 3LXBA 1TPC1 3MI2A 3DENA 3W7EA 4IXHA 5E0KA 1WOAA 1EEPA 4LS0A 1KM1A 2JKEA 4ORMA 3DAQA 1DQWA 3P8IA 4LVFA 1RZMA 4N4QA 5I3JA 4Y8FA 5KTLA 1H50A 5F4WA 4K36A 1GZGA 4JTIA 3GR7A 1IIHA 2Z6JA 2YXGA 3QRHA 1SPQA 3EWBX 3ZFHA 3O06A 1RV8A 3N34A 5G1YA 3NAVA 3TSMA 1KM3A 1XCFA 2Y88A 2YZRA 3DFTA 5DCBA 3LV6A 3M0ZA 4Z0JA 1JRBA 1UB3A 3VI2A 3HG3A 3NQ7A 3WJXA 1RR2A 1YDVA 3TKFA 1W5MA 4XTDA 2E6YA 1W3TA 2UV8G 1LYXA 3IGSA 3L0NA 2JGQA 1GEQA 1YDNA 3DBPA 2Y7EA 1QDSA 5K9XA 3SGUA 1V5XA 1JUBA 4Z1BA 1H5YA 1R2RA 1K3UA 5D05A 3JRKA 3UWYA 5C6MA 5HR7A 2H6RA 3LRMA 4RLIA 2BSLA 1EIXA 4LT9A 1XM3A 3W70A 2C15A 3NXFA 3BLEA 3QMSA 3PBVA 2IQTA 3QM3A 2Q8ZA 5D30A 5TQLA 4BI7A 1ZY9A 1XC4A 1LBFA 1ZJIA 5DLCA 1RQBA 3L66A 1J2WA 4NJHA 4OU1A 2EGZA 3TNOA 2OX1A 3G0XA 4TMCA 1F74A 2JK2A 3H55A 4PA8A 4CQ9A 3DI0A 3UZ5A 5AYXA 3HGOA 2V5LA 1B4KA 1UCWA 5CGQA 1IXPA 1XXXA 1W5PA 1H60A 4O53A 3FS2A 3M6YA 3BLIA 4LW7A 3IVTA 4YCPA 5HMSA 1SFJA 1SQ7A 4S2BA 5K4XA 1JCYA 4PL2A 5KINA 3N3MA 4HSNA 4CCEA 3NQ6A 3W7RA 1A5CA 3O8AA 2PCQA 3DU0A 3EX6A 3S6DA 4JXCA 4YL2A 3GKFA 1F73A 3R12A 3SSJA 1W5QA 4LV9A 4ZQCA 4QITA 2DU2A 1RVGA 1TRDA 2FTPA 3KVMA 4RCXA 3HG5A 1OF6A 1DOSA 4L4LA 3G1FA 4BR1A 2A7PA 2DZPA 3B06A 3THQA 4H6KA 3LB0A 1SSDA 1VQTA 3EXSA 1UBSA 2OMAA 4DXVA 2ATSA 1ZENA 4I7VA 4JTSA 2A6LA 1HO4A 2YGYA 4XKYA 5AHEA 3CT7A 3LCHA 2BWGA 4M7TA 2GQAA 3CPRA 1WV2A 1G4PA 1NSJA 3F4WA 5HJLA 5K3VA 2WQPA 3LRLA 5EPDA 5FF0A 4A29A 3HPZA 3W2MA 5HUPA 4DO5A 5HQEA 2JKAA 3PUDA 3LHTA 4LS2A 4RKAA 1A5AA 1YTDA 2V2DA 1ME8A 4KWVA 5CPOA 1S5VA 4QISA 2CW6A 1OFRA 3N73A 3YPIA 4UR7A 3KVJA 1OFPA 5C55A 1FUYA 1KLZA 2HSAA 4ZQOA 5LGZA 3N2MA 3KOFA 3UXDA 4Z1DA 3W7GA 4LY8A 4DELA 1DJQA 3G1AA 3G0UA 3N9SA 4M5PA 5F1VA 1SZFA 4NQ1A 5IBXC 4Z08A 3U8GA 3QYQA 1YTEA 4QNEA 3TA6A 2V2HA 1R30A 4BI5A 5AC8A 5AN7A 1B3OA 1HFBA 1U83A 5DY3A 2A5HA 1WXJA 2FLIA 1L2UA 4UTUA 1EWDA 2CZDA 4PL1A 2QDGA 5AC7A 4CCCA 1SSGA 2EPHA 1RQHA 3GDRA 3LTYA 3HG4A 4O18A 4QJ1A 3NL3A 1QFEA 3EKZA 3L0KA 3KAOA 1AW1A 3EKLA 1KLYA 5FF3A 4Y96A 3EB2A 2RDUA 1OYAA 3QH2A 2WKJA 1A5BA 2BTMA 1V7YA 5H91A 1ZALA 