4O12A

Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
481
structure length
472
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
publication title Structural and biochemical analyses of the catalysis and potency impact of inhibitor phosphoribosylation by human nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 167
structure length 472
sequence length 481
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-12-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4o12A02
2QCLA 4BWLA 5G1TA 4HNVA 1SZEA 3GB6A 5HWJA 2VXNA 4IPJA 3B05A 4GUHA 2QAPA 1V5XA 1XBXA 1LROA 5H91A 1TPUA 5EL1A 5I3FA 3T78A 2O7SA 1AK5A 3G8RA 3OEXA 4UNKA 1R2SA 1SO5A 1AW5A 1I2NA 1T8XA 4M19A 5CPOA 3KVMA 2F84A 1O94A 4RZ5A 3HOJA 3IGUA 4WJEA 2NWSA 3GR7A 3HB9A 2Y89A 3L9CA 3G8EA 1VCGA 3PBWA 3HG4A 5DBTA 5KMYA 1F05A 5BRBA 4AVFA 2VEIA 1PVNA 1OX4B 4MIMA 2TMDA 2HS6A 3BLFA 1XBVA 1MEWA 4LS0A 1KM3A 1RV8A 3F4NA 5D2WA 1XM3A 4AXKA 1GTHA 1ZCOA 1VS1A 1Z42A 3NNTA 2AQWA 1OFEA 3NR0A 3C61A 3SJ3A 5HQEA 3TSDA 3G1YA 3JR2A 3SECA 3NQGA 4B5NA 1KTBA 3SIZA 3EXSA 1J5TA 3W7EA 3W1UA 5EYWA 3W76A 1HL2A 3ZWSA 4JDYA 1OF8A 4JX5A 5CZ0A 5G4WA 4QNEA 4FIRA 1B57A 3SZ8A 3NYZA 4LV4A 4LRTA 1WDWA 4PC8A 1KLZA 2FPYA 2WNQA 1KTCA 4UXDA 3LLFA 1H7RA 4Z08A 2KZHA 2YW4A 1A5AA 5AHIA 4AHOA 2B7PA 3LHWA 2A6LA 5LNWA 4JTTA 5AHMA 3RMJA 1L6SA 4UUIA 3QQ0A 2YW3A 1JULA 4HT3A 1VHCA 3QZEA 3TXZA 4M7TA 3W84A 3GK0A 2ZCGA 5C54A 1GG1A 4WXYA 3EB2A 3IVSA 4LOCA 2Y85A 3F4WA 1QMLA 3O6DA 3QW4B 1W3TA 1DHPA 4K37A 4JTLA 3LBMA 4NJKA 5F2IA 3C0JA 2XN2A 5TIMA 4DF0A 1W0MA 5F2GA 3ANYA 1NAL1 5CSRA 1KTNA 3NQEA 2JGQA 3O63A 3W2JA 4ZL1A 4A29A 2Y62A 4IPIA 3LXBA 2OZ0A 4FO4A 1LRQA 3N14A 1LBFA 3EWBX 3DXIA 3LB0A 1K7EA 3W7HA 4JICA 3QEZA 5D30A 3S5NA 1PE1A 3VE9A 4WY0B 1S5WA 4RK8A 3TAOA 2DORA 3PS7A 2V2CA 4N9EA 3LCIA 3M6YA 3LCLA 3UWUA 4QAIA 7TIMA 2PC4A 1YPFA 3NL6A 2A1YA 3H54A 5G1YA 3O07A 2BWGA 5D05A 4BWLC 3LTSA 1RQHA 2Y7GA 3OIXA 5DY3A 3MBFA 1OFDA 4K7YA 2QF7A 3MP3A 4IUOA 1R30A 4OV9A 3EKZA 