4O12A

Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
481
structure length
472
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 167
structure length 472
sequence length 481
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4o12A02
5K9CA 1KM2A 3NYZA 5IBXC 1IXNA 1KFCA 4Y8FA 3NQ8A 2VFIA 1SZEA 2V81A 1YXDA 1OK6A 3DGRA 4HT3A 1IXPA 4C1KA 4FNUA 4QNEA 1QOPA 2NZLA 1DVJA 1GG1A 4JTTA 1YTDA 2BTMA 3GVGA 1AL8A 4O0KA 1DV7A 4O18A 3L0NA 3TQ0A 2NV1A 1H7NA 3EKZA 3TAKA 2KZHA 3OVRA 2QUVA 1DQXA 4YMZA 1YADA 3QPZA 4KFNA 5AN7A 1PS9A 1ZFJA 5TBOA 5A5WA 5KZEA 5K7JA 4LVBA 4M6QA 4RXFA 2GVLA 3W23A 4K37A 3NL2A 3HIJA 1IF2A 1ME7A 3FKRA 3LCFA 3R5EA 1SW7A 5DY3A 1KV8A 4ADTA 1O4UA 3N3MA 3B06A 3QFEA 4RLIA 3TC6A 4IPJA 4O50A 3RK8A 4E2BA 1AL7A 3STFA 1UBSA 1F6PA 4S2BA 4HHPA 4DPPA 1KM3A 4H4IA 2QUTA 3IIPA 3BARA 4NXKA 4A29A 5CZSA 3C2RA 5CSRA 4CQAA 3NGJA 1JJKA 4PTNA 3NL6A 3LERA 5IM51 1W1ZA 3G1DA 2IQTA 3NM1A 4D2JA 4XTIA 1FWWA 4Z08A 4JYFA 2ZRUA 5KMYA 3HPXA 1U83A 1W0MA 1WAUA 5CG7A 4NZJA 3EWXA 3SW6A 3W1XA 3W7QA 3I7SA 4LS2A 3GX9A 3L67A 4MUZA 4UTKA 3DKLA 4R53A 4AWUA 4UTTC 3QMSA 1OABA 5AYZA 3G22A 2GJNA 3W6YA 5AFDA 3E9AA 4JNMA 3WK0A 2OT1A 3ELFA 1ZNNA 3L0GA 2RFGA 2CWNA 3N2XA 3EXRA 8TIMA 1L6WA 3THQA 4HNNA 4N6EA 4IMFA 4N9BA 4L4MA 4MY8A 2QCNA 4S1FA 1LORA 3W72A 1SPQA 2ATMA 1OFOA 3TDFA 4Z0SA 5BMXA 4ZMGA 3DAQA 3NNTA 1TPB1 4GRSA 2JK2A 3W73A 3GDLA 3GB6A 4RZ4A 1A5AA 3N73A 2C15A 3PB2A 3ABSA 3M5XA 4JYEA 1YDNA 2UV8G 2ABAA 3NQCA 2P10A 3R2GA 5KZDA 3W1QA 3TFCA 1WXJA 2FLIA 1PCWA 5FEXA 1KA9F 1F73A 1O60A 3MHGA 2JGYA 3P8JA 4UMCA 1EIXA 1SO5A 3EB2A 3NPXA 1QMLA 3UPWA 1TV5A 1G7VA 1L9WA 3LTSA 3LCGA 1LDCA 3CLMA 1TJRA 4RZ5A 1H7XA 3UZJA 5D03A 1DBTA 3PULA 5HQEA 1QOQA 2GQ9A 3HJZA 3G1HA 3NM3A 1AW1A 3W1UA 5CPOA 2CZDA 2PE4A 2VFGA 1JR1A 1HL2A 4U28A 4WZHA 3WJYA 1TTIA 1I45A 2FB2A 4NNBA 4UFKA 2H3DA 4KFOA 3BVJA 2FDSA 4DBEA 1OFAA 1O94A 3IGXA 5HR6A 2A7NA 3ABRA 4LS1A 3DFTA 4KFPA 