4O0Z | Genus

Total Genus 168

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	168
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	168
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-12-14

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4o0zA02

2X16A 3PAJA 3HO8A 4LRTA 3G1VA 1LTDA 5KZEA 1AG1O 1H7OA 3RLUA 4YXGA 3O63A 1QPRA 1TPEA 1TTPA 3STCA 1ICSA 1RD5A 3GR7A 1AW2A 1G67A 3TSDA 3O15A 1ZALA 3USBA 1DJQA 1LLWA 2LLEA 4Q32A 4LU0A 1THFD 2Q8ZA 4AHQA 4NZJA 2H8XA 1Q6OA 1YDNA 3B0UX 1R2RA 3G8EA 3S1WA 4WY0B 4O4VA 3IEBA 1P0KA 1H1ZA 3TKFA 4WOQA 1TCDA 3M0ZA 1Q3NA 4JNMA 5CG7A 3R5EA 3QYQA 4N6EA 2B7PA 2JGQA 1XFBA 4E2BA 3GXTA 3NQDA 1F7BA 5AFDA 4OT7A 1EP3A 4N9EA 1WYIA 3TR2A 4NT0A 1ONRA 2C1HA 3UZ5A 2A7NA 2YW3A 4MYAA 4UTIA 2XN2A 5G2WA 2WSQA 2A4AA 1FWNA 3EEGA 3R13A 3ZFHA 1UUOA 4EIVA 5G1YA 4A29A 1VZWA 1PVNA 5LNVA 4GJ1A 2BLEA 1GVRA 4I7WA 1YXDA 2P10A 5D38A 3G1XA 2CLMA 1B57A 3W70A 3HPXA 5HMSA 1UASA 2J88A 1SZNA 1SZGA 3UYCA 2B4GA 4DBDA 1FDZA 1VR6A 3DHFA 3NL6A 4JIPA 4ORIA 1MEWA 1SO5A 3UXDA 4M6QA 1KFCA 4WZHA 4O52A 4PTNA 1XI3A 1XL9A 4UFLA 1QPNA 5BMWA 1JUKA 5CZSA 3NPUA 1VH7A 4O57A 3W73A 2C13A 1F6KA 1YTEA 4XWUA 3UQNA 4O14A 1SQ7A 4ZMGA 4UNLA 1U5JA 2WOQA 4I9AA 3KHJA 3VNDA 1QO2A 2V2HA 3LB0A 3EWBX 3S6DA 3KXQA 1GG1A 1OABA 1QNVA 3LI0A 1FBAA 3C2OA 3M43A 1GVFA 3P8JA 3UPWA 2NUWA 3FLUA 3IIOA 4JY9A 3BG5A 1RZMA 4HPJA 2O7QA 3LV5A 4FO4A 2NUYA 5CZ0A 3OIXA 4AAJA 5I3GA 4JTLA 4NJGA 4ADTA 1BWKA 3L5LA 3N9SA 4JTIA 1JCLA 1EIXA 3UZJA 3L0GA 3TXZA 2VC6A 2WV8A 1FWWA 4FNPA 1UJPA 1LBFA 3W7DA 3GYEA 4NVTA 5G2IA 1WX0A 1TO3A 2QCHA 3UD6A 4N4QA 1KFBA 1PL9A 2FLIA 4EOUA 1K02A 5EY5A 5KSWA 2ZZ6A 1ZAJA 3TNOA 2E6AA 2ISSA 3IV3A 2HTMA 1QWGA 1CX9A 2VFIA 3JRKA 3DXIA 4OBTA 1DL3A 4QITA 1LBMA 1EWDA 3S1VA 2QR6A 3BW3A 4FNRA 3FYOA 5LGZA 3PBUA 3W7MA 3NZ1A 1MZHA 4M7TA 3GNNA 3P80A 3G0UA 3B04A 4L4LA 2CLFA 1QPOA 2WPBA 1QMLA 2VEMA 3LXBA 3NXFA 1QDSA 4XTDA 3E9AA 2Y61A 3PSVA 