3TQ0A 4JEQA 4UMBA 2YX0A 3C2FA 4UFMA 4EOUA 5LKYA 2ZZ4A 2VEMA 5D37A 4Z0SA 4RV8A 5KSWA 2VFDA 4CQ9A 3UQNA 4Z1DA 1PL9A 3TDFA 5HWMA 2ZZ3A 3S1VA 2B0MA 3M7WA 3W1MA 2G5WA 3THAA 4BI5A 3FYPA 2WJZA 3Q37A 1LLZA 3PBUA 2YXGA 3W1NA 1YPIA 2ALDA 5AC7A 3TUUA 1Q6QA 1JCMP 2RDWA 1Z44A 3W22A 4JYEA 4O54A 1ZALA 5EA9A 3TSMA 2QCCA 2H8XA 3ATZA 3HPZA 1H1ZA 1OG0A 1LBMA 4HHPA 1TV5A 4Z1AA 2WNNA 5TBOA 3FJLA 2IQTA 1XFBA 4O50A 1OABA 3A5VA 3P81A 3CU2A 1G67A 4AHPA 2FPVA 2E5CA 1NF7A 1FCQA 1OX5A 1DORA 3KVKA 1HFBA 4FX6M 1RQEA 1F73A 4AH7A 1K8YA 3GNNA 4TU1A 4Z1CA 4JY9A 4N6EA 4WZHA 2CU0A 4ZQPA 3LHVA 3LCHA 3NM3A 4JGDA 3I65A 5AFDA 4GUJA 5BW6A 4N9CA 4UTMA 4UTHA 3OG3A 3TV8A 5A8GA 3NQVA 2C16A 4JD4A 4K36A 1X6UA 1UCWA 1KFCA 4AB4A 4J9JA 1GTEA 3MI2A 3L5LA 1DBTA 3C8FA 1JQVA 1AMKA 1QFEA 4RZ6A 1G7VA 5DCEA 3LBCA 3GAKA 3MI3A 5LNRA 4ALDA 1GQNA 4CCCA 3W2KA 2WSYA 3GKFA 3PBYA 1AG1O 3BO9A 4OHQA 1SPQA 3QW3A 3HG2A 3BK0A 2VKZG 1GT8A 5DXXA 2R14A 4UFJA 3TW6A 4TO8A 1OVDA 2E6FA 5DCDA 2WOQA 3CQ0A 1THFD 1W3NA 1NSJA 4E2DA 1YTEA 1UJPA 2Y63A 3F03K 3UPBA 5T26A 4OV4A 1I2OA 1NF0A 4AMAA 2A21A 3STFA 2G95A 3LCGA 5AB3A 4KWWA 1M7OA 3G24A 4FXRA 1KBIA 3N9RA 4JS3A 4OBTA 3G1SA 4IMCA 1FCBA 2Y7FA 5HULA 1WX0A 2X2GA 4IXXA 1H51A 4JTIA 2GVJA 2ZQ0A 1FXPA 3WJZA 4BFAA 3N2XA 2QUVA 4LUJA 4JIQA 1K7XA 1WA3A 4NU7A 1FCVA 1N8FA 4LY8A 2WKJA 2YPIA 3BLEA 2FB3A 3G1VA 3QH2A 1ALDA 3WJWA 3L0GA 3NL2A 1E51A 1WAUA 2H3DA 3W7PA 4P2VA 3KOFA 4H6KA 1G4SA 4CQ8A 2RHGA 3T4CA 4R53A 2OJPA 3U8GA 3HPXA 4XBKA 3THQA 3IIPA 4KKXA 3W7MA 1KM0A 1JCYA 2A7RA 1SW0A 3OVRA 3CWNA 2A5HA 2Y61A 4NJGA 1H61A 5K4XA 4MFDA 2ZRWA 4RR4A 2F7FA 3N19B 1X1OA 2HS8A 2VEPA 3ZS4A 3CIXA 1T99A 3JRKA 3TCEA 4EF8A 1CW2A 4Q32A 3GZ3A 1OFAA 4N4PA 4NJIA 2G96A 6ALDA 4WOZA 1EB3A 4LVBA 5C55A 3G18A 1QWGA 3W1LA 4E2BA 3WK0A 4JYDA 4ONVA 4UMAA 2ATSA 2E77A 3C2RA 3T7VA 1KFEA 1EX5A 3SFKA 3K30A 3MHUA 3NO5A 3W2LA 1DKWA 3W23A 1LM1A 1HG3A 3TROA 3W1TA 3DHDA 1A5BA 4LV9A 3GDLA 3WJSA 4NVTA 1P0NA 2C1HA 1RR2A 1U5JA 1YXYA 2X16A 3YPIA 1IXNA 