1OX4B 2ZZ5A 1CI1A 5FEWA 5K9XA 1QPRA 1GTHA 3LCXA 4JX4A 4NUWA 1VLIA 1M6JA 1S5VA 2OX1A 3OEXA 1X6UA 4LVDA 5EY5A 4AEOA 5H2ZA 2Y88A 1SW0A 2GVJA 3PF3A 4MJMA 4UNKA 3O63A 1FWTA 1M7OA 3TQVA 2BZNA 3BLIA 5G1TA 3LDVA 4NJJA 3W1PA 3LXBA 5FI8A 4PEKA 1KFEA 3W83A 2E6AA 5DELA 3FFSA 3EXTA 1ZALA 2A21A 5F2IA 3QSTA 4LVAA 3ANYA 1A53A 3HG3A 2H3BA 4DF2A 3FJLA 4MVAA 2CZ5A 5FEPA 1QPOA 1W56A 2NX9A 2ZZ6A 1Q6LA 1NF7A 1TJPA 4PH6A 5E93A 2C14A 2ZDRA 1IGSA 2AGKA 1UASA 3WJSA 3OG3A 3TE9A 4IWWA 3MJYA 3OVQA 3TV8A 1ME8A 5I3KA 5DLCA 1XC4A 5CZ0A 1NAL1 3LV5A 4IMEA 4ZQNA 4RKAA 3TX9A 4HPXA 2GUUA 2RDTA 3UWYA 1ZAIA 4RJEA 2Q8LA 5D32A 4O10A 1VC4A 4E0CA 4O1DA 3CTLA 4JY9A 1DORA 3T55A 1WBJA 1T8XA 3PR2A 3QC3A 3WFAA 3OHIA 2X16A 3M47A 1JCXA 4UUIA 1SSGA 1VHCA 1BTMA 3EX1A 2A6NA 3FA5A 3NEVA 3YPIA 5LNWA 1H5YA 3W87A 2QCMA 1YPIA 3UXDA 1T99A 3I68A 4MLJA 1OX4A 1LLWA 3PC0A 3TUUA 3PBYA 3PBUA 4O28A 3QRHA 3PY2A 2B7QA 1GG0A 1ME9A 1IXQA 3SZ8A 3GDTA 2PC4A 1VGAA 5DY2A 1SR9A 1KBJA 1W3IA 2PRLA 3NQ7A 1HO1A 5HNRA 2ISSA 1XXXA 1MEIA 3R13A 2FPVA 1SZGA 4OHQA 1LZOA 3FOKA 3VI2A 3P5ZA 1IXOA 3O1NA 3C52A 2V82A 4QISA 5K4ZA 1FDJA 5LHFA 1LOLA 1W5MA 1I2OA 2ISWA 5LGZA 1VCGA 2G96A 3L66A 2QCCA 4O1CA 4IOTA 2DORA 1AW5A 3LGEA 2Z0IA 2AAMA 3LTPA 3MP3A 2CLLA 3TNOA 1UUOA 3SECA 2ZRVA 1R2SA 5C54A 4HPJA 4O14A 5BOOA 1NF0A 2WNNA 1YTEA 3GR7A 1D3HA 1X1ZA 2W6RA 2X1SA 2ZTJA 4GUHA 3QF0A 3TCEA 2QEZA 3GAYA 4ML9A 4LRSA 2WV8A 3SSJA 1FDYA 2XN1A 3C2FA 1XI3A 5A8GA 3GKFA 2EF9A 2ZZ4A 5G5IA 3PM6A 1W8SA 4JS3A 5F4SA 4NZFA 4FIQA 1PHQA 4JTEA 3QQ1A 3B0PA 2RHGA 3DFOA 2YDAA 3C2OA 3KXQA 1YXCA 3W1MA 1RD5A 2NX3A 3DZ1A 1H51A 2VFDA 4LWWA 5HUPA 3TAOA 1QWGA 4LRTA 4UTMA 3CU2A 3C8FA 4LVFA 3BW4A 3HQ1A 4WQ6A 2VELA 3E96A 1ICSA 2C1HA 4AB4A 3O6DA 1KLZA 4GUFA 1H1YA 3KVMA 4MPQA 1NFBA 4FIRA 4UR8A 3W7DA 1TTQA 4W9TA 4OT7A 3LCLA 1TTPA 3S0CA 3L5LA 2ZZ3A 3MBFA 3NXFA 1ZAJA 3CQ0A 2DU2A 2J27A 2ALDA 3W1TA 5CKSA 1XCFA 1EUNA 3DFQA 4WY0F 1QO5A 4IJBA 