4IX2A 3M9YA 4GE8A 4CLMA 1JCXA 3W84A 3G1DA 4UTMA 4U28A 4I7UA 3HMJG 1G69A 1TMHA 4GUJA 1BEUA 3OVQA 2E5BA 3WJXA 3LCFA 4KKXA 5AC7A 1TV5A 3EXTA 2OT0A 3DFNA 4OQVA 1IGSA 5LHFA 3QW4B 2X30A 1T99A 3S42A 3V1PA 2YYTA 3HB9A 5CSSA 3A5VA 5FF7A 4MY8A 3B05A 4FEZA 2WQPA 3W83A 1DVJA 4JYDA 1J2WA 3NL2A 4Z1DA 3G1AA 4BI7A 3ZWSA 4PH6A 4M6VA 1H7XA 3KRZA 3TJLA 1DOSA 1LROA 2ZRZA 3NA8A 1OF8A 2GQ8A 3A23A 1UCWA 3DZ1A 1DJNA 1I4NA 1I8JA 3CHVA 5F2MA 1G4PA 4C1KA 1OFBA 2PRHA 3G3DA 3MP4A 4FXSA 3LHYA 2FPVA 3ANYA 3SSJA 4O18A 4HPXA 1EB3A 5FEZA 1NSJA 4FX7A 3OHIA 3DH7A 3G24A 2JK2A 4K6AA 5TIMA 1KBJA 1P5BA 2R8WA 3OBKA 5C54A 3EX4A 1SUXA 3UWUA 1ME9A 2B7OA 3NR0A 3PBWA 3PUOA 2Q3OA 1A5BA 4ZQOA 4XKYB 1RPXA 4HNUA 1OG0A 4RV8A 4TX9A 3BGJA 3SW6A 3EX2A 3HQ1A 5G1TA 2WNZA 2DJXA 3WK3A 4AH7A 3MO7A 4UTLA 2DZSA 1B3OA 2ZQ0A 3N9RA 5LSMA 5LZLA 2J24A 4FNSA 2EF9A 3BARA 5F4WA 4HHPA 3W7CA 5K9DA 2DZUA 1KFLA 2CLHA 2ZZ2A 2QAFA 1TJRA 4RK8A 2C18A 5K4XA 5DBTA 3QC3A 1KM6A 3SJ3A 2PURA 4YMZA 4E38A 3L67A 2TSYA 1NF0A 1YYAA 3W7JA 4WY0F 3P82A 4LS1A 4UIOA 2QEZA 1GJPA 1FWTA 5CGQA 4DPPA 1LBLA 1Q6RA 2OZ0A 4TU1A 1ALDA 3LCHA 1G7VA 3FJLA 4ALDA 1Z42A 3GVGA 1SO6A 2CLLA 3F4NA 1LORA 5D03A 3TSMA 2J6XA 1IXNA 4GXMA 5FF2A 1X1OA 2J9YA 3UPBA 1W5QA 2E6FA 4MZ1A 1MO0A 4Z1BA 1OF6A 4K8HA 2ZRXA 3UWVA 3KVJA 3QZEA 1JCYA 4BI5A 1RQBA 2BTMA 3G18A 5DXXA 1FWRA 4UMAA 2FPTA 4DF0A 1GTHA 3N14A 2Y63A 1KFKA 2BXVA 4Y6GA 3L5MA 1D3GA 5FEPA 3O05A 2A6NA 2NX1A 4CQ9A 3QMRA 1OFPA 3MBFA 4FF7A 4AHOA 4BFAA 3LCGA 2GJNA 3W86A 2NZLA 3A5FA 1YXYA 3VKJA 1L6WA 4JR5A 1ICQA 3LOTA 4DXVA 2ZZ4A 3N73A 3IGSA 4RZ6A 1JJKA 3C0JA 3N19B 5D32A 5DCDA 2ZRUA 2V2CA 3GR8A 3W7PA 3LLDA 5I3HA 5I3FA 4O19A 2V82A 1OK6A 4KFNA 2ZA2A 3I7QA 1TPVA 1DKWA 4MLRA 3BG9A 4QAIA 1R47A 1ICPA 3TV8A 2I1OA 4UTTA 3W1QA 2CZEA 3V75A 3NQGA 1OX4A 2QJHA 4M7SA 1VHCA 3TH6A 1C8VA 1VS1A 4JYFA 5LGXA 1SZEA 1GQNA 4N9CA 1NFBA 2QCCA 1SW0A 2EGZA 2CW6A 3STEA 1TJPA 1WOAA 3NYZA 1KTNA 3IVUA 3TAOA 1RQEA 