4NF7A

Crystal structure of the gh5 family catalytic domain of endo-1,4-beta-glucanase cel5c from butyrivibrio proteoclasticus.
Total Genus 153
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
153
sequence length
363
structure length
363
Chain Sequence
GAGTDRSATQVVSDMRVGWNIGNSLDSFGQSYNFPYTSLNETYWGNPATTKALIDEVAKAGFNTIRIPVSWGQYTSGSDYQIPDFVMNRVKEVVDYCIVNDMYVILNSHHDINSDYCFYVPNNANKDRSEKYFKSIWTQIAKEFRNYDYHLVFETMNEPRLVGHGEEWWFPRNNPSNDIREAVACINDYNQVALDAIRATGGNNATRCVMVPGYDASIEGCMTDGFKMPNDTASGRLILSVHAYIPYYFALASDTYVTRFDDNLKYDIDSFFNDLNSKFLSRNIPVVVGETSATNRNNTAERVKWADYYWGRAARYSNVAMVLWDNNIYQNNSAGSDGECHMYIDRNSLQWKDPEIISTIMKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional characterisation of endo-1,4-beta-glucanase Cel5C from bovine rumen microbe Butyrivibrio proteoclasticus
rcsb
molecule keywords Endo-1,4-beta-glucanase Cel5C
molecule tags Hydrolase
source organism Butyrivibrio proteoclasticus
total genus 153
structure length 363
sequence length 363
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2013-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4nf7A00
4MAVA 5D9MA 2C7FA 4EANA 1R86A 4AIOA 1W9UA 1D2KA 4LQ1A 1CTNA 1C8YA 3AIWA 5CJ5A 1GHSA 3A4WA 2TAAA 1CNVA 4B9YA 1BAGA 5HBFA 1V3HA 3L2MA 3W6LA 4OKDA 4W8LA 1XRVA 1B9ZA 4KGLA 2XSAA 4HOXA 1C90A 1CDGA 1KR1A 1MVYA 2CXGA 4OJYA 4KRTA 1KFWA 1UOKA 5FL1A 2ZX5A 2ZXQA 1V03A 1V3IA 1FP9A 1GOQA 2Y8KA 3WQWA 5JIPA 2G3JA 1CIUA 2OYMA 2WK2A 2BS9A 1W3JA 1JFXA 2DT1A 1XCWA 1E73M 2J79A 3N9KA 1WKYA 1OWQA 1PJ9A 2PWEA 3TTOA 3CUHA 3WNOA 4UR9A 3SCNA 2WZIA 4FLRA 1CXKA 1HX0A 1US2A 1NH6A 7TAAA 2CPUA 2MANA 1EQCA 5I78A 1OSEA 1Q6FA 2WVVB 1B31A 4MTVA 3RIKA 3ARPA 1UYQA 4HZ6A 2CITA 4ZENA 2XVNA 1OD0A 1QBAA 4QCEA 3VGHA 1BYCA 3KL3A 4D6HA 1CGVA 4ATLA 5BXPA 2XIIA 4RE2A 4E8CA 1SFSA 1BFNA 3GNPA 5A8NA 5ECUA 2D1ZA 3WL0A 1WZMA 3BXWA 1HJUA 1B30A 2PBOA 3WDIA 1WZAA 3ECQA 3VD5A 2W61A 6A3HA 1R7OA 5FCZA 3RM8A 