4YCOA 1OFOA 5FEPA 1Q6OA 4ADSA 3DFSA 4XKYB 2R8WA 3C6CA 1QPRA 2WSRA 2DZSA 4RXFA 4JDYA 1SFLA 3RLVA 4N02A 3W1AA 4D2JA 1P4CA 3TAOA 3W2LA 4JTKA 1GG0A 5LNVA 4PCFA 3SIZA 4XTIA 3NYZA 4LWWA 1NEYA 3Q2DA 1EP3A 3PB2A 3HGJA 1QO2A 4LUJA 3BW3A 1JUKA 4ZQMA 5FF4A 3C0JA 1Z44A 2FDSA 3KX6A 3Q58A 4ZL1A 2A7RA 1FWNA 2VEIA 3EWYA 1D9EA 5CKSA 2FPTA 2QCHA 1GYNA 3TJLA 3TROA 3MI3A 3CIXA 1K02A 5AHFA 3FJ6A 3LX9A 3NQAA 4UMBA 1NF7A 1JRCA 3W7DA 5AHLA 2OT0A 3PR2A 4PODA 3FJLA 2NUXA 3FA5A 5BMXA 5LGXA 4O12A 4UTWA 3TIMA 1LROA 3LLFA 3TW6A 4AAJA 4HNNA 3UYCA 4ZQRA 1YTKA 2W79A 3QFEA 1NVMA 1Z42A 3LCXA 3ZWSA 2YYTA 1EUAA 3P84A 3WJYA 1TREA 3PF3A 3QSTA 3W1PA 3GK0A 2V5BA 5G2IA 1ADOA 3HB9A 4LVBA 1RD5A 3E12A 4NZJA 4OV4A 4GFSA 5G5IA 2E6DA 1I2NA 1H7WA 2Z1BA 4E0CA 2Y89A 1KTNA 1KM5A 5LHFA 2ZRUA 1TSIA 1TPWA 3NQ2A 1P0KA 4O8RA 5KSWA 1G6CA 3TDFA 1O4UA 3DXIA 1PHQA 1H1ZA 3HBLA 2V9DA 2ZTKA 2ZZ1A 3SY5A 3GB6A 1R2SA 2GOUA 3T78A 1WBJA 3IIZA 4JY8A 3QC3A 1HG3A 3QW3A 2X1RA 1I8JA 3PUOA 2O7QA 2E1DA 2R94A 3A5VA 3I7QA 1H63A 3DFNA 1JCLA 1F5ZA 2EKCA 3C2VA 4E38A 2DJXA 2XN1A 4Q32A 1QO5A 1OG0A 4RXGA 2QUTA 3TSDA 3S5ZA 1H7NA 1HTIA 3CWNA 3QZEA 4J9JA 4GBUA 3GDKA 1EWEA 4FNRA 2Y70A 1W54A 5FF2A 3QPZA 4AEOA 2NZLA 1OHLA 1TIMA 2Z2UA 2QCNA 5F4XA 1GVQA 3OA3A 3TMQA 3MUXA 3THAA 3LXAA 3FFSA 3C2RA 3RFAA 4FNQA 5LHEA 5I3KA 2P1FA 3NNTA 4ZZ9A 4RZ6A 3L21A 2EF9A 1QPQA 3PBYA 1LM1A 3C2OA 3M41A 4UTMA 5C2XA 4JX4A 5FESA 4LVGA 3N9RA 1K7XA 1WDWA 2BZNA 1QOQA 3G24A 3WJSA 3SECA 3W9ZA 3LCGA 2QCLA 1THFD 3TAKA 1SUXA 2HTMA 3S9YA 3GVGA 1K7FA 4WXZA 1ME9A 1VYRA 3WFAA 4G1KA 1J5TA 5L9FA 1VC4A 3F4NA 2Y85A 5IM51 2QJGA 2B0MA 4M19A 4GJ1A 5H2ZA 3G1XA 3MWAA 5G1TA 5CZJA 4UTIA 2WNZA 3P60A 3EWZA 1YPIA 2WNNA 3LHUA 3CWOX 3QPYA 2VFHA 4MLJA 2VFFA 5D2YA 2RKXA 3W87A 5GVJA 3DHDA 3UWUA 2ATMA 3VKJA 3W72A 2J88A 1TO3A 3PC0A 4O16A 2RFGA 2DZXA 4O17A 5KZDA 2VFEA 1XUZA 2C3ZA 1ALDA 2A21A 1F6KA 1F05A 1FBAA 5BOOA 3CB8A 4HN4A 5J5DA 4A21A 1M7PA 3MHGA 5CZSA 3SR7A 3RMJA 1W5OA 3NQVA 4LVDA 4O15A 3KVKA 4CCDA 4O13A 4FIQA 4TX9A 1W31A 1IGSA 3EWXA 1F76A 4AWTA 3IIXA 3W7CA 