2ABAA 4LT9A 1KLYA 3P60A 2CZDA 3HG3A 4BI7A 5LZLA 1A5CA 3BVJA 5K3VA 3NDOA 5KITA 2G97A 1VZWA 4EWND 2ZFAA 4HSOA 4UTKA 1LTDA 2DZVA 1XUUA 4JYFA 3BG3A 4LU0A 3N3MA 4O18A 3Q2DA 2Q8LA 1LBLA 1H7XA 3H53A 1NVMA 4IX0A 1KV8A 2YFNA 1H7NA 3GYEA 1NEYA 3FEMA 1O4UA 1TTJA 2CZFA 1LDCA 3CT7A 3N2MA 4QQ3A 3PSVA 4PCFA 1KFJA 3ABOA 4MYAA 4YL2A 3GDKA 1TRDA 5AC6A 5CPLA 4DPPA 3LOTA 3TA6A 5BMWA 2TRSA 3CEPA 4GE8A 4PFMA 1YTKA 2J9YA 3VE7A 3W7LA 4PL2A 1JCJA 1XC4A 4FNUA 2PCQA 3NEVA 2ZRUA 1L6YA 3GDTA 4O28A 1UB3A 1D3GA 1QDSA 2X1SA 3OVPA 1KM6A 5FEXA 2QUTA 1I2RA 5A5WA 1OYAA 3WK2A 3FKKA 3RU6A 1OK4A 1S5TA 1JUBA 1IXPA 3LXCA 2GQ9A 1GJPA 4G1KA 4NX5A 3LGEA 2C14A 2Y6ZA 1WV2A 5I3HA 5EBUA 1XBZA 2J27A 1OFQA 3TMLA 4X3ZA 1WBHA 3RF9A 2ZA1A 1SQ7A 3WK1A 5DXYA 1XI3A 5K2ZA 2DZPA 3NQCA 4DBDA 1JVNA 1W5PA 5AC8A 4O8RA 3AJXA 4DXVA 4IMEA 3LXAA 1QPOA 5FF7A 4UTWA 3W7JA 3QSRA 1WQ5A 3IIXA 5U7SA 3L5MA 4PEKA 1P1XA 1ML1A 3FYOA 4FNSA 3PY2A 3NGJA 5FI8A 1TRIA 3HGOA 4N9DA 1BTMA 3LLDA 4K8EA 3MP4A 2NV1A 1R2RA 4UTTA 1TCDA 3MMTA 4NJHA 5KZEA 3W07A 3MWAA 1FDJA 1XKYA 2Z1BA 2OMAA 3DZ1A 1GWJA 1W54A 4Q4KA 1KW1A 3H55A 3GDRA 1EPXA 1TPDA 3M0ZA 2VELA 3ZFHA 3B06A 2QCDA 1VC4A 2PURA 1F76A 1K8ZA 4XTDA 5DLCA 1B4EA 5HUPA 4JTSA 4WOQA 4ADSA 3G1DA 2W79A 2FLIA 3C3NA 1FCUA 1L2UA 3KFTA 2BTMA 1VR6A 2CLOA 3ZWTA 2FTPA 2QDGA 3EX3A 3QMRA 4UFHA 4NT0A 3UXAA 3S0CA 2DP3A 2NXGA 1TPC1 4DO4A 3UYCA 4X22A 5L6UA 5BNKA 3P82A 1ME7A 2QJGA 3MJYA 1OHLA 2ZYFA 1WBJA 4MUZA 4JXCA 3W3OA 5D03A 1JUKA 3LHZA 1W56A 1YLVA 1FWSA 4WD0A 4CLMA 5ABTA 3LCWA 2ZRXA 2DJXA 3TK7A 5KZMA 5K7JA 3SY5A 1FWRA 3O8AA 4KWVA 4OT7A 5LHFA 1LP6A 2J9ZA 3KX6A 5G4EA 4ICNA 1JCNA 3HPSA 1SZNA 4I7WA 2XN1A 3DFQA 1MEIA 3S8HA 1P4CA 4UR7A 3IRDA 2QCMA 4U28A 4HPXA 1I4NA 5HR7A 1FUYA 1VRDA 1VYSX 1QPQA 4TMCA 3LRMA 2QCHA 3NAVA 3TSBA 2J9XA 5AYYA 2GPTA 1W5NA 3NXFA 4FXSA 3GKAA 1F6KA 4GFSA 1TSIA 4O12A 4QISA 4LW7A 1G69A 4N9BA 4WX2A 1G4EA 1JCLA 3LI0A 2PRHA 2FDSA 1WXJA 1LORA 4M7SA 3LX9A 4O15A 4O10A 2OCZA 3IGSA 1Q45A 2GQAA 5K9DA 1GVSA 