3UERA 3QOMA 1LL6A 3ARYA 1O6IA 1MQPA 2J7CA 4W8BA 3G6MA 2Z1SA 1GQJA 3WIJA 2VCCA 2J8GA 1Z32X 3PZTA 3F4VA 5I77A 5A6SA 3CZJA 4MJ4A 2ZUTA 1ODUA 2WSPA 1RH9A 2J7EA 3AIQA 4FLQA 2WLZA 1KGUA 8CGTA 4X9YA 4AW7A 2DGAA 1GOOA 2FH8A 1US3A 3AYSA 3L4YA 3ZSTA 2ZUNA 1RP9A 2EPLX 2VCAA 1KBBA 2VR4A 3EYPA 2BY1A 4J3UA 3CLWA 4URIA 2X09A 3TP4A 2XFYA 4NRRA 5BWFA 4MDPA 3T2OA 3WL1A 1W3KA 7A3HA 1UKTA 3QR3A 2WKLA 2V5CA 1JDCA 5FL0A 2X05A 4U2YA 2BXYA 4PMRA 3HN3A 3BAJA 4PMQA 5DF0A 1UA7A 2FGLA 1EA9C 2WVVA 2WHMA 1L0PA 1CGTA 1JZ6A 1LLOA 2E9BA 2VZUA 5CLWA 4W93A 3AS2A 3WY1A 1BG4A 3VU2A 4JZ5A 5IHSA 1KXQA 4V27A 2W63A 3K46A 1XSJA 1E6ZA 4HA4A 4HOWA 2D24A 1ISZA 5JIWA 1ZL1A 3PHAA 1UUQA 3NJ3A 3GXDA 4TVCA 1JYWA 2VX4A 2J7GA 3PZNA 3BH4A 4D6EA 1H11A 4JL1A 3N11A 3IJ8A 2G3IA 2ZOXA 2J75A 3AMLA 4MDOA 4ZFMA 1JFHA 1VFMA 2WMGA 3WD3A 3SUTA 1WDPA 1CXLA 3AIBA 4D6GA 4B3LA 1V3KA 4QP0A 5C70A 1E9LA 3G6LA 1H2JA 5LA1A 3WMSA 4KRUA 1W1YA 1MQQA 1V3LA 2GK1B 5HXMA 4B15A 3OG2A 2EXOA 3N12A 3WEZA 4GZIA 2ZX7A 4BQ2A 3VTRA 4X0NA 4IUGA 3UCQA 3MV01 3WNLA 3SEPA 2C8NA 5DFAA 2XFRA 4A4AA 3RILA 1V6XA 3AHTA 1SR0A 2WMFA 1W1VA 4MB3A 3A4XA 1HJSA 3W38A 5JBDA 1HT6A 2VJXA 4JFVA 4HMEA 1YHTA 3AI0A 3TTSA 1JIBA 4CD4A 2E40A 3NDZA 2VMFA 1HKMA 3AICA 3WNKA 3IANA 2VL4A 3OLGA 1J0JA 2DEPA 1V0LA 3ZT7A 3NSXA 5BXTA 3RM4A 2YJQA 3PZVA 4HU8A 1UZ1A 2WM0A 4PMYA 4GZEA 2XWEA 1FA2A 1KR0A 1HL8A 4CU6A 1JAKA 1GW1A 2YLLA 3BMVA 4HPHA 3CZEA 3T0BA 3AS1A 1GQKA 2O92A 4W88A 1C3FA 3THCA 2ZUWA 3T0AA 4YN5A 1JXKA 3ZSSA 4GIAA 5I79A 2CBIA 1ZJAA 1E0WA 5E6YA 4Z2HA 3T0DA 1U30A 2BVTA 3ARZA 4CCEA 1GOMA 3HJEA 3IJ7A 1ISXA 3AS0A 3L4WA 1WDSA 1VJZA 1J18A 3AMDA 5CPTA 5GNZA 4AISA 1GUVA 1Q6GA 1UWSA 5CLTA 4YHGA 1L8NA 4HOZA 4WK9A 1E15A 1FFQA 1UR9A 2J7FA 2GK1A 3CZLA 3OBAA 1VFOA 4N0RA 1KXVA 1B3WA 4AIEA 2YL8A 1O7AA 4JHOA 2C0HA 3MSGA 4UOJA 1TZ7A 1QNSA 2WMIB 4F79A 1WZLA 1D7FA 4CGTA 5DEZA 1EHNA 1OD8A 1TUXA 2XSBA 2QHAA 1J11A 1WNOA 3U5YA 1XD0A 2QLYA 3VPLA 3WNMA 