3M47A 3UWWA 5F2LA 3W2KA 3B03A 3HJZA 3LERA 4HSNA 3BPWA 3R89A 4MY9A 2VEIA 4WD0A 3RMJA 2HSAA 2ZYFA 3W7OA 1K8ZA 1DV7A 1LYXA 4IGHA 1I2OA 1X1ZA 2JKAA 1FUYA 4H6KA 1KV8A 4N9BA 4A3UA 4CCCA 2E1DA 3QMTA 3RNDA 1VRDA 2EPHA 4LV4A 4ZZ9A 1K7XA 1VGAA 2A7RA 2WSYA 4RCXA 4X2RA 3STFA 1ZJIA 4LC6A 5AHFA 2DZWA 4ZQNA 4UFHA 1G4TA 5IBXC 3NEVA 2FIQA 3GX9A 4E2DA 1H50A 5FF4A 1R46A 3GXPA 2Y85A 3DBPA 3TK7A 4O1BA 4NNBA 5C6MA 1P1XA 4K36A 4TMBA 2V5LA 3MWAA 2A1YA 3CPRA 1I2RA 1XM3A 1JUEA 1DBTA 3LBCA 3JR2A 5G4WA 3LBMA 3NL3A 1UBSA 3TMQA 1XDMA 2YDAA 5ABTA 2E5CA 5HWNA 4JTGA 1V5XA 1W56A 3P74A 2Z0IA 4DO4A 1ME7A 3KVLA 4IXXA 3QQ0A 3PC0A 1VYRA 3KRSA 4GUIA 4MVAA 3CIWA 5KITA 4NUWA 3NGJA 3ABQA 3M7WA 1WBHA 4I7VA 2OJPA 2YCEA 1GZGA 2QAPA 2ZZ7A 3EWYA 1DQXA 4PEKA 3LHWA 4LNYA 2NXGA 1AW1A 3NQ2A 1OYBA 1PE1A 2TRSA 1O5KA 5DXYA 3F4WA 3TC7A 5D02A 1QFEA 5BNKA 1QOPA 2V9DA 4M5PA 4JTFA 4H3DA 2A5HA 1UUMA 4Y96A 4CCEA 3E0IA 3YPIA 1PCWA 4JTSA 2CLIA 2NLIA 3BW2A 5D2VA 4U4MA 1P0NA 2F7FA 3DFSA 3EWZA 4LVDA 2RH9A 2G97A 3LM7A 2C16A 3CM4A 1JULA 4JTKA 3NQCA 4R33A 3W88A 3W75A 2NX9A 1WAUA 1N8FA 2A6LA 4UTJA 1OYCA 3L21A 2XN1A 3BVJA 4YLWA 5K2ZA 4A21A 2ZFAA 4RXFA 5T26A 4A2SA 3L9CA 3HGSA 1R2SA 1WXJA 3M5VA 3OG3A 4UMBA 4S2BA 4RX0A 2TMDA 3W1AA 1ML1A 1M6JA 3EX3A 3HOJA 3G1HA 3A22A 3PSWA 1B4KA 4POCA 4WXZA 1HTIA 3DFPA 4LVAA 1A50A 3NQVA 3EKZA 1VJIA 1IXPA 3TAKA 2CWNA 4QSHA 5FEXA 3W85A 4JTTA 4QISA 3THQA 3KX6A 1Q6QA 4HN4A 3THAA 4PC8A 1SO3A 4WUIA 5K7JA 3OA3A 2UV8G 3W2JA 1XBZA 4NJJA 1YXCA 2CFFA 2X1UA 3TQKA 2WO5A 2R91A 4MJZA 3PG8A 3E96A 3EX6A 3M44A 1FXQA 3SIZA 3O8AA 4MFDA 3TROA 1FY6A 5EPDA 4HSOA 1F2JA 1ZY9A 3W07A 1Q45A 4LY8A 3CEPA 5F1VA 3KRUA 3N34A 2CZ5A 4CCDA 4WX2A 1HG3A 3M5YA 2RDUA 1YDVA 1W5NA 3HG2A 3PB0A 5LNSA 5FESA 1EUNA 2ZDRA 1D3HA 4AWTA 3L65A 5AN7A 2OCZA 1KTCA 3DENA 3MBDA 1OFQA 2CLOA 4IPIA 1TTJA 2X1RA 3CTLA 1YPIA 1FCBA 2QCFA 3G1YA 4GBUA 2ATMA 1W5MA 3NQ7A 5AHIA 4EF8A 1T8XA 2Y7GA 3GB6A 1NAL1 3KFTA 