3C2VA 3G1AA 5F2LA 2H90A 3A23A 2X1RA 2C6QA 2TSYA 4FEZA 4QJ1A 5DBUA 2RDTA 3NPXA 1GVFA 1XL9A 5G2HA 1OYBA 1F74A 3W2NA 2V82A 2VENA 1QPNA 5FESA 1PV8A 2HSAA 3L65A 1GYNA 3UZ5A 5KINA 4LVFA 1KV5A 2QCNA 3MUXA 1QOPA 4O1DA 4DPQA 1B9BA 2A6NA 2V81A 2NUWA 5D32A 3TXVA 4UTWC 4MJMA 3LHTA 1MO0A 3EWWA 2ISVA 1YDOA 4NZJA 3W2UA 3I7RA 2ZZ1A 4UR8A 1IIHA 4UFLA 3OHIA 4E0CA 1D3HA 3A5FA 5G2WA 5EPDA 4ZQOA 1S3HA 3MP5A 1EA0A 2NX3A 2C19A 4OWGA 1A5SA 4UTTC 2PRMA 4ORMA 2FQIA 1GOXA 3N73A 2UV8G 3P74A 3O15A 1H50A 4DEFA 3C4UA 3FLUA 4BI6A 1QOQA 5F4WA 1W31A 5HWNA 3TX9A 4HNUA 5CZTA 3P8IA 4Z0JA 4XTIA 2W6RA 4CNOA 4UFIA 4IWWA 1LRTA 3GX9A 3CWOX 3MHFA 2W0UA 5AHFA 1LYXA 2HMCA 4MFEA 1TPVA 2OX1A 2V8ZA 3L0KA 1X8FA 3WFAA 1VLWA 4R7JA 4FB7A 3R5EA 3M44A 3NPUA 3HBLA 1Q6RA 1XDMA 3CB8A 3CIWA 1UBSA 3W6YA 1QPRA 4OQVA 4NZFA 3LHYA 1X7FA 1YADA 4UTLA 4MLJA 3SI9A 3G0SA 1JRCA 1SFJA 1PHQA 4LRSA 4M6PA 2CLEA 5G2IA 3W87A 2Q8ZA 3DENA 1TTIA 1N7KA 2J24A 4O4VA 3WJYA 1J4EA 4O1BA 1VYPX 4MPQA 3NOEA 1H7OA 2A0NA 4QSHA 3DFOA 3NQ7A 2ZZ7A 3S42A 5IBXA 3QMSA 1TO3A 3LDVA 4JTJA 4O53A 4UTJA 1TQXA 1LLWA 2Z6IA 3GAYA 1KFBA 3CPRA 5G5IA 1XBYA 4YMZA 2H3BA 1NFBA 5LSMA 1SZGA 1ICQA 2X1TA 4IMDA 5E93A 2GOUA 1KA9F 1ICPA 2C15A 5AYXA 2ZZ5A 3KRZA 1QO5A 3BPWA 2A7NA 3MW7A 4BR1A 1OK6A 2CLFA 3P5ZA 1K7FA 2QUUA 5U4NA 2E68A 3PWAA 2V2HA 2E5DA 5AOUA 3TH6A 2BZNA 3R12A 2BXVA 4QNWA 4EF9A 4NNBA 3M9YA 3PF3A 3DKJA 4O17A 1SUXA 1TV8A 4GJ1A 5AHNA 2B4GA 2C18A 2VFGA 4TMBA 3TAKA 3PVFA 2YSWA 5FF4A 3NPVA 2NXIA 3L67A 1TB3A 4PA8A 2EAWA 3UZJA 3W7RA 1DVJA 3DU0A 3UWYA 3BARA 1PIIA 4XUGA 2FFCA 3S5YA 1XXXA 3BG9A 5EY5A 4AF0A 4FNPA 3QPYA 1DL3A 3TMQA 1Z41A 2QJIA 3HQ1A 3PUOA 4GUGA 4Y90A 1AW2A 5I3IA 3L66A 3B04A 4MZ1A 3P8JA 3BW4A 3DFTA 3B0UX 3S1WA 4HSNA 4RXGA 4RX0A 5HNRA 3TW7A 3EX1A 5TQLA 3TQKA 2JK2A 4O0ZA 2EPHA 5D2TA 5AHEA 2GQ8A 3W88A 5BMXA 1C29A 4HKPA 1L9WA 4GUIA 4UCGA 3RFAA 1FY6A 5D02A 3D0CA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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