2A3AA 1B90A 2G8ZA 3EMQA 4TUFA 3UR8A 4FLOA 2V3FA 3W25A 4PCSA 4GI6A 2XTKA 1QI4A 2BVYA 3AMCA 1XC6A 4W87A 3WEOA 5FOOA 4UOZA 4EE9A 2J7HA 1XH2A 3AIRA 1W1TA 1JZ5A 5DT5A 5FD0A 1E6QM 4CVUA 1CGUA 3W24A 1CPUA 2EPKX 2ZE0A 5CPSA 1E1EA 4J3XA 5CSUA 2FH6A 4P7OA 3WF0A 4CCDA 3BAWA 4PMUA 1GNXA 1HN1A 1UH4A 3POHA 2O9OA 4CD7A 4IPLA 5CSYA 2G4FA 4W89A 1M7XA 3PBGA 2BHUA 2DT0A 4UQ9A 2NW0A 2VNCA 1JD7A 1NWTA 3CTTA 4H8UA 2J8FA 4BQ3A 1UD2A 5BYWA 4WKFA 1MW3A 2WWCA 2QPUA 3VX0A 1TFVA 4XX6A 2CCRA 3GXFA 5D9NA 3NSMA 2X2YA 1W3LA 5DO8A 2WMIA 1V02E 4IISA 2WCAA 1GVYA 1HXJA 2WMJA 1QNPA 5D8ZA 3FXYA 2YA1A 3SCPA 1XHGA 1UZ4A 2UY2A 4AZ7A 4D1IA 2QF8A 3GXIA 2F2HA 4FLSA 3BAYA 4EK7A 2YL6A 2PWHA 1JI1A 2Y5EA 3VIIA 4P8UA 4UFIA 3CPUA 3CBWA 4OOZA 1WAWA 4AZHA 2CEQA 1EIBA 5A2AA 1RPKA 4K68A 3SCTA 1PZ3A 4PMZA 2HISA 3GBDA 5AC5A 5I23A 2WWDA 1H09A 4F8XA 2YA2A 3WF4A 2DQXA 4QCFA 2YDSA 1CLXA 1RP8A 4LXFA 1G94A 1J0HA 4X0VA 1EDQA 3B8SA 1UHVA 4A3HA 4Z2IA 2OSXA 5A6JA 3RJYA 4U31A 1HP4A 1U33A 1NWRA 4BZYA 3ZJ6A 1A47A 1ZBKA 4JIEA 2XPKA 3VD9A 2PBGA 1CZ1A 2ZICA 1QNOA 5E0CA 3AXHA 1E6NA 4S3JA 4L4PA 2E8ZA 5ABEA 4OUEA 4AZCB 1WZKA 4J3TA 1CXEA 1FH9A 1GOIA 4MB5A 2WXDM 5M5DA 3VM7A 3VILA 4J27A 4QAWA 1CECA 4U3AA 5A95A 2G3NA 1XSKA 1W1PA 3GNOA 2EPOA 3A3HA 2XIBA 4AEEA 3NIYA 1UKQA 4V2XA 1CBGA 1TVPA 2GVYA 3VIJA 3BAIA 2WMKA 1CYGA 3N17A 2OSWA 2UY4A 1ESWA 3AXXA 4OIFA 1NP2A 1BSIA 1KCLA 1BF2A 5CZKA 1VB9A 2X8RA 4IM4A 3WH8A 4WKAA 1VFFA 4Q7NA 1Q6CA 1FFRA 1KXTA 2YLAA 3WD1A 5A6MA 4BCEA 3A6OA 1Y7VA 1C8XA 2VOTA 3BAKA 4H2CA 1DWGM 2BY3A 1J9YA 2ESCA 1EH9A 4AD4A 1UD8A 4MADA 1BQCA 1UWRA 2WYSA 2ZWZA 1BGAA 3TTQA 2OSYA 1KQZA 3EDKA 4Y7EA 3GXMA 2WVSA 4WIWA 2IUZA 4E2OA 3VD4A 1KGXA 2Z1KA 1K9EA 1JI2A 3ARTA 6TAAA 1BG9A 2JF7A 2PI6A 5HNNA 1KQYA 1HF6A 2EQDA 2FHCA 4H8VA 4MPKA 1FOBA 3VMNA 4QLLA 1EQPA 4M1RA 2E0PA 3ARVA 4HA1A 4KH2A 1XV8A 1J0ZA 4AZCA 6CGTA 5C8BB 1V0NA 5AC4A 5M03A 3DHUA 4AD1A 3VIHA 1XYFA 5EFFA 4W5UA 4NSBA 4GO9A 1HVXA 