1SFJA 4N02A 1LLZA 1YTKA 2CZFA 3P8IA 3RK8A 3H54A 3CU2A 4NNCA 1YLVA 3FA5A 1SR9A 3NQEA 1F5ZA 1YPFA 2WNQA 3GK0A 3N3MA 2X1SA 5E1QA 1NVMA 2PRLA 1KFEA 3LXCA 5EKYA 5C5YA 5K9CA 4O28A 3A21A 2QJIA 4IJBA 1OJXA 3SFKA 6ALDA 2QF7A 3TUUA 1KM0A 3I7SA 1XCFA 2Y88A 3SY5A 2VOMA 1EWEA 3SZ8A 3W7GA 1SSDA 2H6RA 2QCEA 2ZZ5A 3TFCA 3QPYA 3DKLA 3STGA 3SR7A 3W7RA 1HO4A 1GG0A 2OX1A 4IMCA 5HR7A 5U4NA 3G8RA 7TIMA 3Q37A 1XKYA 2XFWA 4R34A 4AF0A 3M16A 3IIVA 4GUGA 1H1YA 1WOBA 1VCGA 2E6YA 2GVGA 3P61A 1S5WA 1FCQA 5F2GA 2H3BA 3C52A 1IIHA 5HWMA 4LUIA 3O16A 1KM1A 5G4EA 3B0VC 1MXSA 4JN6A 3UY8A 5AYXA 4HNNA 2GPTA 4JICA 4OE7A 5LNRA 2HS8A 1KM2A 1O4UA 1WDWA 4O12A 3T55A 4UTKA 1F76A 2YW4A 2E09A 1XXXA 4R7JA 4O0KA 3UWYA 3S0CA 3W2UA 2FPYA 4P61A 1Z44A 2Y89A 2ABAA 3TQ0A 4UXDA 4MOZA 4IOTA 1TRIA 5A8GA 1W8SA 4L4MA 3R12A 4PCFA 4K38A 1TTIA 4TIMA 4K39A 1TPUA 1V7YA 2DORA 3MHUA 5F1UA 4MY1A 4K7YA 3M6YA 1AW5A 2V5BA 3GDKA 4PL1A 3NO5A 4YL2A 2BWGA 1FXPA 2YSWA 3IRDA 1R2TA 1W5PA 4OV9A 4KFPA 5HR6A 3DU0A 3MI2A 1TRDA 2VENA 2CLEA 1DORA 2DJLA 3QW3A 4YWIA 2NWRA 1SZFA 2QUUA 3S8HA 1SO4A 3TU9A 1GT8A 2WNNA 1TPFA 3QM3A 4UTWA 4NX0A 2YXGA 5D37A 2A85A 3WJWA 4IMDA 4MZ8A 1XBYA 3ZR4A 1TTQA 4JIQA 2RDWA 2TYSA 3NVTA 4Q33A 4FXRA 3DKJA 4KFOA 1JVNA 4LUJA 2RDTA 3T44A 2HMCA 2ALDA 1Y0EA 1GTEA 5D2XA 3MW7A 2YPIA 1H61A 3VI2A 3SECA 5FEWA 3PULA 1WA3A 3DFQA 2QUTA 1K7FA 4QJ1A 4ORMA 3MMTA 4JTEA 2GJLA 3INPA 4NU7A 4LRSA 2Y7DA 4O1AA 5CPNA 2YZRA 1L6YA 4BI6A 3PR2A 4ML9A 3MYPA 3NPXA 4OWGA 3FIGA 1EP1A 5AHNA 3C2EA 1KTBA 4OV4A 1FCVA 4MPQA 3BLEA 3RLVA 2Z1BA 3I6RA 3BLIA 4IMEA 3L5AA 3NZRA 3OEXA 3W1PA 5DY2A 3C6CA 4WJEA 4MUZA 3QH2A 4DPQA 3CWNA 2FJKA 2DP3A 5HUPA 2FB3A 4GUHA 5DLCA 1FDYA 4QNEA 4B5NA 1WV2A 3G22A 3G0XA 4AB4A 3TE9A 4GFSA 1LOLA 3MP5A 3LCXA 5J5DA 5LKYA 5G5IA 4PA8A 6TIMA 3W7EA 5DELA 3UWZA 2PE4A 1F6PA 3WK0A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4O0ZA

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