3SFKA 1R2TA 3W9ZA 3EWYA 5D2TA 1JUEA 2TSYA 2I9EA 3NZRA 3NVTA 3T40A 4O13A 3MWAA 1TPUA 1GWJA 1I4NA 1QPNA 2C19A 3ATYA 5FF0A 2GVGA 2B0MA 5CZTA 4OBTA 3W7MA 3FS2A 3E0IA 3W2UA 2OCZA 3LI1A 3W2MA 3GAKA 2B7NA 1R2RA 4FNTA 3TXVA 4NT0A 3DXIA 1FX6A 2G97A 3GNNA 1K8YA 3TMQA 3EX2A 5HUOA 5F1UA 5DBUA 4A22A 1H50A 5EA9A 1B57A 4KKXA 3UWUA 1BEUA 3EWZA 1EP3A 3F1QA 3NQFA 1A5SA 3TR2A 3TJLA 1G4EA 2NWSA 1OF8A 5I3JA 4JEQA 4UFJA 3SGZA 2VOMA 3M44A 3W1NA 5AC8A 2Y62A 4FNSA 1N8FA 1YTKA 3KOFA 1GYLA 2A5HA 1KM6A 5D2VA 5I3IA 3GNDA 2V5LA 3STGA 3MUXA 3EEGA 1M5WA 3PVFA 1HO4A 2HMCA 1PIIA 3A21A 2NXGA 5I3FA 4BI7A 1VYSX 4UCGA 3H55A 3RLVA 3EKLA 4O53A 1OX5A 4JX6A 1JRBA 4MIMA 2DZSA 2ZZ1A 4QM1A 4JX5A 3PWAA 3BGJA 4FX7A 2V8ZA 4YWIA 1MZHA 2I14A 4OV9A 5CGQA 3CWNA 1NEYA 1TMHA 2ZA3A 4FNQA 3UWQA 3NQGA 3O6CA 4DF1A 3PSVA 5EMUA 3TKFA 5U4NA 3WK2A 3S1XA 3NDOA 3GIYA 5F4WA 3LLDA 1KFKA 1XFBA 2RDWA 2QKFA 3FEMA 3SJ3A 4TMBA 1OYBA 2XN0A 4CQ8A 3B03A 3M0ZA 3O05A 5KTLA 3FKKA 5TQLA 3PBVA 1XUUA 3BLEA 3HMJG 1FWRA 1RZMA 2AQWA 4O19A 2F84A 5EYWA 2LLEA 4CCEA 1TREA 4EVZA 1RQEA 1FWNA 3G1VA 3MI6A 3OVPA 4DXVA 5FF4A 1P0KA 2ZTKA 3LLFA 1VQTA 2OT0A 1D3GA 2ZA2A 5L9FA 3SGUA 3PUDA 4ALDA 3MHUA 3T4CA 4LUJA 3LHTA 3HG4A 2J9YA 1ML1A 3EX3A 4EF9A 5HMSA 4ADSA 4ZQCA 1ALDA 4A3UA 4N02A 4HN4A 3W1RA 2DZTA 4WJEA 5BMWA 1LROA 4K6AA 4XBSA 4I7WA 4JTSA 4UTWA 1WQ5A 3MP4A 3QZEA 3DENA 2C16A 3I7RA 1TTJA 2YYUA 3VE9A 3L9CA 1E51A 2WNZA 1A5BA 4CNNA 1OJXA 2Y7GA 4LS0A 2WJZA 4UTWC 3O16A 2QUUA 3B0UX 3G0XA 1PE1A 3W1AA 1SW3A 1GYNA 1HFBA 2E5BA 4WY0B 3U6WA 4Z1BA 4IMGA 2Y7FA 1OK4A 4S2CA 3QSRA 4IXXA 3W7EA 2H6RA 3SR7A 3MI2A 3DFPA 3W7GA 1LBMA 3NG3A 3STEA 1FCUA 4ZQOA 1T96A 2WKJA 2NWRA 5H91A 1TPEA 3W74A 2QCDA 2V5BA 2Z2UA 3GXPA 2WQPA 3ABOA 3CEPA 4WX2A 4LUIA 5J5RA 4JR5A 4OU1A 1OF6A 5F1VA 2NX1A 4IQLA 3NZ1A 3W71A 3W7HA 3P8IA 1G4SA 4JY8A 2OMAA 1LBLA 1WOAA 3RLUA 2B7PA 2NV2A 4WUIA 1OFPA 3GZ3A 1IIGA 1LRNA 4UTLA 1SZNA 3LI0A 1B3OA 4O15A 