3TA9A 4GINA 1WB0A 2GJRA 3RO8A 1AQ0A 1W32A 2A3CA 1GVIA 3K4DA 2OLHA 3L4UA 4S3KA 1JZ3A 1QPKA 3NCOA 4H41A 4W8AA 3IAQA 1V6WA 1E6PA 1HJVA 1S46A 2WKGA 1B3XA 3VGFA 1IV8A 3W4RA 3RMEA 1XD1A 1G01A 1E40A 2D3LA 1QVBA 4AD0A 2Q8XA 3OLDA 2ZIDA 4ACZB 3WDQA 4M82A 2D2OA 2ZX8A 5KEZA 1XYZA 3OGVA 1UKPA 3AZRA 4AZIA 1HVQA 2VX7A 1MXGA 4HZ8A 2PWDA 4D71A 4UQAA 5E0FA 3KWXA 2WPGA 3MMDA 4PUDA 2VRKA 2CHNA 8A3HA 1W91A 2YA0A 5I2UA 4PMXA 4CU7A 3OB8A 5D9PA 2IXUA 3J7HA 3AFBA 5ABFB 2YOCA 3S2CA 5BRQA 1ZBCA 3ZR6A 4JFTA 2V3GA 1P6WA 2VQTA 1J12A 3VINA 5ABHA 3SCUA 1KB3A 1H41A 2WZEA 3VVGA 1X1NA 3BMWA 3SURA 3BSGA 3W82A 4CN1A 1A3HA 3QGVA 3PZIA 4PEEA 3GM8A 1I1WA 4DM2A 1B3ZA 3N18A 1MYRA 3OGRA 4MAZA 2VZTA 3PZUA 5CPQA 1ZBVA 4GQQA 4CUCA 3SCRA 3AMGA 2B31A 3ZT6A 3DYMA 5CQ1A 4TX6A 2YIHA 5CGMA 1H0IA 3OZOA 2WB5A 2Y8VA 1K9DA 1KXHA 5A2BA 3SCQA 2DH2A 4D72A 3GH7A 4WLCA 1HIZA 1EO5A 3W6MA 4JHZA 3ZMRA 1OT1A 1R85A 3NYDA 5A6BA 2ZXAA 4CU8A 1C93A 1QHPA 2O9RA 4C7FA 4MNLA 2FGZA 4W85A 2X0YA 1OBAA 1UKOA 4ACZA 1AMYA 5FKYA 2AMGA 4P8WA 4P8VA 3WF3A 2WAGA 3W37A 5A6BD 9CGTA 3M6DA 4JFUA 2WANA 1NWSA 2DT2A 2EJ1A 2ZUVA 1JZ8A 1M53A 2HVMA 5A69A 4MJ2A 3MANA 5JBFA 3WELA 2DT3A 5JUVA 4QFUA 2VQUA 2J7DA 3KL0A 2O9PA 2XVKA 4ZXLA 2ZWYA 4FMVA 1OIMA 1E0XA 4UFMA 5HOSA 3U5UA 3HU7A 4DUXA 2D0GA 3HMCA 5ABFA 4PMOA 2QMKA 1QNQA 4TXEA 3VD3A 3IJ9A 5M3WA 3WDRA 1WE5A 3PZ9A 2YDQA 1WDRA 3WD0A 3WEMA 1UWIA 2DH3A 5FIPA 2GJPA 2WLYA 3WD2A 3AXIA 2WHJA 4LYRA 3OIHA 2VX6A 4HPGA 1E43A 1E4LA 3MUZ1 5HDRA 3OLEA 1UD5A 5I6SA 2FHBA 3D5HA 5A6AA 2CIPA 4P7QA 3AHZA 5TD4A 1TA3B 1OGBA 1UH3A 1BYAA 1UKSA 4F9JA 2CBJA 4D6IA 1V3JA 2VRQA 3MU7A 3WUBA 1E1FA 5HPOA 3WDJA 3WN6A 1TCMA 2YDRA 2CBUA 4L4OA 1AVAA 5AYBA 2WCSA 3CMJA 4CCCA 2WCGA 5LA0A 4AD3A 3I3EA 1CGYA 1HJWA 1AQMA 2A3BA 1VEPA 1N82A 2PWGA 4PMNA 1GONA 4PRWA 2BHYA 2FDMA 1UG6A 3EDDA 2CETA 3RCNA 1BHGA 3WQ4A 1PZ2A 1UA3A 2V3DA 4ZE4A 4YPJA 5A8OA 1GOWA 1MXDA 4EAMA 2GJXB 2DPEA 2XGIA 1BPLB 4P8XA 3WDHA 4PMVA 