4UTTA 4I7UA 1KBIA 4Y9AA 3B8DA 3W1MA 3N2XA 4N6EA 3UWZA 5DELA 3PUEA 1IXQA 2H3DA 4GUHA 2RDTA 3W6YA 4EIVA 4H4IA 3W1XA 3NL6A 4IMEA 5AFDA 4JX5A 3TFCA 2ZCGA 1FQ0A 1SU5A 2A0NA 2YYUA 5D2WA 1MSSA 2F7FA 4POCA 3W23A 4IGHA 3SW6A 1VYPX 4DO6A 4IPIA 1Q6LA 2QKFA 3TQVA 4W9TA 1XFBA 2GJLA 1K8XA 3C2FA 1G4EA 3HIJA 1LCOA 1O60A 2J9YA 1WQ5A 4CQ8A 2WOQA 2TSYA 4UFLA 1LRQA 2Y6ZA 3MYPA 2YW4A 4M6VA 1W5NA 1XDLA 4WJEA 3WK3A 1I4NA 1XBZA 4FNSA 4JEQA 3BG3A 4BI6A 3SFKA 1LDCA 2HS6A 4Y6GA 5D2VA 3S1XA 2O7SA 3UWVA 2QDHA 2G97A 4NXKA 1AW5A 3HPSA 3O6YX 1KFEA 4OE7A 1ZNNA 1O95A 1TTPA 2Y7DA 4FNUA 2QCMA 2HMCA 2X30A 3TCEA 1SW3A 3NEVA 1S3HA 3TSBA 3UNDA 3MO7A 1LRTA 5DXYA 2CZFA 3CHVA 3NPVA 2C14A 4LC8A 4Z0SA 1R2TA 3HGSA 1P0NA 3EWWA 4CQAA 4U28A 5LNWA 5K9DA 3CEPA 3RLUA 5LNSA 4M7SA 2QCEA 5KZMA 4FNTA 2Z6IA 4UCGA 3FOKA 2NUWA 1O94A 2NV1A 2E77A 1H62A 4WUIA 3TX9A 4Q4KA 3HJZA 3W76A 1KTCA 3GXPA 3O07A 1GVOA 1EP1A 5G4EA 1JCNA 3HG2A 4LOCA 2PRLA 4NNBA 4IXXA 2NV2A 4I7WA 4AF0A 3STGA 3UD6A 4C1KA 1AW2A 1F2JA 2AQWA 1TPH1 4N6FA 2NX1A 2E5DA 1N8FA 3IIOA 1FX6A 1KA9F 5EY5A 2ZBTA 3TQKA 4KFOA 4O1CA 2V30A 3BG5A 1AG1O 2CLOA 3DFOA 3GAKA 4DQWA 5DBUA 1TPUA 1ZFJA 4ZVJA 3CC1A 1J4EA 1B9BA 5KZEA 3CLMA 2X1TA 2JKPA 3FKRA 1TV7A 5EL1A 2WSQA 2C0AA 3L0GA 1DORA 3W2JA 2FQIA 1OYBA 2ZDRA 1AK5A 2FIQA 8TIMA 1VHCA 3KRUA 3W85A 1H51A 5C54A 2DZTA 4LV4A 5A5WA 4MUZA 4E2BA 3DHFA 4JR5A 2DZVA 2WJZA 4FX6M 1DQXA 1EPXA 1XBYA 3EX4A 3NGJA 4A3UA 4IPJA 3S1VA 3R2GA 4NJIA 2GPTA 3BK0A 4K8HA 4QNWA 3RNDA 3ANYA 3BGGA 1XUUA 3GR8A 4Y90A 4UMAA 2DP3A 3SGZA 3I7RA 5KITA 5D32A 4AB4A 1OYCA 3R5EA 3V75A 5DCEA 4JTFA 1LRNA 1H7XA 3OBKA 2ZRWA 3P7YA 3W7HA 5A8GA 1E51A 1FCQA 4N2YA 4PC8A 4RZ5A 3UY8A 1SO3A 1OFDA 3M47A 5BMWA 2ABAA 5D09A 1X6UA 1JCMP 4MYAA 1QCWA 3BV4A 2YX0A 3GYEA 3MBFA 2NWSA 5CSSA 3H53A 4IX2A 3M1ZA 3C3NA 3NQFA 1NF0A 2Y61A 2JBMA 4O54A 3MYOA 2BXVA 4NJGA 5AHMA 4JS3A 4ORIA 3W71A 4AF0B 3GZ3A 2OT1A 3IV3A 4CNOA 4O19A 1G69A 3O1NA 2QR6A 5FF7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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