1PL9A 3G1AA 4PC8A 4NVTA 1TPDA 3P7YA 1KW1A 4C1LA 4M6PA 3UWWA 3BV4A 3G0SA 4AWSA 2QCEA 2A7RA 1KLYA 4LU0A 1G4PA 3ZS4A 5HULA 5DCEA 4O57A 5FESA 1TPH1 5K9DA 2YGYA 3CEUA 3GDRA 4Z1AA 3P5YA 3LHUA 4L4LA 1O95A 2BWGA 4M7TA 1OYCA 4LVGA 4NNCA 3S1VA 3NQAA 4O8RA 3KRZA 1RPXA 2DJXA 4PODA 4MY9A 3G1XA 4FB7A 3MI3A 5K2ZA 1TO3A 4ICNA 1G4TA 2X1RA 3M9YA 3W75A 3A23A 5DBTA 2YPIA 3B04A 4TO8A 4WY0A 1IIHA 4JTKA 5EPDA 2NLIA 3L0KA 4YCPA 5D2WA 2Y7EA 4JTLA 4Q33A 3GDMA 1MO0A 3BK0A 2C6QA 3K30A 5LKYA 3BW2A 1B4EA 4N9CA 4X9SA 3Q37A 2VEMA 5KZMA 4WD0A 4O1AA 3MO7A 4HKPA 2CW6A 3INPA 4NJIA 2EAWA 1DHPA 1PVNA 3L65A 4M7SA 4O1BA 1XKYA 1Z44A 2OJPA 3QQ0A 1K02A 2GQ8A 1EWDA 4ORIA 4B5NA 1FWSA 3S6DA 1N55A 1TSIA 4EF8A 1OG0A 2QCLA 3DFSA 1BWKA 3W7RA 1F7BA 3UWZA 1Q6QA 3W2JA 3GXNA 2A1YA 5G2IA 2D73A 2DZVA 3W7OA 1UCWA 2DZUA 2ISVA 3NOEA 3G1FA 1DJNA 2CLMA 5F2LA 4JTFA 4HNUA 1PCKA 3BG3A 4GUIA 2YYTA 4Z0JA 4E38A 3GK0A 2ATSA 2TPSA 4CCDA 1FCBA 2BX7A 2HS6A 1OFEA 3Q94A 4RX0A 3PBWA 3TK7A 4Y90A 4WXZA 4K39A 1WV2A 1F2JA 2TRSA 3IVSA 3W7PA 2Y70A 1KBIA 3UY8A 3QW4B 3S1UA 3QJAA 3OBKA 1F5ZA 4FHAA 5FF7A 1WYIA 1QR7A 2BLEA 3NL3A 3HO8A 2E6FA 1W37A 3A24A 1LM1A 1VLWA 3EXSA 3TXZA 2VEIA 1TCDA 1RQBA 4XTDA 2EGZA 3IIXA 5DN1A 2J24A 1KFJA 1O5XA 2TYSA 3TSBA 1B9BA 1OX6A 4DBDA 3JRKA 1QCWA 3W22A 4NNAA 4YCOA 5LNUA 4N6FA 2Y63A 3BPWA 1JCLA 4QQ3A 4CNOA 1JCYA 3BGGA 4IX0A 2QJGA 4XKYB 4EWND 1TQXA 1OFDA 2BXVA 3CPRA 3E02A 3DHDA 2DZWA 2ZA1A 3MBDA 1L6SA 3QPYA 3IVTA 1OVDA 3UYCA 4O4VA 3NPWA 4PL2A 2HTMA 3BO9A 5LNRA 3STCA 3UXAA 2ZRWA 3LCWA 4X3ZA 2QJHA 4TX9A 4JICA 1T0OA 3M41A 4ADUA 3MYPA 3O8AA 4QSHA 3QMRA 2EPHA 4UFIA 1EUAA 2VFFA 1SFJA 3B8DA 4NU7A 4AF0B 3KFTA 3L2IA 4Q32A 3DKJA 3RNDA 1W54A 2RDUA 3NL5A 4UMAA 3DU0A 1QNVA 3I65A 2ZCGA 3IIZA 5FEZA 1KTBA 4AMAA 5D04C 4M19A 4BF9A 4IMDA 3GLCA 1U5JA 1I2RA 4NQ1A 3TC7A 1AMKA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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