3F5LA 3WD4A 1HL9A 2W67A 5D4YA 1PX4A 2DSWA 1NOFA 3T09A 3WBAA 3WQ5A 3F5KA 5D9OA 3PZOA 1UQYA 3VMOA 3SCSA 3U7VA 3SCWA 4AC1X 1IZKA 1GPFA 2CBVA 2DSKA 4ATWA 5KZ6A 2XVGA 4ML4A 4PTWA 2J77A 2E8YA 1FH7A 1FH8A 1OT2A 1Q6DA 1CGWA 3FAXA 3VIMA 1DP0A 1W9VA 4GZJA 2WHLA 3SIMA 1KWKA 1EDTA 5E6ZA 2GDVA 3EDJA 4ZXOA 2YKKA 4P7NA 4QLJA 3K8MA 1QI0A 3AHYA 1MW2A 3PTQA 2RGMA 3LPOA 3W28A 3FNDA 2BV9A 1JZ7A 2J25A 5M17A 3LPFA 3VD7A 2DIEA 1G0CA 1ZBWA 1K9FA 3T2PA 4BS0A 1EXPA 3L2LA 3VGGA 3OA5A 4ACYA 5BCAA 1UR1A 1LQ0A 1WDQA 1TVNA 5HPCA 3CUJA 5IFTA 4M29A 3B9EA 4KWUA 1C7TA 1E6XM 1ZU8A 2NT1A 3LPGA 3QHOA 3BCFA 3LPPA 4UZUA 3AS3A 1QBBA 4ZEPA 3CHEA 3QHMA 1E4MM 3FHAA 3FN9A 2VZSA 3VX1A 3MKKA 4BA0A 2X1IA 1E71M 1E4IA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4MAV A;  5D9M A;  2C7F A;  4EAN A;  1R86 A;  4AIO A;  1W9U A;  1D2K A;  4LQ1 A;  1CTN A;  1C8Y A;  3AIW A;  5CJ5 A;  1GHS A;  3A4W A;  2TAA A;  1CNV A;  4B9Y A;  1BAG A;  5HBF A;  1V3H A;  3L2M A;  3W6L A;  4OKD A;  4W8L A;  1XRV A;  1B9Z A;  4KGL A;  2XSA A;  4HOX A;  1C90 A;  1CDG A;  1KR1 A;  1MVY A;  2CXG A;  4OJY A;  4KRT A;  1KFW A;  1UOK A;  5FL1 A;  2ZX5 A;  2ZXQ A;  1V03 A;  1V3I A;  1FP9 A;  1GOQ A;  2Y8K A;  3WQW A;  5JIP A;  2G3J A;  1CIU A;  2OYM A;  2WK2 A;  2BS9 A;  1W3J A;  1JFX A;  2DT1 A;  1XCW A;  1E73 M;  2J79 A;  3N9K A;  1WKY A;  1OWQ A;  1PJ9 A;  2PWE A;  3TTO A;  3CUH A;  3WNO A;  4UR9 A;  3SCN A;  2WZI A;  4FLR A;  1CXK A;  1HX0 A;  1US2 A;  1NH6 A;  7TAA A;  2CPU A;  2MAN A;  1EQC A;  5I78 A;  1OSE A;  1Q6F A;  2WVV B;  1B31 A;  4MTV A;  3RIK A;  3ARP A;  1UYQ A;  4HZ6 A;  2CIT A;  4ZEN A;  2XVN A;  1OD0 A;  1QBA A;  4QCE A;  3VGH A;  1BYC A;  3KL3 A;  4D6H A;  1CGV A;  4ATL A;  5BXP A;  2XII A;  4RE2 A;  4E8C A;  1SFS A;  1BFN A;  3GNP A;  5A8N A;  5ECU A;  2D1Z A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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